Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi6g1v0090700 |
Transcript ID | LotjaGi6g1v0090700.2 |
Related isoforms 3 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | LMBR1 domain-containing 2; TAIR: AT5G65290.1 LMBR1-like membrane protein; Swiss-Prot: sp|Q54Q92|LMD2A_DICDI LMBR1 domain-containing protein 2 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|G7J381|G7J381_MEDTR LMBR1 integral membrane-like protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0090700 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:19514135..19524611) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGGGCTGTGGTGCCCCTTATTCAGGGTTTCGAAGATGCTGGGGATTTCACTGTATCAGAAAGATTGAAGACTAGTGTACA TGTTAACTTGGTCTTCTATCTAATTGTGGGATCCATTGGCCTTTTCGGACTTGTTCTTCTCATTATGATGCACAGAAGCT GGTAGGTTCTCATCCTCCAAACCTTATTTTTATTCTCGTTTTAGTTTTTTTTTGTAGGATGATGTTTGCTCCAAGTTCTT GTTGCCTGTATATCTGTTTAAATTTTTATTTTCTAACTTCCTATGATCTCCTCAAAGACACATGCATGACAACTAGTTTC TTATTGATTATTTACTCTGCCATATGTGGATTTGTGGATATGCTTTGCTAATAATGTTGGGCTGCATGCTTTGTTATGAG TGACTGATGTATTCATGAAAATTGAACCTGTACAGACCTCAAACGCACATGCACTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCACTCTC CCTCTCTGTATGAGGAAATATTTAATAAACTACTCTATCTGATTAAGCAATTGATTTGCAAAGTTCAGATTTCACATTGC CTTTGTGAGGACATTTCAGAATATGGAAGACCCTCAATATGTCATCTGTGCAAGATGTGGGTATACAATAATATAGATAC CTGAAAAATAGTGAGGTCATTTGAAAGAAAGTACAGTTAATCTTATTGGGTTGTCAAGACCACGGCAGGGCCATGTATAA CCTCACCATTCACGTGGTTCCTAAGGACTCCCACTAGGGTACCTAAGGGGAAAGTAATGGTGTGTTACATCAGAGTTTTA AGCCCCCTTATCAGGAACTTGCAAGAAAATGTCCCAACCAAGTGAACTAGGATCACAGGATACATTTAATTTTAGTGGGT TGTCCCACAGCAGGGCCAAGCAGAGCTCCACCATCGAAGTGCTGCCTAAGGATTCCTTCTATGGTACCTGAAGGGGTGGG GGGGGGGAGGGAAATTGATGGTGTTTAACCTCAGAGTTTTGAATCCCCTACCATGAACTTGCAAGAAAATGTCTCAACCA AGTGAACTAGGCTCACAGGATAAATAAGTTACAGGTTTAAATTTTACATGTTAGTCACAGATTTTCAATAAGGAGAATCC TTTTTGTTATGAAGGATAGGTGCCACGAAACATAAGAACAGAGGTTCTGTTTGATTTCTGTCAAAACCATCTCCTTATAA TTTTATTTTTTAATTAATATGTCCTTTTGAAAAAGATCAAAGCATTCAATTTTCAGTTCTTATGTTTCGTATCATACTAT ATAGCAATTCTCTTTCAATAATCAATAGCTTGTACGGTTTTTCAAGTCATTGACACAAATATCTGCTCGTTGTCTAATTG TTTGTCTCTTCCTTGTCATGATGTTCATGGTTGACAAGTTAATACGCAATAAGGTTTTTTTCATATATATGTGTATTTAT TTTTCGGGTTTATGTGATGCAATACCTTTTTATTTTGAATATTTTTAATTGATTCATACTTCTGGAAGCAGGACTGGAAG TCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGCATTTCTTCTTGGCTTTGGTTTGAGTG AAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCCGCCAAAAAGTACTTTCTCACAAAATTTCCCAAATGGCT GTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATTGTTGTAAGTGGTTCATTCTAGTGTCTGTTAAATTCATT