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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0292500 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0292500.1 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | AAA-ATPase 1; TAIR: AT4G27680.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q7ZZ25|ATD1A_DANRE ATPase family AAA domain-containing protein 1-A; TrEMBL-Plants: tr|I3TAQ1|I3TAQ1_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0292500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:70963084..70973747) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCCCAATATAATCATTTTGTCCAAGCCCAAATATAAGTCATTTAATTCCGAACCCTATCTTTCCTCATCCCTAACCTTAC CCAGCCATTGTCGATTCTTTTTCTTCACGAAGAAGACACAACAGAACAATTTTCGTTCCCAAGGGTTTTGGAGAGAGAAC AACAACAACAACAAGAACGAATTTTGATAGTAAATTAATCTCAACCCCTGATACAATTTCAAATTTTCATGGTCTCAAGG GGGAGAATGGGAGCGGCTTCAGAGAAATTGCTACAGGACATGCTGTTGTACGCTGCTAGCGCGGCTCTCAGTTGTTTGGT ATTGTTCGTCGGGCTTCGCCAACTCGACCCGAATCGCGAGGCGTCGAAGAAAGCCCTTGAACATAAGAAGGAGATTGCCA AGCGTCTAGGTCGTCCCCTCATTCAAACCAACCCTTACGAGGTCCAGTGTTTTATCTTCTTTGTAAATTTCAATTGTTTA TATCTGGATTAATATTTGATTTCACAGAATGATACAAGTTACTGAATTTCTTCCCGTATCAATTGTCAATATGAAATTGT TATAATTGCATTATTTGTCTTATGCATTTGACATAAATTACATTTGTATTTCTTGCTTAGTACCAGTGTTATTTGTCCCG GATAGCGGCACGCATTAGCCAGCCCCAAGAATGCTATAGCGGTATAGCGCGTAGCAGGATGGTTGCTATGCTGAATTTTG TGTACAGTTTGTATAATTTAACTATATACATATATGAATGCTCAAGAATGATAAAGATGCTTCAAATTCATGGCACTCAT AATTAACCATAAAAAGTCTCATAGGTGTCTTATACAAAACATACAAGTACCCAAAGGAGCCAAGGTGACCAAGAAGCTTA TGCCTCTAATGCTTAAACTAAACTGTCTAAAAACTTGAAAATTCAAATAGAAGTTCCATAAACAGGAATCATCTATCATC CTCTTCTAGATCCAAGTCTTCCTCTTTATCACTTTCATTGCTATCACAACTCTATATCACTTCCTCCTCTAAGTAGACTC TTTTCAACATGTTTCTGAAGAAAAAACCTTAAATTTCCCCAGAAATGCCCGAACATAACTTTTTAAGGGCACTTTTTGGG TTTTTATCAGTTCCAGCAAATAACGCCCAAATAGTGCCGCTATGGCTGCTTTTTCCTCCGCTATAGCAGCCGCAACAGCT GCTACTCTGAACTGCACTGCTACACTACAACTAGTTCACTAGAAGTGGCCAGGGGATGCGGAGCACTGCTACGACGCTAC TTCAACCTATTGACAACCCTGCTTACGACCCATTATTGAATTATATGCTGAGTGTCCCGGTGGGAGTAACTGGTGCTTAT