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LotjaGi1g1v0076400.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0076400
Transcript ID LotjaGi1g1v0076400.1
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Clathrin heavy chain; TAIR: AT3G11130.1 Clathrin, heavy chain; Swiss-Prot: sp|Q0WNJ6|CLAH1_ARATH Clathrin heavy chain 1; TrEMBL-Plants: tr|W8E7A2|W8E7A2_LOTJA Clathrin heavy chain; Found in the gene: LotjaGi1g1v0076400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:10987697..11007343) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTTTCACCACGCTTGAGTCGAAATGATGACATAACTTTAAAAAAAAATGACCTAGGTGGATTTCAGTCATGAATAAAATT TTATCGAGAAGCTTTTTAACATGACAATTGACAATATCATTTTTGCACTATTCTTATCGTCATAATTTTATAGTCAGCAT TCAGCAACTCATTTCAATTTCACATTCTTAATCTTCCCTTTTCTCTTCTCCCCCGTTTCACTCGTGTCAAAAGTCAGCAC ACACCAGCCCATTTCCACGTCTCTCTCTCTTTCTCCCCCTCTTCGCTTTGAAGAGGGTCCAAGTCTTCTCAGATCTCCAC TGGTCGCAGATCGGAGTCTTCGATCTAAGCCACCATGGCGGCCGCCGCGAACGCTCCGATCGCCATGAAAGAAGTCCTCA CCGTGAGTCCTCGTTCTCCTCCGATTTCCACTCCCTGCGCACACAGTTGTTCAGCTTGATCGAAATTCACAATTACTCTT GTTTTTGCTGTTATACTTTGCTCAATTTTGGTTTCCAACTCGATTACTCTACAGTTTCACTTTGCTAGTTTCCTTACTGT GAAGTTTTTCCGGATCTGAATTTTTTGTTGTTGTTGTTTGGTTTATGAACTGGAGAGTGAGAACTGAGAAGCTTAGGCGT TTATTGTTGTTGCTGATGCATGATTTTGATAGAAAATGAATTGATTGATGTGATTTGTGTGATCTGATTTGTGATTGCAG TTGCCGACCCTCGGCATCAATACACAATTCATCAATTTCACGCATGTGACGATGGAATCGGACAAGTATATCTGTGTTCG AGAAACGGCGCCGCAGAGCAGCGTGGTTATCGTTGATATGAGCATGCCAAATCAACCTTTAAGGAGGCCTATTACTGCGG ATTCGGCTCTTATGAATCCGAATTCGAGAATCCTTGCTTTGAAAGGTTGGTTTCGAGTTCTACAATCCTCTCTTTAGTCT 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TATAACATTGAGAACCAAGACTACAGGTAAAGGTATTTATCAATATCTTCCAAGTAAATATGGAAGCATTTAATTTTAAA GTAAACCCGAATATATCAGTATAAAAAAAACAAAGAAAATCTGGATGCCAGACAACAACAGGGAGCAACAACCCAATCAA AATGAAGTGATTAATGAAGCAACAACACGTTCCAATAATGATTTATCAATCCTGAAGCCCTGCAACCAATTATCAACATC AAAAATTGTTATTATGAAAATGGAGTTTAGGGTACAGGACAATTTGCAATTTAAGTGGAGAACCCTATAACATATAATTC TCGCAGCAACCAGCACAATCATGGTTATTGCTTATTGGGTTGATGCACATGACTTAGAATGAATCGATGGAAACTATATT CATGGTTCTTAAAAACTTGGACTTGACATTACAAATATGCTGTTCGTAGTAATTTGTAACTGGATTATGGTATTCAGTAA AATCTAACCGGATAATTGAATGGAAAATGGGGATGAAGAGAGAATGTACCGCCGGAGACGAAGTGAGGTTGAGAGTTGTG