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LotjaGi5g1v0173300.4

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi5g1v0173300
Transcript ID LotjaGi5g1v0173300.4
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description WD repeat and FYVE domain-containing protein 3; TAIR: AT1G03060.1 BEACH-DOMAIN HOMOLOG A1; Swiss-Prot: sp|F4HZB2|BCHA1_ARATH Protein SPIRRIG; TrEMBL-Plants: tr|I1JF68|I1JF68_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0173300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr5:44286675..44302998) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TATTTGACAACACGGAACAAATCACATGCATTCATGGGTGGACATGTAAACTGATTTATAAATTTGGTGGCACATGGCAG CATTGACAGATTTTAGAACATGACTCATCTTGGTTTATTTTTTCAGTCTACTTTTGATTATATTGTATATTAGAATCCAT TTATATTATTATGTATCCAATTTCAAGTTCTTCTTTGTTTCATAATTGGTTAGGACTGATTCTCATGAATTGTTTTTAAT TATGACATGCTTTGGTTATGATGTTAGATGTGGTTGTGACCTTTTCTAGCTTTATATCAGGGATAAACATGAATTGGAAT TGGACTTCAAGAGATTCTGGGAAGAGTTTCGGTCATCCAGCTCTGAGAAGGTTCTCGTTATTACTCTCCTTCTTTGGTGG TCTCATGCATATTTGACCTGCATTAGATGAGGAACTTAAGAGTTGCTAATGCTTTCTCATGCCCTTGCAGGAAAAAGAAG CGGCGTTGAATTTCAGTATAGATGCCTTTTGTAGATTAGTGAACCAGCAAGTGAATGTAGCTCAATTAGTTACCATGTAA AGAAACAATTTCTCCTTAGCTTTGTTGCATTGCTATCTTAATCTACATGCAAAGTGGTAGGAAATGTTTTTGCCTGAGTC ATGGAATTGTTGGGTTTCGACTTTCTAGAAGGATAACCTGATCTATGTTAGACTGTCAGTTGGTTGCAACATGCTTTTTT TGTTGTATGTATTGGCTTTACTGGTGTATGGTGCAATAATGTCACTTGCGTGCTTAGCTTTTATGTTATGATGCTAGGAT ATAAATTAGCATTGACGAAGGTGAAAATGGTGAAATGTATGATGTTATAACTTAAATGGTTATATGCAAAATTGTGGACT TAATGTGGAAACACTCTTGGTGATCAAAGGAACTTCAAACCTGTGGTTGAAGCCCTTTGTGGTGCAAAATGTGAAAAAGG 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0173300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTTAGTTGAAACACATATATTCTCTTTTGTTGTGGGAAGAGCATTTGTCACAGATATAGATAAGTTAAAAATTAGCAG CAAAACAAGATCTTTGGATGTTGCTCAAGTTTTAAAGTTTTTCTCTGAAGTCACAAAGGATGACATCAGTCCAGGAGCAA ATTTATTAACTTCAGTGGAAATCCTTGTTTCTGGGCCTATTGACAAACAATCTCTGCTTGACTCTGGGATATTTTGCTGT CTCATTCATGTTCTCAATGCCCTTCTCGACCCTGATGTAACCATTCAACGGCCAAATAGTGCTAGTGATCATGAAGAACA GTTGGTATTGCAAAAAGAGTACAATGGTGATGTTGGGCAAGGCCGCCGGCTAGAGGTAGAGGGAAGCGTCGTGCATATCA TGAAAGCACTCGCAAGCCATCCATCAGCAGCACAGAGTTTGATAGAGGATGATTCTCTTCAGTTACTTTTTCAAACGGTT