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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0452500 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0452500.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | RING/U-box superfamily protein; TAIR: AT2G20650.1 RING/U-box superfamily protein; Swiss-Prot: sp|P36096|TUL1_YEAST Transmembrane E3 ubiquitin-protein ligase 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A072UNS6|A0A072UNS6_MEDTR RING/U-box protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0452500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:86591214..86602348) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATAAAAGTGTGTATGAATTATTTGGGCATTTAGTTTTGATGGCGCGTGTAGACACATCCCATAGAGCGCGTACATGATAA CACATCCCTGCTGTAGAAGAAGACCAGAGCCAGACAGCATAAGCATGACTCTTCCACACCACAGTTACAGCCCACCTTCG TCAACCACCGCTCTTCACCCTGAAAAACCCCGAAATAATCTTTCCCTGCGATTATAAAAATACAATCTTTTTCAGTTTTC ATAATTATTATCTGTAATCAGAATCATTTGGTGGAAAAAACCGTGCGGTTGAAGCCAATTTTGTCTTCAAGTCGTTGTGC TTTCACTATCTGATGAAACTCTGTGAATCGTTATTGTGACTCAGCGATTCGCTTGTTTGACTCATTCTGAAGCAACCCTT TTGCTATTTCTGGTGATGGGTCTTGGATTCTTCTGTTGGATTCACTGTGATCAGCTGCTGGAACTGGAAACTGGGTTCTT GAAATTCTTTTGAGGCATGGTGTGTTTGGGGTTTGATATGGTTGAGGTTGAGGCTCAGAGGTTGGAGCTTTTGCTGGTTA AGAGGTGGGAATTGAGGATTTTGTTGAAGGTTGGGTTCGTGTGGTGGGTGTTTCTGTTGTTTGTTAGTCCTGTGGTGGGT CTGAGACCATTGAGGGACAGAACTAACTCGTGGGGTGATGAGGTTTGTTCATGGACTTGTAGTTAATTTCAGTTCTTACT GTTTAATTTGTTGTGTCTGCTGCTTTGTTTTATTGCATTTTCTTGATTGTGGATGAAGGTTGTAAATTTGAACATGATTA TCTTAATCTTTGTAATGTTTTGACCTTAGTATTGATGGTTTCATGCCCCCTGTTTGATTTTTTTATTAAATAAGCTGTGA GGAGTTGCTTAAAGGGGTAAAGGTGTTTGCATAAAGGGGTAAAGGTGTAAAATGAAATTTTTTGGAATAGACAGAACAAT GTGGTTTGCATAAAGGGGTAAAGGCGTTTGCACATAGGTTGAGGAGAGATGGATGTTAAGTTAGTTTGCTTAGAATGTCT AGAAGAGGTACCAATTCAAGTCAACCCTTAATTTCCTTGATGAGGCTAGTGGATTAAGAAATTAGTAGTAGTATATTCGT AGTAGAATTGCATGTCAAAGTGCACTTAGTTATATTTAGAGAGGTTTCTTATTCCCATCTTAACCAAGAGCTATTATACA TTTGAATTTATGTTTCATGTTTAACTCGGAAAGTGCTTGAGGGTTGAGAATTTCCACAAGCCCGCATGACGATTGACCAA