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LotjaGi3g1v0000800.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0000800
Transcript ID LotjaGi3g1v0000800.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Calcium-transporting ATPase; TAIR: AT3G21180.1 autoinhibited Ca(2+)-ATPase 9; Swiss-Prot: sp|Q9LU41|ACA9_ARATH Calcium-transporting ATPase 9, plasma membrane-type; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0H8K5|A0A0R0H8K5_SOYBN Calcium-transporting ATPase; Found in the gene: LotjaGi3g1v0000800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:159034..187194) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GTGCATAACACAAAGAGATAGAAAAATGGTATTGTTTGGTATCTAAATATAGAAGTTGGAAAGAGAGGAGGGGATGAAGG GAATGGTTAAGCTAGGTAGGCGCGGCAGCAATAGCAATAGCAATAGCAATAGATGGCAATGGCCAACAATAGACAAGAAA GAGGAAAAGGGAAACAGAGCAGCATTGTGATTTGGGAGGGCATGGTATGGTAATGGTGGTGCATGATTGATACCTACCAA TTAATCTGAATCTGAATTGAGAAGAAGAAGAAGAAAGGGAGGCATCAAATGACGAGCAATAATAATAATAATAATAATAG CAGTAGCAACATGACGTCGACGTCACGAGGTTCCTCCTCCTCCTCCAATGGCCTCCTCCCCGTCACCATCACCAGTAACC ACCCTGACGTCGACGTCTCAACTAATGGCGACCACTATGATGACGACGACGACGACGACTTGCTCGTTGATCCAAACGAC CCTTTCGACATTACCCAGACCAAGAATGCACCTCCCGAAACCCTCAAGCGTTGGCGAGTAAGACATAAATCACATCATCC CCTTTTTCATTTCACTCACTCACTCACTGTGTTTAGAAAGAATAGCATGTTTGGATGGATCAAATTTGACACCCAAGCCA AAAGTTACTCAGAAGCAAGCACAATTCATTTTGATTCTAGAATCAATTTTACAACAACTTATAACATGCACTGAATGTCA TATCTCATTACAATTTTGTTTGGTTCTTTTTCGCTTATTTTGCAGCAAGCAGCATTCGTGCTCAATGCCTCCAGGCGTTT TAGATACACTCTTGACTTGAAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGCAAAAGAAAAGCATGATTCGAGCCCACGCGCAAGTCATAA GAGTAATGTTTTTCTTATTACTCCCAATACAACCTTCCCAATTCTTTAAGTTTTTTCTTTTCTAATCATTGAATTATTCT 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TCTGTTTTACTTGTCTGTGGCTATAGCTTTTGTGGGTCAACCTCATCATGGACACACTTGGGGCTCTTGCACTGGCTACA GAACCACCAACAGACCGCCTTATGAAAAGATCACCAGTTGGCCGAAGGTTTGACTTGACTTTTTTACCCAGCTTAAGCTT AATATTTAGGGAGCGATTGGGCAAACAACTTAATTAAGCGCTTACGGCATTAAACGCTTATGTGATAAGTGCTTATGTGG TCACATTTTCTTTTTAAAATTTGAGGCACCAATAGTGCTATAAACGGTTGATTTTGGCTTAGAATTAACGTTTGTGTGCG CGTTTTCACTATGTTTTTATTATGTTTGGCTTTCAGGGAACCTCTTATAACAAACATTATGTGGAGGAACTTGATGGTAC AGGTAAAATCTAATTTATTCTATGCAGAGACTTGTTAATGTCATCATTGAATTGGAAACATAGGGAACTTCAGATATTAA GACTTAAATGAATATTTGATTTTTTGCTGCAGGCCCATTATCAAGTAATTGTTCTTCTGGTTCTTAACTTCTGCGGTGAA AGTATACTACATCAAGATTCTCAAACACAGACCATACAATTGAAGAATACTTTAATTTTCAACACATTTGTCATGTGCCA AGTAAGTACATCATACATGTTAATGAAAATATAAGATATTTGGCTGGCCCTAACATTAGGGAAGCCACTATTTAATGCCT