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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0604000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0604000.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA replication helicase dna2, putative; TAIR: AT1G08840.4 DNA replication helicase; Swiss-Prot: sp|Q8QHA5|DNA2_XENLA DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2; TrEMBL-Plants: tr|A0A072TZB7|A0A072TZB7_MEDTR DNA replication ATP-dependent helicase Dna2; Found in the gene: LotjaGi1g1v0604000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:114863097..114887289) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTTCGATATTTCTGAAGGCCCAGTGCGAGAAGGGCCCAAAATGACTACCAATGTTATTGTATTAACGCGGGAAAATTAAG CATATAATTTTTGTCCCTTTCCGATCCTCCCTCTCTACCAAACCAAACCAAACCAAAGCACGAAGTGGAAGAAGAAGAAG CAGCGAAAGATCGATTATCTAAGAAGCAAAATGGAACAATAAAACCCTAAATCGATTCTAAAATGCCTCCGAGGAAGAAA CCCAACAACGCCTCATCTTCATCATCATCTTCCTCTGCTACCTCCTCCAAGAAGCCCCTTCCACAACCCTCCAAGTACGG CATCCAGCACTTCTTCGACCGCCACACGCAACTCACCTCTCAGAAGCAGCAGCAGCAAGCCACCACCAATGTCACCTCCG CCGGCGAGGTTCTGTCTTCTTCGCAGAACACTCCGCCTGCGAATCCGCCCTTGCCGCCGCCGCCGGCCAATACTGCTGTA GAGACTCCCTCACTGTCTGAGGTGTCTCCGGAGATCTCGAAGTCCGTGTCGCGTAATAAGCGCGTCAAATTCTCGCCTGG AATGGTAACCTCCGTTTAATTTTACTGTTGTATCGTTTTGATTTTCGTGGTTTGGGCGTGATTTTTGGTTTTGTTCCATT TTCATGCTTTTCTTATTTGCCGTTACAAGCTGGATTGGAAAATGGAAATGAATGATGGTTCACTGTTCAATGCTCATATT TGAGGCATTAACAGGTTTTCTGGCAGTTCTGGGATCAGTTTATTTTTCCCAAGCCTGTGCTTGAAATATTTGATTCAATT AATCATGATTTTAAGTATGCATTTCAGTGTTGTTCATGGCGGATCGCGGAAAGCCAAAAAACCCGCTATTGCCCTCATTG CGAAAAATAGCGGGATAGAAGTGAGCCCTCAGAGCGCTATGCTAAAGCGCTTTAGCGCCCTTGTAACCGCTATTCGCTAT 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GGAAGACATCCACCATGGTCCATGCTGTGAAAGCCTTGTTGATTAGAGGCACATCCATTTTGCTAACAGCCTATACAAAT TCTGCTGTTGATAATTTACTCATCAAATTAAAAGCACAGGTACCCATGCTTGCATATCAGAACATCTTGATATACTGTAC CATATTATGAATTATGGCTACATGTTGCATAAAAAATGCATCCCATTTACTTGAATTGTCGTCTGTCAAGTGTTCTGATT GCTTGGCAAACTATGAAAAAAAAAACTAGAGGTTTAGACAGTATTGCTTTTGGTCTAAAATACACTCAATCTTCATGAGT GGTCGGAACTCGGAATGAACTTAACAGTTAACACGAATAACAGAAGGATTCTGATTCTGAGGCCTAACTAACTAACAGAC TCTAACCACCTCTAGGGTTACAATATAATGCAACCGGGTACACAATGCCCTGATACACCAATATATGCCATACAGTGTTG