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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0124300 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0124300.3 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Clustered mitochondria protein homolog; TAIR: AT3G52140.1 tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein; Swiss-Prot: sp|F4J5S1|CLU_ARATH Clustered mitochondria protein; TrEMBL-Plants: tr|I1MJM1|I1MJM1_SOYBN Clustered mitochondria protein homolog; Found in the gene: LotjaGi3g1v0124300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:15201214..15217061) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTGTTATTTAATTTCCTTCGCATGGTTTAAAATTTAACATTACTGGGATTATCCGTTATGCAGTCTTTTTGACAAATTTT CTTCCAATGATTTTATGAGCCAAGTCAAGCTTTGCCATACCTATTTGATCCTTTGATTTTCCAATCATTAAGTGATTGTC AAATTTTTCTCACGTTTATAATTTGTACTGCTGAATGATATTTTATAATTTATGTAGTCCAATTAAGGTTAACTTGTCTT CATTTTATTTCTTTATTGTTGGTAATGGATATAGGAACTTCATAGCTAATATCCTTCCCAACTGGTGCAGGTGATCTTCA ACTTTACCCTGTTTCTGTTAAAACTCAAACTGGGGAGAAGCTTGAGCTACAGGTGAGTTAACTTCATGAAGCTTTTGATT GTTATTTGGCATTGTGTGAACTGAGGAATCAAGAGGTTTTTAGATGATATTGGCAGAGATTTTGCATTTAAAACTATTTA TCGTATCAAGTTAACATCTTTGGCATATTGTGTGGTATATCTCATGGAAAGCGTTTTCTAAGCTGTTTAGTTGATTCACA GTTGAATCCAGGAGACTCTGTCATGGATATAAGACAGTTTCTTCTTGATGCTCCAGAGACATGCTTTATTACATGCTATG ATTTACTACTGCATACAAAGGATGCATCCACTCATCACCTGGAAGATTATAATGAAATTTCCGAGGTAGCTGATATTACA ACTGGTGGTTGCTCCTTGGAAATGGTTCCTGGTATGAACTTTAGCTCTTGCAGTAGTAAGATGTGTAGCCATTGGTGGAT TATAATATGATGAATTGTCTTTGCAGCATTTTATGATGATAGATCTATAAGGGCTCATGTCCACCGCACAAGAGAGTTGC TTTCTCTTTCTAACCTCCATTCTTCACTATCAACATCACTTGCCCTCCAGAATGAGATCGCACAAAATAAAGCTGCAAAT 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TGCATTTTATATAATGGCAGGCACATCCTGATTTGATACATGCATTCCAAGCTGCTTCAGCAAACGGTGGACCAAGTTCA GGTGCTTCTGCTAACAAATCTCTCAATGCTGCAATAATGGGTGAGGCTCTCCACAGAGGAAGGGGAATTGATGAAAGGGC GGCACGTGCTGCTGCTGAAGTCAGGAAGAAGGCTGCAGCTAGGGGTCTGTTGGTACGTCCACACGGTGTGCCGGTACAGG CCATGCCGCCCCTGACCCAACTTCTGAATATCATAAATTCCGGTGCGACTCCAGATGCTGCTGTTGCGGAAAATGGGAAC GTAGACAGAGCAAAGAAGGAAGAAAATGGCATTCCTTCAAGTGATCCAACTGATGCCAAAAGCGGCCAATCAGTGCCGGT TCAAGAACAGGCTCCAGTTGGACTGGGAAAGGGGTTTTCATCATTGGATGGTAAGAAACCAAAGTCAAAACCAAAGGCTG GGGCTTGA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0124300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATATAAGACAGTTTCTTCTTGATGCTCCAGAGACATGCTTTATTACATGCTATGATTTACTACTGCATACAAAGGA