GCGAAGGGATCCTTGATTGTCTTCTCTCGTTATAAGGAAGGACTTATTCCATTGCACAGCATACAACTTCATAGACATGC TATGCAGATACTGGGTCTTCTTTTGGTCAATGACAACGGGAGCACAGCCAAATACATCCGGAAGCATCATCTGATAAAAG TTCTTTTATCGGCTGTGAAAGATTTTGATCCTGATTGTGGAGATTCTGCGTACGCTGTAGGAATTGTTGACTTGTTACTC AAGTGTGTAGAATTGTCATATAGAGCTGAGGCTGGTGGTGTCAGACTGCGAGAGGATATACATAATGCTCATGGATATCA ATTTCTTGTTCGATTTGCACTAACTCTGTCCAACATGACAAAAAATCAGGGCTTTCAATCTATTCATACATTTGATGACC AAGATGTTGCTTCAGATGGGTCACAAAGCAGCAGAGAACAAAATTCCAGTGGACAAGAAAAGTCCTCCATTCAATATCTT TCACCCACATTATCTAGGTTGCTAGATGTTCTTGTTAGTCTAGCTCAAACTGGGCCAAATGAGTCTCCACGTAACTATGG CGGCAAAGGTTCTAAATCTTCTCAGAACAAGGGTGGTGGTCATAGCAAAACTCGTACCTTATCTAGTGATTGGCTTGGTG ATGAATTATGGGATAAGGACAATGATAAAATTAAGGACCTTGAAGCAGTCCAGATGTTACAAGATATTCTCCTCAAAGCC AGTAATCGGGAGTTGCAGGCCGAAGTATTAAATAGACTGTTTAAAATTTTTTCAGGTCATCTAGATAACTATAAGTTGTG TCAACAGTTAAGAACTGTTCCTCTTTTAATCCTAAATATGGCTGGTTTTCCTTCTTCTTTGCAAGAGATAATCTTGAAAA TTCTTGAGTATGCTGTGACTGTTGTAAATTGTGTTCCTGAGCAAGAATTACTTTCACTTTGCTGCTTATTGCAGCAACCA ATTACATCTGAGTTGAAGCAGACAATACTTTCGTTCTTCGTAAAACTCTTGTCCTTTGACCAACAGTACAAGAAAGTTTT GCGAGAAGTTGGTATTTTGGAAGTTATGTTAGATGATTTGAAGCAACACAGGATTTTGAGTCCAGATCAACAGAATGTCA ACTCCAACCAGTTGGATAAGAAAAACGGCTCAAGCAGCTTCAAGAAGCATCTGGGCAATAAGGATGTTATTATTACTTCA CCCAAGCTTATGGAATCAGGTTCTGGGAAATTCCCTATTTTTGACGTTGAAGGTACTATTGCCATTGCATGGGACTGCAT GGTATCTTTATTGAAGAAAGCTGAGGGTAATCAAGCTGCATTTCGCTCAGCTAGTGGTGTGACTGCCATGCTACCTTTTC TGGTGTCTGATGTGCATCGTCCTGGGGTCCTCAGGATATTATCATGTCTTATAATTGAAGATACCTCACAGGTTCATTCC GAAGAGTTAGGTGTGTTGGTTGAAATTTTGAAAAGTGGAATGGTGACCAGTGCTTTGGGATCCCAATACCGGCTTTCCCA TGATGCAATATGTGACACAATGGGAGCATTGTGGCGGATCCTTGGAGTTAATAACTCTGCTCAGAAGATTTTTGGTGAAG CCACCGGTTTTTCTCTTTTGCTTACTACACTCCATGGGTTCCAAAGTGATGGTGGGGACTTTGACCAATCTTCATTGAAT GTTTACATAAAGGTTCTAACATATTTGTTGCGTGTTGTGACTGCTGGAGTGTCAGACAATGCTGTTAATAGAATGAAGCT TCATGCAATTATATCATCACAAACTTTCTTTGATCTTCTATGTGAGTCTGGCTTACTTTGTGTTGAGCATGAAAAACAAG TCATCCAGTTGATGTTGGAGCTTGCCCTTGAAATAGTGATTCCACCTTTCTTAGCATCAGAGGGTTTGACAAAATCAAAT ACAATCGAGAATGAGTCTTCTCATTATCTTTTACTGACTCCATCAGGTCCAATTAATCCTGATAAAGAGCGAGTGTACAA TGCTGGGGCTATTAAGATTCTGATTCGCTCATTGTTGCTGTTTACTCCTATGGTGCAGCTAAAACTTTTAGAGTTAATTG