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LotjaGi4g1v0153200.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0153200
Transcript ID LotjaGi4g1v0153200.1
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Uridine kinase; TAIR: AT1G26190.1 Phosphoribulokinase / Uridine kinase family; Swiss-Prot: sp|Q54R62|UCKC_DICDI Uridine-cytidine kinase C; TrEMBL-Plants: tr|K7K801|K7K801_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0153200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:25444758..25455761) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CCACGGTCCACAGACATAGCAACTTGTCTGTCTCAGGGCTCTGCATGCAAAAATCTTCCATTGGAAGATGGATTTGAATC ACACGTGGTTCTTTAGAAATTCACGTTTTGTTCGGTTCTCTTGATCTCTTCCTCTTCTTCTCTCCATGATCCATACATTG TTACTCGCTTTAGCCAATGCAGATTGATCATGCTTCAAGGTTGTTCTACCGCTAAACTCACTGTTTATTGAGGGAGCTAA CGAGAACGGTGAGTGCTCCGATAATAATCACAAATGTGTATGTTGGATCCATTTTGATTCTCATTCTCATTCTCACTCTC CTTGGTTGTTATTAGCCATTGATTTATGGGGTTTCCTCTGTTAAAGAGTTGTGCTTTTTCCCCTTTGGTTTGTGAATCAA AATGCTGATTATTTCGTTTTAGGTCGTGTATCGAAGATGGTGTCGTCTAGGATGTTGAATTTTATGATAAATTTGATTGT GGTAAGTGGTAAGAAGGAGCAATATGCTCATAAAGTTTGATTTGTGTTCATCAGAGTCTTCTGTTGATTGTTTCTATGGC AACTTTCTAAACATAATGTTTGAATTTGACCAGAAAATGGTCTTGAATTTGGCCTTACTCTTTTGAGGTTATTAGTATCA GAAAGTTTCTTCTTTGATTTTATGATTCACTATGATATCAGTTTCCTCCACTTTATTGAGGACTTCCTATATTTGGGGCT TGGGGGTTGTTGTGATAATGACTGCAATTTCTTATAATATGAAGGTTCTTCAAGGCCCGTGGCTAGTTTACGGGTAATAG ATATAGCAACAGAAGTTTCTAAAATTAGTTGTTACTTACATTACTTCTACCTCTACATATTATTAATATGGGTTGAATGA CACTTAGCTTCTGTCTTCAAATTTACTCTCTTATTGTATTTATGGATGAATCTCTAGTTTTGACTTTTGAGAAGAATTCA 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GTTTACGTGAACATTCCATATATGTTTCATGATATAGAGAGAGGAAAAGAGCAAAGTAAGAGAGCATATGACTAAATCCG CATGTCTCAATTAAATAGTAAAGCTATAATATATATTCATTGAAGTACTAATTACATGATTCTACCTCATAAAAAGTATA CTTATATACACTATTGACATATCTTCTACCGGTTTATCATTTTTCATGTTTGACATTTAGTTCCTTCATTTACTTTTTAG TTTTTATATTTAATTTTTGATTGATTGCAGATTACATGTTTAACCTGTTTGTTGTAACTTAATAATAAATAGGTACAAGG AAGAGATCGCTTAGTTGTGATATACATAGCACAACAGATGGGTCTTGAAGGTTCTTACATTCCCCGTACCTACATTCAAC AGATTCAACTTGAAAAGCTTGTAAATGGTGTTGTGGTATGGCAACTTTCAATATGCTAATACCTAATCCTATATTAGCTT