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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0299800 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0299800.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Tripeptidyl-peptidase 2; TAIR: AT4G20850.1 tripeptidyl peptidase ii; Swiss-Prot: sp|F4JVN6|TPPII_ARATH Tripeptidyl-peptidase 2; TrEMBL-Plants: tr|I1LDQ6|I1LDQ6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0299800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:61668997..61696849) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCTAAAAATAAAAATGGATTAATATTTTTAACTATTTTAATACAAACACACTTTATATATATATATATATATAACTAATA TAACTATAACTATATAACATTTAACAACCACATTTATTTTATTTGGAGTTGATGAAAGTTGAAACCACGCCACTCAAATT ACATCCAACTATCCTAACCGCTCCTCCACCGCCACCGCCGCCGCCACCACCACCATAACACCACCACACCACACATTACG TTATGCATAATCAACACACGCTCTTACTCAGATTCCCCACATTGCCCTCTCCCTCTGTCATCGTCCTTCATCTCACAGAG GCAAAGCTCAGCTTCAACACGAGAAGAATACACACTGCGAGAACCTTCTTCAGAAGAAGCAACTGGGTTCTCCCCAAGGC AATGTCTACTAGCTCTTCCTTCAGCTCTCGCTTTGGTGGCGGCGATGATGACACCACCACCACCACCACCAACAACAACA ACAACAACAATAACGGTGCTTCTTTCCGCAACTTCAAGCTGAACGAGTCAACATTCTTGGCTTCGCTCATGCCCAAGACA GAGATTGGCGTTGACCGGTTTCTCCATTCTCACCCACACTATGATGGACGCGGTGCTCTCATCGCTATCTTCGGTACCCA TTTCGTAAAGCTCTTCATTTTTTGTTGTTGATGTTGATATTGAACATGGGTAGGTGTTGGTTTCCAATTTGAGTACTGGG AGTGGATGATTAGGTGATTCTGCAGCTTTAGCTGATAGTTTTATGGGAATCAGTAATTTGAAATTGAAGGAGGGTTGGGT GGGGCAGGAATCAGTTGGTTTAAAAATTTAAATATCTAATTGTACCCTTTGGTTTTGATCATTGATTCAATATGTGTACT TGGTTGGAGTCTGAATCCAAGTGGGCAAGTGGTAATCTTTCACTTGGTTTGGGTGGTTTATGTTTCATGATATCAGTGGT 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GAGGACGTGAATTAGTCTAAAAGATGACCCTGGTCTAAGGGGTCACCTGAATGATTTATATTATTATTTGTAACAGCTAT GATCTTGATCTTGATGTTGATGTTGGTGTTGGTGTTGGTGTTGAAGTTCAATTCTCTAGGAAGGAAGCTACCCTTATGAG ATGAAAAAATAAGAAGGGTATTGCTATCTAGTTTCTAGGTTGGGTCAAATAAAGTTTTTAAGAATTTCAACATTCTATAT ATTGGAAACATTGTAGTCTACACTTTTCAATAATTTCATTTGATTTTTTAACTAGTGCTTTTAAGATATTTGTTAGAATA AAATATGAAAAAGAAAATGACCATTTTATACATCTTGACAAGCCTTTAATCGAGAGCTAGATTTGCCACCCCAACCATTA GATTTCACACCCCTCATTTTCAGATTTTTAAGTTCCGAATTATTTCGGAATCTTAGATTCCGAAATTAATTCGTGATTTG TAGTGCAAAATACATGTAACACCCCATTTTTGAGTGAAAAAATTCTTCGGAAACTTTATTTCCGAAATATTTCGGAAACT AAGTGTCCGTAAGTGGGGTGTCATTTCTAATGAGTGGGGGTGCCAAATCTAATGATCCCTTTAATCTTTTTTGGGGGGTC AAGGATAGGCCTTTAAAATGGCTTCGAATATATGGCTTGGGTTCTATAAAACTTACATATATAGTATTAAACTTAATTTT ATCTAACTGCATAACAAACCACCCTTAAACTAACAAGTTAAGGGATTTCTTTTCCATTATTTTATATGTTGCTTTGGTTG CTTTCCCATAAAAATATATGTATGAACATTTTTATGTTGCTTTTGTTCTTATGCCATAATCAAACGCTTACCTAAAAAAA