AAAAGTTGGCTCGTGCTGGCCCTTTTAATCAGGAAAGCCTCACCTCCGTAGGTTGTGTGGAACTTTTGCTGGAGACAGTC CACCCTTTTCTACTTGGTTCATCTTCATTACTTTCTTATGCATTGAGGATTGTGGAAGTCCTTGGTTCCTACAGGCTATC TGCATCTGAATTTGGCATGCTCATCAGATACGTTCTGCAAATGAGGATGAAAATTTCTGGTAATATGATTGTGGAAATGA TGGAAAAATTAATTCTGATGGAAGATATGGCCTCAGAAAATATCTCCCTAGCACCGTTTATGGAGATGGATATGAGCAAG ATTGGGCATGCTGCTATTCAGGTTTCATTGGGTGAAAGATCATGGCCTCCAGCTGCTGGTTATTCATTTGTTTGTTGGTT CCAGTTCCAAAATTTTTTAAAATCACAATCAAAAGACACTGACCCTTCAAAATGTGTCCCTTCCAAGAAGCGCTCTGGCT CAAATGCACTGCATGAGCGACATATCTTAAGGATATTTTCTGTTGGTGCTACTAACAACGATGATGCAACCTATGCTGAA CTTTATCTACAGGAGGATGGTGTTCTAACACTTGCAACCAGCAACTCTTCATTCTTATCATTTTCTGGTTTAGAACTTGA GGAAGGACGGTGGCATCATCTTGCAGTAATTCACAGCAAACCAAATGCTCTTGCTGGGCTGTTTCAAGCTAGTGTTGCAT ATGTTTATCTAAATGGAAAACTTAGACACACTGGAAAATTAGGATATTCACCCTCCCCACCTGGTAAACCACTGCAAGTC ACAATCGGTACATCAGTTGGAAAGGCTAGAGTCAGCGACTTTAAATGGAAACTACGCTCTTGCTATCTTTTTGAGGAAGT GCTTACACCAGGCTGTATATGTTTTATGTATATACTTGGTAGAGGATATAGAGGACTCTTCCAGGACACAGATCTTCTGC AATTCGTACCTAACCAGGCTTGTGGTGGTGGTAGTATGGCCATATTAGATTCTTTAGATGCTGATTTGACTTTGGTTGCT AATGGTCAGAGAGTGGATGCTACCAGCAGGCAGGGAGATCTAAAGGCAGATGGGAGTGGAATTGTCTGGGATTTGGAGAG ACTTGGAAACCTTTCTTTACAGCTTGCAGGAAAGAAGCTAATTTTTGCATTTGATGGAACTTCGACTGAATTTATTCGGT CGTCAGGTAGTTTTTCAGTGCTCAATCTGGTTGATCCTATGTCAGCTGCTGCTTCTCCTATTGGAGGTATTCCACGTTTT GGACGTCTGTGTGGAGATATTTATATCTGCAAGCATGGTGTGATTGGAGAGACTATCCGTTCTATTGGTGGAATGGAACT TGTCCTTGCTCTTGTTGAAGCTGCAGAAACTAGGGATATGCTGCATATGGCCTTGACTCTACTTGCTTGTGCGCTTCATC AAAATCCTCAGAATCTTAAGGACATGCAAACATATAGGGGCTACCATCTGCTTGCTCTTTTTCTCCGCCGTAGAATGTCA TTATTTGACATGCAGTCTCTTGAGATCTTCTTTCAGATTGCTGCTTGTGAAGCATCATTTTCTGAGCCCAAAAAGTTGGA AACTACTCAAACTACTTTGTCCCCTGCAGCATCTCTGCAGGAAGGCAGTCTTGAGGATAATTTTTTGTCAAAGTTTAATG ATGAGAGTTCTTCTATTGGCTCTCATGGAGACATGGATGATTTTTCTGTACAAAAGGATTCATTTAGTCATATTTCAGAG CTGGAAAATACTGATATTGCTGCTGAAACTTCGAATTGCGTTGTCTTGTCAAATGCTGACATGGTTGAACATGTCTTACT GGATTGGACATTGTGGGTAACAGCCTCGGTTTCAATCCAAATTTCATTACTTGGATTTCTTGAAAATTTAGTGTCCATGC ATTGGTACAGAAATCATAATCTTACAGTTTTGCGGCGAATTAACCTTGTTCAACATTTACTAGTGACGTTGCAAAGGGGT GATGTTGAAGTTTCTGTCCTCGAAAAATTGGTTGTGTTGCTTGGGGTCATTCTGGAAGATGGTTTTCTATCTTCCGAGCT