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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi1g1v0554200 |
Transcript ID | LotjaGi1g1v0554200.5 |
Related isoforms 6 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Callose synthase; TAIR: AT5G13000.1 glucan synthase-like 12; Swiss-Prot: sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH Callose synthase 3; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QTX7|A0A0B2QTX7_GLYSO Callose synthase 3; Found in the gene: LotjaGi1g1v0554200 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:108616304..108641390) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCGTCTTCCTCAAGGGGGCCGTCGGAACCACCGCCTCCACGGCGGATCACGCGGACGCAGACTGCAGGGAACTTGGGAGA GGCCATTTTTGACAGTGAGGTCGTTCCTTCCTCTCTCGTCGAGATTGCACCCATTCTTCGTGTTGCTAATGAGGTTGAGA AGACCCATCCCAGAGTTGCTTATCTATGTAAGGAAACCGGAATCAATTAACTCATCATACTAGTTACTTATGTATGTTAT TTATTTATGTTTACTGATCTCTGAGTTTTGTTCTTGTTTTTAGGTCGCTTTTACGCCTTTGAGAAAGCTCACAGATTGGA CCCTACCTCCAGCGGTCGCGGTGTTCGCCAATTCAAAACCGCGCTTCTTCAACGCCTTGAAAGAGTAACCATTTCTCATC CAATTTACTTTATTTGGCACCCAGCTTGGGTTTTAGCCTATAGGAGCTTGTTAGTCGAGATATTTATTTGAATCCTAACT TCTCTCATAAGTTGAAATTAGCATCCTCACCTAACTTCTCCAATAGCACCTGTAAACTTGTGAAGTCTTTTCATAAGTAA GGAAGCCAAATACTTATCTCATTTGAGAAGCTCCTATACACTCGAAGCTAATCTAAACTGAGCATTGATGGTATATAGAA TGAATAGTTTGCTTAGTGAGATTGGATGGTCCTTGTATTAATTCTAACTCTATATTTTTCTTTTGGTCAATTTGTTCTTT AATTGTTAGGAAAATGATCCGACCCTGAAGGGAAGGGTGAAGAAAAGCGATGCTCGTGAAATGCAGAGTTTTTATCAGCA TTACTACAAAAAATATATACAAGCTTTACAAAATGCTGCTGATAAAGCTGACCGGTATGTTCCCTAGATAATTTCAATTT GATATTATCTGGCTATTGTATGAACTATAGTTTGTCTGTTCTTGCAGTGCACAGCTTACCAAGGCATATCAAACTGCTAA 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TCTTAAATATGAACACAAAACATATACTAAGTCTATTAGAAATTGGTGGATTGACCTTGTTAGAAATAAACATTTGAGAT TGATTTCATCTCCATTGAAATAGGGTGGCAAATTAATTTAGTCTTCAGTCCATTTTAATTTAAAGCTGTGCTTTTGACTG ATTTTTGGTCTACTAACTAATACATAAGGCTGTAGGAAGCATAAATTGTCACTAATTTGGACAGCCCGAGTACTGAGTAC CTATAGATAAAAATAAATGTATAACCTGCTCTCTGTTTTCTGCTTACGCAGGGTTCGTTTCCACTATGGTCATCCCGATG TCTTCGATAGGCTTTTTCACCTGACAAGAGGGGGTGTCAGTAAAGCCTCCAAGGTTATCAATCTAAGTGAAGATATTTTT GCTGGTACAGTGTAGTCCAATCCCTCTTAGTATGCTTTGAATTTGAGTATATTTTAATTGGTGTTTTTCCATTATTTCCA TTTATCAGGCTTCAACTCTACACTCCGGGAAGGAAATGTTACCCATCATGAGTACATACAGGTTGGGAAGGGAAGAGATG TGGGTCTCAACCAAATTTCTATGTTTGAAGCAAAGATAGCTAATGGCAATGGAGAGCAAACACTAAGTCGAGATGTATAC CGACTTGGGCACCGCTTTGACTTCTTCAGAATGTTGTCCTGCTATTTCACCACAGTTGGATTTTATTTTAGCACTCTTGT ATGTTATCACCAGAGTTGACGTTTACTTGCATATTACTTAGGTTTTCCTTTTTTTATTTTCAATTAGGAAGATCCCTAGT GGGATCTAATGGGTAATAGGAAATGGCAGGTGGAGGGGATTGAAACCCTTACCTAACAGCTGCCCCCTGATCTTAAAGTC CAGGGACGTACCCTGTGAGCTAAAGAACCCTGTTATATTTTTAGTTTTTATATGATTGACTTCTGAATCTCTTCTTTTCC 