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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0406600 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0406600.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Subtilisin-like protease; TAIR: AT5G67360.1 Subtilase family protein; Swiss-Prot: sp|O65351|SBT17_ARATH Subtilisin-like protease SBT1.7; TrEMBL-Plants: tr|G7IU18|G7IU18_MEDTR Subtilisin-like serine protease; Found in the gene: LotjaGi2g1v0406600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:90379005..90395039) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAAATTGAAAACACAATCAAACAGGCCCGAATGTTCCGATTCTCTCATTTCTTCATTTCTTCTCTCTTCAGTTTGTGA ACTCCAGAACGATGTTCTTAGCCCAAATACTTGATTTTAATCCCAAGACCTTTTAGGAAAGACATATCTCACTGATCAAT GATAGTTATTACCAAGAAGAATCCCCCAATCTTTGATTTTATTGAGGTCTTTGTAATTTTCCTTTTTCTCCATATTTCTT GTCACACCACAACATTCTTGACTCGTTTCCATATGGAATTGGAACCCGCAGGCCGAAGTTCCAAACCCATCATCAAGTCT CAGTTCTTGATCGGTTCTTGAGGCACGAACCAGAGCATGGAACGAACGAGTCCTTGATCGCCTATCTCAAAACCTAACTC ACCACAGGTTTCTAATCTTTTCTTTCTTTCCCAAAACCTAACAGTTATAACTGAATTTGCTCATAGTAATACTCTGAACT GTTCTGCACCTTCTGATAGTTTTTTCAACACCTTCATAGTCTATATTATAAACAAGGTGATTGAAATTTATGCAATATTA ACTATCAAAGTATGATATTTATCTGTATGTTGCGTCCGGTTTCATTTTGCGAGTTATATCTATTTTGCAGGCCATGGTTG CTCGGGGGACCTTGGAGCTGAACTTCCAATAGAGGAAGTTCCTTTATTGCAGGTGATCTGATGCTCCGAGTAGCATGACA TGAGGGCCATTTTTGAAAGATGTATGTGAGTTCTTTCGTGATATCATAATCTACGAATTGTGTTGGTAATTGAGGGATGC GGTGTTTAGTGTCACTGTGAAAGTATAATAAAATAAGAGCAATTGCATTAGTTGTTATGAATTTTAATTTGTAGGATCAT TCTTCCGATATCTTTAGTCTAGTGCGTCAATTGAAGGTGGAACTCTTAGATGTTGACATATGCTGCTTTCAAACTGTTGT 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0406600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGACGTATAAGAAACCTCTTGCTATGATCACACTCTCTTTTTTGTTTCTTGTTCTCTGTGATGTATCTCTGGGGAG AAAAGAGAAGCCCACGACAAACCAAAAGAGTACTTACATAGTACATGCTGCCAAATCCCAAATGCCAGAAAGCTTCGATC ATCACTCGGCTTGGTTCGGATCGACTTTGAAGTCGGCTTCGGACTCAGCAGAAATGATCTACACCTATGACAAAGCTATT CATGGATTCTCGACAAGGTTAACACCAGAGGAAGCCTGTTTGCTGCAAAGTAGAAATGGGATTTTAAAGGTGCTGCCAGA TGAAATCTACAAGCTCCATACAACTCGAACACCACTGTTCCTCGGGCTCGATAAAATCGCTGCAAGCACATTCACCCAAT CCAACATAGGATGTAGTGACGTCATCATCGGAGTCATAGACACAGGTGTTTGGCCTGAGAGCAAGAGCTTCGACGACACC GAGTACGGACCCATCCCCAGCACTTGGAAAGGAAAATGCGAGGTAGGTGCAAATTTCACAGTCGCCAACTGCAACAAGAA ACTGATCGGAGCTAGGTTTTATAATAGTGGCTTCGTGGCCTCGATGGGCCCAATCGATGAATCCATAGTTTCTCTCTCTC CGCGTGATGATATAGGTCATGGTAGCCACACTGCCAGCACTGCTGCAGGCTCTCCGGTGAAAAACGCGAGCCTCTTCGGT TATGCCACCGGAACGGCACGTGGGATGGCCCCACATGCTAGAGTCGCCGTCTACAAGGCATGCTGGAAGGATAATTGTTT TGTTTCTGACATAGTGGCTGCGATCGACCAAGCCATAGCCGATAATGTGAATGTCCTTTCCTTGTCGCTTGGAGGTGGAC AATCTGATTATTTCAGGGACAGCCTCGCAGTTGGAGCGTTTTCAGCAATGGAGCATGGAATTGTTGTGTCTTGCTCTGCT GGGAACGCAGGTCCTAAACCTTTTTCTCTCACTAACGCTGCACCTTGGATTATGACTGTGGGAGCTGGCACACTTGATAG AGATTTCCCAGCATATGTAAGCCTCGGAAATGGAAAAAACTATACTGGTGTGTCCCTTTACAGCGGCAAAAAATTTCCTG ATAAACCCGTGGCACTCACATACGGGGAGAATGCAAGCATAGGAGGAGGGACACAATTGAATTCCCAGTTGTGTTTGCCA GGGAGTTTGTCACCACAAAAAGTCAAGGGAAAGATCGTGGTGTGTGATCGCGGAACAAATAGTAGGGTGGAGAAAGCAGA GGTGGTGAAATCTGTCGGCGGTTTGGGCATGGTGTTGGCCAATGGCGCGACTGAGGGGGAGGAGTTGACTGCCGATTCAT TTGTTTTACCGGCGCTCTTGGTGGGCGCAAAAGCAGGCGAAGCCATCAAGCAGTACTTGATTTCTGATCCAAAACCAACA ACAACAATTGTATTTGAGGGGACAAAGGTCGGGATCGAACCTTCCCCTGTCGTTGCAGCGTTCAGCTCCAGGGGCCCAAA