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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0430900 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0430900.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | BEACH domain-containing protein; TAIR: AT2G45540.1 WD-40 repeat family protein / beige-like protein; Swiss-Prot: sp|F4IG73|BCHC2_ARATH BEACH domain-containing protein C2; TrEMBL-Plants: tr|G7LDJ7|G7LDJ7_MEDTR WD-40 repeat protein/beige protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0430900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:84237060..84270660) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAGCTTATCAAATTTTGACATTTGACTGAGCAATGCCACTCAACCCTCTCTCTCGCGCCAAATTCGCCTTCTCTTCCTC TCTCTCACACACTCACACACTCTCATTCCATTTCCATTCCATCTTCGATCCAAATTCCGAACGTCACTCTGATCTCGACC AAGGTACCATCGATTTCATCCATTCTTCTCTCCTCGTGTTCCCCGTCTCTGAATCAATGTCGATTTCTTCACGATCATGC GTCTTTTTTTGATTCTTTTTTTCTTGAGCTCAATGCTTGAAATGTGATCGCGTTTGATGCATTGAAAGCATCTCTGTTGC ATTATAGGCCATTCCATATCTGGAAGATTTTGTGAGTTTTTTTTTTTGATTTGTGCATGTCACCATTTCTTTCCACTGCA TCCTATGTTGTAAAATGAAGCATGTTTAAATCAAAACTTTTCAGCGGTTATGTTGGAGAATTTTGACAAATTTGTAGTAA TGTTGGTTGTTAGTTGTTACTTGTAGTTGTTGTTTGGTGTTTTCACGGTTAATGTAGTTAGTTCCCTCGCGATGTTTTCA ATCTTTCAGCTCGAAACCGTATTGAAAATTGAAATTGTTAAATATTCTGGTTCCTGGATATCTGGTTATTATTTTTAAAA TTTGTTGGGAAATGATAAAGGTTTTACTTGCAGGTGGATTGGGGTTTTCATTATATACTGATGAACATTTTGTAGCTTAT CTTGATATCGTATAATGGAAGAAGAGGAAAAACCGAAAGAGATGAAAGTAACTGGTCATGAATTAGATAGTGGTGAAGTG GTAGATAGTAATGTGAAACAATTTGCTGAGAGTCTTCGGGAGGAGAATGTTAATGCTGGCAGTGGCATTGGGGATGAACA GGCAGATGAAAGGGTACACTTTCAAGGACATGGGGTTGATTCAGTAACCACGGGTATGGTTGGGAACCAGTTTGAGCATG 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0430900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGAAGAGGAAAAACCGAAAGAGATGAAAGTAACTGGTCATGAATTAGATAGTGGTGAAGTGGTAGATAGTAATGT GAAACAATTTGCTGAGAGTCTTCGGGAGGAGAATGTTAATGCTGGCAGTGGCATTGGGGATGAACAGGCAGATGAAAGGG TACACTTTCAAGGACATGGGGTTGATTCAGTAACCACGGGTATGGTTGGGAACCAGTTTGAGCATGTATCTTTGAAAGGA