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LotjaGi3g1v0276600.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0276600
Transcript ID LotjaGi3g1v0276600.3
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Kinase family protein; TAIR: AT3G45780.1 phototropin 1; Swiss-Prot: sp|O48963|PHOT1_ARATH Phototropin-1; TrEMBL-Plants: tr|A0A126X246|A0A126X246_LUPAN Putative LOV domain-containing protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0276600
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:54922270..54940770) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TAGACAAACATCAAGCCTTTATTTCCATCCAATTTTATATAAAAACTATACTCACTCAATATTGATGAAAATTTGTGATT GCAGTCACACATCAACCAGCCTGGTCTCACGTGTCTACTTTCATAACCGATCTTTTATTTTTGAGGGGTGGGGGTTGCAC GCTCTAGTTTTGATCCAGCAAGATATTACATGATCTAATTTGTCAGGTATTACAAGATATTATTTTCATATGAACTTGTC TTTTTTTTTGTTTTGTTTTTCACTTGCCCAAAATAATTCCACTAAACACAGAGACACAAAAGTCGTTCCCTCCAAACAAA CCGGTCGGTAGAACATGCAGAAACCAATGTGCTGATGAGTAACTGATACAATCCCTACGCATTGATTCTCTGTTTTTGTT GCTTTTTCCTTCTTGACAACTCACTCCACTATCTTACTCAGACCAGAAATCATTACAATTTGAAGGTAAAAGTGCCACTA TTTGTTGGTTCCTGAATCTGAATGTTACCTCTTGATTTGATGTCTTAATGATTCAGGGCTTAAGAGCAAAAGAGGGTTAT AACAATGGGTACAGGAGCCATGTGAACAACAGAGCACAGTGATTGGTGCCAACCCCTTTTTGACAATGATTCAGATTCTC CTTTTTATCTCCCCCTTCCACTTTTCCTCTTGCCATTTCTAGAAATTCAACTTTTGATCATTTTATCAAGTAGTGTGTGT GCAGCTGCTTTCTGAAGAAGAATAAGCACAACTTCACAACACAACCTCATCATCATCATCATCAATTTTTCTAACTCAGC TTGAGGTATGTTCTAGTACTATAGTACTTCCCAGCACTATAAAAATAAAATTAACAATAAATCAAAAGGTTACCTGCTGA AAAGTTTTTACTCTAAGACAGATCCTCCTTCAGCATGCATGTTCCATCAATTTTTGTACTAATAATTTGCTTGCTACTTG 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CACATGATCACGAATTCTTTGGGGTTCTTTTTTTTTTGAGAGAATAATGGAATTTCAATTTCCTGCTTGAGTTGTGTACA GTTTCAACATGTTCATTGTAATAATATATGAATGGAGATCTCCCACAATTTTTGCTAGTGTGTGGTGCTTTAGTTGCCTG GAGTAAGAGATTAGGGGTGTCGTCATTGTGCACTTCAACAGCTATTCAACCACAGCGTCTATGTGTGCAAATTCTTGTAT ATTTTTAATATAATTTTTTGA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0276600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAGCAGCAGTTGAAGAAATCATCACTGAGAACATCATTCCCTCGTGACCCTCGTGGGTCCCTCGAAGTGTTCAACCC AACCGCAAGCAACTCCGCCTCACCGGCGCGCGCTCAGCCGCTCTGGAAAACGTGGAGCGGCGCGGAGGAGGAGGAGCCGC GTGAAATTTCCTCCGATGAGGTATCGTGGATGGCGCTAGAGGGCGAGGAGCGCGGCGTGGCGGCGGAGAGAGCCGCCGAG TGGGGGTTGGTGCTGAGGACGGATACCGAGACCGGGAAGGCGCACGGGGTGGCTGTGAGGAATTCCGGCGGGGATGAGCC TGGTGCGGGCGCCAAAGTTGCGGCGGTTTCTTGTTCTTCTAATAGGAGGAGCTCTAACAACTCCGGTAGAGACTCCGGCG AATCCTCCGACGGCGGCGGGGGGATTCCGAGGATTTCGAAGGATTTGAAGGACGCTTTGTCGACGTTTCAACAGACGTTT