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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0529600 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0529600.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Importin-like protein; TAIR: AT2G31660.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|F4IRR2|SAD2_ARATH Importin beta-like SAD2; TrEMBL-Plants: tr|I1N4Z0|I1N4Z0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0529600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:105661307..105680163) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATCTATCTGGCCATTGGATTAGGTTGGTGTAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGCAAACATATAGCTAAACCA CCAATTTTACTTGTCGCAATAAATTAAAAACACTCCACCAAAGAAGTGGTTAAAAAACCCGTAAACGTAAACCCTAGTAG TTTAAAAAGCCTCCAACTTCCTCTCTCATTTCTCACTTCACCAATCCCAACGCACCACCACCACCACTCTCTGTTCGATT GCTTCACTCCGCCGCTCTCGCCGCCGGTGTCCTAAACCCTAGAAAGAAACCCCCTCTTCCTAGGGTTTAGCTTCCTCATC CATTTCCACTTCATCGTTGATCGGAGATTGATCGTGATGGATCTTCCTAGTCTCGCTGTTATACTCCAAGCCGCTCTTAG CCCCAATCCCGAAGAACGCAAAGCAGCTGAGCAGAGCTTGGATCAGGTAGTTAGTTCTCACTTCTTCATTTCTTGAATTT CGGATTTGCTGATCGTATTGCTGCTTTGTGTTGATTCAATGTTGCACTGCCTTAATTCCATGAATTTATCTTGATTCATG TTGATTATGCTGTTTATTTGCATTAGTGTTCATTTATGGGTGCTAATTGGGTGTAGCAGTGGTTTTAATTTGATGAAATT TCAATTTCAACTTTTAATTTTTTTGAAATTTTGTGATGTACAGTTCCAGTATGCACCTCAGCATCTGGTGAGACTGTTGC AAATTATTGTGGACAATAACTGTGACATGGGTGTGAGACAAGTGGCTAGCATTCATTTCAAGAACTTTATTGCCAAGAAT TGGTCTCCTCTTGACTCCGGTATATGCGCGCCGCCGCACTTTATTGTAGTTGGTGATTAAGATTAGAGAATGAATTTCTG AAGTCCTTTTGTTTAATTGATCATACTGTTCTTTATTTGCTGATATAGATGCCCCACAGAAGATATTGCAGAGTGATAAA 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AAGTATAGTCCATGAGCATTGATGAAGGCATCAATTTTGGGTTATATGAAGCCTTTCAAGGGTGCTTTGATGCAGGTTGT AATACAGTTAGTTCTTTGTGGGAAAAAATCAGATTGATTCTTGTTTAGTGAGGAATACCATGTAATAAGTTTTTGTAAGG TTTCAGAAGCTCCAGTCGCTCTTTCATCCAGAAAAGAAAAATACAAGGAATTGCTCTTATTGTATTGAAAATGTGTTTAT TTAGCAGCACGTTTTTCAAATAGCTCAAGTTGACATGGATATTAATATTTGAACATGCCGGCGGGGCCATGGTATTTTAC TGCTTTACCAAGTCGAAGGACCATCCTAGAATTAAGAATGTACAAAGAATGGTACATAATTTTGGTGCGGAACAGTCTTA GACACAATTTTCATAAAATTTTCAAATAATTTAATACTGAGTCAACTTTATTTTGATGGATAATATACATTTTGAAATAT AAGTAAATAATAACTTTTTTTTTGGTACCTCGAAAAGATAAATTACATCCACCATGGATTTTGATCCATGGACTTTCCTC TTTCCAATTTATATGTTTCTAGCTCTTGACACTTGAGCTATCATTTAGAGACAAAAT
CDS sequence (LotjaGi1g1v0529600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATCTTCCTAGTCTCGCTGTTATACTCCAAGCCGCTCTTAGCCCCAATCCCGAAGAACGCAAAGCAGCTGAGCAGAG CTTGGATCAGTTCCAGTATGCACCTCAGCATCTGGTGAGACTGTTGCAAATTATTGTGGACAATAACTGTGACATGGGTG TGAGACAAGTGGCTAGCATTCATTTCAAGAACTTTATTGCCAAGAATTGGTCTCCTCTTGACTCCGATGCCCCACAGAAG ATATTGCAGAGTGATAAAGATGTAGTGAGGAATCATATTCTCACGTTTGTTACTCAAGTTCCTCCTTTGTTGAGGGTGCA