CAAGAGACGAATAATGAATATGTGGGTTCAAATCCATCCGAAGGTTTAGATAATTTACAGCATGCATTGAGTGAAAATGA GGAGCATTTTCAATGTTCATCTGGGATGTACTCGCCAGAGTGTGCTTCTTCCCCAGTGGCTGTCATGCAGCATGGACATT CTCCTGTTAGTTCTCCACAAAAACCTAGGCAAAAAAGTTCTATGCTAAATGTGTCTGCAGAATTACTACATTTAGTGGAC TCTGCTATCATGGGGAAACCTGAAGGTATGGAGAAACTGAAGAATATTGCAAGCGGGGTAGCAAATTTTGGGAGCGGTGA AGAAATGGAGAGTGCATCCTTTTTAATAGTAGATTCACTTCTTGCAACAATGGGTGGTGTTGAAAGTTTTGACGAGGATG GTGATAATAATCCTCCTAGTGTAATGCTGAACTCCCGAGCAGCCATTGTGGCTGGTGAACTTATTCCTTGGCTTCCTTAT ACAGGTGATTCTGATGTTGTCATGTCACCTAGGACACGAATGGTAAGGGGACTTCTTGCCATATTACGGGCTTGCACTAG AAACAGGGCAATGTGCTCTATGGCCGGTTTGTTAGGAGTACTGTTGAGAACAGCAGAGAAAATTTTCACTGTCGATGTTG GCTTAAATGGGCAAATAAGGTGGGATGGAACTCCATTGTGCCGCTGCATACAACACTTGGCTGGGCATTCTCTTAGTGTC AGTGATCTTCATAGATGGTTTCAAGTCATTACAAAAACGCTCACCACAATTTGGGCTCCGCGCTTACTGGTTGCAATGGA GAAAGCTATGAGTGAAAAGGAATCAATGGGACCAGCTTGCACTTTTGAGTTTGATGGTGAAAGTTCTGGTTTGCTCGGTC CAGGTGAGAGTCGCTGGCCATTTATCAATGGGTATGCATTTGCAACATGGATCTACATCGAATCATTTGCTGATGCAGTA AATACAGCTACAGTTGCTGCTGCAATTGCTGCAGCTGCATCAGCTAAGTCAGGTAAATCATCAGCTATGTCAGCTGCAGC AGCAGCTAGTGCACTTGCTGGTGAAGGTACAGCACACATGCCACGGTTATTCAGTTTTTTATCTGCTGATAATCTGGGTA TAGAGGCTTATTTTCACGCTCAATTTTTGGTTGTTGAAATTGGTACTGGAAAGGGAAAGAGATCTGCATTGCATTTTACT TATCCATTCAAACCTCAATGCTGGTACTTTATTGGTCTTGAACATATAGGCCAGCATGGAATTATTGGGAAAGCAGAAAG TGAAGTTAGGTTGTATGTAGATGGTTCTTTATATGAAAGTCATCCTTTTGAGTTCCCAAAAATTTCCAAACCCATTGCAT TTTGCTGCATAGGAACTAACCCTCCTCCTACTATGGCTGGTTTGCAACGCCGTCGTCGTCAATGCCCTTTGTTTGCTGAG ATGGGACCTGTTTACATCTTCAAGGAACCAATTGGCCTAGAAAGGATGACACGCTTGGCTTCTAGAGGAGGGGATATAGT GCCTTCTTTTGGTAATGCAGCAGGGCTACCATGGCTTGCAACAAATGCCCATGTGCAGAGAAAGGCAGAGGAAAGTGTTC TTTTAGATGCCGAAATTGGAGGTTTCATTCACCTACTCTATCATCCTAGTTTACTTAGTGGGCGTTTCTGTCCAGATGCT TCTCCTACTGGTGCTGCAGGAATCCTTCGACGTCCAGCTGAGGTTCTTGGGCAAGTCCATGTTGCCACACGAATGCGACC CGTGGATGCTTTGTGGGCATTGGCTTATGGAAGTCCATTGTCTATGCTTCCTTTAGCAATAAGCAATGTACACGAGAAAA CTCTAGAACCACAGCAAGGGAATTTTTCTGTGTCTGTAGCGACTACATCTCTTGCTAGTCCAATATTTCGAATTATATCC