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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0180300 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0180300.5 |
| Related isoforms 7 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class); TAIR: AT5G17680.1 disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class); Swiss-Prot: sp|Q40392|TMVRN_NICGU TMV resistance protein N; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RK91|A0A151RK91_CAJCA TMV resistance protein N; Found in the gene: LotjaGi2g1v0180300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:60218880..60244795) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCATGGGTTTTTAGAAAAAAAAATATAAACAAATACCCTAATTGGTTAAAGAAAACAATTAACCCCACTCTTGTTACTT TTCTCTCCCAGCCGTAACTCCATTCTCTTCCTCGACAATTTCCTCCCATGCCTTTGAAACAACTCGTCCTTCTCCTTTCT CTTATACCAACTATCCCTCCTTCCCAAAAATCACTACCAATCCCTCTGTAGCATACACACTCAGGAACGAATTGTGGCAC TCAATTGCAAAGGCACTTGGTTAATTTATGGGGTTTATAATTGGTGCTTTAAGGAAGGAAGGGAGTGCCCACATGTCAAG GTTTCTCTGTTAATTGCATTGAGGTATGCCGCACTCACAAATTTTAGAAATAGTAGTCTGGTATGCTAGACTTAAAGTAG AATTATTTAGGGCTTTTGGGTAAATAATTGGGGTTTTCGTAGTTGCTCACGGGTAGTATGACATAAGTTAATTATTGCTG AAGGGTTGGAATATGTTCTTGGTGTTCAGATTTGCTGGGCGTAGGTTCGTTTGCGCGTCGCGGAACTGTTGAGGACGGTC CAATTATTTCGTCATAGTTGTGAGTGATTTTCCAATCACTGTGACTTTTTTTAATAATTATATAATTGCTGATTTGATTA TTTTATCATATCACTATTTATTTAAATTGGGGAAACATGTTTTACAGTTCTTTAATTATTTGAAAGCTGGTTTTAGGAAG TTGATTTGGAGTCTGATTATGAACTGACATGAGAAAAGAATTTATATTGCTTTGATTTTGGAAATTATGTGAAACTGAGA TTATGAACTTGGAAAGTTGATTTTGAGACTTTTGATGAGACTTGAACTGATTTGAGAAAACGGTTTTGGGGATCCTTGAT AGAACCCCGTAGCCGTTAACGGAGGTAACGGCCTAGGTGCACCTAGCTAGTTTGATTCCGGGAGGAGAGGGCTATCCGTT 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AAAACGACACTTGCTCTAGCAGTTTACAATTCCATTGCTGACCATTTTGAAGGTTTATGTTTTTTGGAGAATGTTAGAGA AAATTCAAACAAACATGGGTTACTACATCTCCAAAAGACCCTTCTTTTGGCTTTCCTTGGAGAGAAGGAAATTGAGATAA CAAGTGTCAAGCATGGAAGTTCAATAATACAACATCGGCTCCAACAAAAAAAGGTTCTTCTGATTCTAGATGATGTTGAC AAGAAGGAGCAATTAAATGATATTATTGGAAGACCTAATTGGGTTGGTCCTGGTAGTAGAGTCATCATCACGACTCGAAA CCAACAATTGCTAGCATGCCATGGGGTTGAAAGAACATTCAAAGTGAAAGAGTTGAAGAAGGAACATGCTACCGAATTGT TCAAGTGGAAAGCTTTTAAAAACCAGGAAGTTAATTCAAGTTATGAGGACTTACTGAACCAAGCATTGAGTTACACTTCC GGCCTTCCATTAGCTTTGGAAGTAATAAGTTCTAACTTGTTTGGTAAAACAAGGGAAGAATGGGAATCGACATTAGAACA ATATAGAAGGATTCCACCTAGAGACATCCAAAAGATACTTGAAGTGAGCTTTGATTCTTTGGAGGAAGAAGAGAAGAATG TTTTCCTAGACATTGCTTGTTGCTTCAAAGGATATGAATTGGGAGTGGTCAAGGACTTACTTTGTGCTCATTATGGTTTC