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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0050800 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0050800.2 |
| Related isoforms 5 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | CCR4-NOT transcription complex subunit 1; TAIR: AT1G02080.2 transcription regulator; Swiss-Prot: sp|A1A5H6|CNOT1_DANRE CCR4-NOT transcription complex subunit 1; TrEMBL-Plants: tr|I1KJP7|I1KJP7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0050800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:5299182..5320865) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTCGGACTATTGTGATTAAAATAGTCTGGGTGGGTGATTTTGTAGAGACAATTAGAGTTCTGTGGTGGTGGTTGATAAT GTGACTCATTTTGCCATGATATATTTGTACTATTTTCCGGTATTGTTCTGCATTTTGCTTTCCCCTTAAATTGCCGTAAT CTGTGGAATAATAGGCTGAAATTGGTGTCAGAAGCTTGCTGCGGTAGATTTGGTTTAGGGTGCTATTTAATTTTTAAACA ATTCATATTTGGAGTGTTCTCTGTATTTTTGGTCTGACTAGATTGGTTATTGACACTTGCAGTTCACTGAGTTTGGAACT GTTGGATGCATTTTGCTGCTTCGGACTTGCTTGGATCACTTTAATTATGTCAGAAGAGATATGAATGACATGCAAAATGA GCCAATTCTGGGGGCAGTCATTAAGCACCTCTTGGACAAACCAAACTTCAGCACAGTGTTGTCTGAGTCAGTGAAGAATG TAGAAATTAATGAAAGCTTTCTCCAAAGTTTTTGTAACGGATTGCAGTTGTCCTTATTGGAAAAAATTGCCATCAGCCTC GCTTTGTCGGATTCCGAAAATCCCGATGCCAGGTTATGTGGTAAGTATGAAGTCAATTTATAGTGTCAGTTAGTGCTTAC TGTTATTCCCACATACATTTAACGGTACAGACAATATTGGTATCTTTCTGCAATATAATTTTCCTGGCCATTTCCATTTT TAGTGTGTTGCTATGTGTCTCATTTTTTTTCCTTGTTATTGTTATATACTTATATATTTAACCTAAACTATTGCGGCTTT GTAGGAAAGAATTTTTGCATGGCTCAGATTGAGGAATTGGGTGCCAGCCCTGGTTCTTTTAGTTGCCATGAACAAATTCA CAATATTATCATGTTCCTCAAGCAGTCTGAGGGTCTTTCCAAGCATGCGGACTCCTTCATGCAGATATTGTCACTGGTGC 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TCGTGCACTTCTTTTTACCTTTTTTTCCCTTGATACCCAGCTTATTATGTCTCCATTTAAAAAACAGGGTCCTGGTCCAC TTGCTGCAAACCGGGAAGACATGAACAATGTAGATTCTATTGAACCGGATCCTGCTGGATTCCGTGACCAGGTATTTTGT CCTTAAAATTGCTAGATAAGTTTGGATTTTTTTACGTGGATATTTGGTAAGAGTGTGCGTAGGATACCAATCAGAATTGG TTTTTATTTTGACTGCATTGTACTCTTGATGCATGGTTTGACCTAATGATGCATGGTTTTGACTGCATTGTACTTTTGAT GCATGGTTTGATAAGAGTGTGCATGGTTTGACTAAGCATACTTTTTATCCTATAGGTTTTATTTTCTGCAGCAGTAGTTG AGTATTGACTGAGTAGAATAATTCATGTATATGAATATGCTATGGTTTGAACTAATTGCACCTTAAAATTGCTCTCCAAA