TGAAAATGTGGTCAGATTTGTGATTATGACATTTGATCCACCAGGGTTGGTGCCACAACGCCCAATTATGAGAGAGTCAA TGGGGAAACATGTAATTGTCAGAAATATGTTACTAGAGATGCTCATTGATCTACAAGTCACTATTAAATCAGAAGAGTTG CTTGAGCAATGGCATAAAGTTGTTTCTTCGAAGTTAATTACATATTTTCTTGATGAAGCAGTTCATCCCACAAGTATGAG ATGGATCATGACTCTACTTGGTGTGTGTCTTACGTCCTCTCCAACATTTGCACTTAAATTTCGCACTGGTGGAGGTTATC AAGGTTTAGTTCGGGTGCTCCCCAGTTTCTATGATTCCCCAGACATCTATTATATTTTGTTCTGTTTGATATTTGGCAAG CCAGTTTATCCTAGGTTACCAGAGGTCCGCATGTTGGACTTTCACGCCCTTATGCCAAGTGATGGAAGTTATATAGAACT TAAGTTTGTCGAATTGTTGGATTCTGTGGTTGCTATGGCAAAAACTACTTTTGATAGAGTAAGCATGCAATCAATGCTTG CCCACCAAACTGGTAACCTTTCCCAGGTTGGTGCAAGCCTTGTAGCTGAGCTTGTAGAGGGAAATTCAGACATGGCTGGT GAGCTTCAGGGGGAGGCTCTGATGCACAAGACATATGCCGCTCGCCTTATGGGTGGTGAGGCATCAGCCCCTGCTGCTGC AACTTCAGTTCTAAGATTTATGGTCGATCTCGCGAAAATGTGTCCCCCTTTTACTACTGTTTGTAGACGTGCAGAATTTC TTGAGAGCTGCATTGACCTGTATTTTTCTTGTGTGAGGGCTGCCCATGCTGTTAAAATGGCTAAAGAACTCTCCTCAGTC ACAGAAGAAAAAACCTTGATTGATGGTGATGATACTTGCAGTTCCCAAAATACATTTTCTAGCTTGCCACTTGATCAGGA TCAGTCTGTTAAAACATCTATCAGTCTTGGAAGCTTTCCTCAAGGGCAGGTAAGTACAAGTTCTGATGATATGGCTGCAC CAGGAAATTCTATGGCTGGGGAGAGATCAGAGAATAATGTTACTGCATCTGAGCTGGAGTCAAATAGATCTGTCCGTGAC GCTATACGAACTGCTCAGAGCTTGGATGGTGATAATGCTGATCAAGGATCTGTTGCTTCCAGTGCACATGAATTCAGCTT TCGCAGTATCAAAGGCAATTTGGAAATTACACTGCCAACAGATTCTCAGAGTGCTGCATCTTATACTGTGCTGGACAGTC CTGCCTTTTCAGAAAAGTCCAGTTCTAGAATTCCCCTTACACCTTCTTCATCACCAGTTGTTGCATTGGCATCTTGGCTT GGAAGTGCAAATCATAATGAAGCAAAATCTCCCTTAACTGCTACTCCTTCTTTTGATTCTTCCATGTCAGCCTGGGAGTT TGATCCATCTTCAAACCTGAAGTCTAGTTCTCAAGGGCCATCTGCCGCTAATAATTTCATTGCTGTAACATCAAAGATGC TTTTGGATATAGATGATTCAGGATATGGGGGTGGTCCTTGTTCTGCAGGAGCTACTGCGGTTTTGGATTTCATTGCAGAA GTCCTTGCTGATTTTATGACGGAGCAGGTGAAAGCATCACAGCTCATAGAGAACATCTTGGAAAGTGTTCCTCTTTATGC TGATAGTGAATCTGTGTTGGTTTTCCAAGGCCTATGCCTTAGTAGATTTATAAACTTCCTTGAAAGACGACTATTGCGTG ATGATGAAGAAGAAGAGAAAAAATTGGATAAGATTCGCTGGTCTTCAAATTTAGATGCTTTGTGCTGGATGATAGTGGAT CGTGTATACATGGGTGCATTTCCTCAGCCTTCAGGGGTACTAAAAACTCTGGAGTTCTTGTTGTCAATGTTACAATTGTC CAACAAAGATGGTAGAATTGAAGAAGCTGCTCCTGCTGGAAAGAGGCTCTTATCAATTTCAAGAGGAAGTAAGCAACTTG AGGCTTATATTCATTCGATTCTTAAAAACACTAATCGAATGATATTATATTGCTTCCTTCCATCATTTTTAGTCAGCATA