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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0258700 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0258700.7 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | NADH-quinone oxidoreductase subunit I; TAIR: AT3G13640.1 RNAse l inhibitor protein 1; Swiss-Prot: sp|Q00388|VHUB_METVO Polyferredoxin protein VhuB; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RCT3|A0A151RCT3_CAJCA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0258700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:57160741..57167842) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCTCTGAGATGTTTCTGCGCCCCAGATATTCCAACTCAGTACCAAAACCATGGTTCTTCCCTGCTAAAACCTTTTTT ACTTGTCTCTTCTTTTTCTCTCTCTAACATACTCATAAAATTTGAAAATTTCCAGTGAAATTGGAACAGAGAAGCAGCAA TAAGAAGTGTCTTCAGAATGTGAAGAGTCTGGTCAACACTATTGAGCTTCCATCCATTTCATCTTCTCCACTTGAGTCTC TTCAGAGAGGCAACTGGGTCAAGCTCATTTGTGGTGCAAGCTTTGAGGTAATGCAAATTTTCATAAACAAACCCAACCAT GCTCTTCCTTTTTATTTGTTTTAACTTGTAAGTGATTTTAACCCCCTCTCTCTCTCTCTTTCTAGGATGTTGTTGATATC AGAAATCTCAGTTTGGTTTACACTCTTGCTGGAGGTAAGGTATTATATACTTATGATTTGTTTGAGAATAATGAAAATAA GCAGAAAATTGTATATGCATGATAATTAGAAAATTATCTATGTCTATTGGTGTTCTTGTTATTTTTTCAGCTATGCAAAC TTGATATTTTGAGGAACTAATGAGTAAGGAATATCATGTGAGTTAAATTGGATTATATATGGATGCAGTTGACTGCATTG ACTGCGCTGCTGATGCTTCGGTTGTCAGCGCTGTGAATGAAGGAATTGAAGCTGCAAGAGATATATTATGCATTCGAAGG CCGTGGGTGATGATCAGTGTCAATGATGACAAAGACCTTCACTTTCGTAAGGCTGGTAGGGCAATCAGTTCTATGGAGCT TCATTGTTGTATTTGTGTTTTCTATGTATTATATTTCAGCAACTCTATAGGTCAGAAATCTTGTGATATAGTTTGATATT CAAATATACTAGTTTAAGTGCAAAATTTAATGAACATAAAGCTCAGTCTATCACATATTGGCAATTCATGCTAATTGCTA 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AGTTCATTATCATAAGCTGCGCAGATTAGCTTATGAATAAGCACTATACCTACCTATTTTGAGCTTATTTCAATTAACTT ATCAAATTAGCTTATGAATAAGTATGTATGTGATAAACACTTAATTAAGTTGTTTACCCAAACACATCCTATATGTAGTT ACATAAAAGTATAGATGTGAGTCGCATCATGGGACTCCGGCATGTCAATTTATCCAATCTTACTATGTACATCTTTGTTC AGATTGTTGGTAGAGTATTGCGATCCATGCAGACCCAACATGGTGGAGCTGCTTCGATTGAGGATCATCCGGAGCATCTC TTGATGGCTCTTAGGGAAGCACTTGCATTGGTTGGACCTGTTAAAAATGTCTGTGATCCATGACAACCTCACAGTTTAAG TACTTTCTTTCATGCAGCAATATGCATAATAGTCTTTCGATAGTAGTCAATACTAATAGGTTCTGTAGCTTGATGCTTTC