TCGCTTATTATTCTATGAGTGTAGTTTCTCCATGGTTGATGGCTTGAACCCATGTAAGTGTGTAACCGCCTCAGACATCT TATATGAGATGTCTTTTTAATTGTCATGGCAAAATCTAATTAGTAGGGCAGAAAATGAGACACAAATTAGGGACAAAAGA TTTTCATTCCTCTTACCAAGATACCGCCTTCAGACACCTACATTAGATGTCTTTTTAATTGACATGACTACAATTTAATT 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0000800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGACGAGCAATAATAATAATAATAATAATAGCAGTAGCAACATGACGTCGACGTCACGAGGTTCCTCCTCCTCCTCCAA TGGCCTCCTCCCCGTCACCATCACCAGTAACCACCCTGACGTCGACGTCTCAACTAATGGCGACCACTATGATGACGACG ACGACGACGACTTGCTCGTTGATCCAAACGACCCTTTCGACATTACCCAGACCAAGAATGCACCTCCCGAAACCCTCAAG CGTTGGCGACAAGCAGCATTCGTGCTCAATGCCTCCAGGCGTTTTAGATACACTCTTGACTTGAAAAAGGAAGAGGAGAA AGAGCAAAAGAAAAGCATGATTCGAGCCCACGCGCAAGTCATAAGAGCAGCTTTGCTTTTCAGATTAGCTGGTGAACGCG AACTAGTGACAAGTACAACAGTGTCATCCTCAACTCATGATGGTGACTATGAAGTTGGGCTTGAACAACTTGTTTCGTTG TCTAAGAATCAGAATATTTCTGCCTTACAACAATATGGTGGGGTTAAAGGATTATCAAAATCACTAAAATCAGATCCGGA TAAAGGAATTAATGGAGATGATGTTGATCTATTAAAGAGGAAAAATGCATTTGGAACTAATACATATCCTCGGAAAAAAG GGAGAAGTTTCTGGAGGTTTCTATGGGAAGCTTGGCAAGACCTGACCCTTATAATATTAATTATAGCAGCTGCGGTGTCT TTGGTTCTTGGAATAAAAACAGAGGGTTTGGAAGAAGGATGGTATGATGGGGGAAGCATTGCGTTCGCAGTTCTTCTTGT CATAGTAGTTACAGCTGTCAGTGATTATCGCCAATCTCTGCAGTTTCAGAACTTGAATTCAGAAAAGCAAAATATACAAT TGGAGGCTATTAGAGGTGGCAGAACAATAAAAATATCGATATTTGATATTGTTGTTGGCGATGTAGTACCCCTTAAAATA GGAGATCAGGTTCCTGCTGATGGAGTTTTAATCACTGGTCACTCACTTGCCATTGATGAATCCAGTATGACTGGTGAAAG CAAGATTGTTCACAAGGATCACAAAGCACCTTTTTTTATGTCTGGTTGCAAAGTAGCAGATGGATTTGGTGCTATGCTGG TAACCGGTGTTGGTATAAACACTGAGTGGGGATTGTTGATGGCAAGTATCTCAGAGGATACTGGAGAAGAGACTCCATTA CAGGTGCGTTTGAATGGAGTAGCAACTTTTATTGGTATTGTTGGGCTTTCTGTAGCTGTTTTGGTGCTTGCAGTCCTCTT GGGAAGATACTTTTCTGGCCATACGAAAGATTTAGATGGAAATGTGCAATTTATTGCCGGCAAGACTAGTATTAGTGACG CAGTAGATGGGGTCATCAAAATTTTTACCATTGCAGTAACAATTGTGGTTGTTGCTGTGCCTGAAGGCCTACCTTTAGCA GTTACCTTAACCCTGGCATTCTCAATGCGGAAAATGATGGCAGACAAAGCCTTGGTACGAAGGCTGTCAGCATGCGAAAC TATGGGCTCTGCTACCACAATTTGCAGTGATAAAACTGGAACTTTGACCTTAAATCAGATGACTGTAGTTGAGACATATG TTGGGAGGAAGAAACTAAATCCACCAGATGACAAGTCAAAATTGCATCCAGAAGTTTTATCTCTGATAAATGAAGGCATA GCAGAAAATACAACTGGCAATGTTTTTGTGCCAAAGGATGGTGGAGAGACAGAGGTTTCAGGATCTCCTACTGAGAAGGC AATTCTTTCTTGGGCTGTGAAGTTGGGGGTGAATTTTGATCATATCAGATCAAGTTCAACTATTCTTCACGTCTTCCCCT TCAATTCTGAGAAAAAGCGAGGTGGTGTTGCTGTGAAACTGCCGGATTCTGCAGTACATATACATTGGAAAGGAGCTGCA GAGATAGTTCTCGGAACATGTACCCAATATCTTGATTCCAATGGTGACCTGCAATCTATTGAAGAAGAGAAGGTATTCTT