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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0785100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0785100.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Exportin-4; TAIR: AT3G04490.2 exportin-4 protein; Swiss-Prot: sp|Q499Y0|XPO4_XENLA Exportin-4; TrEMBL-Plants: tr|K7N067|K7N067_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0785100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:135760506..135775797) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCTCTCAGCTTCAAATATGTGTGTGTGAAGTGATGGAATAAAGTTTCTACAAGCATTTTATTTTTTGTATGAACTCATAG GAATACAAATACATGTCTAATCATGTCCTTGTTATGTATTTGTTTTCAGATCCCTATTAATCCAGGAGCTACTGAGGCAA TTATATTGTCATTAGGCCAGTCTTCTCAGCCATATAAGACTTGTCAATTCATTCTTGGTGAGTTTACATTTGTTGTTTTC AAGCAAAATATTTGCTTATACAAATGGAACTAGTATGCCAAATAAATGATTTGAAGTAATCACTGGCAGGCAAGAATATG CAAATCAACTTGGATTATAAGTGTTGATGGACATGTTTATGCTACATTTACTACTTTACTTAATCATCACATTCCAGGAC CTACTGCTGTTTTAAAATGTGAAAATTGCTGTTCAAATAATTTCCTAAAGTCATCATTTGTATCTTAGATAATATTAGTG TATTTTTGGTTTTGCTTGATAATTGGATAGTGAAAACAGCCAACTTGAATGCAATTCATTAGTATCATGCTATGCTTATT GCCAAGTAATTGTTCAGTAATTTAATTTGTCTCATCAGTAAAAATATAAATGACTCCGCTATTTGATATTTAGGACACTT TTTTAGCAGTGATGCAAATACTATGTATGCATGAGAGGTAAGGAGAACAAATAGAGTAGAAGGAAGGGGAAAAGTGATCA AAACTTTGTAATGTTTTTAAGGAGAGTTAAGCAGGGTAGTGTTCCCCCCTTCTTCCTCCTCAAGGTCCCAAAATTATGGA GTAAGAGTTTTCTTTAAATAAATAAATTGAAGTATCCTCTATCTCTTTCCCCAAAATTAACTCCCGAAAGAAGTGGAAAA GAAGAAGGATCAATTGTCCCTCCATCTCTTCCCTACATTTTACCTTCTCTTCCTCCAACTTCTCTGCTCAAAAGCTTCCA 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CGTCTGAGTCTGCCTTTCGACTTTCTTTGTCTGGGCTAGTACTCTAGCGGGAACATCGGAGTTCCTTGGACTTGTGCTCC TTCGTCTGAGTCTGAGGTCTTGGCTTGCGCAAATGGGACTGCCATTTTTGCTGCTGCTTTTTTTCAGCCTCCCTAACTCT AATATAGTATCAGAGTCTGTCCTAGATCCATTTGTTGACTCCCCATATTTGGGTAGTGCAAACCTCAACTCTTGAGCTAG CTTTTCGGTTGAGTTAGGCCTCCCTAATTCTTGATTACTTAATTGTTTAAGCCTTGATTAGTACTGTATAAAAAGTGAAC GACAGATGAACTTATGTTGCTTTTTCTCTTCAATGACGAATATACAATTTACTTTTCACATCAGGATTATGTTTTCAAGA TTTTTGTTCTCTTTCAAATCAAACATAGATTCCTTAATGCTCTGTTTTTTGTGAATAATTATAACATTATTTTGAAGATA