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0554200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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GCTGAAGCTGATTTCTTTTGCCTGCGAGATGAGCTGTTGGTTTTTGACAAATCTAATGATGACAAGCCACCTAACAAAGA CAGATGGGTTGGGAAAACAAATTTTGTCGAGATAAGGTCGTTTTGGCATATTTTCAGAAGTTTTGATCGCATGTGGAGCT TTTCGATTCTGTGTTTACAGGCTATGATTATTGTTGCTTGGAATGGATCTGGGGATCCAACTGTAATCTTTAAAGGTGAT GTATTCAAGAAGGTGTTGAGTGTGTTTATAACAGCCGCTATATTGAAGCTTGGACAAGCTTTTCTTGATGTGATCCTAAG TTGGAAAGCACAACGGAGTATGTCGCTGTATGTTAAGTTAAGATACATCCTAAAAGTTATTTCAGCTGCAGCATGGGTGA TTGTTCTGTCTGTTACTTATGCTTATACTTGGGCTCACCCTCCTGGGTTTGCTAAAACCATCAAAAGTTGGTTTGGAAGC AACAATTCAAGTGCCCCTTCATTATTTATTTTGGCCGTTGTTGTTTACCTGTCACCAAATATGCTTGCTGCGGTACTCTT TTTGATCCCGTTCATTCGTCGTTTTCTCGAGAGATCAAACTATAGGATTGTGATGCTAATGATGTGGTGGTCACAGCCTC GTCTGTATGTTGGTAGGGGAATGCACGAGAGTACATTTTGCCTTTTCAAGTACACGATGTTTTGGGTTCTCCTTATTATT ACAAAGTTGGCTTTCAGTTACTATATAGAGATAAAACCTCTGGTGGCACCTACAAAAGCTATAATGAGTGTCAAAATCAC GACTTATCAGTGGCATGAATTCTTTCCCCATGCTAGGAACAATATTGGCGTTGTAGTTGCACTTTGGGCTCCAATTATTC TGGTATACTTTATGGATACCCAAATTTGGTATGCCATATTCTCAACATTATTTGGTGGGATTTATGGTGCATTTCGTCGC 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ATGCCAATGGCACCAAAAGTTCGCAACATGCTTTCATTCTCGGTCTTAACACCATACTACACAGAAGAGGTTCTCTTCTC CTTACATGATTTAGATTCACCCAATGAAGATGGCGTTTCAATACTGTTTTACTTGCAAAAGATATTTCCAGATGAGTGGA ACAACTTTCTTGAGCGAGTGAAGTGCTCTAGTGAGGAGGAACTTAAAGGGAATGAATCTGATGAGTTAGAAGAAGAACTT CGTCTTTGGGCTTCATATAGAGGGCAAACTTTGACTAGAACTGTTAGGGGTATGATGTACTACAGAAAAGCTTTGGAGCT TCAAGCTTTTCTTGATATGGCTGAAGATGGAGATTTGATGGAAGGTTACAAAGCCATGGAAAACTCGGATGACAACTCAA AAGGGGAAAGGTCATTGTGGACTCAGTGCCAAGCAGTGGCTGATATGAAATTCACATATGTGGTATCATGCCAACAATAT GGTATTGACAAGCGCTCTGGATCTCCTCGTGCACAAGGCATACTAAGGCTTATGACAAGATATCCTTCACTTCGCGTTGC CTATATTGATGAGGTAGAAGAACCTGTCAAAGACAGTAAGAAAAAGATCAACAAGGTTTACTACTCTTGCTTGGTGAGGG CTATGCCAAAATCCAGTAGTTCTTCAGAGCCTGAGCAGAATCTGGACCAGGTCATATATAAGATAAAGCTTCCTGGACCA GCAATTTTAGGTGAGGGTAAGCCTGAAAATCAGAATCATGCCATAATTTTCACACGTGGAGAAGGCTTGCAAACAATAGA CATGAATCAGGATAACTATATGGAAGAAGCATTAAAAATGAGAAATTTGTTGCAAGAATTTCTTAAGAAGCATGATGGGG TGAGGTTCCCAAGTATTCTTGGACTTAGGGAGCATATATTTACTGGAAGTGTTTCTTCCCTTGCATGGTTCATGTCAAAT CAGGAGACAAGTTTCGTGACAATTGGTCAAAGATTGTTGGCTAATCCCCTGAAGGTTCGTTTCCACTATGGTCATCCCGA TGTCTTCGATAGGCTTTTTCACCTGACAAGAGGGGGTGTCAGTAAAGCCTCCAAGGTTATCAATCTAAGTGAAGATATTT TTGCTGGCTTCAACTCTACACTCCGGGAAGGAAATGTTACCCATCATGAGTACATACAGGTTGGGAAGGGAAGAGATGTG GGTCTCAACCAAATTTCTATGTTTGAAGCAAAGATAGCTAATGGCAATGGAGAGCAAACACTAAGTCGAGATGTATACCG ACTTGGGCACCGCTTTGACTTCTTCAGAATGTTGTCCTGCTATTTCACCACAGTTGGATTTTATTTTAGCACTCTTATAA