GTGCAATGCATGAGCAAGACATAGCAAGTTGAGGTTGGATCAATGTATATTTTGGTCTAAAATAAAGTTCAAGATAAGAC CTTTTTAAATAGAACTTGAACTTACCTTTGAACCTTGCAGTTGTATCCTAACTTCCTATTTAAAAGCATTTGTCAATGTT AAGCAAAATCGAGGGTTTATTTCAGGTTCAAGAAATCATCTTAAGTTATCACCTTTTAAAGCTAATAAGATAATTAAAAC TCAAACCAAGTTGTGTTATCACTTGTTTATTGCTTTGTTTGGAGATTTCAGGGCTCATTGAACAAGACAGATTCCCCATG TTATGGATATTTTACTTAAACATGGGTCATCAGTTTGCTGAATTTGACAATGCAAGCTTTTATCATTTTCATTCACCTTT AAGGAATATCAATTCTAATCATTGGAGAATATATAAAAATGTAAATACCATGTATATTTCTGTAAACAATTGTTGTATAA ATTTTGTCTGCGAAAGCATCAGTCTCCCTAGTGTAACAGCTATTGGCTAATTCAATCATAAATTTGAAATATATGTACTT ATTGATAGGGTATGAAAATGACTAAATGAGATATAAATTTCTGTGTAAACAATAATTTTAATATTCTACATATATTAATC TTATCGTTTAAAGCAAGTTGAAGTTAATTTTGTTTTTTGATAATATTCAATAATACATAACACAGATTGTCAAGAGGGTA AAGTGTCCTTTGGAGCTCACGCTGATTTACTCATCAAAATTTACCACGTGTCACATCACAGGTGGCTCTGGAAGTGATAT TTTTCAAATCAAAATCTCTTAAGTGTTGTGTTATATGTCCCCACCATGTTTAAGGAATGCAAAACCTCCCTTTAAGGTTG TTGTTTCTCGAATAATATTTAAGGGTAGAGAGGAGAGTTAATGTCTCACACCCCAACAAAGAAAAAGCTCAAATCTAATA TGGATGTGAATATGGAGAATTCAGGAGCTGAAAGTAATGGTTCTCATGCAAAGAATCAGGCATTAAGGGATGTTGCGGTT AAAGAAACATTTGACAAATTGGTCAGTTCAGTTCCATATCTTCAATGTATAATGGAGATTTCTACTTTTCTCTCCTCTCC CTTTGTGCACAATATTTGGCTCTATCTTTTGTTAGGTTGAAGAAGAAAGGAAGAAGATGGTCCCACTGAAGGAAACAACT CCTCCACCAATCCTTGAAGCTGCAATTAAGAATGGAAATGTCCGGGCACCAACTCATATTACTTCCACCATTTGTGATGA AAGAGGTACTATACTAATATACTAATGTTGTACATGTGATTTAGAAACTGTGTGTCTCTCTTTTTGATAAAGTTTTGTTT TTGGAAGGTGAGGTGCCATTATATGCTGGTGTACCCTTGTCTTCCATTATTGAAAAGGGTTATGGCATTGGTGATGTTAT CTCTCTTCTCTGGTTCAAACGCAGCCTTCCCCGTTACTGTACTCAATTTATTGAGGTATGTGCAGTGCTTTCCGGCAATG TTTTTCCCCATTATTTCTGTTTATGTTTTTCACTGGAGTATTTGAAATTGTTATACACTCTATAAAGAAGTTTCTTCAAA ATTTTCTACTCAGTTTTCCATTTAGTATTTCTTTTCAAAACAAACAATTGATATATCATCTTCCAGTTTCTATGGTGCTA ATGTATTATTACATTGGTCAGATGTGCATCATGTTATGTGCCGACCATGGTCCTTGCGCCTCTGGTGCTCACAATACTAT TGTGACAGCAAGGGCTGGGAAGGACCTGATTTCTAGTCTAGTATCAGGTAAACACTAAATACATGCCTCTCGGTGCGTCT ACTTCTGAAGCAGACTTAGTGTGTTTGGATACCAGTTAAGTTTGATTGAGCGGGCTTTTATTATAATCCCATAAGAAAAG TTCTGTCCATTTTTTTTTTCTTGAAGTGTGCTAATATACATTGGCACAATGGCACTGATGTAAACATATATCCAAACATA GTCTTACTATATTGTGGGATGACCAAAACTTTCTGAAACAGGTTTGCTTACAATTGGTCCTCGATTTGGCGGTGCCATTG