TCTCATTTTACTGTTGTAGAAGAAGTTACTAAAAATTGATTAGTTGAAATTTTTTGGTTTTTGATTGTGCTCAATGTTGT CATATGGTCCATGAGATTTAACCCACCTAGTGGGAGGCTTGGTTGCTGCCCTGGAAGTTTTGTTAATCTTTCACTTGGTA GTGAGATAGAACTGCCTTTTTTTGCTTGTGATTTGTGTCATTTTGATTAAAAAGAAAAAACTTATTCAATAACACCTTCC CTGAGTTGTATTTCTCCAATTGGCTTTATTTTAAGTTGTGGATACATTGGAAATATATTAATTTTGAAACTTGTATGCAT AGCAGAAAATATGTATAATAGAGCTGAGGTTATGCACTGTCTGATGTCTTGTTCCTTTCCTTCTCGTATAAAAGTTACTA GTAGTAATAGCTTGTTTGTGGCTAGTTATAGTAAGCTTTTGAGGGACATTCCAATTTACAATTGGGCATCTCCATCGATT CTACATGTCTGCCATTTTGGCGAAAATGTTACTTGTGCCAGCAGTGCATCATTAGCGCTTGTGTTGCTCTCGAAAAGAAG CTGTGTAATATTGTATTTGATCAATTATTTTGTATATGGAAGATCTCATGTGTATTATGTTTTTATTGGTTTGGGCCAGT GGGGTCACTGCAAAATAAGAATTGGAGCTTAATTATAGTTTATTTGTATAGGTTGCTCAAGCAACATCCAAGCAGATGTC CAAGCGTGATCCTTTGAGACGTTATATGGATGTCATTGATGATATGCTTGCTCAAATGGTATTGGGCTTACTTTATTTTA TTAAGGATGTCTAAAAACACCTAAATTGTTTTCTTTGTTTAGATATAACCTTCAAATCTTCAGTTTAGGGAAGACCCATC CTTCAAACCACAAGGTGGCCAATTAGGGGAAAATGATATGGATTATGATACAGATGAGAAGTCAATGGCAACACTAAGGC GTCATCTTCGAAAAGCTCGTGAGGAGTATTACAGATATAAAAGGTAAGCACATGGTCAATTGTGTTTGAGGTATTATTCA TTAGAAAAGTTGTTTTTCAATCCTTCACCGCAGTTTCGGTAAATTTAATTCTTATATTCTTACGATGAGTGAAAACATTT ATTAGACCTATTTTTTATTTATTTTTTTATTCAGGTCAATGTCTTTGAGTGTATCAATTAGATTAGTGAAAATGAAATTG CTGTTTTGTTACATGGAGCCCTAACATGTTACATATTACATAAATAGGTCAATTACATGTGCTATTGAAGCTGGTTTGGT TAATAATTCTGGACATTAATTTCTATCCTTTAGTTTTACTTGGACTGGAAAGAGTTTCATTTTTGCTTCCTAGGCTCCTC GCATCTATTAATATGAAAAACCTTGTAAAATCTAGCTTTCTGATTTATCCAGTGGCGAAATAGATTCCTTCTTGCCTTGT TTAGACCAGTGTTATCAAATAACGGCTATAGTGTAGCGGATTTTTGGCTAATCGCGACGCCGCTATTGCCCGCTATAGCG CGCTATTACCGCTATTTCCGCTACTCGCCGCCAAATAGCGGATTCTTGGCTCACCGCGATCGCGATTTGATAACACTGGT TTAGACTAATTTATATATGTTAATGACTTGTTAACAGATGCACTCCCATGGCCATGAGGATGGGGGCAATTGCCCGCACA AGATTTAAGAGTTCATTTGTAATACTCATACTTGATAGTAGAAGATTGCCCCATGATATTTTCTCAACTCTTAAAGTTTC CCTACTACAGATCCAACACTCTTAACACCTTTTTGTCAAAAAAAAAAAACTCAAACCTCATCAATTTTTTTCTCCTCTGT AGTATTGGAAACTCGTTACTCTCACATTATAAAACTAGTGTAAAAGTGTCAGTTTTTTATAATAAATTTAGTTTTTTTTA AACAGTATTGATGGTTAACCAAACAATGATAGGTGTCAATAATATGAATGCAAAGAGCACATAGTACTTAGTACCAAGCT TGTTAATAGCGCGCCCTAGTGGTGCAATAGCGCTATAGCATAGCACCCTGGGGGTTAACCGCTACTCCACTATTCACCCT ATTTGCCGCTATTGTCCGCTATAGCGCCGCAATAGCGCTCAAAATAGTGTTTTCTGGGCTTGCCGCTATGCTACGCTATC CGCGATTATGTTCATTTTAATTTTTTCAATGGAAAATTTTCTTAAAATAAAATTAACAATTGATCGAACATCTTCTCCTG AAATATGTAATGAATGGCTGATGACTGTTTACTTTATAGAGAGATTTTTTGTAGTGCCCAAAATAAATGTAGTAAAAACT CATTCAAATGTTTTCAGAATATTAAAACTTGTTGAAAATAATTATATTATATATTTATATTTTTAATGAGAGTATATGAT ATATGCTTTTAGTGTTACAAATTTACACATGTCACCCCAACAACTTAAAATTTCTTACTTCATCATTGTGTGTATATGTG