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LotjaGi3g1v0050800.4

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0050800
Transcript ID LotjaGi3g1v0050800.4
Related isoforms 5
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description CCR4-NOT transcription complex subunit 1; TAIR: AT1G02080.2 transcription regulator; Swiss-Prot: sp|A1A5H6|CNOT1_DANRE CCR4-NOT transcription complex subunit 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PP65|A0A0B2PP65_GLYSO CCR4-NOT transcription complex subunit 1; Found in the gene: LotjaGi3g1v0050800
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:5299182..5320865) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTTCGGACTATTGTGATTAAAATAGTCTGGGTGGGTGATTTTGTAGAGACAATTAGAGTTCTGTGGTGGTGGTTGATAAT GTGACTCATTTTGCCATGATATATTTGTACTATTTTCCGGTATTGTTCTGCATTTTGCTTTCCCCTTAAATTGCCGTAAT CTGTGGAATAATAGGCTGAAATTGGTGTCAGAAGCTTGCTGCGGTAGATTTGGTTTAGGGTGCTATTTAATTTTTAAACA ATTCATATTTGGAGTGTTCTCTGTATTTTTGGTCTGACTAGATTGGTTATTGACACTTGCAGTTCACTGAGTTTGGAACT GTTGGATGCATTTTGCTGCTTCGGACTTGCTTGGATCACTTTAATTATGTCAGAAGAGATATGAATGACATGCAAAATGA GCCAATTCTGGGGGCAGTCATTAAGCACCTCTTGGACAAACCAAACTTCAGCACAGTGTTGTCTGAGTCAGTGAAGAATG TAGAAATTAATGAAAGCTTTCTCCAAAGTTTTTGTAACGGATTGCAGTTGTCCTTATTGGAAAAAATTGCCATCAGCCTC GCTTTGTCGGATTCCGAAAATCCCGATGCCAGGTTATGTGGTAAGTATGAAGTCAATTTATAGTGTCAGTTAGTGCTTAC TGTTATTCCCACATACATTTAACGGTACAGACAATATTGGTATCTTTCTGCAATATAATTTTCCTGGCCATTTCCATTTT TAGTGTGTTGCTATGTGTCTCATTTTTTTTCCTTGTTATTGTTATATACTTATATATTTAACCTAAACTATTGCGGCTTT GTAGGAAAGAATTTTTGCATGGCTCAGATTGAGGAATTGGGTGCCAGCCCTGGTTCTTTTAGTTGCCATGAACAAATTCA CAATATTATCATGTTCCTCAAGCAGTCTGAGGGTCTTTCCAAGCATGCGGACTCCTTCATGCAGATATTGTCACTGGTGC 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TCTTTAGCAATATATGCCATGCACTAGGAGCTTTTCAATGAAAATTGCATATTCTGACAAAAGTTATTGAATTTCCTTTT AGAATATTGATGGTTTGGGGATCTCCTGATGTTTACATTTACGGATAAGGAACGGATAATTAAAATTTTGAAGTTGAAAA ACAGTAAATAGTATTTACAAAAGATTTGTCCTATTCGCTATAATACCATTAAGAATCTATCTTTGAGACACTGGTTTCTT ATATATATTATATATACAGCCAATCAAGGAGCTAAACATTAGCTAATTTACAGCAAGCAGATAAAGACAGTTGACTAACA TCAAGTATTCAAACAGTGCCAGTTATTTATAATTATTTTACACTTATAGTCTTATTGTATAATTCTGGCAGGTAATTTAT TCAGAAGAAGAAAGGAAATATAACAAAGATATTACTGTTGGCCTCATCCGCAGTGAATTGCTAAATCTGACTGAGTACAA TGTTCATATGGCAAAACTTATTGATGGGGGAAGGAACAGTATGTCAAAAGAAAATTCTTTTACTGTTTTGCCCTTGTTAT