TCTTTGTCTAAATATTCCACAGGCCATGCCAGATGATTTAAGGACAAAGCTTAGACTTGATGAGGATTTGATGTCAAGCC CCAAAGAAGCACTCTTTAAAGCCTCTACTAACGCGCTTCACGTAAGACATAGGCGTATAAGGAGGTGAATATTTACAGTC TATATATGCTTTCTGCTTTTGAGTATTGAGAGAAGAGAAAAATAGGAGATTTTTTGAATACATGCAATGTGAATTATATT GATTTATAATAATAAGTACAGAAGATCTAGAATATCCTAATCACGACAGTTAAATAATTTCATTAGCCTATACAATTAAT TTAGACACAATTTATATATTTTTGAAAAATCCGTAAGTTTGAGCACTAAGCTCATTACAATTGTAGCTTATTTGAAGTTC TCTCAAACAGGTAATGAAAACATATGAGAAATGGTAATTGGAACTAATGAAGTAAATAGTTATTCCCTCTCAGTTTAAGT ATTTTCTGCAATAAAGTGGCAATATATGTGTTTTCTTTTGTTATAAAACATTGGAGTTGAGGAAGCAAGGAATACAATTA ACTTAACCTCCTCAAATATGATGGTATTGTTGAGACTAGGAGAATTATGAACCTACACAAACAGATATATATACATAGAC ATTATAGATACGAAGATTATCATTAGCCTAATTACTATATTTACATGAAAATATATATATCTATAATTACCCTATTTACT TTCTTTCTAACACATATCATTTGCACCATAACTGACTCTTGGATCTGTCAAGTACCACTTCTAGAACCAAGATCAGAAGA CAAGGGATTAAAGTTGACCATTGGTGCAGAATGCGAACATATAGTTACGTGGAAGTCTTCTATTGCCCCACTTCATGTTT TCACATTGGTCATGACTTCAGTAACTGCTTGATTGTGGACAATGCAAACTTTTTCTCTGGAGTCTTCCACAAAGCCTCTT TAGGAGCCATATCATATGCCTTCTCCAAAAAGATGTCCTGAATATGGTATAGGCCGAACTCCACACCGAAAGCTAGCTCA TGAGATGAGGACTCTCTTGACCTTTATAATCTATAATTTGGCCATGTCTCTAGTTGATGTGGGACTGCGAGACACCCCAT CCTGGCCAAGATTTGAACTTTGGTGCTTGTAGATTGTAGGACTTATTTATATTGCACTTTTTAAAGTCGTGGTCAAGTTG ATTGCACTAGGAAATTTTCGGGCTAGGTTGGCTTTTGAATTGCTGTCGGTGGCTCGTTATTAGATCTAGAATAGGATCTG ATATCATCTTGAATTTAGGCTAAGACTTAACTCTACACCAAAAGCTAGCTTATGATATGACTATTGCTCAAACCTTTATT AGCTCTAATTATGTGATAGGTACTTAGATAGTTTGACAGTTAGTCTATAAATAAGAGTGGGTTAGCGGGAGTTAGCTATC CTTTGGATCATTTGGATTCGGAATTAGGGAGGGTGGCTGAGATTCTCGAATATCTCAGCAATCTTGTATATTTCTTCATT CAATAATATCAGGGTTCTATCATAACGTTACCTAATTACAGTTAGTACAAGACATCCTACCTATTTACAAGATACAAGAT ATCTAATAGTATTGTTAAGGTGTTATGAAATTCATTAATTTATTCATATTAAAATAAAATTCACATACATACATATATTC GTACACCAGTACTTTAGTTTTTTCTTAAATTTCGTAGCCGTAACGGTGCCCGTATCTGTGCAACATAGCTCTTCTGCATT TAACAAATGAAAAGGCTGATGTGTTTCTTCAACTTCAACAGTGATATGTCACAGTCATGTACAAATCAAAGGGATAAAAA TCAAGCCAAAGTAACTGGATATGTTTCCAACAATCGAGTGCTTCATGAAAGAGATAATTCAGATTCAGTCACAAATCTGG CAAATCAGGTATGTTCATTTAATTGTGGTAATTTTTATTCTTGTTGATATTCTGATTTGAATATCACCTTTCTAGCTGAC CATCCTGAAATGAATTGGCTATTTTTTAGCTTCATTTTCATAATCATTGGGCACTTGGCAGGGGGCCATTACAATACTTT