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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0064900 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0064900.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA gyrase subunit A; TAIR: AT3G10690.1 DNA GYRASE A; Swiss-Prot: sp|Q5YLB5|GYRA_NICBE DNA gyrase subunit A, chloroplastic/mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|G7I9Z9|G7I9Z9_MEDTR DNA gyrase subunit A; Found in the gene: LotjaGi2g1v0064900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:15097616..15122397) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAAACCCTCTTCCCTCCAAAACCCCCTCAACCCTCATCTTCTCCACTCACCCTCCTCCTCCATCTCCATGGCACTTTC CTCCGCGCTCAGAGTCCTCAGACTCTCCCCTTTCGTCTCCCTCACGCGCCCCTCTCCGCTCCGCCTCGCTTCCTCGGAGC TCCGCTTCCTCTCTTCCGCTACCCGACGGCGCCCCGCCACGGCTGTCCGGGCCTCCGGAAACGGCAGCGTGACGGTTGTG AACGGTAACAGCAACAGTGGTAATAATGGTGATGGCAGGAGTGAAGGAAGGATTCTGACGAAGGAGCTTCACAAAGAGGC CACGGAGGCTTACATGTCGTATGCGATGTCCGTGTTGCTCGGTCGTGCTCTGCCGGACGTTCGCGACGGGTTGAAGCCAG TGCACAGAAGGATTCTGTTAGTATTTTTGCCTTTGAATTTTTCTGATTTGAGAAATTTGAGAAGTGAAAAATTGTTTGTT TCAGTCATTTTATGAAGTGAATTGTTTGTTTGTTTTCTGTATTGTTTGAGTGTCACTGGAAATTTTGAAAACTTTCCATT TGATGATTTTACTTCTTTGAGAATAATTATGCAAACAATGTAGGGAGTTTTCTAAATTTTAGATTCTTTTCCTATTTAAA AAAAACCAGGTTGTGTTTATTTTTCTGACACCAAATTAGGAGGATTTTAGATTGTGGGATAAATGTTTGTTTTTTCTTAA ACCCTTATACAATTATAGTTCAAAAACATGTGAGGGTTGGAGTGGGAGGGGTTCTGGCTCTGTTCCCTAGTCTTAGGTTT ATTAGTTAGTAGTATTTAACTATTTATACTTATGTAGATGCAAAAAATCCTATTGAATAGAAGGTTTACAGGTCCCTCAG CTAGGTTTTAATCCTAAAATGAAAATAAGGAAATTTTCTGCTATATTGTAGGGTCACTGGAAATTTTGAAAATTTTCTGT 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TCCCACATGCATTACCCATGCATCTTCACTAACTCCTCTCCCTATCCAGGGCCACGTGGTATTTTCTCTTTCTTCTGGAA TTTACTTTCCGCACTTTAACTTCCTGATGAACCTGCTTTTCCAGTGGTATTCCCCCACACCCTTATGTAATTCAAGTGTC TCATTACCCCCCCCCCCCTCTTTGGGAAACAATGTTGTCCTCATGACTGAAATTACGGATGGCAAACACATCTTCCCATG TAGCGTCCTCAGCTGGGCGCCCCATATGTTGATCAAACATTGAGGTATCTATTGACTGAAGCGGATAAGCTTAGGGTCAT ATATAAACACCCTATGTAATTCTGTTACTTAAGGTTTAAAAAAATATATAGCCAGTTTTGAGGAAGTAGGAATCAATTGG CCAAACCTTGTAAAATATAAATTCTCCTGCTCTTTACTTTTAGCTTTTAATTCGTTTCTGCCGTCTACAACAGAAAGCAT