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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0136800 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0136800.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Proteasome activator subunit 4; TAIR: AT3G13330.1 proteasome activating protein 200; Swiss-Prot: sp|F4JC97|PSME4_ARATH Proteasome activator subunit 4; TrEMBL-Plants: tr|I1N058|I1N058_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0136800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:39852953..39877500) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGCGGCCATAAGAAGAGTGAAACTGAAAGTCAATTGTGATTTGCAATGAGAACACCCCAAGTCTCCTCATTCCTCCAATA GCAATAAAAAACAACAACAACAAATTTTCACTTCTTTCTCAACTTTATTCACCTTCCTTGTTCAGAAAGTTGCTCTCATT CTCAATCTTCGATCCTCACCCTTTCACACTTATATATAAACCCATAACCTTCCCCTTCTCTCAATTCTCTTTCAATTTTC TCGCACAAAATGCATCTCTACAATGCATGGCTTCCACCGCCTGTGGCGGCTCAGACCGCCGCCGAGAGAGACTCGTTCGC TCGCCTCATCGCCACCGTCAACTCTTCCTTCACCCGCGATGATCCTGAATCCGTCTTCTCCACTCTCAAATACGTCTCCG TCCTTGACCTGTCGGTTCCATTTTTCCACTCTCACCTTCAATTGCTGCTTTCTTCTGCTTGATTTTCCCCTAATTCGTAG TTGATTTTTTGATTTTGCTTCAATTTCGTTTTTGTTTTTGGTCAATTTTCTCTGCTGTGCTGCTTAATTCAGTGAAATGT TTAATTTCATTTTGATTGATTTTGGTTTGAAGTTTTAGCAAATTCAACTGGACTTGCAAATTCAATTGAGTGATTTAATT TCCCATGAAGTGTTGTGATCGAAGGTTTGTTAAGTATTGAAGGTGGAAGTTGCTGAAAGGCAATTCAATTATGAATTTTA TAGTGATTCTATGAGTGTGTGACTTGACTGAGAAAGTTGCAATTATGCAGATTACTTGACTGAGAAAACAGTTTGGAGAG GGAGAGTAGGAGAGTAATCGAGTCGCTTCGTTCATAATTGGTCTAATGTGTTTGGTTCAGCTTAATTATGCGAAAACATT GGCTTGCTTGTCTTTCAGGAAGTGTCTAAGAAAAATGACTATGCTCTTAAAATAATAGCTTATCCAAACATATAAAGCCT 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CDS sequence (LotjaGi6g1v0136800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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CCACGTACACCAAGTTGGATCTCCTTTTTAGGAAATGATATATTCTACTCAAGTTTTGCTCGTATTTTCAAGCGGCTAGT ACAAGAATGTGGCATGCCTGTAGTATTGGCTCTTAAAGGTGCAGTAGATGAGTTTACAATTGCCAAGGAGAGGTCTAAAC AATGTGTAGCCGCTGAAGCATTGGCAGGCGTGTTACATTCTGATATTGATGGTCTATCTGGAGCATGGGAAAGCTGGCTG ATGCCCCAGTTGAAGAATATCATTCTCACACAGTCTGTTGAATCAGTTCCTGAGTGGGCCTCTTGCATAAGATATGCAGT TACTGGTAAAGGAAAGTACGGAACAAGAGTTCCTCTTTTGAGGCAGAAAATTCTAGATTCATTGATGGAACCTTTACCTC CAACAGTACCTACCACCGTAACAGCCAAGCGATATGCTTTTCTGGCTGCTGCACTTATAGAAATTTCTCCACAAAGAATG CCAGTAGCTGAAATCCAGCTTCACAATACACTTCTGAAGGAGGTCCTTGGTAATATGTGCCACTCATCAGCCCAAGTGAG GGAGGCTCTAGGGGTTACCCTTTCTGTATTGTTCTCTAACATTCGGCTATGTCATTCAAGTTATAATGCTAATGCATGTG ATGAGAGAAACAACAATGTTGATAGTTTGATGGAAGATAAAAGCTGGGTTAAGTTTCTGACAGAGCGAGCAGCTGAAGCA GTTGTGAACATTCAGACTGCAACCCAATCAGATAAAGCGGTGAATCCCATGGATACAAGTTCACAAAATGGGCATTTAGA TGGTGATTCACAAGATGATATGAAATGGATGGAAACGCTACTCCACTTCATCATCTCATCATTGAAGTCTGGGAGATCCT CCTATCTACTTGACGTAATTGTGGGGCTTCTTTATCCTGTGATTTCCTTGCAGGAAACTTCAAATAAGGATCTGTCGACA 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Protein sequence (LotjaGi6g1v0136800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MHLYNAWLPPPVAAQTAAERDSFARLIATVNSSFTRDDPESVFSTLKYVSVLDLFIKAKSDVSLEDVRTLIQMGLELFHM