TTATCACTATCTTAACATGCTTATATGTTATCTTTCATGTATGATTCTGAAAGTGCTTGGAATTTCAGACAATTAATGAT TTTTTCTTCCAATTTTGTAAGTTGCACACTAGGGTGAAGTATTTGACCCACCTTGGCCCTAACTGTTTGACCCAACTTGG TCCAAACTAATTGTGGGTCGGATTTGTTCCTGTTCTACCAAAAAAAGGATTAATGCAATGTCTCATTTTATAAGCAATAT TGGTCAGGGATGGGCCCTGACTAATCTAACCCAATTTTATCCTTTTAGTTAGAGTTTTAAGTTCAACACCCCTCCATTTG TTGTTTTAAGTTTGACCTGTATTCTGTATATAACTATATATTGTTTATTTTGTTTGACGATTCAATTTCCTTTAGCTTAT ACCTCTAGTGAACTCGGTTCCATCTTACTTAGGCTCAATCTTAATTAGACCTTAGATCATTGGGTTCCTTAGTTCAGGTT TGGGTTTAAAGAATTGAGCAATCAAACTTTAGGGCTGGATGAGGGACAAACATAACCCTTCCTATGAGCATCCCTAGCCT AGCCGTATTTGCAAAACTTGTTTGCTGAAATTGCTCAAACATATTGAATCCTCAAATGAAGTTATTGTTTTAGGGCCATT TTATTTTGTTATGTGATTTAGTTGCAAGACCTTTCACATTCCTCCAACGATTTCATTTGACCATTTTCTGTCATTTGACT TGCCTAAACATTGTGACATCGCTAAACTTACATTTCAATGTTGGTGGCAACATACATTCATTTACTCATTTTGGCATTTT TTTTTCAGTGGATTTTTGCAGGAAAAGATGAAAGTGACGTAGGTCCATTTTCACAATGGAACATAACCGGAACTTATAGA GGTTGGTATTGTTTAATTACAGAAGTGTAAATTTATGTTGACGACTTCGACATATGGTTTGGTATGTTATGCAAATGTTC AATGCAACTGGTTGCATAGTTGGGTGTATTTTTTTATTGCTGAGCATCTGTTTCATGTATGGTTTGATGAATTTCTGAAC GAGTGATTGTATGATAGGGTAATAAATTTAATGTGAATGATCACAAAGTTACTGCTATATAATATTATCAATTGAGAATT ATTTTTTCTATGGCTACTTGAATTTTTGAATGATTAATGCTTTTCATCAATCAAAATGTCTTGAGGATAAAATATGTTGC TATGCTTCTTACCTTTGCTTAAGTTATTGAGCATTCTTAAATGATTACCACTGGAAGAGAATATAATGGCAAGGGAGCAT CATCCGGGTGGTAGATTAGGGCTATTTGCTCCCATGAATTAACTATGAACTTATGGCATTTGGTCTAAATACTAATAATG TAATGTTAAGAGAAATTCTGTGCAATTATCAAAACATGCTTCATTTGTAAATGAGCAAGTCTTATCTTCTAATGAACTTT GTCCACTAATTTATTGTTGATCGACTTTGTAAGTTCGACAGAGTTTGATGATGTATGTTGCTCTCCTTGAGTGCAGGGAC TTGGAAGTTTTTAGATACCACAAACGGCTCTTCCAGATTTTCAGAAATCAGAAAAATAAATGGAAATTCTGTAATTGAAT TAGTCAGTACGCCCACAAAGATAACTGGTGTACATTATGTGCAGGTGAGAAATATTTAACTGTATAGCTAGTTTTAGAAG GAAGTCAGTTTTCATATATGATGCAGTTTCTTATTTGTTCTATTAAAATTACCTTAGCTTCTGATGCTCCAAGGTTTTAG CTCAATAGAGTGGTTTATTTTTATATATTTATATTGACATCCTGAATATTTATTGGAAATATAGCTGAATTCAGTAGTTC TTTTGATTTAGTGAAGTTACATTGAAACTTGCAATCTCGATATACAACGCCTGACTTTGATTGAGCCCCCTCGATGCCAA GAAATTAATGCAGACGACCCAAGTCTTTAGTCTGAAAGTGCTGAAATAAATTATGTTTTAGAGCCTTGATGAACTATTGA