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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0173300 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0173300.4 |
Related isoforms 6 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | WD repeat and FYVE domain-containing protein 3; TAIR: AT1G03060.1 BEACH-DOMAIN HOMOLOG A1; Swiss-Prot: sp|F4HZB2|BCHA1_ARATH Protein SPIRRIG; TrEMBL-Plants: tr|I1JF68|I1JF68_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0173300 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:44286675..44302998) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TATTTGACAACACGGAACAAATCACATGCATTCATGGGTGGACATGTAAACTGATTTATAAATTTGGTGGCACATGGCAG CATTGACAGATTTTAGAACATGACTCATCTTGGTTTATTTTTTCAGTCTACTTTTGATTATATTGTATATTAGAATCCAT TTATATTATTATGTATCCAATTTCAAGTTCTTCTTTGTTTCATAATTGGTTAGGACTGATTCTCATGAATTGTTTTTAAT TATGACATGCTTTGGTTATGATGTTAGATGTGGTTGTGACCTTTTCTAGCTTTATATCAGGGATAAACATGAATTGGAAT TGGACTTCAAGAGATTCTGGGAAGAGTTTCGGTCATCCAGCTCTGAGAAGGTTCTCGTTATTACTCTCCTTCTTTGGTGG TCTCATGCATATTTGACCTGCATTAGATGAGGAACTTAAGAGTTGCTAATGCTTTCTCATGCCCTTGCAGGAAAAAGAAG CGGCGTTGAATTTCAGTATAGATGCCTTTTGTAGATTAGTGAACCAGCAAGTGAATGTAGCTCAATTAGTTACCATGTAA AGAAACAATTTCTCCTTAGCTTTGTTGCATTGCTATCTTAATCTACATGCAAAGTGGTAGGAAATGTTTTTGCCTGAGTC ATGGAATTGTTGGGTTTCGACTTTCTAGAAGGATAACCTGATCTATGTTAGACTGTCAGTTGGTTGCAACATGCTTTTTT TGTTGTATGTATTGGCTTTACTGGTGTATGGTGCAATAATGTCACTTGCGTGCTTAGCTTTTATGTTATGATGCTAGGAT ATAAATTAGCATTGACGAAGGTGAAAATGGTGAAATGTATGATGTTATAACTTAAATGGTTATATGCAAAATTGTGGACT TAATGTGGAAACACTCTTGGTGATCAAAGGAACTTCAAACCTGTGGTTGAAGCCCTTTGTGGTGCAAAATGTGAAAAAGG 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0173300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTAGTTGAAACACATATATTCTCTTTTGTTGTGGGAAGAGCATTTGTCACAGATATAGATAAGTTAAAAATTAGCAG CAAAACAAGATCTTTGGATGTTGCTCAAGTTTTAAAGTTTTTCTCTGAAGTCACAAAGGATGACATCAGTCCAGGAGCAA ATTTATTAACTTCAGTGGAAATCCTTGTTTCTGGGCCTATTGACAAACAATCTCTGCTTGACTCTGGGATATTTTGCTGT