TGTGGTTTTCCCCCACAACTTGAGATGTCTGGATCCGTCACTGTTAATGAGAGATATACCGCAGCTTTATTACTTAGTTG CAGCGCTTACTTCTGTCAAATCTGTACAAATAAGGTCTCTTAGATTTTTCCTTCAGCGGTAGCCAAACTTTATTTGGTAT TGTTTCTTTTGCAGTGAGTATATGACTTATGTACTGGAAGCCCTTGAATTGGAAGATACAATGAATAATTATGAACGCCG CAAGTCAACTGGATGGTTTGCTTCTAATTTTGTTTTCTATTTTGTTGGTTTTCCCAGCTTCAATATCATTCTATAATATA TTACAGGTTCTTCGAGCTCATATTACATCATTTTTTTATGATATAACTTCAGGGAATATAATTCAAGCATTAGACCTGCT CGGACTGGCAAGTTGGGGTCTGTATTTGATACTTTAGGTAATAATGAGAATTATTATTAAATCTATATTATCCTAACTTC ACTGAATATTACTTTTCTCTAATGAAATTTGATTATTGTTAGATATCTTGTAAATAAGTAGGATATCTTTTATTTAAGTA GGATATCTTTTATTAATTGTAAATAGGTAGCATAGTCATTGTAAATAGGGTAACAATGATATTGTACATTGATTGCACCC AGTGTTGTCAAACCCGAATAGCAGGGCGTAGCAGCCGACCCCTATAATGCTATAGCGTATAGCGAGATGGCTGTATGCTG AATATTTTTATATATAGTTTATTTTATACTAAACACTATGCTTAAAAATGATAAAAAACACTCAAAATTCATGACATTCA AAAAGGAGATAGAGGTTGCTGGGATAGAAGAGATAACTAAAAAATAAAGGACTACAGCATAAACTAAGTAACTAATGGAG GCTGTTGTGATAAAAAAAAAAAAGATAGAGGCTGCTGGGATAAAAGTGATGCATGGTAGTTACTTAGAGACTAAAAGAGA ATACAAATTGAAACAACACTGGCAGAATAAATAACCAGAAGAAAAAAAACAAAGCAGGCATTAGGGAAACAACAGAGAAG GATAGCAAGCTCAAGGATGCGAGAACAAAACTGGGTATTTGGGGATGCAGAGGTGTCGCTATAAGGTTGCTGGAAGGATG CCGGAGGCTGGTCAGAAGTGGTGTGCAAGCTAGAGTGCAGGAAGAATGGAGACACAGTGCTGGGCAGAGGTCGAAGTGAA GTATCAGAGAGGGGGATGTACTATAATGGGTTATTCTAACTTTTCCGAGGCAAAATTTCGTATCTACCCTCAAAAGGTTG CTCTAACAGTAAGATTTTAAGGGTAAAAGGGGTTTTTTCGATAAACCATCAGAATAGTGCAGCATTTGTGATACAATTCC CACTATTCAGGCCAACCTATTGCGGCCGCAACAATGAGCCGCTCCACTTTTTGACATCCTTTTGCGGACAGTGGCTGCTC CGCTCCGCTCACCGCTATAGCATCGCTATTAACAACCCTGATTGCACCTATTATATATAATATAATGGACTCCGCTATGT AGTTGAAACACACAGACTCAGCAAATGCCTCATGTGTCTTTTTTGTTATTCAACATTGTATCAAGAGCCTAACAAGAGGC AATTCTAATCCTAATCCATGACTATCTGGTAGAGACCCATCATGTTTCATTTCCGGTTTCTAGACCTTTTGTGCTGTCTG GCATCATTCCGACAGCCTTCTCCAGCTAATTCCGCCGCTGCCCAACCACCGAGTCTATATATGGTCTCAAGCAATCTCAT AGGGCTTGATTTTGGCAGATTTGGCACTGTTATTCAGTAGTTTGTGTCAAAATAACCACTTATCCCAAAAGTTTAAGCTG TTGGGTAAGGGCCACATGAATGGTTTTATATTATATTCTAACACCCCCCTCACGCAAGAGCCCTTTGGGCTTGAAGCGTG GATGAATGCATAGGCCCACCTACCATGTGCTTAATTAAATTCCACTTTTTAATTAGAAAGTGAGGGGAGCAAGGATCAAA CTCTAGACCTCTCAGTCTCAGCCATAGAGGCTCTGATACCATGTCATAATAACCACTTATCCCAAAAGCTTAAGCTGTTG GGTAAGGGCCACATGAATGGTTTTATATTATATTCTAATAGTTTGGTATGACAGAGTGAGGCTGATCAGTCATCTTTTTA TCATCACTCAGCTGCTGGGTGTATATACTTGATTGTGTATGTGGATGGCATTGTCATTACAGGCACCGATCATCATGGAA TCACACAAGTAAAACAACTTTGTCATCACTTTCAGACAAAAGACCTTGGCAGACTTTGTTATTTCTTGGGCATAGAGGTT GCACAATCCAAACAAGGGATTGTGATTTCACAGAGAAAGTATGCTATGGATATTTTGGAGGAGACAAGATTGTTAAATGC CAAGCCAGTTGACACACCTATGGATCCCAATGCCAAACTTAGGCCAGCTCAAGGGGAGCCACTCTCAGATCCAAAAACAT