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LotjaGi3g1v0147300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0147300
Transcript ID LotjaGi3g1v0147300.1
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Callose synthase-like protein; TAIR: AT3G14570.1 glucan synthase-like 4; Swiss-Prot: sp|Q9LUD7|CALS8_ARATH Putative callose synthase 8; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3SK62|A0A0S3SK62_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0147300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:19781456..19801717) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GAAAAATATAGAAACTAAAGAGACATGAGAAGAAAAATTGGGTGAAAGTAAGATGATTAAGAAAGTAGGGCAGAGGAATG AATCAAAAGTTCAAAACCCATTTTAAAATACACTGCCATTTGCACATTCAAAAGACTTAGTCACTTTTTCCTTAGTCCCA CACACACACATTCATAGTCACAGATACACATAGAGATCCATTCAAACACCTTTTTTTTCTTTTATTTTTCCCTCTTCACA GCTTAGCGGGAAATAAAGCTAAACAAAAACAAAAACACAACTTCAAAAGCAAAAGCAAAAGAAGGCCATCAACTTTCCAA TCAGTGCACACACTCTAAAGTGCACACTAGGCCAAAGCTTACCTCACTAAGCAATCACAATGGAGAAGATCATGATCCCA CATATATACTCTGCACACTTGTCATACCCTTTTGCTTGTTACGGAGCTCACATCAATGATGGAGATTGTGCCTGCAGAAC CGATTGAGGGCATATATTTTGAGCAAGGAGAGTCCTCTACAGCGAGAAGCCATGACCCCTTGGCCATTACCAGTGTCAGT AACAGCGGCGGCGACGTTGGTTATGTTCCAGGACCCTTTGATAGTGAAAGGTTGCCAACAGTTTTCGCTTCCGAAATAGA AAGGTTCCTTCGTGTGGCCAACTTGGTTGGGAAGGAGGAACCTCGTGTTGCTTATCTGTGTGAGTCATTTTTCTTTTCTA GGTTTTCTATTCTGGGTGTATATATTTTTTTTTTTTACAAAAATGTTCGAAATGATAGAAAACACTTCAGACTACGGGAT AGGACGCCAGTGGCCAGCAGAGGCCCACTCTTGGGTAGGAGTACCAGGGATTTTCTCGAGAAGGGTTGCCCACCAATTGA GATTTTACTTGATGTAGGGGGATTCGAACCCTCAACCTATGAGGATGTGAGAGTTGAACCCGAAACATGTGGCTAGTTGT 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TAATATGTTCAGGAGGTCTTATCAAAGTAACGTGACATACGTTGTAATAACTTACGCCATTTGGTTCATGTCCTTAACTT GGTTATGTGCACCTTTCCTTTTTAACCCTGCCGGATTCAGCTGGACCAAGGCGGTAGATGACTGGAAAGAGTGGAATAAA TGGATCAGGCAACCAGGTGGATTGGGAATTCATCAGGATAAAAGTTGGCATTCTTGGTGGTATGATGAGCAAGCTCATCT TCGCCGGTCAAGTCTTGCTTCCAGGTTCACCGAGATATTGCTCTCTCTTCGTTTCTTCATCTATCAGTACGGTCTAGTCT ATCACCTAGACATATCTCACCATAGCAAAAACTTCCTGGTCTATGTCTTTTCTTGGATTGTGATTGTTGCAGTTTTCGTC