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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0074900 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0074900.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein kinase family protein, putative, expressed; TAIR: AT4G18640.1 Leucine-rich repeat protein kinase family protein; Swiss-Prot: sp|C0LGQ4|MDIS2_ARATH Protein MALE DISCOVERER 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151U1E4|A0A151U1E4_CAJCA Putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase MRH1; Found in the gene: LotjaGi1g1v0074900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:10821142..10841992) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAAAATTAATATTTTACCCAAAAAAGCTAAACATTTTGGTCACCCCAAAGTTTGATTTTGCATTAGCTTAGGAAAAATTA AAATGACTCAAAATGATGAAGCAACTTATTATTTAAGCGCGTTTTCAAATCTAATTCTGGGTCCATACACCAAACTCACA TGCAAGTGTCAGAACATGGTTTTAGATTAGAGATTTCACCCTTTTTTCTCTCTGATTTTCTTGTTTTTGGATTAAGCTCT GTTCAAAGTTCGTATCTTTCCAAGAAAATAATCTTGGGTTTTTTCATTTCACGTTGACAAGCTTCAAGAAAATGAGTGAT CTTTGTGGAGCTTTGCGCTTTGTGGTGTTGTGTTTCTTGTTTCTTAACTTGGGTTTGTGCTGTTCTTTGAATGATGAAGG TAGTGGGATCATGAATCTTGAGTTAAAGCTGTAATCTTTATTAGTTTTGGCCTTATGGGTACCTGAGAAGATGCTGAGAT ATGTTTTTTCTGTGCAGGTAATGCTCTTTTGAAGTTGAAGCAGAGAATAGTGAGTGACCCTTTTGGTGCTTTGTCAAATT GGATTGAAGATGATCTTGCTGTTAACCCTTGTGATTGGTTTGGAGTTGAGTGCTCAGAAGATGGAAGAGTTGTGGTCTTG TAAGTTGTGGTCTTGAATATTTGTAACAAATTCTAGGTTCTGTGTTTAATTTATGGCAGAGTTATGACAAGAAAAGGAAG AGGAATATGCATATTTTTTCTAATTTCTTTCTTACTCTCTCTCTCTCTTTCTCTACACAATTTTTTATTGCTCACTTTGC TCCTGACACCTGAAACTATCTAAGTGCATAGAGTCCTTCTACAAGTTATTCTGCCAAATCAATTATGGGGAATAGTTTCT GAGTGCTAGAATTGATTCTGAGAAATTTTTTAAGTGGTTTATTATAGTATCCCTGCAATTGTAGTGTACCTTGCTCTTCA 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AGAAATTGCAACTTCAAATGAAACACAAACTTTCATGTATAGGAATTCACAAAATATACATCTAGCTCTGCATTTTTCAG TGCCTTGTCATTACACACCCTGCTAGAGTGCTAGTGCAGGGTTTTAAACTGCAGTTGCAGACAAATGTTGGTTGATGCAG CTGCAATTGCAGTCTTAGTGTCGTTGCGAGGACTCTAGAACCCTTGAAGTTGCGGTCGCAACTAAGGTTGCAGACAGCAA TTTAAAAGTGCTCTCACACAGAATGATGAGGTTGAGAGCAGCACCTATTGAGCAACCGAAGCAGGGCATCTGCTTTTCTC CTAGCTCTCAAAGAACCATCAGCAGCCAAGCTCTGAAGAGAAGGAACACTCCTTGGATTCGCCAACAGACGCCTCGCCAC TAGCTCCCCTTCTTCCTTGCACAACCCAAGCAGAAGAGTTATTGAGTTCTCCTTCCCTTTCACTGACCCAAATCTCAAAA GATCAATAAGAAGTGGCACCAAAGCTCTATTATCCCTTATCTCTTCAAGCCCTTCAGAGCAACCTTGAAGCACAGCAAGC ACAGCCAACACATCATCTGTTATCCCAGCCTTATCATCCATCAACAACTCAACTAACAAAGGAACTGCCCCAGCTTTAAC AATGCTTGATTTGTTAGGATTGTAAACTGCAAGATTGAAAATTGCAGAAGCAGCATCTCTTTTCCCAATTGGTGTACCTT