GCTATTATAATCAAATGACTTGACTGGATAAATGTGCAGAGGCTGCTACTGAGTTTTCTATCTCTCTTCTGCAAATCCTG GTTATTGAGGAACCTAAAGTTATTTCAGAACTTCAGAGTCTCGTTGATGCTTTGGCAAAGGTTTGTATTTCTGAGGAGTG TTGGCTTCCTTCTTGACTCCTAGATTCTATACCATATATTTAATATATATTCTTTTTCTTTTCCAGCTTGCCACCAAGCC TGGATTCCCTGAATCATTACAACAGCTTATTGAGATGATAAAGAACCCTGCGGCTAATACTTCTGCTCTATCTGCTAGTA ATGCTGGAAAAGATGATAAGGCAAGGCAATCAAGAGACAATAAGGTCATAGGAGATATGTGGTTCAGCTGCACTGTTGTT TCGTGCACTTCTTTTTACCTTTTTTTCCCTTGATACCCAGCTTATTATGTCTCCATTTAAAAAACAGGGTCCTGGTCCAC TTGCTGCAAACCGGGAAGACATGAACAATGTAGATTCTATTGAACCGGATCCTGCTGGATTCCGTGACCAGGTATTTTGT CCTTAAAATTGCTAGATAAGTTTGGATTTTTTTACGTGGATATTTGGTAAGAGTGTGCGTAGGATACCAATCAGAATTGG TTTTTATTTTGACTGCATTGTACTCTTGATGCATGGTTTGACCTAATGATGCATGGTTTTGACTGCATTGTACTTTTGAT GCATGGTTTGATAAGAGTGTGCATGGTTTGACTAAGCATACTTTTTATCCTATAGGTTTTATTTTCTGCAGCAGTAGTTG AGTATTGACTGAGTAGAATAATTCATGTATATGAATATGCTATGGTTTGAACTAATTGCACCTTAAAATTGCTCTCCAAA GTTTGATTATCCCTTGTTGTCAAGGTCCTTGTAAAGTTTAACCTTTGGCAATAAGAGATAAAGAGAATGAATAAGATGCA TATTTTGTCATGTTCTATTCAGACTAATGGAATTGTTTTATGACTGATCTGCATACCTTTGGAATTTTTTTATGGTCTCA TCCGCACTAATTTGACCTTCTAATGGTTACTACAATGCATGTGTTGTAGGTTTCCATGTTGTTCCAAGATTGGTATAGGA TATGTGAACTTCCAGGTGCCAATGATACAGCTTCTACCCATTTCATCTTACAGTTGCATCAGAATGGGTTGCTTAAGGGA GACGACATAACAGATCGCTTTTTCCGAGTGTTGCTGGTGGTGTTTCTTTCGTCAAGCAAGTTACTGCTTCCTACTGATTC CAGTATTGTCAATCTAACCTCCTTTTGTTGTCTTTTTACTAGGAACTTGCTGTTGCACATTGCCTATCCACTGAGGTGAA TAATTCTGGGGCATTGCAGTCTCCTCAGCAGCTGCCAGCAATGTCATTTCTCGCAATTGATATTTATGCAAAGCTTGTCT TCTATATCTTGAAGGTTTTCAACTGTGCTCTTATTCCTATAATCCTATCTCTTTTCTTTTGGGTAGCTTTACCTTCTTAC CGATTTTGTTCTTTGTTGGAACAGGGATCAAACAAACTATTCCTTCTTCCTAAGGTATGTAATGAACTCAAATCTAAATG CAGTTGCTCTTCCTCTTGGGCTTTATTAATTCTCTAATTTCTATAATGATGGTCTAAAAAGCTCCACGCTGCTTTCTGGC AGATTCTGGCAGTTACTGTTAGATGCATTCTAAAAGATGCGGAGGAAAAGAAGGCCTCTTTCAATCCAAGACCATTTTTC AGATTGTTCATCAACTGGCTTCTGGATCTTGGATCACTTGAACCTGTTACTGATGGTGCAAATCTTCAGGTATTTGGCAC TTCCATTTACTGCTTCATTAGTTTCCTTTTTTTTTTTTCCTTTTTCATTAAAGAGTGGCCCTTTCCCCATTTCTATAAGC ATTGTTCATCAACCTTGTATTATGAGATATAATCTGTTGCTAGGATCTTTATTTATAGCCTAGGGGACAGCTTCTAGCTG AACTGCTGATGCTTTACAAGCTGTATCTAACTAACTTACACAACTGATAAGTACTGTTACTGAAAGCCTAAGAACCATGT AAATAAGCCTAACAAAAGCACATAATAGAAAGTAACCATACTGCAGAATCTTAATAACCTGCGGTTTTTGCATCTCTCAA