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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0168100 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0168100.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA-directed RNA polymerase; TAIR: AT1G68990.1 male gametophyte defective 3; Swiss-Prot: sp|Q8L6J5|RPO1B_TOBAC DNA-directed RNA polymerase 1B, mitochondrial; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3R3N7|A0A0S3R3N7_PHAAN DNA-directed RNA polymerase; Found in the gene: LotjaGi4g1v0168100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:32222221..32246205) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CGATTATTTTTTCTTTCCAGATCCGAGAAGGGCCCCGGGTCATAACCGAATCCGGTTTGGAATTTAGAGGCTCGTTACAA GCAAGTCATAGCTTAGGTTTATGAAGGGTTTAAAGGCGGCTGCTACTCTTCGCCTCCTACTGTTCTTCAAAATTTTCTCG GGAAATGCTCATTCATTTTCTCATGTCCCAAACACCTTCCACCTGCAACTGAAACTTCATTTCCTCGCTTGCATCACAAA CATGTGGACCAACATAGTCAAGCGAACCTCCTCAAGGAAGTTCAAGCAATCCTTCGAATTTCTCTCTTCTTTTTCTTCTC CGCTGAGATTTTCTCAGTACCCGAATTTTCCCGAGAAAATTGTGCCCCTTGAGGTAAACTCGAGGCACCCATTGCTGGGT TTCAATCAAGTTGGTGCCTTTACTTCGAAAAGCAAATTGGGTCGATCCAAGTTTTTGATTTCTGGGGATCCTTTTTGTTT TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAAGTTCTTTGAAGCTAGCTAGAGGTTATGCTAGCGTTGCTGAGGCTATTGAATCTT CTGATGCCGAATACGATTATTCTGCGTCTGAGGAGGTGCAGAAATTGTTAGAGGAAATGGTGAAAGAAGAGAAGGAAAAA CCTCAATTGGAGCCTGAAAAGAAAATGGATGGAGGCATGACGAGCTATAAGTACAAGATGCTTAAGAAGAGGCAGATTAA AATGGAGACTGAGGCATGGGAAGATGCAGCAAGAGAGTATCAGGAACTGTTGGAGGACATGCGTAAGCAGAAGCTTGCAC CCAATTTGCCTTATATGAAGTCATTGTTCCTTGGTTGGTTTGAGCCCTTAAGGAATGCAATTGTTGCTGAACAAGAGCTT TGCAAAGATACCCGGCTTCGGTTGACCCATGGTCCTTATTTCAATGAGTTACCTGCAGACATGATGGCTGTGATCACAAT 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CCATGTTGAGACAGATTATTATTTCATTAGAGAAAATATTGTATATTGAGACATCACCACTTACTATGTTAATACAAATG ACCAACTATTAGATGCTTTTACCAAGTCTTTGAGTTTCTAAAAAGAGTTACATATTTAACAAGTTTTTTGTGTATGCCCT AATAGCCCTATATGCTCTAGTTTGAGGGAGAGTGTTGGATTATGTGCAAACAGTATAAGTACATTGTATTGATTAGACTG TACTTTCTCAATGTATATTATCTTTGGTGTATAATTGTGTTAGAATTTGGATGTTTTGATATGCTCTTTTGTTTTCCCCT TTCTCTACACTATAGCTGTTGGAAAAATGTCGCGTGTTAATTTGATTTATGTTTGACCTATATTTTTTTTTCTGGCATAC