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LotjaGi2g1v0345300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0345300
Transcript ID LotjaGi2g1v0345300.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Receptor-like protein kinase; TAIR: AT1G31420.2 Leucine-rich repeat protein kinase family protein; Swiss-Prot: sp|C0LGF4|FEI1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase FEI 1; TrEMBL-Plants: tr|V7CMH3|V7CMH3_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0345300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:82230505..82242250) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TGAAAAAGGTGTGTGGGGGAGAAGCGTTGCACTTCTGTAACGCAATGTAAGCAAGCAAGCAATCTACAGGAGTCAATTTC ATGATTCAATTCAATTGAATTCAACTCAACTAGAGCCAAAGCAAATGCGTCGGTCGCACGTGCGATTCACCCCACCTCTC ACGTGCGAAACAGCCTTGCTCTGATTGGTTCCCCTTTAATTCCCAAACGAAGAGCATCGATTCTCTTCTCTTCTCTTCTC TTCTCTTCTCTCACACACTTCGCACACTCGCACTCGAATCACACACACAAATCTCAGGCAACGAACACACAAACCAGTGG GTGTGAGAAGAAGAGTGAGCGATAACTGATAACGTTTCTTGTTTGTTATCGCTGCATTTTCTCTCTCACCTTCGCATCTC AGATCGAACAAATCCAGGTCAGTTCTTCAATCCAAACCAAAATTCACCATCGCAATTCGTCAAATCGAACCACAATATCA ATTAATTCACCTCGATTTCTCGATTACGCATTGCTTGCTTCTGATTTCAAATGCTCAATTACTCTCTACTCTCTAGTAGT AGTATCCACTGTGTACTGTTATAGAAGCTCTTGTACTAGTTTACCTAGTTTGCTTGCTACTGCGCTTAACTGCTTCTGTA ATTGAACTGGAAATTGCATAGGTTGAGGCATTTACTCGAATTGTAGTCACTGCAAGTCTGCAACTAGTTTTGTCTGCATA GTGTGTGACAGTTGTAAGCCAAACGCCGCGTAACGGCCGAAATAATTTTTGTTTCTTGTGTGTTGTATTTTTTGCTATTG ATGAATTTGTGATAATTGTGTGGTTAATTTAGGTTTACCGGTTTTTTAAGTTGCAGGCAGCGTTGGATTGCGCTGGTGAT GTTCGTGCGGACTAGATAGCTAGCTACATGGTGGAGACGGGAGAGGGACATTTTAGATACTGCTGTCTCAGATGACTTTT GTTAGTTATATCAATTTTGAACAGTTTTGCTATGGGCATTTGTCTGATAAAATGGCAATGGCTGTGGCGGCTTCTTTTTG TTTCGCTGATACATGTTGTAACTTATAAAAGTGAAGCAACCAGTCCTGATGGTATGATTAAAAATTATATGCATTTCTTA TTTTAGAAGCCATGCTTAATTAGGATATAAGTCTGCTTCTGATTTGGTCGCATTTCATATTGATATGATACTAAATTTGG CCGTACTTTATTATGAACGTCTTTAATTTTTTGTTCATATCTTAACTATATTTGTGATATCCTCTGTTTTTCCATTATGA TTTCATAATCTTTTTTTGAAGCTAAGTCAAAACTTTGGAATTCTACTTTAGAGCTTCACTCCCTCCTTGCTTGCATTTGT TCATTCATGTGACTTAGTTTAAATTAACATTTAACTAGTTTTCACTTTTTATGCTGTCGACTCCTTTTCTCTTGCATAAT GGTTTTGATAGTTATATTATTCTTCCACGTATATAGGTGAGGTACTTCTCAGCTTCAGGACAGCAGTTGTTAATTCTGAT GGTTTAGGATGGAGGCCAGAGGAGCCGAACCCGTGTAAATGGAAGGGAGTGAAATGTGATCCAAAAACCAAGAGAGTAAC