CTGCACCTTATCAGATGACTTTACCCAATAATATTGTCAATACTTGTTTTTTAAACTTCAAGCTTAGTCGCCAAAAAAGT GATTATTTCCCTAAAATAAGTTATCCAAATGCACACTATGACTAATACTACTTTCGTAATTGCAGATTTTGATTGCTTTT GCCAATGCATTTCATGCTTTGCAGCCCCTCAAAGTTCCTGCATTCAGGTTAGACTACGAATTATGTTGTTATAATTGATG ATTGGTTGAATTGTGGTATAACAAGTATTATAGCCATGGAATGGCATTCATTTGTTGGGAACGGATTCAATCCAGTAGAA CTCTTTCAGTTATTTGTGTGAAGTGTTATAAATACTTTTTGGATATATTTTCGTCTTTTACACTTATTTTGTTTAATCAT TTACCCTGTGTATTTTACTATTTAATTGGTTAATATGTGGAATATATCTTCAGTTTTGCCTGGCTTGAGTTGATTAGTCA TAGGAGCTTCATGCCAAAAATGGTGACGGGTAATGGTCAAAAAGGTTGGCCTCATATCCAAAGGTTGCTTGTGGATTTGT TCCAATTCATGGAGCCTTTTCTGAGGCATGCTGAACTTGGAGACCCGGTTCGTCTGTCTTTTCCTCAATTGTTTGCTCCC AATTTGGTCTGCTTATTTGCTCCAAGTGCTCACTTCTGCTTAATTTTGTCTTGGTGTTATAATTAGGTTCGTTTTCTCTA TAAAGGCACTCTTAGGGTGCTCTTGGTGCTACTTCATGACTTCCCAGAGTTCCTATGTGACTATCACTTTACCTTTTGTG ATGTTATCCCTCCAAGTTGCATTCAGATGCGAAATATCATTCTTAGCGCATTTCCACGTAGTATGAGGCTACCAGATCCT TCCACTCCCAATTTGAAGGTCTCCAAATCTACTATATTCTTTTTAACTTTTTGCTATGGCTAAGCACATTAAGATGACGA GTTTATTTCACTGTGTTGTGCTTTTGTATGCAGATTGATTTGCTTCAAGAAATAACTCAATCGCCTCGCATACTATCAGA GGTTGATGCAGCACTTAAAGCAAAGCAGATGAAAACTGATGTAGATGAATACCTTAAGGTCTGTCCCCTCCTCCCGTTCT CTTTTAATTGGTTATGTTATTGATTAAGGGTTTATGTTATTGATTAAGGCCCTTCTTTGCAAATTGTCTTCCTTTTTTTT ACCTTAAATATATTCTTCTCTTAAATTCTGCTGCACATCGTATTGGTTAGAGTTTCAACTTCATTCTACATTCATGTCTT TCACTTTCTTACGTTTTATTTAAATTGTGCAGACAAGGCAACAGAATTCTCCATTTTTGTCTGAACTGAAGGAGAAGCTG CTCCTCTCACCCAATGAAGCTGCCTCAGCTGGGACCCGTTACAATGTGCCACTAATTAACTCCCTTGTGTTGTATGTAGG AATGCAGGTACTGTAAATTTGAATCTTTGATGTTCATATTTTCCTCTGCAGTAATTAGTTCAAAATAACATGGAATAAAC CGAGGTTGAACTTCTAGAATGGATTTTGAAAATCACCTATGAGGAGATGAGAATGTTACTATGGATGGATGGTTACACAA TGCAAGGTAGGGTTAGGAATGAAATCATTATAGAGAGCTGGGTTTGCTCACTCGGTAGTAAAGATGATAGTTTCGTATTG GTGGTTTGGAGAAGAACCACAAAAGCACTGGAAAGAAGGTTGACCATGTGGAGAATAGTCCAGCAGTTAGGTCGCTGAAG ACGAAGGAAAACTATAGGCTAAACCATAACATACTTTATCTTAAAAGATATTCTGACTGAAAGATATATGTTTTGGTCAA AGTTTGTTAATTGTGAAACACGAAGAGCATAATACTATCATCTTGAATGTGCATTTATGTTTTCTTTCAATTTTTGTTTT TGTATAATAGGGTATTCAGGGACGAACTCCGCATGCACAGTCAGCCGGAATGTTGGCTGTATTTTCTGTTGGTGCTGCAT TGGATATTTTTCAGACACTAATTGTGGACTTGGACACGGAAGGGCGTTACCTTTTCCTAAATGCTATTGCTAACCAACTG CGTTATCCCAATACTCACACACACTACTTTTCCTTCATCCTGCTCCATTTGTTTGCAGAGTCTAACCAGGTATATATGTA TATAGTCTTGCTGTTTTTAATGTTAAACTCAATCCCAATCTGTTTTTACTTATGATAAACTTGTATTAATTTTGTCGTGT