TTGTCTTTCCTAATTAGTATCATGCTCTTTGAATAATGAGAACTTGAGGTTTTCATATGAAAGCAAGACTTCAGGCATCA ATTGCCTTATTGTATTGATTGCAGAACTAAACATTGTATGTATTTGTCTAATGAGGTTGAGACTTTTAGGTCACCAAGCA TGATCCATGCTTTGGTATTTCTTTCCTAATTTTGATTTTTTTCTCCCTACTTGCTAGGATGGTTCATGCAATGGCTTACA ACATTATGCAGCACTTGGGAGGGACAAGGTACTATAAACATTAAATTTTTACTTTTATTTAATATAATTTCCAAGTATTG GTTTTTGTTTGTGTTTCTATGGGAGTCTGATAAAAATTCAATTTGGAATGCTCTTTATGTAATAAACAAACCTTTTATTG GATTGCAAGCTCCTTTGTTGTGTCTTATGTGAGAGTACTAGGATATGGTTTAGGTTGAGTGTTTTTAAATATCATTTAAA CCATTAATTCTACATTTTTATTTTATTTTGTCTGACTGCTTGAAGATTTCAAATTGCTGCTAGAAACCGAAAGCAAACAA AGCAAATTCATTTTAAATTTTAAATTATTTGGCTTCATGTTTTATAGTGAATGCCAAATTATATCTATTTTACCAGTCAA CTCATATATTTTACCTTTAGCTTATATCTGGAATAATGGAAGTGATTTTTCAATTTAATGATTCTCTCCCTCTCTCTGTT ATTTATCTACTCTATCTATCTGTAGAAACATCGTAGTTAGATTTAAACCTAACTAGAGAAAAAGAAAAAAAAAAACAGCT TGGATTTCTTCATTTTACAAGGTTATTATCTTTTCATTTCTATCTGACCCTATCATAATTTGGGAAGTGAGACACTGCTG ACTTTAAAATAAATACTTTAAGCCTATAAGATTAATCACAGCATGGATCATTATATGCATTCTTTTTTAAACTTATCATT TTGTCATTCACAATACCTTATCTGATTTCACCCTTTTCAAAAAAAAACCCTTATCTGATTTCACATAAGGTGGACTAACT TTAGCCAATTTCGACTTAACAACTACCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTGTTCTTCTGTTTTTTCTCTCTTTATCTTTCTTTA CACTGCCTCATCATCCATTCGCTGCATCTTTTTCCTTTTCAAGTTGGGAGCTGCTGCAGTCAATCTTATTGGTGGAGACC AGCCTGCTGATGTTTATTCAGGAATTGCTACTAGGTAATTATCAAAGTGCATCCATGTGCATGAGAACATTACATATACT TGGCTTTGAACAAGTCCTGCAGCTGATTTATGGCTCGGGGTTTATAGTTTTTCATTGAAATAAATAAAATTATAGTGTAG CCTTCATGCCTTCCATTATTTTACCAGTCAACTCATTTATGTCAAGTTTGTAGCGAAGGCTACACGGGACAAGATTAAGC ATGTAAACTTTGTTTTGAGTTATACAAACTGATAATGGAAGCAAGGGACTCCTGCTCTCTTGTCTATTTGACCTTTTGTC AAATCAAGTGCTAGAGTGTCTCAAAAATCAAAATATCAGTATTTTAGAATTTCATAAACATATCTTCAGCATATCTTTGT AAAATCTCAGAAGGTCGTTAAAGTATATGATCAATTTTGTCATCCAGTTGAGGAAGCAATCTAAAGAGTCCTGATTTCAT TATAGTTACTAATTTCTTTCCTTAATTGGGGTTGAGTTTTAATGAATTTGTTGGCTTGAGCTTATAATGATCACTGCATT ACCGCTTGATCTAATCCTTACTATAAGTAGGTATTTGAGCTTTATATTTTCACACGTCGTGATACACTATATCAAGCTTG TATCAGAGTCTCAATTCTCTTCATTCCTCTTCCCCAATGCAATTGCAAGGTATGAGACTTGCGTTCCACATTTGAAGTAC GAGACTCTGGTTGGGGTTTATTGGGTCTTGTGCTCTCTTACTACAACCGTTAGCTTTTGTGGTGTGCTTGGAGAGTCCAA GACCTGCTAGCAGATTGACATGTGAACAGCTTTAGGAGAAGACACTACTATTCACCTTTCCTTTTACATTTTTTCCTGAC