ACTCGGTGAGTGCCTGAAAACAGTTATACATTCTGATTATCCTGAACAGTGGCCTCATCTTCTTGATTGGGTGAAGCATA ACTTACAGGATCAACAAGTCTATGGTGCCTTATTTGTGCTGCGTATTCTTTCTAGAAAATACGAGTTCAAGTCAGATGAG GAGAGGACTCCGGTTTATCGCATTGTTGAGGAAACGTTTCCCCACCTTCTCGATATATTCAACAGGCTTGTCCAAATTGT TAATCCATCACTTGAAGTAGCAGATTTAATCAAGCTTATCTGTAAAATTTTCTGGTCCTCCATTTATTTAGAGATTCCAA AGCTGTTGTTTGATCAAAATATCTTCAATGCTTGGATGATACTTTTTCTAAATGTATTGGAGAGGCCTGTCCCCTTGGAA GGTCAACCTATGGATCCCGAGCTCAGAAAATCATGGGGTTGGTGGAAGGTCAAGAAGTGGACAGTTCACATTCTAAATAG GCTCTACACTCGTTTTGGTGACTTAAAGCTGCAAAACCCCGAAAACAAAGCCTTTGCTCAGATGTTTCAGAAGCATTATG CAGGGAAGATCTTAGAGTGTCACTTAAATCTGTTGAATGTTATTCGCGTCGGGGGCTATTTACCTGACAGAGTTATCAAC TTGATCCTTCAATATCTAAGCAACAGTATTTCAAGGAATAGTATGTATACTCTGCTGCAGCCTCGGCTTGATGTCCTCCT TTTTGAAATAGTTTTTCCCCTCATGTGCTTCAATGATAACGATCAAAAGCTTTGGGAGGAAGATCCACATGAGTATGTAA GGAAAGGCTATGACATAATTGAAGATTTGTATAGTCCTAGGACTGCGTCTATGGATTTTGTGAGTGAGTTGGTTCGAAAA CGCGGGAAAGAAAATCTTCATAAGTTCATTCAATTCATAGTTGAAATTTTCAGAAGGTATGATGAAGCTTCCATAGAATA CAAGCCGTATAGACAGAAAGATGGTGCTCTTCTTGCTATTGGTGCACTTTGTGACAAATTGAAGCAGTCCGAGCCGTACA AATCTGAACTTGAGCGTATGTTAGTGCAACATGTCTTTCCTGAGTTTAACAGTCCTGTTGGCCACCTTAGAGCTAAGGCA GCATGGGTTGCAGGACAATATGCCCATATTAACTTCTCAGATCAGAACAATTTCCGGAGGGCATTGCAGTGTGTTGTATC CAGAATGCAAGATCCCGAACTTCCTGTGCGTGTGGATTCTGTTTTTGCTTTGCGTTCTTTTATTGAAGCTTGCAAAGATT TGAATGAAATCCGTCCTATTCTTCCTCAGCTCCTTGATGAGTTTTTCAAACTTATGAATGAGGTTGAGAATGAGGACCTT GTATTTACTTTGGAGACTATTGTGGACAAGTTTGGGGAAGAAATGGCACCTTATGCACTTGGGCTGTGCCAAAATTTGGC AGCTGCATTTTGGAGATGTATGAACACTGCAGAAGCTGATGATGAAGCTGATGATCCAGGTGCTCTAGCTGCAGTTGGTT GTTTACGTGCTATTAGCACAATCCTTGAATCAGTGAGCAGGCTTCCTCACCTTTTTGTTCAAATTGAGCCAACCTTGCTT CCGATAATGCGAAGAATGTTAACAACTGATGGTCAAGAGGTTTTTGAAGAAGTTCTGGAGATTGTATCATATATGACCTT TTTCTCTCCAACAATATCATTGGATATGTGGACTCTTTGGCCGTTGATGATGGAAGCACTGGCAGATTGGGCAATTGATT TCTTTCCAAACATTTTAGTTCCTTTGGACAACTATATTTCAAGGGGAACTGCCCATTTCCTTACTTGCAAAGAACCCGAC TATCAACAGAGTCTATGGAACATGATTTCATCTATAATGGCTGATAAGAATATGGAGGATAATGATATTGTACCAGCTCC AAAGCTTATTGAAGTTGTCTTCCAGAATTGCAGAGGGCAGGTGGACCATTGGGTTGAGCCGTATCTCCGAATTACGGTTG AACGCTTGCATCGGACTGAAAAATCATATTTGAAATGTCTTTTCTTTCAAGTGATTGCAGATGCTCTATACTACAATGCT GTGCTGACTCTCAGCATACTGCAAAAGTTAGGTGTTGCATCAGAAATATTCCATGTTTGGTTTCATTTGCTGGAACAAGT CAAGAAGAGCGGTTTGCGTGCTAATTTCAAAAGGGAACATGAGAAGAAAGTGTGCTGCCTTGGTTTAACATCATTACTGG CACTCCCAGCTGATCAGTTACCAGGGGAGGCTTTAGGCCGGGTGTTCCGGGCCACTCTTGAACTTTTAGCTGCATACAAG GATCAAGTTGCAGAGGCTGCGAAAGAGGAAGAAGCTGAAGATGATGATGATATGGATGGCTTTCAGACTGATGATGACGA TGAGGATGGCAGTGGTTTTGACAAGGAAATGGGAGTTGATGGTGATGATGGGGATGAAGCTGATGCTATCACGCTTAGAA AGTTGGCTGAACAGGCGAAGTCATTCCGGCCCCATGATTCAGATGACGATGATTCAGATGATGACTTTAGTGATGATGAA GAGTTGCAGTCCCCAATTGACGAGGTGGATCCTTTTATTTTCTTTGTGGATGCAATCAAAGTGATACAATCTTCAGATCC