TGCATAGCAAATCACATTAAGGTGTTGGTTCAAAAGTCTCTCATAACGATTACTCCGTATTTGAGTGAATTGACACTACA TGACTTAATTGAGGATATGGGTAAAGAAATCGTGCGACAAGAATCACCTAAAGATCCTGGAAACCGTAGTAGGTTATGGT TTCATGAAGACATATTTCAAGTTTTGGAACAAAATACGGTAAGACTAGTTCGGATGATTTGGTTGTTTATCTTTAATCTT 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AGTGGCCGATATGGGAAGAGGATAGCGAGAGTGAGACTTACTATGTATTGCGAAACTTACAGATTCCAGAGAGGTTTGAG CACCAGAACAGGGGTCGATCTCCGTCACTTTCTTTCTGGTTTCGTAACGACTTCCCTGACATCTTACTATGTATTGCTTC TCCACCTGAGCCAAATATGCCTGACAATGATTATTTATTCAGAGTAAATTTCTTCATCAATGGCTCTTCATGTCAACAAT TCATAGTAAATTGGGGTTGTACTCTTCTTAAGAGGCTAAGAAAATACTACTTTTTTAAAGATATGAGGCTAAGCCAAACA AACTATTCATGGAAATATAAATTTATAGAAAATGTGTGGAATCATGTGGAGTTTAGGACTGAAAGGGGCTTAGACTGTGG AATTGGAATCCATGTATTGAAAGAGCAAAACATGCAGGATATCCGATTCACGAATCCTGATAAAAGGAGAAAAATAGACT TGAATTTGGCACCGCTTGAAGAGGATGATGTTAATACTGAGTTGACTCACTAAAGCACAATCCTGGATCATTGCTCTTGG GCCTATATATTCTGATGTGAATAAAAGAGAATGAGATCAACTCTGAGATCAGATGTTGAACATGACTCGTTTATATTATG TTCACATGAGATCTGATGTTGAAGTAAGTAGATCAATAGTTTTACATAAACTTGACTTCACTTCATGGAAAAATCTAATT CTGGAGCTTGTGCAACCATATTTTGTAATTAATTACAAGGTAGAACTGATGCAGAAGCTCTTGAATGGTATGAGAAGACT GCAGAACCAGAGGCCAAAGGGCATGACAAGGTGGGCGTAAGCTTCTTTATTGGGAGAGTATGCGACAGACCTTCAATTTT AACTACATAACCACTTGCCATTTTTTAATCCTCTGAACCCACTTGTTTCCATGTTTGATTACTGTATTTACAATGATGGT AGGCCTCCTGGTATCCAAAAATAATACTATGGTTTAGAGGATGAGTTAAACAACTTGCTAATGCTTCTAAGGAGGACTAT ACATTTAACATGGTCATGTTTATGATGGATATGTTCTGGCATGTGTGATTGGACTTCAACTAATAATTGTCATTTTCTTT GCAAGGTAGGCAAGGGCTTCATCCATCCAACAAGACATGGATACATTGGAAGATTTATAAATTATACTTGTACTTCTTAC CTTCATGTCATAATGATTGGAGCCTTCCCCACAATGTATAAAAGACATATAGAAGGTATGCTTATAATTGCTGCAAGGGA AGAGATATCAGAGTTAGGAGCAATACTTGGCATTGTGATTCAGAGAATGTGAATCATTGAGTTTCTCATGTAGAAGCATG TTGCTGAAGCAGGTTAACTTTTGTTTCGATTTGATTTGTTATGCTTTGAATGTGATAGATTTTATCATTAATATTCTACA CTAAAACAGGAAGTGCATGAGGGGTAAAGACCTACTTTGAATTGCCATGCCTATAAACAGGAAGGATTCCAAAGTGGTTT GAGCACGAGAGAAGGGGTTCACTTTCTTTCTGGTTTTCCATCGTACACTGATTTTAACTCTGAATGGTCATTCTTTACCC CTGATCTCATTTTAACTCCTCCATAAAATTTAATTTTATGATAGAGGTATTTTAACTTCTTCTTTTTTTCTTCTGGTTTC TAGCAGATTTGGAGACGGAGGCTGTAAACTGGATCTTGGGACTGTGGCTGGGTAGCAGTCATCATTGCTGCTGTTTATCA TCCAGGTTTATTGTAAAGAAAATTTTCAAGCAATTAAACCTATCCTTTTGGTATGTTTCTTTCCCATTTTCCAGTACCTT TTAAAACTGTTATGTATTCATGAATCACTGGTACATATTAAGGCTGTGCATTTTTTATGACAACTGCAGACTGCTACACT GCTGTGCTACCACACATCTTGAACTTTTTCCTAGTTTAATGATTTTCATTCTTAGCATATACTTATGAACCATTTTTTAC TATGTCCACTAAGAGAAGCCATGATTGGATTACCCCTGACTTAAAACATTCTATTCTATGTAAAAGGTCGCACATTCTTG AAGGATTTAGGCCTTCCACTTCTTACTGCATACACCAAAGATTGTCCCTTCTTGAGGGACCCTATTCAGATTTAATAAAA