GCATCTGTGAGTTTATAATTTTTGCATTTCTTGTATTGCACTTGCTACAAGACACGGTTTTGTACTGATGGAAATGTTTC TTACGTCATCTTGTTTTGACTGACTGTTGTAATTCGTCACATGTATCACGTAGAGGGTAAATAGATTATTTCACGAGTCA TGTAATTTTATAAGCATGCCAGACCAGATTTTCATGAAAGCTTCATTGCCACGTCTGAAACATTTATATTCTGATTTAGA CTTTAAGTTATGTAAACAATTGTATTACCTAATTCTAGCAACTATTACTGATTGTGAATTTCTGATAAAACAAAAGCCCC 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GTTTTTCTGTTCACCCTGGAAAATCATCGGCATTTAGCTTTGTTGATGGTGATATTTGGACAATTCAATTTAACAACAGA ATTTCACTTTTGTTAACATTGATTTAATGCTCATACTATTGCTTATTACATATTCATACAAACAATTTTACTTTCTGCAT AGCCATGCATCACATGTTATGGTATACTTCACGGTCACACTTAGAGCTTGACATTTTGGAGTTAGTTTCTAATATCACTT CACTTTCTGGAAGAAAGCTTATATAATATAACTACTAGATCTTGTTTTGTATGTTGAGTTTTAAATTGCGTAAATCCAAT TTTTCTATATTGCTGCTTGGTAATAACTTTTACTTCCGGTTGTGCAGATTTTTACAGGGCAATTACCTTGGTGGAATGAT TCCAAGTGAAATAGGAAACCTTTCACAGCTTCAAAATTTGTGAGTTTCTATTAAGTTTATACTTCTCTTTTTATTTATAT TTAATTATTTGTTTCTGAATCCCAAAGAGCCTGTATTTTATAAAAAATGACTAGACATCCATCCCTCTCAACCCCTCCTC ATATTTACGGGCAACATGCGTCACTCACTAACCTATTAACTAACAAACTATTATTCTGTGAAGTGTTTAGTGTTAACTAA CTAATCCAATTAACTGAGTGTACCTATCAGAATCAAACACTGAAGATATTGTAGTACAGTGTTGTTCTGTTTTCATTTGA TGAATAAATGGCCCAAGAATACACATTAAAACAAAAAGCAAACTTTGAGATCATTTGTCTGGTGTGTATCCAACAAAGTT GGTTTTTGATTGAGCTCAATGGCGTAGTGTGATCCATATAGCTGACTTCATCTAGTGGTTTAAGGCTTTTGTTGTTGGTT GTTGTCTGGTGTTCCGTGTTCATGCATGAGGTGTGGGTATATTTATCATGCACATGTGTCTGCTAATTTAGGAAAGAACT 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GTCAAAGTTGACACCATTGTTTGTCTTAGAAGCCATCAATCGATTGACCTCAAGTGTGTTTTATTTCTGTGTGGTTGTTG TTGGTGAGTTGTTGTTTCAGCCTTGTTTTGTTTTCGGGCATATTGTTGCTGGTTTTTCGCCCTTGTTTGCTGGCTCAGCT ACCCTACGACACTCCAGAAGAATTGGTTTTTGTCTTGCATCAGTTTCAGCCAGATCAAGTATGAGAAGTTGTCTTTTGCC TGCCCATGAATTTACTAGAAGTTTGAAAGGTTATTCAATTCAGAGATTCGCCAAGACCGTCATTATTAAGGATATCTATT AAGATAATTTTCTTCTTGGGTTAGATTTGTGACAAGCTTAAAGCTAAGTAAGCTTTAGCTTGAGGGGGAGTGTTGAATAT CTGTTAAGATTTAGTTTATTATTAGTCTTATCTCATAGAGATATAGTTAAGATTTGTTTATCTATTTTACATTAGTATCT ATTTAAATAGAGATGATATCTATTTAATTAGAGATAGGTTTAGATAGATTTAGTTTCTTTTTATCTATTTGTTAGTCTAT ATTGTAGTTTTCAGTCACGTATTATCAATGAAATATAGATATATTTTATCAAATTCAAGTTATATATATATATAAATATA TATATATATATATATATATATACATTTGAGAAAATTAGTTAGTTCCTTCATCACCATGTCTCCCTATTTTACAGGGATTT ATCAAGCAATTCCCTTGATGGGAATATTCCAGCATCACTTGGGAAGTTGGAGAACCTCAAATACTTGTATGTAGACTTAC