TCATCACTTGTAATCACAAAATGTCATCCATATAAACCACAAAATAAATATATTTATTTGACGATGAGCATCTAAGGAAA ACAGAACAGTCTAGCTCACAACTTATCATCCCAAAATACTGGAAAACTTTGCTAAGCTGACCAAACCAAGGTTGAGGTGA TTGTTTTTGGCCACGCGAAGATTTACGCAATTTACATAATCAGACTCGACCCTCTTCCCAACCCCTATGACAAAAAATCC TAGGGTTGCTTCATATCGATCTCCTCCTCTAAGTCTCTATGTAAGAAGGCATTTTCAATATATCTAATCAGAATGTTATC TGAATCTCTGATTATGAGAGAATGATTAACTGACTATCATTGAACTAGCAACTGACTCAACAATTCCATTACTAGCAGCA CATGTATCTTAACAACTTCTAACAGATAATGAAAGCTAAGCAAACTAACTATCTCAAGGGGAGGATACAATACATTATTT ACTCTAACCCGGAAAAGGCTTGGTTGTTATTTTTTATTTTTGTTGTAGCGTATGTGTATGCATTTGTCAAACTATAATTT AGGGCCTTTTTTAGATCATAGAACCAAATACATTACTGTTTGTCACACTGAACTATGATGTCAAATCAATGCACATTTTC ACTCAAGTACTTACGTAATTTTTTTTCATGCTTTTTCTTAGGGAGTAATTATATTCCATGATGTGTTTGACAATGAATAC AATGTTGGTGGTTCTCAAATCAGAGTAGAAGGTGTATATATATGGCCATTTAGACAACTTCGAATGGTAGCGAACAGGTG AACACCAATTTAGTGTGCAGCACAAGTTTTTACGATTCCTTACTGCATTTAGATACCCTAATGCACTGAGACTATGATAA TGGCTTTTTTCCTGGACTTATCCTTTCAAACATTACATTCTGCAGGTTGATATATGGTAAATAATACGTTTCTTTTCTTT CTAATGCTATACTGTTTATTAGCTTGTGGGGCTTGGAGTTTAAGAATGGAATGGATATACTGATTAGCCCATATATATGT GGCTGTTAGAAAAAAAAATTATATAGGGTAGTTATAGCTGTACAGTATAATGTAAGTATAGTATAACATAGAGCTCCACT GTGTAATATACACAGTTGTCACATGCCTTTCATTTCTCTTACCTCTCAAGTCTCAACATGGTATTTGAGCACCAAGTGAT CTAGAGTCATATCCTTATCGCCCCTATTCTAATAAGAAGTTGAATATCAACACAAGGTTAGCGGCTTGGCATTGTCCAAG CTCAAGCCAGTTCTTGTATGATGGGGCATGTCAAATATAAAACCACTCACACGCTTTCACATGAAAAACTTGAGCTTTAG AGATAGTTGCTTCATGAGAATAAACATAATCTATTTCCAATTGAAGTAGTAATGGTAAGCAATATTTCATGTGCTGAAGA ATTTCCTTTGGTTTTCTCCTATTGCAGCGGAAAAGAGGGAGGGTTGAATCAGGATGGAGATTATATATTATCCAATCCGT ATCATCTGGTATTGCATATTTCTTAGGTCTCATTGATTGTACACCTTTTTTTACAGATTATATAGCCTACAATAATCTAA AAAGCAACATATCTTATTTTAGTGATCAATAAAAAATGTTCAAATTATTCTGTATGATTGAAATTTTATGGAGTTCTTGA ATTTCAATAAGGATGCTGCTATCCTTTACATGGGCTCGATTTCATTTTTTGTTGTAAGCTTGTTTGTTGTGAAGAAAGGA ACTTCTGATGTTTATCAGAATTACAATCCTAGATGAGTCCATATGAGGAATAAAAAGTAAATCAGCCAAGTGAATATTAA CAGCTGACTAATTTCTTCCTAAATTATGGGCTCTTCTTTACATAATTAATACCTATTAATGTTAGTCTTTGCTTTGATGG