GGGGAAGATGATCTTCTTTCACAGTTGGGTTTGCTCACTGAATCTAAAAAGAGATTATCCGCAACTTCCCCTCAAGATGA TTCAGGAATTGACATATGCACAGTCTTGCAATTATTGGTTGCTCATAGAAGAATTATATTCTGTCCCAGCAATACCGATA CAGATCTTAATTGCTGTTTATCTATGAATCTAATAGCTCTTCTCGGTGATAGAAGACAAAATGTACAGAATAATGCCATT GATGTGTTTAAGTATCTTCTGGTACATAGGAGAGCTGCATTAGAAGACTTACTTATTTCTAAGCCAAATCAAGGGCAGCA ACTTGATGTGCTTCATGGTGGTTTTGATAAATTATTGACTAGAAGTCTATCTGAGTTTTTTGAGTGGCATCAGAATTCTG AACAAACTGTGAATAAGGTATTGGAGCAGTGTGCTGGAATTATGTGGGTGCAGTATATTGCAGGATCAGCAAAGTTTCCA GGAGTAAGAATCAAAGGGATGGAGGGTCGTCGTAAGAGGGAAGTGGGAAGGAAATCTCGAGATGCTGCAAAATTGGACTT ACGACACTGGGAGCAGGTAAATGAGCGAAGATATGCACTGGATTTAGTTCGTGATGCAATGTCCACTGAGTTGAGAGTTG TTAGGCAGGATAAGTATGGGTGGATTCTACATGCTGAGAGTGAGTGGCAATGCCATCTGCAGCAGCTTGTGCATGAACGT GGAATATTCCCTCTCAGTAAACCCTCTTTGACAGAAGAGCCAGAATGGCAACTTTGTCCTATTGAAGGTCCGTATCGAAT GCGGAAAAAACTTGAGTGCTGCAAACCTAAAATTGACACCATACAAAATATTCTTGATGGACAGTTTGAATTAGAGAAAC CAGAGTTGTCTAGAGGAAAAATTGAAAATGGTTCTGATGAATCAGATTCTAAACCTTATTTTCAACTCTTGGCTGATGGG GGCAAACAAAATGTTTCTGGTGGTGAGCTGTTTGAACCGTACTTCAATAAGTTGGGTGGTGTCCAAGATACAGTTTCTGA GAAGAATGAGTGGAATGATGACAAGGCTAGTAGCATCAATGAAGCAAGCCTCCATTCTGCACTTGAGCTAGGTGCCAAAT CTAGTACAGTATCAGTTCCCATAGAAGAAAGCACACAAGGAAGATCTGATATGGGATCTCCAAGGCAATCTTCCTCTGTG AAAGTTGATGATGTTATAGTTGCTGATGATAAGTCTGATAAAGAACTGAATGATAATGGTGAATACTTAATCAGACCATT TCTCGAGCCATTTGAGAAAATCCGATTTAAATATAACTGTGAACGGGTTGTAGGTCTGGACAAACATGATGGTATATTCC TGATAGGTGAATTCTGTTTGTATGTGATAGAAAACTTCTATATTGATGACTCTGGTTGTTTTTGTGAGAAGGATTGTGAA GATGAACTGTCAGTTATTGATCAGGCTTTGGGTGTCAAGAAAGACGTTACTGGCAGTGTAGATTTTCAATCCAAATCAAC TTTGTCATGGAGCACAACAGCTAAGTCATTGGTTGGGGGTAGGGCATGGGCCTATAGTGGTGGCGCTTGGGGCAAGGAGA AAGTACATAGCACTGGAAACTTACCTCATCCTTGGCGCATGTGGAAACTTGATAGTGTTCATGAGATTTTGAAGCGTGAT TACCAGCTTCGTCCTGTTGCTATTGAAATATTTAGCATGGATGGATTTAATGATCTTTTGGTCTTCCACAAAAAAGAGAG AGAAGAAGTTTTTAAAAATCTAGTTGCCATAAATCTTCCACGGAATAGCATGTTGGACAAAACTATTTCAGGATCATCAA AACAAGAAAGCAATGAGGGTAGCCGTCTTTTCAAGACAATGGCAAAATCCTTTTCAAAGAGGTGGCAAAATGGAGAAATA AGCAATTTCCAGTACCTCATGCATCTTAACACATTGGCTGGACGTGGTTATAGTGATCTTACCCAATATCCAGTATTCCC ATGGGTCCTTGCGGATTATGAGAGTAAGAATCTTGATTTTTCCAACCCAAAAACATTTCGCAGGCTTGATAAACCAATGG GATGTCAGACACCTGAAGGTGAAGATGAATTTATAAAAAGATACGAGAGCTGGGATGATCCAGAGGTCCCAAAGTTTCAT