ATAGGAGATTAGTTGGAAATATGAATTATCTCACTGTTACTCACCCAAATGTTTCATTTTCTTTTAGTAAGGTAAGCAAT TTCTTAATTCTCCATGTGAAGGGCATTGAGAGGTTGTGATTCGCGTACTGAATTATATTAAAAGTGCTCCAGGAGAAAGG TTAATTGTACGAAGATAAGGGACATGCACGAGTTGTAGGATACTCAGATGCATATTGGGTAGGTTCTCATTTTGATAGGA GATCCACCTCGGTAGTGTGTTTTCTTTGGTGATAACTTAATTTCCTAGAAGCGTAAGAAACAAAGCGTAGTGGTAAGAGA GAGCAGAAGGCATGAGAGAACTGGCTGCGATGATGGGCCATGTTATCGTATGTTGGGATAAAACCCATTCACATGGAACA AAAAGGAATATTCAAAGATTCACAAGGGATTTTGCAACTGCTTTGGGAAAGAGATATAGATGACATCCAAGCTATTGCTA AAACTGTGGAGTTGACTACAGTTTTGGGCATTGAAAAAGAGCAGTGGGATCCTGGTGGACATTATTGTCTTCTTCCTGTA TCACGGTTAACATTTCCAGATAGGAGGACTTTGGTGGGATTTTGTTTTAGGTATCTCAAGCTAGGACAAGGTCAATGCTT ACGGGAGGAGTATTGATAGGTACCCCTAGTTAGTTAGTAGTTTTGGTTAGTTGATAAAGTTAGCCATATAGTTAGTAAGT TAAGAGAGTTAGTTCACTTAGTTGGGCTGTAGAGGAAGAAATATAATAAATAAGAGAGTTTAGGAGGATTACATATTTTG GGATAATTTGTAATTGGAAATTGGCAGAAACTCAATAATATCAGCTTTCCTTTTTTCTTTAGTGCTAGAACCTATTAGTT TTCCACAATGCCTCATGAACATTTTATCCTTTCTCTGTATTAAGATATTTATGAAAAATATAATTCTACGTACCCTACTA GCTCAGTTGCTTCCTATGTAAAGAGACCTCAATATTAACTCTATTTTACGTTTTTTTTATTTTGTGGTTAAAAGTTGCAT ATATGTATATAGAAATTAGAAAATTAAATTGACATTCCTAGGTTTTTAATTGAGAGATTCTGAATATAGTATTGACAAAT GGTGGAAGTCAATCTAATTTCCTCATGCATATGTTGCTTTTGGCTTAAAAGTTTCTTGAATTTCATCTGACTTCTGTGTT ACCTTTCTCAATTAGTTCCTTGCTACTTTAATATTGCATTGTTTGATCGTGCAAGGATAGGTCTACATTTTCCTTTCTTT TATGATTTCCTATTTTGGTTAGAGGCATTGGACCCAGGCTTCTAAATAAATGGTACTTCTTCACAGAATTTTGCTGGAGA TGCATTTTAAGGAAACAAGTTGAGAAAGGCTTGGCTGTTCTACTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGC AACTCTTTTGCCTAGCTTTGATTTATCACTTTTCTCCATTCTTATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGG TAGACCAAGTCTTTTAGAGATATTTAGTATAATGGACATTGAGATGCTGTATATGTATTTAAAATACTTTTTTACGTTTT TAAAAGTTTTGGATGAAGATTTCATTCTGAATTTTTTGTGAATCTACAACACTTAAAAGAAAATTGATTTTAGATGTTCT TGATGAAGATTTCATTCTGGAAGTTCTGGAAATCTATAATATGTCGATGAAAATTGCTATCTCATACAAACTTCTTTGCG AAGAGTAAGATGGGCTTCTGTTTGTATATCGATCAATGAGATATGACTTTTTCATTAGATACAGGCAGTCTTTTTCTCTT TTTTTTTTTATGAAAATAAACTTCCATTCCTTTTGGCTTAAGGCTGAACCAAATGCAAACAAATTGCTTATGGAATCTGA TGTTGTGTCTTTGCTTCTGTAATATGCTTCTTCACATATACTATCTTTTTTTATAAAGGTTGTATAAATCACTTACCTTC AATTTTTTGCCCAGGTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCATGTATATGTGCATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGA ATGTTGATGTTTTACTCACTGACACCCAGACAGACTAGCTCAGTTAACTTGCTTATGATATGCTCGTAAGTTTTTACTCA TTTACTACTGCTGCTGCAATTATGACTACTTTATTTTTGCTTCTTGAATTGCCTATGCTCTCAAATGAATACCTGTTATA TTTTATTCTTGATCCCAGGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTT CTAATAAAACGACTATATTTGAAAAGGTACTCTTATCTAACAAATCTATTTGATTGTTGATTCTCTTTAAAATGTTTTTT