CTTAATCATACTTTCTGTTTAGTTACTGAATCTGTGAGTCACTATCTGCTATAATACACTTCTACCATGGCATGTGGGAT GCTCTCTAATAAGGTTTCACTTTATTTTGGAAATCTAAGGTTTCATTTTATGATGTATATTTATGCTGCTTTAAAGTTAA AAATTAAATCTCACTATTTTAGAAATTTCCAAATGCTAAGATTCCTTTCGTACCTCCTCTTGGCTCTAAACAATGGGGTG TGGACACGAGTTAGAGGACTTTCCATTATCTGAACAAAACCATATGAGACAAATAACTGGAGGGTTAATCATTATGGATA TGTGATTATTAATGATATAGTGGTATGGTCTATGTTATTTTTGGGAGTACAATGAGCATTCAAAGTGCTAAATGGCTATG TATGTGCCTTTCTGTATGCAGCTTGGTGTTTTCTCATCCCAAGTATTCCAAGAATCTTCTCGACATAAGATGTGGAGAAG AAAGCATTGTAATTTATCTCTCTTACTAGCATACTTTAAAGAGTTTTATTCCTTTTCTTTTAGTTGGTTAGTACTGTAAT ACTACTAACTTCTTTTTTCCCTTCCCCTTTTCCCCTTGCTGCAGCTCCATTTCATGGCATGGACAAACACTGTAATGTAG AAATTGCTGCACGGGTTTCACGCTTGTCATCTTCAAGACATGGTACATGAGTTCTCTTACCATATGAATACTTTCTGTTG AACATTATGTCACACGTTTTTTCTTCCAACTTTCATTCATATATTAGTAAATTTAGTTATTAATTTATAATGAATCTAGT GATTTTGCCAACCCAAAACTCAAATCCAAGGCTTTAATTCCAATAATTTCTACGTGGTCCTCTGATTCTCCTAACAGCCA AAGAAATACTGATGATTCTCAAGGTGTTCCTGAAGCATTCTTTTCATTTATATAACAAGTCTTAAGGATGTTGCACTTGT TTTTATATACATGCCAGGCTTGTTAATAGCGCGCTATAGCGGCACAATAGCCTATAACGTAGCGGCCTGGGGGGTTCACC GCTACTCCACTATTCACCGCTATTTGCACTATTTTCCGCTATAGCGCTTGAAATAGCATTTTTTGGGCTTGCCGCTACAC TACGCTATCCGCCATTAACAACCCTGATACATGCTATAACGTACAAATGACTAATTCACAGAGCTTCAATTGGCAGGTGT ACAACTAGGCCTTTGTCCACAACCTGTTAGCGAAATTTGGTTCCGATTGCAATTTCCTTATGAGTTGGAAAATGGATATT TTTCACATTATGGCTACGAATCCTTGAATTTACAATATTTATTAAAAAGGGAATGATATGAATCAATTTCTATCTAACAA AGAGGTGTAGGCTGAAAAGAAAACAATGGAAATTTAGTCTCTGTTAGGGGGGTAATTTAATAGGTAGAGGTGGAGGGAAA ACTATAGGCTAAACTTTTAAGAAGGATTTAAATATAAATAATTTATGGTGTCATTTGATCCATGTATCTATCTACACGTA TTGGCACATGAATAGTTTTATATTATATCCCTAACATGCAAGAGCCCGTTGGGCTTGAAGTGTGGAGAATTTCAACTTTT TTATTAGAATAGTTGGGGCAACAAGGATCGAAATCTAGACCACTTGGTCAGAGAGGCTCCGATACAATGCTATGAACCAA CTTTCCCAAAATAAAGGATCAATGAATAGTTTTATATTATATTTCTAACAATATTTATATCCTATGATTTACCAAGTTGT TATATACTTTCTTATAGAAGGGGAGCATGATTCTTTTCAGCTTGAAGGGTTAATGGAAAGTCCTTCTGTGGATGATGATG TAGATTGCTTCTCACCTTTACAGTTAAATGCAACATCGATTAACATTGAAGTCTACTATAGTAAAGCAGTGAACTATACC TTGATGGTTACTTTTGTATCCTTCAGTCATCAGTATTCTTTCAATTTTAAGACTATTATTGTCCATTACTGTATGAGCTC