ATGATGCAGCTCGCTACTTCAAGGATGCTCATGACAGGGTATAATATGAGTAATTTTCCAACAAAGCTGGATGGAACTAG CCAACTAAAATATAATTGGGGAGAGGGGTTGTAAAGAAACTAATCCTAATGAGATATTACATTCTAAGTGAAAATCAGAA ACTCCATACAAACATGTACTTTGTCTTTCATCTAGCATGTGGTGCTATTATTATGTACTTTGTCTTGTCTCAGGGGCTTA CGCCTGATGAGTTTGTTGAAAGCATGAAGAAGAAAGGAATTCGCGTGCCAGGAATAGGGCACAGGTAATGAATGTAATTT TGATCATTCACTAAGTAGTAGTTCTGTTTCTGTTGCTATGAAAAATGAAAATTTATGAGACTTGGTTTTGCTTTGTTAAC AGGGTCAAGAATAAGGACAAGAAAGATAAGAGAGTTGAGATGCTACAGAAGTTTGCACGGGCGCATTTTCCTTGTGTGAA ATACATGGAATATGCTGTTCAAGTTGAAGATTACACCCTCTCAAAGTCAAATAAATTAATTCTCAATATTGATGGTGCCA TTGCATCTCTTTTCTTGGATCTTCTGGCTGGTTGTGGAATGTTCACAGAGCAAGAGATCAGTGAAATTGTGGAGATTGGC TATCTGAATGGGCTCTTTGTGCTGGCACGCTCCATTGGTCTGATTGGGTGAGTTTAAATTAGTCAATAGGTACATATTTC ATGTGAATTGGACATTATTGAAGTTTTGGAATTTTGTCCCTTTTTTATCCACAATTCTCTTGTGGTCCATGGAGTTACAC TTTCATTTAGGCGGTCCTCACAGTCATTAATATTGGTTGTTGAGTGGTTACCAACACTAGATATTGAAATTCAGATTTCC TGCTGTCTAGAAAGTCAGTGTAAACCCTAAACTCTGTTTTGAGGGCATAGTAGACCTTTTTAAATTGAGTCGTCCGATCC CTAATTCCTAGCACCTGGGAGTGCATAGTAGACCTTTTTAAATCGGAGTCGTCCGATCCTTGATTCCCAGTACCTGGATA AGTGAAATGAGGAATCTGACGACTCTGATTTAAAGAAATATGCGGTAAACTTAAAATCAAAGTTGAGGGTTTACACTGAC TTCATTGAATTCAAAACTCTCTTAGTGCGGGAGTGAGTAGATATTACATGTCTTATATATGATGGGACTCACATAAATTT CAACTGATAAAATAGAATGCTGGAAATAGAACGTAAAAGTGAGTGTTAAGGTACCGCTCCTTAAAAAACCAATTATACAT GGTTTGGTCTAGTTGATTGATCCTTGTTTAAAATTTCAGCCATGCCTTTGACCAAAAGAGATTGAAGCAACCCCTCTACC GCCACCCATGGGAGGATGTTCTCTACACAAATTGAGAAGGTTCTGTGTTATGGCTGGCTGGAAAACTTCGCTTCGTTTCA GATTAGGAATCTGTTGAGAAATCATGCATCTCAAGTATCCTGGAATAAATTTTTTAGATGTTAGAGTAGTGTTGCCATCA GTAAGTTGAAACGAACAAATTCACTGTCAAATTTGAAATTACTACTGTAATTCTCTTGGTGAAGATGTTGAAGTAAATGA TTGCCAAGTTCAAGAGCTTTTAATTCTGCTAAATAACGTTGTTAATTAATCTGACTGCATCA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0258700.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGAAGCAGCAATAAGAAGTGTCTTCAGAATGTGAAGAGTCTGGTCAACACTATTGAGCTTCCATCCATTTCATCTTC TCCACTTGAGTCTCTTCAGAGAGGCAACTGGGTCAAGCTCATTTGTGGTGCAAGCTTTGAGGATGTTGTTGATATCAGAA ATCTCAGTTTGGTTTACACTCTTGCTGGAGTTGACTGCATTGACTGCGCTGCTGATGCTTCGGTTGTCAGCGCTGTGAAT