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LotjaGi6g1v0090700.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0090700
Transcript ID LotjaGi6g1v0090700.2
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description LMBR1 domain-containing 2; TAIR: AT5G65290.1 LMBR1-like membrane protein; Swiss-Prot: sp|Q54Q92|LMD2A_DICDI LMBR1 domain-containing protein 2 homolog A; TrEMBL-Plants: tr|G7J381|G7J381_MEDTR LMBR1 integral membrane-like protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0090700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:19514135..19524611) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGGGCTGTGGTGCCCCTTATTCAGGGTTTCGAAGATGCTGGGGATTTCACTGTATCAGAAAGATTGAAGACTAGTGTACA TGTTAACTTGGTCTTCTATCTAATTGTGGGATCCATTGGCCTTTTCGGACTTGTTCTTCTCATTATGATGCACAGAAGCT GGTAGGTTCTCATCCTCCAAACCTTATTTTTATTCTCGTTTTAGTTTTTTTTTGTAGGATGATGTTTGCTCCAAGTTCTT GTTGCCTGTATATCTGTTTAAATTTTTATTTTCTAACTTCCTATGATCTCCTCAAAGACACATGCATGACAACTAGTTTC TTATTGATTATTTACTCTGCCATATGTGGATTTGTGGATATGCTTTGCTAATAATGTTGGGCTGCATGCTTTGTTATGAG TGACTGATGTATTCATGAAAATTGAACCTGTACAGACCTCAAACGCACATGCACTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCACTCTC CCTCTCTGTATGAGGAAATATTTAATAAACTACTCTATCTGATTAAGCAATTGATTTGCAAAGTTCAGATTTCACATTGC CTTTGTGAGGACATTTCAGAATATGGAAGACCCTCAATATGTCATCTGTGCAAGATGTGGGTATACAATAATATAGATAC CTGAAAAATAGTGAGGTCATTTGAAAGAAAGTACAGTTAATCTTATTGGGTTGTCAAGACCACGGCAGGGCCATGTATAA CCTCACCATTCACGTGGTTCCTAAGGACTCCCACTAGGGTACCTAAGGGGAAAGTAATGGTGTGTTACATCAGAGTTTTA AGCCCCCTTATCAGGAACTTGCAAGAAAATGTCCCAACCAAGTGAACTAGGATCACAGGATACATTTAATTTTAGTGGGT TGTCCCACAGCAGGGCCAAGCAGAGCTCCACCATCGAAGTGCTGCCTAAGGATTCCTTCTATGGTACCTGAAGGGGTGGG GGGGGGGAGGGAAATTGATGGTGTTTAACCTCAGAGTTTTGAATCCCCTACCATGAACTTGCAAGAAAATGTCTCAACCA AGTGAACTAGGCTCACAGGATAAATAAGTTACAGGTTTAAATTTTACATGTTAGTCACAGATTTTCAATAAGGAGAATCC TTTTTGTTATGAAGGATAGGTGCCACGAAACATAAGAACAGAGGTTCTGTTTGATTTCTGTCAAAACCATCTCCTTATAA TTTTATTTTTTAATTAATATGTCCTTTTGAAAAAGATCAAAGCATTCAATTTTCAGTTCTTATGTTTCGTATCATACTAT ATAGCAATTCTCTTTCAATAATCAATAGCTTGTACGGTTTTTCAAGTCATTGACACAAATATCTGCTCGTTGTCTAATTG TTTGTCTCTTCCTTGTCATGATGTTCATGGTTGACAAGTTAATACGCAATAAGGTTTTTTTCATATATATGTGTATTTAT TTTTCGGGTTTATGTGATGCAATACCTTTTTATTTTGAATATTTTTAATTGATTCATACTTCTGGAAGCAGGACTGGAAG TCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGCATTTCTTCTTGGCTTTGGTTTGAGTG AAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCCGCCAAAAAGTACTTTCTCACAAAATTTCCCAAATGGCT GTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATTGTTGTAAGTGGTTCATTCTAGTGTCTGTTAAATTCATT TCTCATTTTACTGTTGTAGAAGAAGTTACTAAAAATTGATTAGTTGAAATTTTTTGGTTTTTGATTGTGCTCAATGTTGT CATATGGTCCATGAGATTTAACCCACCTAGTGGGAGGCTTGGTTGCTGCCCTGGAAGTTTTGTTAATCTTTCACTTGGTA 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ATTAGACCTATTTTTTATTTATTTTTTTATTCAGGTCAATGTCTTTGAGTGTATCAATTAGATTAGTGAAAATGAAATTG CTGTTTTGTTACATGGAGCCCTAACATGTTACATATTACATAAATAGGTCAATTACATGTGCTATTGAAGCTGGTTTGGT TAATAATTCTGGACATTAATTTCTATCCTTTAGTTTTACTTGGACTGGAAAGAGTTTCATTTTTGCTTCCTAGGCTCCTC GCATCTATTAATATGAAAAACCTTGTAAAATCTAGCTTTCTGATTTATCCAGTGGCGAAATAGATTCCTTCTTGCCTTGT TTAGACCAGTGTTATCAAATAACGGCTATAGTGTAGCGGATTTTTGGCTAATCGCGACGCCGCTATTGCCCGCTATAGCG CGCTATTACCGCTATTTCCGCTACTCGCCGCCAAATAGCGGATTCTTGGCTCACCGCGATCGCGATTTGATAACACTGGT TTAGACTAATTTATATATGTTAATGACTTGTTAACAGATGCACTCCCATGGCCATGAGGATGGGGGCAATTGCCCGCACA AGATTTAAGAGTTCATTTGTAATACTCATACTTGATAGTAGAAGATTGCCCCATGATATTTTCTCAACTCTTAAAGTTTC CCTACTACAGATCCAACACTCTTAACACCTTTTTGTCAAAAAAAAAAAACTCAAACCTCATCAATTTTTTTCTCCTCTGT AGTATTGGAAACTCGTTACTCTCACATTATAAAACTAGTGTAAAAGTGTCAGTTTTTTATAATAAATTTAGTTTTTTTTA AACAGTATTGATGGTTAACCAAACAATGATAGGTGTCAATAATATGAATGCAAAGAGCACATAGTACTTAGTACCAAGCT TGTTAATAGCGCGCCCTAGTGGTGCAATAGCGCTATAGCATAGCACCCTGGGGGTTAACCGCTACTCCACTATTCACCCT ATTTGCCGCTATTGTCCGCTATAGCGCCGCAATAGCGCTCAAAATAGTGTTTTCTGGGCTTGCCGCTATGCTACGCTATC CGCGATTATGTTCATTTTAATTTTTTCAATGGAAAATTTTCTTAAAATAAAATTAACAATTGATCGAACATCTTCTCCTG AAATATGTAATGAATGGCTGATGACTGTTTACTTTATAGAGAGATTTTTTGTAGTGCCCAAAATAAATGTAGTAAAAACT CATTCAAATGTTTTCAGAATATTAAAACTTGTTGAAAATAATTATATTATATATTTATATTTTTAATGAGAGTATATGAT ATATGCTTTTAGTGTTACAAATTTACACATGTCACCCCAACAACTTAAAATTTCTTACTTCATCATTGTGTGTATATGTG TGTGGTTTTCCCCCACAACTTGAGATGTCTGGATCCGTCACTGTTAATGAGAGATATACCGCAGCTTTATTACTTAGTTG CAGCGCTTACTTCTGTCAAATCTGTACAAATAAGGTCTCTTAGATTTTTCCTTCAGCGGTAGCCAAACTTTATTTGGTAT TGTTTCTTTTGCAGTGAGTATATGACTTATGTACTGGAAGCCCTTGAATTGGAAGATACAATGAATAATTATGAACGCCG CAAGTCAACTGGATGGTTTGCTTCTAATTTTGTTTTCTATTTTGTTGGTTTTCCCAGCTTCAATATCATTCTATAATATA TTACAGGTTCTTCGAGCTCATATTACATCATTTTTTTATGATATAACTTCAGGGAATATAATTCAAGCATTAGACCTGCT CGGACTGGCAAGTTGGGGTCTGTATTTGATACTTTAGGTAATAATGAGAATTATTATTAAATCTATATTATCCTAACTTC