TTAGTCTGGCTTCAACTAATTGAAGAATATGCATAACTGTATTTATGTTGTGAATTTGCAGGAAATTATCCAAGAACAAA TTACAAGAGTCGTGTTAGAACGCTTAATTGTTAATCGACCTCATCCTTGGGGTCTCCTGGTTACTTTTATTGAGCTGGTC AAGGTATTCTTCAATTGCTTGTATACCTATCTCTTATCTCTTATGAGCATTTTAGTAGTTGCTTGCAATTAACACTTTTT TTCCTTTCTTTCTTTGTCATTGCCAGAATCGCATGTATAGCTTCTGGAACAGATCTTTCATAAGATGCGCGCCAGAGATC GAAAAACTATTTGAATCACTATTTGAATCAGTCTCAAGATCTTGTGGAGGTCCAAAACCAGTGGATGAGTCTGGATGGGT CTGA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0050800.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAATGACATGCAAAATGAGCCAATTCTGGGGGCAGTCATTAAGCACCTCTTGGACAAACCAAACTTCAGCACAGTGTT GTCTGAGTCAGTGAAGAATGTAGAAATTAATGAAAGCTTTCTCCAAAGTTTTTGTAACGGATTGCAGTTGTCCTTATTGG AAAAAATTGCCATCAGCCTCGCTTTGTCGGATTCCGAAAATCCCGATGCCAGGTTATGTGGAAAGAATTTTTGCATGGCT CAGATTGAGGAATTGGGTGCCAGCCCTGGTTCTTTTAGTTGCCATGAACAAATTCACAATATTATCATGTTCCTCAAGCA GTCTGAGGGTCTTTCCAAGCATGCGGACTCCTTCATGCAGATATTGTCACTGGTGCAGTTCAAGGACACACCACCTTATG TTTTGACTCCAGTGCTACCAGATGAGATGCATGAGGCTGATTTTTTAAGGAATATGGAGTTGTTCCATGAGTCTGGAGAA AATGATTTCGATGCTATTTTGGCTGACATACAGAAGGAAATGAACATGGGAGATATTGTGAAGGAACTAGGCTATGGCTG CACGGTTGATGTCTTACAATGTAAGGAGATATTGTCGCTCTTCTTACCTATAACTGATAAAACGCTCTCGAAATTACTTG GTGCTATTGTTCGTACCCATGCTGGGCTGGAGGACAACCAGAGCACATTCTTAACTTTTGGCACGGCCCTTGGATACAAC AACTTGGCTGAGTTGCCGCCACTGAGCTCTTGGAATATTGATGTCTTGATAGATACAGTCAAACTCCTTGCACCTCAGAC AAATTGGGTACGGGTCATTGAAAATCTAGATCATGAAGGATTTTTCCTTCCTAGCGAAGAAGCTTTTTCTTTTCTCATGG CTGTATATAAACATGCCTATAAGCAGGAGCCATTTCCTCTCCATGCAATCTGTGGGTTTGTCTGGAAGAATACAGAGGGT CAGCTGTCTTTCCTCAAATATGCCGCATCAGCACCGCCAGAATTGTTTACCTTTGCACACTCTGCAAGACAGCTGGCATA TGTTGATGCGATTAATGGACACAAGCTTCAAAGTGGACATGCAAATCATGCCTGGCTGTGTCTTGACCTTTTGGATGTTC TCTGCCAGCTAGCTGAGAAGGGTCATGCCAGCATTGTTCGATCTATCCTTGATTATCCCCTTAAACACTGTCCAGACGTC TTGCTTCTTGGGATGGCACACATTAATACTACTTACAATCTCTTCCAGCGTGAAGTATCTCTGGCTGTTTTTCCCATGAT AGTAAATAGTGCTGTAGGCAGTGGAATGATTCTACACCTTTGGCATGTTAATCCCAATCTGGTCTTGCGAGGGCTTATGG ATTCTCAAAACAGTGATGTAGACAGCATTACTAAAATTGTGGACATTTGCCAAGAGCTAAAGATTCTATCGTCAGTGCTG GAAATTATTCCCTCTTATTATAGTATAAGATTAGCAGCTGTAGCTTCAAGAAAAGAATTTCTTGATCTTGGGAAGTGGTT GAGTAGCATCTTGACTACGTACAAGGATGTCTTCTTTGAGGAGTGCCTCAAGTTCTTAAAGGAAGTCCATTTTTCAGGAT CACAGAACCTCTCTGGCAATTCTTTTCATCAGCCTGGTGCTGTTCTGAATCTCTATACTGAGACAGCTGCTACCCTCTTG AAGGTTCTTAAATCTCATACTGACTTGGTTACATCTGGACTACTTAAAGAGGAGCTTGAGAGTTTGCACATATCTATTAT