TATGGATCCCATTATTCAAGTGCTGGAATTGTTCTATTCTATCTTCTTCGTCTGCCGCCTTTTAGTGCAGAGAATCAAAA ACTACAGGGTGGCCAGTTTGACCATGCTGATCGCCTTTTCAATAGTGTAAGGGATACATGGTTCAGTGCTGCTGGGAAGG GAAATACTTCTGATGTGAAGGAACTGATTCCAGAATTTTTCTACGTGCCTGAGTTCTTGGAGAATCGATTCAACCTTGAC TTGGGAGAGAAACAGTCCGGCGAGAAGGTTGGGGATGTTATCCTTCCTCCATGGGCAAAAGGTAGTCCTCGGGAGTTCAT TAATAGGCATAGGGAAGCCCTTGAATCTGATTATGTCTCAGAAAATTTGCACCACTGGATAGACCTCATTTTTGGCTTTA AGCAAAGAGGGAAGGCTGCTGAAGAAGCAGTTAATGTGTTCTATCACTACACCTATGAAGGGAGTGTGGACATAGACTCA GTCACAGACCCTGCAATGAAAGCATCCATTTTAGCACAAATTAATCATTTTGGGCAGACGCCAAAGCAATTGTTCCTCAA GCCCCATGTGAAAAGGCGGATTGACAGAAAACTTCCTCCCCATCCCCTTAAACATTCCAGTCATCTTGCTTCACATGAGA TTCGCAAAAGTTCTTCACCTATCACTCAAATTGTTAGTCTCAACGATAAAATTCTCATTGCAGGAACAAACAATTTGCTT AAACCGAGAACATATACCAAATATGTTGCTTGGGGCTTTCCTGATCGTAGTTTGAGATTTTTGAGCTATGACCAAGATAG ACTTATTTCAACACATGAAAATTTACATGGAGGTAATCAAATTCAGTGTGCTAGTGTTAGCCATGATGGTCAGATTCTTG TTACTGGGGCTGATGATGGTCTAGTTAATGTTTGGAGAGTTACTAAGTTTGGGCCCCGTGCCATAAGGCGCTTGAAACTG GAGAAGCCACTTTGTGGGCATACAGCCAGAATCACATGCCTTCAAGTTAGCCAGCCTTACATGCTTATTGTGAGTGGATC GGATGATTGCACAGTTATTATATGGGATCTCAGTTCCATGGCATTTGTACGGCAGCTCCCAGAATTCCCAGCACCTGTTT CAGCAGTTTTTGTTAATGACTTGTCGGGAGAAATTGTTACAGCAGCTGGTATTCTTCTTGCAGTTTGGAGTATCAATGGG GATTGTCTGGCAATGATCTACACATCACAACTTCCATCTGATTCTATTCTCTCAGTAACTGGAAGTACAATTTCTGATTG GCAGGACACGATGTGGTATGCAACAGGTCATCAGAGTGGAGCTGTAAAAGTGTGGCAAATGGTTCACTGCTCTGACCCAG ATAGCTCCCTCAGCAAATCAGGTTCTGGTGGGTTGGCAGGGTTAAATTTTGGTACAAAAGAACCAGAATACAAATTGATC CTGCGCAAAGTACTTAAGTTCCATAAACATCCTGTTACTGCCCTGCACCTCTCGGCCGATCTGAAACAGTTTTTGAGTGG GGATTCGGGTGGGCATTTGCTTTCATGGACACTACCGGATGAGAGTCTGCGAGGTTCATTGAATCAGGGGTGA 

Protein sequence (LotjaGi5g1v0173300.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLVETHIFSFVVGRAFVTDIDKLKISSKTRSLDVAQVLKFFSEVTKDDISPGANLLTSVEILVSGPIDKQSLLDSGIFCC LIHVLNALLDPDVTIQRPNSASDHEEQLVLQKEYNGDVGQGRRLEVEGSVVHIMKALASHPSAAQSLIEDDSLQLLFQTV AKGSLIVFSRYKEGLIPLHSIQLHRHAMQILGLLLVNDNGSTAKYIRKHHLIKVLLSAVKDFDPDCGDSAYAVGIVDLLL KCVELSYRAEAGGVRLREDIHNAHGYQFLVRFALTLSNMTKNQGFQSIHTFDDQDVASDGSQSSREQNSSGQEKSSIQYL SPTLSRLLDVLVSLAQTGPNESPRNYGGKGSKSSQNKGGGHSKTRTLSSDWLGDELWDKDNDKIKDLEAVQMLQDILLKA