CTCATTCATGTTCTCAATGCCCTTCTCGACCCTGATGTAACCATTCAACGGCCAAATAGTGCTAGTGATCATGAAGAACA GTTGGTATTGCAAAAAGAGTACAATGGTGATGTTGGGCAAGGCCGCCGGCTAGAGGTAGAGGGAAGCGTCGTGCATATCA TGAAAGCACTCGCAAGCCATCCATCAGCAGCACAGAGTTTGATAGAGGATGATTCTCTTCAGTTACTTTTTCAAACGGTT GCGAAGGGATCCTTGATTGTCTTCTCTCGTTATAAGGAAGGACTTATTCCATTGCACAGCATACAACTTCATAGACATGC TATGCAGATACTGGGTCTTCTTTTGGTCAATGACAACGGGAGCACAGCCAAATACATCCGGAAGCATCATCTGATAAAAG TTCTTTTATCGGCTGTGAAAGATTTTGATCCTGATTGTGGAGATTCTGCGTACGCTGTAGGAATTGTTGACTTGTTACTC AAGTGTGTAGAATTGTCATATAGAGCTGAGGCTGGTGGTGTCAGACTGCGAGAGGATATACATAATGCTCATGGATATCA ATTTCTTGTTCGATTTGCACTAACTCTGTCCAACATGACAAAAAATCAGGGCTTTCAATCTATTCATACATTTGATGACC AAGATGTTGCTTCAGATGGGTCACAAAGCAGCAGAGAACAAAATTCCAGTGGACAAGAAAAGTCCTCCATTCAATATCTT 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GGACGTCTGTGTGGAGATATTTATATCTGCAAGCATGGTGTGATTGGAGAGACTATCCGTTCTATTGGTGGAATGGAACT TGTCCTTGCTCTTGTTGAAGCTGCAGAAACTAGGGATATGCTGCATATGGCCTTGACTCTACTTGCTTGTGCGCTTCATC AAAATCCTCAGAATCTTAAGGACATGCAAACATATAGGGGCTACCATCTGCTTGCTCTTTTTCTCCGCCGTAGAATGTCA TTATTTGACATGCAGTCTCTTGAGATCTTCTTTCAGATTGCTGCTTGTGAAGCATCATTTTCTGAGCCCAAAAAGTTGGA AACTACTCAAACTACTTTGTCCCCTGCAGCATCTCTGCAGGAAGGCAGTCTTGAGGATAATTTTTTGTCAAAGTTTAATG ATGAGAGTTCTTCTATTGGCTCTCATGGAGACATGGATGATTTTTCTGTACAAAAGGATTCATTTAGTCATATTTCAGAG CTGGAAAATACTGATATTGCTGCTGAAACTTCGAATTGCGTTGTCTTGTCAAATGCTGACATGGTTGAACATGTCTTACT GGATTGGACATTGTGGGTAACAGCCTCGGTTTCAATCCAAATTTCATTACTTGGATTTCTTGAAAATTTAGTGTCCATGC ATTGGTACAGAAATCATAATCTTACAGTTTTGCGGCGAATTAACCTTGTTCAACATTTACTAGTGACGTTGCAAAGGGGT GATGTTGAAGTTTCTGTCCTCGAAAAATTGGTTGTGTTGCTTGGGGTCATTCTGGAAGATGGTTTTCTATCTTCCGAGCT TGAAAATGTGGTCAGATTTGTGATTATGACATTTGATCCACCAGGGTTGGTGCCACAACGCCCAATTATGAGAGAGTCAA TGGGGAAACATGTAATTGTCAGAAATATGTTACTAGAGATGCTCATTGATCTACAAGTCACTATTAAATCAGAAGAGTTG 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GCTATACGAACTGCTCAGAGCTTGGATGGTGATAATGCTGATCAAGGATCTGTTGCTTCCAGTGCACATGAATTCAGCTT TCGCAGTATCAAAGGCAATTTGGAAATTACACTGCCAACAGATTCTCAGAGTGCTGCATCTTATACTGTGCTGGACAGTC