AGATTCAAATCCAAGGCTCCAAAATGGTGGGACTACTGATTCCTCTGCTTCTGATGGATACGCGGAGGACATTGAAGCAG AAGCAAACTCCTACTTCCATCAAATGTTTTCTGAACAGTTACACATTAATGCAATGGTGCAAATGCTTGCCCGATTCAAG GAATCTTCTGTGAAGAGGGAAAAATCAATATTTGAGTGCATGATTCAAAACTTGTTCGAGGAGTATCGGTTTTTCCCCAA GTATCCTGAAAGGCAACTCAAAATTGCTGCAGTCCTATTTGGTTCTGTGATCAAGCATCAGCTTGTAACTCATCTCTCTC TGGGGATTGCGCTTCGTTATGTTCTTGATGCATTGCGCAAGCCTGCAGATTCAAAAATGTTCTTGTTTGGAAGTCTGGCA CTGGAGCAGTTTGTGGGTCGTCTTGTTGAGTGGCCTCAGTATTGCAATCACATTCTGCAAATTTCCCATTTGCGCAGTAC GCATTCGGAAATAGTTGCTTTAATTGAACAGGCTCTTGCCAGGATTTCCTCTGGCCATATAGATGGAGATGGGGCGAGCC ATGCTTCCATAATTGGTAACCATAATTCTGCACAGGCTACATTTGGTCATTCCATCCTAGCCTGGCTCACTGGCTCTAGC GTGATACAACCTGGACAGCCACATTTGTCTATGCAACTTCAACAGAGACATGAAAATTCCTTTGATGATCGTCACAAAGC CTCCATTGGTTCATCTTCTGATGTAAAACCACTCTTATCTACTCTAGGTCAATCTTCAGTAGTTACACCCGCTGATGCTT CTAGTACTAATAAGTTACATAGCATAGTCAGCACCTCGTCAATGCTATCTTCTTCTCCTGGATTTGTTCGTCCTTCCCGG GGAGCTACTTCTGCCAAGTTTGGATCTGTCTTGAACATTGAAACTTTGGTCGCCGCTGCTGAGAAAAGAGAAACTCCTAT TGAGGGTCCAGGATCGGAAGTTCAGGACAAGATATCATTTATAATTAATAATATATCATCTACCAATGTTGAAGCTAAAG CCAAAGAGTTCGATGAAATTTTGAAAGAGCAGTACTATCCATGGTTTGCACAGTATATGGTTATGAAAAGAGTGAGCATT GAGCCAAATTTTCATGATGTGTACCTGAAATTCCTTGATAAAGTTAATTCAAAGGCTTTGAACAAAGAGATTGTGCAGGC AACTTATGAAAATTGCAAGGTTCTTTTAGGATCAGAACTCATAAAGTCAAGTTCAGAAGAGCGCTCTCTGCTGAAAAATC TGGGGAGCTGGCTTGGAAAGTTGACAATTGGTCGAAATCAGGTTTTGAGGGCTCGTGAAATTGACCCAAAATCTTTGATT ATAGAGGCATATGAGAAGGGGCTGATGATTGCTGTTATTCCATTTACTTCAAAGATCCTCGAACCATGCCAGAGCAGTCT TGCATATCAGCCCCCTAATCCTTGGACCATGGGCATTTTGGGATTGCTTGTTGAGATTTATTCAATGCCAAACCTAAAAA TGAACCTCAAGTTTGACATAGAGGTATTGTTCAAAACTCTTGCCGTAGAGATGAAGGATGTCACACCAACTTCTCTCCTG AAGGATCGCAAAAGAGAAATTGAAGGGAATCCTGATTTTTCTAATAAAGATGTTGGGGTGTCTCAAGCACAACTGGTTTC TGATATAAAACCTGGCCTTGTACCGCCTGTAAATCAAGTGGAGTTACCACCGCTTGAAGTCACAAATCCATCCAATCCAC ATATGTTGTCTCCGTATGCTGGTCCTCTACATATAACCACGGGACCATTGATTGATGATGAGAAAGTAACACCTCTGGGC CTCTCTGATCAACTTCCAACCGCTCAAGGACTGTTACAAGCCACTACTAACCCATCACCTTTTAGCCAGCTCTCAACACA GATCCCTAACATAGGGACTCATGTTATTATCAATCCAAAGCTCAGTGGTTTTGGATTGCAAATGCATTTTCAGAGAGCGG TACCTATTTCAATGGATAGAGCTATCAAAGAGATAGTCACTGGTATTGTGCAGCGCAGTGTTTCCATAGCAACACAAACA ACTAAGGAGCTTGTTTTGAAGGATTATGCTATGGAATCAGATGAAACACGTATATTAAATGCTGCACATTTGATGGTTGC