TTGGTGAAGGTATTTTTCACTAATACCCTCTTTCCTTGCACTCTTAAAAAATTTGCTCAACAAAGTAAAAGCATGATTTT GATGCAGGCTGTGAACCTGGGAAGGCAACTGCTAAGTGCTAATTATCAGCTTGGATTCAGATTTTTCAAAGCATTCCTGT TCATTGGTGTTATTGCCCTCATAATTACTCTTTCCTTTATATATCAACTTTCATCGATGGACCTTTTTGTTTGCTGTCTG GCATTCATGCCAACTGCATGGGGATTGATAATGGTAATAATCTTTAGCAACCCTTTTTTTTAACATATCTTTAGCAACCT TGGATGAGCTAAATTGTCACCTTTTTTAATTTGTTCCTTGCTTTTTCCCTGTGAGGCTGTGACTTAATCCATGTAGGAGG CCATTTGAATACGGACTTATTGAAGCTTATGTATAAGAAAAAACACTGTATAAGCTCTAACAAGTGCTCTTTGTCTTACA TCCAAGCGGGTTCTAATTAATATATTTTGGTGGTTCAGATAGCACAAGCTGCAAGGCCAAAGATAGAGCATACAGGATTG TGGGACTTCACCCGTGCACTTGCTAGAGAATTTGACTACGGAATGGGGATAGTTCTTTTTGGACCTATAGCTATTTTGGC ATGGCTACCAATCATTAAAGCCTTCCATGCTCGTATCCTCTTCAACGAGGCATTCAAAAGGCACTTGCAAATCCAACCAA TTCTTGCAGGAAAAAGGAAGAAGCACAGAACTTGATCATGATTTGTACTTGTTTTTGTACAGCCATGCAATGAATCATGT TTTATTTTTCTATAGAAACGATATTAGGAACTTAACAGAACTTATAGCATGTACAGCTAGCTGCATTCGTGTGAGTATAC ATAGTCATAAATGTGCACAGGAAATTATTTCTCATCGCCTAGTTGAATAAGTTATAAAGGAAATTAAAGGGAAGTAAAAC AATACTAGTGCTTTTGTGGATGACTAAAGCATAGGCTCGTTGATAATTTTTGTTGTATGAATAACACTTTAGGAGTAGTA ACATGGTTTTATGTAACATGGTTTTTGGCTCTCTCAAAATTGTTTCATTACCTCTCTTAAAGTCTCAGAAGTATATATTA TATAGGTATTAATTTAATTTTTTTGGGGTCGACTAAGGCAATTGTCTGTATTGCATCAGGCAATACACAACCTGCGCTTC TGCTGCTATGTGTAGCATAATATTTGGAGGAAGAAAGTCTCTTTATAATCTAGATAAGAAAAGGCATAAAAGACTCTTGA TCTCCTTGCTTAATTTGAGCTAATGAATGTGAATTTTTTTGGCATATTTCGGTTATTGATCCAGTGATGAGTGAATTGGA GGGAAAGGTTGTGATAGGTGCTAATGGAGCATGGAGCCAGAGTTTTGAACCAAGTGAGGGCAGCCATGCACAGGGTTCAC GGAAATATAAGCTGTTATGTGGCTCCTAAGTAGCTTAGTTAACTAGTTCTTGAAAGCATTAACATGCTTGTGAGGGTCGC CTCTCCGATGTCTGGCTCCCACCAAGAGACGGAGGGAAGGTGGTTTTTCAGATAGATTGTTTGATGTTGTTCAATTATTG GCAGGTTGTTTTTCACATTTGG 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0147300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGATGGAGATTGTGCCTGCAGAACCGATTGAGGGCATATATTTTGAGCAAGGAGAGTCCTCTACAGCGAGAAGCCATGA CCCCTTGGCCATTACCAGTGTCAGTAACAGCGGCGGCGACGTTGGTTATGTTCCAGGACCCTTTGATAGTGAAAGGTTGC CAACAGTTTTCGCTTCCGAAATAGAAAGGTTCCTTCGTGTGGCCAACTTGGTTGGGAAGGAGGAACCTCGTGTTGCTTAT