SNRELQAEVLNRLFKIFSGHLDNYKLCQQLRTVPLLILNMAGFPSSLQEIILKILEYAVTVVNCVPEQELLSLCCLLQQP ITSELKQTILSFFVKLLSFDQQYKKVLREVGILEVMLDDLKQHRILSPDQQNVNSNQLDKKNGSSSFKKHLGNKDVIITS PKLMESGSGKFPIFDVEGTIAIAWDCMVSLLKKAEGNQAAFRSASGVTAMLPFLVSDVHRPGVLRILSCLIIEDTSQVHS EELGVLVEILKSGMVTSALGSQYRLSHDAICDTMGALWRILGVNNSAQKIFGEATGFSLLLTTLHGFQSDGGDFDQSSLN VYIKVLTYLLRVVTAGVSDNAVNRMKLHAIISSQTFFDLLCESGLLCVEHEKQVIQLMLELALEIVIPPFLASEGLTKSN TIENESSHYLLLTPSGPINPDKERVYNAGAIKILIRSLLLFTPMVQLKLLELIEKLARAGPFNQESLTSVGCVELLLETV HPFLLGSSSLLSYALRIVEVLGSYRLSASEFGMLIRYVLQMRMKISGNMIVEMMEKLILMEDMASENISLAPFMEMDMSK IGHAAIQVSLGERSWPPAAGYSFVCWFQFQNFLKSQSKDTDPSKCVPSKKRSGSNALHERHILRIFSVGATNNDDATYAE LYLQEDGVLTLATSNSSFLSFSGLELEEGRWHHLAVIHSKPNALAGLFQASVAYVYLNGKLRHTGKLGYSPSPPGKPLQV TIGTSVGKARVSDFKWKLRSCYLFEEVLTPGCICFMYILGRGYRGLFQDTDLLQFVPNQACGGGSMAILDSLDADLTLVA NGQRVDATSRQGDLKADGSGIVWDLERLGNLSLQLAGKKLIFAFDGTSTEFIRSSGSFSVLNLVDPMSAAASPIGGIPRF GRLCGDIYICKHGVIGETIRSIGGMELVLALVEAAETRDMLHMALTLLACALHQNPQNLKDMQTYRGYHLLALFLRRRMS LFDMQSLEIFFQIAACEASFSEPKKLETTQTTLSPAASLQEGSLEDNFLSKFNDESSSIGSHGDMDDFSVQKDSFSHISE LENTDIAAETSNCVVLSNADMVEHVLLDWTLWVTASVSIQISLLGFLENLVSMHWYRNHNLTVLRRINLVQHLLVTLQRG DVEVSVLEKLVVLLGVILEDGFLSSELENVVRFVIMTFDPPGLVPQRPIMRESMGKHVIVRNMLLEMLIDLQVTIKSEEL LEQWHKVVSSKLITYFLDEAVHPTSMRWIMTLLGVCLTSSPTFALKFRTGGGYQGLVRVLPSFYDSPDIYYILFCLIFGK PVYPRLPEVRMLDFHALMPSDGSYIELKFVELLDSVVAMAKTTFDRVSMQSMLAHQTGNLSQVGASLVAELVEGNSDMAG ELQGEALMHKTYAARLMGGEASAPAAATSVLRFMVDLAKMCPPFTTVCRRAEFLESCIDLYFSCVRAAHAVKMAKELSSV TEEKTLIDGDDTCSSQNTFSSLPLDQDQSVKTSISLGSFPQGQVSTSSDDMAAPGNSMAGERSENNVTASELESNRSVRD AIRTAQSLDGDNADQGSVASSAHEFSFRSIKGNLEITLPTDSQSAASYTVLDSPAFSEKSSSRIPLTPSSSPVVALASWL GSANHNEAKSPLTATPSFDSSMSAWEFDPSSNLKSSSQGPSAANNFIAVTSKMLLDIDDSGYGGGPCSAGATAVLDFIAE VLADFMTEQVKASQLIENILESVPLYADSESVLVFQGLCLSRFINFLERRLLRDDEEEEKKLDKIRWSSNLDALCWMIVD RVYMGAFPQPSGVLKTLEFLLSMLQLSNKDGRIEEAAPAGKRLLSISRGSKQLEAYIHSILKNTNRMILYCFLPSFLVSI GEDDLLSQLGLLTESKKRLSATSPQDDSGIDICTVLQLLVAHRRIIFCPSNTDTDLNCCLSMNLIALLGDRRQNVQNNAI DVFKYLLVHRRAALEDLLISKPNQGQQLDVLHGGFDKLLTRSLSEFFEWHQNSEQTVNKVLEQCAGIMWVQYIAGSAKFP GVRIKGMEGRRKREVGRKSRDAAKLDLRHWEQVNERRYALDLVRDAMSTELRVVRQDKYGWILHAESEWQCHLQQLVHER