SRSKLYAQVRWGNLLIRLLNKYRKKVALTIEWRPLYDTLVSTHFTRNTGPEGWRVRQRHFETITSLVQSCRRFFPSGSAF EIWSEFKSLLQNPWHNSSFEGSGFARLFLPTNSDNQDFYTHDWITECIDLWGSIPNCQFWNNQWADVVARVVKSYHNVDW ECFLPLLFARYLNMFEVPVANGSGSYPFSLDVPRNTRFLFSNRTSTPAKAIAKSIVYLLKPGNSAQQHFEKLVNILEQYY HPSNGGRWTYSLDRFLFHLVIQFQKRLQNEQLGTNNSKPTEQHLAESDRAFFVNLVLKLIDRGQYSKNEHLSETVAAATS VLSYVEPSLVLPFVASRFRMALETMTATHQLKVAVMSVAFVGRSLFYTSISASSMKPVDLGGGDETFIDLVGVSLSNALL GMDANDPPKTLATMQLIGSVFSNLALLDDKIDDLTLMPMIRFSEWLDEFFCRLFSLLLHLEPSSVINEGLHSSASSGTFL VDDGPYYFCLLEVLLGRLSKPLYNQALKKISKFVRTNILPGAIAEVGLLCCACIHSNPEEAVSQLVEPILASVISSLKET PRTGFGGGSFDASVSTKVRSTISPALEAAIDYQLKILSVGITYGGPALLRYKDQFKEAIFLAFDSPSWKVNGAADHLLRS VLGSQIHYYPIDQYKCVFSHPDAVALEQWISMKDFYTDERLIPKWHVPNDEEIQFANELLDIHFKSALDDLLKICQTKIH ADQGDEKEHLKVTLLRVESTLQGLFSCLPDFVPESRNGMVEDSNLTFLIAGATGCTIGSTALREKATEVIHAACKYILEK KSDDSILLILVIRIIDALGNYGSLEYDEWYSHRQAWKLESAAIIEPPINFIVSTHSKGKKRPWWALIDKAFMHNTWRSSQ ASYHLYRTSGNFCPSNHVTMLMDDLLSLCLHSYETVRLLAGKALVKLIKRWPSTISKCVITLANNLQEPNPKECEVLGSC SVLASQTVLKHLTTDPKSFSSFILAILSSSHHESLKSQKAINELFVKYNIYFSGVSRSFFRISEKDNHTGGLGFSDLVSQ IGSLSFESTGLHWRYNLMANRVLLLLALASRNHPSSSSKILSETAGHFLKNLKSQLPQTRILAISALNTLLKESPYKLSP GEKSAVVEDLQGNIKSSLEGTLTQTFEEEGFFNETLTSLSHVHIITDSESASRGNHGDSSFQSLADKSITRFYFEFSASW PRTPSWISFLGNDIFYSSFARIFKRLVQECGMPVVLALKGAVDEFTIAKERSKQCVAAEALAGVLHSDIDGLSGAWESWL MPQLKNIILTQSVESVPEWASCIRYAVTGKGKYGTRVPLLRQKILDSLMEPLPPTVPTTVTAKRYAFLAAALIEISPQRM PVAEIQLHNTLLKEVLGNMCHSSAQVREALGVTLSVLFSNIRLCHSSYNANACDERNNNVDSLMEDKSWVKFLTERAAEA VVNIQTATQSDKAVNPMDTSSQNGHLDGDSQDDMKWMETLLHFIISSLKSGRSSYLLDVIVGLLYPVISLQETSNKDLST LAKAAFELLKWMVVWEPHLQKAISVILSAANDSNWRTRSAKLTYLRTFMYRHTFILSSSKKQEIWSTVEKLLIDNQVEVR EHAAAVLAGLMKGGDEDLAKDFRDRAYLEANSVHRRRKLRNASSGPSVASVHGAVLALAASVLSAPYDMPSWLPEHITLL ARFSGEPSPVKSTVTKAVAEFRRTHADTWNVQKELFTEEQLEILADTSSSSSYFA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1815 | 1815 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1815 | 1815 | 0.0 | ||
| SUPERFAMILY | 291 | 1086 | 796 | 1.23E-5 | ||
| Pfam | 310 | 506 | 197 | 1.3E-29 | ||
| Pfam | 519 | 824 | 306 | 4.3E-23 | ||
| SUPERFAMILY | 959 | 1698 | 740 | 3.1E-23 | ||
| Gene3D | 1515 | 1703 | 189 | 1.5E-7 | ||
| Pfam | 1730 | 1815 | 86 | 2.7E-28 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Peptidase activator activity | Binds to and increases the activity of a peptidase, any enzyme that catalyzes the hydrolysis peptide bonds. | ||
| Molecular function | Lysine-acetylated histone binding | Interacting selectively and non-covalently with a histone in which a lysine residue has been modified by acetylation. | ||
| Molecular function | Proteasome binding | Interacting selectively and non-covalently with a proteasome, a large multisubunit protein complex that catalyzes protein degradation. |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0136800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…