TTTCTGATTCCATTCATCACGATGAGTCAGTTGCAACTGCCATTGCATATATGCATTGTAATCTTTCCTCCAGAAGTGAA CCATATGACCATATTCAATACTAATATTACCATTCAGTCTTTACCCCAGAAGTGGAGCATGTGACTATTAAATACTGATA TTACCATTTAGTCTTTCATCTATCAATAAGTTTTATGTTTTCCTGTTGGCAATATCATTATTTGTTTTCATACCTGAAAT TTGTTTAAGGGATACTGTTTTGATGTCTTCAAGTTTTGTATTATTTTGCAGAGTACTTGAAATCATGAGAAGAGATGCAG AGAAAGATCCCAAAACTAACCCAAATGCATTGCATGCTAGGAATTTGATCAACCAGGTTCCTATTAATTTTATCAAAATA GAATTTTCTTTTCTTTTAGTTGTTTTTCTGTGGAATATTTGAAAATGGAATGTGAGAAGTTCCAGACCAGTTGACTCATC TGACATGTGTTGTACATGAAGTCAAATCTATTTGCATATGTGCTAGCATCAGTCTATATCAACTGAAAACTCTCATTATT GGGAAAATTAGGTGGACCGAAAGTTGGTGAAGCAAACAGTGATGACATCAGTCTATGGAGTGACTTACATTGGGGCCCGA GACCAGATCAAGAGGAGGTTAAAGGAGCGCTGTGCCATCGAGGATGATGCACAGCTGTTTGGTGCTTCCTGCTATGCAGC AAAAGTATGAGAATTTGATTCAGTGGAGTAGTATGTGAACATTTTTAAATCATTTATATTATTTGTTTTACTTACTCACT ATTTTATAGACCACCCTTACCGCCTTACAAGAGATGTTTGAGGCAGCAAGAAGTATTATGGGTTGGCTAGGTGATTGTGC AAAGGTATGACTAAGTTTGTGTTGAATAGCATTACTTACAAGAAAGAGTGAGTGATTTAACTATTCATTGCTGTAAAATA TAGCTGTTGTGAATAAAAGGCTAACTAGCGACTTGTAACATCAATTGTCTTTTGACTATCCTCCTGATATAATTTTCTTT GTTTGATCTTGTTTATTTAAGTTCCATATATGTTATGTTTTCCCCCCAAATGATTCTCTTTACTCAGTTAGAATTTGTTA AGAAAGTTATATTAGAGAGGGGCGAGATACCAGCCGGGAAAAGTTTAAGATGTTCTACATAATAAATAAAAAAAATGCAA GGAGTATAGAAGTTGATTGTCTACTCTGTAGAAGTTTGCGGCCAACAGCACTCAGTGAGCTGTTAATAGTATCTGAACAA AAGTAGAGATTTGTTATCTCTGTCAGGGTGGAAACTCCTATTATTTCACTGTTTTCCAGAGGTCATGCTTAAAACTTGGT CATGCTAAAAACTTAAACTATATGGCAAATGACTTATGAATGATTTATATTATATTTCTAATATGCCCCCTCATGCAAGA GCCAACTTGGGCTTAAGCGTGGTCAATGCACAAGCCCACCTACCATGTGCTGAAGTTAAACTTTTTATTAGAATAATAGT GGCAACAAGGATCGAACTCTAGACCACTCGGTCATAGAGGCTCTGATACCATGTCATGAACCAATTATCCCAAAAGTTTA AGCCATTGGGTGAGGCACACATGAATGGTTTTATATTTTAGATTTCTAACAGCCCCCAACAGTTTTTTGATGTCCTTAGT TGAGGATCTAGTTGTATAAGAAAAAAAGAGTGTAATTGTTTTGAAAATTGTGAACCTTATCGGGCCTTTTCATTCCACTA GTTACTTTTGGCATGTTTTATTTCCTACGTTCCCTTGTTTCAATGTTGATTATGCTTTGACCTGTATTGCATCACAGTTA TTCTAATGGTTCAACTTTGAACATGGAATAGGTGATAGCTTCCACAAACCAAGCAGTCCGATGGACCACTCCCCTTGGGC TTCCTGTAGTACAACCTTATCGCCAACACGGAAGGCATCTTGTAATTTCCTTAACAGTATCCTAAATTTTTCCTTTTTCT TTTATCTTTTTTTTTTTAAATTCTATATAAATCAAATAATCTAGCAGTAGCTGTCATGTTTCTTTATCTCACAACTATGG