AATTATCTTGTGCACTCTCAGCATCACTCAGCAGTCAGAACTACTTATTCAGCTGCCATTCTGTTAGAGAAAGTTGTTGA TAGCTGTTAGCAACCGTGACTAGTTAGTGTATAAATAGATCAGATTACAGATTATCATTCAGATTATTGATCAGTAATAA AGCTCAGATTTCAGATTTTTTTCATGCTGTCTTTCTCTTGAACCCAGTTTCTTCATTTTCTTAGATTTTCTATCACTTTC TCTCTCTAATTCTCTGCTTACCTATACCTAATACACCTTGCCTGTATCCCCATGTTGTGTCAAGGTTGTGTCAAATTCCT GGATCTTGGTTGGCTGCTTAAACTAAATTGGGTGTCCTTCATGGAGTACTGCATTTTCTCTGTTGATGCATGCTCTCCTT TATCCAAATGACTATAATATAATGTTTCTCTGAAACTTTTGGTATTTACAGTTGATCTTGCATATAATTGTAATATAAAT GGATGCAGGGCATTGATTTTGTACGTATTGGAAGGCATGAGGCCGTGAATGAAGAGGTCAGAGGTCACTGCCTCTCAGGT TTGCCAATTTCTTGTTGGTAGTCTTTCTTTTAAAGTCATAACACTTGTATCAATTAGTTTGACAGAAGTTTCTATCACAG TAACGAATGTACAAAGTGTTGAAGATATTAAAATAAGGTTAGAACAAGTCAAAGTTGTTGCAGTTACTTGTCTGGGCATC TCCAGTCCCTTGCTTACTAACATGAGATTCGATGTATGCATTATGGATGAAGCTGGACAGACAACTTTACCGGTATGTGC CCTATGCCTTTAATATATTTTATTAGACGTGTGATACTCATTGACATGTACAGATGTATAGGAAACTGGGAACTATAGCC GAAAACTTTATTGTACTAATGGTAAAAGTCTCTGCTAGTGATATGAACTGATTGATACCGATAACAGATAGTATGTTTTT ACAAAAAACGAAAATGATAGAAATGTAGCCTTTTCGAGGATCTTATCCTATCTCCTCCCAGCCCAAAGGACCAAAGTTCC ACTTGAATGTTTCAAGCTTGCTTGAGAGAGGATGTTTTAGTGTACTATTACTATCATTGATTATTGATTTAATAAGCTGG AAACGTTTCCTAGAATACCATTGTTCCAATACTATTTTGAACTAGTTATCTATTTAATAACTTGTTCATGCCAACTGAAA AAATTGTTCATGTGTATGTAATTATAATGGACATGCTTCCATTGCAGGTGTCCTTGGGCCCTCTAACATTTGCTTCGACG TTTGTTCTTGTTGGGGATCATTATCAACTTCCACCACTTGTCCAAGTATGTGCCTTAAGTACTCATACTTCCTCTGTACA AAGTTCACTGTATAACACTATTTGAATTTTTTTTTTCTAATAATTCTTAGAGTACAGAAGCCCGAGAGAATGGCATGGGG ATGAGTTTATTTTGTAGGCTCTCAGAAGCACATCCACAGGCAATTTCAGCTTTACAGAGTCAGGTGCGGTAGCCACTAAC ATTAGTTTACAAACTTCGGTCTGGTTCTTTTCGCTTCGTTCTATTTCAGCTTCACTTACTAAGTAAAAATATATACAGTA CCGTATGTGTCAGGGAATTATGGACCTTTCAAATGCCTTGATATATGGTGACAGATTAAGGTGTGGTTCATCTGAGATAG CTGATGCAAAACTTGAGTTTACTGGTTTCAAATGTGGTGTGCCTTGGCTAGAGAATGTGAGGCTATTCTTCTCTTCCGAA TTCTCATTATCTTATATTTGAAGGATTTGCATGTATTGCTGAATTTGATCTATTTAAAGGAGCTTCTTCTGATTGGATCA TTGATGATGGAAGTAATTTTTATTTTGTTTTTTGGTAGAACTTTTCTCAAAGCTTATTTTACTATATTTTCAATGCCACT TTGTTAGATCGTTTTCCTCATATTCTTCTTTAGTCAACTATTTTTGGATGTGCATTGGATACTGCGTGTTAAATTTCAAT GACCAAGCCAGTAAAACATGCCCCCCCCCCCCCCTCCAATACTCAAGTTGGGTGAAATAATGAAAATAAAATAAATGAAT CACTTAAATTTGTGGCACATTTCAAAGATCTGTGTGAGGATAATGCCTTCGAATGTTAGTATACTGATCCTGGGTTGGGA