CAGAACAAATTTCTTCCTTAAATGATAGAATGGATGAGTTTACAAATCAAATTCAAGAGCTGAACTCCAAGTTAACTATC AAGAAAAATTGTGCAAGCCAACAAAATATTGTCCTGCAAGCTGAGGCCTGCAATGGTTCTGCTCCCACCTCTCACTCCAT CACTAGTTGGAATAATCGTTCACTAACTAGACCTATCATTCCAAATTCCTCGTCCCCAACACAGTTCGCCAAGGAGACAC CATTAGCAGATGAGGTATCTTTTCATATTCTTATATCCTATTTTACTTTCAGCATTGAAGGATAAGTTTGATGGTTTCCA TTATACACAATTCTCTCAATGAGGAAGATTTGTAAATCTTAACTTTAGGAACCAAAAATAGATTAAATAGTAGAAGGTTG TAGAAAGGAAATGTTCTAGTGACATTTAATTGGAATTTCTCAAGATAAATGTTATGCAATGGGAGTGGAAGATAGCATAT TTTTTTTTAATAAAATGTTTAATTGCACTTTTAGTCCATCTAGTTTGGACTATGTGCGAGTTTGGTCCCTCTAGTTTTTT GAACTAATTAAGTCCCTCTACTTTTAAAGTTAAGCAAATTTGGTCATTCTGTTATTTTTCATATACTAAAATTTCTTAAA TCTTCATTTTGTATTCAAGTATTTTTTATTTCTAATTTTATAGTTTAAAATTTGGTGAAAAATAAAATTTTAAGGATTTT ATGTGATGTGAGAAAGAGGTTTAGAGAGGAGAAATTTGACAATTCCTCAATTTTAAGTCGAATCTAATACAACAGTGCTA CCAACACTCACTCTAACACTTTCTTTCCAACTCTCTTTTATTGGTTAAAATTTATGCAGGTCACACAAAATTGGGAGTGG GGCCCATATAATTTAGTGGACCCTACGTGGATTTCAACTAATGAAAGAGAGACGGTTGGAAAGAGTGTCAAAGTGAGTGT TGGTAGCATATCTCAATTTAACATTTTAGTTTGCCAGTTTAATTTGAGTAGGAGAATGTTTAACATGATTTAATTGAATC AATTTGAAGTTACTTCACTTAGATAATAATAATTTTAACTAGAATAAAAGTGATGGGGACTTGGTTGTATATAACAATTT TAAATTCGAGCGATTAAATTTACTACAAAAAATTATTAAGGGATCAAAACCACACAAAGCTATAGTTGAGGGACAAAAAG TACAATTGAGCTAAAAAATGTGCTTTTAATGGTGGTTAACTTACCAAAAGTCATTAACTTACCTTGGTAGTGTTATATAA TAAAAATAGGCATTGATTTGGCCTGAGATAAGTTAGTGAATACAATTAAACGATCTCCTTTCCTGGTACAGGGATTTCTT ACCTATGTATGATTATTATTAAAAGGAAAAATATAGCAGATACCATTAAGATGTTTTTGGCAGATTTATAAGATTGAATA GTTCTGAAATTGTCTGATATAGGGCTTGTCTCAGTCATTTTAGCTTTAATGCTTACCAGTTGTTTCTGGTTTATGTTTTG ACAAAATTCAGACTGTACTACTGCTTCTATAAAAATAGAATTTATCATTCACTTGAAGCATGTGCTGGTAAATTCATATA ATCTTTCTGAATTGGTGAGGTGAGGGGCATAACTCTAATGAATACTGCATCAGTTCTCGATTGATGTCAATAAATGCTGT ATGTAATCAGATTGCAATGGGTCAGCGTCAGATCATTCATCAGTTGGACAATCTGAATAATCTTTTATGCGGAAACACGG GAGATAAGCCTCATCAAACAAGAACCAACAGAAAAAGTGTAGCTCCTTATTCAGATTCCACTGGACCTAATCTAATATTG GCAGTGGCTGTTGGTTGTTTGGGGATCTTCTTGGTGAAGGGTTTGTTAACTCGAAATTGATACCTGGACATATAATCAGT GCTATTCAGTCATATTTTTATTTTACTTCATGATATTTTTCTGATAAGATAGTGAGGCATTGCCAATGATTCTGAGGCTA GTATAGCTTTCAAGGGTATTTGAGGATCTGACAGGGGAGATGATGCCTGCTGGAAATTTCGTAGTATTACTTGGTATCTT