CTGCCTTTTCAGAAAAGTCCAGTTCTAGAATTCCCCTTACACCTTCTTCATCACCAGTTGTTGCATTGGCATCTTGGCTT GGAAGTGCAAATCATAATGAAGCAAAATCTCCCTTAACTGCTACTCCTTCTTTTGATTCTTCCATGTCAGCCTGGGAGTT TGATCCATCTTCAAACCTGAAGTCTAGTTCTCAAGGGCCATCTGCCGCTAATAATTTCATTGCTGTAACATCAAAGATGC TTTTGGATATAGATGATTCAGGATATGGGGGTGGTCCTTGTTCTGCAGGAGCTACTGCGGTTTTGGATTTCATTGCAGAA GTCCTTGCTGATTTTATGACGGAGCAGGTGAAAGCATCACAGCTCATAGAGAACATCTTGGAAAGTGTTCCTCTTTATGC TGATAGTGAATCTGTGTTGGTTTTCCAAGGCCTATGCCTTAGTAGATTTATAAACTTCCTTGAAAGACGACTATTGCGTG ATGATGAAGAAGAAGAGAAAAAATTGGATAAGATTCGCTGGTCTTCAAATTTAGATGCTTTGTGCTGGATGATAGTGGAT CGTGTATACATGGGTGCATTTCCTCAGCCTTCAGGGGTACTAAAAACTCTGGAGTTCTTGTTGTCAATGTTACAATTGTC CAACAAAGATGGTAGAATTGAAGAAGCTGCTCCTGCTGGAAAGAGGCTCTTATCAATTTCAAGAGGAAGTAAGCAACTTG AGGCTTATATTCATTCGATTCTTAAAAACACTAATCGAATGATATTATATTGCTTCCTTCCATCATTTTTAGTCAGCATA GGGGAAGATGATCTTCTTTCACAGTTGGGTTTGCTCACTGAATCTAAAAAGAGATTATCCGCAACTTCCCCTCAAGATGA TTCAGGAATTGACATATGCACAGTCTTGCAATTATTGGTTGCTCATAGAAGAATTATATTCTGTCCCAGCAATACCGATA CAGATCTTAATTGCTGTTTATCTATGAATCTAATAGCTCTTCTCGGTGATAGAAGACAAAATGTACAGAATAATGCCATT GATGTGTTTAAGTATCTTCTGGTACATAGGAGAGCTGCATTAGAAGACTTACTTATTTCTAAGCCAAATCAAGGGCAGCA ACTTGATGTGCTTCATGGTGGTTTTGATAAATTATTGACTAGAAGTCTATCTGAGTTTTTTGAGTGGCATCAGAATTCTG AACAAACTGTGAATAAGGTATTGGAGCAGTGTGCTGGAATTATGTGGGTGCAGTATATTGCAGGATCAGCAAAGTTTCCA GGAGTAAGAATCAAAGGGATGGAGGGTCGTCGTAAGAGGGAAGTGGGAAGGAAATCTCGAGATGCTGCAAAATTGGACTT ACGACACTGGGAGCAGGTAAATGAGCGAAGATATGCACTGGATTTAGTTCGTGATGCAATGTCCACTGAGTTGAGAGTTG TTAGGCAGGATAAGTATGGGTGGATTCTACATGCTGAGAGTGAGTGGCAATGCCATCTGCAGCAGCTTGTGCATGAACGT GGAATATTCCCTCTCAGTAAACCCTCTTTGACAGAAGAGCCAGAATGGCAACTTTGTCCTATTGAAGGTCCGTATCGAAT GCGGAAAAAACTTGAGTGCTGCAAACCTAAAATTGACACCATACAAAATATTCTTGATGGACAGTTTGAATTAGAGAAAC CAGAGTTGTCTAGAGGAAAAATTGAAAATGGTTCTGATGAATCAGATTCTAAACCTTATTTTCAACTCTTGGCTGATGGG GGCAAACAAAATGTTTCTGGTGGTGAGCTGTTTGAACCGTACTTCAATAAGTTGGGTGGTGTCCAAGATACAGTTTCTGA GAAGAATGAGTGGAATGATGACAAGGCTAGTAGCATCAATGAAGCAAGCCTCCATTCTGCACTTGAGCTAGGTGCCAAAT