TCTTTTCTGCTCTGTTTTTTTATTGGTCATTTTTATTAGTTTGGCATTTTGTTATCAAATGAAATTTTTTACTATCGTGG TCTTGTTGGATACTCTGCAGTAATGTATCAGCCAATTTTCTGGTCGGACCAATACCTTCGGACGGTATCCTTGCCAAATT TGCTGGAAGCTCGTAAGTACAGTTTTTTCTGTTTATAGATTATCAGTAGGTTTAAGTTCTGATGGGAATATGCCTGATTG GCTGTATAGTTTGTTTGCATCCTTGGGTTTTCAGGGTGAAGCTATTGGCACTCTCAATTGCTAATGCACACAGTACATTA ACAACTCATTATTGTAGTTTCCTAAGTTATCCTTGGCTATTTTTTTTTGTATTAAAGTTTAATTTTAATCAAATGTATTA ATATTAGTCTTGTCACACTCCATGGTATTAGTTAGTTAAGCTTTTATTTATGTATTCAAAATCTTACAATTTTCATTATA TATATGTTATAATATTTAAACCGTCTTTTTATCTTTTATCTTTTTTTTTTCTTTTCTGGTTTGCTTGGTAGTCACACATT TAAATTTAATAAATTTCTCAATTCTACTTTCTCTTTGTTTGGAATGTGACATAGCTAGAAATATTTTATGACTTTTCATA CTGTGAGCTGCATACTTTTGCCTTGTATTTTTCTTAGTTGAATGAAGAGGCGTTCCGTTTAAAAAATTATCAGAATAAAC TTTTGTGATAGTTGGTTCATGACAAAGAAGAAGTCTTGCAGTTCCTTCACAGGAATCATGGCATTTGATATTGTTGTTTT GTTATGTTGAAATCCATCTTAGTTTTCCTTTAGGCATAGATTAATTCCGAATATGCCTCATATTAGCTGTCCAGTCTTGT GATAATTTATTATGTTATTCTGGCTGATATTTTTATAGATGTACTAAGTCAGGACATAAATATCATGAATAATTTTATGT TTACATTTTTTCCCTTGATGATCATTGATATTATTAGACTGTCCTAATGTATTGTCTACCTCTATGGATCAATATTTGAG AAAAGTATTCATTTTTGTAGCTTTGTTGGAAATCGCGGTTTGTGTGGAGCGCAAATCAGTTCAACATGTAAAGATGGCTC GCCTGGGACAAATACATCTAATTCCTCGGGTACAACATGATTTTGAACCAAGTCCTTAATCCTTCATTTATCCTCGTGCC AATCTTGCTATCTTTCTTTGTTTTAATGATGTATCGTCTTTTCATATTTTTAGGTTAAATATTTGAACCTTTAGCTTTAT AAATATTCTGGTTAAATCTTTTCAATAAAAGGTGGTATTTTAAGTCCTCAACTGATTTTAGATGGAGCTGAAATGAAGAG TGGGGAAACTTTTGTTGAGGATATTTTGAAGTTGGTTGATGTTTTTTGGTTAAATTTTCAATCCTGGACCTATATTGTCA TATAAATAAGGGTGAAGTAGAGTCACAACAAGGTTCTGGTGGCATTTCATAATCGGACTGCAATCAACGGAAAATATGAG AAACTTTGGTGTTTGGGTCTTTGGGTGTATGTATACAAAGTCAATCAGTCAGAGGAGTCCCTCTATTTTTTGAATAAAGT TCTGTTTGTTGGGCTATTCAAAATGTCCAACCAGGCAAACTGAATAAATGAAGGAAAAATTTAGCAGCTGTGAGCAAGCT TTGTTTAAAATTGATTAATTTTTTTAGAAATAGTTCATTATGAAGTTAATAATCAAGATTCTGTCTTTGTTCGAGATTTC TTAATAGTGCAAGCAAACAGATCATAATTTTTGTCTGACTTTTGATTCCTTGGCATAGCTTTGATTGGACTTTAATGAGT TTTTGTTTTCACGAAACAGTATCAACAGTGTTGTATATATGTATATACTACAGTTAATTGGATCGCGTTGTTTCGAATTA CATTTTGACTTCTTGTTTTGCTCTTTCTAGATTCAAATCAAAATGGAAAGAAGAAATATTCTGGCCGGCTGCTCATCAGT GCATCAGCAACTGTGGGTGCACTACTTTTGGTGGCACTAATGTGTTTCTGGGGTTGTTTTCTTTATAAAAAGTTTGGTAA AAATGATAGAATAAGTCTGGCAATGGATGTCGGTGCAGGTGACCTTGTCTTTCTTTGGCTTGCAGATAGACCTGTTTAAG