TAATGATGAGCAGGTTTTGTGGGTGTTTCTAGTTTTTAGGTTGTTTAGGATAGTGATAGATTCGTTGTTCTTCCTTACTA ACTCTATTTATGTGGTATCTCTTAGACATGGTTGGTTTCTGCTACAACTTTACTAGTTGTATCTTTTCTTACTAATGACT TGGCTAATGGTATGGCTGGGGAAGATGAGAAACAATGTGTTTGGTGTGTATTGTACTTCATTGTGTGTGTCTCTGTTATT CTCTGCCCTTTATATTACAGCTTAAGTTACTTGGTTGAAATTTGAATTATTTGAATTGGTGGAATAATTTATTATTTATT ATTTGGTAGCTAACTCTAATTTAAACCGTCAAGTATAACTGCCAGTGCTAATAGTCTTCCTAGAGGGATAGGGCTTGGTC GTTGTTGGTGTACTACTCATGAATCATGATGTTTTCACGGCACTTCTACAATCAATGTGAAGATGGATTCATAAGTCTAG TCAATGGTGTACTTGGTTGAAATTTGAGTTATTTGAATTGGTGGAATAATTTTTTATTTTTTATTTGGTAGCTAACTCTA ATTTAAACCTTCAAGCATAACTGCCAATGCTAATAGTCTTCCTAGAGGGATAGGGCTTGGTCGTTGTTGGTGTACTACTC ATGAATCATGATGTTATCACGGCACTTCTACAATCAATGTGAAGATGGATTCATAAGTCTAGTCAATGGTGTTCTAAAAA GAGATTCCTCAATTCCTTATAAAGTAATCTACAATGATTTCCCAATACTGGCCGTTTTCTTCGATAGATGAAGAAATTAA TTTCGGAAAACAATTCTATCCAAATAAACACAGTAAAGAAGGACTAGTTCATAACACATATCCTTTTTGGAGATATGTCC TTCCTTTATTTACTGGAATGTATTTTTAGTTTTACGATATATATTATTATTAGATCATAATTAAGTTTTATATTTATTGA ATTTATGTCCTTTTTTGTGTACAGGATGTTATAGCCTGTGATGTTATTAATCCTGACCACATTGATGTGGAATTTGGGTC TATTGGGGGACTGGAATCAATCAAGGAAGCTTTGTTTGAACTTGTTATTCTACCTCTAAAAAGACCTGACTTGTTTTCAC ATGGTAAGCTTCTTGGACCGCAAAAAGGGGTCCTATTGTATGGACCCCCTGGCACAGGAAAAACCATGCTTGCCAAAGCT ATTGCCAAGGAGTCAGGAGCAGTTTTTATTAATGTGAGGATATCAAACCTGATGAGCAAATGGTTTGGGGACGCCCAAAA GCTTGGTAAGTGCATGTTTCTTTATTGATACTTTTACAGTAAATTATAGAACTATTTTATACAATATGCTTTAGCATCTC CAACGTTGAATTTTTTTTGTTCATAAGGACATTATGATTGTCTTAATTAAATTGACGAAAACTCATCTGGACCCTTTTTT TTCATAAATGCACGATTACACAAAGATCCAATAAACTGTCAAACACTTGTTGTTTCTTTGGGTTGAAGCACCTCTTGTGC TTCCTTTATTGTATTTGGCTTTTCAAAAAAAAAGATCCAATAAACTGTTTATGATTACTTTTCTCCTGTGTAAAAGCTTG ACATGCTAGTTATTAAAACCATTGTATATAATTTCCTTTGTATTTCGCTACATGACTTGTGTGCTGCAATCTTGTTTCAC TCATTGCTGGAAGTGTTATTATGTGCCATAGTAAGGTTGATTGTGCCATCTGTGATTTGAAGAGCAGTTCCAATCTATTT CCTTTCTTTTGCTTGATAAAGGATTTATTTTGTTAACCACTAACTATAAAAGTTTAATCCTAAATCTAGAATGCACAACT AAAATTATGTCTAGACTCTTAGTGTGTGCTTGGATAGAGAATTTTAAAAATCAAGAGAAATTTTAATTCTAAGAAATTGA ATATATCAATTAAATTCCTTGAATTCATAAAATATCTTGTTTGTATAAAACCTTGCCTTTCTAAAATTGATGAAGTCCTG