GTGGTTTCGGATGCTACGAAACCCGATTACCCGATCATGTATGCGAGTGTCGGGTTCTTCAAGATGACGGGTTATACGTC CAAGGAAGTCATAGGCCGGAACTGTCGGTTTTTGCAGGGTGCAGATACGGATCCGGAGGAAGTTTCAAAGATAAGGGAAG CGTTAGAAGCGGGGAAAAGTTACTGCGGAAGGTTACTGAATTACAAAAAGGACGGCTCACCTTTCTGGAACCTTCTCACC GTTTCACCCATCAAAGACGACGATGGCAAAGTGCTCAAATTCATCGGAATGCAAGTGGAGGTTAGCAAGCATACAGAAGG ATCCAAGGAGAAGATGCTGCGGCCCAATGGATTGCCCGAATCATTAATCCGATATGACGCTCGTCAGAAAGAGAAGGCTG AAACTTCAGCATCTGAGTTGGTACAAGCTGTGAAGCGCCCCCGAGCACTCAGTGAATCAGAAAACCGTCCCTCCATCAGA AAATCAGAGAGTGCTGAAGATGAAGAAGAAGAGGAAGAAAAACCAGAAAAAACTTCAAGGAGAAAATCTGAGAGTGTGGC TTCATTTAGACAGAAACCACAAGTAAGAAATAGAAATTCAATGCAGCGAATCAGTGAGGTGCCTGAAAACAAACAGAAAA ACAACCATCGCCATTCTTTCATGGGGTTCATTAAGAAAAGTCCTCCCAAAGATGAAAGCATAGCTAATGAAGTTATTGAG GTTGTCATCTCTGACAGTGAGGATGATGAGAGGCCTGATAGCTTCGAATTCGATGAAAAAGAAAAGCTCAGGGAAAAGAG GAAAGGTCTTGATCTTGCTACCACACTTGAGCGTATTGAGAAAAACTTTGTCATTACTGATCCAAGGCTTCCTGATAATC CTATAATCTTTGCATCTGATAGCTTCTTAGAGCTTACAGAATACAGTCGTGAAGAAATATTGGGAAGAAATTGCAGGTTT CTGCAAGGACCTGAAACTGATCCAGAAACTGTGAGAAAAATTAGAAAGGCCATTGACAACCAAACAGAAGTCACCGTGCA ACTCATTAATTATACTAAGAGTGGCAAAAAGTTCTGGAACCTGTTTCATTTGCAACCTATGCGTGATCAGAAGGGAGAAG TGCAATATTTTATTGGTGTTCAACTTGATGGTAGTCAACACATAGAACCTCTTCACAACTGCATCGCAGTAGATAATGCA AAGGAGGGAGAACAATTGGTTAAACAAACCGCAGAATATGTTGATGAGGCAGCGAGAGAACTTCCGGATGCTAATCTGAA ACCAGACGAGTTATGGATGAATCATTCAAAAGTGGTTCGCCCCAAACCGCATAGGAAGGAAGATGCAACTTGGAAAGCTA TTCAAAAGATCCTAGAAAGTGGGGAACAGATAGGCCTAAAGCACTTCAGGCCAATCAAACCCCTGGGGTCGGGGGATACT GGCAGTGTGCATCTGGTGGAGCTAAGTGGAACTGGTCAATATTTTGCCATGAAGGCTATGGATAAGAGTGTTATGCTCAA TCGTAACAAGGTGCATAGAGCTTGCACAGAGAGAGAAATCCTTGACATGTTGGACCACCCTTTTCTGCCTGCATTATATG CGTCCTTTCAGACCAAAACACATGTTTGTTTGATAACCGATTACTGTCCTGGTGGAGAGTTATTCCTGCTTCTTGACCGG CAGCCAACAAAGGTTCTCAAGGAAGACGCTGTGAGATTTTATGCTGCTGAGGTACTGATTGCATTGGAGTACCTTCATTG TCAAGGGATAATATATCGAGATTTGAAGCCAGAAAATGTGTTAATCCAGAGCAATGGGCATTTGTCTCTAACAGATTTTG ATTTGTCATGTTTAACATCTTGCAAGCCACAGCTTGTAATTCCAGCTTCAAATGAAAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAACAA CAGAAAAGTCAGCAGGTTCCAATGTTTATGGCTGAACCAATGAGAGCATCAAATTCTTTTGTTGGCACGGAAGAGTACAT AGCTCCGGAAATTATAACTGGTTCAGGCCATTCTAGTGCTGTAGATTGGTGGGCTCTAGGTATTCTTCTATATGAAATGC TTTATGGGTATACACCATTCAGGGGAAAGACAAGACAAAAAACATTTGCAAATATTCTTCACAAAGATCTTAAATTTCCC AAAAGCAAACCGGTAAGTCTCCATGCAAAGCAGCTAATTTACCGGTTGTTGCATAGAGATCCCAAAAACAGATTGGGTTC ACAAGAGGGAGCAAATGAAATTAAGCGGCATCCATTCTTCCGGGGTGTCGATTGGGCACTAATTCGTTGCATGAAACCTC CAGAGCTTGATGCTCCTCTCTTACAAGAAACTGAAGAAGACAAAGAAGCCAAAGATGTAGACCCCAGGCTAGAAGATTTA CAGGAAAACTTTTTCTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0276600.