GAGATGAACGCCTCTGACGGGGCCGTCTGTGGCGGCTGGCGAGGAACCATGGCCGCTTGCGGTGGAAACTGAGAACCTTT CTTGTGTTACTCTTGGTCAGAGAAAAGATGAAGAAGAAGTAGGAGAAATAGGGTTTTGGATATTTTAAACGCTATCGAGG AAGAAAGACGACATCTGGATCGGGCGGGGAGCGGAGGAATCAGTTGAGGCGTGAGGGAGAAAATGATGGGAATAAAGCTG GTTGAAGAAGAAATTCCTCATATGGCAGATGTGAATAAGCTGGATAAAGTGGTTGGCAGATTAGAGAGCTTAAAAATTTG ATTTTGAAATTCACATGTTCATGGGAGCTGTGCAGAGCTTGGGACACGAAACGTGCAGAAGGGAGGTGGGGGTTGAAGAA ATTTGATTGGTCATGGAGGGAAGAGATTAATAGGAATCAGGAAAAAACAATTATCAAGGCTTTGCATGCTTCTGTGGTAT GTGTGAAACATTTAAAAATGGGGTTGGAAGTTCCACTCTTTGGAAAGCTTCTTCTGGAAGGGTGAAAAGAGAGCTTGCCA CGTCAGCGAAACAGGGAACTCGATTGGTGGATGAGTGCCACGTGAAATCTGAGTGAGATAGGAGAATAAAGGAGAACATG ACACATAATCAGTGAATGGAGGGAAGCAATGAGAGTGAGCCACGTTGGAATTCCACTCACTTTGAGAATGCATCAGAGAA GAGAATGATTCTGGTGACGACACATAAGCAAATGGGTCTCATAATCCTTGCTGTTTTAATATATATATTGATATTGATAT TGATTCAATCATCTTTGTAAAGTCTGACAGTTTATGGGTTGCATCTTGAACAGTCGCTGTGAACTACTTTTTGATGAATG TTGGCTTTCTAGTTTACACTTTACTGTTGATAAAAATTATGAATAGTAGATACTAGATAGTCTCTGCGAGATAGTGATGA TAAGCTTATGATGGTTGTAGTTCTTTTTATGTACTTCTGGTATTGCATGGGTGGGTTATCCGAGCACATCTAGGTTGACT AATGCATTTATTTACTTTCTTCAGCCTTTCCTGCAACGGATCTATTTTTTGCCATCATCTTGTGCTTTATCTTACCATCT TCTCTTGTAGTTTATCCGTGAGTACACTGGCAAAGTTGATGAATTGGTGAAGGACAAAATTGAAGCACAAATCGAAGAGA AGGCTAAAGAGAAAGAAGAAAAGGACGTAGTTTCTCAGCAGGTAACTTTTTTGGTTATTTTCTGTTGGCCAAATATAACT TAATTTTGAGCACCGCTGACATTCATGTCATCAGTTTGAATGTTCAGAGCAGTTTGCTGTTGATTAACCCGATTTCCATC TCATCCTTTATTGTCAACTGGTTGGACTTTAGAGTAGTGTTGTTAATGAATGAGATGTGTTTTCTGTTGCAGAACATGTA TGCTCAATTGTTGCCTCTTGCTTTGCCTGCGCCACCAATGCCTGGAATGGGAGGAGGCTATGGTCCTCCCCCTCCAATGG GTGGACTAGGGATGCCCCCTCCTTACGGCATGCCACCAATGGGTGGCGGTTACTAACATGTACACAGCGGTGACAAGTAT AGCATGAACTAGGTCCCTATGGGGAGCAATATTTAGCAGCTTCGAAATTTTGCATAGATTTTCTTGCGGGATTTGGATGC AGCATTCTTTCTTTTAGCTTCTGGTGGAGGTAGAGATTCAAGTTACAATAATCTGAAGTTTTTTTTTTTTTGAGATTGTG TCATAATAGTCTTGCCCCTTTTATTTTCTAATGGTAGTTAAGGCATTTTCTGGGCTGCTTTTTTGAGCTAGCCGATACAT TCATTTTCTTGTATTAAATGAATTAGTTTCAGTATAGTACGAAATTTACCGACTTTAACAACCAGCTTGATATATGCTTG TCTTGGCCTGGATTTTACCACTCGTTATGGAAGTCAGCTAATTGAAGCTCGCTTGCATGGGTGTATGTAGTCCTGCATAG TCTTCAAGTTTAAAATAAAGTGTCTTTAAACACAATTTTTAAAATAAAAAAAAAAACAATTTTAAGGTTATGAACAATAT AAACTAACGTCTGTTTCACATAAATATTTTAAAATAAAAGTTATCCTTCTATACAAGATTAAGATTACGTTTTTACAAAC