TGCATCCACTCATCACCTGGAAGATTATAATGAAATTTCCGAGGTAGCTGATATTACAACTGGTGGTTGCTCCTTGGAAA TGGTTCCTGCATTTTATGATGATAGATCTATAAGGGCTCATGTCCACCGCACAAGAGAGTTGCTTTCTCTTTCTAACCTC CATTCTTCACTATCAACATCACTTGCCCTCCAGAATGAGATCGCACAAAATAAAGCTGCAAATTCTGGAGAAACCTTAAA ACCTGAAGCTCCTGAGCTTGATGGGCTTGGTTATATGGAGGACATTTCTGGTTCATTGGGTAATTTATTATCATCCCCAT TGAAGGATATTAAATGTTTGGACAGCATGGTGTTTTCATCCTTCAATCCTCCTCCGAACTATAGAAGGCTTGTTGGAGAT TTGATTTATTTGGATGTGATAACTCTTGAGAGTAATAAGTTTTCTATTACGGGAAGTACAAAAATGTTTTATGTCAACTC AAGCTCAGCAAACACTCTTGACCCAAGGCCAAGTAAAGCTACTTTTGAAGCTACAACTCTTGTTGCTCTCTTACAGAAAA TCAGCCCAAAGTTCAAAAAAGCTTTCCGCGAAATATTGGAGGGTAGAGCTGCTGCCCATCCTTTTGAAAATGTGCAGTCA TTGTTGCCACCTAATTCGTGGCTTGGCTTTTACCCTGTTCCAGACCACAGACGCGATGCAGCCAGAGCTGAAAATTCCTT GACTCTTCTGTATGGCAGTGAGCCAATTGGCATGCAAAGAGATTGGAATGAGGAATTACAATCTTGTCGAGAATTTTCTC ATATAACTCCACAGGAGAGGATTTTGCGGGATAGGGCACTTTATAAAGTGACATCAGACTTCGTTGATGCAGCCATTAAT GGTGCTGTTGGAGTGATAAGTGGGTGTATTCCTCCAATAAACCCAACCGATCCAGAATGCTTTCACATGTATGTGCACAA CAATATATTCTTTAGTTTTGCTATTGATGCTGACCTTGAGAAGCTGTCCAAAAAACATCCGGATAGTAATTCACAAACAC GGAGTGCTGGCACTTTGCAAAGTTCTTCTGATAAAGCTTCTCATATTGTACTTCATGGAGACAGTCAGGTTCCCAATGGG GGGAAAAATGATACTTCAAGTACAGAAGATCTTAATGGCACAGAAGTCACTGATGATGTTTCTCCTGAAGGTCAGCTGGC TGAGAATGAGCAAGCCACATATGCTTCGGCGAACAATGATTTGAAGGGCACCAAGGCTTACCAGGAAGCTGATGTCCCTG GACTTTACAATCTTGCTATGGCTATAATTGACTACAGGGGTCACAGAGTTGTAGCTCAGAGTGTTTTACCAGGCATTCTT CAAGGGGACAAGTCAGACTCTCTCTTGTATGGCTCTGTTGACAATGGGAAAAAAATTTGCTGGAATGAAGATTTTCATTC TAAGGTATCTGAGGCTGCCAAACGCCTCCATTTGAAGGAACATTTAGTCCTTGATGGATCTGGAAATGTTTTCAAATTAG CTGCACCAGTGGAGTGCAAGGGCATTGTTGGTGGCGATGACAGGCATTATCTTCTTGATTTGTTGAGGGCAACTCCTCGG GATGCCAACTATAGTGGACCTGGTTCTCGATTTTGTATCTTGAGACAAGAATTAATTACTGCCTTTTGTCAGGTCCAAGC AGCTGAGACAACCAAATCTGAGGAGACGAGTACTCAAGGTGCAGATAATTTGGCTACTGATTCTCAAAATGGCATTGACG CTGACAAAAACCTAACCCATTGCTTTGGCATATTTAATGCGTGGAAATTTGATTTAACAGTAGAAGAAAAAGCGGAGGAT GCGAAAGGACATGCTTCTGCATCTACTGAAACCTCTGGTTGCAAAGACGAAATTACTTTCAATCCTAATGTTTTCACTGG ATTCAAACTTGCTGGGAGTCCAGAGGAAATTGCAGCTGATGAAGCAAATGTGAGAAAAGTTAGTCAATATCTTACTGACG TCGTACTTCCGAAGTTTGTACAAGACCTATGCACCCTTGAAGTTTCACCTATGGATGGCCAAACATTAACAGAAGCACTT CATGCTCATGGCATTAATGTTCGCTATATTGGCAAAGTGGCTGGAGGGACTAAACATCTGCCTCATTTGTGGGATCTTTG TAATAATGAAATTGTTGTTAGATCGGCGAAGCATGTAATCAAGGACTTGTTGAGAGACACAGAGGATCATGATCTTGCAC CAGCAATTTCTCATTTCTTGAACTGCCTATTTGGAAGTTGTCAAGCCCCTGGTGGAAAAATAAATGCTAATAGCACACAG