TCAGATTCAGATTCAATTTCTTCTCTGTTTTACTCTCTCTAATTTGTTGCATGTGTGTTGTGTTACACATGTATGTTTCC CATTTCTCTCTTGGAATATATTTTATCTTTTCTTTTGCAGTCTCATCCATCAAAAGTAATAGATTTCGAAAATCTATTGC TTACTTGAAGATTGAATGAGACTAATTATTGAAGCTACATTTATTTTTTCATGGGCTTCTTGTCTGTAAGTATATTTTCT GTACAAACTCAGGGTATTCTTATTGGGTTTGACAATCTGGATCGGGTGATTCACATAATACGTGAGGCGTCAAGTAACTC AATTGCAACAGCTGGGTTACGCAATGGTAAGCTCCATATTTTGAACTTGTTTATTGATTTTCCTTTGTATAAAAATATTT TCTTGAAATATGTATTTCAAGACATGTGATAAGAAGAGGCCGCTTTTCTAGATGCTGATGCTTAGTTGGAAACTTTTATT TTGTATCTCTATCTTTTGTGAAGTTCAACTTGTTATTGAAATGAAATCCATTTAATCATGGCTCGATATTCTGTATCTTT TAGCTGTTTGATGTGGGTGTCTATTATTCATTTGCAGAGTTCAGTCTCTCTGAAAAACAAGCTGAAGCTCTTATGGACAT CAGCCTAAGAAGACTGACCCGTCGTGAGGTGCATAAGAATCATGCTTATAACTAGACTTGAATAATTGTTTTTCTTTACT GTAAGTTCTATGAAATCACATGTGATGAGACCATAGCTAGAATTATAAGCTTCATGCTATGCAGAGCGGGAACTTTCTGG CTGAAAGCAAATCTTTGATGGAACAAATTTCCAAGTTAGAAGAATTATTGTCCAGCAGGAGTAACATACTGGAGGTATAG TTTCATTTTGAGTCCCTTCCTCTTATTCATTTCTTTCTGAATCAGCTTTTTAAAAATTTTGGTTGGTTACTGGGTGACTG TTCAGTTAGCTCAATAAGTCTAGTTAGATCAGTGTGATACTGTTGTGAGTAGTACAGTGATAAATACAAGGGGGGTGCTA ATTACAGCAATTACATGATTTGTTTCTTCCTATACAATGAAAGTAGTCACTGTTCATATAGTTTCCAACACTAACCATGT GGAGTAATGCACATGGTTAACGAGACTACTAACATTGCTTAAAAAATTCTTTAAAATTCGTAACAACCTGCAAGTGAAAG TTTTTAGGTTTGATTGCAATACCTTGTAGGAATAATACCAAAAAAGCAAAACTTTATGGGAGACCTGATCAACTGTATTC TTTCTCTTTCTAGATATTTTTTTCGGCGACTCATGAGCCAGTGGAGAGGCTATTAAGATGGCTCAAAAAAATAATTTATT TGCTGGGATGACTATTTTAATGTCTCATATTTTTAGGTCATAGAACAAGAAGCAATTGAGCTGAAAAATAAGTTTGCCGA TCCAAGGCGTTCAATGTTGGAGGACACAGATAATGGTCAACTAGAAGACATTGATGTTATTCCAAATGATGAAATTATAT TGGTATGTGGCAGTAGGGTATAAATCTTATTTCTACACTTCCCTTACTTTACCTATATGTCACTAAACGATTAGTGTTTA TGATGGTGACCTTTACTCTAAGGCACTTAGTGAAAAAGGTTATGTGAAGCGTATGAAGCCAAACACTTTTAACCTTCAAA ACCGTGGAACAATTGGCAAATCAGTGGGCAAACTAAAAGTGAATGATTCAATGTCTGATTTTCTTGTTTGTCGTGCACAC GATCATGTCCTTTATTTCAGGTTTGTTTTTGTTCCATTTCCTAAGGTAAAATAATTTCTGCCTTTTCAAAGTTTTGAACC TTTTGATGCAGAAGAAAACTGGGAGAAGGGTATCCTTCAAAGTCATTGCGGTACAGCTTATTTTGTTAATTTTTAATATG ACATGGCTTGCAAACCTTAATTTTCAGTGATAAGGGAACAGTATACTCAGCTCGTGCTTATAAAATTCCTGAATGTAGCC GGACTGCGGCTGGTACTCCACTTATTCAGGTAATTCTTTGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACCAC