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LotjaGi1g1v0496800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0496800
Transcript ID LotjaGi1g1v0496800.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein ARABIDILLO 1; TAIR: AT2G44900.1 ARABIDILLO-1; Swiss-Prot: sp|O22161|ADLO1_ARATH Protein ARABIDILLO 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QL67|A0A0B2QL67_GLYSO Protein ARABIDILLO 1; Found in the gene: LotjaGi1g1v0496800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:101210937..101228331) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACAAGTTTGATAAAATGCTGTAAATCTTGGACTTGTGTGTGGGGGTTGGTCCATGATCTCTTCTCTCGATATATATATTT TGTATAAAATATGTAAAAACGCAATATAAATTATGCTTATTTTATGAGCTGTTGTTGTTTGTTCTCCTTCTCCACCCCAT TGTTCTTCCCCTTCCTTCCTGCGTTTCTCTCAATGCCGTAATTCCCTTTGTGTCGCGAGATTGCATTACCAATTACCTTC CTCTTCTCCTTCAACTTGTTGCCTCACACACATGACCACAACGCATTTCAGAGTCTGGGTTGTTTCCCAATGAATTTCCC TTTCTCTTTCTCTCCACACCACCCCATTCAACCAGCTTCTTCATCTTCACTCCCTTTTCTTTCTCAGGTTTTCTTCAAAT TTCTGTTAGATGCAGCATCTGATTTGTGTTCTGAACATCCAAGAAACTTAGCCTGACTTCACAGGTTTGTGAAAAGAATG TTTTTTTGGTTCTGTTTCTGTGTTCTTACCTTGATATCAATTCTGGGTATTGTCTGTTTTTTTGTATCTGGGGTTGGGTT GTTTTGTGTTGTGAGTTTTCAGCACTGTGTTGTCTTGTTGCAATTTGATAACTTTGATGAAGGACTAGGGTTTTTTTTTT GGGTTCAAAAGGTGTTTATATTTTGGTGGGTTGTATTGTTTTTACAATGTTTATTGGATTTGAGTGTTTAAGGTTGTTGT CTTGGTGAATTGTTTCAGTGGTTTTGAGATTTGGGTTTTTGTGTTTGAATGTGCAGGTGTATGTTTTGCTGTGGTTTTGG TAGCAATGAGTCGTAGAGTGAGGAGGAAGGTGGCAAAGAAAGGCAAAGGGAATGAGGTGGTGTCCATTCCTGAAATTCAA GGAGAGGTTTTGGATTTGGAAAGCCAAGGAATTGTTGAGTGGAGGGGCTTACCTGATGATACAGTGATTCAGCTGTTGTC 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TGATTGTCACCAGTTATAAATATTTCTAGTTGGAGGGGCATTTTTTGCTTTCTTAAATTTTAGAATTTGAATTCTGATTC TTGGTTCTTCAAATTCAACTAGCTCAAGTTTTCAC 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0496800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAGTCGTAGAGTGAGGAGGAAGGTGGCAAAGAAAGGCAAAGGGAATGAGGTGGTGTCCATTCCTGAAATTCAAGGAGA GGTTTTGGATTTGGAAAGCCAAGGAATTGTTGAGTGGAGGGGCTTACCTGATGATACAGTGATTCAGCTGTTGTCATGTT TGAGCTATCGAGACCGAGCTAGCTTTTCATCAAGTTGTAGGACATGGAGGTCTCTTGGTAGCTCCCCATGTTTGTGGACT TCTCTTGATCTTCGTTCCCACAAGTTTGATCCCAGCACGGCATCTTCACTTGCTTCAAGATGTGTGCATCTTCAAAAGCT TAGGTTTCGCGGGGCGGAGTCCGCTGACGCTATTATTCATCTTCGAGCTGGGAACTTGCGTGAATTAAGCGGCGACTATT