AGCGTCAAGAGCAAGAGACATGACGGGGTGGAGAGTTACTCGTTGTGCATCTCCCAGAGAATTTGCATTTTCCTTATTGC GAGATGTTGTTTCAAATCCTGTACATTTAGCTAAACAAAATACTTGATATAAATCCTGTCATTTTTATAATTCCACAAAT ATCTAAACAGTATATTTTATTACAAATCATTTTAATTACCCTTTTTAAATGCATTGCCTCCTGAAATTACTTCATCCAAA CACTCTTAGATGTTGGTTTACTGGATTACCTTGAGAGGACAAATATGACAACCATTGTTAGTTTGAGTCAATCACAATCA GAAATTCTGCATTATTTAGTGACCGAGTGAATATTCTATTCCCTTGCAGTTCCTCCGTGCCACTCTGTCAGATTAGAGTA GGATTCTCTCCTCAGGTATATTTAATACTATGGACTATGGTTTAAAGGTCATTGTTGTAAGTAAGCCCATACATAGGACC CAATATAATATCCACCTTTGAGTAATGCTTAATAATAGTACAGCTAACAATCCCAGTCACTTTATTTAGTCTTTACAAAA TGCCCTAATTAATTTTGATGAACAGAACTGCACAAATTATAGGTGGATTAAACCCATAGGTCATATTATGAAGCTATGGG AGAGGGTAATTGAACAAAGATTACGGCAAGAGAAACTTCCGTACAAAACAAAACAATTTGGCTTTATGCCAAGGAGTTCA ATATTGAAAGCAAGATACTTACAATGGAGATTTTTTTTTTTTGATAAGCACAATGGAGATAATAGTGTGGTATCCTACGA GGAATGAAAAATACTCGCACATGGATTTCGAGCGTAATTGGTTCTCTAGGGAGATATTGTGTAAGGCCGTGGAGAGAAGA GTTTATATTGCCTTAATTCGAGCGCATTATATGTATGATGGGGTTATGACAAGTTTGAGAACACAAGGTGAGCAGAGAGC ACTTTCCTAGTAACTATGAAATGCACCATGGGTCAACTTGAGCCTTTATCTTTTTACCAGTGTTTTGGATGTGCTTTTTG AACGTATCCAAAAGCCCAGATGACATGATGCATGCTTTTGCAATGATAATCCTAGTTAGATAGCCAAGAGAAGAAATAAA AATGAACCTAGAAATGTGGAGACATGCTGTTATCCAGTAACTTGTTCAGAAATATTGTAATGAAAGGAATATAGGAGTTT GCCACCATTTATTTACCAAATAGGATTGTTCAGTTCTTATAGAACCTATCAAAAGGACATGGTTTTTGTTTAAGAAGGAT TAAGTGAAGTATATGGGATTTCACTTTAAGCAAAAAGGTCCATTGCTAATAGCATAGAGGTGATAATTAAAAATTGGAGT TATACCTGACCTGCAAGTCACATGATTTAATTATCCTGGGCCTATCATATAAAATTATGGGAGTATACAGGGTGATGTAG ACCTAAGGGAAAATTTATAAGATTAAGGGAAAATTTTACCGCACAACTATAAGAACTACGATGTTGTATGGGATTGAATG TGTGGTAGGCTAATTAGAAAATAAACTCAATGTTGCAGATATGAGAATATTTTGATGGACGAGTGGACATGAAGTCTAGG ATATGATTAGAAATGAATGCATTAGAGAGGAAGTTAAGATTAACATTTATATTTTGAAAGATTGTCGAATTTTGTCTTCA GTAGTTTACAGAGATTGAGAAAAACCATAGGTCAAACCATAAGAAAGGTATTCGATAGACTTAGACATGATTTACGATAG GATATTATGACATCACTTGATCTATGTAGGCAATGTAGCCAACTCCACATAATAGAAAAAGGATTTTGTGTTGTTGATTT AATCAATTTTAACCTCCAGTTAGCATTTACCCATTTGGACAGCACGTCAAATTTTAAAAATATTTCCAGATCAATGAAAC