ACACACACATGCCAGAAAACTGGGCATACTGGCATAATATACTGGTATGCATGCACGAGAAAAAGGATTGGGCAAAAGGT GGGATACTAAAGATAGTTAAAGGGGTGAGCGTGTACCGAAAGGTGAGGGGAGTTAATCTTCACTTTATAACCATACAACC ATATATCAACGGTTTTGTTATTGCTATAGGTCAAATAATTAAAAGATTTAGAGATAAATCATTAGAAGATTTAGAGATAA ATGATCTATCGTTAAATGTAATTCATGATAGGTTTTGTTATTGCTGTATTTCCTATTAAGCTCTGCATTTTTTTAAGATA AACCCTTGAACTGAGCACCTGAGACACGAGTGGTTTAAATTAACAATTTTTTTGTTCTTTTTCTACATTTGACCAGATCT TATCTTTATCTGATGGTGAAAGAATAACATCCATTATTCCTGTGAGTGAGTTTGCTGAAGATCAGTTTTTGGTGATGCTT ACAATGCAAGGTTATATCAAGAGAGTATCCTTGAATTCATTTTCATCAATCAGATCGACCGGAATCATTGCTATTCAGTT GGTTTGTTCTCTTGTTTTGAGTTCTCTGTATAGATTGCTATTTCTTCATTATATTGTCCTACCACTAGATTAGTGGTCAA AATCTTTGTGTATGATTATTCATTCATATATTTAACTTGAAAGGTTCCTGGTGATGAGCTGAAATGGGTCCATCTTTGCA CAAATGATGACTTTGTGGCCATGGCTTCCCACAATGGAATGGTCATATTGAGCCTATGCAGTAAGGTAAGTTGCTGTTCT CTATATTTTAGTTAAATTTTAAATTTCGAATTCTGTAACATTTGGATACGGCTGGCTTAAATAACTAATATTATGAAGAA TTCATTGAAAATAGATGCATCGAATTTTATTTGTATTGTGTCATCTCTCTGGAATAACTGTTGAAAATGGTGTAGCTATT GAAAATTAAGTCATGGAAAATGAAACAGCAAGACGGGGGCATAAAAAAACATGTAATGCAGTCAGAAGCTTTGAATGGCT GTGACAATGACCTTTTTATCTTCATTTCTACTAAAACTATTACTACAACAATGACAATTGTACCCTTACTTTGGTACTAC ATGTAGTCTTTTATTTAATGAGCTTCTTAATGACGTAGTCATAAATTACTCGTGTCGAAACTCATGTTCTTTCTATGAAT TAATCATGTCATTTGAAAGCCTCTCAAACAGGCTATTCTTATGTATTGTGTCCACGAAGACTCACAAAATAATCTGCTAA AGTAGTTTTCATTGCTGAAATTGTGAAATAGTTTGTTGCTATAGTATGTTATTGTGAAATTTATTTGACATTAATTTGTC TTGATTTGATCTCAGATTCGCACACTCGGAAGAAATACGAGGGGGGCTGTGGCAATGAGACTCAGGGAAGGGGATAGGAT GGCAAGTATGGACATTATACCAGCAGCCATGTGGAACAACTTGGAATCCTTATCAAAATCTCCTGGAAACAAGTAATAAT GATGAGATCCTGTATGCTTGTCTTGGTAGTGATTAATAACTGTTAAAATATACCAGACTAAATTTAATATTGCCATAGTC TGAATTCAGATATGATCTAATTGTGAACAATGCTTAGATTTATGATTCCTTAGGAATATGTTCCGACCTGCTTATAAGTA ATAAATAATAATTACTGTTTGTAGGTATGTGTCTGAAATGATATGTCAACCTGTTTTTAGGCACTGTGCAATATAATATA GCTTTAATTTTGCATACTAAATTTCTCAAACTTGGAGTTCCTTTGAAGGTTAAAACATATTGAAATTATAATAGAAATTC TTAGTTTTGAAATGACTTTTGTGTTTTGAGGGTTCACGTTAGCTTATATAGGCATATTATTATATATTTTATTATAATAA GGAGGAAATCTATTTGTTCAGTTGTTGTTATTATTGTTATTTTGTCCTTGTTGGAAATAATATATCTTAAATATTATTGT TATTTACATTATGGCAAATAAGAATCGTCAAATCCTCATGTTGTTGGTTCAAAGATTGACCCTAGATGAAAATAGTCTTC