CTGTGTCGAGTTCACGCCTTTGTAGTTGCGCACAACTTGGACAAAAATTCTAGTGGAAGGGGTGTTAGACAATTCAAAAC TTCACTCCTTCATAGACTTGAACAGGATGAGAGAGTTACAAAAAGGAAGGGGAAGAGTGACATTCGTGAACTTAAGGATG TTTACCATGCCTATAGGGATTATTTTATTAGACATCATCAGGCATTCGATCTAGAGCAAAGTCGTAGGGAGAAATTGATA AATGCACGGAATATTGCTTCTGTTCTATTTGAAGTACTCAAAACAGTTACGGATACAGCTAGTTCTCAGGCATTTATTGA AGGGAAAGCAATCCACAAAAAAACTGAGTTTAACATTCTTCCACTTGAGCAAGGAGGCATTCAGCATGCAATTATGAAGC AGCCTGAGATTAAGGCTGCCATTGCAGTTATTCGCAATGTTCGTGGTTTGCCCCCAGCTCAAGATTTCAAGAAACATGGA GCCTTTGTAGATCTGTTTGATTTTCTTCAGCATTGTTTTGGATTCCAGGAGGCCAGTGTTGCAAACCAAAGGGAACATCT TATTCTACTCCTAGCCAACATTCAGACTCGGCAAACTCACAACCAGACATCTGTTTTGAAGTTAGGAGAAGGAGGCGTGG ATGAACTTATGAGGAAGTTTTTCAAAAATTATACCAACTGGTGCAAGTATTTGGGAAGAAATAGCAATATCCGCTTACCT TTTGTCAAACAGGAAGCCCAACAATACAAAATTTTGTATATTGGCCTTTACCTGCTCATATGGGGGGAGGCAGCTAATTT ACGGTTCATGCCAGAGTGTCTCTGCTATATCTTTCACCATATGGTGTATGAATTGCATGGAGTTTTAAGCGGTGCTATCA GCTTAACAACATGGGAAAAGGTCATGCCTGCATATGGAGGAGAACCAGAGTCTTTCCTTAATGATGTTGTCACCCCCATA TACGAAGTTATAAGAAAGGAAGTTGCCAATAGCAAAGGCGGGACAGCTGATCATTCTGCATGGAGAAACTATGATGATCT GAATGAGTATTTCTGGTCCCCTGATTGTTTCAAAATCGGTTGGCCCATGCGTCTGGACCATGATTTTTTCGAAGTAAAAT CTGTAAAGAAACCCGATGTCAAGAATGCTCTTGTTGAATCACCTGGTGATAGAAAAGAAAAGAAGAACGAAGAAGCAGAG GATACTGGGGACGAAAACCACGAACCACAATGGCTGGGAAAGACAAATTTTGTAGAGATTCGCTCATTTTTGCAAATATT TCGAAGCTTTGATAGAATGTGGAGTTTTTATATTTTATCCCTTCAGGCCATTATAATCATCGCTTGCCATGACGTGGGAT CTCCACTTCAGTTGTTTGATACCACAGTATTTGAGGATATAATCAGCGTCTTTATCACCTCTGCATTTCTTAAACTTCTT CATGCAATTTTAGACATAGCTTTTACATGGAGAGCGAGATGTACCATGGAATATTCTCAAAAAGTGAAACTTGTGATGAA GCTGGTCTTTGCTGTTATATGGAATATTGTTCTTCCCCTTTGCTATGCTAACTCAAGAGGAAAATATACTTGTTATTCCA CAAAGTCTGGAACCAGGGTTGAGGAATGGTGCTTTACTTCCTACATGGTTGCTGCTGCAATATACTTGACGAGTAATGCC GTTGAATTGGTTTTATTTTTTGTCCCTGCTGTGGCCAAGTATATTGAGGTCTCTAATTACCAGATATGCAAAGTTTTGTC TTGGTGGATTCAGCCTAGAATCTATGTTGGACGGGGGATGCAAGAAGACCAGGTTTCAGTTTTAAAGTACACAGTGTTTT GGGTATTGGTGTTATCATGTAAATTTTTGTTCAGCTACAGTTTTGAGATTAAACCACTTATAAAACCAACTAGACAGATT