CTTAACATACTTACCAGGTCTCGTTCTTGCAAGTTCTTCTGTTGATTCGGCAAATGGAGCATAGCAATACCCAATCTGTA AGAAATCGCTTCAGAATATATTTGAAATTTCACATGTTATAGGATATAATCAATTGAAATAATATAAATGATTCTATATT TGGATGAATATGCTCGACAATATTCATTTCGTACTTCATAGTAGTTCATAAATATATGAATATAGAGAATGAATATGTTC CATATATACCTTTACAGGGGGCTGCCAAGGTTTCAATAATAATGATTGGTCAGCAAGCTATAGTGGATGCTTATCTTTGC CTTATACATCTTACAGCAGGAATACTAGTTGGTAAAGTTCTCAAAAGTCCAAATAAGCTCCTGGAATTTTTGTATAATCA CTTGAGATATCTCTATAAAAATTCTTTCTTTATTGTCCAAATAATCTCTAGAAACCTTGTAGACTGAGATACTAGTTTCA GAGTGAGATAAAATCAATGGATTCTTCATTAACTGGTCGAGGAATATTTTTCAGTGCCCTTAATTTTGTTTTTTGTGCCC AGCAGGCTATAACAGTAGTTTATCTAAGCCATATAAATACGCGTTGTTGTAAACATACCCGCATGCACTCAAACATAGAT GCATTTCCCATACAAAGGAGATAGCAATCTTCATACTTGGATGCTCGGGTTTAGGGTAATCTAATGTTTCACCAGTAGTT CAATCCCTAAAATCAAACTTCCTCTTATGCTAATTCTAGAGCACACCGGGATTCTATACCGTACAGGACTACAAATTCTT TAAATATGTGCCATGTTAAGAGCAATTATTTTTATTTGTCTCATAATAGTGCAACATTATAAATTATTTTGCAGTAGGTT ATAGGTTCAAACTTCCTGCCCTCATTTTAACCAAAAGAGAAAATTATAAATCAATTGTCGTATATTGTTATCCTTGTTCA GTATATGTGACTTCAGTGGTTGATTATCCTCTTTTTAAGATTGTCAGATGAGTAATTTTTGCTACTTCCTGCCATGCAGA ATCCTTGTTTAATGCTTTTGCAACTGCTGCATTTTTCAAGTTTGTGGTTTTCTCAATATTTGAGATGAGATATCTCCTTG CCATCTGGAAGGCAAATAGGCCTATGACTAATGGTGAAGGTTGGGAGACAATGAGGCGTGAGCTTTCAGTTTTGTACAGC CGTTTCTGTAAGTGCTCATTTAGAATGGAAGTTGCTGCAACTGATTTTGTTAATTGTGATCTTGTCACTGTGAATTTACC ATGGAGTTTTTGGTCCCATAGGATGCATGTTCACTTCATGTTATTTCTTTAACTGTTGAACTTTAATAGGCAGTCTACTT CTCATGAGCCTGCCAACTTATACTTTCTTTAACTATGTTGCTTTTTTCAAAATATTTTGGGGGTAAGTAAAGTTAAATGC TGGCCCTAATGGTCTATCTATGAATTTCACATATTGTTGATTGTATTTTGCTTTTAGGCCAACATGAACATGTGAGCTTC AAGCACACGTGATAGAATGACAAATATAGTATAAAAATTATCTACTTCAATTTGGGGTAATCCAGCTTTTAACCAACTGG TGGTTGGTTCAAGTGGTGCATGTTTGATTCCCTATAAGTAAGGTCGGGTTCGAGTCTTGTGTATGGGAAAGCCCCTGCGG GGAGAGCTAGCCTCACTAGGATGTCCCTGCTCAAACATGATTGTCTCCCATGGAGGATAAATCACACCAAAAGAATTTGG GCTAATCCACCTTTATACCTTAGATTCTTGTAATGATCATATCCAAATATTTTCTATTCCATTCTTGTGGTCCAGTATGG CAGATAACTTAGTTTTATGTTTTTTGTTGCTTCAACGGGTGCAAAGATTTCCTTGTATGAAGAAGTGTGGCTCAGATCTA