CAGGACAAAAGAATGATACGAACTGATGTGTGCAATTTTTTTAGTGTTATTTTCAGTATTTTGTTTTGAACTTTTGAGTT GATATTATTTCACCACTTTTTATGCCAACTTATTTTTATTTGTGCTAGAAATATAATATTAAACCATTTATGTGGCCTTT ACCCAACAACTTAAGCTTTTGGGATAATTGGTTGTTTGACATGGTATCAGAGGCACTATGACTAAGTGGTCTAGAGTTCG ATCCTTGTCGCCCTCAATTCTTCTAAAAGAAAGTTGAATTTCATTACATGGTAGGTGGGCATGTGCATGTCCACGCTTCA AGCCCATGTGAGGGGGCTTGCTGAAAATATAATATAAAACTATTTATGTGGCTTTTTGACAATTTGCATAAGCTCAAATT TATAATGTGTGTGTATGATTGATTTTTTTCAACCATTACGCGACTTCTGATATTTGCCCACGATTCTCCACCACTTTCCA CTACTGATTTTTTGCTTGCTTCCATTTTCCGCAATCTGCTGTTGAGAACACCGGCAAGATTATTGCTTTTAAAGAAATTA GCTCATCCTTTGTTAGCTCAAATGATCAAGTGGCAGATTTGCTCAGCAAAGCTTTTGATCTCTACCCTCTAGAATCAGGG GGAGTGTTAGGAATAATATCTTAAATATAACTTATTATTTCACTTTCCAAATCTCATAGGTTTATTGTACCTTTGTAAAT TGAAATAGTTTAATTATGCTTGTTGTGTAAACTGTATTTTTTCACTGTTTCTGTATATATAAATATTATTCCTCTGATTG TGTTTTTCTAACTCAAGCATATATGTATATTTCTCCATCTTCTAAAGCGTTTGGTTTATATATGTTTGATGGTTATAATT AAAAGAGATCACATCTTCCTTTAGTCTTTTTTTATCTCTTGAATATGACCCCAAATGCTCGGACAGATAAGTGTTTAGAC TTTCTGATGGGAGTAGTTTGTCATATGTCCTTAGCATATTTTTACTGTCTGCCTGCAGTGGGAAGAGCCAAAATGGCCCA TGGTTGTTGTTTGTTTCAGAGAGTGGCTATGGAAAGCGGGTTCCTTTAAGCAGTTTCCGAATGTCATCTTTGAATCGAAT TGGTTTGATAGGATACAAGGTATTTTATTCCTATCACAGAAATGTCCCTTGACAATCATAAACTATTCTTTTCATTTGAA GCTTATTGTATATTTTGCCTGTGTATTCAGTTCTCTGCTGAGGATCGCTTGGCTGCTGTTTTTGTGGTTGGGTTCTCATT AGCAGGTATTTTCTTAATACTCTTAGTTCAACATTGACATCTTTGGTTACAGTTTTGATGATTAGAAGTACTAATTTTGC TACTGTTATTGCTATGCTATTAACTTTTTTTATTGTGAAATATCATTGTCTACCAGAGGATGGTGAAAGTGATGAACAAG TGGTTCTCGTAAGCCAAAGTGGTACAGTGAACAGAATTAAGGTTCGGGATATTTCAATACAATCTCGATTTGCAAGGTAA ATTTGTGTTCTATTTGCATATTCCGTGGTTACTGATTGCTGAACTATTATGGCTGTAAAAAACAGGAGAGTTGAAAAAAA GAAGCTTTACAATTTATTATCTTTTTCTGTTGACATCATATGGAAGCTTTACAATGAGGCTGCCAAACTTTTCATTCGAA TTGTTTTAAATTTAAAACGTACTAATTTCATATCATTAATTTGATACCTACTAGAGTGTTGTTGCTTTTTAATGACTGTT GTTTGTTGAAATTTTGTCAGGGGTGTTATTTTGATGCGGCTTGATCATGCTGGAAAGATTCAGTCAGCTTCCTTGATCTC AGCAACAGAATGCGAAGAGCCTGAGGAAGTTCTGGAAGTTGCCCAAGGCTAGTTGTACATGA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0064900.