ATGCCATAATCAAACTAAGTTTTATGTACAAAGCAAGTTATACACATCACACGAGTTATTTTGAATTTAGATGTGAAATT ATCTTAAGAAGAG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0299800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCATAATCAACACACGCTCTTACTCAGATTCCCCACATTGCCCTCTCCCTCTGTCATCGTCCTTCATCTCACAGAGGC AAAGCTCAGCTTCAACACGAGAAGAATACACACTGCGAGAACCTTCTTCAGAAGAAGCAACTGGGTTCTCCCCAAGGCAA TGTCTACTAGCTCTTCCTTCAGCTCTCGCTTTGGTGGCGGCGATGATGACACCACCACCACCACCACCAACAACAACAAC AACAACAATAACGGTGCTTCTTTCCGCAACTTCAAGCTGAACGAGTCAACATTCTTGGCTTCGCTCATGCCCAAGACAGA GATTGGCGTTGACCGGTTTCTCCATTCTCACCCACACTATGATGGACGCGGTGCTCTCATCGCTATCTTCGATTCTGGTG TAGACCCGGCTGCTACGGGATTACAGGTTACCTCAGATGGGAAGCCGAAAATTCTTGATATTCTTGATTGCACTGGGAGC GGTGATATTGATACCTCAAAGGTGGTGAACGCAGATGCTGATGGTTGTATTTCTGGGGCATCAGGGGCATCTTTGGTTAT CAATACTTCATGGAAAAATCCTTCTTGTGAATGGCATGTGGGTTATAAATTGGTTTATGAGCTCTTCACTGAAAAATTAA CTTCTCGTATGAAGAAAGAAAGAAGGAAAAAGTGGGACAAGAAAAACCAGGAGGAAATTGCTAAGGCTGTAAAACAACTT AATGATTTTGATCAGCAACACATGAAGGTGGAGAATGTTAAACTCAAAAAGGCTCGCGGAGATCTACAGAGTAGGCTTGA TCTTCTTAAAAAGCAATTTGAGAGCTATGATGATAAGGGGCCTGCCATAGATGCTGTCGTCTGGTATGATGGAGAAGTTT GGAGGGTTGCTCTTGACACACAGAGTCTTCAGGATGATCCAGATTGTGGGAAGCTTGCTAACTTTGTACCCTTAACTAAC TATAGGACAGAGAGGAAGTATGGTGTCTTCAGCAAACTAGATGCTTGTACATTTGTTGTGAATGTCTATAATGATGGGAA TGTCTTAAGTATTGTAACAGACAGCTCTCCTCACGGCACCCATGTTGCTGGTATAGCTACTGCATTCCACCCAGAGGAAC CTTTGTTAAATGGAGTTGCACCTGGAGCACAATTAATTTCTTGTAAAATTGGGGACTCTCGCTTAGGTTCAATGGAAACT GGAACTGGTTTGACTCGGGCATTGATAGCTGCTGTTGAGCATAAATGCGACCTTATCAACATGAGTTATGGTGAGCCAAC ACTACTGCCAGACTATGGACGCTTTGTTGACCTTGTGAACGAAGCAGTAAACAAGCACCGTCTGATATTTGTGAGCAGTG CTGGTAATAGTGGGCCAGCATTGAGCACTGTTGGTGCACCTGGCGGTACATCTTCAAGTATCATAGGTGTTGGCGCTTAT GTTTCTCCTGCTATGGCAGCAGGTGCTCACTGTGTTGTTGAACCTCCTTCTGAAGGGCTTGAATACACTTGGTCTAGCCG AGGACCAACAGCTGATGGAGATCTTGGTGTCTGTGTGAGTGCTCCTGGTGGTGCTATTGCTTCTGTCCCTACTTGGACTC TTCAACGGCGCATGCTCATGAATGGGACATCAATGGCATCTCCGTCAGCTTGTGGTGGAATTGCATTGCTCATAAGTGCA ATGAAGGCTGAAGGAATTCCTGTGAGTCCATATATTGTGAGGAAGGCCCTTGAGAATACATCTGTTCCCATAGGCAATTC ACCTGAGGATAAATTATCTACTGGGCAAGGGCTGATGCAAGTTGACAAGTGTTATGAATATATACAGCAGTCTCAAAATA TTCCATATGTTTGGTATCAAATAAACGTCAAGCAATCTGGAAAATCAAATCCTTCATCACGGGGCATCTACTTGAGAGAG GCTGCTGCTTGCCAACAAGCTACTGAGTGGATGGTGCAAGTTGATCCAATATTTCACGAAGATGCCGACAAGTTTGAAGA ATTAGTTGTGTTTGAGGAGTGCATTGAGTTACACTCATCAGATAGGACAGTAATTAAAGCCCCCGAGTATCTACTGCTCA CTCACAATGGTCGTACCTTCAACATATTAGTGGATCCTACCAATTTATGTGATGGTCTGCATTATTATGAGGTCTATGGT ATTGACTGCAAAGCACCATGGCGTGGCCCTCTTTTCAGAATTCCAATTACTATAACCAAGCCTATGGCTCTTACTAACAG ATCTCCACAAGTTTCATTTTCAAAGATGTTATTCCAGCCAGGCCATATAGAAAGGAAATACATAGAAGTGCCACATGGTG