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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0496800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0496800.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein ARABIDILLO 1; TAIR: AT2G44900.1 ARABIDILLO-1; Swiss-Prot: sp|O22161|ADLO1_ARATH Protein ARABIDILLO 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QL67|A0A0B2QL67_GLYSO Protein ARABIDILLO 1; Found in the gene: LotjaGi1g1v0496800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:101211759..101228165) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCCCCTTCCTTCCTGCGTTTCTCTCAATGCCGTAATTCCCTTTGTGTCGCGAGATTGCATTACCAATTACCTTCCTCTTC TCCTTCAACTTGTTGCCTCACACACATGACCACAACGCATTTCAGAGTCTGGGTTGTTTCCCAATGAATTTCCCTTTCTC TTTCTCTCCACACCACCCCATTCAACCAGCTTCTTCATCTTCACTCCCTTTTCTTTCTCAGGTTTTCTTCAAATTTCTGT TAGATGCAGCATCTGATTTGTGTTCTGAACATCCAAGAAACTTAGCCTGACTTCACAGGTTTGTGAAAAGAATGTTTTTT TGGTTCTGTTTCTGTGTTCTTACCTTGATATCAATTCTGGGTATTGTCTGTTTTTTTGTATCTGGGGTTGGGTTGTTTTG TGTTGTGAGTTTTCAGCACTGTGTTGTCTTGTTGCAATTTGATAACTTTGATGAAGGACTAGGGTTTTTTTTTTGGGTTC AAAAGGTGTTTATATTTTGGTGGGTTGTATTGTTTTTACAATGTTTATTGGATTTGAGTGTTTAAGGTTGTTGTCTTGGT GAATTGTTTCAGTGGTTTTGAGATTTGGGTTTTTGTGTTTGAATGTGCAGGTGTATGTTTTGCTGTGGTTTTGGTAGCAA TGAGTCGTAGAGTGAGGAGGAAGGTGGCAAAGAAAGGCAAAGGGAATGAGGTGGTGTCCATTCCTGAAATTCAAGGAGAG GTTTTGGATTTGGAAAGCCAAGGAATTGTTGAGTGGAGGGGCTTACCTGATGATACAGTGATTCAGCTGTTGTCATGTTT GAGCTATCGAGACCGAGCTAGCTTTTCATCAAGTTGTAGGACATGGAGGTCTCTTGGTAGCTCCCCATGTTTGTGGACTT CTCTTGATCTTCGTTCCCACAAGTTTGATCCCAGCACGGCATCTTCACTTGCTTCAAGATGTGTGCATCTTCAAAAGCTT 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CTGCAGCAGATAGGTAAATTGGTATAAATTGTATTGCCTTGATGTTTTTTACCCTTTGTATTATTTTTATGTACCCTGTA TAATTAT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0496800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGTCGTAGAGTGAGGAGGAAGGTGGCAAAGAAAGGCAAAGGGAATGAGGTGGTGTCCATTCCTGAAATTCAAGGAGA GGTTTTGGATTTGGAAAGCCAAGGAATTGTTGAGTGGAGGGGCTTACCTGATGATACAGTGATTCAGCTGTTGTCATGTT TGAGCTATCGAGACCGAGCTAGCTTTTCATCAAGTTGTAGGACATGGAGGTCTCTTGGTAGCTCCCCATGTTTGTGGACT TCTCTTGATCTTCGTTCCCACAAGTTTGATCCCAGCACGGCATCTTCACTTGCTTCAAGATGTGTGCATCTTCAAAAGCT TAGGTTTCGCGGGGCGGAGTCCGCTGACGCTATTATTCATCTTCGAGCTGGGAACTTGCGTGAATTAAGCGGCGACTATT GCAGGAAGATTACTGATGCTACTCTTTCAGTGATTGCGGCTCGGCATGAGTTACTTGAGAGTCTTCAGCTTGGACCTGAT TTCTGTGAGAGAATAAGTAGCGATGCTATTAGAGCTATAGCTCATTGCTGTCCTAGATTGAACAAACTTAGGCTCTCTGG