ACAGCTATTCAACATCCAAAGAACAATGAGGAGTTTGCTCGTGGTAAGGGGCCTGAAGTTCTTTCAAAGATTTTAAATTA TCTTCTCCAAACCCTGTCATCACTTGGTGTTGGAAAGCATGATGGTGTCAGAGATGAGGAACTTGTTTCAGCAGTTGTCT CACTTTGTCAATCTCAGAAGATGAACCATATGCTTAAAGTGCAGCTCTTCACTACACTGCTCCTGGATTTAAATATCTGG AGTTTATGTAGTTATGGAATACAAAAGAAGCTTCTATCTTCACTTGCTGATATGGTTTTCACCGAGTCTGCAGTGATGCG AGATGCCAATGCCATTCAGATGCTTCTTGATGGTTGTAGACGGTGCTATTGGACTGTTCCTGAAAAGGATTCAGTAAATA CTATTTCTTTAACTGGAGCAGCAAGGCCAGTGGGTGAAGTCAATGCTTTGGTTGACGAGCTCTTAGTGGTAATTGAACTT CTAATAGTGGCTGCATCTCCTTTGTTGGCTTCCGATGATGTCCGATGTTTACTTGGGTTCATAGTTGACTGTCCACAACC TGGTCAGATTGCTAGGGTGTTGCATCTCTTCTACAGGCTTGTTGTACAGCCAAATACATCTAGAGCTCAGACATTTGCAG AAGCATTCTTAGCATGTGGCGGGATAGAAACTCTTCTTGTCCTGCTCCAGAGGGAGGCTAAAGCTGGAGATAGTGCTGTC CCGGAATCAATGTCAAAGTGTCCTGAACTTCAAAAGAATGAAACAGATGGCAGCAGTCAAATCACAGAACCATGTCAGGA TGATGAAGGATCAGATGAGAAAAGTGAAGCCATCTTACAAGACAGTGATCAAGGTTCTCAATCTGTTGATAGTGGCAGTG ACCTTGATCCTTATTCTCCTGATGTGAATATTGGAGGGATGGCATTTACATCTGAAACTCCATCTTTCGAGAATTTGGGA GGCATAAGTCTATCCATCAGTGCCGACAGTGCCAGAAAAAATGTTTATAATGTGGATAAAAGTGATAGCATTGTTGTTGG GATCATAAGTCTATTGGGGGCATTGGTAGCTTTTGGGCATCTGAGGTTTGGTTCTCGTGCTGGTCCTGATACAACAAGTA ACCTTTTGGGGGTTGGATTGCATGATGGAGGGGGTACAATGTTTGATGATAAGGTTTCTCTTCTTCTTTATGCCTTTCAG AAGGCTTTCCAAGCTGCACCCAACAGGCTAATGACTAACAATGTTTATACAGCGTTATTGACTGCCTCGATCAATGCTTG TTCAACAGAGGATGGGCTGAACTTCTATAATTCTGGTCATCGCCTTGAGCACTTGCAACTTCTATTGGTGCTTTTGCATT CGCTTCCATTTGCGCCCAAGTCCCTGCAGAGAAGAGCACTACAGGATCTTCTATTTTTAGCTTGCAGTCGCACAGAAAAT AGAAGCAGTCTGAAAAATATGGAGGAATGGCCTGAATGGATTATAGAGGTCTTGATCTCAAACCATGAGTTGGGTCCAAG CAAATCACCCGACTCAACAAGCCTTGGAGACATAGAGGACCTCATACATAACTTCCTTATCATCATGCTACAATATTCAA TGCGACAAAAGGATGGATGGAAGGATATTGAAGCCACAATTCATTGTGCAGAATGGCTTTCTATTGTGGGTGGTTCTAGC ACAGGAGAACAACGAACTAGACGTGAAGAATCATTACCGATATTTAAGAGAAGACTCTTAGGAGGCTTGCTGGACTTTGC TGCTAGAGAATTGCACGTCCAGAAACAAATTATTGCTGCGGCAGCTGCTGGTGTTGCAGCTGGGGGTTTGTCTCCAAGCG ATGCTAAGGCAGAGTCTGAGAGTGCCGCTCACCTATCTGTGGCTTTAGTAGAGAATGCTGTTGTGATACTTATGCTTGTT