CATCTTGGGTTGAAGCAACCATAAACGCATCCAGTTTTGATACTGCTCGAAGATTTTTTGTGGACGCAGTTCAGATATGT CCACTGCAAAGACCTTTTAAATGGAGGAATGTGATATCCTTTTCATCCCCGGCTGCCAAAAGCTTCACCTTTAGGGTAAT AGGTGGTCAGACATTGGAACTAGTCATAGCTCAGCTTTGGTCAAGTGGAATCGGGAGTCATGAGACTACCAATGTGGATC TTGAGGTTGTGTTTCATGGTGTACAAGTCAATCAAGAGGAAATTGTACTTGATGGGAGTGAAGCCCCACTCAGAATTGAT GCTGAAGCACTACTGGCATCTGAGAAACTTGCTCCTGTAGCAATTCTAAATAAGATAAGGATCCCATATCGACCAATAGA TGCTAAGATTAGTTCACTTTCAACTGATCGTGACAAACTCCCCTCTGGAAAGCAGATACTTGCATTGACATTAACATACA AGATCAAATTGGAAGATGGAGCTGAAATCAAACCTCAAATACCATTTCTAAATGGTCGGATATATGATACTAAATTTGAG TCTCAATTTTATATGATTTCTGATTCAAATAAGAAAGTACATTCAAGTGGAGATGCCTATCCGAACCCTACAAAACTTCC CAAGGGCGAATATAATTTACAGTTATATTTGAGGCATGACAACTTGCAGATTTTGGAAAAGTTGAAGCAGCTAGTGTTAT TCATTGAGCGAAATTTGGAAGAGAAGGACATCATTAGGTTGTGCTTTTTCTCTCAACCAGATGGTCCACTGATAGGAAAT GGTTCCTTTAAGTCTTCGACATTAATTCCAGGGATAAAAGAAGGCTTTTATCTTGGCCCACCACCAAAAGACAAGCTTCC CAAGAACTCTCCACAAGGATCTGTATTGGTGGGATCTATATCATATGGGAAACTATCATTAGCCAGTCACGGGGAGCATA AAAATCCAGAAAAGCACCCTGTATCATATCGGATTTCTTATATAGTTCCGCCAAATAAGATTGATGAGGACAAGGGAAAA ACTTCCTCCTCATCTCCCAAGAAGACAGTTTCTGAACGTTTAGAAGAAGAGGTACGAGATGCAAAAATAAAAGTGATTGG AGGTCTAAAACCAGAAAGTGATGAAGAGTTCTTGGAATGGAATAAATTGTCTGCCTTACTCAAAACTGAATATCCAAAGT ACACTCCGTTGCTTGTGAAGATTTTAGAAGGTTTAGTTTCTAGGAGTAATATCAAGGACAAGTTCCATCATGATGAAGAG GTAATTGATGCAGCAAATGAGGTGATCGACAGTATAGATAGAGAAGAGTTAGCAAGATTTTTCGCACTAAAAAATGATCC TGAAGATGAGGATGCAGAGAAAATCAAGAAAAAGATGGAATCAACCAGGGATCAGTTAGCGGATGCACTTTATCAAAAGG GGCTTGCACTGGCAGAAATTGAGTCTTTAAAGGTAGATGATTCCCTGGATTCGGCGGCAACAGAAGGTGCAAAACAAGAT GTAGAAAAAACTGACGAGAAATCCAAGGATGATGGTGATCCAGATATGTTTGAAGAGAACTTTAATGAACTGAAGAAATG GGTTGATGTTAAGTGCACAAAATATGGAACCCTCTTGGTCACAAACGAGAGGCGTAGTAAAAGGCTTGGGACTGCATTGA AGGTACTGACTGACATAATTCAAGAAGATACCGGGCCAGCGAAGAAGAAAATGTATGAACTAAAACTCTCTTTGGTTGAG GAAATTGGATGGACTCATTTGGCTACATATGAGAGACAGTGGATGCTTGTGCGTTTCCCCCCTAACTTGCCCCTTTTCTA G
Protein sequence (LotjaGi5g1v0299800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MHNQHTLLLRFPTLPSPSVIVLHLTEAKLSFNTRRIHTARTFFRRSNWVLPKAMSTSSSFSSRFGGGDDDTTTTTTNNNN NNNNGASFRNFKLNESTFLASLMPKTEIGVDRFLHSHPHYDGRGALIAIFDSGVDPAATGLQVTSDGKPKILDILDCTGS GDIDTSKVVNADADGCISGASGASLVINTSWKNPSCEWHVGYKLVYELFTEKLTSRMKKERRKKWDKKNQEEIAKAVKQL NDFDQQHMKVENVKLKKARGDLQSRLDLLKKQFESYDDKGPAIDAVVWYDGEVWRVALDTQSLQDDPDCGKLANFVPLTN YRTERKYGVFSKLDACTFVVNVYNDGNVLSIVTDSSPHGTHVAGIATAFHPEEPLLNGVAPGAQLISCKIGDSRLGSMET GTGLTRALIAAVEHKCDLINMSYGEPTLLPDYGRFVDLVNEAVNKHRLIFVSSAGNSGPALSTVGAPGGTSSSIIGVGAY VSPAMAAGAHCVVEPPSEGLEYTWSSRGPTADGDLGVCVSAPGGAIASVPTWTLQRRMLMNGTSMASPSACGGIALLISA