CATTAGGGATGTAAATGCGGATGCTATTAATGCCTTGGCTAATCATTGTCCTAAGTTGACTGATATTGGGTTCATTGACT GCCTTAACGTTGATGAGGTTGCTTTGGGAAATGTGTCGACAATTCGTTTCCTTTCCGTTGCCGGGATGTCAAGTATGAAG TGGGGTGTGGTTTCCCATCTTTGGCATAAACTTCCTAACCTGGTTGGGTTAGATGTTTCAAGAACTGATATTGGTCCATC TGCTGTTTTAAGATTGTTATCCTCATCACAGAGTTTGAGGGTTTTGATTGCTCTGAATTGTCCTATCCTTGAAGAAGACA CTAGCTTCTGTGCTACTAAGTATAAAAACAAGTTACTAATTTCCGTTTCTACTGATATTTTTAAAGGACTAGCTTCTTTA TTTTTTGATAATACCAAGAGTGGAAAGAATGTGTTTTTGGACTGGAGGAATTTGAAGAATAATGATAAGGACCTTAATGA AATTATACCCTGGCTTGAATGGATGCTATCCCATACGCTTTTGCGTTCTGCTGAGACCCCTCAACAGGGTCTTGATAATT TTTGGATTGAACAAGGTGGGTTGCTCTTGCTTAGTCTAATGCAGAGTTCTCAAGAGGATGTTCAGGAAAGGGCAGCCACG GGTCTTGCAACTTTTGTTGTAATTGATGATGAAAATGCTAGCATAGATTGTGGAAGGGCTGAAGCAATTATGCGAGAGGG TGGCATACGCCTCCTTCTTGGCCTGGCAAAATCTTGGAGGGAAGGACTTCAGTCTGAGGCAGCTAAGGCCATTGCAAATT TGTCCGTCAATGCCAATGTCGCCAAAGCTGTTGCAGAAGAGGGTGGGATTGAGATTCTCGCTAGTTTGGCCAGGTCAACA AACAAATTGGTGGCTGAAGAGGCTGCTGGAGGGTTATGGAATCTCTCTGTTGGAGAGGAGCACAAGGGCGCCATTGCTGA GGCTGGTGGAATAAAAGCTTTAGTGGAACTTATATTCAAGTGGTCTTCTAGTGGAGATGGAGTTTTAGAACGTGCAGCTG GTGCATTGGCTAATTTGGCAGCTGATGACAAGTGTAGCACAGAGGTTGCACTGGCTGGAGGTGTACATGCTCTAGTAATG CTTGCTCGTAAGTGCCAATTTGAGGGAGTGCAAGAGCAGGCTGCTCGCGCATTGGCTAATTTAGCTGCTCATGGAGATAG CAACAGTAACAATGCTGCTGTGGGAAGAGAAGCAGGTGCTCTTGAGGCACTTGTTCAACTTACGCGTTCTCCCCATGAGG GTGTCAGGCAAGAAGCTGCTGGTGCACTTTGGAATTTGTCATTTGATGATAGAAATCGAGAGTCCATTGCAGCAGCTGGT GGAGTTCAGGCACTGGTTGCTCTAGCCCAATCTTGTTCTAATGCCTCCCCTGGACTTCAAGAGAGGGCTGCTGGAGCTCT CTGGGGACTGTCAGTTTCTGAAGTCAATAGCATTGCCATTGGACAAGAAGGAGGTGTTGCACCTCTGATTGCACTGGCAC GGTCTGAAGCAGAGGACGTTCATGAAACTGCTGCTGGAGCACTATGGAATCTTGCTTACAACCCTGGTAATGCTCTACGA ATAGTGGAGGAAGGTGGAGTAACTGCCCTTGTCGATCTCTGTTCTACATCAGTATCGAAAATGGCACGATTTATGGCTGC ATTGGCATTGTCTTATATGTTCGATGGGAGAATGGACGAATTTGCTTTAGCAGGCCTAATGTCGGAAAGTATTTCTAAGA TAGCTGCGAGCTTGGATGGAGCTAGAAAGATGGCTTTGAAACATATTGAAACATTTGTCCATATGTTCTCTAACCAACAA GCATTTGCGGCTGCTGCTGCATCATCAGCGCCTGCAGCACTAGCACAAGTTACTGATGGTGCTCGTATTCAAGAAGCTGG ACATCTAAGATTGGTTCTGAAATTGGAAGATTTGTTACTATGCTCCGAAATCCATCACCTATACTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0496800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSRRVRRKVAKKGKGNEVVSIPEIQGEVLDLESQGIVEWRGLPDDTVIQLLSCLSYRDRASFSSSCRTWRSLGSSPCLWT SLDLRSHKFDPSTASSLASRCVHLQKLRFRGAESADAIIHLRAGNLRELSGDYCRKITDATLSVIAARHELLESLQLGPD FCERISSDAIRAIAHCCPRLNKLRLSGIRDVNADAINALANHCPKLTDIGFIDCLNVDEVALGNVSTIRFLSVAGMSSMK