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MEQQLKKSSLRTSFPRDPRGSLEVFNPTASNSASPARAQPLWKTWSGAEEEEPREISSDEVSWMALEGEERGVAAERAAE WGLVLRTDTETGKAHGVAVRNSGGDEPGAGAKVAAVSCSSNRRSSNNSGRDSGESSDGGGGIPRISKDLKDALSTFQQTF VVSDATKPDYPIMYASVGFFKMTGYTSKEVIGRNCRFLQGADTDPEEVSKIREALEAGKSYCGRLLNYKKDGSPFWNLLT VSPIKDDDGKVLKFIGMQVEVSKHTEGSKEKMLRPNGLPESLIRYDARQKEKAETSASELVQAVKRPRALSESENRPSIR KSESAEDEEEEEEKPEKTSRRKSESVASFRQKPQVRNRNSMQRISEVPENKQKNNHRHSFMGFIKKSPPKDESIANEVIE VVISDSEDDERPDSFEFDEKEKLREKRKGLDLATTLERIEKNFVITDPRLPDNPIIFASDSFLELTEYSREEILGRNCRF LQGPETDPETVRKIRKAIDNQTEVTVQLINYTKSGKKFWNLFHLQPMRDQKGEVQYFIGVQLDGSQHIEPLHNCIAVDNA KEGEQLVKQTAEYVDEAARELPDANLKPDELWMNHSKVVRPKPHRKEDATWKAIQKILESGEQIGLKHFRPIKPLGSGDT GSVHLVELSGTGQYFAMKAMDKSVMLNRNKVHRACTEREILDMLDHPFLPALYASFQTKTHVCLITDYCPGGELFLLLDR QPTKVLKEDAVRFYAAEVLIALEYLHCQGIIYRDLKPENVLIQSNGHLSLTDFDLSCLTSCKPQLVIPASNEKRKKKKKQ QKSQQVPMFMAEPMRASNSFVGTEEYIAPEIITGSGHSSAVDWWALGILLYEMLYGYTPFRGKTRQKTFANILHKDLKFP KSKPVSLHAKQLIYRLLHRDPKNRLGSQEGANEIKRHPFFRGVDWALIRCMKPPELDAPLLQETEEDKEAKDVDPRLEDL QENFF 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 15 15 -
MobiDBLite 1 59 59 -
MobiDBLite 24 39 16 -
PANTHER 64 965 902 0.0
PANTHER 64 965 902 0.0
MobiDBLite 118 134 17 -
MobiDBLite 118 144 27 -
ProSiteProfiles 145 216 72 11.294
SMART 147 216 70 7.6
Gene3D 159 317 159 7.3E-48
SUPERFAMILY 166 258 93 8.03E-24
Pfam 166 262 97 4.5E-20
CDD 172 261 90 1.53493E-8
TIGRFAM 172 265 94 1.0E-11
ProSiteProfiles 219 273 55 12.607
SMART 222 264 43 1.8E-6
MobiDBLite 287 378 92 -
MobiDBLite 309 324 16 -
MobiDBLite 348 368 21 -
Gene3D 417 581 165 5.7E-48
ProSiteProfiles 428 501 74 11.359
SMART 430 499 70 0.075
CDD 443 543 101 1.7465E-12
SUPERFAMILY 444 543 100 3.21E-25
Pfam 451 543 93 2.0E-21
TIGRFAM 453 543 91 3.2E-11
ProSiteProfiles 502 556 55 11.571
SMART 505 547 43 2.9E-8
SUPERFAMILY 611 941 331 2.73E-82
CDD 627 939 313 0.0
Gene3D 628 947 320 4.5E-98
SMART 629 920 292 6.5E-95
ProSiteProfiles 629 920 292 46.223
Pfam 631 920 290 5.6E-65
ProSitePatterns 635 658 24 -
Gene3D 713 944 232 4.5E-98
ProSitePatterns 750 762 13 -
MobiDBLite 942 965 24 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein kinase activity Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Protein phosphorylation The process of introducing a phosphate group on to a protein.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0276600.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…