TCCAGAACTCCTAAAAAGGAACAAGAAGGGAATCAGTCTTCTGGAAAGCATTCCAAAGGGCAAACACAATGGAAAGGAAG GGCATCTTTAAGAAAAACTCAACCTTCATATGTGAATATGAGCTCTGATACTGTTTGGTCAGACATTCAAGAATTTGCAA TGCTCAAATATGAGTTTGAGTTGCCAGAGGATGCAAGGTCACGGGTTAGGAAAATTTCTGTTATACGTAATCTCTGTCTG AAGGCCGGTATAACCATTGCAGCTCGTAGATATGATCTTAGTTCTGCAGCACCCTTCCAAACATCAGATGTTTTGGATCT TCGACCAGTAGTCAAGCATTCAGTACCTGCATGTTCAGAAGCCAAGGAACTTGTTGAAACGGGAAAACTTCAATTGGCTG AGGGCATGCTCAGTGAAGCCTACACTTTATTTTCAGAGGCATTCTCCATTTTACAACAGGTTACTGGTCCTATGCATCGG GAGGTTGCTAATTGCTGTCGGTATCTTGCCATGGTTTTGTATCATGCTGGAGATATGGCTGGGGCTATCATGCAACAACA TAAGGAACTAATTATCAACGAACGTTGTCTTGGTCTAGATCATCCTGATACCGCTCACAGCTATGGAAATATGGCTCTGT TCTACCATGGACTTAACCAGACGGAACTTGCCCTTCGCCATATGTCCCGGGCTTTGATCTTATTAAGTTTGTCATCAGGG CCAGATCATCCTGATGTAGCAGCTACTTTTATAAATGTTGCGATGATGTATCAGGATATAGGAAAGATGGATACAGCTCT TCGTTATCTGCAAGAAGCTTTAAAGAAGAACGAAAGGCTTCTTGGCGAGGAACATATTCAAACTGCTGTCTGTTATCATG CTCTTGCCATTGCATTTAATTGTATGGGTGCTTTCAAGCTCTCTCACCAGCATGAGAAAAAAACATATGATATACTTGTA AAACAACTTGGTGAGGATGATTCAAGGACACGGGACTCGCAGAACTGGATGAACACATTTAAGATGCGTGAACTACAGAT GAATGCTCAAAAGCAAAAGGGTCAAGCTCTGAATGCAGCTTCGGCTCAGAAGGCTATTGATATCTTGAAGGCACATCCTG ATTTGATACATGCATTCCAAGCTGCTTCAGCAAACGGTGGACCAAGTTCAGGTGCTTCTGCTAACAAATCTCTCAATGCT GCAATAATGGGTGAGGCTCTCCACAGAGGAAGGGGAATTGATGAAAGGGCGGCACGTGCTGCTGCTGAAGTCAGGAAGAA GGCTGCAGCTAGGGGTCTGTTGGTACGTCCACACGGTGTGCCGGTACAGGCCATGCCGCCCCTGACCCAACTTCTGAATA TCATAAATTCCGGTGCGACTCCAGATGCTGCTGTTGCGGAAAATGGGAACGTAGACAGAGCAAAGAAGGAAGAAAATGGC ATTCCTTCAAGTGATCCAACTGATGCCAAAAGCGGCCAATCAGTGCCGGTTCAAGAACAGGCTCCAGTTGGACTGGGAAA GGGGTTTTCATCATTGGATGGTAAGAAACCAAAGTCAAAACCAAAGGCTGGGGCTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0124300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDIRQFLLDAPETCFITCYDLLLHTKDASTHHLEDYNEISEVADITTGGCSLEMVPAFYDDRSIRAHVHRTRELLSLSNL HSSLSTSLALQNEIAQNKAANSGETLKPEAPELDGLGYMEDISGSLGNLLSSPLKDIKCLDSMVFSSFNPPPNYRRLVGD LIYLDVITLESNKFSITGSTKMFYVNSSSANTLDPRPSKATFEATTLVALLQKISPKFKKAFREILEGRAAAHPFENVQS LLPPNSWLGFYPVPDHRRDAARAENSLTLLYGSEPIGMQRDWNEELQSCREFSHITPQERILRDRALYKVTSDFVDAAIN GAVGVISGCIPPINPTDPECFHMYVHNNIFFSFAIDADLEKLSKKHPDSNSQTRSAGTLQSSSDKASHIVLHGDSQVPNG GKNDTSSTEDLNGTEVTDDVSPEGQLAENEQATYASANNDLKGTKAYQEADVPGLYNLAMAIIDYRGHRVVAQSVLPGIL QGDKSDSLLYGSVDNGKKICWNEDFHSKVSEAAKRLHLKEHLVLDGSGNVFKLAAPVECKGIVGGDDRHYLLDLLRATPR DANYSGPGSRFCILRQELITAFCQVQAAETTKSEETSTQGADNLATDSQNGIDADKNLTHCFGIFNAWKFDLTVEEKAED