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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0452200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0452200.10 |
| Related isoforms 9 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Regulatory-associated protein of TOR 1; TAIR: AT3G08850.1 Regulatory-associated protein of TOR 1; Swiss-Prot: sp|Q93YQ1|RTOR1_ARATH Regulatory-associated protein of TOR 1; TrEMBL-Plants: tr|V7B2P2|V7B2P2_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0452200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:95185210..95198462) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTCTTCAACCCGATGAACGATCGCTGAGGGTTTCCGATTTGGATGGCATTGGGTGATTTCATGGCATCACGCTTTTCCC AATCCAGCGTTCTCGTCGTTCCGAATCATCACCACCACCACCACGATGATTCCGCTACCTCCACTACCCTCGACGACGCC GATTTCGGCCCCCGTCGGGATTCTGAGCCCGCCGTTGCTAGCAGTAGCAGCGGTAGCGCCGCCGCCGCGTATCCTAATGC TGCCACCAGCTTGGCGTACCTTCCGCAGACCGTTGTGCTTTGCGAGCTCCGTCATGATGCCTTTGAGGCCGCCGTTCCCG TCGGTCCCTCCGACAGCGGCCTTGTTTCGAAATGGCGGCCGAAGGACAGGGTATAGCTTTCTCCTTTGCCTGTTGTTTTG TGTTTTCGTGTCTGTGATTCGCGATTTGCTTTTCGGATATGTGTTTTGCATAGTAGGAACTTGGAAACTTAGGTCATTGC AGTTGTTAGTGTATTGGCATTATCACATAACACTTGGAAACTTGAGGTTTTAACAAATAAGGGTTTGGATCCACTCACCA GCAAATGGGTAAAGTGTCGAATGGTAACTATTATTAAGGAAATCAAGTGTGCGAGTTCTGCTATCCATGATTTTTAACCC AGATGGTTGTATTTAATAGAATAGGATTCTAAATCATTGGAGTTTTTATGAAAGGTTATAAACTTATCACTTTATTTTGT GTGGTGCATTTTGCATTTTTGAGGTTCAATCAATTCAAGGAATAATAACAAGATTGCATCGGGGGCGGGGGATTTCTTCA GTTAATCTATTTGGCTGAAAAACGACTACAAGATGATCAGTTTTCCTGAAATTGCTTGACTGGAGTAGTGATTTATAGAC TGAGTCAAGGAAAATATATTCTTACATTCGCTTCTTAGTATAATAGGCCTTTTATTAGTCCTGTTACCTAGGAAGTGGCT TGTTCTCATCAATGGGAGGTTGCTAATTTCTTACTTCTGCAATGTGGTGGAAGTTCATTGGCACTGAGAGATAGCTTTGG CATTGGCAATATGAATATAAAATTTGCATATACTTTTTGTTAGGAGTGATGATTTGAAATTCCAATTTCAAGGACTCTCA CTTAAAATGTGAATTAGGCAGACCACTTTTGCTTAATCTGATTCTATCAAGTGGGGAATTTATTTGCAGTTTTATATTGC CAATGATCTTTAGTTGTTTTGGTGTTCTTCGACTTTACAACTATTGCAATTGCTTTTTCTTCAACCTAAGCAGCTAATTA AGTGATGTATTGAATGTCTTGTTGGGCATTAATTCCATGGAAATTTCATACACTGGCATTTTCATCTTTCTGACATGTCT CCCGTATTATCGTAATGCAAGTGGTTTGTGAAGGAAGAAAGGGATTATTCACTTGAATAAAACATCAAATTTGTTGCTGC ATTTCTATGATATAATAACGAGATTTGAACTGTTCTAAATCAACCAAATTGCTTTTGTGGTATTGATGACAGTGTAGCGG CTGCCCCCAATAATGGGATAGGGGGTAGAGGGATGGCCGGGGTAGTGAATTTTTGTTTATATATTATATAGTAAATCAAT GATAAATAGTACTTGAAATTCATAACATATTCATACTTCCATAGTAGCAAACTAGCAATAAAAGTCATAGGTTTTGAGAG AGCAAGGGCGAAGAGCGCAAGGAAGTGAGGTGAGGGTCGGACTCTTCCTCCCATGTAGGGGTTTTTCATAGCAAAAACCT GAAAGTGCCCCTTAAAATACCCCCAATGCTTAAAATTGGAGGTCATTTTTGAAAATGCCGGACCTTTTCTTGTTGTGCCG GGATCCCACGGGAAATGGGCCGGGATCCCAACCGGGACGGCCAGGACGATGAAACTGGTTGGGATGGTGAGTGCTGTCCC 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GTAGAGTCTCGTCTTATGTGTTTTGGACATGTATGTGTAATACCTGTTGAACCACAAATTAGGAGGGTTGACCAAATCGA