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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0452200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0452200.9 |
| Related isoforms 9 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Regulatory-associated protein of TOR 1; TAIR: AT3G08850.1 Regulatory-associated protein of TOR 1; Swiss-Prot: sp|Q93YQ1|RTOR1_ARATH Regulatory-associated protein of TOR 1; TrEMBL-Plants: tr|V7B2P2|V7B2P2_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0452200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:95185210..95198445) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACGATCGCTGAGGGTTTCCGATTTGGATGGCATTGGGTGATTTCATGGCATCACGCTTTTCCCAATCCAGCGTTCTCGTC GTTCCGAATCATCACCACCACCACCACGATGATTCCGCTACCTCCACTACCCTCGACGACGCCGATTTCGGCCCCCGTCG GGATTCTGAGCCCGCCGTTGCTAGCAGTAGCAGCGGTAGCGCCGCCGCCGCGTATCCTAATGCTGCCACCAGCTTGGCGT ACCTTCCGCAGACCGTTGTGCTTTGCGAGCTCCGTCATGATGCCTTTGAGGCCGCCGTTCCCGTCGGTCCCTCCGACAGC GGCCTTGTTTCGAAATGGCGGCCGAAGGACAGGGTATAGCTTTCTCCTTTGCCTGTTGTTTTGTGTTTTCGTGTCTGTGA TTCGCGATTTGCTTTTCGGATATGTGTTTTGCATAGTAGGAACTTGGAAACTTAGGTCATTGCAGTTGTTAGTGTATTGG CATTATCACATAACACTTGGAAACTTGAGGTTTTAACAAATAAGGGTTTGGATCCACTCACCAGCAAATGGGTAAAGTGT CGAATGGTAACTATTATTAAGGAAATCAAGTGTGCGAGTTCTGCTATCCATGATTTTTAACCCAGATGGTTGTATTTAAT AGAATAGGATTCTAAATCATTGGAGTTTTTATGAAAGGTTATAAACTTATCACTTTATTTTGTGTGGTGCATTTTGCATT TTTGAGGTTCAATCAATTCAAGGAATAATAACAAGATTGCATCGGGGGCGGGGGATTTCTTCAGTTAATCTATTTGGCTG AAAAACGACTACAAGATGATCAGTTTTCCTGAAATTGCTTGACTGGAGTAGTGATTTATAGACTGAGTCAAGGAAAATAT ATTCTTACATTCGCTTCTTAGTATAATAGGCCTTTTATTAGTCCTGTTACCTAGGAAGTGGCTTGTTCTCATCAATGGGA 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0452200.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCATTGGGTGATTTCATGGCATCACGCTTTTCCCAATCCAGCGTTCTCGTCGTTCCGAATCATCACCACCACCACCA CGATGATTCCGCTACCTCCACTACCCTCGACGACGCCGATTTCGGCCCCCGTCGGGATTCTGAGCCCGCCGTTGCTAGCA GTAGCAGCGGTAGCGCCGCCGCCGCGTATCCTAATGCTGCCACCAGCTTGGCGTACCTTCCGCAGACCGTTGTGCTTTGC GAGCTCCGTCATGATGCCTTTGAGGCCGCCGTTCCCGTCGGTCCCTCCGACAGCGGCCTTGTTTCGAAATGGCGGCCGAA GGACAGGATGAAGACAGGATGTGTAGCTCTAGTATTATGTTTAAACATTAGTGTTGATCCTCCAGATGTAATAAAGATAT CCCCTTGTGCCAGAATGGAGTGCTGGATAGATCCTTTTTCTATGGCACCACAAAAGGCATTGGAATCAATTGGAAAATCT TTGAGCTGTCAGTATGAAAGATGGCAACCGAAGGCACGCTATAAGTGTCAACTTGATCCAACCGTGGATGAGGTGAAGAA GCTTTGTACTACATGTCGCAGATATGCAAAGACGGAAAGAGTTTTATTCCATTACAATGGGCATGGTGTACCAAAGCCAA