AATGTGTGAACAGAAGAAGATTGGACATATTAGCCAGCACTCAACAAGTTACCCAAGGTGGAACTACGAATTTACTGACA TTGTAGAAAATCATACTTGATAGGAGTACTGACATCATATATTAAGATGCGCATGTCTTGGGTATGGTAGTCGGAAGGGC CATAGGGAAATTATCCTGTTAAGATAATAAAGACCTTAGAAGTAGTAGTTTAAACATCAGCATGCTGCTATTTGAAGATA ATGATATTTGACTGAAAAATTAGTTTAACATCTTTAAGTGTAAATTTTTTTAACACATTACAATAGATGTCAAAGAGGTC TCCTGTTGTCCCAGTATCTTCATTTTTAGAGAAGTAAATCTTTTTCTCCCATGGTTGTGAAGTGAGAACAACCGTTGTCA TCATCTAGATGCTTTACTAATTATTTAGTTTCACTGCAAAAGGTTATAGTTGCTACTTCCATCAGGTGGAAAACCCTACA TTCAATAATATTTATATGACAGATAACCCCTGTCAAAGACCTGATAAGTCTTATTGACTTGTTATTATGGTTGAAGTTTT ATGGATATCTTGTATGATGATATTATTATATAATCTTTTGAGTTTATGAATTCGAAATTATGTGCATTGTTGATGCTTTT AGGTTGTCCTCTGTTAGAATATAATATAAAACCATTCATGTGGCCCTTACCCATCAGCTTAAGCTTTTGGGATAATCGGT TGCTTGACATGGTATCGGAGCCTCTATGACCGAGAAGTCTAGAGTTCGATCCTTGCTCCCCTCACTTTCTAATTAAAAAG TGGAATTTAATTAAGCACGTGGTAGGTGGGTCTGCGCATTTATCCACGCTTCAAGCCCAAATGGCTCTTGCGTGAGGAGG CGTGTTAGAATATAATATAAAACCATTCATGTGGCCCTTACCCAACAGCTTAAGCTTTTGGGATAATCGGTTGCTTGACA TCCTCAAAATCACGTATATGTATAATACGGTTCATTAACCAGCATCAAGGAATTTTTATGTTCATACTTATCTAGATATT TTGTGTATTTAGTTATTTTAGCTTCTTGATCATTCTTGCGTTGTCTTACATTTATCAGAATTTGTTGTCATATATTTGTA ATGTGCTGTATGCCTGTATCCATGACCCGCGCCAATATTGATGTTTTTAGTTTTTACTATACATTGGCAATATATTGAAC AATGAGGAAAATATTCATGGGTCATGGCAATTTATTTAGATTGGGAGTTGTCTTGAGAAAGAAATATGTAGGTAATAGTT ATAGCATGCAAGTGCATCATTCAACTTGTATTTTTGGCTTTCTATTTCTTAATAGGTTGGTTTGACAAGTTGACATCCAC GTTAGTTGTACTATGAAAAGAGATGTTCTTTCTAACTGATGTGTCAATCTGTTTCATGGATGATTTTCTGTATTTTTTTA ATGGCAACCTGTTCTGAGATTTATAGTGGTCTGTCATTGTTAAAATGAGCTTATAGCAGATCAAATAACATTTGAAAGTA GAAGTGAAGTTACTAGCATGGGAACCAATCTGGTCCTAAAAAGGATAACCGGCCCCTGTTGGTCTACTTGTGAAAGCCGA AAAAATAACAAGGCCAGAGAAAGTGGCAGGAGATATGGTTTAGTGGTGGGAAGAGTTAGTTAGGGAGAGAGAATGTAATA AGGGAAGGGTGTAGTTCTGTTATATAGGGAATAGAGTGAATATATTATATATGATGCACGAAAGTCATTTTTCTGTTATT AGTGGGGAACCAAGGGGTCACATCCTTGGTGCATCTCTGCTCTTTAGCGTGTTCCCTTTTTCATTGAATAGTAATACATG CAACGACGGATCCACGTGAAACACTATGGGGTCAAATGCCCCCACCATTTTTTTGGAATAAAAAAGTTTCACAAGAGTAA TAAACTAGCAAAAGACTAAATTAAGCCCCCAGCACCAATAGTATACCAATAGTATGCCCCCACGTAAAAGTTTTTCTTCA