ACTGAATATTACTTTTCTCTAATGAAATTTGATTATTGTTAGATATCTTGTAAATAAGTAGGATATCTTTTATTTAAGTA GGATATCTTTTATTAATTGTAAATAGGTAGCATAGTCATTGTAAATAGGGTAACAATGATATTGTACATTGATTGCACCC AGTGTTGTCAAACCCGAATAGCAGGGCGTAGCAGCCGACCCCTATAATGCTATAGCGTATAGCGAGATGGCTGTATGCTG AATATTTTTATATATAGTTTATTTTATACTAAACACTATGCTTAAAAATGATAAAAAACACTCAAAATTCATGACATTCA AAAAGGAGATAGAGGTTGCTGGGATAGAAGAGATAACTAAAAAATAAAGGACTACAGCATAAACTAAGTAACTAATGGAG GCTGTTGTGATAAAAAAAAAAAAGATAGAGGCTGCTGGGATAAAAGTGATGCATGGTAGTTACTTAGAGACTAAAAGAGA ATACAAATTGAAACAACACTGGCAGAATAAATAACCAGAAGAAAAAAAACAAAGCAGGCATTAGGGAAACAACAGAGAAG GATAGCAAGCTCAAGGATGCGAGAACAAAACTGGGTATTTGGGGATGCAGAGGTGTCGCTATAAGGTTGCTGGAAGGATG CCGGAGGCTGGTCAGAAGTGGTGTGCAAGCTAGAGTGCAGGAAGAATGGAGACACAGTGCTGGGCAGAGGTCGAAGTGAA GTATCAGAGAGGGGGATGTACTATAATGGGTTATTCTAACTTTTCCGAGGCAAAATTTCGTATCTACCCTCAAAAGGTTG CTCTAACAGTAAGATTTTAAGGGTAAAAGGGGTTTTTTCGATAAACCATCAGAATAGTGCAGCATTTGTGATACAATTCC CACTATTCAGGCCAACCTATTGCGGCCGCAACAATGAGCCGCTCCACTTTTTGACATCCTTTTGCGGACAGTGGCTGCTC CGCTCCGCTCACCGCTATAGCATCGCTATTAACAACCCTGATTGCACCTATTATATATAATATAATGGACTCCGCTATGT AGTTGAAACACACAGACTCAGCAAATGCCTCATGTGTCTTTTTTGTTATTCAACATTGTATCAAGAGCCTAACAAGAGGC AATTCTAATCCTAATCCATGACTATCTGGTAGAGACCCATCATGTTTCATTTCCGGTTTCTAGACCTTTTGTGCTGTCTG GCATCATTCCGACAGCCTTCTCCAGCTAATTCCGCCGCTGCCCAACCACCGAGTCTATATATGGTCTCAAGCAATCTCAT AGGGCTTGATTTTGGCAGATTTGGCACTGTTATTCAGTAGTTTGTGTCAAAATAACCACTTATCCCAAAAGTTTAAGCTG TTGGGTAAGGGCCACATGAATGGTTTTATATTATATTCTAACACCCCCCTCACGCAAGAGCCCTTTGGGCTTGAAGCGTG GATGAATGCATAGGCCCACCTACCATGTGCTTAATTAAATTCCACTTTTTAATTAGAAAGTGAGGGGAGCAAGGATCAAA CTCTAGACCTCTCAGTCTCAGCCATAGAGGCTCTGATACCATGTCATAATAACCACTTATCCCAAAAGCTTAAGCTGTTG GGTAAGGGCCACATGAATGGTTTTATATTATATTCTAATAGTTTGGTATGACAGAGTGAGGCTGATCAGTCATCTTTTTA TCATCACTCAGCTGCTGGGTGTATATACTTGATTGTGTATGTGGATGGCATTGTCATTACAGGCACCGATCATCATGGAA TCACACAAGTAAAACAACTTTGTCATCACTTTCAGACAAAAGACCTTGGCAGACTTTGTTATTTCTTGGGCATAGAGGTT GCACAATCCAAACAAGGGATTGTGATTTCACAGAGAAAGTATGCTATGGATATTTTGGAGGAGACAAGATTGTTAAATGC CAAGCCAGTTGACACACCTATGGATCCCAATGCCAAACTTAGGCCAGCTCAAGGGGAGCCACTCTCAGATCCAAAAACAT ATAGGAGATTAGTTGGAAATATGAATTATCTCACTGTTACTCACCCAAATGTTTCATTTTCTTTTAGTAAGGTAAGCAAT TTCTTAATTCTCCATGTGAAGGGCATTGAGAGGTTGTGATTCGCGTACTGAATTATATTAAAAGTGCTCCAGGAGAAAGG TTAATTGTACGAAGATAAGGGACATGCACGAGTTGTAGGATACTCAGATGCATATTGGGTAGGTTCTCATTTTGATAGGA GATCCACCTCGGTAGTGTGTTTTCTTTGGTGATAACTTAATTTCCTAGAAGCGTAAGAAACAAAGCGTAGTGGTAAGAGA