GTTTGATTATCCCTTGTTGTCAAGGTCCTTGTAAAGTTTAACCTTTGGCAATAAGAGATAAAGAGAATGAATAAGATGCA TATTTTGTCATGTTCTATTCAGACTAATGGAATTGTTTTATGACTGATCTGCATACCTTTGGAATTTTTTTATGGTCTCA TCCGCACTAATTTGACCTTCTAATGGTTACTACAATGCATGTGTTGTAGGTTTCCATGTTGTTCCAAGATTGGTATAGGA TATGTGAACTTCCAGGTGCCAATGATACAGCTTCTACCCATTTCATCTTACAGTTGCATCAGAATGGGTTGCTTAAGGGA GACGACATAACAGATCGCTTTTTCCGAGTGTTGCTGGTGGTGTTTCTTTCGTCAAGCAAGTTACTGCTTCCTACTGATTC CAGTATTGTCAATCTAACCTCCTTTTGTTGTCTTTTTACTAGGAACTTGCTGTTGCACATTGCCTATCCACTGAGGTGAA TAATTCTGGGGCATTGCAGTCTCCTCAGCAGCTGCCAGCAATGTCATTTCTCGCAATTGATATTTATGCAAAGCTTGTCT TCTATATCTTGAAGGTTTTCAACTGTGCTCTTATTCCTATAATCCTATCTCTTTTCTTTTGGGTAGCTTTACCTTCTTAC CGATTTTGTTCTTTGTTGGAACAGGGATCAAACAAACTATTCCTTCTTCCTAAGGTATGTAATGAACTCAAATCTAAATG CAGTTGCTCTTCCTCTTGGGCTTTATTAATTCTCTAATTTCTATAATGATGGTCTAAAAAGCTCCACGCTGCTTTCTGGC AGATTCTGGCAGTTACTGTTAGATGCATTCTAAAAGATGCGGAGGAAAAGAAGGCCTCTTTCAATCCAAGACCATTTTTC AGATTGTTCATCAACTGGCTTCTGGATCTTGGATCACTTGAACCTGTTACTGATGGTGCAAATCTTCAGGTATTTGGCAC TTCCATTTACTGCTTCATTAGTTTCCTTTTTTTTTTTTCCTTTTTCATTAAAGAGTGGCCCTTTCCCCATTTCTATAAGC ATTGTTCATCAACCTTGTATTATGAGATATAATCTGTTGCTAGGATCTTTATTTATAGCCTAGGGGACAGCTTCTAGCTG AACTGCTGATGCTTTACAAGCTGTATCTAACTAACTTACACAACTGATAAGTACTGTTACTGAAAGCCTAAGAACCATGT AAATAAGCCTAACAAAAGCACATAATAGAAAGTAACCATACTGCAGAATCTTAATAACCTGCGGTTTTTGCATCTCTCAA CTGCACCTTATCAGATGACTTTACCCAATAATATTGTCAATACTTGTTTTTTAAACTTCAAGCTTAGTCGCCAAAAAAGT GATTATTTCCCTAAAATAAGTTATCCAAATGCACACTATGACTAATACTACTTTCGTAATTGCAGATTTTGATTGCTTTT GCCAATGCATTTCATGCTTTGCAGCCCCTCAAAGTTCCTGCATTCAGGTTAGACTACGAATTATGTTGTTATAATTGATG ATTGGTTGAATTGTGGTATAACAAGTATTATAGCCATGGAATGGCATTCATTTGTTGGGAACGGATTCAATCCAGTAGAA CTCTTTCAGTTATTTGTGTGAAGTGTTATAAATACTTTTTGGATATATTTTCGTCTTTTACACTTATTTTGTTTAATCAT TTACCCTGTGTATTTTACTATTTAATTGGTTAATATGTGGAATATATCTTCAGTTTTGCCTGGCTTGAGTTGATTAGTCA TAGGAGCTTCATGCCAAAAATGGTGACGGGTAATGGTCAAAAAGGTTGGCCTCATATCCAAAGGTTGCTTGTGGATTTGT TCCAATTCATGGAGCCTTTTCTGAGGCATGCTGAACTTGGAGACCCGGTTCGTCTGTCTTTTCCTCAATTGTTTGCTCCC AATTTGGTCTGCTTATTTGCTCCAAGTGCTCACTTCTGCTTAATTTTGTCTTGGTGTTATAATTAGGTTCGTTTTCTCTA TAAAGGCACTCTTAGGGTGCTCTTGGTGCTACTTCATGACTTCCCAGAGTTCCTATGTGACTATCACTTTACCTTTTGTG ATGTTATCCCTCCAAGTTGCATTCAGATGCGAAATATCATTCTTAGCGCATTTCCACGTAGTATGAGGCTACCAGATCCT