TGTGCTACATTGAATGCCCCCATAGTATTGGTTTGTTGGATAATGGATAAATTTTAGAGGAGTGCAAACTATACTTACAA ACTATACTCTTTTTTTATAGTAATAATGTATTTTTAGTGCTATAAGTTTATATGTATAACTTTCAAAAAAAAATTATACG TATAAGTTGCCCCCACAGCTTAAAATTTCTGGATCCGTCACTGAATACATGCATACTGTTTCAGGATTATTTTATTCCCA TCATGAAGCCCTTTCCCTCCACCTAATTTAGGATGTTTGACAAATTTATGTAGCTGCTAAAGGCTTACAATCGGTCAGGA TTGTGCTCTTTTCTGAAAGAAGTTATTTTAAGAACAGTTTTTTTTTTAAATAATCATTTATAAGGTTAAATATCACAAAC TATTCCTGTTTTAGAACGAGTTAAAGGATTCCCTTATATGTTGCTGCTGGCTGAGTTTGTCCCCCGTGCATGTTACCTTG CCTTGAGTTACCGTGAGGGTGTATAGTGATGGCCACATCAGTATATGTTCTCTAAATATTGTGGATGAGCAAATGTGGTT GTTTGCTTGAAGGTCGAAGCCCTGTTCAGCCACATATTGGTAAATAATATGGTCTAAATTCTTCATCAGAAATGTTGGTT AACAAGGGTACCTTGGAATTCGTAACTAACTAACTATGCGTATATTTCTTAAGCCCCCACTTTGTGATTCTAGAATATAA ATTTGCCTAATTGTTATTGTGCATAATTGGTTTGTATCATGAAATCAACCTCTTGTAATGCCAGGCAGATTGCCTACTAT GATCCATAATGAGTTTGGTCTTTCACTCTTTCCAGACTTCGCCATGACTGAAGCTTTATAACACCAAGTTTCCCTGCTTA TTGCGCTTAATTATGCTCTATGTTCTTTATCTGAATGGCAGTTCTTTCTTTTGGTAGACTGTTAATAATATTCTGATGTT CTTCTGCAGTTGCTGCTGTATTTAGCTTGGCTCATAAACTCCAGCCTGCCATCATATTCATTGATGAAGTTGACAGTTTT CTGGGTCAACGTCGAACAACAGATCATGAAGCTTTGTTGAACATGAAAACTGAGTTCATGGCTCTTTGGGACGGATTTAC CACCGATCGTAAGTTTTAAGACTCATTATCATGTTATTTTCTTCAGTTGCGTAGACATTCAATATAAGTTGCACATGGGT GACAATTTCAATGGAGATTCAGTAACTTGGTAATTTTGTTATCTATATTTGAGTAAACTAGTTAATTATGATGACTGCAT TTTTGTGCTCTTGTAGAGAATGCTCGAGTTATGGTCCTTGCAGCTACTAATCGTCCTTCAGAACTTGATGAAGCAATACT TCGACGGCTTCCTCAATCCTTTGAAATTGGAATGCCAGACCAGAGTGAGAGGGCAGAGATATTAAAGGTTATCTTAAAGG GTGAGAGGGTTGAAGATAACATAGACTTTGGTCACATAGCTGCCCTATGTGAGGGTTACACTGGTTCAGATCTATTTGAT CTATGCAAGAAGGCTGCCTATTTTCCTATTAGAGAACTTCTCGATGATGAGAAGAAAGGGAAACGATCTCCTGTTAGTAC ATTTCACTCTCTTCCGGTTGCTTTACCTTAATTTCTTTATTTTGCCAATAGTGAACAGTACCATTACCATCTACTGCTGA TTTGGCTAGAATGCAATTCCTTGTCAGTTTCAATTTCTGTTAACTAAAAGAGAAGATTTTTTTTAGTGCAAAGTATTTTA TTTGAAACTATACTGTGCACTCAAAGTTATAGTTGCATGACTAGAAGCATCTCTGGTCAATAAAAGATATTTGCTTGTGC TAGATCAGATTGTGACTGTGTGGAAACGTTTCCAGATATTAATTCTTGTTAAAGAAACTGATTAATCTTCTCTTGGTGGC TTTCTCATAAGTGCAGGAGATTGTGAAATTACTAAGCTGTTTTATTTATTTTTCAAGTTTCAGGCATCTAGACCTCTGTC