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAACCCTCTTCCCTCCAAAACCCCCTCAACCCTCATCTTCTCCACTCACCCTCCTCCTCCATCTCCATGGCACTTTC CTCCGCGCTCAGAGTCCTCAGACTCTCCCCTTTCGTCTCCCTCACGCGCCCCTCTCCGCTCCGCCTCGCTTCCTCGGAGC TCCGCTTCCTCTCTTCCGCTACCCGACGGCGCCCCGCCACGGCTGTCCGGGCCTCCGGAAACGGCAGCGTGACGGTTGTG AACGGTAACAGCAACAGTGGTAATAATGGTGATGGCAGGAGTGAAGGAAGGATTCTGACGAAGGAGCTTCACAAAGAGGC CACGGAGGCTTACATGTCGTATGCGATGTCCGTGTTGCTCGGTCGTGCTCTGCCGGACGTTCGCGACGGGTTGAAGCCAG TGCACAGAAGGATTCTATTTGCAATGCATGAGCTCGGTCTCTCTTCAAAAAAATCATTCAAGAAATGTGCAAGAGTTGTT GGAGAGGTATTGGGAAAATTCCACCCTCATGGAGACTCTGCTGTGTATGATTCCTTGGTGCGGATGGCTCAGGATTTTTC GTTGCGCTATCCTTTGATCCAAGGTCATGGAAATTTTGGGTCAATTGATGCTGATCCTGCTGCTGCCATGCGTTACACAG AGTCCAGACTGGAAGAATTGGCTGAAGCAGTGTTGTTGGCAGATCTAGAGCTAGATACAGTTGATTTTGTTCCAAATTTT GATAATTCACAGAAAGAACCATCAGTTCTACCTGCTCGTCTTCCAATCTTATTGTTAAATGGTGCTTCTGGGATTGCGGT TGGGATGGCTACTAATATCCCTCCTCATAATCTCGGGGAATTAGTGGATGTGCTTCGTGTGTTGATACATAATCCAGAAG CTACTCTGCAAGAAATGCTTGAATACATGCCGGGACCTGATTTTCCAACAGGAGGGGTGATTATGGGAAATCTTGGGATC CTAGAAGCCTACCGAACTGGTCGAGGACGTGTTGTTGTCAGAGGGAAAACTGAGTTTGAATTGCTCGATTCTAAGACAAA ACGGACTGCAATAATCATTAAAGAGATTCCTTACCAGACAAACAAAGCTGCATTAGTAGAGAAGATTGCTGAACTTGTAG AAAACAAGAGTTTAGATGGGATAAGTGATATTCGGGATGAGAGTGATCGTTCTGGAATGCGTATAGTCATTGAGCTGAAG CGGGGATCAGACCCATTAATTGTGCTGAATAATCTTTATCGCTTAACGTCTCTACAGTCAACATTTAGTTGTAACATGGT GGGTATTCTTAATGGACAACCTAAACAAACGGGGTTGAAGGAATTGTTGCAGGAATTCTTAGACTTCAGATGCTCTGTTA TTGAGAGACGTGCGAGATTTAAGCTATCAAAAGCACAAGAAAGGAGACATATTGTTGAGTACTTCGGCCACATGGTGTTC AACCACAGGCCTTGTTCACTCTCTTCTCGTGTCTTTGGAGTGGGTATTCTTATTGGGTTTGACAATCTGGATCGGGTGAT TCACATAATACGTGAGGCGTCAAGTAACTCAATTGCAACAGCTGGGTTACGCAATGAGTTCAGTCTCTCTGAAAAACAAG CTGAAGCTCTTATGGACATCAGCCTAAGAAGACTGACCCGTCGTGAGAGCGGGAACTTTCTGGCTGAAAGCAAATCTTTG ATGGAACAAATTTCCAAGTTAGAAGAATTATTGTCCAGCAGGAGTAACATACTGGAGGTCATAGAACAAGAAGCAATTGA GCTGAAAAATAAGTTTGCCGATCCAAGGCGTTCAATGTTGGAGGACACAGATAATGGTCAACTAGAAGACATTGATGTTA TTCCAAATGATGAAATTATATTGGCACTTAGTGAAAAAGGTTATGTGAAGCGTATGAAGCCAAACACTTTTAACCTTCAA AACCGTGGAACAATTGGCAAATCAGTGGGCAAACTAAAAGTGAATGATTCAATTGATAAGGGAACAGTATACTCAGCTCG TGCTTATAAAATTCCTGAATGTAGCCGGACTGCGGCTGGTACTCCACTTATTCAGATCTTATCTTTATCTGATGGTGAAA