CTGTTCTCACTGTATATGTATTCCTTTATGGTCGGCTCTATCTTGTTCTCAGTGGGCTTGAAGAGGGTTTGAGTACTCAA AAAGCCATTCGGGACAATAAGCCCCTTCAAGTGGCTCTTGCTTCTCAGTCATTCGTTCAGATTGGGTTTTTAATGGCGTT ACCCATGCTGATGGAAATTGGCTTGGAAAGGGGCTTCCGAACTGCACTTAGTGAGTTCATATTAATGCAGTTGCAGCTGG CCCCAGTATTCTTCACATTTTCACTCGGGACAAAGACTCACTATTTTGGAAGGACATTGCTTCATGGAGGTGCAAAATAT AGATCCACAGGTCGAGGGTTTGTGGTTTTCCATGCTAAATTTGCAGACAATTATAGACTTTACTCCCGTAGCCACTTTGT CAAGGGTATTGAGCTCATGATATTGCTTGTTGTATATCAAATTTTTGGTCAAAGTTATAGAAGTTCTGTTGCATATGTAT TGATTACCATATCGATGTGGTTTATGGTGGGCACGTGGCTGTTTGCTCCCTTCTTGTTCAATCCCTCTGGGTTTGAATGG CAAAAAATTGTTGATGATTGGACTGATTGGAATAAATGGATTAGTAACCGAGGAGGTATAGGTGTACCACCTGAAAAAAG TTGGGAATCTTGGTGGGAAGAGGAACAAGATCATCTCCACTATTCAGGATTGCGTGGAATCATAGTGGAGATATTGTTAT CATTGCGATTCTTTATCTACCAGTATGGTCTTGTATATCACTTGAAATTTACAAAGAAGGGCGACAAAAGTTTTCTGGTA TATGGCATTTCGTGGTTGGTGATCTTTGTAATATTGTTTGTGATGAAGGTTGGTGACAAACTACTGCTTATTAGGGACAT GTCATAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0554200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MQSFYQHYYKKYIQALQNAADKADRAQLTKAYQTANVLFEVLKAVNMTQSMEVDREILETQDKVAQKTEILVPYNLLPLD PDSANQAIMRFPEIQASVYALRNTRGLPWPKDYKKKKDEDILDWLGSMFGFQRHNVANQREHLILLLANVHIRQFPKPDQ QPKLDERALTEVMKKLFKNYKKWCKYLGRKSSLWLPTIQQEVQQRKLLYMGLYLLIWGEAANLRFMPECLCYIYHHMAFE LYGMLAGSVSPMTGENVKPAYGGEEEAFLRKVVTPIYNVIAQEAARSKKGRSKHSEWRNYDDLNEYFWSADCFRLGWPMR AEADFFCLRDELLVFDKSNDDKPPNKDRWVGKTNFVEIRSFWHIFRSFDRMWSFSILCLQAMIIVAWNGSGDPTVIFKGD VFKKVLSVFITAAILKLGQAFLDVILSWKAQRSMSLYVKLRYILKVISAAAWVIVLSVTYAYTWAHPPGFAKTIKSWFGS NNSSAPSLFILAVVVYLSPNMLAAVLFLIPFIRRFLERSNYRIVMLMMWWSQPRLYVGRGMHESTFCLFKYTMFWVLLII TKLAFSYYIEIKPLVAPTKAIMSVKITTYQWHEFFPHARNNIGVVVALWAPIILVYFMDTQIWYAIFSTLFGGIYGAFRR LGEIRTLGMLRSRFQSLPGAFNASLIPEEANERRKKGLKATLSRRFSQVISNKGKEAARFAQLWNQIITSFREEDLISDR EMDLLLVPYWADTQLDLVQWPPFLLASKIPIALDMAKDSNGKDRELKKRIEADNYMSCAVRECYASFKSIIMHLVQGERE TLVIEQMFKVVDDHIEEGKLISEFRMSALPSLYGQFVQLIKYLLENNQKDRDQVVILFQDMLEVVTRDIMMEVQDQDLVD SSHGGAGHEGMLHLEREPQHQLFASEGAIRFPIEPVTAAWTEKIKRLYLLLTTKESAMDVPSNLEARRRISFFSNSLFMV MPMAPKVRNMLSFSVLTPYYTEEVLFSLHDLDSPNEDGVSILFYLQKIFPDEWNNFLERVKCSSEEELKGNESDELEEEL RLWASYRGQTLTRTVRGMMYYRKALELQAFLDMAEDGDLMEGYKAMENSDDNSKGERSLWTQCQAVADMKFTYVVSCQQY GIDKRSGSPRAQGILRLMTRYPSLRVAYIDEVEEPVKDSKKKINKVYYSCLVRAMPKSSSSSEPEQNLDQVIYKIKLPGP AILGEGKPENQNHAIIFTRGEGLQTIDMNQDNYMEEALKMRNLLQEFLKKHDGVRFPSILGLREHIFTGSVSSLAWFMSN QETSFVTIGQRLLANPLKVRFHYGHPDVFDRLFHLTRGGVSKASKVINLSEDIFAGFNSTLREGNVTHHEYIQVGKGRDV GLNQISMFEAKIANGNGEQTLSRDVYRLGHRFDFFRMLSCYFTTVGFYFSTLITVLTVYVFLYGRLYLVLSGLEEGLSTQ KAIRDNKPLQVALASQSFVQIGFLMALPMLMEIGLERGFRTALSEFILMQLQLAPVFFTFSLGTKTHYFGRTLLHGGAKY RSTGRGFVVFHAKFADNYRLYSRSHFVKGIELMILLVVYQIFGQSYRSSVAYVLITISMWFMVGTWLFAPFLFNPSGFEW QKIVDDWTDWNKWISNRGGIGVPPEKSWESWWEEEQDHLHYSGLRGIIVEILLSLRFFIYQYGLVYHLKFTKKGDKSFLV YGISWLVIFVILFVMKVGDKLLLIRDMS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 1697 | 1697 | 0.0 | ||
