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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0276600 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0276600.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Kinase family protein; TAIR: AT3G45780.1 phototropin 1; Swiss-Prot: sp|O48963|PHOT1_ARATH Phototropin-1; TrEMBL-Plants: tr|A0A126X246|A0A126X246_LUPAN Putative LOV domain-containing protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0276600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:54921747..54942091) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CACGACTGCTGTCTAAACCGACAACCAGAGAAATATCACTATGTGAAAATTGTTACAACACATAGACTTCTCTCACTCTC ACCCCAATGCCCTAGTACAACCACACTCTCACAAAGCAAATATTAAACTAAGTCAGATATAAGCTTAAAGTGCTACTAAA TGGTGCATCTAAAAACAAAGAACTTAGGTCCGATATATAGCCTTGGTCTCCCCCTTGTTTCACCACACTAAGCTATGCGG GACTTCTCCAATAACTAATTTTTAACCTCCTTCTTTATTTTAGAAACTTGGACAATGTGGGACTTGACAATCAACCCCAA CATGTTGAACACATTGATCAAATAACTATTTCCCTTCCATATTAGCATTGAAATCTTCCTAGAAGCCATGTTAAATAGGC AATTAGTAAAATTGTAACTGCATCAACCCAAGTTTATCTGCAATTTCACAATATAACCACAACTATAACAGCAACCACAA CCGCGATTTTAAAACTTGCTAGCAGCCATGTTAAACAAGCAGTTAGACAAACATCAAGCCTTTATTTCCATCCAATTTTA TATAAAAACTATACTCACTCAATATTGATGAAAATTTGTGATTGCAGTCACACATCAACCAGCCTGGTCTCACGTGTCTA CTTTCATAACCGATCTTTTATTTTTGAGGGGTGGGGGTTGCACGCTCTAGTTTTGATCCAGCAAGATATTACATGATCTA ATTTGTCAGGTATTACAAGATATTATTTTCATATGAACTTGTCTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTCACTTGCCCAAAATAAT TCCACTAAACACAGAGACACAAAAGTCGTTCCCTCCAAACAAACCGGTCGGTAGAACATGCAGAAACCAATGTGCTGATG AGTAACTGATACAATCCCTACGCATTGATTCTCTGTTTTTGTTGCTTTTTCCTTCTTGACAACTCACTCCACTATCTTAC 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TATAAAGCTAGAAAACCTAGCTGGTGTGGTGAACATAATCAATTATCAGATTTTGGAATTGAAATTCACATTAACTTACA GAAATCACTTTTCTCATCAATATACTCAAATTTAAACCTTCATTTTTATGTTTTAACTCCCATGTCTATCCAAAGTCAAT GTTGATACCACTAATTCAAATACACTCTCATTAGCTAAGGATTTTTGTTCAATGTCTAGTTCTATTTTGTGGTCAGCTGT TTGATCAGTAAATCATTCATATCTTATCAGAAACCTCCAGAGCTTGATGCTCCTCTCTTACAAGAAACTGAAGAAGACAA AGAAGCCAAAGATGTAGACCCCAGGCTAGAAGATTTACAGGAAAACTTTTTCTGAAAGGTGTCTTTTTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATGTGTGTATATGTTGTGTGGTTAACATTCCAGTGATTAACACATTATCTTGTG GCCTTGTAGATTTAGATAATGGAGTCTCATAGCATTCAAGAAACACATGATCACGAATTCTTTGGGGTTCTTTTTTTTTT GAGAGAATAATGGAATTTCAATTTCCTGCTTGAGTTGTGTACAGTTTCAACATGTTCATTGTAATAATATATGAATGGAG ATCTCCCACAATTTTTGCTAGTGTGTGGTGCTTTAGTTGCCTGGAGTAAGAGATTAGGGGTGTCGTCATTGTGCACTTCA ACAGCTATTCAACCACAGCGTCTATGTGTGCAAATTCTTGTATATTTTTAATATAATTTTTTGAGTAAGTTAAAATATGT