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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0554200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0554200.1 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Callose synthase; TAIR: AT5G13000.1 glucan synthase-like 12; Swiss-Prot: sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH Callose synthase 3; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QTX7|A0A0B2QTX7_GLYSO Callose synthase 3; Found in the gene: LotjaGi1g1v0554200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:108615963..108642084) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATATGATAAAGAAATGAAAAGAAAAGAAAAGAAAATGAAAAGAAAGGAAAAGCGTCTTTGTGAGTGGTACTGCTACTGCG CTTCGTATGTCCGCAACCAGCAATATTTAGTAACTCTCACTCTCTCTTTCTCTCTCTTGTTGTTACTCACTAGTCACTCA CTCATTGCTTCGCTTCGAAGTAGCTTTAGCTTTTCCACTCTCTTCCTCTTTCTGCATCTGCTAGGGTTTCTTTCCTCACC CAATGCCATCTTCACATGCTTGAATCAGAATCAGAATCTAAATCAAAATCTAAGTTGCATGTGAATGCATTGTAGGATTT GAAGAGAGAGAGAGAATGTCGTCGTCTTCCTCAAGGGGGCCGTCGGAACCACCGCCTCCACGGCGGATCACGCGGACGCA GACTGCAGGGAACTTGGGAGAGGCCATTTTTGACAGTGAGGTCGTTCCTTCCTCTCTCGTCGAGATTGCACCCATTCTTC GTGTTGCTAATGAGGTTGAGAAGACCCATCCCAGAGTTGCTTATCTATGTAAGGAAACCGGAATCAATTAACTCATCATA CTAGTTACTTATGTATGTTATTTATTTATGTTTACTGATCTCTGAGTTTTGTTCTTGTTTTTAGGTCGCTTTTACGCCTT TGAGAAAGCTCACAGATTGGACCCTACCTCCAGCGGTCGCGGTGTTCGCCAATTCAAAACCGCGCTTCTTCAACGCCTTG AAAGAGTAACCATTTCTCATCCAATTTACTTTATTTGGCACCCAGCTTGGGTTTTAGCCTATAGGAGCTTGTTAGTCGAG ATATTTATTTGAATCCTAACTTCTCTCATAAGTTGAAATTAGCATCCTCACCTAACTTCTCCAATAGCACCTGTAAACTT GTGAAGTCTTTTCATAAGTAAGGAAGCCAAATACTTATCTCATTTGAGAAGCTCCTATACACTCGAAGCTAATCTAAACT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0554200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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TCAGCTGCAGCATGGGTGATTGTTCTGTCTGTTACTTATGCTTATACTTGGGCTCACCCTCCTGGGTTTGCTAAAACCAT CAAAAGTTGGTTTGGAAGCAACAATTCAAGTGCCCCTTCATTATTTATTTTGGCCGTTGTTGTTTACCTGTCACCAAATA TGCTTGCTGCGGTACTCTTTTTGATCCCGTTCATTCGTCGTTTTCTCGAGAGATCAAACTATAGGATTGTGATGCTAATG ATGTGGTGGTCACAGCCTCGTCTGTATGTTGGTAGGGGAATGCACGAGAGTACATTTTGCCTTTTCAAGTACACGATGTT TTGGGTTCTCCTTATTATTACAAAGTTGGCTTTCAGTTACTATATAGAGATAAAACCTCTGGTGGCACCTACAAAAGCTA TAATGAGTGTCAAAATCACGACTTATCAGTGGCATGAATTCTTTCCCCATGCTAGGAACAATATTGGCGTTGTAGTTGCA CTTTGGGCTCCAATTATTCTGGTATACTTTATGGATACCCAAATTTGGTATGCCATATTCTCAACATTATTTGGTGGGAT TTATGGTGCATTTCGTCGCCTTGGGGAGATACGTACATTAGGAATGCTTAGGTCTCGTTTTCAATCATTGCCTGGTGCTT TCAATGCCAGTTTGATCCCAGAGGAAGCAAATGAGCGAAGGAAAAAAGGATTAAAAGCCACCTTATCTCGCAGATTTAGT CAGGTCATATCTAACAAGGGGAAGGAAGCTGCAAGGTTTGCTCAATTGTGGAACCAAATAATCACTAGTTTCAGAGAGGA