CTAGTACAGTATCAGTTCCCATAGAAGAAAGCACACAAGGAAGATCTGATATGGGATCTCCAAGGCAATCTTCCTCTGTG AAAGTTGATGATGTTATAGTTGCTGATGATAAGTCTGATAAAGAACTGAATGATAATGGTGAATACTTAATCAGACCATT TCTCGAGCCATTTGAGAAAATCCGATTTAAATATAACTGTGAACGGGTTGTAGGTCTGGACAAACATGATGGTATATTCC TGATAGGTGAATTCTGTTTGTATGTGATAGAAAACTTCTATATTGATGACTCTGGTTGTTTTTGTGAGAAGGATTGTGAA GATGAACTGTCAGTTATTGATCAGGCTTTGGGTGTCAAGAAAGACGTTACTGGCAGTGTAGATTTTCAATCCAAATCAAC TTTGTCATGGAGCACAACAGCTAAGTCATTGGTTGGGGGTAGGGCATGGGCCTATAGTGGTGGCGCTTGGGGCAAGGAGA AAGTACATAGCACTGGAAACTTACCTCATCCTTGGCGCATGTGGAAACTTGATAGTGTTCATGAGATTTTGAAGCGTGAT TACCAGCTTCGTCCTGTTGCTATTGAAATATTTAGCATGGATGGATTTAATGATCTTTTGGTCTTCCACAAAAAAGAGAG AGAAGAAGTTTTTAAAAATCTAGTTGCCATAAATCTTCCACGGAATAGCATGTTGGACAAAACTATTTCAGGATCATCAA AACAAGAAAGCAATGAGGGTAGCCGTCTTTTCAAGACAATGGCAAAATCCTTTTCAAAGAGGTGGCAAAATGGAGAAATA AGCAATTTCCAGTACCTCATGCATCTTAACACATTGGCTGGACGTGGTTATAGTGATCTTACCCAATATCCAGTATTCCC ATGGGTCCTTGCGGATTATGAGAGTAAGAATCTTGATTTTTCCAACCCAAAAACATTTCGCAGGCTTGATAAACCAATGG GATGTCAGACACCTGAAGGTGAAGATGAATTTATAAAAAGATACGAGAGCTGGGATGATCCAGAGGTCCCAAAGTTTCAT TATGGATCCCATTATTCAAGTGCTGGAATTGTTCTATTCTATCTTCTTCGTCTGCCGCCTTTTAGTGCAGAGAATCAAAA ACTACAGGGTGGCCAGTTTGACCATGCTGATCGCCTTTTCAATAGTGTAAGGGATACATGGTTCAGTGCTGCTGGGAAGG GAAATACTTCTGATGTGAAGGAACTGATTCCAGAATTTTTCTACGTGCCTGAGTTCTTGGAGAATCGATTCAACCTTGAC TTGGGAGAGAAACAGTCCGGCGAGAAGGTTGGGGATGTTATCCTTCCTCCATGGGCAAAAGGTAGTCCTCGGGAGTTCAT TAATAGGCATAGGGAAGCCCTTGAATCTGATTATGTCTCAGAAAATTTGCACCACTGGATAGACCTCATTTTTGGCTTTA AGCAAAGAGGGAAGGCTGCTGAAGAAGCAGTTAATGTGTTCTATCACTACACCTATGAAGGGAGTGTGGACATAGACTCA GTCACAGACCCTGCAATGAAAGCATCCATTTTAGCACAAATTAATCATTTTGGGCAGACGCCAAAGCAATTGTTCCTCAA GCCCCATGTGAAAAGGCGGATTGACAGAAAACTTCCTCCCCATCCCCTTAAACATTCCAGTCATCTTGCTTCACATGAGA TTCGCAAAAGTTCTTCACCTATCACTCAAATTGTTAGTCTCAACGATAAAATTCTCATTGCAGGAACAAACAATTTGCTT AAACCGAGAACATATACCAAATATGTTGCTTGGGGCTTTCCTGATCGTAGTTTGAGATTTTTGAGCTATGACCAAGATAG ACTTATTTCAACACATGAAAATTTACATGGAGGTAATCAAATTCAGTGTGCTAGTGTTAGCCATGATGGTCAGATTCTTG