TCCACTCCCAATTTGAAGGTCTCCAAATCTACTATATTCTTTTTAACTTTTTGCTATGGCTAAGCACATTAAGATGACGA GTTTATTTCACTGTGTTGTGCTTTTGTATGCAGATTGATTTGCTTCAAGAAATAACTCAATCGCCTCGCATACTATCAGA GGTTGATGCAGCACTTAAAGCAAAGCAGATGAAAACTGATGTAGATGAATACCTTAAGGTCTGTCCCCTCCTCCCGTTCT CTTTTAATTGGTTATGTTATTGATTAAGGGTTTATGTTATTGATTAAGGCCCTTCTTTGCAAATTGTCTTCCTTTTTTTT ACCTTAAATATATTCTTCTCTTAAATTCTGCTGCACATCGTATTGGTTAGAGTTTCAACTTCATTCTACATTCATGTCTT TCACTTTCTTACGTTTTATTTAAATTGTGCAGACAAGGCAACAGAATTCTCCATTTTTGTCTGAACTGAAGGAGAAGCTG CTCCTCTCACCCAATGAAGCTGCCTCAGCTGGGACCCGTTACAATGTGCCACTAATTAACTCCCTTGTGTTGTATGTAGG AATGCAGGTACTGTAAATTTGAATCTTTGATGTTCATATTTTCCTCTGCAGTAATTAGTTCAAAATAACATGGAATAAAC CGAGGTTGAACTTCTAGAATGGATTTTGAAAATCACCTATGAGGAGATGAGAATGTTACTATGGATGGATGGTTACACAA TGCAAGGTAGGGTTAGGAATGAAATCATTATAGAGAGCTGGGTTTGCTCACTCGGTAGTAAAGATGATAGTTTCGTATTG GTGGTTTGGAGAAGAACCACAAAAGCACTGGAAAGAAGGTTGACCATGTGGAGAATAGTCCAGCAGTTAGGTCGCTGAAG ACGAAGGAAAACTATAGGCTAAACCATAACATACTTTATCTTAAAAGATATTCTGACTGAAAGATATATGTTTTGGTCAA AGTTTGTTAATTGTGAAACACGAAGAGCATAATACTATCATCTTGAATGTGCATTTATGTTTTCTTTCAATTTTTGTTTT TGTATAATAGGGTATTCAGGGACGAACTCCGCATGCACAGTCAGCCGGAATGTTGGCTGTATTTTCTGTTGGTGCTGCAT TGGATATTTTTCAGACACTAATTGTGGACTTGGACACGGAAGGGCGTTACCTTTTCCTAAATGCTATTGCTAACCAACTG CGTTATCCCAATACTCACACACACTACTTTTCCTTCATCCTGCTCCATTTGTTTGCAGAGTCTAACCAGGTATATATGTA TATAGTCTTGCTGTTTTTAATGTTAAACTCAATCCCAATCTGTTTTTACTTATGATAAACTTGTATTAATTTTGTCGTGT TTAGTCTGGCTTCAACTAATTGAAGAATATGCATAACTGTATTTATGTTGTGAATTTGCAGGAAATTATCCAAGAACAAA TTACAAGAGTCGTGTTAGAACGCTTAATTGTTAATCGACCTCATCCTTGGGGTCTCCTGGTTACTTTTATTGAGCTGGTC AAGGTATTCTTCAATTGCTTGTATACCTATCTCTTATCTCTTATGAGCATTTTAGTAGTTGCTTGCAATTAACACTTTTT TTCCTTTCTTTCTTTGTCATTGCCAGAATCGCATGTATAGCTTCTGGAACAGATCTTTCATAAGATGCGCGCCAGAGATC GAAAAACTATTTGAATCACTATTTGAATCAGTCTCAAGATCTTGTGGAGGTCCAAAACCAGTGGATGAGTCTGGATGGGT CTGA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0050800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAATGACATGCAAAATGAGCCAATTCTGGGGGCAGTCATTAAGCACCTCTTGGACAAACCAAACTTCAGCACAGTGTT GTCTGAGTCAGTGAAGAATGTAGAAATTAATGAAAGCTTTCTCCAAAGTTTTTGTAACGGATTGCAGTTGTCCTTATTGG AAAAAATTGCCATCAGCCTCGCTTTGTCGGATTCCGAAAATCCCGATGCCAGGTTATGTGGAAAGAATTTTTGCATGGCT