TAAAAAGGCTATTGATGACATGGCTGCTCGGAGCTTGCGTTGCGTTGCCATTGCATATAGACCATATGAATTGGACAAAA TTCCATCTAATGAGGAGGATTTGAACAAGTGGTCCTTACCAGAACACGAGCTTATTTTACTTGCTATTGTTGGAATAAAG GATCCTTGTCGCCCTGGTGTCAAAGATGCTGTGAGGTTATGCACTGCAGCTGGCGTTAAGGTACGCATGGTTACGGGCGA CAATCTTCAAACAGCAAAAGCAATAGCTCTGGAGTGTGGAATACTGTTTTCAGATGAAGATGCAATTGAGCCAAATATAA TTGAAGGAAAGACATTCAGACAACTATCTGAAAAAGAAAGGGAACAAGTAGCCAAGAAAATAACGGTGATGGGAAGGTCT TCTCCAAATGACAAGCTTTTGCTCGTTCAAGCACTTCGTAAAGGTGGTGAGGTTGTTGCAGTCACAGGAGATGGCACCAA TGATGCTCCTGCGCTTCACGAGGCAGATATTGGTCTTTCTATGGGCATTCAAGGAACTGAAGTTGCCAAAGAAAGCTCAG ATATTATAATACTGGATGATAACTTTGCATCAGTAGTAAAGGTTGTTCGCTGGGGGCGTTCTGTTTATGCAAATATTCAG AAATTTATTCAGTTCCAGCTCACTGTTAATGTTGCTGCTCTTGTAATCAATGTTGTGGCTGCAATATCTTCTGGTGATGT TCCTTTAAATGCAGTACAGCTTTTGTGGGTCAACCTCATCATGGACACACTTGGGGCTCTTGCACTGGCTACAGAACCAC CAACAGACCGCCTTATGAAAAGATCACCAGTTGGCCGAAGGGAACCTCTTATAACAAACATTATGTGGAGGAACTTGATG GTACAGGCCCATTATCAAGTAATTGTTCTTCTGGTTCTTAACTTCTGCGGTGAAAGTATACTACATCAAGATTCTCAAAC ACAGACCATACAATTGAAGAATACTTTAATTTTCAACACATTTGTCATGTGCCAAATATTCAATGAGTTCAATGCTCGAA AACCAGAAGAAATGAATGTATTCCGGGGAGTGACTAAGAACCGTCTCTTTGTGGGAATTGTTGGAATGACCTTCGTACTT CAGATAATCATCATCGAGTTCCTTGGAAAGTTCACGAGTACAGTTAGGCTTGATTGGAAGTTGTGGCTTGCTTCTCTCTG TATTGGGCTTTTCAGTTGGCCTCTTGCTATAATTGGGAAATTCATTCCAGTTCCAAAAACGCCATTGTCCCGGTCCTTCA TGAAGACATTCAGGCGCTTGAAGAAATCTCGAACTGCATAG 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0000800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MTSNNNNNNNSSSNMTSTSRGSSSSSNGLLPVTITSNHPDVDVSTNGDHYDDDDDDDLLVDPNDPFDITQTKNAPPETLK RWRQAAFVLNASRRFRYTLDLKKEEEKEQKKSMIRAHAQVIRAALLFRLAGERELVTSTTVSSSTHDGDYEVGLEQLVSL SKNQNISALQQYGGVKGLSKSLKSDPDKGINGDDVDLLKRKNAFGTNTYPRKKGRSFWRFLWEAWQDLTLIILIIAAAVS LVLGIKTEGLEEGWYDGGSIAFAVLLVIVVTAVSDYRQSLQFQNLNSEKQNIQLEAIRGGRTIKISIFDIVVGDVVPLKI GDQVPADGVLITGHSLAIDESSMTGESKIVHKDHKAPFFMSGCKVADGFGAMLVTGVGINTEWGLLMASISEDTGEETPL QVRLNGVATFIGIVGLSVAVLVLAVLLGRYFSGHTKDLDGNVQFIAGKTSISDAVDGVIKIFTIAVTIVVVAVPEGLPLA VTLTLAFSMRKMMADKALVRRLSACETMGSATTICSDKTGTLTLNQMTVVETYVGRKKLNPPDDKSKLHPEVLSLINEGI AENTTGNVFVPKDGGETEVSGSPTEKAILSWAVKLGVNFDHIRSSSTILHVFPFNSEKKRGGVAVKLPDSAVHIHWKGAA EIVLGTCTQYLDSNGDLQSIEEEKVFFKKAIDDMAARSLRCVAIAYRPYELDKIPSNEEDLNKWSLPEHELILLAIVGIK DPCRPGVKDAVRLCTAAGVKVRMVTGDNLQTAKAIALECGILFSDEDAIEPNIIEGKTFRQLSEKEREQVAKKITVMGRS SPNDKLLLVQALRKGGEVVAVTGDGTNDAPALHEADIGLSMGIQGTEVAKESSDIIILDDNFASVVKVVRWGRSVYANIQ KFIQFQLTVNVAALVINVVAAISSGDVPLNAVQLLWVNLIMDTLGALALATEPPTDRLMKRSPVGRREPLITNIMWRNLM VQAHYQVIVLLVLNFCGESILHQDSQTQTIQLKNTLIFNTFVMCQIFNEFNARKPEEMNVFRGVTKNRLFVGIVGMTFVL QIIIIEFLGKFTSTVRLDWKLWLASLCIGLFSWPLAIIGKFIPVPKTPLSRSFMKTFRRLKKSRTA 