ATGAAAATTGGCCAACAATATGAGTGGCATGAGCTTTTTCCAAAAGTCAAAAGTAACGCTGGTGCAATTGTGGCCGTATG GAGCCCTGTAGTAATTGTATTTTTTATGGATACACAGATTTGGTATTCTGTTTTCTGTGCAATATTTGGTGGACTTTATG GAGTTTTGCATCACCTTGGTGAGATAAGAACCCTAGGAATGCTGAGAAGTCGATTTAACTCCTTGCCTTCAGCATTTAAT GTCTGTCTGAACCCACCTTCGTCCAAACGCGGTAAAAAGAAAAGAAAAGGTCTCCTCAGCAATATATTTCAAAAGGTGCC TGATGAAAAAAATGCTACTGCCAAATTTGTGGTGGTATGGAATCAAATTATATACCATCTTCGTCTTGAAGACTTGATTA GTAACAGAGAGATGGATTTAATGATGATGCCTGTGTCTTCAGAATTGTTTTCTAGGAAGGTTCTTTGGCCTGTTTTTCTC TTGGCAAATAAGTTTTCTACAGCTTTGACCATTGCTAAAGATTTTGAGGGAAAGGATGAAATTCTTGCCAGAAAAATTAC AAGAGACATATACATGTTCTATGCTGTAAGAGAGTGCTACCAGTTACTGAAATACGTCCTTGAGATTCTTATTGTGGGTA GCATGGAGAAAAGGATCATATTTGATATACAAAGTGAAATTGAAAAATGTATTGAAGAATCAAGTCTACTGAAGAACTTC AACTTGAAAGTTCTCCCAGATCTACATGCAAAGGTCATTGAGCTAGCTGAACTCCTGATTGAGGGAGATAAAGACCAGCA GCACAAAGTCGTGAAAGCTTTACTAGATATGTTGGAACTTGTAACAAATGATATGATGACTGATTCCAGAATATTGGATA TGTTTCACTTTCCTCAACAAAGTGAGCGTGGGTTTGTCTATTTTAGAGATGATGATCAACTATTTGTCAATGATGAAACG AATAGTGGATTCTATCCATTTGCCAATGAGAATTCTATCCATTTTCCCTTGCCAGAAAGTGGCCCTCTCATGGAAAAGAT CAAGCGTTTTCATTTGTTGCTTACTGTCAAAGATACAGCTTTGGACGTGCCGGCAAACTTAGATGCTCGTAGGCGCATAT CATTCTTTGCTACTTCTCTGTTTTCTGATATACCAGACGCTCCAAAAGTGCTCAATATGCTGCCTTTTAGTGTCATGACT CCACACTACATGGAAGACATTAATTTTTCAGTGAAGGAGCTTGGTTCAGATATAGAGCAGGATTCCATCATCTTTTACAT GCAAAAGATATTTCCAGATGAATGGAAAAACTTTATGGAACGTATGGGTTGTGAAAATCCCCAGAGTTTAGAAGATGAAC TCAAGACAGAAGAGCTTAGACTGTGGGCTTCATTCCGGGGCCAGACACTGAGCAGAACAGTTAGAGGGATGATGTACTAC AGAGAAGCCTTAAAATTACAAGCATTTCTTGACATGGCTGAAGATGAAGATATTCTTGAAGGTTATGAGACTGCTGAGAA AGGCAACCATGCATTGTTTGCTCGTTTAGAAGCACTAGCGGACATGAAATACACCTATGTCATTTCCTGTCAATCATTTG CTTCACAAAAGGCTTTGAATGATCCCCGTTATAAAGATACAATTGACTTAATGATAAGGTATCCATCTCTTCGTGTTGCT TATGTTGAGGAAAAGGAACAGATTGTGCCGGGTAAACCTCCCAAAGTATATACATCTAAACTGGTTAAAGTTGTCAATGG ATTTGAACAGACAATATATCAAATAAAACTTCCAGGTCCACCACTACTTGGAGAAGGGAAGCCTGAAAATCAAAACAACG CAATAATATTCACTCGGGGTGAAGCCCTCCAAACAATTGACATGAACCAAGATAATTGCTTGGAAGAAGCTCTTAAAATG AGAAACCTTCTCCAAGAATTTCATCGCCGCCAAGGCCGGCGTCCTCCAACCATACTTGGTCTGAGGGAGCACATTTTCAC