CAGATTGAGGAATTGGGTGCCAGCCCTGGTTCTTTTAGTTGCCATGAACAAATTCACAATATTATCATGTTCCTCAAGCA GTCTGAGGGTCTTTCCAAGCATGCGGACTCCTTCATGCAGATATTGTCACTGGTGCAGTTCAAGGACACACCACCTTATG TTTTGACTCCAGTGCTACCAGATGAGATGCATGAGGCTGATTTTTTAAGGAATATGGAGTTGTTCCATGAGTCTGGAGAA AATGATTTCGATGCTATTTTGGCTGACATACAGAAGGAAATGAACATGGGAGATATTGTGAAGGAACTAGGCTATGGCTG CACGGTTGATGTCTTACAATGTAAGGAGATATTGTCGCTCTTCTTACCTATAACTGATAAAACGCTCTCGAAATTACTTG GTGCTATTGTTCGTACCCATGCTGGGCTGGAGGACAACCAGAGCACATTCTTAACTTTTGGCACGGCCCTTGGATACAAC AACTTGGCTGAGTTGCCGCCACTGAGCTCTTGGAATATTGATGTCTTGATAGATACAGTCAAACTCCTTGCACCTCAGAC AAATTGGGTACGGGTCATTGAAAATCTAGATCATGAAGGATTTTTCCTTCCTAGCGAAGAAGCTTTTTCTTTTCTCATGG CTGTATATAAACATGCCTATAAGCAGGAGCCATTTCCTCTCCATGCAATCTGTGGGTTTGTCTGGAAGAATACAGAGGGT CAGCTGTCTTTCCTCAAATATGCCGCATCAGCACCGCCAGAATTGTTTACCTTTGCACACTCTGCAAGACAGCTGGCATA TGTTGATGCGATTAATGGACACAAGCTTCAAAGTGGACATGCAAATCATGCCTGGCTGTGTCTTGACCTTTTGGATGTTC TCTGCCAGCTAGCTGAGAAGGGTCATGCCAGCATTGTTCGATCTATCCTTGATTATCCCCTTAAACACTGTCCAGACGTC TTGCTTCTTGGGATGGCACACATTAATACTACTTACAATCTCTTCCAGCGTGAAGTATCTCTGGCTGTTTTTCCCATGAT AGTAAATAGTGCTGTAGGCAGTGGAATGATTCTACACCTTTGGCATGTTAATCCCAATCTGGTCTTGCGAGGGCTTATGG ATTCTCAAAACAGTGATGTAGACAGCATTACTAAAATTGTGGACATTTGCCAAGAGCTAAAGATTCTATCGTCAGTGCTG GAAATTATTCCCTCTTATTATAGTATAAGATTAGCAGCTGTAGCTTCAAGAAAAGAATTTCTTGATCTTGGGAAGTGGTT GAGTAGCATCTTGACTACGTACAAGGATGTCTTCTTTGAGGAGTGCCTCAAGTTCTTAAAGGAAGTCCATTTTTCAGGAT CACAGAACCTCTCTGGCAATTCTTTTCATCAGCCTGGTGCTGTTCTGAATCTCTATACTGAGACAGCTGCTACCCTCTTG AAGGTTCTTAAATCTCATACTGACTTGGTTACATCTGGACTACTTAAAGAGGAGCTTGAGAGTTTGCACATATCTATTAT AGATTCAAATCCAAGGCTCCAAAATGGTGGGACTACTGATTCCTCTGCTTCTGATGGATACGCGGAGGACATTGAAGCAG AAGCAAACTCCTACTTCCATCAAATGTTTTCTGAACAGTTACACATTAATGCAATGGTGCAAATGCTTGCCCGATTCAAG GAATCTTCTGTGAAGAGGGAAAAATCAATATTTGAGTGCATGATTCAAAACTTGTTCGAGGAGTATCGGTTTTTCCCCAA GTATCCTGAAAGGCAACTCAAAATTGCTGCAGTCCTATTTGGTTCTGTGATCAAGCATCAGCTTGTAACTCATCTCTCTC TGGGGATTGCGCTTCGTTATGTTCTTGATGCATTGCGCAAGCCTGCAGATTCAAAAATGTTCTTGTTTGGAAGTCTGGCA CTGGAGCAGTTTGTGGGTCGTCTTGTTGAGTGGCCTCAGTATTGCAATCACATTCTGCAAATTTCCCATTTGCGCAGTAC GCATTCGGAAATAGTTGCTTTAATTGAACAGGCTCTTGCCAGGATTTCCTCTGGCCATATAGATGGAGATGGGGCGAGCC ATGCTTCCATAATTGGTAACCATAATTCTGCACAGGCTACATTTGGTCATGTGGAGCTCACTGGCTCTAGCGTGATACAA