GAGGATCATTTAAGGTTACAGAGCAAACGAGCTTCTTCTTTGCGTGCTACAGATAGCTCTCCATCTCCCCTTTCTCTCTT ATATCCAATGCCTAATAACTCAACATCATCATCAACAATTGGTGGATCAGCAGAAGTTATGGGTGATTGCACATCATCAT CTAGCAACTCCGGGGGAGTCTCTCTAGATGTCCTTTCTTCAATGGCTGATGCCAATGGTCGGATTTCGGCTTCAGTTATG GAAAGGCTTGCTGCAGCAGCTGCAGCTGAGCCGTATGAATCTGTTTCTTGTGCTTATGTATCATATGGGTCCTGTGCTAA GGATTTAGCTATTGGGTGGAAATATAGGAGTCGGTTGTGGTATGGTGTTGGCCTTCCTTCAAATACAGCTTCATTTGGTG GTGGTGGGAGTGGATGGGATTTTTGGAAATCTTCTTTGGAGAAAGATGCTAGTGGCAACTGGCTTGAACTTCCTTTGGTG AAGAAGTCTGTGGCAATGCTCCAAACATTGTTGCTAGATGATTCTGGGCTTGGTGGTGGTCTAGGTATAGGTGGAGGGTC TGGTACAGGAATGGGAGCGATGACTGCATTATACAATTTATTAGACAGTGACCAGCCATTCTTGTGCATGCTTCGGATGG TTCTTCTATCAATGAGGGAAGATGATGATGGGGAAGAACCTATACCGATGAGGACTATAAGTATGGAGGATGCAATATCT GAAGGAAGGAAATCATGCTCAGCACTTCTGTGGAGTGTTCTCTCACCCGTTCTCAACATGCCAGTTTCTGATTCTAAAAG ACAAAGAGTCTTGGTAGCATCTTGCGTGCTGTATTCCGAGGTATACCATGCTATTAGCATAGACCAAAAGCCTCTTCGTA GAAAGTACCTTGAGGCTATTTTACCTCCATTTGTTGCTGTCTTAAGAAGGTGGCGACCTGTTTTGGCTGGAATTCATGAA CTTGCAACTGCCGATGGTTTAAATCCACTTATTGTGGATGATCGTATAGTGGCTGCTGATGCCCTGCCAGTTGAGGCTGC TCTTGCTATGATATCTCCTGCTTGGGCTGCTGCTTTTGCATCACCTCCTGCTGCAATGGCATTGGCGATGATTGCAGCTG GGACTTCTGGTGGTGAAAGTCATGCTCCTTCAACAAGTTCAACAAGTTCCCAGCTTAGGCGTGATACCTCGTTGACAGAA CGCAAACAGGCTAAGCTTTATACCTTTTCAAGCTTTCAGAAACCTTTAGAAGCTCCTAACAAAACACCACCCCTACCCAA GAGCAAAGCTGCTGCAAAAGCAGCTGCGCTAGCAGCTTCTCGTGATCGTCAACGATTTTCAAGGGTTGGTTCTGGAAGAG GTCTTAGTGCTGTTGCAATGGCTACATCTGCACAGCGTAGGAGTGCTAGTGATATGGAGCGAGCAATGCGATGGAATATT ACTGAAGCAATGGGAGTTGCCTGGATGGAATGTTTGCATCCAGTTGATACAAAGTCAGTATATGGGAAAGATTTTAATGC TTTGTCGTATAAATTTATTGCTGTTCTTGTTGCCAGTTTTGCCGTAGCAAGGAATATCCAACGGTCTGAGATTGACAGGC GTGCTCATGTAGATAAAATAGCTCGACATCGAATCAGTACTGGACTTCGTGCATGGCGTAAACTTATACGTCAGTTAATC GAGATGAGAAGTCTATTTGGGCCCTTTGCAGAGAATTTCTATAGCCCACCTCTTGTTTTCTGGAAGCTAGATTTTATGGA AAGTTCTTCTCGGATGAGAAGATGCATGAAGAGGAATTACCAAGGGTCTGATCATTTAGGTGCTGCAGCTAATTATGAAG AATTTTCAGGGGAGAATAAGAATAATGATCAGAGTGCTCCAATTTTGTCGGCAGAAGCGATCTCAATAGAGGGTGTAAAT GAAGGTGAACAGATGGAAACAGAGAGTTTGGATGCTAAGGTCAATGACATTAAAGATAAAGAAGAAAATCAGCCTAGATT