CTAGATCTCGAGGTCCAATTTAGGCATAAAATCCTATATTCTACAGTTTGCTCTATATCATGATTGGTGGTTGAAGGTCG CAATTTAACAGAGTTGTACTAAATCGAAGATTACAATTCTCTCTTTTGGTCTTAATGTTCAACTACTGTGTTGTTTCTCT CTTTAATCTCTAGTATTGTTGCTTGCTTTTTGACACCTATCTTGGTATTTTGTAGTTTAAAAAATTGGAAGTTTTATCAT CCACTAAAATTATTCATGATAGCTTGAAATAACCAATTAAATTTGTTGTAGATATGATACTTGTGATGGATTGTCTTTAA TCGTTGGAAATGAGTTTCACTGGTGACTTACCGTGGACACTCGAGTCAATTAGCTGACGTACATTTTAAACATGTTTATC AGCATATTAAAGTTATCATCCTTGATTGAAAATCTCATAAGTGTCCCAGATCTTAGGCTTAATTGCACTATTGGTCCCCC ACGAATGCCATATGTGTCATCGGAGTCCCTAAACTTCAAAAATCTCATTTTACATCCCCGACGTTAATCTCCGTTAACAA CTTTGGTCCCTTCTTTCTTTTCCATCAAAAAACTAACGTTTTTAGCT 

CDS sequence (LotjaGi1g1v0076400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCGGCCGCCGCGAACGCTCCGATCGCCATGAAAGAAGTCCTCACCTTGCCGACCCTCGGCATCAATACACAATTCAT CAATTTCACGCATGTGACGATGGAATCGGACAAGTATATCTGTGTTCGAGAAACGGCGCCGCAGAGCAGCGTGGTTATCG TTGATATGAGCATGCCAAATCAACCTTTAAGGAGGCCTATTACTGCGGATTCGGCTCTTATGAATCCGAATTCGAGAATC CTTGCTTTGAAAGCGCAACTCCAAGGGACTACTCAGGATCACCTGCAGATATTTAATATTGAATTGAAAGCTAAGATGAA ATCATATCAGATGCCTGAGCAGGTAGTCTTCTGGAAGTGGATTAGCCCCAAGACATTGGGCCTTGTAACACTGACCTCTG TATACCATTGGTCAATTGAAGGTGACTCTGAACCTATTAAGATGTTTGAGAGAACTGCGAATTTGGCGAACAACCAGATA ATTAATTATCGATCTGACCCTACAGAAAAATGGTTGGTCTTGATTGGTATTGCTCCTGGTTCCCCTGAGAGGCCGCAATT GGTTAAAGGAAACATGCAACTTTTCTCTGTGGATCAGCAGCGCAGTCAGGCTCTTGAAGCTCATGCTGCATCATTTGCCC AATATAAAGTTCCTGGGAATGAAAATCCTTCTACTTTGATTTCTTTTTCCACAAAGACACTTAATGCTGGTCAAATTGTA TCTAAGTTGCATGTTATTGAGCTGGGTGCGCAGCCAGGGAAGCCATCATTCACGAAGAAACAAGCAGATCTTTTCTTTCC ACCAGATTTTGCTGATGACTTTCCAGTTGCGATGCAGATATCCCACAAATACAGTTTGATTTATGTGATTACCAAACTTG GCCTACTTTTTGTCTACGATTTGGAGACAGCTACTGCTGTATATAGGAACAGAATTAGTCCAGATCCTATATTTTTGACA TCAGAAGCTACAACAGTGGGAGGCTTTTATGCCATAAACAGGAGAGGCCAGGTTTTATTGGCTACTGTTAATGAACAAAC CATTGTGAATTTTGTCAGCGGTCAATTAAACAATTTGGAGCTAGCAGTTAGTCTTGCCAAAAGAGGAAATCTTCCTGGTG CTGAGAAGCTGGTAGTGGAACGTTTCCATGAACTGTTTGCCCAAACAAAGTACAAAGAAGCAGCTGAGCTTGCTGCTGAA TCTCCACAAGGAATCCTTCGTACGCCAGACACAGTTGCCAAATTTCAGAGTGTTCCTGTGCAATCTGGGCAAACTCCCCC ACTGTTGCAGTATTTTGGAACACTTTTAACGAGGGGAAAGTTGAATGCCTTCGAGTCATTAGAATTATCTCGATTGGTTG TGAACCAGAACAAGAAAAATCTGTTGGAAAATTGGTTGGCAGAGGACAAGCTTGAATGCAGCGAGGAGCTAGGAGATCTC