MKAEGIPVSPYIVRKALENTSVPIGNSPEDKLSTGQGLMQVDKCYEYIQQSQNIPYVWYQINVKQSGKSNPSSRGIYLRE AAACQQATEWMVQVDPIFHEDADKFEELVVFEECIELHSSDRTVIKAPEYLLLTHNGRTFNILVDPTNLCDGLHYYEVYG IDCKAPWRGPLFRIPITITKPMALTNRSPQVSFSKMLFQPGHIERKYIEVPHGASWVEATINASSFDTARRFFVDAVQIC PLQRPFKWRNVISFSSPAAKSFTFRVIGGQTLELVIAQLWSSGIGSHETTNVDLEVVFHGVQVNQEEIVLDGSEAPLRID AEALLASEKLAPVAILNKIRIPYRPIDAKISSLSTDRDKLPSGKQILALTLTYKIKLEDGAEIKPQIPFLNGRIYDTKFE SQFYMISDSNKKVHSSGDAYPNPTKLPKGEYNLQLYLRHDNLQILEKLKQLVLFIERNLEEKDIIRLCFFSQPDGPLIGN GSFKSSTLIPGIKEGFYLGPPPKDKLPKNSPQGSVLVGSISYGKLSLASHGEHKNPEKHPVSYRISYIVPPNKIDEDKGK TSSSSPKKTVSERLEEEVRDAKIKVIGGLKPESDEEFLEWNKLSALLKTEYPKYTPLLVKILEGLVSRSNIKDKFHHDEE VIDAANEVIDSIDREELARFFALKNDPEDEDAEKIKKKMESTRDQLADALYQKGLALAEIESLKVDDSLDSAATEGAKQD VEKTDEKSKDDGDPDMFEENFNELKKWVDVKCTKYGTLLVTNERRSKRLGTALKVLTDIIQEDTGPAKKKMYELKLSLVE EIGWTHLATYERQWMLVRFPPNLPLF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 56 | 88 | 33 | - | – | |
| PANTHER | 80 | 1335 | 1256 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 80 | 1335 | 1256 | 0.0 | – | |
| CDD | 102 | 584 | 483 | 0.0 | ||
| Gene3D | 105 | 199 | 95 | 1.6E-8 | ||
| ProSiteProfiles | 107 | 605 | 499 | 26.115 | – | |
| SUPERFAMILY | 108 | 615 | 508 | 7.07E-55 | ||
| PRINTS | 122 | 141 | 20 | 3.3E-12 | ||
| Pfam | 122 | 588 | 467 | 2.9E-81 | ||
| Coils | 252 | 272 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 283 | 615 | 333 | 2.4E-73 | ||
| PRINTS | 354 | 367 | 14 | 3.3E-12 | ||
| ProSitePatterns | 358 | 368 | 11 | - | ||
| PRINTS | 541 | 557 | 17 | 3.3E-12 | ||
| ProSitePatterns | 542 | 552 | 11 | - | ||
| Gene3D | 619 | 752 | 134 | 7.7E-36 | – | |
| Pfam | 884 | 1069 | 186 | 6.5E-58 | ||
| MobiDBLite | 1112 | 1134 | 23 | - | – | |
| Gene3D | 1128 | 1386 | 259 | 1.3E-41 | – | |
| Coils | 1232 | 1252 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 1271 | 1294 | 24 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Serine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a catalytic mechanism that involves a catalytic triad consisting of a serine nucleophile that is activated by a proton relay involving an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine). | ||
| Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. | ||
| Molecular function | Tripeptidyl-peptidase activity | Catalysis of the release of an N-terminal tripeptide from a polypeptide. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0299800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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