AGTTTATGGCATTTTCAACTTTAAGACTTTTCCCTTTTCTAACTATAGTTACCTAGTTAACAATATGATAGCCAAGATGT AACGATGATTTAAAGCTAGTAATGACTTAGTTATTTTATGCCTTGGGTAAATGTTATTTTCCTGTTACAGACTTTTGATT TACCAGATCTATCAGTATGTGTATACATACCCGTAAGGTTACAATGGTGTAATAATAATAATATGATCTATCAGTATGTG TATACAAATTTACCACACCTACTGCAGGCTACACTCTGAGCAAGGTTAAAATGGTGTCGCCGCTAATCTCAGCAAGGTTA CAATGGTGTTGCCTCTTATTTGTTGGGAGAGCATTCCGCCTAACTAGCCACAAAAAGAAGCAAACTATCGCCCGTGCACA ACACTTTCCATTTTTTTTCCAAATCCTGGATTGGTTTGCCATCATCCGCAATCTAAGCATAGGACCATCACCAGCAATCT AAGCATAACCAAAACTTGAGGTAAAATACTCATGATGCGTTCCCTTCCAGCCCAAAGAGTCATCACCCTGAGTCACAGTT CGAATTGTAAAGGTGTTACATTAAATTTTGTTTTTATTTCAAAG 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0153200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAAATCAACATTCCTGCTATGGCACAAGATAATTCTGGTGCTGATTGCTGTCTTGGTCTCATAAGAGATCAAGTTCG CTTGGTTAAAAGGAAACACTCTGATCGCTATGAGGTTGCTCCAATCCATGACCAATTATCATTTGAGAAGGGGTATTTCG TAGTATTCCACGCATGCCAATTGTTGGTCCAAAAGAATGATGGAATAATATTGGTAGGGGTGGCAGGTCCTTCAGGGGCT GGGAAGACTGCATTTACTGAAAAGATACTCAACATCTTGCCAGGCATTGCAGTCATTTCAATGGACAATTACAATGACTC TAGTCAAATTGTTGATGGAAACTTTGATGATCCACGCGTAACAGATTATGAAACATTGCTCCGAAATATACGTGATTTAA AGGAAGGAAAGCCAGTGCAAGTTCCTATATATGATTTCAAATCCAGTTCACGTACAGGATACAGGACAGTAGATGTGCCA AGCTCTCGAATTGTGATTATAGAGGGCATTTATGCATTGAGTGAGAAGTTGAGGCTTCTATTGGACCTTCGAGTATCTGT AACAGGCGGCGTTCACCTTGACCTTGTTAAACGAGTTATACGTGATATACAACGTGCTGGTCAAGAACCTGAAGAAATTA TTCATCAAATATCTGAGACGGTATATCCTATGTACAAGGCTTTTATTGAACCTGATCTGCAGACAGCACATATAAAAATC ATCAACAAGTTCAATCCGTTTATTGGATTCCAGAGCCCTACTTACATATTAAAGTCAGCCAGAAATGTAACAGTGGATCA AATTAAAGCTGTTCTCTCTGAAGATTTTGAGGAAACAACTGAGCAGACTTATGACATATATCTTCTACCACCTGGTGAAG ATCCGGAAAGCTGTCAATCATATTTACGGATGCGGAATAAGGATGGGAAATACAATCTCATGTTTGAGGAATGGGTGACA AACAATCCATTTATCATATCACCAAGAATTACTTTCGCAGTTAGTGTTCGTCTCCTTGGTGGACTAATGGCCCTAGGATA CACAATAGCAACTATCCTTAAAAGAAGCAGCCGTGTATTATCGGATGATAGGGTTTGTGTGAAACTAGATTGGCTTGAGC AACTTAATCGACATTATGTTCAGGTACAAGGAAGAGATCGCTTAGTTGTGATATACATAGCACAACAGATGGGTCTTGAA GGTTCTTACATTCCCCGTACCTACATTCAACAGATTCAACTTGAAAAGCTTGTAAATGGTGTTGTGGCCATGCCAGATGA