GTTAAGACTGTGGATAACGATCTTGCTTTAAAAATTTATATCAAAGCCAGAGCTACTCCAAAAGTTGTTGCAGCTTTTGC TGAGAGGAGGGAGTTTGACAAAATTCTGATATACTCTAAGCAGGTTGGGTACACACCTGACTACCTCTTCCTCTTGCAAA CAATTCTCCGGACAGATCCTCAGGGTGCTGTTAATTTTGCGTTAATGATGTCTCAAATGGAGGGAGGTAGCCCAGTTGAT TACAATACCATAACTGATCTGTTTCTTCAGAGAAACCTGATCCGTGAGGCAACAGCTTTTCTTCTGGATGTTTTAAAGCC AAATCTACCAGAACACGGGTTCCTGCAGACAAAGGTCTTGGAGATAAATCTGGTGACATTCCCCAATGTTGCTGATGCTA TTTTGGCTAATGGCATGTTCAGCCATTATGACCGTCCTCGTATTGCCCAACTCTGTGAAAAAGCTGGTCTTTACGTGCGA GCTTTGCAACATTACACAGAGCTACCAGATATAAAACGTGTGATTGTTAATACACATGCAATTGAGCCTCAGTCACTTGT AGAGTTTTTTGGCACTCTATCTCAAGAATGGGCTTTAGAGTGCATGAAAGACCTATTGCTGGCCAACCTTAGGGGAAACC TGCAGATTATTGTGCAGGTTGCTAAAGAATACTGTGAACAATTGGGCGTTGATGCCTGCATAAAACTTTTTGAGCAGTTT AGGTCATATGAAGGACTGTACTTTTTCCTTGGCTCATATTTGAGCTCCAGTGAGGATCCTGATATTCACTTTAAGTACAT TGAAGCAGCAGCAAAGACTGGTCAAATCAAGGAGGTCGAGCGTGTGACAAGAGAATCCAATTTCTATGATGCCGAGAAAG CGAAGAACTTTCTAATGGAGGCTAAGCTTCCAGATGCACGGCCTTTAATTAATGTTTGTGATCGTTTTGGATTTGTTCCA GATCTAACACACTATCTATACACAAACAACATGCTTCGCTATATTGAAGGTTACGTTCAGAAGGTAAACCCTGGGAATGC TCCTTTAGTTGTTGGGCAGCTGCTAGATGATGAGTGTCCAGAAGATTTTATCAAAGGTTTGATTCTTTCTGTCCGTTCAT TACTGCCAGTGGAGCCCCTTGTGGAGGAATGTGAGAAGAGGAATCGGCTTCGTTTGCTAACTCAGTTCTTGGAACATCTC GTAAGTGAGGGAAGCCAGGATGTACATGTTCACAATGCACTGGGTAAAATTATCATTGAGAGCAACAACAACCCAGAGCA TTTTCTCACAACCAATCCATACTATGATTCTCGAGTTGTGGGCAAGTATTGTGAAAAACGTGATCCCACCTTGGCAGTCG TAGCTTACCGGCGAGGACAATGTGATGATGAACTTATCAATGTCACCAGCAAAAATTCTTTGTTCAAATTGCAAGCAAGA TATGTTGTTGAGAGAATGGATGGTGATTTGTGGGCTAAAGTTCTTACTCCTGATAATGAGTATAGAAGGCAACTTATTGA TCAGGTTGTATCTACGGCTTTGCCTGAAAGCTCAAGCCCAGAACAAGTTTCTGCAGCTGTTAAGGCTTTCATGACAGCTG ATCTGCCTCATGAATTGATTGAACTTCTCGAGAAGATTGTGCTTCAGAATTCTGCATTCAGTGGGAACTTTAATTTGCAG AATCTTCTTATTTTGACCGCAATAAAGGCTGATCCATCCAGAGTTATGGATTATATCAATAGACTGGATAATTTTGATGG GCCCGCAGTTGGAGAAATGGCTGTAGAAGGTCAACTGTATGAGGAAGCATTTGCAATTTTTAAGAAGTTCAACTTGAATG TTCAAGCAGTTGATGTCTTGCTTGAAAATATACATAGCATTGATAGAGCTGTGGAGTTTGCTTTTAGAGTTGAAGAAGAT GCTGTTTGGAGTCAAGTGGCCAAGGCTCAACTTAGGGAAGGGCTTGTAAGTGATGCCATTGAGTCGTTTATACGGGCAGA AGATGCTACGCAATTTTTGGATGTCATCAGTGCTGCTGGAAATGCTAATGTTTACCATGACCTGGTGAAATACTTATTAA