TTACTGGGGCTGATGATGGTCTAGTTAATGTTTGGAGAGTTACTAAGTTTGGGCCCCGTGCCATAAGGCGCTTGAAACTG GAGAAGCCACTTTGTGGGCATACAGCCAGAATCACATGCCTTCAAGTTAGCCAGCCTTACATGCTTATTGTGAGTGGATC GGATGATTGCACAGTTATTATATGGGATCTCAGTTCCATGGCATTTGTACGGCAGCTCCCAGAATTCCCAGCACCTGTTT CAGCAGTTTTTGTTAATGACTTGTCGGGAGAAATTGTTACAGCAGCTGGTATTCTTCTTGCAGTTTGGAGTATCAATGGG GATTGTCTGGCAATGATCTACACATCACAACTTCCATCTGATTCTATTCTCTCAGTAACTGGAAGTACAATTTCTGATTG GCAGGACACGATGTGGTATGCAACAGGTCATCAGAGTGGAGCTGTAAAAGTGTGGCAAATGGTTCACTGCTCTGACCCAG ATAGCTCCCTCAGCAAATCAGGTTCTGGTGGGTTGGCAGGGTTAAATTTTGGTACAAAAGAACCAGAATACAAATTGATC CTGCGCAAAGTACTTAAGTTCCATAAACATCCTGTTACTGCCCTGCACCTCTCGGCCGATCTGAAACAGTTTTTGAGTGG GGATTCGGGTGGGCATTTGCTTTCATGGACACTACCGGATGAGAGTCTGCGAGGTTCATTGAATCAGGGGTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0173300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLVETHIFSFVVGRAFVTDIDKLKISSKTRSLDVAQVLKFFSEVTKDDISPGANLLTSVEILVSGPIDKQSLLDSGIFCC LIHVLNALLDPDVTIQRPNSASDHEEQLVLQKEYNGDVGQGRRLEVEGSVVHIMKALASHPSAAQSLIEDDSLQLLFQTV AKGSLIVFSRYKEGLIPLHSIQLHRHAMQILGLLLVNDNGSTAKYIRKHHLIKVLLSAVKDFDPDCGDSAYAVGIVDLLL KCVELSYRAEAGGVRLREDIHNAHGYQFLVRFALTLSNMTKNQGFQSIHTFDDQDVASDGSQSSREQNSSGQEKSSIQYL SPTLSRLLDVLVSLAQTGPNESPRNYGGKGSKSSQNKGGGHSKTRTLSSDWLGDELWDKDNDKIKDLEAVQMLQDILLKA SNRELQAEVLNRLFKIFSGHLDNYKLCQQLRTVPLLILNMAGFPSSLQEIILKILEYAVTVVNCVPEQELLSLCCLLQQP ITSELKQTILSFFVKLLSFDQQYKKVLREVGILEVMLDDLKQHRILSPDQQNVNSNQLDKKNGSSSFKKHLGNKDVIITS PKLMESGSGKFPIFDVEGTIAIAWDCMVSLLKKAEGNQAAFRSASGVTAMLPFLVSDVHRPGVLRILSCLIIEDTSQVHS EELGVLVEILKSGMVTSALGSQYRLSHDAICDTMGALWRILGVNNSAQKIFGEATGFSLLLTTLHGFQSDGGDFDQSSLN VYIKVLTYLLRVVTAGVSDNAVNRMKLHAIISSQTFFDLLCESGLLCVEHEKQVIQLMLELALEIVIPPFLASEGLTKSN TIENESSHYLLLTPSGPINPDKERVYNAGAIKILIRSLLLFTPMVQLKLLELIEKLARAGPFNQESLTSVGCVELLLETV HPFLLGSSSLLSYALRIVEVLGSYRLSASEFGMLIRYVLQMRMKISGNMIVEMMEKLILMEDMASENISLAPFMEMDMSK IGHAAIQVSLGERSWPPAAGYSFVCWFQFQNFLKSQSKDTDPSKCVPSKKRSGSNALHERHILRIFSVGATNNDDATYAE LYLQEDGVLTLATSNSSFLSFSGLELEEGRWHHLAVIHSKPNALAGLFQASVAYVYLNGKLRHTGKLGYSPSPPGKPLQV