GIFPLSKPSLTEEPEWQLCPIEGPYRMRKKLECCKPKIDTIQNILDGQFELEKPELSRGKIENGSDESDSKPYFQLLADG GKQNVSGGELFEPYFNKLGGVQDTVSEKNEWNDDKASSINEASLHSALELGAKSSTVSVPIEESTQGRSDMGSPRQSSSV KVDDVIVADDKSDKELNDNGEYLIRPFLEPFEKIRFKYNCERVVGLDKHDGIFLIGEFCLYVIENFYIDDSGCFCEKDCE DELSVIDQALGVKKDVTGSVDFQSKSTLSWSTTAKSLVGGRAWAYSGGAWGKEKVHSTGNLPHPWRMWKLDSVHEILKRD YQLRPVAIEIFSMDGFNDLLVFHKKEREEVFKNLVAINLPRNSMLDKTISGSSKQESNEGSRLFKTMAKSFSKRWQNGEI SNFQYLMHLNTLAGRGYSDLTQYPVFPWVLADYESKNLDFSNPKTFRRLDKPMGCQTPEGEDEFIKRYESWDDPEVPKFH YGSHYSSAGIVLFYLLRLPPFSAENQKLQGGQFDHADRLFNSVRDTWFSAAGKGNTSDVKELIPEFFYVPEFLENRFNLD LGEKQSGEKVGDVILPPWAKGSPREFINRHREALESDYVSENLHHWIDLIFGFKQRGKAAEEAVNVFYHYTYEGSVDIDS VTDPAMKASILAQINHFGQTPKQLFLKPHVKRRIDRKLPPHPLKHSSHLASHEIRKSSSPITQIVSLNDKILIAGTNNLL KPRTYTKYVAWGFPDRSLRFLSYDQDRLISTHENLHGGNQIQCASVSHDGQILVTGADDGLVNVWRVTKFGPRAIRRLKL EKPLCGHTARITCLQVSQPYMLIVSGSDDCTVIIWDLSSMAFVRQLPEFPAPVSAVFVNDLSGEIVTAAGILLAVWSING DCLAMIYTSQLPSDSILSVTGSTISDWQDTMWYATGHQSGAVKVWQMVHCSDPDSSLSKSGSGGLAGLNFGTKEPEYKLI LRKVLKFHKHPVTALHLSADLKQFLSGDSGGHLLSWTLPDESLRGSLNQG 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 3480 3480 0.0
MobiDBLite 294 316 23 -
MobiDBLite 338 366 29 -
SUPERFAMILY 384 886 503 4.13E-6
SUPERFAMILY 1024 1169 146 1.69E-10
Pfam 1027 1151 125 2.7E-7
MobiDBLite 1876 1918 43 -
MobiDBLite 2616 2641 26 -
MobiDBLite 2616 2640 25 -
ProSiteProfiles 2669 2835 167 29.407
SUPERFAMILY 2672 2837 166 3.81E-17
CDD 2672 2836 165 2.31686E-26
Pfam 2775 2834 60 1.1E-8
ProSiteProfiles 2860 3152 293 136.471
Gene3D 2863 3152 290 4.1E-132
SUPERFAMILY 2870 3152 283 4.32E-121
SMART 2872 3152 281 1.4E-202
CDD 2873 3152 280 7.82803E-151
Pfam 2873 3152 280 8.0E-120
Gene3D 3203 3488 286 4.3E-32
SUPERFAMILY 3205 3487 283 7.51E-34
SMART 3225 3266 42 0.0023
ProSiteProfiles 3234 3325 92 15.267
Pfam 3236 3265 30 0.015
ProSiteProfiles 3241 3267 27 9.071
SMART 3277 3316 40 4.0E-7
Pfam 3282 3316 35 7.0E-5
ProSiteProfiles 3284 3325 42 13.182
ProSitePatterns 3303 3317 15 -
SMART 3369 3406 38 460.0
SMART 3438 3477 40 0.75

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi5g1v0173300.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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