ATTGAGGTTTGAGAACCTCACTCAGACACTTGAATTCAAATATCAAGCGCTTGCTAATGGCGTTGCTCAACATGCTGAGC TGAGACGAGCTGAAATTGAGAAGGAAAAATTAGAGAAGTCATCAGTTGGCACAGCTTCTTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0529600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDLPSLAVILQAALSPNPEERKAAEQSLDQFQYAPQHLVRLLQIIVDNNCDMGVRQVASIHFKNFIAKNWSPLDSDAPQK ILQSDKDVVRNHILTFVTQVPPLLRVQLGECLKTVIHSDYPEQWPHLLDWVKHNLQDQQVYGALFVLRILSRKYEFKSDE ERTPVYRIVEETFPHLLDIFNRLVQIVNPSLEVADLIKLICKIFWSSIYLEIPKLLFDQNIFNAWMILFLNVLERPVPLE GQPMDPELRKSWGWWKVKKWTVHILNRLYTRFGDLKLQNPENKAFAQMFQKHYAGKILECHLNLLNVIRVGGYLPDRVIN LILQYLSNSISRNSMYTLLQPRLDVLLFEIVFPLMCFNDNDQKLWEEDPHEYVRKGYDIIEDLYSPRTASMDFVSELVRK RGKENLHKFIQFIVEIFRRYDEASIEYKPYRQKDGALLAIGALCDKLKQSEPYKSELERMLVQHVFPEFNSPVGHLRAKA AWVAGQYAHINFSDQNNFRRALQCVVSRMQDPELPVRVDSVFALRSFIEACKDLNEIRPILPQLLDEFFKLMNEVENEDL VFTLETIVDKFGEEMAPYALGLCQNLAAAFWRCMNTAEADDEADDPGALAAVGCLRAISTILESVSRLPHLFVQIEPTLL PIMRRMLTTDGQEVFEEVLEIVSYMTFFSPTISLDMWTLWPLMMEALADWAIDFFPNILVPLDNYISRGTAHFLTCKEPD YQQSLWNMISSIMADKNMEDNDIVPAPKLIEVVFQNCRGQVDHWVEPYLRITVERLHRTEKSYLKCLFFQVIADALYYNA VLTLSILQKLGVASEIFHVWFHLLEQVKKSGLRANFKREHEKKVCCLGLTSLLALPADQLPGEALGRVFRATLELLAAYK DQVAEAAKEEEAEDDDDMDGFQTDDDDEDGSGFDKEMGVDGDDGDEADAITLRKLAEQAKSFRPHDSDDDDSDDDFSDDE ELQSPIDEVDPFIFFVDAIKVIQSSDPLRFENLTQTLEFKYQALANGVAQHAELRRAEIEKEKLEKSSVGTAS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 1 | 1006 | 1006 | 3.22E-141 | ||
| Gene3D | 1 | 965 | 965 | 8.8E-223 | ||
| Phobius | 1 | 23 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1 | 2 | 2 | - | – | |
| PANTHER | 3 | 1016 | 1014 | 0.0 | – | |
| Phobius | 3 | 14 | 12 | - | – | |
| PANTHER | 3 | 1016 | 1014 | 0.0 | – | |
| Phobius | 15 | 23 | 9 | - | – | |
| Phobius | 24 | 1033 | 1010 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 24 | 99 | 76 | 20.047 | ||
| Pfam | 24 | 98 | 75 | 1.9E-17 | ||
| SMART | 24 | 99 | 76 | 2.7E-11 | ||
| Pfam | 153 | 446 | 294 | 4.2E-8 | ||
| Coils | 876 | 896 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 886 | 925 | 40 | - | – | |
| MobiDBLite | 888 | 925 | 38 | - | – | |
| MobiDBLite | 938 | 963 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 948 | 963 | 16 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Intracellular protein transport | The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell. | ||
| Molecular function | Ran GTPase binding | Interacting selectively and non-covalently with Ran, a conserved Ras-like GTP-binding protein, implicated in nucleocytoplasmic transport, cell cycle progression, spindle assembly, nuclear organization and nuclear envelope (NE) assembly. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0529600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…