CTGTTAATGGTGAAATTTGGGTCTTCAATAAGTATATCCCCTTACCAATCAGTGACCTTGATTCCTGGCTGAAGACCCCA TCAATTTATGTTTTTGATTGCTCTGCTGCGGGGTTAATAGTGAATTCTTTCATTGAGCTTCATGAATGGAGTGCATCTAA CACTGCTGGGGCCACAAGGGATTGCATTTTGCTTGCAGCATGTGAAGCACATGAGACTTTGCCTCAGAGTGTTGAATTCC CAGCTGATGTGTTCTGTACTCGTTCATTACTTCGTCAGTCGCTTGATTATTCCCTTATAGATAAGATCCCTGGCCGTCCC AATGACCGAAAGACACTTCTGGGTGAATTGAATTGGATTTTTACAGCAGTAACTGATACGATTGCCTGGAATGTTCTTCC TCATGAACTTTTTCAGAGGCTGTTCAGACAAGATTTGCTTGTTGCAAGTCTGTTTCGAAATTTTCTACTTGCTGAGCGAA TAATGCGATCTGCAAATTGTACTCCTGTCTCTCACCCTATGTTACCGCCAACTCATCAGCATCATATGTGGGATGCATGG GACATGGCTGCTGAGCTTTGCCTCTCTCAACTTCCCTCATTAGTTGAGGATCCTAATGCAGAATTTCAGCCTAGTACATT TTTCACTGAGCAGTTGACAGCATTCGAGGTATGGCTTGACCATGGTTCTGAACATAAGAAACCACCAGAACAGTTGCCTA TAGTTCTTCAGGTTTTACTCAGTCAGTGCCATCGATTTCGGGCTTTAGTTCTCCTTGGAAGGTTCCTTGATATGGGGCCA TGGGCTGTTGATCTGGCATTATCTGTTGGAATATTTCCTTACGTTCTTAAGCTGCTGCAAACTACAACACCAGAATTACG TCAGATTCTTGTATTCATATGGACTAAGATTTTGGCACTTGACAAGTCATGTCAGGTTGATCTAGTGAAAGATGGAGGTC ATATCTATTTTATTAAGTTTCTTGATAGCATGGAAGCATATCCAGAGCAACGAGCAATGGCTGCTTTTGTTTTAGCTGTG ATTGTGGATGGTCATAGAAGAGGTCAAGAAGCTTGTATTGAAGCTGGTTTGATCCAAGTCTGCTTAAAGCACCTTCAGAG CTCATCTCTCAATGATTCACAAACCGAACCCCTTTTCCTTCAGTGGCTGTGCTTGTGTCTGGGGAAATTGTGGGAAGACT ACACAGAGGCGCAAGCAATCGGTTTGCATGAAGATGCTACTTCTATATATGCTCCTCTACTTTCTGAACCCCAGCCAGAG GTTAGAGCATCTGCTGTTTTTGCACTGGGCACACTTCTTGATGTGGGATTTGATTCATGTAGAAGTGTTGGAGGAGATGA AGAATGTGATGATGATGACAAGTTTAGGGCTGAAGTTAGTATAGTTAAGAGTCTGTTGAGTGTTGCTTCAGATGGGAGTC CGTTGGTGAGGGCTGAGGTTGCAGTGGCTTTAGCAAGGTTTGCTTTTGGCCACAACAAGTACCTGAAATCTATTGCTGCT GCATATTGGAAGCCTCAGACTAGTTCTTTGATAAATTCCTTACCCTCATTGACTAATATTAAAGATTCAGTTGGTGGTTT TTCTAACCAGAACCAGCATAAGCCTCATGGAAATATTGTTTCACCTCAAATTGGTCCTCTCAGGGTTGGGAGTGAGAATT CTAAAGTGGTTCGAGATGGGCGGATCTCATCTAGCAGTCCTCTCGCTAGTTCTGGAATCATGCATGGGTCCCCGATGTCT GATGATTCATCTCATCATTCTGATTCAGGAATATTGAATGATGGTTTCAGTAATGGAGTGGTTAACCACACTGGGCCAAA ACCCTTGGATAATGCATTATATTCACAATGTGTACTTGCTATGTGTACTTTAGCAAAAGATCCATCGCCCCGCATTGCTA ACCTTGGCCGCCGAGTACTTTCCATAATAGGTATTGAACAAGTTGTAGCAAAACCATTGAAATCTACTGGTGTTCGTCCT AGTGAAGCTACAGCCACTCCTAGCCTTGCTGGACTTGTTCGCTCATCTTCTTGGTTTGATATGAATGGAGGACACTTGCC TCTAACCTTCAGAACTCCTCCAGTCAGTCCTCCTCGCCCAAGTTATATAACTGGAATGCGCAGAGTATGTTCATTGGAGT TTAGGCCCCACCTGATGACTTCTCCAGACTCAGGATTAGCTGATCCACTTTTAGGTTCGGCTGGAGCTGCGGGGAGTTCA GATCGCAGTTTTCTTCCACAATCAACTATATATAATTGGAGTTGTGGGCACTTTTCCAAACCACTTTTAACTGCGGCAGA