TAAATTGGATATGATGCAGATCAAGACTTCCCTTCAGGTATTGACGTTACAGCGGGAGACTGACAAGGTAACTATATATT TGTCCACAGTTATCCCAGGTTGACATTGGCTCTAAGTATATCCTAGGTGCACCTTGACCCTGACTATTTGAGATGCAATT AGACCCCAACTTTTGTCCCATATGTGGTCTATTTCTTAATAAAAATGACCTGATAAATCCATGCATGGCATGGGCATACA TGCTAGTTTCCTTGCATATCATGATTTATTTTCTTATTTAATTAGGATTAACAGTCTAATATTTAGCATAAATAAGGATT GTTGTTTTGTCTTTAGCAATAATATCCATTGTAGCATTCACATCAATGTTAATATAATTTTATTATTACAAATATTACTT TCCCCTCTTCTGTATCTAATAGTCTAAATCCAATAACCTTAACACAGGTCATGACTAAAAGACAGAGAACAGCTTTTGCC CCAAATTTTGTTCACTCTCTTGATGGTTCTCACATGATGATGACTGCAGTTGCTTGTAAAAAAGCAGGGTTGAACTTCGC AGGTGCTTACTGGTTTATATAACTGACATACACAGTCATATATGTTGTTTGTCTTTCTGTTTTTATTAGGAATTCAAGTT TTATAAATGAATGCTTGATTGCAGGGGTTCATGATTCATATTGGACACACGCGTGTGATGTTGATGAAATGAATAGGGTA CTGAGGGAAAAGTTTGTTGAACTCTACGAGGCTCCAGTATTGGAAAATGTAAAGTATCTTGCATCTTCTTTTGACAAGCT TCTTCAATTTTGATAAATGCCACTTTCTGGTCCTGCTTTTGTTATTTTTCCTTATTTTCCTGGTTTGGGTCAAATATGCT TTTGAAATTCGGAACACCGCCATTCCTAAGAACTAGATTGCCTTGAACAGAACCTTTACTTCAGTCCACTCTGACATTAT CATTATCACTTATCTTTTATACACAACTGTTGGTCAACTGAGTCATATAGTATAACCTTGTGGATTGCATCCTTTGTTTG CTTCTGAAAGTTCTGATTCTTTCAATAATTGCATATCTTGTAGCGTCTAACCTAACTTTCTACTTGACAAGATCAGTGAA TGTATACAGGTCTCAGAAATTTTTGGTTTATCTGGATGCATATTGTTTTTTAATTTATTGACTCATTATTATTGTCTTGT CTTGTCTTGAATCCCAATTCCCGAATGACTTTGCTGTTTAAGGGTTCCTTGTTTAATCATGAATGCAGTTGTTGGAAAAC TTCCAGAAGACTTTTCCCACATTGAACTTTCCTGCCTTACCAGAGAGGGGAGACTTCGATCTTCGAGAGGTTTTGGAGTC TCCCTACTTTTTCAACTAAACTGAACAGGATCTCCAGTTGCTTTTCTAGTACTAACCTGCGGAGTTCAGCCCAACATGGT GAAATATGTATTATATCTACTTACATGGGATTGTAAAAGCCCCAAGAACAGACATGGAGAAGACACAAGTGCAAATACAG GAACCCAATACTTATCCTATATCTGTTTCGAACAAACGCATTTTCAACCAGGCGAGTCCCATGACAGCTGTGTCTCCCAG ATCAAAGGATATGGGAAATCTCGGGATCTAAGTTAAGATAATTTGTCTGAAAGAAAGCAGGCTCCAAATATGGCTTTCAA ATTGATCCAGAATATTTCTTGGATCAGTTCCAAAGCAAGAAGGTTCCGCATATACAGTAAACACAGATAATAAAGGATTG GAGCACTAGTAATCAATGAGACCAGATCAACCTCTGAGTTCATGATTTGATTTATCAGACTAGTTATGAAAAGGTGATCT TCTCAGATGTGCAAGCTTCAGTCTCCATTGCTTTCCTCTTGTAAAGAAAAGCCTAAATTATTTTTTGTCATGGTTACTGT AATATTTGATCGTACACTGTTCATTATTTGAATTGATAAATGTAAATACCAATAAAAAGGTCAGAGCTTACACACCTCAT TTTCTTTCTCTCATCTCAATTCTACTCTTATTTTTCTCTTCCTATCTCCTCTTATTTTTCTATCCCATCACATATCATAC CACTCTTTTCTCTCTCTTTTCTTCATATATCACTTAGACCATCTCCAATGGTTTCAACATTCAAC