TTCTGAAGCAGCTGAGCAAAGTGTACAAGCATCTTCAGAATCTTTAGATACTCAACATGAGAATGGTGAAGGTGTTCTTC AGAGTTCTTCAGCCTTTGCACCTGGGTATGTTCCAAATGAGCTTGATGACAGAATTGTTCTCGAGCTACCATCATCAATA GTGCAACCACTTAGGGTTGTACAGGGAACTTTCCAAGTTACCAGAAGAAGGATAAATTTTCTAGTTGATAACGGTGAGGC CAGCACTACAGGGGATGGTTTGGATTCGGGTTCTGTAGAAGGTGACCAAGAAAAGAATCGCAGCTGGTTGATGTCATCAC TTCATCAAGTTTATAGCCGGAGATATCTACTTAGAAGAAGTGCACTGGAGCTATTTATGGTGGACCGTTCAAACTTCTTC TTTGACTTTGGGAGTAGTGAGGGGCGAAGAAATGCATATCAAGCAATTGTTCGCGCACGACCTCCTCATTTAAACAATAT ATATTTGGCAACACAGAGGCCTGAACAACTTTTGAAAAGAATTCAGCTTATGGAGCGCTGGGCTAGGTGGGAGATCAGTA ATTTTGAGTATCTAATGCAACTCAATACACTAGCTGGGCGTAGTTATAATGATATAACGCAGTATCCTGTTTTCCCCTGG ATTCTTTCTGATTACAGTTCAGAGAGTTTGGATCTTTCAAGTCCTTCTTCTTATCGAGATCTTTCAAAGCCTGTTGGTGC ACTGAACCCAGATCGTCTGAAAAAATTTCAAGAGAGATATGCTAGCTTTGATGATCCAGTTATCCCCAAATTCCATTATG GATCACACTACTCAAGTGCAGGAACAGTCTTATATTACCTTGTTAGAGTTGAACCTTTCACCACCCTTGCAATCAAATTA CAAGGCGGAAAATTTGATCATGCAGATCGGATGTTTTCTGATATTTCTGGTACTTGGGATGGAGTTCTTAAGGATATGAG TGATGTAAAGGAATTGGTTCCTGAGCTATTTTACCTCCCCGAGGTCCTCACAAATGAAAATTCAATTGATTTTGGTACAA CGCAGTTGGGAGGAAAGCTTGATACTGTAAGACTTCCAGCTTGGGCTGAGAATCCAGTTGATTTTGTGCATAAGCATAGG ATGGCTCTGGAGAGTGAGTATGTATCTGCTCATTTACATGAATGGATTGACCTCATATTTGGGTATAAACAACGGGGCAA AGAGGCTATTGCAGCAAATAATGTTTTCTTTCATGTTACCTATGAAGGGACAGTGGATATTGATAAAATATTAGACCCAG TGCAACAACGTGCCACACAAGATCAAATTGCTTATTTTGGACAAACACCGTCCCAACTTTTGAGGGTTCCTCACTTGAAG AAGATGCCGTTAGCAGAAGCTCTGCATTTGCAGACAATATTCCGCAATCCAAAGGAAGTCAAACCGTATGCTGTTCCATC CTCGGAATACTGCAATCTACCTGCGGCTGCCATTCACGCATCTTCAGATATGGTTGTGGTTGTTGACTGCAATGCACCAG CAGCTCATGTTGCCCGACACAAATGGCAACCCAATACACCTGATGGCCAGGGTAGTCCATTCCTTTTTCAAAATGGAAAA GCTATATCTGACTCTGCTAGTGGGACAATTGTACGTATGTTCAAAGGACCTACTGGGACTGGTGAACAGTGGCAGTTTCC CCAAGCATTGGCATTTGGTGTTTCTGGAATTAGAAGTCAAGCTATTGTTTCTGTGACCTGTGACAAGGAAATTATTACAG GTGGGCATGCTGATAATAGTGTTAGGGTGATATCCTCTGATGGAGCTAAAACCTTGGAAACAGCCTATGCACACTGTGCA CCTGTAACTTGCCTTAGTCTTTCATCCGATAGTTACTATCTAGTCACAGGATCTCGAGATACAACAATATTACTCTGGAG