AGAGTTAGATTTAGCGAAAGCCCTTGCCACTTCACGAAAGACAAAGGTTGCTGCAAATGAATATGGTGGATTAAACCTAA GAGTGCAAGGCGAGTCAGGTGATTATCAGATTCAAGCTGCAATCAATGAATTCTCTAAGCTAGTGGTTTCTCACATGGTT AACCTCCAATCTGATTCTCAGGATCCTTAAAGTGTTGAGTTTATTTTTAGAGCAATCTTCTACTGTCATTTAGCCTAGTT CAGATTGTACCAGTGGTTACTTCCTAGCAATATTTATTCTAGAACATATTGTTACTACACATTGATAATATAAGTGCCAT GATTGGCTATTGCATTTTGTTCAGCAATTGATGGATCAGCCCCTGCAGTAGCACACTTAAATATTCCATGCCTAGGCAAA CTCTATCTTTTATTACTGTTAGATGATGCAAATATATTTTCATCATTCCACCTGTATTTAGTGTGATATGATCCAGTCAA ATGACAAAGTGGTAGTCTTTATTGTCTGTCTCTCAGTTATCAATGCATCCACATTCTGACAGTACATAATTCTAAGCCAA ACTTACAAATAAAAGGATAGATTAATTTTCCATAAGGCCTGAGCTGTTAAATTGGCTCAAGATCTAGGGAAGAGTTGAAT CATACATTCCAATATATTTTGTTTAGCTTTTAGAAGAGAAACATACAATTGTTTGTTACAATTCTAAATAACTCTTACTT GTGGTCCTATCTATACAAACTTAATATAAAGTTCATCTTTCTTGATCTATTATGTGATTTAATCCTTGAGTAGTATAATT GGATCTAACACTGACATGGCAACAACTGCAACAGAGTAAGCTAAGATTCATGGTCAAGTTGCCAACATCCATCAATGATT GAGACCTTGGGGAAATAACTGGCATTGAAGTGGGTTCTGCAGCTTATACGTAAAGCAGTGTGGGTCAGTTATCATCCCTG GCTCTCTGGTCCACTTGTATATGATGATGATGATTAACACAAACCCTTTAAATTTGCAAGCTGTTCCATCACCATTCATT CATTATAGTTAGGACCACAAATTTGTACCTTTTTTTTAACAAGAACATATTTCTTCCGGGACTGCAGGACCACCACTTAG GGGTGTATCTTCTTCAGTGTGTGGCTTGTTTGATGTTTTTCTCGTGGTTACATTATTACTTAAACCACTTTTAAGGTTTC AGAAACAAGGTAAACATGGAAATAAATTCTAGATAACCACCACCCACATGCAATAGTTGTATCCAATCCATGAACTGTGT AGGAACGTGGGAAGAAATCAGAACAAATAAAATGGAAAGTAAAAAAAAAAGTTGAGAATAATTGTGTATTTGTTTGGGAG AAGAAAAAGAATGAAAAGTTTGGA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0292500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTCTCAAGGGGGAGAATGGGAGCGGCTTCAGAGAAATTGCTACAGGACATGCTGTTGTACGCTGCTAGCGCGGCTCT CAGTTGTTTGGTATTGTTCGTCGGGCTTCGCCAACTCGACCCGAATCGCGAGGCGTCGAAGAAAGCCCTTGAACATAAGA AGGAGATTGCCAAGCGTCTAGGTCGTCCCCTCATTCAAACCAACCCTTACGAGGATGTTATAGCCTGTGATGTTATTAAT CCTGACCACATTGATGTGGAATTTGGGTCTATTGGGGGACTGGAATCAATCAAGGAAGCTTTGTTTGAACTTGTTATTCT ACCTCTAAAAAGACCTGACTTGTTTTCACATGGTAAGCTTCTTGGACCGCAAAAAGGGGTCCTATTGTATGGACCCCCTG GCACAGGAAAAACCATGCTTGCCAAAGCTATTGCCAAGGAGTCAGGAGCAGTTTTTATTAATGTGAGGATATCAAACCTG