CCTGGACAGCCACATTTGTCTATGCAACTTCAACAGAGACATGAAAATTCCTTTGATGATCGTCACAAAGCCTCCATTGG TTCATCTTCTGATGTAAAACCACTCTTATCTACTCTAGGTCAATCTTCAGTAGTTACACCCGCTGATGCTTCTAGTACTA ATAAGTTACATAGCATAGTCAGCACCTCGTCAATGCTATCTTCTTCTCCTGGATTTGTTCGTCCTTCCCGGGGAGCTACT TCTGCCAAGTTTGGATCTGTCTTGAACATTGAAACTTTGGTCGCCGCTGCTGAGAAAAGAGAAACTCCTATTGAGGGTCC AGGATCGGAAGTTCAGGACAAGATATCATTTATAATTAATAATATATCATCTACCAATGTTGAAGCTAAAGCCAAAGAGT TCGATGAAATTTTGAAAGAGCAGTACTATCCATGGTTTGCACAGTATATGGTTATGAAAAGAGTGAGCATTGAGCCAAAT TTTCATGATGTGTACCTGAAATTCCTTGATAAAGTTAATTCAAAGGCTTTGAACAAAGAGATTGTGCAGGCAACTTATGA AAATTGCAAGGTTCTTTTAGGATCAGAACTCATAAAGTCAAGTTCAGAAGAGCGCTCTCTGCTGAAAAATCTGGGGAGCT GGCTTGGAAAGTTGACAATTGGTCGAAATCAGGTTTTGAGGGCTCGTGAAATTGACCCAAAATCTTTGATTATAGAGGCA TATGAGAAGGGGCTGATGATTGCTGTTATTCCATTTACTTCAAAGATCCTCGAACCATGCCAGAGCAGTCTTGCATATCA GCCCCCTAATCCTTGGACCATGGGCATTTTGGGATTGCTTGTTGAGATTTATTCAATGCCAAACCTAAAAATGAACCTCA AGTTTGACATAGAGGTATTGTTCAAAACTCTTGCCGTAGAGATGAAGGATGTCACACCAACTTCTCTCCTGAAGGATCGC AAAAGAGAAATTGAAGGGAATCCTGATTTTTCTAATAAAGATGTTGGGGTGTCTCAAGCACAACTGGTTTCTGATATAAA ACCTGGCCTTGTACCGCCTGTAAATCAAGTGGAGTTACCACCGCTTGAAGTCACAAATCCATCCAATCCACATATGTTGT CTCCGTATGCTGGTCCTCTACATATAACCACGGGACCATTGATTGATGATGAGAAAGTAACACCTCTGGGCCTCTCTGAT CAACTTCCAACCGCTCAAGGACTGTTACAAGCCACTACTAACCCATCACCTTTTAGCCAGCTCTCAACACAGATCCCTAA CATAGGGACTCATGTTATTATCAATCCAAAGCTCAGTGGTTTTGGATTGCAAATGCATTTTCAGAGAGCGGTACCTATTT CAATGGATAGAGCTATCAAAGAGATAGTCACTGGTATTGTGCAGCGCAGTGTTTCCATAGCAACACAAACAACTAAGGAG CTTGTTTTGAAGGATTATGCTATGGAATCAGATGAAACACGTATATTAAATGCTGCACATTTGATGGTTGCTAGTCTGTC CGGAAGTTTGGCTCATGTCACATGCAAAGAACCTTTACGAACATCAATATCAAACCAACTGAGGACGGCACTTCAGAATA TAAATATTGCAAGTGAAATCTTGGAACAAGCTGTCCAACTTGTCACCAATGATAATCTTGATCTTGGTTGTGCTGTCATT GAACAGGCTGCTACCGATAAGGCAATAAGCACCATAGATACAGAGATTGGTCAACAACTTTCTGTGAGAAGGAAGCATCG AGAAGGTATGGGCTCTACATTTTTTGACGCGAACATGTATCAACAAGGTTCAATGGGTGGTGTTCCAGAGCCCCTTCGAC CCAAACCTGGTCAGCTGTCCCTCTCACAACAGCGCGTTTATGAGGACTTTGTTCGGCTTCCGTGGCAAAACCAGTCTACC CAGAACTCACATTCTATATCTGGTGGTGTTTCTATTCAATCTGGAGGTACTGGTCTCACTGGTACCAGTGGTACTGTATC CGGACAAATGAGCCCTGGCTACTCTGTGAACACAGGATATGAAGGGGTCCCTCGACCAATAGATGATATTTCAGAATCTA