CTTGCTTTTCATGCTCCATGCATTGAAAAACCCTTGAATATTAATATCTCCAAATAATGTCTTGTAGGTGCTTCAATAGT GATGTTTCATGGAGACCTACCATATTCTTCGAAAGACATTATTAAGAAACTAGAGACTTTGAATGAGGAACATATAATAG GGGTAGGGGGATTTGGAACCGTTTACAAGCTTGCAATGGATGACGGCAATGTATTTGCTTTGAAAAGGATTGTAAAGTTG AATGAGGGCTTTGATCGTTTTTTTGAGAGGGAGCTTCAAATTCTTGGTAGCATCAAACACCGTTACCTAGTGAACTTACG AGGATATTGCAATTCACCTACGTCAAAGTTGTTAATATATGACTACCTACCTGGTGGTAGTCTCGATGAAGTTCTTCATG GTAAGATGCCTATTTAAATACTTAATAGATTTTCATCATCAAATTAATGCATGAAACAAGTACAGCTGTATTATTGGGCG CTAGTGCTGGACTTAAAGGCTGGCATATGGCAATTACTAATTAGAACGTCAATGCTTACATGTGGTAATCATCATCTAGT TCTCCTTGATTAAAAACTCTCAAAAAAGGTCCCTACATAAATATATATGTAATATGTTACACGCATTCATTATTAAACAA GTACTTGCAATTGCAACCTTTTCTTTTCCATAGCAGCTGAGCATGTAAAACTTTAGTGCTTTTTGAATACAACTCAACCG GGAATTATGTTGTATGGAACATTTTGATGCATCAAAATTTGGTTGCAAACTTATTAAAATTTCTATCTGCTTGGGATGTG GTGCTATTATATGCTTTAATTGTTTGATTGTTAAATTTGGCCTTCTCATTTATTCTGCACTAGTTGATACTTGATACAAA TTCAATTGACATGGAAGCTAGTACAGTCATTATCTCTGCTTTAATCTTTTTGGGAGGATAATGTTGTTTGTGATGCATTG CACAGAAAGATCTGAGCAACTAGACTGGGATTCACGCTTGAATATAATAATGGGGGCTGCAAAAGGGCTGTCGTACTTAC ACCATGATTGTTCCCCTAGAATCATACACCGAGATATAAAATCGAGCAACATTTTACTTGATGGAAAATTGGATGCTCGG GTCTCAGATTTTGGACTTGCAAAACTTCTGGAGGATGAAGAATCTCACATCACCACAATTGTTGCTGGGACATTTGGTTA TCTTGCTCCAGGTAAGCAATGTTGAATGGATATGATATTGACCTGATAGATAGTTGGCTGGAGCATGATTAATGATTTTA GCCTTTAAATTATTAATCAAATTCTGCTGGTGTCAGGGTATGTATAGCTAGTTAATACGTGGTCTCATACTGCATGGATA TTCTAGTTAATACGTGGTCTCATACTGCATGGATATTTATATGTTTATCTCTTGTTTTGATGTGTTCACAGGAAATATCT TTCTGTTGTAAGTGCTTCTGAAATTGTACTAGATTGATTTATGAGAAAGATGAAATACATCGGTGTTGAAGTCTTTCTTC CTCTGGCCATTAAAGAGAGAGGGGGAGCATGAGAGAAAATTGTTGAATATGTTCAAACTTCAAAGCCTTTATAACATAAA GTAGCTGCTAATAATCAATATACATGTTAAGCTTCACCATTTCGTTACTTGGAGTGGCTGGTTATGTTTGGGGTGTGCTA AAATGTGGGTTTTTGTTGGACTATTAGTTTTCCATTTTAACTACACGCCTGATCAAGCCTTTGTACTACAGAGTATATGC AAAGTGGCAGAGCAACTGAGAAGACTGATGTGTATAGTTTTGGTGTGCTGACACTTGAAGTGCTGAGTGGAAAGCGGCCA ACAGATGCATCGTTCATTGAAAAGGGTCTCAATATTGTTGGTTGGGTAAGCTATGCACTTAGATTTTAGTGCGAATTATT ATCTCTTTTCCAGTATTTTAAACACTGTAAAATAACTGAAATTAGTTATCATCTTCTAGTACATTCTAGTACATATATAA GCTTTGTAGCTTGTTATGTGATAATTACAAAGCAAGATTCCCATTCTGATGCCACTTATTCACCATCTTTGCAGTTGAAT TTTCTTATTACGGAAAATAGGGCGAGGGAAATTGTGGATCCACTGTGTGAGGGGGTGCAGGTAGACAGCCTTGATGCCTT