GCATATTCATTGTCTTTTGTGGTCTTTTTCAGAGAGGAACATCCATTATGAATCAGCATATATTCCTATTTTTTGTGTTA CCCAAAATTTTAGAAGTTCGTAAATAATCACTAGTCCCGATACACTATTGTACTGCATATCCAAGTATTCCTGCCATGAT TTTCATCCTCCATTTAATAAATGGTTCCTGAATTTGAGAGGTTTTGGGTATATTTCTTTGCAGAGACTGGGCAATGAATT GATAGAGAGACTAGCAAATCCAACACTCAGATCAAGGCTCGCCAATGCTTTGCATGCACTAACAAGTGCAAATCAGCTTT CTTCCTCCCTTGATCGAATAAATTACCAGAGATTTAGGAAAAATCTTAACATCTTCCTTGTTGAAGTTCGTGGATTTCTG AGGACCATGTGA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0785100.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCCTTGTTATGTATTTGTTTTCAGATCCCTATTAATCCAGGAGCTACTGAGGCAATTATATTGTCATTAGGCCAGTC TTCTCAGCCATATAAGACTTGTCAATTCATTCTTGAAAATTCCCTGGTAGCAACTGCAAGGTTTCACGCGGCTGCAGCAA TCAGAGAAGCAGCTATCAGAGAATGGGGTTTTCTTAATACTGATGACAAGAGAGGCTTGATTAGTTTTTGTCTATGCTAT GCTATGCAACATGCGAGTTCTCCTGATGGCTATGTCCAAGCAAAGGTATCTTCTGTGGCTGCTCAGTTGATGAAAAGGGC TTGGCTTGAGTTTGCAGCAGCAGAGAAGGAGACACTCTTTTATCAGGTGAACCAGGCTATTGTGGGCATTCATGGATTAG ATGTGCAGTTTGCTGGAATCAAATTTCTTGAATCGTTGGTATCTGAATTTTCTCCATCTACTTCAAGTGCTATGGGCCTT CCAAGGGAATTTCATGAGCAGTGTAGGACTTCATTTGAAAAAGACTACCTGAAGACATTCTACCGATGGACACAAGAAGC TGCTTCAAGTGTCACAAGTAGGATTATTGAATCTGACTCTGTTGTACCTGAGGTTAAAGTTTGCACTACTGCACTGGATC TCATGCTTCAAATCCTAAATTGGGATTTTCGTTGCAATACCAGTGACACAAAAATAAATGTAAATATCTTCTCTTCTGGA GTTAGGCAAGACGGGGATACTCCTAAAAGATCTGAATGTCACCTAGTGCAGCCTGGTTCAGATTGGCGTGACGTGTTGAT ATTAAGTGGTCATGTTGGATGGCTTTTGAGTCTATACGCAGCATTGAGGCAGAAGTTTTCACGTGAAGGCTACTGGCTTG ACTGCCCTATTGCAGTCTCTGCTCGAAAGCTAATTGTACAATTTTGTTCTTTAACAGGAACTGTATTTCTTTCTGATGAT AAAAAAATGCATGAGCACCATCTTCTGCAACTCCTCTCAGGGATAATAGCGTGGGTAGATCCTCCTGAAGCTGTTTCAAA AGCTATTGAATGTGGGAGAAGTGAAAGTGAGATGCTTGATGGTTGTCGTGCACTATTGGCTCTTGCAAATGTAACAAATC CCTGTGTGTTTGACGATCTCCTAAAGTCCATGAGGCCCATTGGTACCCTTACCTTTTTGTCGATGTTGATGTCTGAAGTA ATTAAAGTCCTCATGACTAACAACACTGAAGAGGAGTCTTGGAGCTATGAAGCTCGTGATGTCTTATTGGATACTTGGAC TGCCCTTCTAATGCCAATAAATACTATCACTGTGAATGCTTTGCTTCCGTCTGAAGGGATACAAGCTGCTGCAAATCTCT TTGGTTTCATTGTTGAATGCGAGCTAAGAATGGCCTCTGCTTCAGCATTTAATGATGGGGGCGATTCAGATTATCTTCAT GGTTCTGTATCTGCCATGGATGAAAGGTTAAGCTCCTATGCTCTTATTGCACGAGCTGCAATTGATGTTACAATTCCTTT