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LotjaGi1g1v0452200.6

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi1g1v0452200
Transcript ID LotjaGi1g1v0452200.6
Related isoforms 9
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Regulatory-associated protein of TOR 1; TAIR: AT3G08850.1 Regulatory-associated protein of TOR 1; Swiss-Prot: sp|Q93YQ1|RTOR1_ARATH Regulatory-associated protein of TOR 1; TrEMBL-Plants: tr|V7B2P2|V7B2P2_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0452200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr1:95185210..95198419) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGCATTGGGTGATTTCATGGCATCACGCTTTTCCCAATCCAGCGTTCTCGTCGTTCCGAATCATCACCACCACCACCA CGATGATTCCGCTACCTCCACTACCCTCGACGACGCCGATTTCGGCCCCCGTCGGGATTCTGAGCCCGCCGTTGCTAGCA GTAGCAGCGGTAGCGCCGCCGCCGCGTATCCTAATGCTGCCACCAGCTTGGCGTACCTTCCGCAGACCGTTGTGCTTTGC GAGCTCCGTCATGATGCCTTTGAGGCCGCCGTTCCCGTCGGTCCCTCCGACAGCGGCCTTGTTTCGAAATGGCGGCCGAA GGACAGGGTATAGCTTTCTCCTTTGCCTGTTGTTTTGTGTTTTCGTGTCTGTGATTCGCGATTTGCTTTTCGGATATGTG TTTTGCATAGTAGGAACTTGGAAACTTAGGTCATTGCAGTTGTTAGTGTATTGGCATTATCACATAACACTTGGAAACTT GAGGTTTTAACAAATAAGGGTTTGGATCCACTCACCAGCAAATGGGTAAAGTGTCGAATGGTAACTATTATTAAGGAAAT CAAGTGTGCGAGTTCTGCTATCCATGATTTTTAACCCAGATGGTTGTATTTAATAGAATAGGATTCTAAATCATTGGAGT TTTTATGAAAGGTTATAAACTTATCACTTTATTTTGTGTGGTGCATTTTGCATTTTTGAGGTTCAATCAATTCAAGGAAT AATAACAAGATTGCATCGGGGGCGGGGGATTTCTTCAGTTAATCTATTTGGCTGAAAAACGACTACAAGATGATCAGTTT TCCTGAAATTGCTTGACTGGAGTAGTGATTTATAGACTGAGTCAAGGAAAATATATTCTTACATTCGCTTCTTAGTATAA TAGGCCTTTTATTAGTCCTGTTACCTAGGAAGTGGCTTGTTCTCATCAATGGGAGGTTGCTAATTTCTTACTTCTGCAAT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0452200.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCATTGGGTGATTTCATGGCATCACGCTTTTCCCAATCCAGCGTTCTCGTCGTTCCGAATCATCACCACCACCACCA CGATGATTCCGCTACCTCCACTACCCTCGACGACGCCGATTTCGGCCCCCGTCGGGATTCTGAGCCCGCCGTTGCTAGCA GTAGCAGCGGTAGCGCCGCCGCCGCGTATCCTAATGCTGCCACCAGCTTGGCGTACCTTCCGCAGACCGTTGTGCTTTGC GAGCTCCGTCATGATGCCTTTGAGGCCGCCGTTCCCGTCGGTCCCTCCGACAGCGGCCTTGTTTCGAAATGGCGGCCGAA GGACAGGATGAAGACAGGATGTGTAGCTCTAGTATTATGTTTAAACATTAGTGTTGATCCTCCAGATGTAATAAAGATAT CCCCTTGTGCCAGAATGGAGTGCTGGATAGATCCTTTTTCTATGGCACCACAAAAGGCATTGGAATCAATTGGAAAATCT TTGAGCTGTCAGTATGAAAGATGGCAACCGAAGGCACGCTATAAGTGTCAACTTGATCCAACCGTGGATGAGGTGAAGAA