PANTHER | 1 | 1697 | 1697 | 0.0 | – | |
Phobius | 1 | 370 | 370 | - | – | |
Coils | 9 | 29 | 21 | - | – | |
SMART | 204 | 320 | 117 | 1.3E-74 | ||
Pfam | 206 | 318 | 113 | 5.2E-38 | ||
Phobius | 371 | 388 | 18 | - | – | |
TMHMM | 372 | 391 | 20 | - | – | |
Phobius | 389 | 407 | 19 | - | – | |
TMHMM | 406 | 428 | 23 | - | – | |
Phobius | 408 | 430 | 23 | - | – | |
Phobius | 431 | 441 | 11 | - | – | |
TMHMM | 440 | 462 | 23 | - | – | |
Phobius | 442 | 465 | 24 | - | – | |
Phobius | 466 | 484 | 19 | - | – | |
Phobius | 485 | 509 | 25 | - | – | |
TMHMM | 490 | 512 | 23 | - | – | |
Phobius | 510 | 520 | 11 | - | – | |
Phobius | 521 | 537 | 17 | - | – | |
Phobius | 538 | 548 | 11 | - | – | |
TMHMM | 547 | 569 | 23 | - | – | |
Phobius | 549 | 569 | 21 | - | – | |
Phobius | 570 | 599 | 30 | - | – | |
TMHMM | 595 | 617 | 23 | - | – | |
Phobius | 600 | 617 | 18 | - | – | |
Phobius | 618 | 622 | 5 | - | – | |
TMHMM | 622 | 639 | 18 | - | – | |
Phobius | 623 | 642 | 20 | - | – | |
Phobius | 643 | 1399 | 757 | - | – | |
Pfam | 940 | 1649 | 710 | 3.3E-245 | ||
Phobius | 1400 | 1422 | 23 | - | – | |
TMHMM | 1401 | 1423 | 23 | - | – | |
Phobius | 1423 | 1450 | 28 | - | – | |
TMHMM | 1449 | 1471 | 23 | - | – | |
Phobius | 1451 | 1470 | 20 | - | – | |
Phobius | 1471 | 1481 | 11 | - | – | |
Phobius | 1482 | 1503 | 22 | - | – | |
TMHMM | 1486 | 1503 | 18 | - | – | |
Phobius | 1504 | 1544 | 41 | - | – | |
Phobius | 1545 | 1562 | 18 | - | – | |
Phobius | 1563 | 1568 | 6 | - | – | |
Phobius | 1569 | 1593 | 25 | - | – | |
TMHMM | 1570 | 1592 | 23 | - | – | |
Phobius | 1594 | 1646 | 53 | - | – | |
TMHMM | 1647 | 1666 | 20 | - | – | |
Phobius | 1647 | 1666 | 20 | - | – | |
Phobius | 1667 | 1677 | 11 | - | – | |
TMHMM | 1678 | 1695 | 18 | - | – | |
Phobius | 1678 | 1698 | 21 | - | – | |
Phobius | 1699 | 1708 | 10 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
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Cellular component | 1,3-beta-D-glucan synthase complex | A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain. | ||
Molecular function | 1,3-beta-D-glucan synthase activity | Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1). | ||
Biological process | (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds. | ||
Cellular component | Membrane | A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0554200.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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