ACTTATGAGAGTGTTTTCTGAACGGGTTGCACGCCTTAATCAGGGCAGGGGCATTATGGACTTGACTGAAACTATGGAAG AGCTTTATTCATTGTTGCTTATTATTGGCCATGTAATTGCAGACGAAGGGGAGGGGGAAACACCTCTGGTTCCTAATGCC ATACAAACCCAAGTAGTTGTGGATTCTGTGGAAGAAGATAAACATCCTGTTATTTTACTTTCCAGCTCAATCTTAAAATT TGCTGAGCAGTGCCTAAATCCAGAAATGAGAGCATCAATTTTCAGTCCCCGACTTATGGAGTCAATTATATGGTTCCTTG CAAGGTGGTCTCATACATATTTAATGTCTTGCGATGGGATTGGGGAGAAAATCTTGGATTCAAGTCATCATTATGAGCAT AGTTCAAAAAAGGCTTTGCTTAGTTTCTTTGGAGAGCATAAACAAGGGAGACTTGTTCTTGATATTATTGTCCATATATC CTTGATCACACTTACGTCCTATCCCGGGGAAAAGGATCTGCAGGGCCTCACTTGTTACCTTCTACTTCATTCCTTGGTTC AGCACAAGCATATATGCATTCACCTTGTTACTCTGAATTCATGGCATGAACTAGCAACTGCATTTTCCGGTGAAAAGACG TTGTTCTTGTTGGACACTGCTCATCAGCGGTCTCTTGCACAAACACTTGTTCGCTCAGCCTCGGGCATAAAAAATTTAGA AGCATCAAACCAGTATGTAAGGAATCTCATGGGTCATATTGCTAAATATATAGTGGAGATATCCAGCAAGAGTAATTTCA AAAGTATTGCCCAACAACCAGATATCCTCCTGTCGGTCAGCTGCATGTTAGAACGGCTACGAGGAGCTGCAAGTGCTTCT GAACCTCGAACACAGAAGGCAATCTATGAGCTAGGATTCTCTGTAATGAATCCCATACTAGTTCTTCTTGAATCTGCAGT AGTCTACCTGCTACTTAAATTTGTAGTTGGTTGGGTCGATGGACAAATTACTTACTTGGAGGCCCAAGAAACTGCTGCTG TTGTTGATTTCTGCATGCGCTTACTACAGCTGTATTCATCTCACAATATTGGCAAGATATCGCTTAGTCTTTCAAGCAGC TTACTTAGTGAGGCAAAAACAGATCAGTATAGAGATTTGCGAGCTCTTCTTCAACTTCTTTCGAGTCTTTGCTCTAAAGA CATGATTGATTTCTCATCAGATTCAATTGAGACCCAAGGCACTAACATATCTCAGGTGGTTTACTTTGGTCTTCACATAG TTACACCACTGATTTCAATGGACCTCCTGAAATATCCCAAACTTTGTCATGATTATTTTTCTCTCTTGTCCCATATGTTG GAGGTTTATCCTGAAACATTCGCACAACTGAATAGAGAAGCCTTTGCTCATGTACTTGGGACCCTTGATTTTGGCCTTCA CCATCAGGATGCAGATGTGGTTAGTAAGTGTTTGAGAGCTCTTCAAGCTCTTGCTTCCTACCACTACAAGGAGACTGCTA ATGGTAATATAGGCTTGGGTTCACATGCCGTTGGTCTTGAGGATTCAAGTGGTAAGATTCAAGAAGGCCTTCTGAGCCGC TTTCTCCGTTCATTGTTGCAGTTACTCCTTTTTGAGGATTACAGTTCTGATCTAATCAGCGTTGCAGCAGATGCTCTCCT TCCATTAATCCTATGTGAACAAGGCCTGTATCAGAGACTGGGCAATGAATTGATAGAGAGACTAGCAAATCCAACACTCA GATCAAGGCTCGCCAATGCTTTGCATGCACTAACAAGTGCAAATCAGCTTTCTTCCTCCCTTGATCGAATAAATTACCAG AGATTTAGGAAAAATCTTAACATCTTCCTTGTTGAAGTTCGTGGATTTCTGAGGACCATGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0785100.