AGATCTGATAGTTAGGGGTAGAGTGACCTAGGAAATTTTTATGACAAATAATTTAAAGGGATTTAGAAGTAAATAATCTA TCTCAAAAATTAAAATCAAGGCTTGATCTTGTTTTTCTATCTAAAGTAAAATCTCCTATGTAAGCCTAACTTTCAAACTT TTCTTTTATGCACTTTTGACTGACAATTTATATTTACACCGCATGTATATTATTTTTGCTTCGAAGAAAAGTGTTTGCCA TTTGTTGATAATTTTGCATGCATCGATAAAGTGGCATTTTTCCTATTTCAGGTTTTACTCAGTCAGTGCCATCGATTTCG GGCTTTAGTTCTCCTTGGAAGGTTCCTTGATATGGGGCCATGGGCTGTTGATCTGGTAATCTTTGTATCATGTCATCATC TTTTGTAGCAGTTGTTATACCTTTTAATAGAAAGGATTATGATATTATAAATTGATACCAAATTTCTTATATGTAGGCAT TATCTGTTGGAATATTTCCTTACGTTCTTAAGCTGCTGCAAACTACAACACCAGAATTACGTCAGATTCTTGTATTCATA TGGACTAAGATTTTGGCACTTGACAAGGTAATGTTTCATAATTTTTATTATTTAATGTGTGTAAACCCGAATTTTAATAT AAATTATGTTGAAATTTTGACTTTGATGGCTAAGGCCGCTTTGTACTATAATTATTACTGTGCACAAACATGTTATTTTT TGCATTGTATTTGGTTCTGGACAAGCGGAGAAAAGTAAAAATTGAATAGGGATAAGAGGGAAAGAAACAGTAATGTCCGA CATGAAAGCCTTTATGTGAGCAAACCTATTTTTCCTAGTTTTATTTTCCTCTTTCGGATGATAAACATTCACTTGGTAGT 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CTAGCAGTCCTCTCGCTAGTTCTGGAATCATGCATGGGTCCCCGATGTCTGATGATTCATCTCATCATTCTGATTCAGGA ATATTGAATGATGGTTTCAGTAATGGAGTGGTTAACCACACTGGGCCAAAACCCTTGGATAATGCATTATATTCACAATG TGTACTTGCTATGTGTACTTTAGCAAAAGATCCATCGCCCCGCATTGCTAACCTTGGCCGCCGAGTACTTTCCATAATAG GTATTGAACAAGTTGTAGCAAAACCATTGAAATCTACTGGTGTTCGTCCTAGTGAAGCTACAGCCACTCCTAGCCTTGCT GGACTTGTTCGCTCATCTTCTTGGTTTGATATGAATGGAGGTAAGCCGCCCTCTCTTTTTATTTGACGATTAATATCCTG GGATAATTTTCAATTCAGTTTGGTAAGGTTTATCTGTTTATCTCTTTGCATCAGATTTTAATTTTGTGATAATTCATGCT GCTATGTTATTTTCTTTTTTTGTTTATTATTGTATGCTGCTTTTGCAGGACACTTGCCTCTAACCTTCAGAACTCCTCCA GTCAGTCCTCCTCGCCCAAGTTATATAACTGGAATGCGCAGAGTATGTTCATTGGAGTTTAGGCCCCACCTGATGACTTC TCCAGACTCAGGATTAGCTGATCCACTTTTAGGTTCGGCTGGAGCTGCGGGGAGTTCAGATCGCAGTTTTCTTCCACAAT CAACTATATATAATTGGAGTTGTGGGCACTTTTCCAAACCACTTTTAACTGCGGCAGATGATAGTGAAGAAGTATTAGCA AGAAGAGAAGAGAGGGAAAAATATGCATTGGAGCACATAGCAAAATGCCAGCACTCAGGTTTGTATTTCATTTTTCTTAT CCAATTAAGCAAGTATTTTATAAATGTCCAGTTGGGAACTTCACTTCATTTTCTGCTGTCAGCTGTGACCAGACTAACAA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0452200.10) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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Protein sequence (LotjaGi1g1v0452200.10) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MALGDFMASRFSQSSVLVVPNHHHHHHDDSATSTTLDDADFGPRRDSEPAVASSSSGSAAAAYPNAATSLAYLPQTVVLC ELRHDAFEAAVPVGPSDSGLVSKWRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIDPFSMAPQKALESIGKS LSCQYERWQPKARYKCQLDPTVDEVKKLCTTCRRYAKTERVLFHYNGHGVPKPTVNGEIWVFNKSYTQYIPLPISDLDSW LKTPSIYVFDCSAAGLIVNSFIELHEWSASNTAGATRDCILLAACEAHETLPQSVEFPADVFTSCLTTPIKMALRWFCTR SLLRQSLDYSLIDKIPGRPNDRKTLLGELNWIFTAVTDTIAWNVLPHELFQRLFRQDLLVASLFRNFLLAERIMRSANCT PVSHPMLPPTHQHHMWDAWDMAAELCLSQLPSLVEDPNAEFQPSTFFTEQLTAFEVWLDHGSEHKKPPEQLPIVLQVLLS