TGGTAAGACAGAAGGCAAAAGAACCCAAGGTTGACAGTGAGCTCATTTATGCGTATGCAAAGATTGATAGGCTCAGTGAC ATTGAGGAGTTTATTCTTATGCCGAATGTTGCTAATCTACAAAATGTTGGTGATCGGTTGTATGATGAAGCATTATATGA GGCTGCAAAAATCATATTTGCTTTTATATCGAACTGGGCTAAGTTGGCCATCACACTGGTCAAGTTAAAACAGTTCCAAG GTGCTGTTGATGCGGCAAGGAAAGCCAACAGCTCAAAAACATGGAAGGAAGTTTGCTTTGCTTGTGTTGATGAAGAAGAG TTTCGTTTGGCCCAGATATGTGGACTTAACATTATTATTCAGGTGGATGACTTGGAAGAAGTCAGTGAATATTACCAAAA TAGAGGCCACTTCAATGAGTTAATATCTCTCATGGAGAGTGGTTTAGGGTTAGAGCGGGCTCATATGGGCATCTTCACCG AGTTAGGAGTTTTGTTTGCTAGATACCGCCCTGAGAAACTTATGGAGCATATCAAACTATTCTCCACCCGCCTCAATATT CCAAAACTCATAAGAGCTTGTGATGAACAACAACATTGGACAGAATTGACGTATTTGTATATCCAATATGATGAGTTTGA TAATGCTGCAACCACCATCATGAACCATTCACCAGAAGCATGGGATCACATGCAATTCAAAGATGTTATTGTCAAAGTTG GAAATGTTGAGTTGTATTATAAGGCTGTTCACTTCTATTTGGAAGAGCATCCAGATCTTATCAATGATGTTCTGAATGTC CTTGCCCTTCGTGTGGACCATGCACGTGTTGTTGACATCATGCGAAAGGCTGGTCACCTCCGCCTTGTAAAGCCATACAT GGTTGCAGTTCAGAGCAACAATGTATCTGCTGTTAATGAAGCCTTGAACGAGATATATGTTGAGGAGGAAGATTATGATA GATTGCGTGAGTCAATTGATTTGCATGATAACTTTGATCAAATAGGCCTCGCACAAAAGATTGAAAAGCATGAGCTTCTT GAGATGAGGCGTGTTGCTGCTTATATTTACAAGAAGGCTGGTAGGTGGAAGCAATCCATTGCTCTGTCAAAGAAGGATAA TCTTTACAAAGATGCAATGGAGACAGCCTCACAATCTGGCGAGCGTGAACTTGCTGAGGAATTGCTTGTTTATTTCATTG ATCAGGGAAAGAAGGAATGCTTTGCCTCGTGTCTATTTGTTTGCTATGATTTAATAAGGGCGGACATTGCTCTTGAACTA GCTTGGATGCACAATATGATCGACTTTGCCTTCCCATATCTTTTACAGTTTATCCGTGAGTACACTGGCAAAGTTGATGA ATTGGTGAAGGACAAAATTGAAGCACAAATCGAAGAGAAGGCTAAAGAGAAAGAAGAAAAGGACGTAGTTTCTCAGCAGA ACATGTATGCTCAATTGTTGCCTCTTGCTTTGCCTGCGCCACCAATGCCTGGAATGGGAGGAGGCTATGGTCCTCCCCCT CCAATGGGTGGACTAGGGATGCCCCCTCCTTACGGCATGCCACCAATGGGTGGCGGTTACTAA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0076400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MAAAANAPIAMKEVLTLPTLGINTQFINFTHVTMESDKYICVRETAPQSSVVIVDMSMPNQPLRRPITADSALMNPNSRI LALKAQLQGTTQDHLQIFNIELKAKMKSYQMPEQVVFWKWISPKTLGLVTLTSVYHWSIEGDSEPIKMFERTANLANNQI INYRSDPTEKWLVLIGIAPGSPERPQLVKGNMQLFSVDQQRSQALEAHAASFAQYKVPGNENPSTLISFSTKTLNAGQIV SKLHVIELGAQPGKPSFTKKQADLFFPPDFADDFPVAMQISHKYSLIYVITKLGLLFVYDLETATAVYRNRISPDPIFLT SEATTVGGFYAINRRGQVLLATVNEQTIVNFVSGQLNNLELAVSLAKRGNLPGAEKLVVERFHELFAQTKYKEAAELAAE SPQGILRTPDTVAKFQSVPVQSGQTPPLLQYFGTLLTRGKLNAFESLELSRLVVNQNKKNLLENWLAEDKLECSEELGDL