TGATAGTGAAGAAGTATTAGCAAGAAGAGAAGAGAGGGAAAAATATGCATTGGAGCACATAGCAAAATGCCAGCACTCAG CTGTGACCAGACTAACAAATCCTATTGCTAAATGGGACACTAAGGGTACACAAACAGTGTTGCTGCAACCTTTCTCTCCT ATAGTGATAGCTGCTGATGAGAATGAACGTATCAGGGTATGGAACCATGAAGAAGCATCACTTCTCAACAGCTTTGATAA CAATGATTTTCCTGACAAAGGAATTTCTAAACTCTGCCTAGTGAATGAGCTTGATGATAGCTTGCTTCTTGCTGCTTCAT CTGATGGAAATATTCGAATTTGGAAAGATTATACTCTAAAGGGTAAACAGAAGCTTGTATCTGCATTCTCTTCAATTCAT GGTCATAAACCTGGTGTGAGGAGTTTGAATGCAGTTGTTGATTGGCAACAGCAATGTGGTTATCTGTATGCATCGGGTGA GATATCATCTATTATGCTATGGGATCTTGATAAAGAGCAACTTCTTAATGCTATACCTTCAGCATCAGATTGCAGTGTGT CTGCATTGGCCGCATCTCAAGTTCATGGGGGACAATTTGCAGCTGGGTTTGTAGATGGTTTCGTCAGACTCTATGATGTC AGAACACCTGAAATGCTCGTCTGTGGATTACAGCCACACACACAAGGAGTAGAAAAAGTTGTGGGGATTGGCTTTCAACC TGGGTTGGACCCAGGAAAGATTGTTAGTGCTTCTCAGGCTGGGGATATCCAATTCCTTGATATAAGAAATCACAGCAGCG CCTATCTCACTATTTCAGCTCACAGGGGTTCCCTTACAGCTTTAGCAGTACATAGACACGCTCCAATTATTGCCAGCGGT TCTGCCAAACAACTCATTAAAGTTTTTAACCTGGAGGGTGATCAACTGGGCACCATTCGTTACTATCCTACCCTAATGGC CCAGAAAATTGGTTCAGTAAGCTGCCTAAATTTCCACCCATACCAAGTACTACTTGCTGCCGGTGCGGCAGATGCATGTG TATGTATTTATGCTGATGACAGCACTCAAGCAAGATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0452200.9) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MALGDFMASRFSQSSVLVVPNHHHHHHDDSATSTTLDDADFGPRRDSEPAVASSSSGSAAAAYPNAATSLAYLPQTVVLC ELRHDAFEAAVPVGPSDSGLVSKWRPKDRMKTGCVALVLCLNISVDPPDVIKISPCARMECWIDPFSMAPQKALESIGKS LSCQYERWQPKARYKCQLDPTVDEVKKLCTTCRRYAKTERVLFHYNGHGVPKPTVNGEIWVFNKYIPLPISDLDSWLKTP SIYVFDCSAAGLIVNSFIELHEWSASNTAGATRDCILLAACEAHETLPQSVEFPADVFCTRSLLRQSLDYSLIDKIPGRP NDRKTLLGELNWIFTAVTDTIAWNVLPHELFQRLFRQDLLVASLFRNFLLAERIMRSANCTPVSHPMLPPTHQHHMWDAW DMAAELCLSQLPSLVEDPNAEFQPSTFFTEQLTAFEVWLDHGSEHKKPPEQLPIVLQVLLSQCHRFRALVLLGRFLDMGP WAVDLALSVGIFPYVLKLLQTTTPELRQILVFIWTKILALDKSCQVDLVKDGGHIYFIKFLDSMEAYPEQRAMAAFVLAV IVDGHRRGQEACIEAGLIQVCLKHLQSSSLNDSQTEPLFLQWLCLCLGKLWEDYTEAQAIGLHEDATSIYAPLLSEPQPE VRASAVFALGTLLDVGFDSCRSVGGDEECDDDDKFRAEVSIVKSLLSVASDGSPLVRAEVAVALARFAFGHNKYLKSIAA AYWKPQTSSLINSLPSLTNIKDSVGGFSNQNQHKPHGNIVSPQIGPLRVGSENSKVVRDGRISSSSPLASSGIMHGSPMS DDSSHHSDSGILNDGFSNGVVNHTGPKPLDNALYSQCVLAMCTLAKDPSPRIANLGRRVLSIIGIEQVVAKPLKSTGVRP SEATATPSLAGLVRSSSWFDMNGGHLPLTFRTPPVSPPRPSYITGMRRVCSLEFRPHLMTSPDSGLADPLLGSAGAAGSS DRSFLPQSTIYNWSCGHFSKPLLTAADDSEEVLARREEREKYALEHIAKCQHSAVTRLTNPIAKWDTKGTQTVLLQPFSP IVIAADENERIRVWNHEEASLLNSFDNNDFPDKGISKLCLVNELDDSLLLAASSDGNIRIWKDYTLKGKQKLVSAFSSIH GHKPGVRSLNAVVDWQQQCGYLYASGEISSIMLWDLDKEQLLNAIPSASDCSVSALAASQVHGGQFAAGFVDGFVRLYDV RTPEMLVCGLQPHTQGVEKVVGIGFQPGLDPGKIVSASQAGDIQFLDIRNHSSAYLTISAHRGSLTALAVHRHAPIIASG SAKQLIKVFNLEGDQLGTIRYYPTLMAQKIGSVSCLNFHPYQVLLAAGAADACVCIYADDSTQAR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1340 | 1340 | 0.0 | ||