QCHRFRALVLLGRFLDMGPWAVDLALSVGIFPYVLKLLQTTTPELRQILVFIWTKILALDKSCQVDLVKDGGHIYFIKFL DSMEAYPEQRAMAAFVLAVIVDGHRRGQEACIEAGLIQVCLKHLQSSSLNDSQTEPLFLQWLCLCLGKLWEDYTEAQAIG LHEDATSIYAPLLSEPQPEVRASAVFALGTLLDVGFDSCRSVGGDEECDDDDKFRAEVSIVKSLLSVASDGSPLVRAEVA VALARFAFGHNKYLKSIAAAYWKPQTSSLINSLPSLTNIKDSVGGFSNQNQHKPHGNIVSPQIGPLRVGSENSKVVRDGR ISSSSPLASSGIMHGSPMSDDSSHHSDSGILNDGFSNGVVNHTGPKPLDNALYSQCVLAMCTLAKDPSPRIANLGRRVLS IIGIEQVVAKPLKSTGVRPSEATATPSLAGLVRSSSWFDMNGGHLPLTFRTPPVSPPRPSYITGMRRVCSLEFRPHLMTS PDSGLADPLLGSAGAAGSSDRSFLPQSTIYNWSCGHFSKPLLTAADDSEEVLARREEREKYALEHIAKCQHSAVTRLTNP IAKWDTKGTQTVLLQPFSPIVIAADENERIRVWNHEEASLLNSFDNNDFPDKGISKLCLVNELDDSLLLAASCNVIFCLI LCILFTNYCCSTKYQVIL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1114 | 1114 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1114 | 1114 | 0.0 | ||
| Phobius | 1 | 1106 | 1106 | - | – | |
| MobiDBLite | 22 | 45 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 22 | 56 | 35 | - | – | |
| PRINTS | 108 | 129 | 22 | 1.5E-154 | – | |
| SMART | 109 | 262 | 154 | 4.0E-95 | ||
| Pfam | 110 | 261 | 152 | 4.5E-68 | ||
| PRINTS | 152 | 171 | 20 | 1.5E-154 | – | |
| PRINTS | 173 | 194 | 22 | 1.5E-154 | – | |
| PRINTS | 199 | 224 | 26 | 1.5E-154 | – | |
| PRINTS | 226 | 250 | 25 | 1.5E-154 | – | |
| PRINTS | 297 | 317 | 21 | 1.5E-154 | – | |
| PRINTS | 335 | 362 | 28 | 1.5E-154 | – | |
| PRINTS | 370 | 394 | 25 | 1.5E-154 | – | |
| PRINTS | 446 | 476 | 31 | 1.5E-154 | – | |
| SUPERFAMILY | 462 | 884 | 423 | 5.76E-33 | ||
| PRINTS | 477 | 498 | 22 | 1.5E-154 | – | |
| Gene3D | 480 | 762 | 283 | 1.1E-27 | ||
| PRINTS | 500 | 519 | 20 | 1.5E-154 | – | |
| PRINTS | 524 | 540 | 17 | 1.5E-154 | – | |
| MobiDBLite | 800 | 830 | 31 | - | – | |
| Phobius | 1107 | 1130 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 1107 | 1129 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1131 | 1138 | 8 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | TOR signaling | A series of molecular signals mediated by TOR (Target of rapamycin) proteins, members of the phosphoinositide (PI) 3-kinase related kinase (PIKK) family that act as serine/threonine kinases in response to nutrient availability or growth factors. | ||
| Cellular component | TORC1 complex | A protein complex that contains at least TOR (target of rapamycin) and Raptor (regulatory-associated protein of TOR), or orthologs of, in complex with other signaling components. Mediates the phosphorylation and activation of S6K. In Saccharomyces, the complex contains Kog1p, Lst8p, Tco89p, and either Tor1p or Tor2p. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0452200.10, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…