TAGTCTGTCCGGAAGTTTGGCTCATGTCACATGCAAAGAACCTTTACGAACATCAATATCAAACCAACTGAGGACGGCAC TTCAGAATATAAATATTGCAAGTGAAATCTTGGAACAAGCTGTCCAACTTGTCACCAATGATAATCTTGATCTTGGTTGT GCTGTCATTGAACAGGCTGCTACCGATAAGGCAATAAGCACCATAGATACAGAGATTGGTCAACAACTTTCTGTGAGAAG GAAGCATCGAGAAGGTATGGGCTCTACATTTTTTGACGCGAACATGTATCAACAAGGTTCAATGGGTGGTGTTCCAGAGC CCCTTCGACCCAAACCTGGTCAGCTGTCCCTCTCACAACAGCGCGTTTATGAGGACTTTGTTCGGCTTCCGTGGCAAAAC CAGTCTACCCAGAACTCACATTCTATATCTGGTGGTGTTTCTATTCAATCTGGAGGTACTGGTCTCACTGGTACCAGTGG TACTGTATCCGGACAAATGAGCCCTGGCTACTCTGTGAACACAGGATATGAAGGGGTCCCTCGACCAATAGATGATATTT CAGAATCTAATTTGGCTCCGCATTTTAGTGCTTCCTCTGTTCACATCAGAGCCGCTGACAGTGTTTCCCAGCATAGTCTG GAGAAAGACTCTGTTGCCTCATTTCCTTCAACTGCTTCCACCCCTGAATTACATACAGTGGATTCTTCTGATGCTGTTAA AGATTCTGGAGCTTCTTCACAGCCACCGGTTTCATCAGGTGCCATGGAGCGCCTCGGAAGTAGCTTCTTGGAGCCTACTC TCACTACACGCGATGCTTTGGATAAGTACCAACTTGTAGCACAAAAGTTGGAAGCTGTCGTCAACAATGATTCCCGGGAA GCAGATATACAGGGCATCATTTCTGAGGTTCCTGAGATCATACTCAGATGTGTTAGTCGAGATGAGGCTGCTTTAGCTGT TGCTCAAAAGGTTTTCAAGGGTTTATATGACAATGCAACTAACAACATTCATGTCTTTGCTCATCTTGCTATCCTAACTG CCATTCGTGATGTTTGCAAGCTTGCTGTCAAGGAACTTACTAGTTGGGTAATTTATTCAGAAGAAGAAAGGAAATATAAC AAAGATATTACTGTTGGCCTCATCCGCAGTGAATTGCTAAATCTGACTGAGTACAATGTTCATATGGCAAAACTTATTGA TGGGGGAAGGAACAAGGCTGCTACTGAGTTTTCTATCTCTCTTCTGCAAATCCTGGTTATTGAGGAACCTAAAGTTATTT CAGAACTTCAGAGTCTCGTTGATGCTTTGGCAAAGCTTGCCACCAAGCCTGGATTCCCTGAATCATTACAACAGCTTATT GAGATGATAAAGAACCCTGCGGCTAATACTTCTGCTCTATCTGCTAGTAATGCTGGAAAAGATGATAAGGCAAGGCAATC AAGAGACAATAAGGGTCCTGGTCCACTTGCTGCAAACCGGGAAGACATGAACAATGTAGATTCTATTGAACCGGATCCTG CTGGATTCCGTGACCAGGTTTCCATGTTGTTCCAAGATTGGTATAGGATATGTGAACTTCCAGGTGCCAATGATACAGCT TCTACCCATTTCATCTTACAGTTGCATCAGAATGGGTTGCTTAAGGGAGACGACATAACAGATCGCTTTTTCCGAGTGTT GCTGGTGGAACTTGCTGTTGCACATTGCCTATCCACTGAGGTGAATAATTCTGGGGCATTGCAGTCTCCTCAGCAGCTGC CAGCAATGTCATTTCTCGCAATTGATATTTATGCAAAGCTTGTCTTCTATATCTTGAAGGGATCAAACAAACTATTCCTT CTTCCTAAGATTCTGGCAGTTACTGTTAGATGCATTCTAAAAGATGCGGAGGAAAAGAAGGCCTCTTTCAATCCAAGACC ATTTTTCAGATTGTTCATCAACTGGCTTCTGGATCTTGGATCACTTGAACCTGTTACTGATGGTGCAAATCTTCAGATTT TGATTGCTTTTGCCAATGCATTTCATGCTTTGCAGCCCCTCAAAGTTCCTGCATTCAGTTTTGCCTGGCTTGAGTTGATT AGTCATAGGAGCTTCATGCCAAAAATGGTGACGGGTAATGGTCAAAAAGGTTGGCCTCATATCCAAAGGTTGCTTGTGGA TTTGTTCCAATTCATGGAGCCTTTTCTGAGGCATGCTGAACTTGGAGACCCGGTTCGTTTTCTCTATAAAGGCACTCTTA