Domain prediction

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Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
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PANTHER 70 1096 1027 0.0
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SUPERFAMILY 172 1084 913 1.09E-120
Pfam 173 240 68 2.4E-13
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Phobius 257 276 20 -
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Phobius 277 406 130 -
Pfam 294 493 200 1.4E-35
SUPERFAMILY 294 388 95 9.42E-23
PRINTS 339 353 15 1.2E-34
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Phobius 407 431 25 -
Phobius 432 460 29 -
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PRINTS 508 529 22 1.4E-10
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ProSitePatterns 517 523 7 -
SUPERFAMILY 522 719 198 1.41E-37
Gene3D 525 722 198 8.5E-212
PRINTS 634 652 19 1.4E-10
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TIGRFAM 788 902 115 1.0E-31
PRINTS 822 841 20 1.2E-34
PRINTS 846 858 13 1.2E-34
TMHMM 882 904 23 -
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Phobius 903 913 11 -
Pfam 907 1082 176 2.8E-45
TMHMM 909 931 23 -
Phobius 914 931 18 -
Phobius 932 1028 97 -
TMHMM 1028 1047 20 -
Phobius 1029 1049 21 -
Phobius 1050 1060 11 -
Phobius 1061 1082 22 -
TMHMM 1062 1084 23 -
Phobius 1083 1106 24 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Nucleotide binding Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose.
Molecular function Calcium-transporting ATPase activity Enables the transfer of a solute or solutes from one side of a membrane to the other according to the reaction: ATP + H2O + Ca2+(cis) = ADP + phosphate + Ca2+(trans).
Molecular function Calmodulin binding Interacting selectively and non-covalently with calmodulin, a calcium-binding protein with many roles, both in the calcium-bound and calcium-free states.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.
Biological process Calcium ion transmembrane transport A process in which a calcium ion is transported from one side of a membrane to the other by means of some agent such as a transporter or pore.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0000800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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