GCTTTGTACTACATGTCGCAGATATGCAAAGACGGAAAGAGTTTTATTCCATTACAATGGGCATGGTGTACCAAAGCCAA CTGTTAATGGTGAAATTTGGGTCTTCAATAAGAGTTATACGCAGTATATCCCCTTACCAATCAGTGACCTTGATTCCTGG CTGAAGACCCCATCAATTTATGTTTTTGATTGCTCTGCTGCGGGGTTAATAGTGAATTCTTTCATTGAGCTTCATGAATG GAGTGCATCTAACACTGCTGGGGCCACAAGGGATTGCATTTTGCTTGCAGCATGTGAAGCACATGAGACTTTGCCTCAGA GTGTTGAATTCCCAGCTGATGTGTTTACATCTTGCCTAACAACACCTATAAAGATGGCATTGCGGTGGTTCTGTACTCGT TCATTACTTCGTCAGTCGCTTGATTATTCCCTTATAGATAAGATCCCTGGCCGTCCCAATGACCGAAAGACACTTCTGGG TGAATTGAATTGGATTTTTACAGCAGTAACTGATACGATTGCCTGGAATGTTCTTCCTCATGAACTTTTTCAGAGGCTGT TCAGACAAGATTTGCTTGTTGCAAGTCTGTTTCGAAATTTTCTACTTGCTGAGCGAATAATGCGATCTGCAAATTGTACT CCTGTCTCTCACCCTATGTTACCGCCAACTCATCAGCATCATATGTGGGATGCATGGGACATGGCTGCTGAGCTTTGCCT CTCTCAACTTCCCTCATTAGTTGAGGATCCTAATGCAGAATTTCAGCGTTTGGTTGTTCTTTTTCAGCCTAGTACATTTT TCACTGAGCAGTTGACAGCATTCGAGGTATGGCTTGACCATGGTTCTGAACATAAGAAACCACCAGAACAGTTGCCTATA GTTCTTCAGGTTTTACTCAGTCAGTGCCATCGATTTCGGGCTTTAGTTCTCCTTGGAAGGTTCCTTGATATGGGGCCATG GGCTGTTGATCTGGCATTATCTGTTGGAATATTTCCTTACGTTCTTAAGCTGCTGCAAACTACAACACCAGAATTACGTC AGATTCTTGTATTCATATGGACTAAGATTTTGGCACTTGACAAGTCATGTCAGGTTGATCTAGTGAAAGATGGAGGTCAT ATCTATTTTATTAAGTTTCTTGATAGCATGGAAGCATATCCAGAGCAACGAGCAATGGCTGCTTTTGTTTTAGCTGTGAT TGTGGATGGTCATAGAAGAGGTCAAGAAGCTTGTATTGAAGCTGGTTTGATCCAAGTCTGCTTAAAGCACCTTCAGAGCT CATCTCTCAATGATTCACAAACCGAACCCCTTTTCCTTCAGTGGCTGTGCTTGTGTCTGGGGAAATTGTGGGAAGACTAC ACAGAGGCGCAAGCAATCGGTTTGCATGAAGATGCTACTTCTATATATGCTCCTCTACTTTCTGAACCCCAGCCAGAGGT TAGAGCATCTGCTGTTTTTGCACTGGGCACACTTCTTGATGTGGGATTTGATTCATGTAGAAGTGTTGGAGGAGATGAAG AATGTGATGATGATGACAAGTTTAGGGCTGAAGTTAGTATAGTTAAGAGTCTGTTGAGTGTTGCTTCAGATGGGAGTCCG TTGGTGAGGGCTGAGGTTGCAGTGGCTTTAGCAAGGTTTGCTTTTGGCCACAACAAGTACCTGAAATCTATTGCTGCTGC ATATTGGAAGCCTCAGACTAGTTCTTTGATAAATTCCTTACCCTCATTGACTAATATTAAAGATTCAGTTGGTGGTTTTT CTAACCAGAACCAGCATAAGCCTCATGGAAATATTGTTTCACCTCAAATTGGTCCTCTCAGGGTTGGGAGTGAGAATTCT AAAGTGGTTCGAGATGGGCGGATCTCATCTAGCAGTCCTCTCGCTAGTTCTGGAATCATGCATGGGTCCCCGATGTCTGA TGATTCATCTCATCATTCTGATTCAGGAATATTGAATGATGGTTTCAGTAATGGAGTGGTTAACCACACTGGGCCAAAAC CCTTGGATAATGCATTATATTCACAATGTGTACTTGCTATGTGTACTTTAGCAAAAGATCCATCGCCCCGCATTGCTAAC CTTGGCCGCCGAGTACTTTCCATAATAGGTATTGAACAAGTTGTAGCAAAACCATTGAAATCTACTGGTGTTCGTCCTAG TGAAGCTACAGCCACTCCTAGCCTTGCTGGACTTGTTCGCTCATCTTCTTGGTTTGATATGAATGGAGGACACTTGCCTC