GAGCAGAAGGCATGAGAGAACTGGCTGCGATGATGGGCCATGTTATCGTATGTTGGGATAAAACCCATTCACATGGAACA AAAAGGAATATTCAAAGATTCACAAGGGATTTTGCAACTGCTTTGGGAAAGAGATATAGATGACATCCAAGCTATTGCTA AAACTGTGGAGTTGACTACAGTTTTGGGCATTGAAAAAGAGCAGTGGGATCCTGGTGGACATTATTGTCTTCTTCCTGTA TCACGGTTAACATTTCCAGATAGGAGGACTTTGGTGGGATTTTGTTTTAGGTATCTCAAGCTAGGACAAGGTCAATGCTT ACGGGAGGAGTATTGATAGGTACCCCTAGTTAGTTAGTAGTTTTGGTTAGTTGATAAAGTTAGCCATATAGTTAGTAAGT TAAGAGAGTTAGTTCACTTAGTTGGGCTGTAGAGGAAGAAATATAATAAATAAGAGAGTTTAGGAGGATTACATATTTTG GGATAATTTGTAATTGGAAATTGGCAGAAACTCAATAATATCAGCTTTCCTTTTTTCTTTAGTGCTAGAACCTATTAGTT TTCCACAATGCCTCATGAACATTTTATCCTTTCTCTGTATTAAGATATTTATGAAAAATATAATTCTACGTACCCTACTA GCTCAGTTGCTTCCTATGTAAAGAGACCTCAATATTAACTCTATTTTACGTTTTTTTTATTTTGTGGTTAAAAGTTGCAT ATATGTATATAGAAATTAGAAAATTAAATTGACATTCCTAGGTTTTTAATTGAGAGATTCTGAATATAGTATTGACAAAT GGTGGAAGTCAATCTAATTTCCTCATGCATATGTTGCTTTTGGCTTAAAAGTTTCTTGAATTTCATCTGACTTCTGTGTT ACCTTTCTCAATTAGTTCCTTGCTACTTTAATATTGCATTGTTTGATCGTGCAAGGATAGGTCTACATTTTCCTTTCTTT TATGATTTCCTATTTTGGTTAGAGGCATTGGACCCAGGCTTCTAAATAAATGGTACTTCTTCACAGAATTTTGCTGGAGA TGCATTTTAAGGAAACAAGTTGAGAAAGGCTTGGCTGTTCTACTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGC AACTCTTTTGCCTAGCTTTGATTTATCACTTTTCTCCATTCTTATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGG TAGACCAAGTCTTTTAGAGATATTTAGTATAATGGACATTGAGATGCTGTATATGTATTTAAAATACTTTTTTACGTTTT TAAAAGTTTTGGATGAAGATTTCATTCTGAATTTTTTGTGAATCTACAACACTTAAAAGAAAATTGATTTTAGATGTTCT TGATGAAGATTTCATTCTGGAAGTTCTGGAAATCTATAATATGTCGATGAAAATTGCTATCTCATACAAACTTCTTTGCG AAGAGTAAGATGGGCTTCTGTTTGTATATCGATCAATGAGATATGACTTTTTCATTAGATACAGGCAGTCTTTTTCTCTT TTTTTTTTTATGAAAATAAACTTCCATTCCTTTTGGCTTAAGGCTGAACCAAATGCAAACAAATTGCTTATGGAATCTGA TGTTGTGTCTTTGCTTCTGTAATATGCTTCTTCACATATACTATCTTTTTTTATAAAGGTTGTATAAATCACTTACCTTC AATTTTTTGCCCAGGTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCATGTATATGTGCATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGA ATGTTGATGTTTTACTCACTGACACCCAGACAGACTAGCTCAGTTAACTTGCTTATGATATGCTCGTAAGTTTTTACTCA TTTACTACTGCTGCTGCAATTATGACTACTTTATTTTTGCTTCTTGAATTGCCTATGCTCTCAAATGAATACCTGTTATA TTTTATTCTTGATCCCAGGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATTCGACTTGGTT CTAATAAAACGACTATATTTGAAAAGGTACTCTTATCTAACAAATCTATTTGATTGTTGATTCTCTTTAAAATGTTTTTT TGACAATATTGTGGGGCACTGGGTGGAGTTCCATTTCCATATATTGCTTACTGTGATAGATCTTCTTGCTTATTACTTTG