TGACAATATTGTGGGGCACTGGGTGGAGTTCCATTTCCATATATTGCTTACTGTGATAGATCTTCTTGCTTATTACTTTG GCACTTATATTAAATTAATTCCTAATAATCCTAGAAATTTCTTTTTCATTGGTTATAAGACTAGTCTATTATTTTGTTTA CTTGTACTTATTTTCACATGCCTTTCGTATATTCTTTTATGATAATTTTTCTTCTCAGCTTGTAACTGTTAAATTATCTG AACTTTAGCCTCAGAACACTTTGGCTCCATCTCCTTAGTAATATTTTCTTATTATAATTTGGTGCGTGATTTGGCTATTA CTGCAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAAATTTAACAAAATCTATCCACTTATTATGGT TACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATTTTCTGGGAAGCTGGAAGAGATATATTTTCA AAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATTTTACAAAGAGGTCTGAAACAAATTGAAACA AATTTTCCGTTGTTACAACTTTAGTTCAAGTTACTCACTGAAAAAATCTTATCTAAATTTGTGATACTGACTTTGCCATA CTTTTGATTGATTGATTTTGCATTATTTGTAGAGCGGTCTTGGCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTC CCCTGGCAAGGAATTTTAATGGTGTTGATATTGAATCGGCAAACAATTTAATGGTATGTAGACATAACTTCAAAAAGGTG GAAGCAATCTTGTCTCACCTCCCATTTAGCCTCTCATCTCATAGTTTTGACAGATTCAACATATGACATTTGTTACTACT ACAGTATAATCATTTTACACCTTAAACATTCAGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGA AACCAATGGACTGTCTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATG CTGCCATTAGAGAGCAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTT GATAAAGGCAGTAATTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAG TTTCAAGGCCAACATAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCAT CTGAGTCCCTTGATGAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0090700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGATGCACAGAAGCTGGACTGGAAGTCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGC ATTTCTTCTTGGCTTTGGTTTGAGTGAAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCCGCCAAAAAGTAC TTTCTCACAAAATTTCCCAAATGGCTGTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATTGTTGTTGCTCAA GCAACATCCAAGCAGATGTCCAAGCGTGATCCTTTGAGACGTTATATGGATGTCATTGATGATATGCTTGCTCAAATGTT TAGGGAAGACCCATCCTTCAAACCACAAGGTGGCCAATTAGGGGAAAATGATATGGATTATGATACAGATGAGAAGTCAA TGGCAACACTAAGGCGTCATCTTCGAAAAGCTCGTGAGGAGTATTACAGATATAAAAGTGAGTATATGACTTATGTACTG GAAGCCCTTGAATTGGAAGATACAATGAATAATTATGAACGCCGCAAGTCAACTGGATGGGAATATAATTCAAGCATTAG ACCTGCTCGGACTGGCAAGTTGGGGTCTGTATTTGATACTTTAGAATTTTGCTGGAGATGCATTTTAAGGAAACAAGTTG AGAAAGGCTTGGCTGTTCTACTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCTTTTGCCTAGCTTTGAT TTATCACTTTTCTCCATTCTTATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCAT GTATATGTGCATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTACTCACTGACACCCAGACAGACTA GCTCAGTTAACTTGCTTATGATATGCTCGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATT CGACTTGGTTCTAATAAAACGACTATATTTGAAAAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAA ATTTAACAAAATCTATCCACTTATTATGGTTACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATT TTCTGGGAAGCTGGAAGAGATATATTTTCAAAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATT TTACAAAGAGAGCGGTCTTGGCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGGCAAGGAATTTTAATGG TGTTGATATTGAATCGGCAAACAATTTAATGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGAAA CCAATGGACTGTCTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATGCT GCCATTAGAGAGCAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTTGA TAAAGGCAGTAATTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAGTT TCAAGGCCAACATAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCATCT GAGTCCCTTGATGAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0090700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MMHRSWTGSLLGFAMACSNTFGLVTGAFLLGFGLSEIPKSIWRNAEWTTRQKVLSHKISQMAVKLDDAHQELSNAIVVAQ ATSKQMSKRDPLRRYMDVIDDMLAQMFREDPSFKPQGGQLGENDMDYDTDEKSMATLRRHLRKAREEYYRYKSEYMTYVL EALELEDTMNNYERRKSTGWEYNSSIRPARTGKLGSVFDTLEFCWRCILRKQVEKGLAVLLGIMSVAILLAEATLLPSFD LSLFSILIKSVRTQEMLVQVFAFVPLMYMCMCTYYSLFKIGMLMFYSLTPRQTSSVNLLMICSMVARYAPPVSYNFLNLI RLGSNKTTIFEKRMGNIDNAVPFFGDKFNKIYPLIMVTYTLLVASNFFDRVFDFLGSWKRYIFKTEDDDMDGLDPSGVII LQRERSWLEQGHKVGEQVVPLARNFNGVDIESANNLMERHVEMKTNSDVITEETNGLSKSSREETSRYGSSREAISNKYA AIREQGGPASKRKAEEKNVASANSVLDKGSNSGGAPSSGLASTWLNMKTGFQSFKANIGAKKFLPIRQIQESNVSCVSSS ESLDEIFQRLKGTSLDQNTYNEED
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
ProSiteProfiles | 1 | 17 | 17 | 5.0 | – | |
Phobius | 1 | 11 | 11 | - | – | |
PANTHER | 2 | 582 | 581 | 1.3E-283 | – | |
PANTHER | 2 | 582 | 581 | 1.3E-283 | – | |
Pfam | 5 | 367 | 363 | 6.9E-63 | ||
TMHMM | 10 | 32 | 23 | - | – | |
Phobius | 12 | 34 | 23 | - | – | |
Phobius | 35 | 215 | 181 | - | – | |
Coils | 127 | 154 | 28 | - | – | |
Phobius | 216 | 236 | 21 | - | – | |
TMHMM | 217 | 236 | 20 | - | – | |
Phobius | 237 | 255 | 19 | - | – | |
TMHMM | 256 | 278 | 23 | - | – | |
Phobius | 256 | 277 | 22 | - | – | |
Phobius | 278 | 297 | 20 | - | – | |
Phobius | 298 | 317 | 20 | - | – | |
Phobius | 318 | 350 | 33 | - | – | |
TMHMM | 351 | 368 | 18 | - | – | |
Phobius | 351 | 372 | 22 | - | – | |
Phobius | 373 | 584 | 212 | - | – | |
MobiDBLite | 450 | 472 | 23 | - | – | |
MobiDBLite | 484 | 517 | 34 | - | – | |
MobiDBLite | 503 | 517 | 15 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0090700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…