TAACCTTCAGAACTCCTCCAGTCAGTCCTCCTCGCCCAAGTTATATAACTGGAATGCGCAGAGTATGTTCATTGGAGTTT AGGCCCCACCTGATGACTTCTCCAGACTCAGGATTAGCTGATCCACTTTTAGGTTCGGCTGGAGCTGCGGGGAGTTCAGA TCGCAGTTTTCTTCCACAATCAACTATATATAATTGGAGTTGTGGGCACTTTTCCAAACCACTTTTAACTGCGGCAGATG ATAGTGAAGAAGTATTAGCAAGAAGAGAAGAGAGGGAAAAATATGCATTGGAGCACATAGCAAAATGCCAGCACTCAGCT GTGACCAGACTAACAAATCCTATTGCTAAATGGGACACTAAGGGTACACAAACAGTGTTGCTGCAACCTTTCTCTCCTAT AGTGATAGCTGCTGATGAGAATGAACGTATCAGGGTATGGAACCATGAAGAAGCATCACTTCTCAACAGCTTTGATAACA ATGATTTTCCTGACAAAGGAATTTCTAAACTCTGCCTAGTGAATGAGCTTGATGATAGCTTGCTTCTTGCTGCTTCATCT GATGGAAATATTCGAATTTGGAAAGATTATACTCTAAAGGGTAAACAGAAGCTTGTATCTGCATTCTCTTCAATTCATGG TCATAAACCTGGTGTGAGGAGTTTGAATGCAGTTGTTGATTGGCAACAGCAATGTGGTTATCTGTATGCATCGGGTGAGA TATCATCTATTATGCTATGGGATCTTGATAAAGAGCAACTTCTTAATGCTATACCTTCAGCATCAGATTGCAGTGTGTCT GCATTGGCCGCATCTCAAGTTCATGGGGGACAATTTGCAGCTGGGTTTGTAGATGGTTTCGTCAGACTCTATGATGTCAG AACACCTGAAATGCTCGTCTGTGGATTACAGCCACACACACAAGGAGTAGAAAAAGTTGTGGGGATTGGCTTTCAACCTG GGTTGGACCCAGGAAAGATTGTTAGTGCTTCTCAGGCTGGGGATATCCAATTCCTTGATATAAGAAATCACAGCAGCGCC TATCTCACTATTTCAGCTCACAGGGGTTCCCTTACAGCTTTAGCAGTACATAGACACGCTCCAATTATTGCCAGCGGTTC TGCCAAACAACTCATTAAAGTTTTTAACCTGGAGGGTGATCAACTGGGCACCATTCGTTACTATCCTACCCTAATGGCCC AGAAAATTGGTTCAGTAAGCTGCCTAAATTTCCACCCATACCAAGTACTACTTGCTGCCGGTGCGGCAGATGCATGTGTA TGTATTTATGCTGATGACAGCACTCAAGCAAGATGA 

Protein sequence (LotjaGi1g1v0452200.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MALGDFMASRFSQSSVLVVPNHHHHHHDDSATSTTLDDADFGPRRDSEPAVASSSSGSAAAAYPNAATSLAYLPQTVVLC ELRHDAFEAAVPVGPSDSGLVSKWRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIDPFSMAPQKALESIGKS LSCQYERWQPKARYKCQLDPTVDEVKKLCTTCRRYAKTERVLFHYNGHGVPKPTVNGEIWVFNKSYTQYIPLPISDLDSW LKTPSIYVFDCSAAGLIVNSFIELHEWSASNTAGATRDCILLAACEAHETLPQSVEFPADVFTSCLTTPIKMALRWFCTR SLLRQSLDYSLIDKIPGRPNDRKTLLGELNWIFTAVTDTIAWNVLPHELFQRLFRQDLLVASLFRNFLLAERIMRSANCT PVSHPMLPPTHQHHMWDAWDMAAELCLSQLPSLVEDPNAEFQRLVVLFQPSTFFTEQLTAFEVWLDHGSEHKKPPEQLPI VLQVLLSQCHRFRALVLLGRFLDMGPWAVDLALSVGIFPYVLKLLQTTTPELRQILVFIWTKILALDKSCQVDLVKDGGH IYFIKFLDSMEAYPEQRAMAAFVLAVIVDGHRRGQEACIEAGLIQVCLKHLQSSSLNDSQTEPLFLQWLCLCLGKLWEDY TEAQAIGLHEDATSIYAPLLSEPQPEVRASAVFALGTLLDVGFDSCRSVGGDEECDDDDKFRAEVSIVKSLLSVASDGSP LVRAEVAVALARFAFGHNKYLKSIAAAYWKPQTSSLINSLPSLTNIKDSVGGFSNQNQHKPHGNIVSPQIGPLRVGSENS