ACGGTAAGAATTTTTTTTTTACATCGAAAAGATAAACTACGACCCTCCAGGTTTGATTCATGGACCTCCCCTCCCCAACC CATATGCTCACCATAAATCAACTAAGTATTGTTAAATTATTTTTAGAAAATTGCTTTCAAGCAATCTCCAAATGTGTGTT TGAATTAATTTATTTACTAAAATATTACTGTATTTTTTTAGAAAGCAGAAATTTATATATATGGAAAAATAGACAAAAGC ACAAAACTCAACTCCAAAAGGAAAAAGAACCCCAAACCAGGCTAAAATTCAGAAGAATAACAACGGACCTCTCAAAATTA CCCACAGAGGAACAAACTGAGAAGTCTGAGGAACACCACCCGAGACACAAACGCATCCAACAAAACTACCACAGAACCTA AAGACCCCAGGAAAAGGAAAAAGGGGGAAACCAAAAAAACTTTGCGAGGAGGACCATGATATCAACAGCAAAAAAAAGGA GAAACCACCACTACTACAATGACCTGCGGGCACGAATCTCGACTGCTATCTGGTTCAGAACAGTCTCATTTGTACAATCG TAACGAATATCCATATAATTCCTCATCAAAAGGGCACTCCTTACTCTAGTCATGATACCATAAGGCTCTGAAAAACTCTA TGGATAAAACCATCAGCTAATTCATTTTGTTTGCTTCCAATGAACCTGAATCCTTAACTATCAAAGAACCACTAGTAACC CCAACAAGCTCCTTCTTCTTCCCACCTCTTTTCACAAATTTCATGGGTCTTCCCTTATGCCTGATCAGATATATAGTCCC ACCACCAACTGTGATCAGTGGCGGAGGCACATGGGTGACTTCTCCCTACTTAGTCACCCCTGGTTTTTGGTCCTCTGTGA TCAGTGGCGGAGGCACATGGGTGACTTCTCCCTACTTAGTCACCCCTGGTTTTTGGTCCTCTGTGGGAGAAGCTATCGTG ATCCATCACTTCTTTGGTCCCCTCTAGTTTAATGATCATATTTTTCGTTTTTGCCTCTGGTTGTGTCAATAAAGCTGGCA TGGGGACCTCAAGCTTCGTCTCTCTGTGCCTTGTTTTACTGTGTTTCTGCAGGCTTCCTTGCTGTGGTACCAAGGTCATG TTTTTGCTGAATGGCTCCGACTGCTGAACCTTTTCTTCTTTGTTTTCTTTGCCCTCTGCTCTGTTTACTTTCCTCTATAT GTTTTTGTTTTGTCTTTCTTCCTTTTTTCTGGCCCTTGTGATCCTCTCCTTTGTTTGATCCTTGGTGCTTTTTTGTACTT GTCCTGAGCCTCTTTGTGCCCATGG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0276600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGCAGCAGTTGAAGAAATCATCACTGAGAACATCATTCCCTCGTGACCCTCGTGGGTCCCTCGAAGTGTTCAACCC AACCGCAAGCAACTCCGCCTCACCGGCGCGCGCTCAGCCGCTCTGGAAAACGTGGAGCGGCGCGGAGGAGGAGGAGCCGC GTGAAATTTCCTCCGATGAGGTATCGTGGATGGCGCTAGAGGGCGAGGAGCGCGGCGTGGCGGCGGAGAGAGCCGCCGAG TGGGGGTTGGTGCTGAGGACGGATACCGAGACCGGGAAGGCGCACGGGGTGGCTGTGAGGAATTCCGGCGGGGATGAGCC TGGTGCGGGCGCCAAAGTTGCGGCGGTTTCTTGTTCTTCTAATAGGAGGAGCTCTAACAACTCCGGTAGAGACTCCGGCG AATCCTCCGACGGCGGCGGGGGGATTCCGAGGATTTCGAAGGATTTGAAGGACGCTTTGTCGACGTTTCAACAGACGTTT GTGGTTTCGGATGCTACGAAACCCGATTACCCGATCATGTATGCGAGTGTCGGGTTCTTCAAGATGACGGGTTATACGTC CAAGGAAGTCATAGGCCGGAACTGTCGGTTTTTGCAGGGTGCAGATACGGATCCGGAGGAAGTTTCAAAGATAAGGGAAG CGTTAGAAGCGGGGAAAAGTTACTGCGGAAGGTTACTGAATTACAAAAAGGACGGCTCACCTTTCTGGAACCTTCTCACC GTTTCACCCATCAAAGACGACGATGGCAAAGTGCTCAAATTCATCGGAATGCAAGTGGAGGTTAGCAAGCATACAGAAGG ATCCAAGGAGAAGATGCTGCGGCCCAATGGATTGCCCGAATCATTAATCCGATATGACGCTCGTCAGAAAGAGAAGGCTG AAACTTCAGCATCTGAGTTGGTACAAGCTGTGAAGCGCCCCCGAGCACTCAGTGAATCAGAAAACCGTCCCTCCATCAGA AAATCAGAGAGTGCTGAAGATGAAGAAGAAGAGGAAGAAAAACCAGAAAAAACTTCAAGGAGAAAATCTGAGAGTGTGGC