VKTVDNDLALKIYIKARATPKVVAAFAERREFDKILIYSKQVGYTPDYLFLLQTILRTDPQGAVNFALMMSQMEGGSPVD YNTITDLFLQRNLIREATAFLLDVLKPNLPEHGFLQTKVLEINLVTFPNVADAILANGMFSHYDRPRIAQLCEKAGLYVR ALQHYTELPDIKRVIVNTHAIEPQSLVEFFGTLSQEWALECMKDLLLANLRGNLQIIVQVAKEYCEQLGVDACIKLFEQF RSYEGLYFFLGSYLSSSEDPDIHFKYIEAAAKTGQIKEVERVTRESNFYDAEKAKNFLMEAKLPDARPLINVCDRFGFVP DLTHYLYTNNMLRYIEGYVQKVNPGNAPLVVGQLLDDECPEDFIKGLILSVRSLLPVEPLVEECEKRNRLRLLTQFLEHL VSEGSQDVHVHNALGKIIIESNNNPEHFLTTNPYYDSRVVGKYCEKRDPTLAVVAYRRGQCDDELINVTSKNSLFKLQAR YVVERMDGDLWAKVLTPDNEYRRQLIDQVVSTALPESSSPEQVSAAVKAFMTADLPHELIELLEKIVLQNSAFSGNFNLQ NLLILTAIKADPSRVMDYINRLDNFDGPAVGEMAVEGQLYEEAFAIFKKFNLNVQAVDVLLENIHSIDRAVEFAFRVEED AVWSQVAKAQLREGLVSDAIESFIRAEDATQFLDVISAAGNANVYHDLVKYLLMVRQKAKEPKVDSELIYAYAKIDRLSD IEEFILMPNVANLQNVGDRLYDEALYEAAKIIFAFISNWAKLAITLVKLKQFQGAVDAARKANSSKTWKEVCFACVDEEE FRLAQICGLNIIIQVDDLEEVSEYYQNRGHFNELISLMESGLGLERAHMGIFTELGVLFARYRPEKLMEHIKLFSTRLNI PKLIRACDEQQHWTELTYLYIQYDEFDNAATTIMNHSPEAWDHMQFKDVIVKVGNVELYYKAVHFYLEEHPDLINDVLNV LALRVDHARVVDIMRKAGHLRLVKPYMVAVQSNNVSAVNEALNEIYVEEEDYDRLRESIDLHDNFDQIGLAQKIEKHELL EMRRVAAYIYKKAGRWKQSIALSKKDNLYKDAMETASQSGERELAEELLVYFIDQGKKECFASCLFVCYDLIRADIALEL AWMHNMIDFAFPYLLQFIREYTGKVDELVKDKIEAQIEEKAKEKEEKDVVSQQNMYAQLLPLALPAPPMPGMGGGYGPPP PMGGLGMPPPYGMPPMGGGY 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 1 378 378 4.5E-155
PANTHER 3 1698 1696 0.0
PANTHER 3 1698 1696 0.0
PIRSF 4 1680 1677 0.0
SUPERFAMILY 6 344 339 3.4E-129
Pfam 21 56 36 2.5E-6
Pfam 155 198 44 8.4E-10
Pfam 345 368 24 7.0E-9
SUPERFAMILY 346 501 156 5.24E-53
Pfam 370 435 66 6.4E-29
SUPERFAMILY 458 794 337 9.78E-86
Gene3D 460 790 331 5.1E-16
SMART 552 694 143 2.2E-34
ProSiteProfiles 552 698 147 37.264
Pfam 556 691 136 1.3E-22
SMART 701 843 143 1.6E-39
ProSiteProfiles 701 843 143 33.528
Pfam 702 841 140 9.5E-21
SMART 848 987 140 9.7E-42
ProSiteProfiles 848 987 140 36.385
Pfam 851 984 134 4.5E-28
SUPERFAMILY 902 1068 167 2.68E-36
ProSiteProfiles 994 1139 146 43.52
SMART 994 1139 146 5.1E-45
Pfam 994 1133 140 5.5E-31
SUPERFAMILY 1053 1196 144 1.32E-26
Gene3D 1053 1197 145 5.8E-35
SMART 1143 1284 142 3.8E-36
ProSiteProfiles 1143 1284 142 32.838
Pfam 1147 1282 136 1.4E-25