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSLLCICFQIPINPGATEAIILSLGQSSQPYKTCQFILENSLVATARFHAAAAIREAAIREWGFLNTDDKRGLISFCLCY AMQHASSPDGYVQAKVSSVAAQLMKRAWLEFAAAEKETLFYQVNQAIVGIHGLDVQFAGIKFLESLVSEFSPSTSSAMGL PREFHEQCRTSFEKDYLKTFYRWTQEAASSVTSRIIESDSVVPEVKVCTTALDLMLQILNWDFRCNTSDTKINVNIFSSG VRQDGDTPKRSECHLVQPGSDWRDVLILSGHVGWLLSLYAALRQKFSREGYWLDCPIAVSARKLIVQFCSLTGTVFLSDD KKMHEHHLLQLLSGIIAWVDPPEAVSKAIECGRSESEMLDGCRALLALANVTNPCVFDDLLKSMRPIGTLTFLSMLMSEV IKVLMTNNTEEESWSYEARDVLLDTWTALLMPINTITVNALLPSEGIQAAANLFGFIVECELRMASASAFNDGGDSDYLH GSVSAMDERLSSYALIARAAIDVTIPLLMRVFSERVARLNQGRGIMDLTETMEELYSLLLIIGHVIADEGEGETPLVPNA IQTQVVVDSVEEDKHPVILLSSSILKFAEQCLNPEMRASIFSPRLMESIIWFLARWSHTYLMSCDGIGEKILDSSHHYEH SSKKALLSFFGEHKQGRLVLDIIVHISLITLTSYPGEKDLQGLTCYLLLHSLVQHKHICIHLVTLNSWHELATAFSGEKT LFLLDTAHQRSLAQTLVRSASGIKNLEASNQYVRNLMGHIAKYIVEISSKSNFKSIAQQPDILLSVSCMLERLRGAASAS EPRTQKAIYELGFSVMNPILVLLESAVVYLLLKFVVGWVDGQITYLEAQETAAVVDFCMRLLQLYSSHNIGKISLSLSSS LLSEAKTDQYRDLRALLQLLSSLCSKDMIDFSSDSIETQGTNISQVVYFGLHIVTPLISMDLLKYPKLCHDYFSLLSHML EVYPETFAQLNREAFAHVLGTLDFGLHHQDADVVSKCLRALQALASYHYKETANGNIGLGSHAVGLEDSSGKIQEGLLSR FLRSLLQLLLFEDYSSDLISVAADALLPLILCEQGLYQRLGNELIERLANPTLRSRLANALHALTSANQLSSSLDRINYQ RFRKNLNIFLVEVRGFLRTM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 19 | 19 | - | – | |
| Phobius | 1 | 2 | 2 | - | – | |
| Phobius | 3 | 10 | 8 | - | – | |
| PANTHER | 4 | 1138 | 1135 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 4 | 1138 | 1135 | 0.0 | – | |
| Phobius | 11 | 19 | 9 | - | – | |
| Gene3D | 15 | 238 | 224 | 8.4E-21 | ||
| SUPERFAMILY | 18 | 1105 | 1088 | 9.42E-20 | ||
| Phobius | 20 | 1140 | 1121 | - | – | |
| Gene3D | 686 | 1139 | 454 | 2.1E-26 | ||
| Pfam | 935 | 1005 | 71 | 4.0E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nuclear export signal receptor activity | Combining with a nuclear export signal (NES) on a cargo to be transported, to mediate transport of a the cargo through the nuclear pore, from the nuclear lumen to the cytoplasm. The cargo can be either a RNA or a protein. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0785100.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…