CDS sequence (LotjaGi4g1v0168100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGGGTTTAAAGGCGGCTGCTACTCTTCGCCTCCTACTGTTCTTCAAAATTTTCTCGGGAAATGCTCATTCATTTTC TCATGTCCCAAACACCTTCCACCTGCAACTGAAACTTCATTTCCTCGCTTGCATCACAAACATGTGGACCAACATAGTCA AGCGAACCTCCTCAAGGAAGTTCAAGCAATCCTTCGAATTTCTCTCTTCTTTTTCTTCTCCGCTGAGATTTTCTCAGTAC CCGAATTTTCCCGAGAAAATTGTGCCCCTTGAGGTAAACTCGAGGCACCCATTGCTGGGTTTCAATCAAGTTGGTGCCTT TACTTCGAAAAGCAAATTGGGTCGATCCAAGTTTTTGATTTCTGGGGATCCTTTTTGTTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT CTTCAAGTTCTTTGAAGCTAGCTAGAGGTTATGCTAGCGTTGCTGAGGCTATTGAATCTTCTGATGCCGAATACGATTAT TCTGCGTCTGAGGAGGTGCAGAAATTGTTAGAGGAAATGGTGAAAGAAGAGAAGGAAAAACCTCAATTGGAGCCTGAAAA GAAAATGGATGGAGGCATGACGAGCTATAAGTACAAGATGCTTAAGAAGAGGCAGATTAAAATGGAGACTGAGGCATGGG AAGATGCAGCAAGAGAGTATCAGGAACTGTTGGAGGACATGCGTAAGCAGAAGCTTGCACCCAATTTGCCTTATATGAAG TCATTGTTCCTTGGTTGGTTTGAGCCCTTAAGGAATGCAATTGTTGCTGAACAAGAGCTTTGCAAAGATACCCGGCTTCG GTTGACCCATGGTCCTTATTTCAATGAGTTACCTGCAGACATGATGGCTGTGATCACAATGCACAAGTTGATGGGGTTGT TGATGACCAATACAAATGGGGTGGGCAGTGCTAAAGTGGTCCAAGGTGCTTCACAAATAGGTGAAGCCATTGAACATGAG GCTAGGATATACCGTTTTATGGAGAAGACAAAGAAGAAGACTAAAGCAACTGACAATTGTGAAGGTGAATCTGATCTTGC ACCTGTAAAAAAAGGTAAATTGACTGAAGAGGAGAAAGTGAAACTGGATAAAGAGAAGAAAAGACTCAGGAGAAAGCTTA ATAGTTTAATAAAAAAACAGAAGAACCAACAAGCATTGGGAATAGTCAGGGGACGAGATGATTGGAAGCCTTGGGGACAG GAAGCTCAAGTAAAGGTTGGCTCTTGTTTGATGCAACTGTTGATAGATACAGCCTACATACAACCACCTGCCAATCAAAT TGGAGATGGTCCACCAGATATTCGTCCAGCATTTAAGCATACCCTTAAAAATATTTCAACTGATTCACAGAATGGAAGTA AGAGATATGGTGTCATTGAATGTGACTCGCTGGTTCAACAGGGCCTTGAAAAGTCTGCGAGACACATGGTCATCCCCTAC ATGCCAATGTTGGTTCCACCTAATAACTGGACAGGGTATGACAAAGGAGCATACTTGTTTTTGCCATCATATGTCATGAG AATACATGGAGCAAAGCAGCAGCGTGACGCTGTTAAAAGGGCTCCTGTGACTCAACTCAACCCTGTTTTTGAGGCTCTGA ATACCCTTGGCAGTACCAAATGGAGGGTAAACAAAAGGGTACTTAGTGTGATAGATCAAATATGGGCTAAAGGAGGAGGC CTAGCTGACTTGGTGGACCGTAAAGATGTTCCCCTCCCAGAGGAACTAGATACAGAAGATGAAGCGGAAATTCGAAAATG GAAATGGAGTGTAAAAAATGTCCGAAAAGAGAATAATGAGAGGCATTCACAGCGGTGTGACATAGAACTTAAACTTGCAG TTGCGCGAAAGATGAAGGATGAAGATGGCTTCTACTATCCTCACAATCTTGATTTCCGAGGACGTGCATATCCCATGCAC