ACCAACATGGATTAACATCTCCAATGACATAGGTACAATATATTTTATCCAACATGGATTGGAATGTTGGATATATTCTT TCCATTTTTATTATTGTTTCCTTAATTCCATTAAATTTGAAAGCAAGAAGAGAGCATGTTGTTAAGGTCTGATTTTAGTG AATTGCTATGTCACTGCTTTATATTGTGCATCATGTTCCCTTTTTCTGCATTTGTTCTGGGTGTCAAAGAAGGGTGATAG TAAAGTTGGCTTCTAAGAAGACTAATGACTTGCAATTATTAACTATTGAATTCAGTTGAGTTATGGAAGGTCTTTCTTGG AGGGAAATTGGTAAATAATTCAGAAGACAAGTGAAGCACGTAAGGTTGAAAATTTGATCCCAGCAAATGCATTTGAAATT TGTAAAGTCTGAGGAGTCTGAAAAATAAATTAGGACTAATCTTTTACCACTATCACCATTGTGATCACCATTACCATGGT AATAATGGCTGCATTCATTCTAAGTTGGTTCATTTCCACCAAAAAACAAGGAGAGATACTGTTGCAGAAATAACCAGGCA TAGATACTTAAACTTTGAGCTCTTTATTTCCAAGCATCACCTTAATATTACAAGTACATGATAAATATATTGCAATAAGG ATAAGGGTAGGAGAAGCTTAAATATCTAGATTGTGTGTCAAGAAGAAAAATGAAATGCTATAACTTCTTAGATAAAAGTT CAATTTCTGAAATTACTGTACTCCTTGCTGCTTATATCTCGTTTATTTGCCATTTTAGGTTCTAGGAAATTCGTTTCTCC TTATGTCTAATAGATCCCTTGTACATGCAGAAGTGGTTTTATTATAAAAAGATGATCGGTGCATTGAAATGTCTTGCGAC TATAACTGACTCTTTACTGGTTCTTGGATCTATTTGAAGTGGCACCAACATTTAGCATCTATTACCACAGAATCTCGGAA AGGCTGCTTGTTTGGTGTGGTCTGAACTTTGAATTGAAAGTTGAAGGTATGTATTTCATAGAAGTAACTGAAATAGGATC ACATTTGTTTGAGAATTCTAGCAGAAAAATTATTTTAGATTTGATATAAGTGCAATCTAATATTGATTTGCAGTGCATAT GTGGGAAGTTTATTCCTTAGGCAGTTCTGTAGATAATTTTTCCAAAATGGTATTGAGAAGTCCCACATTCACTAGAAATA TGGTTAAGATAGTCTTTATATATGGGAAGACAATCCTTGAACAAACTTTTTGGTTGAGTTAATTCTCCCAAATTCAAATA TGGTATTAGAGCTTCTACCACTGAGTGGTTTGGACTTCGATCCTTTTTGCTCTCATTATTCTAATAAAAAGTGGAATTTT AGCACATAGTAGGTGGGTATGTGCATTGTCCACTCTTCAAGCCCAAGTAGGCTCTTGCGTGAGGGGGCGTGTTAGAAATA TAATATAAAACTATTCTGAGGTTTTTGTCCAACAACTTAACTTTTTGAGATAATTGGTTGATTGACCGTGTGACAGCTAT CTAAGCAGTTAGTAGTATCTAAATGTTATGAACCTGAGGCTTCACAGAATGTTGACTTAAACTATTCTTCAAGGCATTCT GATTCTTCAATATTGGTCCTTTATCTGAAAAAGGAAATTTAGTTCTCTAGTAAATAACAAATGGACATTGTGAGATTTAC ACTTCAAGTTACCGGGAAAAGAATGGATACGATTACTAAATCCCAATATCGGACATCATTTGTGACACTAACTCAACATT TTATTTTATTTCAAGCAGAGAAGAAAAACAAATTTTCTTGAAAGAGTGTATAAGAACACCTGATGCAGAAGCTACAACTT GAATGCTAAGATTTATGACACCAAAGCTAGCTGAACCAGAGGCCAAAGGGCATGATGACAAGGTGGAACTTATAAGCTTC TTTAATGAGAGAGGGGGCAACATAGCTTCAATTTTAACCACGTAACTGCTTGCTAATTTTTAAGCCCCATAATGTCATAA TCCTCTTATTTCATGTTTGATTACTATAAATGTAGTGGAGATACACCACATAGACATAGTAGAAGCCGATTTGTTACCCT GGTGCACAAATCGTGGTATGCAAAAATAGCATTATGGTTTATTAAAGACAAGTTATGGTCCAGCAGAGTTACTTGCAAAT ATTCTAGCAAGGTGGTTCTGATTAGTTGTTCAAGAGCTTCCAGTATTATCTGGAGGATAGGTTTTGATCACTCTGTTGTG GTTGAAGCAGAAGGCTTTGTGGGAGGTATCTGGATTCACTGGGATGGTCAGGCTTTTAGATGTGGAGATTCATGCGAGGA TTAAGGCCAAGGGATAGTTTGGCCTTTTTAAATGGAAACTTTGATATTCTATTGTTTTTTTAGCACTAAGACATGTTTAG ATAAGAAAGTGAACTCATACACAGTCGATCATTTTATGTACAATGGGGCTGCAATTCTCATTAATATTTGTTGGGAGCAA TAATAGAAAGGAGAGAAGAGAGAAAGAAATATAACACAGGAGTTTTTAACGTGGTTCGGAACACAATGTGTGTACCTACG TCCACGGCTACACTAGGTAGTAATATTTCTTTGGTGTGTATAATGCTTACAATGAGGTGCTTATATATAGTAGGAG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0180300.