SUPERFAMILY 1197 1532 336 2.07E-106
Gene3D 1198 1537 340 7.7E-151
ProSiteProfiles 1289 1435 147 42.593
SMART 1289 1435 147 4.3E-44
Pfam 1293 1432 140 5.8E-28
ProSiteProfiles 1438 1581 144 39.259
SMART 1438 1597 160 2.4E-44
Pfam 1441 1580 140 7.6E-30
Coils 1478 1498 21 -
Gene3D 1543 1642 100 2.2E-38
Coils 1625 1653 29 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Structural molecule activity The action of a molecule that contributes to the structural integrity of a complex or its assembly within or outside a cell.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process Intracellular protein transport The directed movement of proteins in a cell, including the movement of proteins between specific compartments or structures within a cell, such as organelles of a eukaryotic cell.
Biological process Vesicle-mediated transport A cellular transport process in which transported substances are moved in membrane-bounded vesicles; transported substances are enclosed in the vesicle lumen or located in the vesicle membrane. The process begins with a step that directs a substance to the forming vesicle, and includes vesicle budding and coating. Vesicles are then targeted to, and fuse with, an acceptor membrane.
Cellular component Clathrin coat of trans-Golgi network vesicle A clathrin coat found on a vesicle of the trans-Golgi network.
Cellular component Clathrin coat of coated pit The coat found on coated pits and the coated vesicles derived from coated pits; comprises clathrin and the AP-2 adaptor complex.
Molecular function Clathrin light chain binding Interacting selectively and non-covalently with a clathrin light chain.
Cellular component Clathrin complex A protein complex that consists of three clathrin heavy chains and three clathrin light chains, organized into a symmetrical three-legged structure called a triskelion. In clathrin-coated vesicles clathrin is the main component of the coat and forms a polymeric mechanical scaffold on the vesicle surface.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0076400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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