GCACTTATATTAAATTAATTCCTAATAATCCTAGAAATTTCTTTTTCATTGGTTATAAGACTAGTCTATTATTTTGTTTA CTTGTACTTATTTTCACATGCCTTTCGTATATTCTTTTATGATAATTTTTCTTCTCAGCTTGTAACTGTTAAATTATCTG AACTTTAGCCTCAGAACACTTTGGCTCCATCTCCTTAGTAATATTTTCTTATTATAATTTGGTGCGTGATTTGGCTATTA CTGCAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAAATTTAACAAAATCTATCCACTTATTATGGT TACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATTTTCTGGGAAGCTGGAAGAGATATATTTTCA AAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATTTTACAAAGAGGTCTGAAACAAATTGAAACA AATTTTCCGTTGTTACAACTTTAGTTCAAGTTACTCACTGAAAAAATCTTATCTAAATTTGTGATACTGACTTTGCCATA CTTTTGATTGATTGATTTTGCATTATTTGTAGAGCGGTCTTGGCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTC CCCTGGCAAGGAATTTTAATGGTGTTGATATTGAATCGGCAAACAATTTAATGGTATGTAGACATAACTTCAAAAAGGTG GAAGCAATCTTGTCTCACCTCCCATTTAGCCTCTCATCTCATAGTTTTGACAGATTCAACATATGACATTTGTTACTACT ACAGTATAATCATTTTACACCTTAAACATTCAGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGA AACCAATGGACTGTCTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATG CTGCCATTAGAGAGCAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTT GATAAAGGCAGTAATTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAG TTTCAAGGCCAACATAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCAT CTGAGTCCCTTGATGAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAA 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0090700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGATGCACAGAAGCTGGACTGGAAGTCTTCTGGGATTTGCCATGGCTTGTTCAAATACTTTTGGACTTGTTACTGGTGC ATTTCTTCTTGGCTTTGGTTTGAGTGAAATTCCTAAAAGCATTTGGAGAAACGCTGAGTGGACCACCCGCCAAAAAGTAC TTTCTCACAAAATTTCCCAAATGGCTGTCAAACTCGATGATGCTCACCAAGAACTTTCAAATGCCATTGTTGTTGCTCAA GCAACATCCAAGCAGATGTCCAAGCGTGATCCTTTGAGACGTTATATGGATGTCATTGATGATATGCTTGCTCAAATGTT TAGGGAAGACCCATCCTTCAAACCACAAGGTGGCCAATTAGGGGAAAATGATATGGATTATGATACAGATGAGAAGTCAA TGGCAACACTAAGGCGTCATCTTCGAAAAGCTCGTGAGGAGTATTACAGATATAAAAGTGAGTATATGACTTATGTACTG GAAGCCCTTGAATTGGAAGATACAATGAATAATTATGAACGCCGCAAGTCAACTGGATGGGAATATAATTCAAGCATTAG ACCTGCTCGGACTGGCAAGTTGGGGTCTGTATTTGATACTTTAGAATTTTGCTGGAGATGCATTTTAAGGAAACAAGTTG AGAAAGGCTTGGCTGTTCTACTTGGTATCATGTCTGTTGCAATACTTTTAGCAGAGGCAACTCTTTTGCCTAGCTTTGAT TTATCACTTTTCTCCATTCTTATAAAATCTGTGAGAACACAGGAGATGCTTGTACAGGTGTTTGCTTTTGTTCCTCTCAT