CTTTCAAAAGTGCAACTAATGCAGGTATTGCCCTTGTACATGCCCCAATTTGCACTTTGCAATCATCAACCATAGACAAG CTGTATATTGCTGCTGCAGCATTTTCTCTTGCCTCCATGGTTTTTCCTGATTCTAGCACTTCTACTATGTTGTCAACTGC TCCTGCTACCATGATCAAAATCTTGTTGTTGTCTAAGATGGACAGGTTGAACAAGGCTGTGACTGCATGCTCCTGAGTTC TAGAGTCTTGAGATGCTAGAAGTGTCACAAGAAAGGGAATTGCACCTGCCTCAGGTATGATGCTTCGGTTGTTCGTGCCG GATTTCGCGAGTAACCGAAGCTCATACGCGGCTTGTCTTTGGATATCAACTGAGCCGGTTGCCAATTTTCCAACTAGAAA CTCTGCTGTCATTTTAACAGCATCTGAAGCTGCTTTGTTTGCTGAAATATGATCAATAGCTTCCTCTTTCAAGTTCTTCT TGCTTCTGCTGTTGTTTAAGAGAGAATTCATAGGCTCATTCACCGGGACATTGTTCTCATAACACCATTGCTGAACAAGG CTCTTTAAAGCATAGTTTGGAATTAGAGCAGTGTGAATTAGCCTTTGACCACTCTTGGGGCAAGTGTGATGCCCTGTGTT TATCCATTGTGCAATCGAATTTCGATCATAAGTGTGCCCGGATGACACAATCACAGGGTCCCTCATTAAATCAAGTGAAA TCGGGCAACGGAATTCATCAGGAATGTTTGGTATCACTGAAATGGACATAGAAGATGAAGAACTATCATGGTTTTTGTTG TATAAAATCAAAGACAGTGGCTTACACTCTTCTTCATCTCTATCATTTTCGCCGTTTCTGAATATCATGGATTTGGAATA AGAAACTAGAGATATGAGATTGTTTATATTGGAGACAACAATTAGTCCTCCTGTGCCGGCCTGATTCTGAGCTTCAACCT CCAAATTGGATATTTCTCCATCATAATCTGATGGAGTTCTCAAACCAATGCTGCTTAATATATCTTCCACTTTCCCAAAA TCAATGAACCCTTTGTTCTTCTTGTTCCGCAAACTGTTGTTTGCCATTACTTGTAGAAGCTGTTCTCTTCTTTGAAGCTC TCTTGGATCAATGAGTAACTCAACCCTCTTTGCTTGTTTTTGGAGAAGCTGCACTTGCTCCTTTGTATCTGCTGTTATAT TGAGCAATTTCAGAGGTAGGATATCTAAGGCCCTTCCTAGCTCCTTTGCAAGCACATAAAATTGGTTAGAAATGAGCTCT AACTGTATGAGACCCCAGAGAGTGCTTCCATCCTTGCACTCTTGGATCAAATCTTTCACTCTTGTAATCACTGAGTAGAG CTCTGTGAAGCACAGGATTGAAGAAGGAGGAAGTGGGGAATCTGTTTCTTGAATCTCTTCAAACAAAGAAGAAAGAAGCT TGATCCTCCTTATCATAGATGAGACATTCCTTGTGTGGACCAAGGGAAGCTTCTCCATTGAACCAACTTCATTAGAGATG TGAATCAATGAATCTAGCAAAGTCCCAGTTGGTAACAAGCCTGAGGAAATCATCATTGCGGATACAGCATCATTCATTGT GGTTGTTTGTTCTTACCTTATGAGGATGTTTCTGTTCATTCTTATGGTTGACAAAATTAGCTCTATGCTAGGAATTGGAC TATTCTTAGATCTTCTGTAACACATTTTGATTTTTTTAATTAAAAGAACATAAACTATTTGTCGAAATGGCAAGTTGTAC CAACAGTGGTTGGTTCAGGTGGTATATGTCTGATTTTCCTTAAGCAAGGTCTCAGTTCGAGTATTGTGAATGGAAAAAAA AAATCCTAGGGAAAGGCAAGTCCCATCATAATGTGGAAATTCCTGGCTCGAGCGCACACTGCTCATGTGCAAGATACCTG TATTACGAAAATAAAAATTAAAGGCAAGCTGTTTAATTAATTGAATGATACTTTGACCCTTTCTGTTTGTGTAGTTAGTG CTAAAGACAAAAAGAAAAGAATTGAAGGAGAGTCGAGAATTTATGATGTGCTGCCATTTGGAGGATTTTCCTGGCTTCCA ACATTATTTATACTCTTCTGCCAATATTTTTTTATTCAAACATGACAATATGTTGATATTGGGCCTTGTCAAACATAATT TTCAACTGCTGCTATACTTGCTGATAGTTATGTCCTCATTTGGACATCTTGACGGACTAGTTGATGAGATCTTCAAAGGA ATATTTTATTTTTCAATGCAACTTGATGTTTTGATATATGTTCAAGTCCAACTCCAACTCCAACAGCACCCTTAACCAGA TGCATAAAATTTCATTTTATTGATTTGTCTTTTCAGGGAAAATTGAGCATTATTTGTAGATTATGGCTCCTAGAATCCTT