CCATATTTAAATCATCTTGGTTCTGATTTATGCCGAGGCATACTTGAGTTCGGTGAGGGACGCCCTCTAGGGAAGTCAGG CTTGCACTGGTTGAAAATACATCTGGCAAATTTGTATGCTGGTGGTGTGGACAAGCTATGCTATGATGGTCGAATAGCAT TTACTGAGAACCACCTGGATGATATATTTGATTCTGCAAACAAGCCTCTTGAAGGAAAGCGGTGGTGGTTGGAAGCAGAG GATCCTTTTCAATGCTTGGCAGCTTGTATCAATCTCGCTGAAGCATTGAGAAGCCCCACTCCTGAGACTACAATGTCTCA CATGCCTGTACACCAGGATGGTTCATGCAATGGCTTACAACATTATGCAGCACTTGGGAGGGACAAGTTGGGAGCTGCTG CAGTCAATCTTATTGGTGGAGACCAGCCTGCTGATGTTTATTCAGGAATTGCTACTAGAGTACTTGAAATCATGAGAAGA GATGCAGAGAAAGATCCCAAAACTAACCCAAATGCATTGCATGCTAGGAATTTGATCAACCAGGTGGACCGAAAGTTGGT GAAGCAAACAGTGATGACATCAGTCTATGGAGTGACTTACATTGGGGCCCGAGACCAGATCAAGAGGAGGTTAAAGGAGC GCTGTGCCATCGAGGATGATGCACAGCTGTTTGGTGCTTCCTGCTATGCAGCAAAAACCACCCTTACCGCCTTACAAGAG ATGTTTGAGGCAGCAAGAAGTATTATGGGTTGGCTAGGTGATTGTGCAAAGGTGATAGCTTCCACAAACCAAGCAGTCCG ATGGACCACTCCCCTTGGGCTTCCTGTAGTACAACCTTATCGCCAACACGGAAGGCATCTTATCAAGACTTCCCTTCAGG TATTGACGTTACAGCGGGAGACTGACAAGGTCATGACTAAAAGACAGAGAACAGCTTTTGCCCCAAATTTTGTTCACTCT CTTGATGGTTCTCACATGATGATGACTGCAGTTGCTTGTAAAAAAGCAGGGTTGAACTTCGCAGGGGTTCATGATTCATA TTGGACACACGCGTGTGATGTTGATGAAATGAATAGGGTACTGAGGGAAAAGTTTGTTGAACTCTACGAGGCTCCAGTAT TGGAAAATTTGTTGGAAAACTTCCAGAAGACTTTTCCCACATTGAACTTTCCTGCCTTACCAGAGAGGGGAGACTTCGAT CTTCGAGAGGTTTTGGAGTCTCCCTACTTTTTCAACTAA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0168100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKGLKAAATLRLLLFFKIFSGNAHSFSHVPNTFHLQLKLHFLACITNMWTNIVKRTSSRKFKQSFEFLSSFSSPLRFSQY PNFPEKIVPLEVNSRHPLLGFNQVGAFTSKSKLGRSKFLISGDPFCFSSSSSSSSSSLKLARGYASVAEAIESSDAEYDY SASEEVQKLLEEMVKEEKEKPQLEPEKKMDGGMTSYKYKMLKKRQIKMETEAWEDAAREYQELLEDMRKQKLAPNLPYMK SLFLGWFEPLRNAIVAEQELCKDTRLRLTHGPYFNELPADMMAVITMHKLMGLLMTNTNGVGSAKVVQGASQIGEAIEHE ARIYRFMEKTKKKTKATDNCEGESDLAPVKKGKLTEEEKVKLDKEKKRLRRKLNSLIKKQKNQQALGIVRGRDDWKPWGQ EAQVKVGSCLMQLLIDTAYIQPPANQIGDGPPDIRPAFKHTLKNISTDSQNGSKRYGVIECDSLVQQGLEKSARHMVIPY MPMLVPPNNWTGYDKGAYLFLPSYVMRIHGAKQQRDAVKRAPVTQLNPVFEALNTLGSTKWRVNKRVLSVIDQIWAKGGG LADLVDRKDVPLPEELDTEDEAEIRKWKWSVKNVRKENNERHSQRCDIELKLAVARKMKDEDGFYYPHNLDFRGRAYPMH PYLNHLGSDLCRGILEFGEGRPLGKSGLHWLKIHLANLYAGGVDKLCYDGRIAFTENHLDDIFDSANKPLEGKRWWLEAE