TCCTGTCACCTCAGACACCTCACAAATATTGAAGCCTGATTTGATCGCGCCAGGTGTCAACATCTTAGCTGCATTTACCA GGAATGCGGGTCCGAGTGCTCTGGATTCAGATGAAAGGCGCGTGGATTTCAACATCCTCTCGGGCACGTCCATGTCATGC CCTCACGTGAGTGGTATTGCAGCTTTAATTAAGTCAGCTCATCCAGACTGGAGTCCGGCCGCGATTCGGTCTGCGTTGAT GACAACAGCTTATTCGACTTACAAGAATGGTAAGCCATTGCTGGACAGTGCAACTGGAAAACCAGGAACACCGTTTGATT TTGGCGCAGGACATGTAGACCCTGTCCCTGCACTTAATCCAGGGCTTATTTATGATTTGACGGTGGATGATTATCTGAAT TTTCTCTGTTCGATAGACTACACACCTGAAATGATTGAACTCATCGCGAAAAGAAAATACGTGTGTGACGGAAAGGCACA CTACTTTAATTACCCTTCATTTGCAGTGATTTTTGATGCTGGTGAGAATGGTACGCAGGTTAAGCAAATGCGAACTCTCA CCAATGTGGGTGCTGCAGGAACATACAAGGTATCAGTTCAGACAACTATCCCGGGTGTCAAGATCATAGTTGAACCGGAA GTGTTGAGTTTTGGAGTAAATGAGAAAAAATCCTATACTGTTACATTCACGGCACCAGGTGTGAAGCAACAGAAAACTCC AGGTTTTGGACGTTTGGAATGGTCTAATGGAAAAAACATTGTTCGAAGTCCTATCTTATTTAGTTGGGAACCGTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0406600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
METYKKPLAMITLSFLFLVLCDVSLGRKEKPTTNQKSTYIVHAAKSQMPESFDHHSAWFGSTLKSASDSAEMIYTYDKAI HGFSTRLTPEEACLLQSRNGILKVLPDEIYKLHTTRTPLFLGLDKIAASTFTQSNIGCSDVIIGVIDTGVWPESKSFDDT EYGPIPSTWKGKCEVGANFTVANCNKKLIGARFYNSGFVASMGPIDESIVSLSPRDDIGHGSHTASTAAGSPVKNASLFG YATGTARGMAPHARVAVYKACWKDNCFVSDIVAAIDQAIADNVNVLSLSLGGGQSDYFRDSLAVGAFSAMEHGIVVSCSA GNAGPKPFSLTNAAPWIMTVGAGTLDRDFPAYVSLGNGKNYTGVSLYSGKKFPDKPVALTYGENASIGGGTQLNSQLCLP GSLSPQKVKGKIVVCDRGTNSRVEKAEVVKSVGGLGMVLANGATEGEELTADSFVLPALLVGAKAGEAIKQYLISDPKPT TTIVFEGTKVGIEPSPVVAAFSSRGPNPVTSDTSQILKPDLIAPGVNILAAFTRNAGPSALDSDERRVDFNILSGTSMSC PHVSGIAALIKSAHPDWSPAAIRSALMTTAYSTYKNGKPLLDSATGKPGTPFDFGAGHVDPVPALNPGLIYDLTVDDYLN FLCSIDYTPEMIELIAKRKYVCDGKAHYFNYPSFAVIFDAGENGTQVKQMRTLTNVGAAGTYKVSVQTTIPGVKIIVEPE VLSFGVNEKKSYTVTFTAPGVKQQKTPGFGRLEWSNGKNIVRSPILFSWEP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 7 | 7 | - | – | |
| Phobius | 1 | 26 | 26 | - | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 26 | 26 | - | – | |
| Phobius | 8 | 21 | 14 | - | – | |
| Gene3D | 22 | 113 | 92 | 4.2E-13 | ||
| Phobius | 22 | 26 | 5 | - | – | |
| Phobius | 27 | 771 | 745 | - | – | |
| PANTHER | 27 | 770 | 744 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 27 | 770 | 744 | 0.0 | – | |
| Pfam | 38 | 113 | 76 | 1.7E-12 | ||
| CDD | 110 | 591 | 482 | 2.57101E-149 | ||
| SUPERFAMILY | 112 | 629 | 518 | 3.01E-81 | ||
| ProSiteProfiles | 120 | 625 | 506 | 27.927 | – | |
| PRINTS | 138 | 157 | 20 | 1.4E-12 | ||
| Pfam | 139 | 616 | 478 | 7.1E-47 | ||
| Gene3D | 140 | 639 | 500 | 2.4E-185 | ||
| PRINTS | 216 | 229 | 14 | 1.4E-12 | ||
| Gene3D | 346 | 491 | 146 | 2.4E-185 | – | |
| CDD | 352 | 483 | 132 | 3.24139E-38 | – | |
| Pfam | 400 | 469 | 70 | 2.3E-9 | ||
| PRINTS | 554 | 570 | 17 | 1.4E-12 | ||
| ProSitePatterns | 555 | 565 | 11 | - | ||
| Gene3D | 642 | 769 | 128 | 2.0E-29 | – | |
| Pfam | 669 | 766 | 98 | 1.1E-22 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Serine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a catalytic mechanism that involves a catalytic triad consisting of a serine nucleophile that is activated by a proton relay involving an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine). | ||
| Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0406600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…