AATACATAGTGTACTTGCATCAAGCTCAAGTATGATATCAGAATCTTCCACTGGTACTGGCACTCGGCCATCAACTAACA ATAGTTCTTCATCACACTTGTTGCTAGAAAAGAATCGGAGACGTCGTATTGAGGGTCCTATACAGGTACTTCGGGGGCAC CACAGTGAAATACTCAGTTGTTGTGTCAGCTCAGATCTTGGAGTAGTTGTTTCATGCTCCCAAACAACAGATGTTCTCTT GCACTCTATAAGAAGAGGACGTTTACTGCGAAGGCTGGATGGTGTGGTGGCTCATACTGTCTGCCTTTCCTCTGAAGGGC TTGTCATTACTTGGAACGAATTGCAGCATACTCTCAGTACCTTTACTCTTAATGGGGTTCTGACTGCTACAACAGAATTG TCTTTCTCTAGCAGCATTAGTTGCATGGAAGTTTCTGTTGATGGGAAAAATGCGTTGATTGGAATTAATTCTCTAGAAAA TGGTAGAGCCCGTAATAATGATTTGAATTTGCAGTCAAGTAAACCAGGTATTGTTGATTTTAATTCAGAATCAGAAAAAA CTCACGAAGGCTACAGAATTGATGCTCCAACACCATCAATTTGCTTCCTGGATCTGCACACTCTGGAGGTATTTCATGTG TTAAAGCTGGAAGAAGGACAGGATATCACAACTCTTGCTCTAAATAAGGATAACACAAATCTTTTGGTGTCAACTATGGA TAAACAATTGATTATCTTTACTGATCCAGCTTTAAGCTTGAAAGTGGTCGATAAAATGCTCAAGCTTGGTTGGGAAGGTG ATGGGCTTACGAACCTCATAAAATCATAG
Protein sequence (LotjaGi3g1v0430900.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEEEEKPKEMKVTGHELDSGEVVDSNVKQFAESLREENVNAGSGIGDEQADERVHFQGHGVDSVTTGMVGNQFEHVSLKG QETNNEYVGSNPSEGLDNLQHALSENEEHFQCSSGMYSPECASSPVAVMQHGHSPVSSPQKPRQKSSMLNVSAELLHLVD SAIMGKPEGMEKLKNIASGVANFGSGEEMESASFLIVDSLLATMGGVESFDEDGDNNPPSVMLNSRAAIVAGELIPWLPY TGDSDVVMSPRTRMVRGLLAILRACTRNRAMCSMAGLLGVLLRTAEKIFTVDVGLNGQIRWDGTPLCRCIQHLAGHSLSV SDLHRWFQVITKTLTTIWAPRLLVAMEKAMSEKESMGPACTFEFDGESSGLLGPGESRWPFINGYAFATWIYIESFADAV NTATVAAAIAAAASAKSGKSSAMSAAAAASALAGEGTAHMPRLFSFLSADNLGIEAYFHAQFLVVEIGTGKGKRSALHFT YPFKPQCWYFIGLEHIGQHGIIGKAESEVRLYVDGSLYESHPFEFPKISKPIAFCCIGTNPPPTMAGLQRRRRQCPLFAE MGPVYIFKEPIGLERMTRLASRGGDIVPSFGNAAGLPWLATNAHVQRKAEESVLLDAEIGGFIHLLYHPSLLSGRFCPDA SPTGAAGILRRPAEVLGQVHVATRMRPVDALWALAYGSPLSMLPLAISNVHEKTLEPQQGNFSVSVATTSLASPIFRIIS TAIQHPKNNEEFARGKGPEVLSKILNYLLQTLSSLGVGKHDGVRDEELVSAVVSLCQSQKMNHMLKVQLFTTLLLDLNIW SLCSYGIQKKLLSSLADMVFTESAVMRDANAIQMLLDGCRRCYWTVPEKDSVNTISLTGAARPVGEVNALVDELLVVIEL LIVAASPLLASDDVRCLLGFIVDCPQPGQIARVLHLFYRLVVQPNTSRAQTFAEAFLACGGIETLLVLLQREAKAGDSAV PESMSKCPELQKNETDGSSQITEPCQDDEGSDEKSEAILQDSDQGSQSVDSGSDLDPYSPDVNIGGMAFTSETPSFENLG