GCAGGAAGATTACTGATGCTACTCTTTCAGTGATTGCGGCTCGGCATGAGTTACTTGAGAGTCTTCAGCTTGGACCTGAT TTCTGTGAGAGAATAAGTAGCGATGCTATTAGAGCTATAGCTCATTGCTGTCCTAGATTGAACAAACTTAGGCTCTCTGG CATTAGGGATGTAAATGCGGATGCTATTAATGCCTTGGCTAATCATTGTCCTAAGTTGACTGATATTGGGTTCATTGACT GCCTTAACGTTGATGAGGTTGCTTTGGGAAATGTGTCGACAATTCGTTTCCTTTCCGTTGCCGGGATGTCAAGTATGAAG TGGGGTGTGGTTTCCCATCTTTGGCATAAACTTCCTAACCTGGTTGGGTTAGATGTTTCAAGAACTGATATTGGTCCATC TGCTGTTTTAAGATTGTTATCCTCATCACAGAGTTTGAGGGTTTTGATTGCTCTGAATTGTCCTATCCTTGAAGAAGACA CTAGCTTCTGTGCTACTAAGTATAAAAACAAGTTACTAATTTCCGTTTCTACTGATATTTTTAAAGGACTAGCTTCTTTA TTTTTTGATAATACCAAGAGTGGAAAGAATGTGTTTTTGGACTGGAGGAATTTGAAGAATAATGATAAGGACCTTAATGA AATTATACCCTGGCTTGAATGGATGCTATCCCATACGCTTTTGCGTTCTGCTGAGACCCCTCAACAGGGTCTTGATAATT TTTGGATTGAACAAGGTGGGTTGCTCTTGCTTAGTCTAATGCAGAGTTCTCAAGAGGATGTTCAGGAAAGGGCAGCCACG GGTCTTGCAACTTTTGTTGTAATTGATGATGAAAATGCTAGCATAGATTGTGGAAGGGCTGAAGCAATTATGCGAGAGGG TGGCATACGCCTCCTTCTTGGCCTGGCAAAATCTTGGAGGGAAGGACTTCAGTCTGAGGCAGCTAAGGCCATTGCAAATT TGTCCGTCAATGCCAATGTCGCCAAAGCTGTTGCAGAAGAGGGTGGGATTGAGATTCTCGCTAGTTTGGCCAGGTCAACA AACAAATTGGTGGCTGAAGAGGCTGCTGGAGGGTTATGGAATCTCTCTGTTGGAGAGGAGCACAAGGGCGCCATTGCTGA GGCTGGTGGAATAAAAGCTTTAGTGGAACTTATATTCAAGTGGTCTTCTAGTGGAGATGGAGTTTTAGAACGTGCAGCTG GTGCATTGGCTAATTTGGCAGCTGATGACAAGTGTAGCACAGAGGTTGCACTGGCTGGAGGTGTACATGCTCTAGTAATG CTTGCTCGTAAGTGCCAATTTGAGGGAGTGCAAGAGCAGGCTGCTCGCGCATTGGCTAATTTAGCTGCTCATGGAGATAG CAACAGTAACAATGCTGCTGTGGGAAGAGAAGCAGGTGCTCTTGAGGCACTTGTTCAACTTACGCGTTCTCCCCATGAGG GTGTCAGGCAAGAAGCTGCTGGTGCACTTTGGAATTTGTCATTTGATGATAGAAATCGAGAGTCCATTGCAGCAGCTGGT GGAGTTCAGGCACTGGTTGCTCTAGCCCAATCTTGTTCTAATGCCTCCCCTGGACTTCAAGAGAGGGCTGCTGGAGCTCT CTGGGGACTGTCAGTTTCTGAAGTCAATAGCATTGCCATTGGACAAGAAGGAGGTGTTGCACCTCTGATTGCACTGGCAC GGTCTGAAGCAGAGGACGTTCATGAAACTGCTGCTGGAGCACTATGGAATCTTGCTTACAACCCTGGTAATGCTCTACGA ATAGTGGAGGAAGGTGGAGTAACTGCCCTTGTCGATCTCTGTTCTACATCAGTATCGAAAATGGCACGATTTATGGCTGC ATTGGCATTGTCTTATATGTTCGATGGGAGAATGGACGAATTTGCTTTAGCAGGCCTAATGTCGGAAAGTATTTCTAAGA TAGCTGCGAGCTTGGATGGAGCTAGAAAGATGGCTTTGAAACATATTGAAACATTTGTCCATATGTTCTCTAACCAACAA GCATTTGCGGCTGCTGCTGCATCATCAGCGCCTGCAGCACTAGCACAAGTTACTGATGGTGCTCGTATTCAAGAAGCTGG ACATCTAAGATGCAGTGGTTCTGAAATTGGAAGATTTGTTACTATGCTCCGAAATCCATCACCTATACTGAAATCTTGTG CAGCATTTGCTCTTCTCCAGTTCACAATCCCTGGTGGACGACATGCTGGGCACCATGCTAGCCTCATGCAGAATGCAGGT