AGATCTTATCAGTGATAGGGAAATGGACCTTTTGCTTGTACCTTACTGGGCTGATACTCAATTGGACCTTGTACAATGGC CCCCCTTTCTACTTGCTAGCAAGATCCCAATTGCATTAGATATGGCAAAGGACAGCAATGGGAAGGATCGAGAGCTAAAG AAAAGAATTGAGGCTGACAACTACATGTCTTGTGCTGTCCGTGAGTGCTATGCTTCATTTAAAAGCATTATTATGCACTT GGTTCAAGGGGAACGGGAGACACTAGTTATAGAGCAAATGTTCAAAGTAGTAGACGATCATATTGAAGAAGGTAAACTGA TTAGTGAATTCAGAATGAGTGCTCTTCCTAGCCTCTATGGACAGTTTGTTCAGCTAATAAAATATTTGTTGGAAAATAAT CAGAAAGATAGGGACCAAGTTGTGATTCTATTCCAGGACATGCTGGAGGTTGTGACAAGAGATATAATGATGGAGGTTCA GGACCAGGAGATATTCAGTTTGGTTGATTCAAGTCATGGTGGTGCTGGACATGAGGGGATGCTTCACCTTGAGCGTGAAC CACAGCACCAGTTATTTGCATCTGAAGGAGCTATCAGGTTTCCAATTGAACCTGTTACAGCAGCTTGGACAGAGAAGATT AAACGACTTTACTTGCTGCTTACGACAAAGGAATCTGCCATGGACGTACCATCTAACTTAGAAGCAAGAAGGCGTATTTC TTTCTTCTCAAATTCACTGTTTATGGTCATGCCAATGGCACCAAAAGTTCGCAACATGCTTTCATTCTCGGTCTTAACAC CATACTACACAGAAGAGGTTCTCTTCTCCTTACATGATTTAGATTCACCCAATGAAGATGGCGTTTCAATACTGTTTTAC TTGCAAAAGATATTTCCAGATGAGTGGAACAACTTTCTTGAGCGAGTGAAGTGCTCTAGTGAGGAGGAACTTAAAGGGAA TGAATCTGATGAGTTAGAAGAAGAACTTCGTCTTTGGGCTTCATATAGAGGGCAAACTTTGACTAGAACTGTTAGGGGTA TGATGTACTACAGAAAAGCTTTGGAGCTTCAAGCTTTTCTTGATATGGCTGAAGATGGAGATTTGATGGAAGGTTACAAA 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GTTGGATTTTATTTTAGCACTCTTATAACTGTTCTCACTGTATATGTATTCCTTTATGGTCGGCTCTATCTTGTTCTCAG TGGGCTTGAAGAGGGTTTGAGTACTCAAAAAGCCATTCGGGACAATAAGCCCCTTCAAGTGGCTCTTGCTTCTCAGTCAT TCGTTCAGATTGGGTTTTTAATGGCGTTACCCATGCTGATGGAAATTGGCTTGGAAAGGGGCTTCCGAACTGCACTTAGT GAGTTCATATTAATGCAGTTGCAGCTGGCCCCAGTATTCTTCACATTTTCACTCGGGACAAAGACTCACTATTTTGGAAG GACATTGCTTCATGGAGGTGCAAAATATAGATCCACAGGTCGAGGGTTTGTGGTTTTCCATGCTAAATTTGCAGACAATT ATAGACTTTACTCCCGTAGCCACTTTGTCAAGGGTATTGAGCTCATGATATTGCTTGTTGTATATCAAATTTTTGGTCAA AGTTATAGAAGTTCTGTTGCATATGTATTGATTACCATATCGATGTGGTTTATGGTGGGCACGTGGCTGTTTGCTCCCTT CTTGTTCAATCCCTCTGGGTTTGAATGGCAAAAAATTGTTGATGATTGGACTGATTGGAATAAATGGATTAGTAACCGAG GAGGTATAGGTGTACCACCTGAAAAAAGTTGGGAATCTTGGTGGGAAGAGGAACAAGATCATCTCCACTATTCAGGATTG CGTGGAATCATAGTGGAGATATTGTTATCATTGCGATTCTTTATCTACCAGTATGGTCTTGTATATCACTTGAAATTTAC AAAGAAGGGCGACAAAAGTTTTCTGGTATATGGCATTTCGTGGTTGGTGATCTTTGTAATATTGTTTGTGATGAAGACTG TGTCCGTTGGGAGGCGGAAATTCAGTGCAAATTTTCAACTTGTCTTCCGGCTAATCAAGGGAATGATATTCCTAACTTTT GTCTCTATTCTTGTTACTTTGATTGCCCTTCCACATATGACATTGCAGGACATTGTTGTTTGCATTCTTGCGTTCATGCC AACTGGTTGGGGAATGCTACAGATTGCTCAAGCATTAAAACCCCTTGTACGCCGTGCTGGATTTTGGGGATCAGTAAAAA CTCTTGCTCGCGGATATGAGATTGTGATGGGTTTGCTTTTGTTCACTCCTGTTGCTTTTCTGGCTTGGTTTCCTTTTGTT TCAGAGTTTCAAACCCGTATGCTGTTCAACCAAGCGTTCAGCAGAGGTTTGCAAATTTCTCGTATTCTTGGAGGTCAAAG GAAGGAGCGATCATCTCGCAACAAGGAATAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0554200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFGFQRHNVANQREHLILLLANVHIRQFPKPDQQPKLDERALTEVMKKLFKNYKKWCKYLGRKSSLWLPTIQQEVQQRKL