AACGGCTTATTCTATATCATCATGCCTTCCCAGTTTCTGCTACCACTTCTGATATCTAATTTGTCGTTTGTATAGGATCC CTTGCAGCCTCTATAGAATGTTTCAACTAGCACATTATATATCAAGAACCAACTATCCTAAAAGTTAAATTGTCAGGTGA AGGCACATGAATGATTTTATATTATACTTCTAATATATTCTTCCACTTATGCTGAAATTCAACTTCTTATTAGAAAAGTG AGAACAACAATGATCGAACTTTGTACTATTTAGTTATATAAGCTCTGATATCATTCATGAACTAAGATGCATTAATGTAA TTTTATTAGATTTCTAACCCTATGTTCCCCATTTTTCCATCACATTAGATGCCAAGTGCCACAAAATTGCAATTAATAAT ATTGGGTTTAGACTTTGGACATTACATAACAAATCAGGAGTCATCTTTCCC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0074900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGTGATCTTTGTGGAGCTTTGCGCTTTGTGGTGTTGTGTTTCTTGTTTCTTAACTTGGGTTTGTGCTGTTCTTTGAA TGATGAAGGTAATGCTCTTTTGAAGTTGAAGCAGAGAATAGTGAGTGACCCTTTTGGTGCTTTGTCAAATTGGATTGAAG ATGATCTTGCTGTTAACCCTTGTGATTGGTTTGGAGTTGAGTGCTCAGAAGATGGAAGAGTTGTGGTCTTGAATTTGAAA GATCTCTGTCTTGGAGGAACTTTGTCACCAGAGATTGTGAACCTTATTCACATAAAGTCTATCATTTTGCGGAATAACTC TTTCTCTGGAACCATCCCTGAAGGAATTGGAGATTTGAAAGAAATGGAGGTGTTGGATTTGGGATTCAACAACTTCAGTG GACACTTACCTGTTAATCTTGGGAGTAATATCTCTCTAGCAATCCTTTTACTGGACAATAATGAGCTTCTTGTTGGTTTC TCTCCTGAAATCAATGAACTGAAGATGCTTTCTGAATGTCAAGTAGATGAAAACCAGCTAGTCAATGCAGCTAAGATGCC AGCTTGTACAGAAAGACCCATCACATGGCATGTTGGTCAAATTAAAGGTACTCGGAGCCTACTGGAAAATCCTGAAGGAC CTGCACCACCATATCGTGGTGTTCATGAAGACCATCTTAATCACGCCACTAATCCATATCCTGATAGCCCTTCTCCTCCA GCATTACCACCACTTCATCGTGCTCATGAAGACCGTCTTAATCGCGCCACTAGTCCATATCTTGATAGCTCTTCTCCTCC AGCAATACCACCAGTTATGAGGCCAGCTTCCCCTAGTCATAATGCTTTTGATTCTCCTCATCCCCTGTCTACAACAGGAT CTCGAGCACAATCTAGAAGCATCTCATCAAAGAAGCATAGAGTCCCTATTTGGGCTGGAGTTCTCGGTGGTTCTGTGTTT ATTCTTATTTCAAGCATTGCTATATATCTTTGTAAAATCATGAAGGTAGCTAATGTCAGACCTTGGACTACCGGATTAAG TGGACAGCTTCAGAAAGCATTTGTGACCGGTGCACCGAAGCTAAAGAGATCAGAACTTGAAGCAGCATGTGAAGAATTTA GTAATGTGATTGGAACTTCACCTATTGGTTCGTTGTATAAAGGAACTTTGTCTAGTGGCGTGGAAATAGCTGTAGCTTCT GTTTTGGTGACATCATCCAAGAATTGGTCAAGGACTTCAGAAGCACAATTTAGGATGAAGATAGACACATTATCAAAAGT GAATCACAAGAATTTTGTCAATCTTATTGGATATTGTGAAGAAGATGACCCTTTCACCAGAATGTTGGTTTTTGAATATG CCCCAAATGGAACATTATTTGAGCACTTACATGTAAAAGAAGCTGAGCGCTTGGATTGGAGAACAAGACTCAGGATTGCA ACCGGTATGGCTTATTGCCTGCAACATATGCACCAGTTGGACCCTCCAATAGCCCTTACCAACCTGAACTCTTCGGCTGT CTACCTTACTGATGACTATGCTGCCAAAATATCAGACTTCAGTTTCTCCAACGAAACAGCTTCTGTCGAGAATAAAGCTG GGGGGAAAAATCACATTGACATACCATTAGAAACTCCAGCAAGTAATGTTTATACCTTTGGTGTTCTACTATTTGAAATG GTTACTGGTCGTCTCCCTTATAAAGTGGGTAATAGCTCAAGCGAAAACTGGGCATCACACTATTTACAAGGGGACAAGCC CTTCAAAGAAATGGTGGATCCAAATCTAGCCTCTTATCAAGAAGATCAGCTGGAACAGGTTGCTGCATTGATTAAATCTT