TGTGAGAACTCAGAAGCACAATAGTGATAAGACAGGTCATGGAGAATGGTATTATGTTGAAGTTGCTGGTTGCTACTTCA GGAAGGAAGGATTGTGATTATTGTTTGATACAAATGACTAAAAAATCCTAATTAAATAAAACACTATAATGGCAATAGCT TGACTCCTAATCGTAATTTAAAAGGAAACAAATGATGAAATATAAAGAAATATCAAAACCAATCTAAGATAGTATACAAT CCAAATATTATGAGATATTTTTCATATATTCCAACACTAACATAGGTATACTTGTAACTGGATGCAGATATTTTGTTTGG TTTTTTGTGTTATACCACTGGATGCAGAAGGTTGTATAAAGTAGTTTGCATTTTGTTAGACTATAGGTAGAGAACTAATG CTGAATAAAATCACATCTCCTGTTGAATTGAATCTTTTTTCTGTTTCTATGAACACATGCAGGTTTTGAATCCAGGAAGG CCCGTGATATTTATTGATACTGGTTTGTAAATATCACTTTTTTTTTCCTTTATACTAAAGGTCTTTTGAATGGGATTGCT TATATACTTATTTATTTCTCTCTTTAGACATGTTGCCTGCTTTGGAGGCAAGAGATCAGAAGGTTGTGAATAACCCAATT GAAGCTTTCATAATTGCTGAGGTATGTCAAGAGGACTAAATTATGGTGATTTAAAAAAATTGTGGACCCAAACCAGTAAA CAAATGTGGGACCAAAACTATTTTTTTCTTATATTATAGGGATAAAAATAATTAAGCCAAAATCAATCCTCAGAGTTGGT CCAAAAATCTTCCTCTTGACTGATTGATGGTTTGTTTAACCGAATAAAGGTAATATTAGCTATATTATATTGTTTAGCTT AATATAAACTAGTAATTATTTATATCAAGCTAGCCGATATATTTTCTAGGTGAAATTAATTCACATAATATAATCAATAT TTAACCATTGATAGACTTCTTTTTTTTTATTTTTGACTGGGTATCCCCATAGGCTATGTTATGGGACTAACCCTCTGGTT CACATTCCGACCAAATACTTTATGGTAACAGAGATTTTGTTTAACTCATTTTATTTTGGGTAATGAACTTGAGTGTTTTT GTATCGAAGTGATCCTACTTGATAAATATGCTTGTGGCAATCTGTTAATGGAAACAGTTTGGCATGCAAACCTCAAAAGT TGAACAATTTTGTGGTTTGAGTTTGTACTTTTCCCTTTTCTAATTATTAATTAATGATTCATGCTGTTTGACCATCACAA GTTCGTTAACCAATTTTCCATTGATTTTATAATGCAGATTGCAAAGGAATTGGTAAAAAATGGAATTGAAGGAGAACACA TTGGCATTATTACTCCTTATAATTCACAGGCAAACCTCATCCGGCATGCTGCTTGCATAACATCCTTGGAGATACATACC ATTGACAAATACCAGGTGAGGCTGAAGCAAATATGTAGAATTATGTTCAAACAATTAGGCCTGCATTACAAAAAATTAGT CCTCTTATCCAAACGCATTGTGTTTAGCATTTCACTAACATGTAATGCATGCATTTCACTAACATGTAATGCATAACTTA GTGTTTCTGTCTTGTGATTTTAAACATGATCACATTGATAATGGTCCTCACAAACCGGTCATCTGATTGTACAGGGAAGA GATAAGGACTGTATATTAGTTTCTTTTGTGAGGTCTAGTGAAAACCCAACAAGCTATGCTGCTTCTCTTCTTGGAGACTG GCACAGGATAAACGTGGCTCTTACGCGTGCTAAGGTACTTCTGTTATGCTCAAACTTTCTCTCTCAGACAAATTTTCAAC ACACTTGATAATAAATAGGCTTAATTGCAACTTTGGTCCCTGACATTTACAAAAGCCACGATTTTGGTCCCTCACCTAAT TTAATTACAAAAATCGCCCCTCACCTAACACTTCGTGAACAACGTTGGTCCAACCGTCAATTTTTTAACGGAAGAAGCTT ACGTGGCGTCTGAAAGCTTATGTGGAAGTGCCACTGGCGTCAGAATCGATTTTTTCTCTCCTCTCGGCTGTTTTTTTTAT CTCATAGTGAAGCTTTGCTGTTGGGAGGCCTAGTTGTTGGAACGCTGGGATTGAGGTTGTGTCCTATTCCTCTGAGTTTT