ATTTGGCTCCGCATTTTAGTGCTTCCTCTGTTCACATCAGAGCCGCTGACAGTGTTTCCCAGCATAGTCTGGAGAAAGAC TCTGTTGCCTCATTTCCTTCAACTGCTTCCACCCCTGAATTACATACAGTGGATTCTTCTGATGCTGTTAAAGATTCTGG AGCTTCTTCACAGCCACCGGTTTCATCAGGTGCCATGGAGCGCCTCGGAAGTAGCTTCTTGGAGCCTACTCTCACTACAC GCGATGCTTTGGATAAGTACCAACTTGTAGCACAAAAGTTGGAAGCTGTCGTCAACAATGATTCCCGGGAAGCAGATATA CAGGGCATCATTTCTGAGGTTCCTGAGATCATACTCAGATGTGTTAGTCGAGATGAGGCTGCTTTAGCTGTTGCTCAAAA GGTTTTCAAGGGTTTATATGACAATGCAACTAACAACATTCATGTCTTTGCTCATCTTGCTATCCTAACTGCCATTCGTG ATGTTTGCAAGCTTGCTGTCAAGGAACTTACTAGTTGGGTAATTTATTCAGAAGAAGAAAGGAAATATAACAAAGATATT ACTGTTGGCCTCATCCGCAGTGAATTGCTAAATCTGACTGAGTACAATGTTCATATGGCAAAACTTATTGATGGGGGAAG GAACAAGGCTGCTACTGAGTTTTCTATCTCTCTTCTGCAAATCCTGGTTATTGAGGAACCTAAAGTTATTTCAGAACTTC AGAGTCTCGTTGATGCTTTGGCAAAGCTTGCCACCAAGCCTGGATTCCCTGAATCATTACAACAGCTTATTGAGATGATA AAGAACCCTGCGGCTAATACTTCTGCTCTATCTGCTAGTAATGCTGGAAAAGATGATAAGGCAAGGCAATCAAGAGACAA TAAGGGTCCTGGTCCACTTGCTGCAAACCGGGAAGACATGAACAATGTAGATTCTATTGAACCGGATCCTGCTGGATTCC GTGACCAGGTTTCCATGTTGTTCCAAGATTGGTATAGGATATGTGAACTTCCAGGTGCCAATGATACAGCTTCTACCCAT TTCATCTTACAGTTGCATCAGAATGGGTTGCTTAAGGGAGACGACATAACAGATCGCTTTTTCCGAGTGTTGCTGGTGGA ACTTGCTGTTGCACATTGCCTATCCACTGAGGTGAATAATTCTGGGGCATTGCAGTCTCCTCAGCAGCTGCCAGCAATGT CATTTCTCGCAATTGATATTTATGCAAAGCTTGTCTTCTATATCTTGAAGGGATCAAACAAACTATTCCTTCTTCCTAAG ATTCTGGCAGTTACTGTTAGATGCATTCTAAAAGATGCGGAGGAAAAGAAGGCCTCTTTCAATCCAAGACCATTTTTCAG ATTGTTCATCAACTGGCTTCTGGATCTTGGATCACTTGAACCTGTTACTGATGGTGCAAATCTTCAGATTTTGATTGCTT TTGCCAATGCATTTCATGCTTTGCAGCCCCTCAAAGTTCCTGCATTCAGTTTTGCCTGGCTTGAGTTGATTAGTCATAGG AGCTTCATGCCAAAAATGGTGACGGGTAATGGTCAAAAAGGTTGGCCTCATATCCAAAGGTTGCTTGTGGATTTGTTCCA ATTCATGGAGCCTTTTCTGAGGCATGCTGAACTTGGAGACCCGGTTCGTTTTCTCTATAAAGGCACTCTTAGGGTGCTCT TGGTGCTACTTCATGACTTCCCAGAGTTCCTATGTGACTATCACTTTACCTTTTGTGATGTTATCCCTCCAAGTTGCATT CAGATGCGAAATATCATTCTTAGCGCATTTCCACGTAGTATGAGGCTACCAGATCCTTCCACTCCCAATTTGAAGATTGA TTTGCTTCAAGAAATAACTCAATCGCCTCGCATACTATCAGAGGTTGATGCAGCACTTAAAGCAAAGCAGATGAAAACTG ATGTAGATGAATACCTTAAGACAAGGCAACAGAATTCTCCATTTTTGTCTGAACTGAAGGAGAAGCTGCTCCTCTCACCC AATGAAGCTGCCTCAGCTGGGACCCGTTACAATGTGCCACTAATTAACTCCCTTGTGTTGTATGTAGGAATGCAGGGTAT TCAGGGACGAACTCCGCATGCACAGTCAGCCGGAATGTTGGCTGTATTTTCTGTTGGTGCTGCATTGGATATTTTTCAGA