GTGTCAATCCTGATTCAAAGCAGAGACCTACAATGAAAGAAATCTGTGAGAGATTGAAGGAGATAACAAAAATAACACCT GAATCAGCAGTGCCAAAACTTTCTCCACTTTGGTGGGCTGAGCTTGAGATTTCTTCTACAGAAGGACCCTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0074900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSDLCGALRFVVLCFLFLNLGLCCSLNDEGNALLKLKQRIVSDPFGALSNWIEDDLAVNPCDWFGVECSEDGRVVVLNLK DLCLGGTLSPEIVNLIHIKSIILRNNSFSGTIPEGIGDLKEMEVLDLGFNNFSGHLPVNLGSNISLAILLLDNNELLVGF SPEINELKMLSECQVDENQLVNAAKMPACTERPITWHVGQIKGTRSLLENPEGPAPPYRGVHEDHLNHATNPYPDSPSPP ALPPLHRAHEDRLNRATSPYLDSSSPPAIPPVMRPASPSHNAFDSPHPLSTTGSRAQSRSISSKKHRVPIWAGVLGGSVF ILISSIAIYLCKIMKVANVRPWTTGLSGQLQKAFVTGAPKLKRSELEAACEEFSNVIGTSPIGSLYKGTLSSGVEIAVAS VLVTSSKNWSRTSEAQFRMKIDTLSKVNHKNFVNLIGYCEEDDPFTRMLVFEYAPNGTLFEHLHVKEAERLDWRTRLRIA TGMAYCLQHMHQLDPPIALTNLNSSAVYLTDDYAAKISDFSFSNETASVENKAGGKNHIDIPLETPASNVYTFGVLLFEM VTGRLPYKVGNSSSENWASHYLQGDKPFKEMVDPNLASYQEDQLEQVAALIKSCVNPDSKQRPTMKEICERLKEITKITP ESAVPKLSPLWWAELEISSTEGP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_EUK | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| Phobius | 1 | 3 | 3 | - | – | |
| Phobius | 1 | 23 | 23 | - | – | |
| Phobius | 4 | 18 | 15 | - | – | |
| TMHMM | 5 | 27 | 23 | - | – | |
| PANTHER | 7 | 659 | 653 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 7 | 659 | 653 | 0.0 | – | |
| Phobius | 19 | 23 | 5 | - | – | |
| Gene3D | 22 | 192 | 171 | 5.0E-37 | ||
| Phobius | 24 | 307 | 284 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 26 | 182 | 157 | 3.91E-23 | – | |
| Pfam | 27 | 69 | 43 | 6.7E-10 | ||
| MobiDBLite | 207 | 302 | 96 | - | – | |
| MobiDBLite | 283 | 299 | 17 | - | – | |
| Phobius | 308 | 331 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 308 | 330 | 23 | - | – | |
| Phobius | 332 | 663 | 332 | - | – | |
| Gene3D | 343 | 453 | 111 | 4.5E-18 | – | |
| SUPERFAMILY | 359 | 632 | 274 | 1.57E-42 | ||
| ProSiteProfiles | 371 | 635 | 265 | 20.626 | ||
| Pfam | 373 | 632 | 260 | 2.7E-25 | ||
| Gene3D | 454 | 644 | 191 | 5.1E-33 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein kinase activity | Catalysis of the phosphorylation of an amino acid residue in a protein, usually according to the reaction: a protein + ATP = a phosphoprotein + ADP. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Protein phosphorylation | The process of introducing a phosphate group on to a protein. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0074900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…