GTATATGTGCATGTGCACATACTATTCCTTGTTCAAAATTGGAATGTTGATGTTTTACTCACTGACACCCAGACAGACTA GCTCAGTTAACTTGCTTATGATATGCTCGATGGTTGCTCGATATGCCCCCCCAGTTTCATACAACTTTCTTAATCTCATT CGACTTGGTTCTAATAAAACGACTATATTTGAAAAGAGAATGGGGAACATTGACAATGCTGTCCCTTTCTTTGGGGATAA ATTTAACAAAATCTATCCACTTATTATGGTTACATACACCCTTTTGGTTGCAAGCAACTTCTTTGACAGAGTATTTGATT TTCTGGGAAGCTGGAAGAGATATATTTTCAAAACTGAAGATGATGATATGGATGGTCTTGATCCATCAGGAGTAATTATT TTACAAAGAGAGCGGTCTTGGCTTGAACAAGGACACAAAGTAGGGGAACAAGTTGTTCCCCTGGCAAGGAATTTTAATGG TGTTGATATTGAATCGGCAAACAATTTAATGGAGAGACATGTCGAAATGAAGACAAATTCCGATGTAATTACCGAAGAAA CCAATGGACTGTCTAAAAGTTCGAGGGAAGAGACAAGCAGATATGGTTCGAGCAGGGAAGCCATCAGTAACAAATATGCT GCCATTAGAGAGCAGGGAGGTCCAGCATCTAAACGGAAGGCAGAAGAGAAAAATGTAGCCTCTGCCAATTCCGTCCTTGA TAAAGGCAGTAATTCCGGTGGAGCGCCTTCTTCAGGTTTGGCTTCGACGTGGCTAAATATGAAGACAGGATTTCAGAGTT TCAAGGCCAACATAGGAGCCAAGAAGTTTTTACCAATACGGCAAATACAGGAAAGTAATGTGTCTTGTGTGTCGTCATCT GAGTCCCTTGATGAGATATTTCAAAGACTCAAAGGGACTTCTTTGGACCAAAATACTTACAATGAAGAGGACTAA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0090700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MMHRSWTGSLLGFAMACSNTFGLVTGAFLLGFGLSEIPKSIWRNAEWTTRQKVLSHKISQMAVKLDDAHQELSNAIVVAQ ATSKQMSKRDPLRRYMDVIDDMLAQMFREDPSFKPQGGQLGENDMDYDTDEKSMATLRRHLRKAREEYYRYKSEYMTYVL EALELEDTMNNYERRKSTGWEYNSSIRPARTGKLGSVFDTLEFCWRCILRKQVEKGLAVLLGIMSVAILLAEATLLPSFD LSLFSILIKSVRTQEMLVQVFAFVPLMYMCMCTYYSLFKIGMLMFYSLTPRQTSSVNLLMICSMVARYAPPVSYNFLNLI RLGSNKTTIFEKRMGNIDNAVPFFGDKFNKIYPLIMVTYTLLVASNFFDRVFDFLGSWKRYIFKTEDDDMDGLDPSGVII LQRERSWLEQGHKVGEQVVPLARNFNGVDIESANNLMERHVEMKTNSDVITEETNGLSKSSREETSRYGSSREAISNKYA AIREQGGPASKRKAEEKNVASANSVLDKGSNSGGAPSSGLASTWLNMKTGFQSFKANIGAKKFLPIRQIQESNVSCVSSS ESLDEIFQRLKGTSLDQNTYNEED 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
ProSiteProfiles 1 17 17 5.0
Phobius 1 11 11 -
PANTHER 2 582 581 1.3E-283
PANTHER 2 582 581 1.3E-283
Pfam 5 367 363 6.9E-63
TMHMM 10 32 23 -
Phobius 12 34 23 -
Phobius 35 215 181 -
Coils 127 154 28 -
Phobius 216 236 21 -
TMHMM 217 236 20 -
Phobius 237 255 19 -
TMHMM 256 278 23 -
Phobius 256 277 22 -
Phobius 278 297 20 -
Phobius 298 317 20 -
Phobius 318 350 33 -
TMHMM 351 368 18 -
Phobius 351 372 22 -
Phobius 373 584 212 -
MobiDBLite 450 472 23 -
MobiDBLite 484 517 34 -
MobiDBLite 503 517 15 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0090700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…