TIGTSVGKARVSDFKWKLRSCYLFEEVLTPGCICFMYILGRGYRGLFQDTDLLQFVPNQACGGGSMAILDSLDADLTLVA NGQRVDATSRQGDLKADGSGIVWDLERLGNLSLQLAGKKLIFAFDGTSTEFIRSSGSFSVLNLVDPMSAAASPIGGIPRF GRLCGDIYICKHGVIGETIRSIGGMELVLALVEAAETRDMLHMALTLLACALHQNPQNLKDMQTYRGYHLLALFLRRRMS LFDMQSLEIFFQIAACEASFSEPKKLETTQTTLSPAASLQEGSLEDNFLSKFNDESSSIGSHGDMDDFSVQKDSFSHISE LENTDIAAETSNCVVLSNADMVEHVLLDWTLWVTASVSIQISLLGFLENLVSMHWYRNHNLTVLRRINLVQHLLVTLQRG DVEVSVLEKLVVLLGVILEDGFLSSELENVVRFVIMTFDPPGLVPQRPIMRESMGKHVIVRNMLLEMLIDLQVTIKSEEL LEQWHKVVSSKLITYFLDEAVHPTSMRWIMTLLGVCLTSSPTFALKFRTGGGYQGLVRVLPSFYDSPDIYYILFCLIFGK PVYPRLPEVRMLDFHALMPSDGSYIELKFVELLDSVVAMAKTTFDRVSMQSMLAHQTGNLSQVGASLVAELVEGNSDMAG ELQGEALMHKTYAARLMGGEASAPAAATSVLRFMVDLAKMCPPFTTVCRRAEFLESCIDLYFSCVRAAHAVKMAKELSSV TEEKTLIDGDDTCSSQNTFSSLPLDQDQSVKTSISLGSFPQGQVSTSSDDMAAPGNSMAGERSENNVTASELESNRSVRD AIRTAQSLDGDNADQGSVASSAHEFSFRSIKGNLEITLPTDSQSAASYTVLDSPAFSEKSSSRIPLTPSSSPVVALASWL GSANHNEAKSPLTATPSFDSSMSAWEFDPSSNLKSSSQGPSAANNFIAVTSKMLLDIDDSGYGGGPCSAGATAVLDFIAE VLADFMTEQVKASQLIENILESVPLYADSESVLVFQGLCLSRFINFLERRLLRDDEEEEKKLDKIRWSSNLDALCWMIVD RVYMGAFPQPSGVLKTLEFLLSMLQLSNKDGRIEEAAPAGKRLLSISRGSKQLEAYIHSILKNTNRMILYCFLPSFLVSI GEDDLLSQLGLLTESKKRLSATSPQDDSGIDICTVLQLLVAHRRIIFCPSNTDTDLNCCLSMNLIALLGDRRQNVQNNAI DVFKYLLVHRRAALEDLLISKPNQGQQLDVLHGGFDKLLTRSLSEFFEWHQNSEQTVNKVLEQCAGIMWVQYIAGSAKFP GVRIKGMEGRRKREVGRKSRDAAKLDLRHWEQVNERRYALDLVRDAMSTELRVVRQDKYGWILHAESEWQCHLQQLVHER GIFPLSKPSLTEEPEWQLCPIEGPYRMRKKLECCKPKIDTIQNILDGQFELEKPELSRGKIENGSDESDSKPYFQLLADG GKQNVSGGELFEPYFNKLGGVQDTVSEKNEWNDDKASSINEASLHSALELGAKSSTVSVPIEESTQGRSDMGSPRQSSSV KVDDVIVADDKSDKELNDNGEYLIRPFLEPFEKIRFKYNCERVVGLDKHDGIFLIGEFCLYVIENFYIDDSGCFCEKDCE DELSVIDQALGVKKDVTGSVDFQSKSTLSWSTTAKSLVGGRAWAYSGGAWGKEKVHSTGNLPHPWRMWKLDSVHEILKRD YQLRPVAIEIFSMDGFNDLLVFHKKEREEVFKNLVAINLPRNSMLDKTISGSSKQESNEGSRLFKTMAKSFSKRWQNGEI SNFQYLMHLNTLAGRGYSDLTQYPVFPWVLADYESKNLDFSNPKTFRRLDKPMGCQTPEGEDEFIKRYESWDDPEVPKFH YGSHYSSAGIVLFYLLRLPPFSAENQKLQGGQFDHADRLFNSVRDTWFSAAGKGNTSDVKELIPEFFYVPEFLENRFNLD