| PANTHER | 1 | 1340 | 1340 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 22 | 45 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 22 | 56 | 35 | - | – | |
| PRINTS | 108 | 129 | 22 | 3.0E-137 | – | |
| SMART | 109 | 258 | 150 | 2.9E-89 | ||
| Pfam | 110 | 257 | 148 | 5.2E-62 | ||
| PRINTS | 152 | 171 | 20 | 3.0E-137 | – | |
| PRINTS | 173 | 194 | 22 | 3.0E-137 | – | |
| PRINTS | 199 | 224 | 26 | 3.0E-137 | – | |
| PRINTS | 316 | 343 | 28 | 3.0E-137 | – | |
| PRINTS | 351 | 375 | 25 | 3.0E-137 | – | |
| PRINTS | 427 | 457 | 31 | 3.0E-137 | – | |
| SUPERFAMILY | 443 | 865 | 423 | 8.64E-33 | ||
| PRINTS | 458 | 479 | 22 | 3.0E-137 | – | |
| Gene3D | 461 | 743 | 283 | 1.5E-27 | ||
| PRINTS | 481 | 500 | 20 | 3.0E-137 | – | |
| PRINTS | 505 | 521 | 17 | 3.0E-137 | – | |
| MobiDBLite | 781 | 811 | 31 | - | – | |
| Gene3D | 1005 | 1170 | 166 | 1.4E-14 | ||
| SMART | 1018 | 1055 | 38 | 99.0 | ||
| ProSiteProfiles | 1023 | 1345 | 323 | 18.457 | ||
| SUPERFAMILY | 1028 | 1337 | 310 | 6.23E-36 | ||
| SMART | 1058 | 1102 | 45 | 1.8 | ||
| ProSiteProfiles | 1085 | 1102 | 18 | 8.57 | ||
| SMART | 1158 | 1199 | 42 | 2.2 | ||
| Gene3D | 1171 | 1344 | 174 | 5.7E-21 | ||
| PRINTS | 1183 | 1201 | 19 | 3.0E-137 | – | |
| SMART | 1251 | 1290 | 40 | 0.023 | ||
| SMART | 1303 | 1338 | 36 | 17.0 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Biological process | TOR signaling | A series of molecular signals mediated by TOR (Target of rapamycin) proteins, members of the phosphoinositide (PI) 3-kinase related kinase (PIKK) family that act as serine/threonine kinases in response to nutrient availability or growth factors. | ||
| Cellular component | TORC1 complex | A protein complex that contains at least TOR (target of rapamycin) and Raptor (regulatory-associated protein of TOR), or orthologs of, in complex with other signaling components. Mediates the phosphorylation and activation of S6K. In Saccharomyces, the complex contains Kog1p, Lst8p, Tco89p, and either Tor1p or Tor2p. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0452200.9, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…