AGGAAGCGTGTCTTCTCTGGCATGGTTCATGTCATATCAGGAGACCAGCTTCGTCACTATTGGTCAAAGGATTCTGGCTA ACCCTCTCAGAGTGCGGTTCCACTATGGCCATCCAGATGTATTTGACAGGGTTTTTCATATTACAAGAGGAGGAATAAGC AAGGCATCTAAAACAATTAACTTGAGTGAGGATGTTTTTGCTGGGTTCAATTCTATTTTAAGAAGGGGGTGTATTTCCTA CCATGAATACTTGCAAATAGGAAAAGGTCGGGATGTAGGTCTAAATCCGATCTCAAAATTTGAAGCCAAGGTAGCAAATG GAAACAGTGAGCAAACTATAAGCCGTGACATATTCCGCCTAGGACGGCAATTTGATTTTTTTCGGATGCTATCTTGTTAT TTCACAACCATTGGATTTTACTTCAGCAGCTTGATTTCAGTTATAGGAGTATATGTATTCCTTTACGGGCAACTATACCT GGGGATTAGTGGTTTGGGGAGAGCACTTGTTATGGAGGCTCGAATAAAAAATGTACAGTCCCTAGAAACAGCGCTTGCCT CGCAATCATTTATACAACTCGGGCTTCTAACCGGCTTGCCAATGATGATGGAGATAGGCCTTGAGAGAGGTTTCCTCACA GCGCTTAAAGATTTTGTCCTCATGCAATTGCAGCTGGCTGCTGTTTTCTTCACTTTCTCCCTCGGAACGAAAACACATTA TTATGGAAGAACAATTTTGCATGGGGGTGCCAAGTACAGACCAACTGGGCGCAAAGTCGTCTTTCATGCTAGCTTTACTG AAAACTACAGATTATATTCAAGAAGCCACTTTGTCAAGGCATTTGAGCTATTGTTGTTGCTGATTGTTTATAATATGTTC AGGAGGTCTTATCAAAGTAACGTGACATACGTTGTAATAACTTACGCCATTTGGTTCATGTCCTTAACTTGGTTATGTGC ACCTTTCCTTTTTAACCCTGCCGGATTCAGCTGGACCAAGGCGGTAGATGACTGGAAAGAGTGGAATAAATGGATCAGGC AACCAGGTGGATTGGGAATTCATCAGGATAAAAGTTGGCATTCTTGGTGGTATGATGAGCAAGCTCATCTTCGCCGGTCA AGTCTTGCTTCCAGGTTCACCGAGATATTGCTCTCTCTTCGTTTCTTCATCTATCAGTACGGTCTAGTCTATCACCTAGA CATATCTCACCATAGCAAAAACTTCCTGGTCTATGTCTTTTCTTGGATTGTGATTGTTGCAGTTTTCGTCTTGGTGAAGG CTGTGAACCTGGGAAGGCAACTGCTAAGTGCTAATTATCAGCTTGGATTCAGATTTTTCAAAGCATTCCTGTTCATTGGT GTTATTGCCCTCATAATTACTCTTTCCTTTATATATCAACTTTCATCGATGGACCTTTTTGTTTGCTGTCTGGCATTCAT GCCAACTGCATGGGGATTGATAATGATAGCACAAGCTGCAAGGCCAAAGATAGAGCATACAGGATTGTGGGACTTCACCC GTGCACTTGCTAGAGAATTTGACTACGGAATGGGGATAGTTCTTTTTGGACCTATAGCTATTTTGGCATGGCTACCAATC ATTAAAGCCTTCCATGCTCGTATCCTCTTCAACGAGGCATTCAAAAGGCACTTGCAAATCCAACCAATTCTTGCAGGAAA AAGGAAGAAGCACAGAACTTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0147300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MMEIVPAEPIEGIYFEQGESSTARSHDPLAITSVSNSGGDVGYVPGPFDSERLPTVFASEIERFLRVANLVGKEEPRVAY LCRVHAFVVAHNLDKNSSGRGVRQFKTSLLHRLEQDERVTKRKGKSDIRELKDVYHAYRDYFIRHHQAFDLEQSRREKLI