GISLSISADSARKNVYNVDKSDSIVVGIISLLGALVAFGHLRFGSRAGPDTTSNLLGVGLHDGGGTMFDDKVSLLLYAFQ KAFQAAPNRLMTNNVYTALLTASINACSTEDGLNFYNSGHRLEHLQLLLVLLHSLPFAPKSLQRRALQDLLFLACSRTEN RSSLKNMEEWPEWIIEVLISNHELGPSKSPDSTSLGDIEDLIHNFLIIMLQYSMRQKDGWKDIEATIHCAEWLSIVGGSS TGEQRTRREESLPIFKRRLLGGLLDFAARELHVQKQIIAAAAAGVAAGGLSPSDAKAESESAAHLSVALVENAVVILMLV EDHLRLQSKRASSLRATDSSPSPLSLLYPMPNNSTSSSTIGGSAEVMGDCTSSSSNSGGVSLDVLSSMADANGRISASVM ERLAAAAAAEPYESVSCAYVSYGSCAKDLAIGWKYRSRLWYGVGLPSNTASFGGGGSGWDFWKSSLEKDASGNWLELPLV KKSVAMLQTLLLDDSGLGGGLGIGGGSGTGMGAMTALYNLLDSDQPFLCMLRMVLLSMREDDDGEEPIPMRTISMEDAIS EGRKSCSALLWSVLSPVLNMPVSDSKRQRVLVASCVLYSEVYHAISIDQKPLRRKYLEAILPPFVAVLRRWRPVLAGIHE LATADGLNPLIVDDRIVAADALPVEAALAMISPAWAAAFASPPAAMALAMIAAGTSGGESHAPSTSSTSSQLRRDTSLTE RKQAKLYTFSSFQKPLEAPNKTPPLPKSKAAAKAAALAASRDRQRFSRVGSGRGLSAVAMATSAQRRSASDMERAMRWNI TEAMGVAWMECLHPVDTKSVYGKDFNALSYKFIAVLVASFAVARNIQRSEIDRRAHVDKIARHRISTGLRAWRKLIRQLI EMRSLFGPFAENFYSPPLVFWKLDFMESSSRMRRCMKRNYQGSDHLGAAANYEEFSGENKNNDQSAPILSAEAISIEGVN EGEQMETESLDAKVNDIKDKEENQPRFSEAAEQSVQASSESLDTQHENGEGVLQSSSAFAPGYVPNELDDRIVLELPSSI VQPLRVVQGTFQVTRRRINFLVDNGEASTTGDGLDSGSVEGDQEKNRSWLMSSLHQVYSRRYLLRRSALELFMVDRSNFF FDFGSSEGRRNAYQAIVRARPPHLNNIYLATQRPEQLLKRIQLMERWARWEISNFEYLMQLNTLAGRSYNDITQYPVFPW ILSDYSSESLDLSSPSSYRDLSKPVGALNPDRLKKFQERYASFDDPVIPKFHYGSHYSSAGTVLYYLVRVEPFTTLAIKL QGGKFDHADRMFSDISGTWDGVLKDMSDVKELVPELFYLPEVLTNENSIDFGTTQLGGKLDTVRLPAWAENPVDFVHKHR MALESEYVSAHLHEWIDLIFGYKQRGKEAIAANNVFFHVTYEGTVDIDKILDPVQQRATQDQIAYFGQTPSQLLRVPHLK KMPLAEALHLQTIFRNPKEVKPYAVPSSEYCNLPAAAIHASSDMVVVVDCNAPAAHVARHKWQPNTPDGQGSPFLFQNGK AISDSASGTIVRMFKGPTGTGEQWQFPQALAFGVSGIRSQAIVSVTCDKEIITGGHADNSVRVISSDGAKTLETAYAHCA PVTCLSLSSDSYYLVTGSRDTTILLWRIHSVLASSSSMISESSTGTGTRPSTNNSSSSHLLLEKNRRRRIEGPIQVLRGH HSEILSCCVSSDLGVVVSCSQTTDVLLHSIRRGRLLRRLDGVVAHTVCLSSEGLVITWNELQHTLSTFTLNGVLTATTEL SFSSSISCMEVSVDGKNALIGINSLENGRARNNDLNLQSSKPGIVDFNSESEKTHEGYRIDAPTPSICFLDLHTLEVFHV LKLEEGQDITTLALNKDNTNLLVSTMDKQLIIFTDPALSLKVVDKMLKLGWEGDGLTNLIKS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 24 | 24 | - | – | |