DPFQCLAACINLAEALRSPTPETTMSHMPVHQDGSCNGLQHYAALGRDKLGAAAVNLIGGDQPADVYSGIATRVLEIMRR DAEKDPKTNPNALHARNLINQVDRKLVKQTVMTSVYGVTYIGARDQIKRRLKERCAIEDDAQLFGASCYAAKTTLTALQE MFEAARSIMGWLGDCAKVIASTNQAVRWTTPLGLPVVQPYRQHGRHLIKTSLQVLTLQRETDKVMTKRQRTAFAPNFVHS LDGSHMMMTAVACKKAGLNFAGVHDSYWTHACDVDEMNRVLREKFVELYEAPVLENLLENFQKTFPTLNFPALPERGDFD LREVLESPYFFN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 23 | 23 | - | – | |
| SignalP_GRAM_NEGATIVE | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| Phobius | 1 | 5 | 5 | - | – | |
| Phobius | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| Phobius | 6 | 16 | 11 | - | – | |
| Phobius | 17 | 25 | 9 | - | – | |
| Phobius | 26 | 1052 | 1027 | - | – | |
| PANTHER | 49 | 1051 | 1003 | 0.0 | ||
| PANTHER | 49 | 1051 | 1003 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 187 | 536 | 350 | 8.9E-31 | ||
| SUPERFAMILY | 192 | 1052 | 861 | 8.89E-283 | ||
| SMART | 203 | 538 | 336 | 4.4E-121 | ||
| Pfam | 204 | 538 | 335 | 1.0E-82 | ||
| Coils | 210 | 230 | 21 | - | – | |
| Coils | 352 | 386 | 35 | - | – | |
| Gene3D | 539 | 620 | 82 | 1.7E-11 | ||
| Gene3D | 631 | 1037 | 407 | 2.7E-159 | – | |
| Pfam | 661 | 1052 | 392 | 2.4E-159 | ||
| Gene3D | 661 | 743 | 83 | 2.7E-159 | – | |
| ProSitePatterns | 749 | 760 | 12 | - | ||
| Gene3D | 770 | 961 | 192 | 2.7E-159 | – | |
| ProSitePatterns | 822 | 836 | 15 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | DNA binding | Any molecular function by which a gene product interacts selectively and non-covalently with DNA (deoxyribonucleic acid). | ||
| Molecular function | DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity | Catalysis of the reaction: nucleoside triphosphate + RNA(n) = diphosphate + RNA(n+1). Utilizes a DNA template, i.e. the catalysis of DNA-template-directed extension of the 3'-end of an RNA strand by one nucleotide at a time. Can initiate a chain 'de novo'. | ||
| Biological process | Transcription, DNA-templated | The cellular synthesis of RNA on a template of DNA. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0168100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…