ACCAAGCTGATAAACTTCTCTTGCAGATGGGATCTTGTTGGGAGGCATTCTGCTAATGTATGAATTTCATAATTACATGA GACCTGTTCTTCTTCTCGTGTACTCCTTCTGGATACCTCAAATAATCACCAATGTTGTTCGTGACTCCCGCAAACCATTG CATCCTCATTATATCTTAGGCATAACTGTTACTCGCCTCGCGATCCCATTATATATTTTTGGTTGTCCTAACAACTTCTT GCGCATAGAACCGGATCAGAGCTGGTGTGCTAGTTTGTCTGTATTTGTTGGACTTCAAGCTATAATTCTCCTTCTTCAGC ACTATCTCGGGTCCCGTTGGTTCATTCCTCATCAGGTTGGGCCCAACATTGTCTTTCTCTCTACACTTAATAACCACTTA TACTGAGTTGTTTTCATTCACTCTTTAGATTGCTTCTCAGTGAGTCTAATTTTATCTTCATGAGTTGCAGATCCTACCTG AGAAATACAGCTATTATAGGAGGTTTGCTCCAGATACAAGCCATGCCACAGACTGTGTTATTTGCATGACAGCCATTGAT GTTACGCCGCGGTCAAATGATTGCATGGTATGTGAATATAACCTTTGTCTTATCAAATTAATCTTAACAATCTTGATTAA GGCTAATACGCCAACTGTTATACAGGTAACACCTTGTGATCACTTTTTCCACTCTGGCTGTTTACAAAGATGGATGGATA TAAAGATGGAATGCCCAACTTGCCGGCGCGCGCTTCCACCAGCATGAAGAGATTTCCTGTGTTTATATCATTAGGATCAA CTGACAATTTTGGTAATATGTTTAGTGGCATCCAAGATATCCAACCGTCTACTTAGTAGGAAAAGTTTATTATTGTTGTT AATTTACTTCCGGTCTTTTCTGATTCAAGAGTCGCACGAAATGGGTTTTGCTGTTTCAACCTTTTCAGCAAATTTTGTAA TTTGATTTTTGCTCTTGATTCCATACGCTAAGTGCATGTTTGGAAATCTTTTTACAATTGATTCTAAAGCCAGAAGCAAT CCCGAGAAAAAGACTAATGTGAGTAGCTTCTGGTCTTTTAATTGATTCTGAAAGGCTGATGCAAACATGCTATAAGAGTA TTACGGCTCCTATACATAACTCGAAAGGCAATCAGCATAACTGTCTTTTTCCTATTAAATATGAAATATATTTTTACTTC TGCCTCTTGTGATTCATCCAGAATTGAATTTATAAGTTATTTCTTAGTTCTACTTTTGGCCTCATCTTAAGTCCAATAGT AATCAGTATTCAGTAACATGATTTCAACTTCAAGTGTTTAGTCTGCATATTTTACTAAAGTTTTTTCTTACGTTTTGCAG GTTGGGACAGAATCTACATTGGATATTGTTGCACCTTCAGTAAGAGGCTGAAGTACGACACTTCTCATAATTGTATCATG AAGCATTTGTTTGTAGCTGATTATTAGTTCTTTTTTTCACTGGTTATGTATCAATAATCATCAATGCTGTACATTAGAAA ATCTTTAAGATAATGTTTTGAATTCCATCCTTGGTTTAGTGCTTCTCTTTATTTTCTATATGCTATAATATCAATATCAA TTTTTAGGGTAAATTACTTAGTAGGTCCTCCTCCTCCTCCTCCGCGTTGTATCTATACACATAAAAGACAGAGAAATGTA AGTATGGAGTACTCTAATCTCTTTATTTTCACATAACTCTCTTTACTAGTCTTGGCCTCTCCTCTTGAGGGTTACTTAAC CTCCCCCTAATGACCCATGGGAATGCACATATTTTTGTCAAAAATTTAGTATGAAATTATTTTATTTAAATGTGACTATT GAAAGTCAATATATAGTGGAAACTATTGATATAAACAAAATTCCATGCCAGGTCATAGATACATCATACATGTGGTAATG CTAACTTGGACTTCTATTAACCACATTAGCATTCCCCTCAATGGTGTTAACCTCATGGACCAAAATCATGTTATTTTAGA TATAAAGTGATCAAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0452500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTGTGTTTGGGGTTTGATATGGTTGAGGTTGAGGCTCAGAGGTTGGAGCTTTTGCTGGTTAAGAGGTGGGAATTGAG GATTTTGTTGAAGGTTGGGTTCGTGTGGTGGGTGTTTCTGTTGTTTGTTAGTCCTGTGGTGGGTCTGAGACCATTGAGGG ACAGAACTAACTCGTGGGGTGATGAGTGGATTTTTGCAGGAAAAGATGAAAGTGACGTAGGTCCATTTTCACAATGGAAC ATAACCGGAACTTATAGAGGGACTTGGAAGTTTTTAGATACCACAAACGGCTCTTCCAGATTTTCAGAAATCAGAAAAAT AAATGGAAATTCTGTAATTGAATTAGTCAGTACGCCCACAAAGATAACTGGTGTACATTATGTGCAGCTTGGTGTTTTCT CATCCCAAGTATTCCAAGAATCTTCTCGACATAAGATGTGGAGAAGAAAGCATTCTCCATTTCATGGCATGGACAAACAC TGTAATGTAGAAATTGCTGCACGGGTTTCACGCTTGTCATCTTCAAGACATGAAGGGGAGCATGATTCTTTTCAGCTTGA AGGGTTAATGGAAAGTCCTTCTGTGGATGATGATGTAGATTGCTTCTCACCTTTACAGTTAAATGCAACATCGATTAACA TTGAAGTCTACTATAGTAAAGCAGTGAACTATACCTTGATGGTTACTTTTGTCTCGTTCTTGCAAGTTCTTCTGTTGATT CGGCAAATGGAGCATAGCAATACCCAATCTGGGGCTGCCAAGGTTTCAATAATAATGATTGGTCAGCAAGCTATAGTGGA TGCTTATCTTTGCCTTATACATCTTACAGCAGGAATACTAGTTGAATCCTTGTTTAATGCTTTTGCAACTGCTGCATTTT TCAAGTTTGTGGTTTTCTCAATATTTGAGATGAGATATCTCCTTGCCATCTGGAAGGCAAATAGGCCTATGACTAATGGT GAAGGTTGGGAGACAATGAGGCGTGAGCTTTCAGTTTTGTACAGCCGTTTCTATGGGATCTTGTTGGGAGGCATTCTGCT AATGTATGAATTTCATAATTACATGAGACCTGTTCTTCTTCTCGTGTACTCCTTCTGGATACCTCAAATAATCACCAATG TTGTTCGTGACTCCCGCAAACCATTGCATCCTCATTATATCTTAGGCATAACTGTTACTCGCCTCGCGATCCCATTATAT ATTTTTGGTTGTCCTAACAACTTCTTGCGCATAGAACCGGATCAGAGCTGGTGTGCTAGTTTGTCTGTATTTGTTGGACT TCAAGCTATAATTCTCCTTCTTCAGCACTATCTCGGGTCCCGTTGGTTCATTCCTCATCAGATCCTACCTGAGAAATACA GCTATTATAGGAGGTTTGCTCCAGATACAAGCCATGCCACAGACTGTGTTATTTGCATGACAGCCATTGATGTTACGCCG CGGTCAAATGATTGCATGGTAACACCTTGTGATCACTTTTTCCACTCTGGCTGTTTACAAAGATGGATGGATATAAAGAT GGAATGCCCAACTTGCCGGCGCGCGCTTCCACCAGCATGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0452500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVCLGFDMVEVEAQRLELLLVKRWELRILLKVGFVWWVFLLFVSPVVGLRPLRDRTNSWGDEWIFAGKDESDVGPFSQWN ITGTYRGTWKFLDTTNGSSRFSEIRKINGNSVIELVSTPTKITGVHYVQLGVFSSQVFQESSRHKMWRRKHSPFHGMDKH