AKGHASASTETSGCKDEITFNPNVFTGFKLAGSPEEIAADEANVRKVSQYLTDVVLPKFVQDLCTLEVSPMDGQTLTEAL HAHGINVRYIGKVAGGTKHLPHLWDLCNNEIVVRSAKHVIKDLLRDTEDHDLAPAISHFLNCLFGSCQAPGGKINANSTQ SRTPKKEQEGNQSSGKHSKGQTQWKGRASLRKTQPSYVNMSSDTVWSDIQEFAMLKYEFELPEDARSRVRKISVIRNLCL KAGITIAARRYDLSSAAPFQTSDVLDLRPVVKHSVPACSEAKELVETGKLQLAEGMLSEAYTLFSEAFSILQQVTGPMHR EVANCCRYLAMVLYHAGDMAGAIMQQHKELIINERCLGLDHPDTAHSYGNMALFYHGLNQTELALRHMSRALILLSLSSG PDHPDVAATFINVAMMYQDIGKMDTALRYLQEALKKNERLLGEEHIQTAVCYHALAIAFNCMGAFKLSHQHEKKTYDILV KQLGEDDSRTRDSQNWMNTFKMRELQMNAQKQKGQALNAASAQKAIDILKAHPDLIHAFQAASANGGPSSGASANKSLNA AIMGEALHRGRGIDERAARAAAEVRKKAAARGLLVRPHGVPVQAMPPLTQLLNIINSGATPDAAVAENGNVDRAKKEENG IPSSDPTDAKSGQSVPVQEQAPVGLGKGFSSLDGKKPKSKPKAGA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Hamap | 1 | 1267 | 1267 | 33.783 | ||
| PANTHER | 1 | 1322 | 1322 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1322 | 1322 | 0.0 | – | |
| Pfam | 2 | 74 | 73 | 2.3E-12 | ||
| SUPERFAMILY | 126 | 238 | 113 | 5.23E-23 | – | |
| Gene3D | 154 | 233 | 80 | 4.3E-7 | ||
| Pfam | 160 | 227 | 68 | 1.1E-5 | ||
| ProSiteProfiles | 254 | 565 | 312 | 48.141 | ||
| Pfam | 281 | 564 | 284 | 4.1E-83 | ||
| MobiDBLite | 364 | 424 | 61 | - | – | |
| MobiDBLite | 369 | 389 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 398 | 424 | 27 | - | – | |
| Pfam | 708 | 892 | 185 | 2.6E-50 | ||
| CDD | 710 | 893 | 184 | 1.39003E-48 | ||
| MobiDBLite | 794 | 831 | 38 | - | – | |
| Gene3D | 912 | 1177 | 266 | 9.3E-42 | ||
| SUPERFAMILY | 921 | 1115 | 195 | 1.21E-13 | ||
| ProSiteProfiles | 921 | 954 | 34 | 6.048 | ||
| SMART | 921 | 954 | 34 | 180.0 | ||
| Pfam | 969 | 1032 | 64 | 9.0E-9 | – | |
| ProSiteProfiles | 1005 | 1080 | 76 | 11.181 | ||
| SMART | 1005 | 1038 | 34 | 49.0 | ||
| ProSiteProfiles | 1005 | 1038 | 34 | 6.018 | ||
| Pfam | 1045 | 1118 | 74 | 2.8E-12 | – | |
| ProSiteProfiles | 1047 | 1080 | 34 | 9.086 | ||
| SMART | 1047 | 1080 | 34 | 0.097 | ||
| MobiDBLite | 1270 | 1325 | 56 | - | – | |
| MobiDBLite | 1284 | 1298 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Biological process | Intracellular distribution of mitochondria | Any process that establishes the spatial arrangement of mitochondria within the cell. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0124300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…