CACTAATTGTGGACTTGGACACGGAAGGGCGTTACCTTTTCCTAAATGCTATTGCTAACCAACTGCGTTATCCCAATACT CACACACACTACTTTTCCTTCATCCTGCTCCATTTGTTTGCAGAGTCTAACCAGGAAATTATCCAAGAACAAATTACAAG AGTCGTGTTAGAACGCTTAATTGTTAATCGACCTCATCCTTGGGGTCTCCTGGTTACTTTTATTGAGCTGGTCAAGAATC GCATGTATAGCTTCTGGAACAGATCTTTCATAAGATGCGCGCCAGAGATCGAAAAACTATTTGAATCACTATTTGAATCA GTCTCAAGATCTTGTGGAGGTCCAAAACCAGTGGATGAGTCTGGATGGGTCTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0050800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MNDMQNEPILGAVIKHLLDKPNFSTVLSESVKNVEINESFLQSFCNGLQLSLLEKIAISLALSDSENPDARLCGKNFCMA QIEELGASPGSFSCHEQIHNIIMFLKQSEGLSKHADSFMQILSLVQFKDTPPYVLTPVLPDEMHEADFLRNMELFHESGE NDFDAILADIQKEMNMGDIVKELGYGCTVDVLQCKEILSLFLPITDKTLSKLLGAIVRTHAGLEDNQSTFLTFGTALGYN NLAELPPLSSWNIDVLIDTVKLLAPQTNWVRVIENLDHEGFFLPSEEAFSFLMAVYKHAYKQEPFPLHAICGFVWKNTEG QLSFLKYAASAPPELFTFAHSARQLAYVDAINGHKLQSGHANHAWLCLDLLDVLCQLAEKGHASIVRSILDYPLKHCPDV LLLGMAHINTTYNLFQREVSLAVFPMIVNSAVGSGMILHLWHVNPNLVLRGLMDSQNSDVDSITKIVDICQELKILSSVL EIIPSYYSIRLAAVASRKEFLDLGKWLSSILTTYKDVFFEECLKFLKEVHFSGSQNLSGNSFHQPGAVLNLYTETAATLL KVLKSHTDLVTSGLLKEELESLHISIIDSNPRLQNGGTTDSSASDGYAEDIEAEANSYFHQMFSEQLHINAMVQMLARFK ESSVKREKSIFECMIQNLFEEYRFFPKYPERQLKIAAVLFGSVIKHQLVTHLSLGIALRYVLDALRKPADSKMFLFGSLA LEQFVGRLVEWPQYCNHILQISHLRSTHSEIVALIEQALARISSGHIDGDGASHASIIGNHNSAQATFGHVELTGSSVIQ PGQPHLSMQLQQRHENSFDDRHKASIGSSSDVKPLLSTLGQSSVVTPADASSTNKLHSIVSTSSMLSSSPGFVRPSRGAT SAKFGSVLNIETLVAAAEKRETPIEGPGSEVQDKISFIINNISSTNVEAKAKEFDEILKEQYYPWFAQYMVMKRVSIEPN FHDVYLKFLDKVNSKALNKEIVQATYENCKVLLGSELIKSSSEERSLLKNLGSWLGKLTIGRNQVLRAREIDPKSLIIEA YEKGLMIAVIPFTSKILEPCQSSLAYQPPNPWTMGILGLLVEIYSMPNLKMNLKFDIEVLFKTLAVEMKDVTPTSLLKDR KREIEGNPDFSNKDVGVSQAQLVSDIKPGLVPPVNQVELPPLEVTNPSNPHMLSPYAGPLHITTGPLIDDEKVTPLGLSD QLPTAQGLLQATTNPSPFSQLSTQIPNIGTHVIINPKLSGFGLQMHFQRAVPISMDRAIKEIVTGIVQRSVSIATQTTKE LVLKDYAMESDETRILNAAHLMVASLSGSLAHVTCKEPLRTSISNQLRTALQNINIASEILEQAVQLVTNDNLDLGCAVI EQAATDKAISTIDTEIGQQLSVRRKHREGMGSTFFDANMYQQGSMGGVPEPLRPKPGQLSLSQQRVYEDFVRLPWQNQST QNSHSISGGVSIQSGGTGLTGTSGTVSGQMSPGYSVNTGYEGVPRPIDDISESNLAPHFSASSVHIRAADSVSQHSLEKD SVASFPSTASTPELHTVDSSDAVKDSGASSQPPVSSGAMERLGSSFLEPTLTTRDALDKYQLVAQKLEAVVNNDSREADI