LYMGLYLLIWGEAANLRFMPECLCYIYHHMAFELYGMLAGSVSPMTGENVKPAYGGEEEAFLRKVVTPIYNVIAQEAARS KKGRSKHSEWRNYDDLNEYFWSADCFRLGWPMRAEADFFCLRDELLVFDKSNDDKPPNKDRWVGKTNFVEIRSFWHIFRS FDRMWSFSILCLQAMIIVAWNGSGDPTVIFKGDVFKKVLSVFITAAILKLGQAFLDVILSWKAQRSMSLYVKLRYILKVI SAAAWVIVLSVTYAYTWAHPPGFAKTIKSWFGSNNSSAPSLFILAVVVYLSPNMLAAVLFLIPFIRRFLERSNYRIVMLM MWWSQPRLYVGRGMHESTFCLFKYTMFWVLLIITKLAFSYYIEIKPLVAPTKAIMSVKITTYQWHEFFPHARNNIGVVVA LWAPIILVYFMDTQIWYAIFSTLFGGIYGAFRRLGEIRTLGMLRSRFQSLPGAFNASLIPEEANERRKKGLKATLSRRFS QVISNKGKEAARFAQLWNQIITSFREEDLISDREMDLLLVPYWADTQLDLVQWPPFLLASKIPIALDMAKDSNGKDRELK KRIEADNYMSCAVRECYASFKSIIMHLVQGERETLVIEQMFKVVDDHIEEGKLISEFRMSALPSLYGQFVQLIKYLLENN QKDRDQVVILFQDMLEVVTRDIMMEVQDQEIFSLVDSSHGGAGHEGMLHLEREPQHQLFASEGAIRFPIEPVTAAWTEKI KRLYLLLTTKESAMDVPSNLEARRRISFFSNSLFMVMPMAPKVRNMLSFSVLTPYYTEEVLFSLHDLDSPNEDGVSILFY LQKIFPDEWNNFLERVKCSSEEELKGNESDELEEELRLWASYRGQTLTRTVRGMMYYRKALELQAFLDMAEDGDLMEGYK AMENSDDNSKGERSLWTQCQAVADMKFTYVVSCQQYGIDKRSGSPRAQGILRLMTRYPSLRVAYIDEVEEPVKDSKKKIN KVYYSCLVRAMPKSSSSSEPEQNLDQVIYKIKLPGPAILGEGKPENQNHAIIFTRGEGLQTIDMNQDNYMEEALKMRNLL QEFLKKHDGVRFPSILGLREHIFTGSVSSLAWFMSNQETSFVTIGQRLLANPLKVRFHYGHPDVFDRLFHLTRGGVSKAS KVINLSEDIFAGFNSTLREGNVTHHEYIQVGKGRDVGLNQISMFEAKIANGNGEQTLSRDVYRLGHRFDFFRMLSCYFTT VGFYFSTLITVLTVYVFLYGRLYLVLSGLEEGLSTQKAIRDNKPLQVALASQSFVQIGFLMALPMLMEIGLERGFRTALS EFILMQLQLAPVFFTFSLGTKTHYFGRTLLHGGAKYRSTGRGFVVFHAKFADNYRLYSRSHFVKGIELMILLVVYQIFGQ SYRSSVAYVLITISMWFMVGTWLFAPFLFNPSGFEWQKIVDDWTDWNKWISNRGGIGVPPEKSWESWWEEEQDHLHYSGL RGIIVEILLSLRFFIYQYGLVYHLKFTKKGDKSFLVYGISWLVIFVILFVMKTVSVGRRKFSANFQLVFRLIKGMIFLTF VSILVTLIALPHMTLQDIVVCILAFMPTGWGMLQIAQALKPLVRRAGFWGSVKTLARGYEIVMGLLLFTPVAFLAWFPFV SEFQTRMLFNQAFSRGLQISRILGGQRKERSSRNKE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 243 | 243 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 1712 | 1712 | 0.0 | ||
| PANTHER | 1 | 1712 | 1712 | 0.0 | – | |
| SMART | 77 | 193 | 117 | 1.3E-74 | ||
| Pfam | 79 | 191 | 113 | 5.2E-38 | ||
| Phobius | 244 | 261 | 18 | - | – | |
| TMHMM | 245 | 264 | 20 | - | – | |
| Phobius | 262 | 280 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 279 | 301 | 23 | - | – | |
| Phobius | 281 | 303 | 23 | - | – | |
| Phobius | 304 | 314 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 313 | 335 | 23 | - | – | |
| Phobius | 315 | 338 | 24 | - | – | |
| Phobius | 339 | 357 | 19 | - | – | |
| Phobius | 358 | 382 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 363 | 385 | 23 | - | – | |
| Phobius | 383 | 393 | 11 | - | – | |
| Phobius | 394 | 410 | 17 | - | – | |
| Phobius | 411 | 421 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 420 | 442 | 23 | - | – | |