LGEKQSGEKVGDVILPPWAKGSPREFINRHREALESDYVSENLHHWIDLIFGFKQRGKAAEEAVNVFYHYTYEGSVDIDS VTDPAMKASILAQINHFGQTPKQLFLKPHVKRRIDRKLPPHPLKHSSHLASHEIRKSSSPITQIVSLNDKILIAGTNNLL KPRTYTKYVAWGFPDRSLRFLSYDQDRLISTHENLHGGNQIQCASVSHDGQILVTGADDGLVNVWRVTKFGPRAIRRLKL EKPLCGHTARITCLQVSQPYMLIVSGSDDCTVIIWDLSSMAFVRQLPEFPAPVSAVFVNDLSGEIVTAAGILLAVWSING DCLAMIYTSQLPSDSILSVTGSTISDWQDTMWYATGHQSGAVKVWQMVHCSDPDSSLSKSGSGGLAGLNFGTKEPEYKLI LRKVLKFHKHPVTALHLSADLKQFLSGDSGGHLLSWTLPDESLRGSLNQG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 3480 | 3480 | 0.0 | – | |
MobiDBLite | 294 | 316 | 23 | - | – | |
MobiDBLite | 338 | 366 | 29 | - | – | |
SUPERFAMILY | 384 | 886 | 503 | 4.13E-6 | ||
SUPERFAMILY | 1024 | 1169 | 146 | 1.69E-10 | ||
Pfam | 1027 | 1151 | 125 | 2.7E-7 | – | |
MobiDBLite | 1876 | 1918 | 43 | - | – | |
MobiDBLite | 2616 | 2641 | 26 | - | – | |
MobiDBLite | 2616 | 2640 | 25 | - | – | |
ProSiteProfiles | 2669 | 2835 | 167 | 29.407 | ||
SUPERFAMILY | 2672 | 2837 | 166 | 3.81E-17 | – | |
CDD | 2672 | 2836 | 165 | 2.31686E-26 | ||
Pfam | 2775 | 2834 | 60 | 1.1E-8 | ||
ProSiteProfiles | 2860 | 3152 | 293 | 136.471 | ||
Gene3D | 2863 | 3152 | 290 | 4.1E-132 | ||
SUPERFAMILY | 2870 | 3152 | 283 | 4.32E-121 | ||
SMART | 2872 | 3152 | 281 | 1.4E-202 | ||
CDD | 2873 | 3152 | 280 | 7.82803E-151 | ||
Pfam | 2873 | 3152 | 280 | 8.0E-120 | ||
Gene3D | 3203 | 3488 | 286 | 4.3E-32 | ||
SUPERFAMILY | 3205 | 3487 | 283 | 7.51E-34 | ||
SMART | 3225 | 3266 | 42 | 0.0023 | ||
ProSiteProfiles | 3234 | 3325 | 92 | 15.267 | ||
Pfam | 3236 | 3265 | 30 | 0.015 | ||
ProSiteProfiles | 3241 | 3267 | 27 | 9.071 | ||
SMART | 3277 | 3316 | 40 | 4.0E-7 | ||
Pfam | 3282 | 3316 | 35 | 7.0E-5 | ||
ProSiteProfiles | 3284 | 3325 | 42 | 13.182 | ||
ProSitePatterns | 3303 | 3317 | 15 | - | ||
SMART | 3369 | 3406 | 38 | 460.0 | ||
SMART | 3438 | 3477 | 40 | 0.75 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0173300.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…