GCAGCAAGAGTTCTGCGTGGTGCAGCCGCTGCAGCGACTGCGCCACTTGAAGCGAAAATCTTCGCCAGAATTGTTCTTCG CAATCTTGAGTATCACCAGATAGAACATACAAAGTAG 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0496800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSRRVRRKVAKKGKGNEVVSIPEIQGEVLDLESQGIVEWRGLPDDTVIQLLSCLSYRDRASFSSSCRTWRSLGSSPCLWT SLDLRSHKFDPSTASSLASRCVHLQKLRFRGAESADAIIHLRAGNLRELSGDYCRKITDATLSVIAARHELLESLQLGPD FCERISSDAIRAIAHCCPRLNKLRLSGIRDVNADAINALANHCPKLTDIGFIDCLNVDEVALGNVSTIRFLSVAGMSSMK WGVVSHLWHKLPNLVGLDVSRTDIGPSAVLRLLSSSQSLRVLIALNCPILEEDTSFCATKYKNKLLISVSTDIFKGLASL FFDNTKSGKNVFLDWRNLKNNDKDLNEIIPWLEWMLSHTLLRSAETPQQGLDNFWIEQGGLLLLSLMQSSQEDVQERAAT GLATFVVIDDENASIDCGRAEAIMREGGIRLLLGLAKSWREGLQSEAAKAIANLSVNANVAKAVAEEGGIEILASLARST NKLVAEEAAGGLWNLSVGEEHKGAIAEAGGIKALVELIFKWSSSGDGVLERAAGALANLAADDKCSTEVALAGGVHALVM LARKCQFEGVQEQAARALANLAAHGDSNSNNAAVGREAGALEALVQLTRSPHEGVRQEAAGALWNLSFDDRNRESIAAAG GVQALVALAQSCSNASPGLQERAAGALWGLSVSEVNSIAIGQEGGVAPLIALARSEAEDVHETAAGALWNLAYNPGNALR IVEEGGVTALVDLCSTSVSKMARFMAALALSYMFDGRMDEFALAGLMSESISKIAASLDGARKMALKHIETFVHMFSNQQ AFAAAAASSAPAALAQVTDGARIQEAGHLRCSGSEIGRFVTMLRNPSPILKSCAAFALLQFTIPGGRHAGHHASLMQNAG AARVLRGAAAAATAPLEAKIFARIVLRNLEYHQIEHTK 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 915 915 0.0
Gene3D 35 341 307 3.0E-35
ProSiteProfiles 36 82 47 8.544
Pfam 40 85 46 1.3E-5
SMART 42 82 41 2.4E-4
SUPERFAMILY 61 292 232 2.3E-21
SMART 123 148 26 68.0
SMART 149 176 28 390.0
SMART 177 202 26 20.0
SMART 203 228 26 150.0
SMART 251 275 25 340.0
SUPERFAMILY 359 744 386 2.47E-50
Gene3D 382 502 121 3.9E-21
SMART 416 456 41 27.0
Pfam 421 455 35 2.5E-4
ProSiteProfiles 427 469 43 8.697
SMART 457 497 41 0.0081
Pfam 462 496 35 3.4E-5
ProSiteProfiles 468 510 43 11.812
SMART 498 541 44 1.1E-4
Pfam 499 541 43 4.1E-7
Gene3D 503 589 87 1.3E-17
ProSiteProfiles 509 554 46 12.162
SMART 542 583 42 0.033
Pfam 552 583 32 1.2E-5
SMART 588 628 41 6.6E-7
Pfam 589 627 39 4.8E-9
Gene3D 590 677 88 3.0E-23
ProSiteProfiles 599 641 43 15.452
SMART 629 672 44 0.0076
Pfam 629 671 43 5.1E-6
ProSiteProfiles 640 685 46 10.377
SMART 673 713 41 0.0014
Pfam 675 712 38 1.4E-8
Gene3D 678 777 100 6.2E-17
ProSiteProfiles 684 726 43 13.597
SMART 714 755 42 6.0

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0496800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…