CNVEIAARVSRLSSSRHEGEHDSFQLEGLMESPSVDDDVDCFSPLQLNATSINIEVYYSKAVNYTLMVTFVSFLQVLLLI RQMEHSNTQSGAAKVSIIMIGQQAIVDAYLCLIHLTAGILVESLFNAFATAAFFKFVVFSIFEMRYLLAIWKANRPMTNG EGWETMRRELSVLYSRFYGILLGGILLMYEFHNYMRPVLLLVYSFWIPQIITNVVRDSRKPLHPHYILGITVTRLAIPLY IFGCPNNFLRIEPDQSWCASLSVFVGLQAIILLLQHYLGSRWFIPHQILPEKYSYYRRFAPDTSHATDCVICMTAIDVTP RSNDCMVTPCDHFFHSGCLQRWMDIKMECPTCRRALPPA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 27 | 27 | - | – | |
| Phobius | 28 | 48 | 21 | - | – | |
| TMHMM | 32 | 49 | 18 | - | – | |
| Phobius | 49 | 220 | 172 | - | – | |
| PANTHER | 52 | 129 | 78 | 1.3E-296 | – | |
| PANTHER | 52 | 129 | 78 | 1.3E-296 | – | |
| PANTHER | 130 | 519 | 390 | 1.3E-296 | – | |
| PANTHER | 130 | 519 | 390 | 1.3E-296 | – | |
| Phobius | 221 | 240 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 221 | 240 | 20 | - | – | |
| Phobius | 241 | 251 | 11 | - | – | |
| Phobius | 252 | 281 | 30 | - | – | |
| Phobius | 282 | 286 | 5 | - | – | |
| Phobius | 287 | 309 | 23 | - | – | |
| TMHMM | 287 | 309 | 23 | - | – | |
| Phobius | 310 | 329 | 20 | - | – | |
| Phobius | 330 | 349 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 330 | 352 | 23 | - | – | |
| Phobius | 350 | 354 | 5 | - | – | |
| Phobius | 355 | 374 | 20 | - | – | |
| Phobius | 375 | 385 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 382 | 404 | 23 | - | – | |
| Phobius | 386 | 403 | 18 | - | – | |
| Phobius | 404 | 414 | 11 | - | – | |
| Phobius | 415 | 434 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 417 | 439 | 23 | - | – | |
| Phobius | 435 | 519 | 85 | - | – | |
| Gene3D | 452 | 517 | 66 | 2.8E-14 | ||
| SUPERFAMILY | 468 | 517 | 50 | 1.02E-14 | – | |
| Pfam | 468 | 513 | 46 | 1.5E-9 | ||
| SMART | 468 | 513 | 46 | 0.0024 | ||
| ProSiteProfiles | 469 | 513 | 45 | 12.194 | ||
| SMART | 469 | 512 | 44 | 1.3E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Zinc ion binding | Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0452500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…