TTTGTTGTTTTTTCCTCTGAGATGTAGAGGCATGTGCCTCCCTCTCTCCAGTGGCACTTCCACCTAAGTTTTCAAACACC ACATAAGCTTCTTCCGTTAAAAAATTGACGGTGGGACCAACTTTGTTCACAGAGTGTTAGGTGAGGGATGATTTTTGTAA TTAAATTAGGTGAGGGACCAAAATCGTGGCTTTTATAAATGTCAGGGACCAAAGATGCAATTAAGCCTAATAAATAAGCT TTACTTATCATCATGCTAAGGCTATCCTTGTACTCTTATCTGGCAGATAACTAATGAGTAAATTTAAATCGATAATTATT GGGTTAATAACCCTAGTGCTATTCTTTGGTTGTATTACATTTTTATCATTATAAACCAAGTACTAAATAACGATTTTATT AATTTAAAAAAAATAACGATTTTATTTATTAAAGTAAATACATTTTAACCTCTTCAAGAAAGAGTGAAACTTTAATTACA TGCTATAGCCAAAAGGAAAAACAGAATGAAAGCTTTCCTCAAATCAGAACCTCCAATTTTTAAGTGAGGAATCTGATCCT TTTGCTGCTAGCGTTAATTTTCTAGTTTTTCTGTAACATTCACCACCCCTATCAGTTATTTCCTTTCTCAAATATTTCAA TGCCTGTTGTAAAGATGTTTAAATTTTGAAGACCTGTCTCTTATTATGATTTATGGTTACAGAGAAAGTTGATAATGGTG GGGTCTCGTAGAACTCTATTGAAGGTTCCTCTACTGAAGCTTCTCATTAAGAAGGTTGAGGAGCAATCTGGAATTGTATG TGTGTCTAAGACGGATATCTATCGAAAATGTGAGCTCAAGAGATGTTCGCAAATGAGATGAGTGAAAATTCCTTCCCCCT ATTTTTTGATGGGTTGTGTAATTGTTATATCATTGTCCAAGTATATGTAACGAGTGTATTCTATTATTGATTACTCATTC AATAAAGTAAAGGTAACTGGTAAAATTTGTAAATACATGTTAGGTTAATTATCAAATTAGTCCTTATATTTGCATGAGAA TCCGTGTTTAATCCTTCTCGGAAAAAAGTTTGATTCATATTCCCATGATGACAACAAGTTTGGTTTTGGTCCTCATTGGA GGGCGGAGCTCCGGCGAGAGTGCTGTGTGGCAG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0604000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCTCCGAGGAAGAAACCCAACAACGCCTCATCTTCATCATCATCTTCCTCTGCTACCTCCTCCAAGAAGCCCCTTCC ACAACCCTCCAAGTACGGCATCCAGCACTTCTTCGACCGCCACACGCAACTCACCTCTCAGAAGCAGCAGCAGCAAGCCA CCACCAATGTCACCTCCGCCGGCGAGGTTCTGTCTTCTTCGCAGAACACTCCGCCTGCGAATCCGCCCTTGCCGCCGCCG CCGGCCAATACTGCTGTAGAGACTCCCTCACTGTCTGAGGTGTCTCCGGAGATCTCGAAGTCCGTGTCGCGTAATAAGCG CGTCAAATTCTCGCCTGGAATGTTTATCAAGCCGAGCCAGGATGATGGGGCTGATGAGGTTACATGGAAGATATCTCCTG TGAATGAAAGGCTTCAAGCAGTATCGAAACAAATGCCTGAGATAATTAAAGCTTTGGCCGAGTCCTCGAGGATCAACTTG TCGCCGATTCACGGCTGCTCCGAAGATGAGACGTTTCGGGATAAAGATGGCAGGGTTGAAAAGTTGCTTACTAATACATC AATTCCTAATGGTTCCGCAAAACCTCTGGTGCCAATGAGTAAATTAGGCCCGCAAAGGATTAACCCTGGCCGAGACGTGG AGTTTAGTGTCAATTCAACGGCTGTGAGCAGTTCTGGAGTTTCTGGTGATGAGAGTCCCTTCAGAACTCCACCGTCATTG TCCTTTCGCCAGGATAAGGTGCAGCTTGCCAAGGGTGTTGAACATAGTGGACCATCTGACCAACTTTTCCTAAGACAGCA CAAAAAGGCATTGCTTGAACTATTAGATCAAGTTGAAGATGCAATCACTGTTGACAACGATGCAATTTGTAATAAAACCA