GGGTGCTCTTGGTGCTACTTCATGACTTCCCAGAGTTCCTATGTGACTATCACTTTACCTTTTGTGATGTTATCCCTCCA AGTTGCATTCAGATGCGAAATATCATTCTTAGCGCATTTCCACGTAGTATGAGGCTACCAGATCCTTCCACTCCCAATTT GAAGATTGATTTGCTTCAAGAAATAACTCAATCGCCTCGCATACTATCAGAGGTTGATGCAGCACTTAAAGCAAAGCAGA TGAAAACTGATGTAGATGAATACCTTAAGACAAGGCAACAGAATTCTCCATTTTTGTCTGAACTGAAGGAGAAGCTGCTC CTCTCACCCAATGAAGCTGCCTCAGCTGGGACCCGTTACAATGTGCCACTAATTAACTCCCTTGTGTTGTATGTAGGAAT GCAGGGTATTCAGGGACGAACTCCGCATGCACAGTCAGCCGGAATGTTGGCTGTATTTTCTGTTGGTGCTGCATTGGATA TTTTTCAGACACTAATTGTGGACTTGGACACGGAAGGGCGTTACCTTTTCCTAAATGCTATTGCTAACCAACTGCGTTAT CCCAATACTCACACACACTACTTTTCCTTCATCCTGCTCCATTTGTTTGCAGAGTCTAACCAGGAAATTATCCAAGAACA AATTACAAGAGTCGTGTTAGAACGCTTAATTGTTAATCGACCTCATCCTTGGGGTCTCCTGGTTACTTTTATTGAGCTGG TCAAGAATCGCATGTATAGCTTCTGGAACAGATCTTTCATAAGATGCGCGCCAGAGATCGAAAAACTATTTGAATCACTA TTTGAATCAGTCTCAAGATCTTGTGGAGGTCCAAAACCAGTGGATGAGTCTGGATGGGTCTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0050800.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MNDMQNEPILGAVIKHLLDKPNFSTVLSESVKNVEINESFLQSFCNGLQLSLLEKIAISLALSDSENPDARLCGKNFCMA QIEELGASPGSFSCHEQIHNIIMFLKQSEGLSKHADSFMQILSLVQFKDTPPYVLTPVLPDEMHEADFLRNMELFHESGE NDFDAILADIQKEMNMGDIVKELGYGCTVDVLQCKEILSLFLPITDKTLSKLLGAIVRTHAGLEDNQSTFLTFGTALGYN NLAELPPLSSWNIDVLIDTVKLLAPQTNWVRVIENLDHEGFFLPSEEAFSFLMAVYKHAYKQEPFPLHAICGFVWKNTEG QLSFLKYAASAPPELFTFAHSARQLAYVDAINGHKLQSGHANHAWLCLDLLDVLCQLAEKGHASIVRSILDYPLKHCPDV LLLGMAHINTTYNLFQREVSLAVFPMIVNSAVGSGMILHLWHVNPNLVLRGLMDSQNSDVDSITKIVDICQELKILSSVL EIIPSYYSIRLAAVASRKEFLDLGKWLSSILTTYKDVFFEECLKFLKEVHFSGSQNLSGNSFHQPGAVLNLYTETAATLL KVLKSHTDLVTSGLLKEELESLHISIIDSNPRLQNGGTTDSSASDGYAEDIEAEANSYFHQMFSEQLHINAMVQMLARFK ESSVKREKSIFECMIQNLFEEYRFFPKYPERQLKIAAVLFGSVIKHQLVTHLSLGIALRYVLDALRKPADSKMFLFGSLA LEQFVGRLVEWPQYCNHILQISHLRSTHSEIVALIEQALARISSGHIDGDGASHASIIGNHNSAQATFGHSILAWLTGSS VIQPGQPHLSMQLQQRHENSFDDRHKASIGSSSDVKPLLSTLGQSSVVTPADASSTNKLHSIVSTSSMLSSSPGFVRPSR GATSAKFGSVLNIETLVAAAEKRETPIEGPGSEVQDKISFIINNISSTNVEAKAKEFDEILKEQYYPWFAQYMVMKRVSI EPNFHDVYLKFLDKVNSKALNKEIVQATYENCKVLLGSELIKSSSEERSLLKNLGSWLGKLTIGRNQVLRAREIDPKSLI IEAYEKGLMIAVIPFTSKILEPCQSSLAYQPPNPWTMGILGLLVEIYSMPNLKMNLKFDIEVLFKTLAVEMKDVTPTSLL KDRKREIEGNPDFSNKDVGVSQAQLVSDIKPGLVPPVNQVELPPLEVTNPSNPHMLSPYAGPLHITTGPLIDDEKVTPLG LSDQLPTAQGLLQATTNPSPFSQLSTQIPNIGTHVIINPKLSGFGLQMHFQRAVPISMDRAIKEIVTGIVQRSVSIATQT