WGVVSHLWHKLPNLVGLDVSRTDIGPSAVLRLLSSSQSLRVLIALNCPILEEDTSFCATKYKNKLLISVSTDIFKGLASL FFDNTKSGKNVFLDWRNLKNNDKDLNEIIPWLEWMLSHTLLRSAETPQQGLDNFWIEQGGLLLLSLMQSSQEDVQERAAT GLATFVVIDDENASIDCGRAEAIMREGGIRLLLGLAKSWREGLQSEAAKAIANLSVNANVAKAVAEEGGIEILASLARST NKLVAEEAAGGLWNLSVGEEHKGAIAEAGGIKALVELIFKWSSSGDGVLERAAGALANLAADDKCSTEVALAGGVHALVM LARKCQFEGVQEQAARALANLAAHGDSNSNNAAVGREAGALEALVQLTRSPHEGVRQEAAGALWNLSFDDRNRESIAAAG GVQALVALAQSCSNASPGLQERAAGALWGLSVSEVNSIAIGQEGGVAPLIALARSEAEDVHETAAGALWNLAYNPGNALR IVEEGGVTALVDLCSTSVSKMARFMAALALSYMFDGRMDEFALAGLMSESISKIAASLDGARKMALKHIETFVHMFSNQQ AFAAAAASSAPAALAQVTDGARIQEAGHLRLVLKLEDLLLCSEIHHLY
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 832 | 832 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 35 | 340 | 306 | 2.1E-35 | ||
| ProSiteProfiles | 36 | 82 | 47 | 8.544 | ||
| Pfam | 40 | 85 | 46 | 1.2E-5 | ||
| SMART | 42 | 82 | 41 | 2.4E-4 | ||
| SUPERFAMILY | 61 | 292 | 232 | 1.99E-21 | – | |
| SMART | 123 | 148 | 26 | 68.0 | ||
| SMART | 149 | 176 | 28 | 390.0 | ||
| SMART | 177 | 202 | 26 | 20.0 | ||
| SMART | 203 | 228 | 26 | 150.0 | ||
| SMART | 251 | 275 | 25 | 340.0 | ||
| SUPERFAMILY | 344 | 746 | 403 | 8.53E-50 | ||
| Gene3D | 382 | 502 | 121 | 1.8E-21 | ||
| SMART | 416 | 456 | 41 | 27.0 | ||
| Pfam | 421 | 455 | 35 | 2.3E-4 | ||
| ProSiteProfiles | 427 | 469 | 43 | 8.697 | ||
| SMART | 457 | 497 | 41 | 0.0081 | ||
| Pfam | 462 | 496 | 35 | 3.1E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 468 | 510 | 43 | 11.812 | ||
| SMART | 498 | 541 | 44 | 1.1E-4 | ||
| Pfam | 499 | 541 | 43 | 3.7E-7 | ||
| Gene3D | 503 | 588 | 86 | 9.6E-18 | ||
| ProSiteProfiles | 509 | 554 | 46 | 12.162 | ||
| SMART | 542 | 583 | 42 | 0.033 | ||
| Pfam | 552 | 583 | 32 | 1.1E-5 | ||
| SMART | 588 | 628 | 41 | 6.6E-7 | ||
| Gene3D | 589 | 676 | 88 | 4.7E-23 | ||
| Pfam | 589 | 627 | 39 | 4.3E-9 | ||
| ProSiteProfiles | 599 | 641 | 43 | 15.452 | ||
| SMART | 629 | 672 | 44 | 0.0076 | ||
| Pfam | 629 | 671 | 43 | 4.6E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 640 | 685 | 46 | 10.377 | ||
| SMART | 673 | 713 | 41 | 0.0014 | ||
| Pfam | 675 | 712 | 38 | 1.3E-8 | ||
| Gene3D | 677 | 799 | 123 | 4.5E-17 | ||
| ProSiteProfiles | 684 | 726 | 43 | 13.597 | ||
| SMART | 714 | 755 | 42 | 6.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0496800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…