CTTATTCCTTCAAATCTCAAGATGAAATTGCTAATGACCCTGCCAGAGCTAACCATGCAGTAGAAAGGACAAAGTCACAC AAGCCTAAAGAGGCCACTAGTGTTCTCTCCAATTCTAGTTATTTGGCTTTGGAGGTATCAGAAAAGCACAGGCCTGCTAA TTCCTCTTCTGCTCAATGCCCATACAAGGTGCTCCGATTACTAAATGAAAAAACTGGAGAAGAGCGGGTTGTAAACTTGA GAGATGAGTGGTCTTACAGTGTAATTGCACCTGGGGATACTGTGAACATAATCGGTCAATTTGATGAAGGCGGAAATTGT GATATTGATCATGATAATAATTTTTTGATTGTACACCCAGATACTTTAGTGTCTGGCACACGGGTTGCTGCCAGTTTTAG TTGCCCAAGGAGAACTGTCTTAGATGAGAGGCTAAAATCCAATGATTACTCAACTGCAGCATTAACTGGAACCTTACTTC ACCAAATTTTTCAGGCTGCGCTTACAAACGATAGTCCTACAATAAACTTTTTAGAAGATTACACAAAAGTGGTTGTGCAG AGAAATATTGAAAGTTTGTATGCATGTGGAGTAAATGAAAAAGATGTTCACAAGACCTTGGTTGGTTCTATCCCAAGAAT ATTAAGTTGGATCAAGCGGTTCAAAAATATGGAGGAAAACAAAGACCCTAATGTAAATTTTCGATGTGACGAGGGGCTGA AGCAAGTTGTCATATCTGAGGTAATAGATATTGAAGAAATGTCATGGGCTCCAAAATATGGTTTGAAAGGGATGATTGAT GCTTCGGTCAGAGTAAAAGTTCAATCAAGAAAAGATGAACAAGAGGAGAAGATCATGCCAGTGGAGTTCAAAACCGGAAA ATCACCAAATAGTCAGTCATCAGTAGAACATAGTGCCCAAGTAATTTTGTACACTCTCCTGATGTCTGAAAGGTACCAGA AGACTATTGATTCTGGTCTTTTATATTATCTCCAATCAGACCAGACACAGGGTATTATGGTTCAAAGATCTGACTTAGTT GGACTAATAATGAGACGTAATGAGCTAGCAAGTGATATTCTTAAGGCATTAACTTCGCAACAACTGCCACCAATGTTGCA GAGTCTTGGCATTTGCAGAGGTTGTCGCCATCTTAATGTCTGCAGCATTTATCATAAGGCCCATGGTGGAAGCACAGAGA GCAGTGGATTGGGAGATGTGTTTGATTCTCATAGTAATCACCTGACATCATCTCATTCTAAGTTCCTCTGCCATTGGGAT CGGTTGATTGACTTAGAAGCTAAAGGGACTGAGCTCTCAAAGAAAGAGGTGTGGCGATCACATAGTTTAAAGACTCGAAA CAGTGGTGGCCTTTCTTCTATTGTTCTTGATGCTTCACAAGGAATACCTCATCAGAAATCTCTTAAAGATAATTGTTTCG TCTATCGTTTTGTACAAGATACTTCTTGCCTCTCTGATGTTTCTGATGGTGATCCTTCTAGTGCTGCTTTGAAAAGTGAT TTAGATCTCACACTTAAAAGTGGAGACCATGTGATATTAAGCAATGAATCTAGCCATCAAACTATTGCAAAAGGGGTGAT CTCAGATATTAGTCAGATCCACGTATCAGTTTCTTTTACTAAGTGCTTGCGAATTCCTGGGAGGCCTTCCACCACACATG ATCTCCTTCAACAAGTTTGGAGAATTGACAAGGATGAATTTGTGACCTCATTTGCAATTATGAGGTTTAATCTCGTACAA CTTTTTCTTCAAAATGATCAAAGTGCTCATCTCCGGAGGATGATTGTTGACCTTGAGGCTCCTAGATTTGACAGTGGATC TATAGTTAGCCAGGATCCAGCAATATCCTATGTTTGGTCAGAGAAGAGTTTGAATGATGATCAACGTAGAGCCATTCTCA AGATACTTACGGCAAAAGACTATGCCCTTATATTAGGGATGCCGGGAACAGGGAAGACATCCACCATGGTCCATGCTGTG AAAGCCTTGTTGATTAGAGGCACATCCATTTTGCTAACAGCCTATACAAATTCTGCTGTTGATAATTTACTCATCAAATT