TKELVLKDYAMESDETRILNAAHLMVASLSGSLAHVTCKEPLRTSISNQLRTALQNINIASEILEQAVQLVTNDNLDLGC AVIEQAATDKAISTIDTEIGQQLSVRRKHREGMGSTFFDANMYQQGSMGGVPEPLRPKPGQLSLSQQRVYEDFVRLPWQN QSTQNSHSISGGVSIQSGGTGLTGTSGTVSGQMSPGYSVNTGYEGVPRPIDDISESNLAPHFSASSVHIRAADSVSQHSL EKDSVASFPSTASTPELHTVDSSDAVKDSGASSQPPVSSGAMERLGSSFLEPTLTTRDALDKYQLVAQKLEAVVNNDSRE ADIQGIISEVPEIILRCVSRDEAALAVAQKVFKGLYDNATNNIHVFAHLAILTAIRDVCKLAVKELTSWVIYSEEERKYN KDITVGLIRSELLNLTEYNVHMAKLIDGGRNKAATEFSISLLQILVIEEPKVISELQSLVDALAKLATKPGFPESLQQLI EMIKNPAANTSALSASNAGKDDKARQSRDNKGPGPLAANREDMNNVDSIEPDPAGFRDQVSMLFQDWYRICELPGANDTA STHFILQLHQNGLLKGDDITDRFFRVLLVELAVAHCLSTEVNNSGALQSPQQLPAMSFLAIDIYAKLVFYILKGSNKLFL LPKILAVTVRCILKDAEEKKASFNPRPFFRLFINWLLDLGSLEPVTDGANLQILIAFANAFHALQPLKVPAFSFAWLELI SHRSFMPKMVTGNGQKGWPHIQRLLVDLFQFMEPFLRHAELGDPVRFLYKGTLRVLLVLLHDFPEFLCDYHFTFCDVIPP SCIQMRNIILSAFPRSMRLPDPSTPNLKIDLLQEITQSPRILSEVDAALKAKQMKTDVDEYLKTRQQNSPFLSELKEKLL LSPNEAASAGTRYNVPLINSLVLYVGMQGIQGRTPHAQSAGMLAVFSVGAALDIFQTLIVDLDTEGRYLFLNAIANQLRY PNTHTHYFSFILLHLFAESNQEIIQEQITRVVLERLIVNRPHPWGLLVTFIELVKNRMYSFWNRSFIRCAPEIEKLFESL FESVSRSCGGPKPVDESGWV 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 1892 1892 -
PANTHER 8 2331 2324 0.0
PANTHER 8 2331 2324 0.0
Pfam 418 564 147 1.8E-30
Pfam 591 761 171 1.2E-67
Gene3D 597 764 168 2.6E-66
Gene3D 880 1129 250 5.8E-107
Pfam 908 1127 220 2.8E-91
Pfam 1249 1390 142 9.8E-52
MobiDBLite 1442 1483 42 -
MobiDBLite 1442 1479 38 -
MobiDBLite 1522 1564 43 -
MobiDBLite 1522 1561 40 -
MobiDBLite 1771 1806 36 -
Gene3D 1805 2095 291 9.0E-112
Phobius 1893 1912 20 -
Phobius 1913 2340 428 -
Pfam 1958 2320 363 2.0E-149
Gene3D 2096 2319 224 1.4E-97

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Biological process Regulation of translation Any process that modulates the frequency, rate or extent of the chemical reactions and pathways resulting in the formation of proteins by the translation of mRNA or circRNA.
Cellular component CCR4-NOT core complex The core of the CCR4-NOT complex. In Saccharomyces the CCR4-NOT core complex comprises Ccr4p, Caf1p, Caf40p, Caf130p, Not1p, Not2p, Not3p, Not4p, and Not5p.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0050800.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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