GCTCACTATGGCGATTCAGTGTGTTTCCTCAAGTCCAGAGGATCGACCCACGATGCACCGAGTGGTCCAGTTGCTAGAAT CGGAGGTCGTAACTCCATGCCCAAGTGACTTCTATGATTCCGACTAGAAAGCTCGCGAAGATAAATTGGACAGTATGTTG TGTTTGCATCCATGTCACTGCAAATTGCTTGGAAGTCAGAAGCGAAGAAAGAGGCTCAGAATCTACAGTGCCACTTTTTA TATCGATTGCATTCATTCTTAAGGTTTGTGATGACAGATGTCTTCATTAGACCACTTCGCGACAGAATTTGTGGTCCTCT GTCGGATGTCATCATTGGACATGTTCATGCATTTCTTTGTCTTCTGAGTTGCATGTGTAACTTGATAGTGGTTCTCCCTT CCTATTTCGTTTTCCCACTCTTGTTAGCATTTGTAATCTTAGTCACATTTGTCCTCTCCAATTTAAGTGTATATGAATGT GTACAAGCTCAGAAAGTCTACTTTTGCAAGTGATTCTTGTTATTTTTTTTGTAATATATGTTTCCACAAAAGAATTCATC AAAAGATGCTGGTTTCACTTGTCTGTAAATGTTTGTGTTTTGTAATGCTTCTTACAATTTGGCTGACAAAAATGCATTTT TTAATAAAATAAAGAACACAATATAAATGTAGAATATAACCACAAAACATAGATTCTCTCACACTTAAGAGGACTATAGA GTAGTGATTAGCTTCTGTTGTATTCTCTGTGGGTATATTAGTGTATTGCTATGTTGAGTTCGGTTATGGTTGTTATGGTC AGTAACATTAGTTCCACTATTAGTTAAGTGATCGTTGTCACTGTAATAGTATTTGGTTAAGAGCCG 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0345300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGCATTTGTCTGATAAAATGGCAATGGCTGTGGCGGCTTCTTTTTGTTTCGCTGATACATGTTGTAACTTATAAAAG TGAAGCAACCAGTCCTGATGGTGAGGTACTTCTCAGCTTCAGGACAGCAGTTGTTAATTCTGATGGTTTAGGATGGAGGC CAGAGGAGCCGAACCCGTGTAAATGGAAGGGAGTGAAATGTGATCCAAAAACCAAGAGAGTAACGCATCTGAGTCTATCT CACCGTAGGTTAAGTGGCTCTTTATCACCTGACCTTGGGAAGCTAGAGCATCTGAGAGTTCTTGCTCTTCATAACAACAA CTTCTATGGGAAAATTCCATCAGAATTGGGAAATTGCACTGAATTGGAAGGAATATTTTTACAGGGCAATTACCTTGGTG GAATGATTCCAAGTGAAATAGGAAACCTTTCACAGCTTCAAAATTTGGATTTATCAAGCAATTCCCTTGATGGGAATATT CCAGCATCACTTGGGAAGTTGGAGAACCTCAAATACTTTAATGTATCAGCCAATTTTCTGGTCGGACCAATACCTTCGGA CGGTATCCTTGCCAAATTTGCTGGAAGCTCCTTTGTTGGAAATCGCGGTTTGTGTGGAGCGCAAATCAGTTCAACATGTA AAGATGGCTCGCCTGGGACAAATACATCTAATTCCTCGGATTCAAATCAAAATGGAAAGAAGAAATATTCTGGCCGGCTG CTCATCAGTGCATCAGCAACTGTGGGTGCACTACTTTTGGTGGCACTAATGTGTTTCTGGGGTTGTTTTCTTTATAAAAA GTTTGGTAAAAATGATAGAATAAGTCTGGCAATGGATGTCGGTGCAGGTGCTTCAATAGTGATGTTTCATGGAGACCTAC CATATTCTTCGAAAGACATTATTAAGAAACTAGAGACTTTGAATGAGGAACATATAATAGGGGTAGGGGGATTTGGAACC GTTTACAAGCTTGCAATGGATGACGGCAATGTATTTGCTTTGAAAAGGATTGTAAAGTTGAATGAGGGCTTTGATCGTTT TTTTGAGAGGGAGCTTCAAATTCTTGGTAGCATCAAACACCGTTACCTAGTGAACTTACGAGGATATTGCAATTCACCTA CGTCAAAGTTGTTAATATATGACTACCTACCTGGTGGTAGTCTCGATGAAGTTCTTCATGAAAGATCTGAGCAACTAGAC TGGGATTCACGCTTGAATATAATAATGGGGGCTGCAAAAGGGCTGTCGTACTTACACCATGATTGTTCCCCTAGAATCAT