NARNIASVLFEVLKTVTDTASSQAFIEGKAIHKKTEFNILPLEQGGIQHAIMKQPEIKAAIAVIRNVRGLPPAQDFKKHG AFVDLFDFLQHCFGFQEASVANQREHLILLLANIQTRQTHNQTSVLKLGEGGVDELMRKFFKNYTNWCKYLGRNSNIRLP FVKQEAQQYKILYIGLYLLIWGEAANLRFMPECLCYIFHHMVYELHGVLSGAISLTTWEKVMPAYGGEPESFLNDVVTPI YEVIRKEVANSKGGTADHSAWRNYDDLNEYFWSPDCFKIGWPMRLDHDFFEVKSVKKPDVKNALVESPGDRKEKKNEEAE DTGDENHEPQWLGKTNFVEIRSFLQIFRSFDRMWSFYILSLQAIIIIACHDVGSPLQLFDTTVFEDIISVFITSAFLKLL HAILDIAFTWRARCTMEYSQKVKLVMKLVFAVIWNIVLPLCYANSRGKYTCYSTKSGTRVEEWCFTSYMVAAAIYLTSNA VELVLFFVPAVAKYIEVSNYQICKVLSWWIQPRIYVGRGMQEDQVSVLKYTVFWVLVLSCKFLFSYSFEIKPLIKPTRQI MKIGQQYEWHELFPKVKSNAGAIVAVWSPVVIVFFMDTQIWYSVFCAIFGGLYGVLHHLGEIRTLGMLRSRFNSLPSAFN VCLNPPSSKRGKKKRKGLLSNIFQKVPDEKNATAKFVVVWNQIIYHLRLEDLISNREMDLMMMPVSSELFSRKVLWPVFL LANKFSTALTIAKDFEGKDEILARKITRDIYMFYAVRECYQLLKYVLEILIVGSMEKRIIFDIQSEIEKCIEESSLLKNF NLKVLPDLHAKVIELAELLIEGDKDQQHKVVKALLDMLELVTNDMMTDSRILDMFHFPQQSERGFVYFRDDDQLFVNDET NSGFYPFANENSIHFPLPESGPLMEKIKRFHLLLTVKDTALDVPANLDARRRISFFATSLFSDIPDAPKVLNMLPFSVMT PHYMEDINFSVKELGSDIEQDSIIFYMQKIFPDEWKNFMERMGCENPQSLEDELKTEELRLWASFRGQTLSRTVRGMMYY REALKLQAFLDMAEDEDILEGYETAEKGNHALFARLEALADMKYTYVISCQSFASQKALNDPRYKDTIDLMIRYPSLRVA YVEEKEQIVPGKPPKVYTSKLVKVVNGFEQTIYQIKLPGPPLLGEGKPENQNNAIIFTRGEALQTIDMNQDNCLEEALKM RNLLQEFHRRQGRRPPTILGLREHIFTGSVSSLAWFMSYQETSFVTIGQRILANPLRVRFHYGHPDVFDRVFHITRGGIS KASKTINLSEDVFAGFNSILRRGCISYHEYLQIGKGRDVGLNPISKFEAKVANGNSEQTISRDIFRLGRQFDFFRMLSCY FTTIGFYFSSLISVIGVYVFLYGQLYLGISGLGRALVMEARIKNVQSLETALASQSFIQLGLLTGLPMMMEIGLERGFLT ALKDFVLMQLQLAAVFFTFSLGTKTHYYGRTILHGGAKYRPTGRKVVFHASFTENYRLYSRSHFVKAFELLLLLIVYNMF RRSYQSNVTYVVITYAIWFMSLTWLCAPFLFNPAGFSWTKAVDDWKEWNKWIRQPGGLGIHQDKSWHSWWYDEQAHLRRS SLASRFTEILLSLRFFIYQYGLVYHLDISHHSKNFLVYVFSWIVIVAVFVLVKAVNLGRQLLSANYQLGFRFFKAFLFIG VIALIITLSFIYQLSSMDLFVCCLAFMPTAWGLIMIAQAARPKIEHTGLWDFTRALAREFDYGMGIVLFGPIAILAWLPI IKAFHARILFNEAFKRHLQIQPILAGKRKKHRT 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 513 513 -
PANTHER 41 1948 1908 0.0
PANTHER 41 1948 1908 0.0
Gene3D 49 197 149 1.2E-8
Pfam 61 181 121 1.8E-10
SMART 328 444 117 1.3E-74