GAATAACATCCATTATTCCTGTGAGTGAGTTTGCTGAAGATCAGTTTTTGGTGATGCTTACAATGCAAGGTTATATCAAG AGAGTATCCTTGAATTCATTTTCATCAATCAGATCGACCGGAATCATTGCTATTCAGTTGGTTCCTGGTGATGAGCTGAA ATGGGTCCATCTTTGCACAAATGATGACTTTGTGGCCATGGCTTCCCACAATGGAATGATTCGCACACTCGGAAGAAATA CGAGGGGGGCTGTGGCAATGAGACTCAGGGAAGGGGATAGGATGGCAAGTATGGACATTATACCAGCAGCCATGTGGAAC AACTTGGAATCCTTATCAAAATCTCCTGGAAACAATGGGAAGAGCCAAAATGGCCCATGGTTGTTGTTTGTTTCAGAGAG TGGCTATGGAAAGCGGGTTCCTTTAAGCAGTTTCCGAATGTCATCTTTGAATCGAATTGGTTTGATAGGATACAAGTTCT CTGCTGAGGATCGCTTGGCTGCTGTTTTTGTGGTTGGGTTCTCATTAGCAGAGGATGGTGAAAGTGATGAACAAGTGGTT CTCGTAAGCCAAAGTGGTACAGTGAACAGAATTAAGGTTCGGGATATTTCAATACAATCTCGATTTGCAAGGGGTGTTAT TTTGATGCGGCTTGATCATGCTGGAAAGATTCAGTCAGCTTCCTTGATCTCAGCAACAGAATGCGAAGAGCCTGAGGAAG TTCTGGAAGTTGCCCAAGGCTAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0064900.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKPSSLQNPLNPHLLHSPSSSISMALSSALRVLRLSPFVSLTRPSPLRLASSELRFLSSATRRRPATAVRASGNGSVTVV NGNSNSGNNGDGRSEGRILTKELHKEATEAYMSYAMSVLLGRALPDVRDGLKPVHRRILFAMHELGLSSKKSFKKCARVV GEVLGKFHPHGDSAVYDSLVRMAQDFSLRYPLIQGHGNFGSIDADPAAAMRYTESRLEELAEAVLLADLELDTVDFVPNF DNSQKEPSVLPARLPILLLNGASGIAVGMATNIPPHNLGELVDVLRVLIHNPEATLQEMLEYMPGPDFPTGGVIMGNLGI LEAYRTGRGRVVVRGKTEFELLDSKTKRTAIIIKEIPYQTNKAALVEKIAELVENKSLDGISDIRDESDRSGMRIVIELK RGSDPLIVLNNLYRLTSLQSTFSCNMVGILNGQPKQTGLKELLQEFLDFRCSVIERRARFKLSKAQERRHIVEYFGHMVF NHRPCSLSSRVFGVGILIGFDNLDRVIHIIREASSNSIATAGLRNEFSLSEKQAEALMDISLRRLTRRESGNFLAESKSL MEQISKLEELLSSRSNILEVIEQEAIELKNKFADPRRSMLEDTDNGQLEDIDVIPNDEIILALSEKGYVKRMKPNTFNLQ NRGTIGKSVGKLKVNDSIDKGTVYSARAYKIPECSRTAAGTPLIQILSLSDGERITSIIPVSEFAEDQFLVMLTMQGYIK RVSLNSFSSIRSTGIIAIQLVPGDELKWVHLCTNDDFVAMASHNGMIRTLGRNTRGAVAMRLREGDRMASMDIIPAAMWN NLESLSKSPGNNGKSQNGPWLLFVSESGYGKRVPLSSFRMSSLNRIGLIGYKFSAEDRLAAVFVVGFSLAEDGESDEQVV LVSQSGTVNRIKVRDISIQSRFARGVILMRLDHAGKIQSASLISATECEEPEEVLEVAQG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 40 | 474 | 435 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 40 | 474 | 435 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 70 | 95 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 71 | 93 | 23 | - | – | |
| SMART | 101 | 578 | 478 | 8.4E-229 | ||