ATGAGCAAATGGTTTGGGGACGCCCAAAAGCTTGTTGCTGCTGTATTTAGCTTGGCTCATAAACTCCAGCCTGCCATCAT ATTCATTGATGAAGTTGACAGTTTTCTGGGTCAACGTCGAACAACAGATCATGAAGCTTTGTTGAACATGAAAACTGAGT TCATGGCTCTTTGGGACGGATTTACCACCGATCAGAATGCTCGAGTTATGGTCCTTGCAGCTACTAATCGTCCTTCAGAA CTTGATGAAGCAATACTTCGACGGCTTCCTCAATCCTTTGAAATTGGAATGCCAGACCAGAGTGAGAGGGCAGAGATATT AAAGGTTATCTTAAAGGGTGAGAGGGTTGAAGATAACATAGACTTTGGTCACATAGCTGCCCTATGTGAGGGTTACACTG GTTCAGATCTATTTGATCTATGCAAGAAGGCTGCCTATTTTCCTATTAGAGAACTTCTCGATGATGAGAAGAAAGGGAAA CGATCTCCTTTTCAGGCATCTAGACCTCTGTCAGAGTTAGATTTAGCGAAAGCCCTTGCCACTTCACGAAAGACAAAGGT TGCTGCAAATGAATATGGTGGATTAAACCTAAGAGTGCAAGGCGAGTCAGGTGATTATCAGATTCAAGCTGCAATCAATG AATTCTCTAAGCTAGTGGTTTCTCACATGGTTAACCTCCAATCTGATTCTCAGGATCCTTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0292500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVSRGRMGAASEKLLQDMLLYAASAALSCLVLFVGLRQLDPNREASKKALEHKKEIAKRLGRPLIQTNPYEDVIACDVIN PDHIDVEFGSIGGLESIKEALFELVILPLKRPDLFSHGKLLGPQKGVLLYGPPGTGKTMLAKAIAKESGAVFINVRISNL MSKWFGDAQKLVAAVFSLAHKLQPAIIFIDEVDSFLGQRRTTDHEALLNMKTEFMALWDGFTTDQNARVMVLAATNRPSE LDEAILRRLPQSFEIGMPDQSERAEILKVILKGERVEDNIDFGHIAALCEGYTGSDLFDLCKKAAYFPIRELLDDEKKGK RSPFQASRPLSELDLAKALATSRKTKVAANEYGGLNLRVQGESGDYQIQAAINEFSKLVVSHMVNLQSDSQDP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 19 | 19 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 1 | 29 | 29 | 6.0 | – | |
| PANTHER | 8 | 361 | 354 | 7.8E-212 | – | |
| PANTHER | 8 | 361 | 354 | 7.8E-212 | – | |
| Phobius | 20 | 39 | 20 | - | – | |
| Phobius | 40 | 393 | 354 | - | – | |
| Gene3D | 85 | 345 | 261 | 2.8E-86 | – | |
| SUPERFAMILY | 87 | 314 | 228 | 2.01E-55 | ||
| CDD | 92 | 256 | 165 | 6.90738E-23 | – | |
| SMART | 123 | 259 | 137 | 3.3E-15 | ||
| Pfam | 127 | 256 | 130 | 1.3E-35 | ||
| ProSitePatterns | 229 | 248 | 20 | - | ||
| Gene3D | 258 | 342 | 85 | 2.8E-86 | – | |
| Pfam | 279 | 314 | 36 | 2.9E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0292500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…