TTCATTTAGACAGAAACCACAAGTAAGAAATAGAAATTCAATGCAGCGAATCAGTGAGGTGCCTGAAAACAAACAGAAAA ACAACCATCGCCATTCTTTCATGGGGTTCATTAAGAAAAGTCCTCCCAAAGATGAAAGCATAGCTAATGAAGTTATTGAG GTTGTCATCTCTGACAGTGAGGATGATGAGAGGCCTGATAGCTTCGAATTCGATGAAAAAGAAAAGCTCAGGGAAAAGAG GAAAGGTCTTGATCTTGCTACCACACTTGAGCGTATTGAGAAAAACTTTGTCATTACTGATCCAAGGCTTCCTGATAATC CTATAATCTTTGCATCTGATAGCTTCTTAGAGCTTACAGAATACAGTCGTGAAGAAATATTGGGAAGAAATTGCAGGTTT CTGCAAGGACCTGAAACTGATCCAGAAACTGTGAGAAAAATTAGAAAGGCCATTGACAACCAAACAGAAGTCACCGTGCA ACTCATTAATTATACTAAGAGTGGCAAAAAGTTCTGGAACCTGTTTCATTTGCAACCTATGCGTGATCAGAAGGGAGAAG TGCAATATTTTATTGGTGTTCAACTTGATGGTAGTCAACACATAGAACCTCTTCACAACTGCATCGCAGTAGATAATGCA AAGGAGGGAGAACAATTGGTTAAACAAACCGCAGAATATGTTGATGAGGCAGCGAGAGAACTTCCGGATGCTAATCTGAA ACCAGACGAGTTATGGATGAATCATTCAAAAGTGGTTCGCCCCAAACCGCATAGGAAGGAAGATGCAACTTGGAAAGCTA TTCAAAAGATCCTAGAAAGTGGGGAACAGATAGGCCTAAAGCACTTCAGGCCAATCAAACCCCTGGGGTCGGGGGATACT GGCAGTGTGCATCTGGTGGAGCTAAGTGGAACTGGTCAATATTTTGCCATGAAGGCTATGGATAAGAGTGTTATGCTCAA TCGTAACAAGGTGCATAGAGCTTGCACAGAGAGAGAAATCCTTGACATGTTGGACCACCCTTTTCTGCCTGCATTATATG CGTCCTTTCAGACCAAAACACATGTTTGTTTGATAACCGATTACTGTCCTGGTGGAGAGTTATTCCTGCTTCTTGACCGG CAGCCAACAAAGGTTCTCAAGGAAGACGCTGTGAGATTTTATGCTGCTGAGGTACTGATTGCATTGGAGTACCTTCATTG TCAAGGGATAATATATCGAGATTTGAAGCCAGAAAATGTGTTAATCCAGAGCAATGGGCATTTGTCTCTAACAGATTTTG ATTTGTCATGTTTAACATCTTGCAAGCCACAGCTTGTAATTCCAGCTTCAAATGAAAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAACAA CAGAAAAGTCAGCAGGTTCCAATGTTTATGGCTGAACCAATGAGAGCATCAAATTCTTTTGTTGGCACGGAAGAGTACAT AGCTCCGGAAATTATAACTGGTTCAGGCCATTCTAGTGCTGTAGATTGGTGGGCTCTAGGTATTCTTCTATATGAAATGC TTTATGGGTATACACCATTCAGGGGAAAGACAAGACAAAAAACATTTGCAAATATTCTTCACAAAGATCTTAAATTTCCC AAAAGCAAACCGGTAAGTCTCCATGCAAAGCAGCTAATTTACCGGTTGTTGCATAGAGATCCCAAAAACAGATTGGGTTC ACAAGAGGGAGCAAATGAAATTAAGCGGCATCCATTCTTCCGGGGTGTCGATTGGGCACTAATTCGTTGCATGAAACCTC CAGAGCTTGATGCTCCTCTCTTACAAGAAACTGAAGAAGACAAAGAAGCCAAAGATGTAGACCCCAGGCTAGAAGATTTA CAGGAAAACTTTTTCTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0276600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEQQLKKSSLRTSFPRDPRGSLEVFNPTASNSASPARAQPLWKTWSGAEEEEPREISSDEVSWMALEGEERGVAAERAAE WGLVLRTDTETGKAHGVAVRNSGGDEPGAGAKVAAVSCSSNRRSSNNSGRDSGESSDGGGGIPRISKDLKDALSTFQQTF VVSDATKPDYPIMYASVGFFKMTGYTSKEVIGRNCRFLQGADTDPEEVSKIREALEAGKSYCGRLLNYKKDGSPFWNLLT VSPIKDDDGKVLKFIGMQVEVSKHTEGSKEKMLRPNGLPESLIRYDARQKEKAETSASELVQAVKRPRALSESENRPSIR KSESAEDEEEEEEKPEKTSRRKSESVASFRQKPQVRNRNSMQRISEVPENKQKNNHRHSFMGFIKKSPPKDESIANEVIE