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTTCCTACCATCATCATCCTCCTCTTCCATCACCTATGCATTCACCTACGATGTGTTCATCAGCTTCAAGGGTTC TGATACCCGCTATGACTTTACCGGCAATCTCTACAAAGCTCTCTATGGTAAGGGAATTCACACTTTTATTGATGACAAGG AGCTTCACAAAGGGGACGAAATCACACCATCACTTGAGAAGGCCATTCAAAACTCCAGGATTTTCATTGTTGTCCTCTCT AAGGACTATGCGTGCTCCTCATTTTGCTTAGATGAACTTTCCAAGATTCTTGACTGCTCTCAGGAAGAGGGTCGTCTTGT TTGGCCAGTTTTTTATGGTGTGGATCCTTCTGATGTGCGAAAGCAAATTGGGACGTTCGGAGAAGCAATGGCCCTGCATA CAGAGAGGTTCAAAGATAACAAGGACAAGTTGCAAAAATGGAGGATAGCTCTACAACAAGTAGCTGATTTGTCAGGCTGG CATTTCAAACATGGAGATGGATATGAACACGAGTTTATCGGAAAGATCATTAATGAAGTTTCAAGAAAGATGAATCGTGT TGCTTTACCTATTGCTGATTACCCGATTGGACTAGAGTCACAAGTGCGACAAGTAGTTTCGCTTTTGGATGTTGGGTCTA TTAATAGAGTTCACATGGTAGGGATCCATGGAATAGGGGGAATTGGTAAAACGACACTTGCTCTAGCAGTTTACAATTCC ATTGCTGACCATTTTGAAGGTTTATGTTTTTTGGAGAATGTTAGAGAAAATTCAAACAAACATGGGTTACTACATCTCCA AAAGACCCTTCTTTTGGCTTTCCTTGGAGAGAAGGAAATTGAGATAACAAGTGTCAAGCATGGAAGTTCAATAATACAAC ATCGGCTCCAACAAAAAAAGGTTCTTCTGATTCTAGATGATGTTGACAAGAAGGAGCAATTAAATGATATTATTGGAAGA CCTAATTGGGTTGGTCCTGGTAGTAGAGTCATCATCACGACTCGAAACCAACAATTGCTAGCATGCCATGGGGTTGAAAG AACATTCAAAGTGAAAGAGTTGAAGAAGGAACATGCTACCGAATTGTTCAAGTGGAAAGCTTTTAAAAACCAGGAAGTTA ATTCAAGTTATGAGGACTTACTGAACCAAGCATTGAGTTACACTTCCGGCCTTCCATTAGCTTTGGAAGTAATAAGTTCT AACTTGTTTGGTAAAACAAGGGAAGAATGGGAATCGACATTAGAACAATATAGAAGGATTCCACCTAGAGACATCCAAAA GATACTTGAAGTGAGCTTTGATTCTTTGGAGGAAGAAGAGAAGAATGTTTTCCTAGACATTGCTTGTTGCTTCAAAGGAT ATGAATTGGGAGTGGTCAAGGACTTACTTTGTGCTCATTATGGTTTCTGCATAGCAAATCACATTAAGGTGTTGGTTCAA AAGTCTCTCATAACGATTACTCCGTATTTGAGTGAATTGACACTACATGACTTAATTGAGGATATGGGTAAAGAAATCGT GCGACAAGAATCACCTAAAGATCCTGGAAACCGTAGTAGGTTATGGTTTCATGAAGACATATTTCAAGTTTTGGAACAAA ATACGGGAACAAGCAAAATTGAAATGATGCATCTAGATTACCCGTCATTTGAAGAAGTGGATTGGGATGGAGAGGCTTTC AAAGAGATGAAAAAACTGAAAACACTTGTCATTAGAAAAACTCATTTTTCTAAAGGTCCAGAGCATCTTCCAAATAGTTT AAGAGTACTAGAGTGGTGGAAATACCCTTCACAACATTTACCAAGTGATTTCCGTCCAAAGAAACTTTCCATATGCAAAT TACCCGAGAGTAGGTTTATGTCATTGGAGTTGCTAAGTTCATCAAAGGCAAGTATGATAATGATTCAATATCCTTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0180300.