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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0344900 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0344900.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | BEACH domain-containing protein lvsC; TAIR: AT1G58230.2 binding protein; Swiss-Prot: sp|F4I9T0|BCHB_ARATH BEACH domain-containing protein B; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0K6C6|A0A0R0K6C6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0344900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:81120859..81157025) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAATATTGTTAAGGGTGTCGCTGACCTTATCCGGAGAACTTCCTCTGGCCATACCGGCGAATCCCCAGGTTTCCAAGC TCAGAAGTTCTCTCCTCCTGGGCCCAAGATTCGCTTCAGGTAAAATTATATATCGAATAATAAAGCTTCTTGGTTGCGTT AATTGCAACAATTTGAACAATATTGTTATGAAATCATGTCATTTGATGTTCTCAGAGTGCAGAAGTTGCGTTTTTTCGTA ATTGAGTAGAGCATTAGGAAGGGAGTTTTATGGTTAATATAATGTTTCATTGTGTTTTGATTCATAGAGAATACATTGTG TTTGGCAATCTCTTAGGTACTCTTGATCAGGGTTGTTAATGGCGGATAGCGTAGTGTAGCGGCAAGCCCATAAAACGCTA TTTCGAGCGCTATTGCGGTAGCGGCAAATAGCGGTGAATAGTGGAGTAGCGGTGAACCCCCAGGGCGCTACGCTATAGGC TATTGCGCCGCTATAGCGTGCTATTAACAAGCCTGCTCTTGATACAATAGGACTAATAGGGATTGTATTGCAAATATCAC CCCTCTTGAGATTGGGAGTGACTGGTTGACATTAAGTGTGCTTGTTTTTATGGAATTATATTTCTTTGACCAATGGAAAA GATGTGAATTTTGCTTTATTCAGGGTATTTTCTTTTACCGCTTTAGGAAAATAAATAAAAAAAGGCAAATAAATGAAGAA TATAATGCTTAAATCTTGTTAAGTTTGTGCCAGAGAAAGAAACTCATGTAATGATTATTGTCGATCAACACTACTTGCGA CTATCATTCCTCTTGGACTTTCTTGAATCCTCTCTCTCGATGACCCTTGATCTGATTGGGGAAGACACCGATAAGAAATG CACTATTTTTCATGCTATTATGAAGGGTTTCATCTTAGAGCTTCAAACCACATTTATTTTGTAAGCTTTTTTCACCAACT 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Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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|---|---|---|---|---|---|---|
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| Phobius | 245 | 2665 | 2421 | - | – | |
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| SUPERFAMILY | 1065 | 1256 | 192 | 5.63E-20 | ||
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| Pfam | 1076 | 1247 | 172 | 3.7E-8 | – | |
| Pfam | 1318 | 1597 | 280 | 5.2E-71 | ||
| Pfam | 2191 | 2286 | 96 | 9.0E-12 | – | |
| MobiDBLite | 2341 | 2358 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 2341 | 2386 | 46 | - | – | |
| MobiDBLite | 2359 | 2384 | 26 | - | – | |
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| SUPERFAMILY | 2390 | 2544 | 155 | 4.18E-19 | – | |
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| SMART | 3097 | 3137 | 41 | 1.2 | ||
| SMART | 3139 | 3177 | 39 | 23.0 | ||
| SMART | 3180 | 3218 | 39 | 1.4 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0344900.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…