| Phobius | 1 | 1341 | 1341 | - | – | |
| PANTHER | 62 | 2931 | 2870 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 62 | 2931 | 2870 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 357 | 583 | 227 | 1.08E-5 | ||
| Pfam | 653 | 933 | 281 | 1.5E-45 | ||
| MobiDBLite | 958 | 1017 | 60 | - | – | |
| MobiDBLite | 968 | 985 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 1000 | 1014 | 15 | - | – | |
| Phobius | 1342 | 1360 | 19 | - | – | |
| Phobius | 1361 | 1867 | 507 | - | – | |
| MobiDBLite | 1737 | 1757 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 1738 | 1754 | 17 | - | – | |
| Phobius | 1868 | 1886 | 19 | - | – | |
| Phobius | 1887 | 2942 | 1056 | - | – | |
| MobiDBLite | 2022 | 2058 | 37 | - | – | |
| MobiDBLite | 2028 | 2058 | 31 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 2067 | 2177 | 111 | 33.407 | ||
| CDD | 2070 | 2180 | 111 | 6.52013E-29 | ||
| Gene3D | 2070 | 2176 | 107 | 1.9E-31 | – | |
| SUPERFAMILY | 2070 | 2180 | 111 | 2.4E-20 | – | |
| Pfam | 2079 | 2177 | 99 | 1.5E-26 | ||
| SUPERFAMILY | 2191 | 2481 | 291 | 1.22E-124 | ||
| ProSiteProfiles | 2192 | 2481 | 290 | 117.888 | ||
| Gene3D | 2193 | 2481 | 289 | 2.9E-135 | ||
| SMART | 2204 | 2481 | 278 | 3.8E-197 | ||
| CDD | 2204 | 2481 | 278 | 1.28088E-148 | ||
| Pfam | 2205 | 2480 | 276 | 4.2E-120 | ||
| Gene3D | 2510 | 2686 | 177 | 6.5E-10 | ||
| SUPERFAMILY | 2606 | 2914 | 309 | 4.71E-24 | ||
| ProSiteProfiles | 2608 | 2676 | 69 | 12.025 | ||
| SMART | 2628 | 2667 | 40 | 2.4E-6 | ||
| ProSiteProfiles | 2635 | 2670 | 36 | 12.28 | ||
| Pfam | 2637 | 2666 | 30 | 8.0E-5 | ||
| MobiDBLite | 2679 | 2700 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 2679 | 2702 | 24 | - | – | |
| SMART | 2710 | 2749 | 40 | 0.14 | ||
| SMART | 2874 | 2914 | 41 | 5.3 | ||
| Coils | 2940 | 2942 | 3 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0430900.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…