ACACCGAGATATAAAATCGAGCAACATTTTACTTGATGGAAAATTGGATGCTCGGGTCTCAGATTTTGGACTTGCAAAAC TTCTGGAGGATGAAGAATCTCACATCACCACAATTGTTGCTGGGACATTTGGTTATCTTGCTCCAGAGTATATGCAAAGT GGCAGAGCAACTGAGAAGACTGATGTGTATAGTTTTGGTGTGCTGACACTTGAAGTGCTGAGTGGAAAGCGGCCAACAGA TGCATCGTTCATTGAAAAGGGTCTCAATATTGTTGGTTGGTTGAATTTTCTTATTACGGAAAATAGGGCGAGGGAAATTG TGGATCCACTGTGTGAGGGGGTGCAGGTAGACAGCCTTGATGCCTTGCTCACTATGGCGATTCAGTGTGTTTCCTCAAGT CCAGAGGATCGACCCACGATGCACCGAGTGGTCCAGTTGCTAGAATCGGAGGTCGTAACTCCATGCCCAAGTGACTTCTA TGATTCCGACTAG 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0345300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGICLIKWQWLWRLLFVSLIHVVTYKSEATSPDGEVLLSFRTAVVNSDGLGWRPEEPNPCKWKGVKCDPKTKRVTHLSLS HRRLSGSLSPDLGKLEHLRVLALHNNNFYGKIPSELGNCTELEGIFLQGNYLGGMIPSEIGNLSQLQNLDLSSNSLDGNI PASLGKLENLKYFNVSANFLVGPIPSDGILAKFAGSSFVGNRGLCGAQISSTCKDGSPGTNTSNSSDSNQNGKKKYSGRL LISASATVGALLLVALMCFWGCFLYKKFGKNDRISLAMDVGAGASIVMFHGDLPYSSKDIIKKLETLNEEHIIGVGGFGT VYKLAMDDGNVFALKRIVKLNEGFDRFFERELQILGSIKHRYLVNLRGYCNSPTSKLLIYDYLPGGSLDEVLHERSEQLD WDSRLNIIMGAAKGLSYLHHDCSPRIIHRDIKSSNILLDGKLDARVSDFGLAKLLEDEESHITTIVAGTFGYLAPEYMQS GRATEKTDVYSFGVLTLEVLSGKRPTDASFIEKGLNIVGWLNFLITENRAREIVDPLCEGVQVDSLDALLTMAIQCVSSS PEDRPTMHRVVQLLESEVVTPCPSDFYDSD 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SignalP_EUK 1 25 25 -
Phobius 1 239 239 -
Gene3D 25 215 191 9.8E-56
Pfam 32 68 37 2.5E-6
PANTHER 44 587 544 1.8E-155
PANTHER 44 587 544 1.8E-155
SUPERFAMILY 50 186 137 1.51E-34
MobiDBLite 213 232 20 -
Phobius 240 265 26 -
TMHMM 241 263 23 -
Phobius 266 590 325 -
Gene3D 280 382 103 9.8E-20
SUPERFAMILY 292 574 283 1.09E-74
ProSiteProfiles 307 579 273 39.085
SMART 307 579 273 9.3E-32
Pfam 309 572 264 4.8E-46
ProSitePatterns 313 339 27 -
Gene3D 383 580 198 9.7E-62
ProSitePatterns 426 438 13 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.
Biological process Cellulose biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of cellulose, a linear beta1-4 glucan of molecular mass 50-400 kDa with the pyranose units in the -4C1 conformation.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0345300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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