VVISDSEDDERPDSFEFDEKEKLREKRKGLDLATTLERIEKNFVITDPRLPDNPIIFASDSFLELTEYSREEILGRNCRF LQGPETDPETVRKIRKAIDNQTEVTVQLINYTKSGKKFWNLFHLQPMRDQKGEVQYFIGVQLDGSQHIEPLHNCIAVDNA KEGEQLVKQTAEYVDEAARELPDANLKPDELWMNHSKVVRPKPHRKEDATWKAIQKILESGEQIGLKHFRPIKPLGSGDT GSVHLVELSGTGQYFAMKAMDKSVMLNRNKVHRACTEREILDMLDHPFLPALYASFQTKTHVCLITDYCPGGELFLLLDR QPTKVLKEDAVRFYAAEVLIALEYLHCQGIIYRDLKPENVLIQSNGHLSLTDFDLSCLTSCKPQLVIPASNEKRKKKKKQ QKSQQVPMFMAEPMRASNSFVGTEEYIAPEIITGSGHSSAVDWWALGILLYEMLYGYTPFRGKTRQKTFANILHKDLKFP KSKPVSLHAKQLIYRLLHRDPKNRLGSQEGANEIKRHPFFRGVDWALIRCMKPPELDAPLLQETEEDKEAKDVDPRLEDL QENFF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 15 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 59 | 59 | - | – | |
| MobiDBLite | 24 | 39 | 16 | - | – | |
| PANTHER | 64 | 965 | 902 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 64 | 965 | 902 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 118 | 134 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 118 | 144 | 27 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 145 | 216 | 72 | 11.294 | ||
| SMART | 147 | 216 | 70 | 7.6 | ||
| Gene3D | 159 | 317 | 159 | 7.3E-48 | – | |
| SUPERFAMILY | 166 | 258 | 93 | 8.03E-24 | ||
| Pfam | 166 | 262 | 97 | 4.5E-20 | ||
| CDD | 172 | 261 | 90 | 1.53493E-8 | ||
| TIGRFAM | 172 | 265 | 94 | 1.0E-11 | ||
| ProSiteProfiles | 219 | 273 | 55 | 12.607 | ||
| SMART | 222 | 264 | 43 | 1.8E-6 | ||
| MobiDBLite | 287 | 378 | 92 | - | – | |
| MobiDBLite | 309 | 324 | 16 | - | – | |
| MobiDBLite | 348 | 368 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 417 | 581 | 165 | 5.7E-48 | – | |
| ProSiteProfiles | 428 | 501 | 74 | 11.359 | ||
| SMART | 430 | 499 | 70 | 0.075 | ||
| CDD | 443 | 543 | 101 | 1.7465E-12 | ||
| SUPERFAMILY | 444 | 543 | 100 | 3.21E-25 | ||
| Pfam | 451 | 543 | 93 | 2.0E-21 | ||
| TIGRFAM | 453 | 543 | 91 | 3.2E-11 | ||
| ProSiteProfiles | 502 | 556 | 55 | 11.571 | ||
| SMART | 505 | 547 | 43 | 2.9E-8 | ||
| SUPERFAMILY | 611 | 941 | 331 | 2.73E-82 | ||
| CDD | 627 | 939 | 313 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 628 | 947 | 320 | 4.5E-98 | – | |
| SMART | 629 | 920 | 292 | 6.5E-95 | ||
| ProSiteProfiles | 629 | 920 | 292 | 46.223 | ||
| Pfam | 631 | 920 | 290 | 5.6E-65 | ||
| ProSitePatterns | 635 | 658 | 24 | - | ||
| Gene3D | 713 | 944 | 232 | 4.5E-98 | – | |
| ProSitePatterns | 750 | 762 | 13 | - | ||
| MobiDBLite | 942 | 965 | 24 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0276600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…