| Phobius | 422 | 442 | 21 | - | – | |
| Phobius | 443 | 472 | 30 | - | – | |
| TMHMM | 468 | 490 | 23 | - | – | |
| Phobius | 473 | 490 | 18 | - | – | |
| Phobius | 491 | 495 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 495 | 512 | 18 | - | – | |
| Phobius | 496 | 515 | 20 | - | – | |
| Phobius | 516 | 1275 | 760 | - | – | |
| Pfam | 816 | 1525 | 710 | 1.0E-244 | ||
| Phobius | 1276 | 1298 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 1277 | 1299 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1299 | 1326 | 28 | - | – | |
| TMHMM | 1325 | 1347 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1327 | 1346 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1347 | 1357 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1358 | 1379 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 1362 | 1379 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1380 | 1420 | 41 | - | – | |
| TMHMM | 1416 | 1438 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1421 | 1438 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1439 | 1444 | 6 | - | – | |
| Phobius | 1445 | 1469 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 1448 | 1470 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1470 | 1522 | 53 | - | – | |
| TMHMM | 1522 | 1544 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1523 | 1542 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1543 | 1553 | 11 | - | – | |
| Phobius | 1554 | 1571 | 18 | - | – | |
| TMHMM | 1554 | 1576 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1572 | 1590 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 1588 | 1610 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1591 | 1611 | 21 | - | – | |
| Phobius | 1612 | 1617 | 6 | - | – | |
| TMHMM | 1615 | 1637 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1618 | 1639 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1640 | 1658 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 1658 | 1680 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1659 | 1680 | 22 | - | – | |
| Phobius | 1681 | 1716 | 36 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Cellular component | 1,3-beta-D-glucan synthase complex | A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain. | ||
| Molecular function | 1,3-beta-D-glucan synthase activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1). | ||
| Biological process | (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds. | ||
| Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0554200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…