GAAGGAATTGAAGCTGCAAGAGATATATTATGCATTCGAAGGCCGTGGGTGATGATCAGTGTCAATGATGACAAAGACCT TCACTTTCGTAAGGCTGAATTTGATCCAGAGGACTGTCCAGCAGACTGTTCACGGCCTTGTGAAAATGTGTGCCCTGCTA ATGCAATATCATTCCAACGAAAACCTAATGTTGGAAATATGATGTTGGAAAACCTAAAGGATGGAGTCATCACTGAACGC TGCTATGGCTGTGGTCGCTGTCTTCCAGTTTGCCCCTATGATAAAATTAGAGAGGTAACATATGTTAGAGATGCTATCAC AACTGCTGATCTCATCAAAAGAAATGATGTTGATGCTATGGAGATACACACAAGTGGGAGGCAGAGTACACTGTTCGAAG AACTCTGGTATGCTCTAGGAGACACAGTACAAAATTTGAAGCTAATAGCAGTTAGCTTACCTAATAATGGGGATTCAACA ATATCCTCCATGAACAAAATGTTCTCTATTATGAAACCCAGTCTTCGAGGCTTCAACTTATGGCAGTTAGATGGCCGTCC CATGAGTGGAGATATTGGGAGAGGAGCCACTAAGGAATCAATTGTGTTTGCTGCTCATTTGACTAAAGCAAAAGATAGAC CTCCAGGTTTTCTTCAACTTGCTGGTGGAACTAATGCTCACACAATAGATGGGTTGAAAAAAGAGGGACTCTTTCAAACA ACTATAACCGAGTACCTAGATGATGAAATGTCAACAATCAGCTCATCTAATTCATCACATGTTTTAATTAGTGGCATAGC TTACGGTGGCTACGCACGGAAGATTGTTGGTAGAGTATTGCGATCCATGCAGACCCAACATGGTGGAGCTGCTTCGATTG AGGATCATCCGGAGCATCTCTTGATGGCTCTTAGGGAAGCACTTGCATTGGTTGGACCTGTTAAAAATATTGTCAAGAGG GTAAAGTGTCCTTTGGAGCTCACGCTGATTTACTCATCAAAATTTACCACGTGTCACATCACAGGTGGCTCTGGAAGTGA TATTTTTCAAATCAAAATCTCTTAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0258700.7) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MRSSNKKCLQNVKSLVNTIELPSISSSPLESLQRGNWVKLICGASFEDVVDIRNLSLVYTLAGVDCIDCAADASVVSAVN EGIEAARDILCIRRPWVMISVNDDKDLHFRKAEFDPEDCPADCSRPCENVCPANAISFQRKPNVGNMMLENLKDGVITER CYGCGRCLPVCPYDKIREVTYVRDAITTADLIKRNDVDAMEIHTSGRQSTLFEELWYALGDTVQNLKLIAVSLPNNGDST ISSMNKMFSIMKPSLRGFNLWQLDGRPMSGDIGRGATKESIVFAAHLTKAKDRPPGFLQLAGGTNAHTIDGLKKEGLFQT TITEYLDDEMSTISSSNSSHVLISGIAYGGYARKIVGRVLRSMQTQHGGAASIEDHPEHLLMALREALALVGPVKNIVKR VKCPLELTLIYSSKFTTCHITGGSGSDIFQIKIS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 12 | 396 | 385 | 4.8E-197 | – | |
| PANTHER | 12 | 396 | 385 | 4.8E-197 | ||
| SUPERFAMILY | 100 | 186 | 87 | 2.3E-14 | – | |
| ProSiteProfiles | 110 | 141 | 32 | 9.365 | ||
| Gene3D | 114 | 215 | 102 | 1.7E-8 | – | |
| ProSiteProfiles | 152 | 181 | 30 | 9.264 | ||
| ProSitePatterns | 161 | 172 | 12 | - | ||
| Pfam | 191 | 392 | 202 | 5.8E-62 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0258700.7, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…