KVVRDGRISSSSPLASSGIMHGSPMSDDSSHHSDSGILNDGFSNGVVNHTGPKPLDNALYSQCVLAMCTLAKDPSPRIAN LGRRVLSIIGIEQVVAKPLKSTGVRPSEATATPSLAGLVRSSSWFDMNGGHLPLTFRTPPVSPPRPSYITGMRRVCSLEF RPHLMTSPDSGLADPLLGSAGAAGSSDRSFLPQSTIYNWSCGHFSKPLLTAADDSEEVLARREEREKYALEHIAKCQHSA VTRLTNPIAKWDTKGTQTVLLQPFSPIVIAADENERIRVWNHEEASLLNSFDNNDFPDKGISKLCLVNELDDSLLLAASS DGNIRIWKDYTLKGKQKLVSAFSSIHGHKPGVRSLNAVVDWQQQCGYLYASGEISSIMLWDLDKEQLLNAIPSASDCSVS ALAASQVHGGQFAAGFVDGFVRLYDVRTPEMLVCGLQPHTQGVEKVVGIGFQPGLDPGKIVSASQAGDIQFLDIRNHSSA YLTISAHRGSLTALAVHRHAPIIASGSAKQLIKVFNLEGDQLGTIRYYPTLMAQKIGSVSCLNFHPYQVLLAAGAADACV CIYADDSTQAR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 1366 1366 0.0
PANTHER 1 1366 1366 0.0
MobiDBLite 22 56 35 -
MobiDBLite 22 45 24 -
PRINTS 108 129 22 9.2E-163
SMART 109 262 154 4.0E-95
Pfam 110 261 152 5.9E-68
PRINTS 152 171 20 9.2E-163
PRINTS 173 194 22 9.2E-163
PRINTS 199 224 26 9.2E-163
PRINTS 226 250 25 9.2E-163
PRINTS 297 317 21 9.2E-163
PRINTS 335 362 28 9.2E-163
PRINTS 370 394 25 9.2E-163
PRINTS 453 483 31 9.2E-163
SUPERFAMILY 469 891 423 9.05E-33
PRINTS 484 505 22 9.2E-163
Gene3D 487 769 283 1.5E-27
PRINTS 507 526 20 9.2E-163
PRINTS 531 547 17 9.2E-163
MobiDBLite 807 837 31 -
Gene3D 1029 1193 165 1.4E-14
SMART 1044 1081 38 99.0
ProSiteProfiles 1049 1371 323 18.457
SUPERFAMILY 1054 1363 310 5.83E-36
SMART 1084 1128 45 1.8
ProSiteProfiles 1111 1128 18 8.57
SMART 1184 1225 42 2.2
Gene3D 1194 1370 177 1.2E-20
PRINTS 1209 1227 19 9.2E-163
SMART 1277 1316 40 0.023
SMART 1329 1364 36 17.0

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process TOR signaling A series of molecular signals mediated by TOR (Target of rapamycin) proteins, members of the phosphoinositide (PI) 3-kinase related kinase (PIKK) family that act as serine/threonine kinases in response to nutrient availability or growth factors.
Cellular component TORC1 complex A protein complex that contains at least TOR (target of rapamycin) and Raptor (regulatory-associated protein of TOR), or orthologs of, in complex with other signaling components. Mediates the phosphorylation and activation of S6K. In Saccharomyces, the complex contains Kog1p, Lst8p, Tco89p, and either Tor1p or Tor2p.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi1g1v0452200.6, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…