Pfam 330 442 113 3.1E-38
MobiDBLite 465 488 24 -
MobiDBLite 465 490 26 -
TMHMM 513 535 23 -
Phobius 514 536 23 -
Phobius 537 547 11 -
TMHMM 547 569 23 -
Phobius 548 572 25 -
Phobius 573 583 11 -
Phobius 584 605 22 -
TMHMM 584 603 20 -
Phobius 606 624 19 -
TMHMM 624 646 23 -
Phobius 625 648 24 -
Phobius 649 686 38 -
Phobius 687 708 22 -
TMHMM 690 708 19 -
Phobius 709 759 51 -
TMHMM 760 782 23 -
Phobius 760 779 20 -
Phobius 780 1518 739 -
Pfam 1083 1172 90 2.6E-23
Pfam 1174 1766 593 6.7E-191
Phobius 1519 1541 23 -
TMHMM 1520 1542 23 -
Phobius 1542 1576 35 -
TMHMM 1568 1590 23 -
Phobius 1577 1594 18 -
Phobius 1595 1605 11 -
TMHMM 1605 1622 18 -
Phobius 1606 1623 18 -
Phobius 1624 1662 39 -
Phobius 1663 1680 18 -
Phobius 1681 1691 11 -
TMHMM 1689 1711 23 -
Phobius 1692 1711 20 -
Phobius 1712 1761 50 -
Phobius 1762 1783 22 -
Phobius 1784 1794 11 -
Phobius 1795 1812 18 -
TMHMM 1795 1817 23 -
Phobius 1813 1831 19 -
TMHMM 1830 1852 23 -
Phobius 1832 1852 21 -
Phobius 1853 1858 6 -
TMHMM 1857 1879 23 -
Phobius 1859 1880 22 -
Phobius 1881 1899 19 -
TMHMM 1899 1921 23 -
Phobius 1900 1921 22 -
Phobius 1922 1953 32 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component 1,3-beta-D-glucan synthase complex A protein complex that catalyzes the transfer of a glucose group from UDP-glucose to a (1->3)-beta-D-glucan chain.
Molecular function 1,3-beta-D-glucan synthase activity Catalysis of the reaction: UDP-glucose + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n) = UDP + [(1->3)-beta-D-glucosyl](n+1).
Biological process (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of (1->3)-beta-D-glucans, compounds composed of glucose residues linked by (1->3)-beta-D-glucosidic bonds.
Cellular component Membrane A lipid bilayer along with all the proteins and protein complexes embedded in it an attached to it.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0147300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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