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAFLPSSSSSSITYAFTYDVFISFKGSDTRYDFTGNLYKALYGKGIHTFIDDKELHKGDEITPSLEKAIQNSRIFIVVLS KDYACSSFCLDELSKILDCSQEEGRLVWPVFYGVDPSDVRKQIGTFGEAMALHTERFKDNKDKLQKWRIALQQVADLSGW HFKHGDGYEHEFIGKIINEVSRKMNRVALPIADYPIGLESQVRQVVSLLDVGSINRVHMVGIHGIGGIGKTTLALAVYNS IADHFEGLCFLENVRENSNKHGLLHLQKTLLLAFLGEKEIEITSVKHGSSIIQHRLQQKKVLLILDDVDKKEQLNDIIGR PNWVGPGSRVIITTRNQQLLACHGVERTFKVKELKKEHATELFKWKAFKNQEVNSSYEDLLNQALSYTSGLPLALEVISS NLFGKTREEWESTLEQYRRIPPRDIQKILEVSFDSLEEEEKNVFLDIACCFKGYELGVVKDLLCAHYGFCIANHIKVLVQ KSLITITPYLSELTLHDLIEDMGKEIVRQESPKDPGNRSRLWFHEDIFQVLEQNTGTSKIEMMHLDYPSFEEVDWDGEAF KEMKKLKTLVIRKTHFSKGPEHLPNSLRVLEWWKYPSQHLPSDFRPKKLSICKLPESRFMSLELLSSSKASMIMIQYP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SUPERFAMILY | 7 | 160 | 154 | 4.58E-42 | ||
| Gene3D | 13 | 188 | 176 | 7.7E-67 | ||
| PANTHER | 15 | 625 | 611 | 3.1E-270 | – | |
| PANTHER | 15 | 625 | 611 | 3.1E-270 | – | |
| ProSiteProfiles | 16 | 157 | 142 | 29.084 | ||
| SMART | 17 | 157 | 141 | 3.1E-43 | ||
| Pfam | 18 | 185 | 168 | 7.1E-43 | ||
| SUPERFAMILY | 185 | 447 | 263 | 1.78E-66 | ||
| Gene3D | 189 | 351 | 163 | 1.6E-32 | – | |
| Pfam | 199 | 432 | 234 | 1.7E-30 | ||
| PRINTS | 219 | 234 | 16 | 7.3E-20 | – | |
| PRINTS | 295 | 309 | 15 | 7.3E-20 | – | |
| PRINTS | 388 | 402 | 15 | 7.3E-20 | – | |
| SUPERFAMILY | 424 | 532 | 109 | 7.62E-24 | ||
| PRINTS | 561 | 577 | 17 | 7.3E-20 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Biological process | Signal transduction | The cellular process in which a signal is conveyed to trigger a change in the activity or state of a cell. Signal transduction begins with reception of a signal (e.g. a ligand binding to a receptor or receptor activation by a stimulus such as light), or for signal transduction in the absence of ligand, signal-withdrawal or the activity of a constitutively active receptor. Signal transduction ends with regulation of a downstream cellular process, e.g. regulation of transcription or regulation of a metabolic process. Signal transduction covers signaling from receptors located on the surface of the cell and signaling via molecules located within the cell. For signaling between cells, signal transduction is restricted to events at and within the receiving cell. | ||
| Molecular function | ADP binding | Interacting selectively and non-covalently with ADP, adenosine 5'-diphosphate. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0180300.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…