QGIISEVPEIILRCVSRDEAALAVAQKVFKGLYDNATNNIHVFAHLAILTAIRDVCKLAVKELTSWVIYSEEERKYNKDI TVGLIRSELLNLTEYNVHMAKLIDGGRNKAATEFSISLLQILVIEEPKVISELQSLVDALAKLATKPGFPESLQQLIEMI KNPAANTSALSASNAGKDDKARQSRDNKGPGPLAANREDMNNVDSIEPDPAGFRDQVSMLFQDWYRICELPGANDTASTH FILQLHQNGLLKGDDITDRFFRVLLVELAVAHCLSTEVNNSGALQSPQQLPAMSFLAIDIYAKLVFYILKGSNKLFLLPK ILAVTVRCILKDAEEKKASFNPRPFFRLFINWLLDLGSLEPVTDGANLQILIAFANAFHALQPLKVPAFSFAWLELISHR SFMPKMVTGNGQKGWPHIQRLLVDLFQFMEPFLRHAELGDPVRFLYKGTLRVLLVLLHDFPEFLCDYHFTFCDVIPPSCI QMRNIILSAFPRSMRLPDPSTPNLKIDLLQEITQSPRILSEVDAALKAKQMKTDVDEYLKTRQQNSPFLSELKEKLLLSP NEAASAGTRYNVPLINSLVLYVGMQGIQGRTPHAQSAGMLAVFSVGAALDIFQTLIVDLDTEGRYLFLNAIANQLRYPNT HTHYFSFILLHLFAESNQEIIQEQITRVVLERLIVNRPHPWGLLVTFIELVKNRMYSFWNRSFIRCAPEIEKLFESLFES VSRSCGGPKPVDESGWV
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 1889 | 1889 | - | – | |
| PANTHER | 8 | 2328 | 2321 | 0.0 | ||
| PANTHER | 8 | 2328 | 2321 | 0.0 | – | |
| Pfam | 418 | 564 | 147 | 1.8E-30 | ||
| Pfam | 591 | 761 | 171 | 1.2E-67 | ||
| Gene3D | 597 | 764 | 168 | 2.6E-66 | ||
| Gene3D | 877 | 1126 | 250 | 5.8E-107 | ||
| Pfam | 905 | 1124 | 220 | 2.8E-91 | ||
| Pfam | 1246 | 1387 | 142 | 9.8E-52 | ||
| MobiDBLite | 1439 | 1480 | 42 | - | – | |
| MobiDBLite | 1439 | 1476 | 38 | - | – | |
| MobiDBLite | 1519 | 1561 | 43 | - | – | |
| MobiDBLite | 1519 | 1558 | 40 | - | – | |
| MobiDBLite | 1768 | 1803 | 36 | - | – | |
| Gene3D | 1802 | 2092 | 291 | 9.0E-112 | – | |
| Phobius | 1890 | 1909 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1910 | 2337 | 428 | - | – | |
| Pfam | 1955 | 2317 | 363 | 2.0E-149 | ||
| Gene3D | 2093 | 2316 | 224 | 1.4E-97 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Regulation of translation | Any process that modulates the frequency, rate or extent of the chemical reactions and pathways resulting in the formation of proteins by the translation of mRNA or circRNA. | ||
| Cellular component | CCR4-NOT core complex | The core of the CCR4-NOT complex. In Saccharomyces the CCR4-NOT core complex comprises Ccr4p, Caf1p, Caf40p, Caf130p, Not1p, Not2p, Not3p, Not4p, and Not5p. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0050800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…