| CDD | 121 | 588 | 468 | 0.0 | ||
| SUPERFAMILY | 121 | 598 | 478 | 1.22E-158 | ||
| Pfam | 122 | 578 | 457 | 7.5E-146 | ||
| Gene3D | 123 | 461 | 339 | 4.9E-172 | ||
| Gene3D | 327 | 425 | 99 | 4.9E-172 | – | |
| Gene3D | 462 | 473 | 12 | 4.9E-172 | ||
| Gene3D | 492 | 600 | 109 | 4.0E-25 | ||
| PANTHER | 495 | 933 | 439 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 495 | 933 | 439 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 611 | 925 | 315 | 1.1E-86 | ||
| SUPERFAMILY | 614 | 935 | 322 | 3.27E-70 | ||
| Pfam | 619 | 658 | 40 | 4.2E-7 | ||
| Pfam | 659 | 702 | 44 | 9.8E-5 | ||
| Pfam | 709 | 751 | 43 | 2.8E-7 | ||
| Pfam | 767 | 794 | 28 | 0.011 | ||
| Pfam | 820 | 865 | 46 | 3.0E-8 | ||
| Pfam | 878 | 923 | 46 | 9.6E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Molecular function | DNA topoisomerase activity | Catalysis of the transient cleavage and passage of individual DNA strands or double helices through one another, resulting a topological transformation in double-stranded DNA. | ||
| Molecular function | DNA topoisomerase type II (ATP-hydrolyzing) activity | Catalysis of a DNA topological transformation by transiently cleaving a pair of complementary DNA strands to form a gate through which a second double-stranded DNA segment is passed, after which the severed strands in the first DNA segment are rejoined; product release is coupled to ATP binding and hydrolysis; changes the linking number in multiples of 2. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | DNA metabolic process | Any cellular metabolic process involving deoxyribonucleic acid. This is one of the two main types of nucleic acid, consisting of a long, unbranched macromolecule formed from one, or more commonly, two, strands of linked deoxyribonucleotides. | ||
| Biological process | DNA topological change | The process in which a transformation is induced in the topological structure of a double-stranded DNA helix, resulting in a change in linking number. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0064900.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…