TTTAAGGACAAAGCTTAGACTTGATGAGGATTTGATGTCAAGCCCCAAAGAAGCACTCTTTAAAGCCTCTACTAACGCGC TTCACGTAAGACATAGGCGTATAAGGAGTGATATGTCACAGTCATGTACAAATCAAAGGGATAAAAATCAAGCCAAAGTA ACTGGATATGTTTCCAACAATCGAGTGCTTCATGAAAGAGATAATTCAGATTCAGTCACAAATCTGGCAAATCAGGGGGC CATTACAATACTTTCAGAACAAATTTCTTCCTTAAATGATAGAATGGATGAGTTTACAAATCAAATTCAAGAGCTGAACT CCAAGTTAACTATCAAGAAAAATTGTGCAAGCCAACAAAATATTGTCCTGCAAGCTGAGGCCTGCAATGGTTCTGCTCCC ACCTCTCACTCCATCACTAGTTGGAATAATCGTTCACTAACTAGACCTATCATTCCAAATTCCTCGTCCCCAACACAGTT CGCCAAGGAGACACCATTAGCAGATGAGATTGCAATGGGTCAGCGTCAGATCATTCATCAGTTGGACAATCTGAATAATC TTTTATGCGGAAACACGGGAGATAAGCCTCATCAAACAAGAACCAACAGAAAAAGTGTAGCTCCTTATTCAGATTCCACT GGACCTAATCTAATATTGGCAGTGGCTGTTGGTTGTTTGGGGATCTTCTTGGTGAAGGGTTTGTTAACTCGAAATTGA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0153200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MEINIPAMAQDNSGADCCLGLIRDQVRLVKRKHSDRYEVAPIHDQLSFEKGYFVVFHACQLLVQKNDGIILVGVAGPSGA GKTAFTEKILNILPGIAVISMDNYNDSSQIVDGNFDDPRVTDYETLLRNIRDLKEGKPVQVPIYDFKSSSRTGYRTVDVP SSRIVIIEGIYALSEKLRLLLDLRVSVTGGVHLDLVKRVIRDIQRAGQEPEEIIHQISETVYPMYKAFIEPDLQTAHIKI INKFNPFIGFQSPTYILKSARNVTVDQIKAVLSEDFEETTEQTYDIYLLPPGEDPESCQSYLRMRNKDGKYNLMFEEWVT NNPFIISPRITFAVSVRLLGGLMALGYTIATILKRSSRVLSDDRVCVKLDWLEQLNRHYVQVQGRDRLVVIYIAQQMGLE GSYIPRTYIQQIQLEKLVNGVVAMPDDLRTKLRLDEDLMSSPKEALFKASTNALHVRHRRIRSDMSQSCTNQRDKNQAKV TGYVSNNRVLHERDNSDSVTNLANQGAITILSEQISSLNDRMDEFTNQIQELNSKLTIKKNCASQQNIVLQAEACNGSAP TSHSITSWNNRSLTRPIIPNSSSPTQFAKETPLADEIAMGQRQIIHQLDNLNNLLCGNTGDKPHQTRTNRKSVAPYSDST GPNLILAVAVGCLGIFLVKGLLTRN 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 643 643 -
PANTHER 19 629 611 4.7E-285
PANTHER 19 629 611 4.7E-285
SUPERFAMILY 67 240 174 4.24E-22
PRINTS 69 86 18 8.2E-12
Gene3D 70 247 178 6.1E-39
CDD 71 243 173 4.47484E-70
Pfam 72 240 169 4.3E-27
PRINTS 136 151 16 8.2E-12
PRINTS 192 202 11 8.2E-12
PRINTS 228 241 14 8.2E-12
ProSiteProfiles 252 414 163 13.843
SUPERFAMILY 265 411 147 9.81E-15
Pfam 273 408 136 3.4E-16
Coils 508 535 28 -
TMHMM 640 662 23 -
Phobius 644 662 19 -
Phobius 663 665 3 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0153200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…