AAAAGCACAGGGCATTGATTTTGTACGTATTGGAAGGCATGAGGCCGTGAATGAAGAGGTCAGAGGTCACTGCCTCTCAG TAACGAATGTACAAAGTGTTGAAGATATTAAAATAAGGTTAGAACAAGTCAAAGTTGTTGCAGTTACTTGTCTGGGCATC TCCAGTCCCTTGCTTACTAACATGAGATTCGATGTATGCATTATGGATGAAGCTGGACAGACAACTTTACCGGTGTCCTT GGGCCCTCTAACATTTGCTTCGACGTTTGTTCTTGTTGGGGATCATTATCAACTTCCACCACTTGTCCAAAGTACAGAAG CCCGAGAGAATGGCATGGGGATGAGTTTATTTTGTAGGCTCTCAGAAGCACATCCACAGGCAATTTCAGCTTTACAGAGT CAGTACCGTATGTGTCAGGGAATTATGGACCTTTCAAATGCCTTGATATATGGTGACAGATTAAGGTGTGGTTCATCTGA GATAGCTGATGCAAAACTTGAGTTTACTGGTTTCAAATGTGGTGTGCCTTGGCTAGAGAATGTTTTGAATCCAGGAAGGC CCGTGATATTTATTGATACTGACATGTTGCCTGCTTTGGAGGCAAGAGATCAGAAGGTTGTGAATAACCCAATTGAAGCT TTCATAATTGCTGAGATTGCAAAGGAATTGGTAAAAAATGGAATTGAAGGAGAACACATTGGCATTATTACTCCTTATAA TTCACAGGCAAACCTCATCCGGCATGCTGCTTGCATAACATCCTTGGAGATACATACCATTGACAAATACCAGGGAAGAG ATAAGGACTGTATATTAGTTTCTTTTGTGAGGTCTAGTGAAAACCCAACAAGCTATGCTGCTTCTCTTCTTGGAGACTGG CACAGGATAAACGTGGCTCTTACGCGTGCTAAGAGAAAGTTGATAATGGTGGGGTCTCGTAGAACTCTATTGAAGGTTCC TCTACTGAAGCTTCTCATTAAGAAGGTTGAGGAGCAATCTGGAATTGTATGTGTGTCTAAGACGGATATCTATCGAAAAT GTGAGCTCAAGAGATGTTCGCAAATGAGATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0604000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPPRKKPNNASSSSSSSSATSSKKPLPQPSKYGIQHFFDRHTQLTSQKQQQQATTNVTSAGEVLSSSQNTPPANPPLPPP PANTAVETPSLSEVSPEISKSVSRNKRVKFSPGMFIKPSQDDGADEVTWKISPVNERLQAVSKQMPEIIKALAESSRINL SPIHGCSEDETFRDKDGRVEKLLTNTSIPNGSAKPLVPMSKLGPQRINPGRDVEFSVNSTAVSSSGVSGDESPFRTPPSL SFRQDKVQLAKGVEHSGPSDQLFLRQHKKALLELLDQVEDAITVDNDAICNKTTYSFKSQDEIANDPARANHAVERTKSH KPKEATSVLSNSSYLALEVSEKHRPANSSSAQCPYKVLRLLNEKTGEERVVNLRDEWSYSVIAPGDTVNIIGQFDEGGNC DIDHDNNFLIVHPDTLVSGTRVAASFSCPRRTVLDERLKSNDYSTAALTGTLLHQIFQAALTNDSPTINFLEDYTKVVVQ RNIESLYACGVNEKDVHKTLVGSIPRILSWIKRFKNMEENKDPNVNFRCDEGLKQVVISEVIDIEEMSWAPKYGLKGMID ASVRVKVQSRKDEQEEKIMPVEFKTGKSPNSQSSVEHSAQVILYTLLMSERYQKTIDSGLLYYLQSDQTQGIMVQRSDLV GLIMRRNELASDILKALTSQQLPPMLQSLGICRGCRHLNVCSIYHKAHGGSTESSGLGDVFDSHSNHLTSSHSKFLCHWD RLIDLEAKGTELSKKEVWRSHSLKTRNSGGLSSIVLDASQGIPHQKSLKDNCFVYRFVQDTSCLSDVSDGDPSSAALKSD LDLTLKSGDHVILSNESSHQTIAKGVISDISQIHVSVSFTKCLRIPGRPSTTHDLLQQVWRIDKDEFVTSFAIMRFNLVQ LFLQNDQSAHLRRMIVDLEAPRFDSGSIVSQDPAISYVWSEKSLNDDQRRAILKILTAKDYALILGMPGTGKTSTMVHAV KALLIRGTSILLTAYTNSAVDNLLIKLKAQGIDFVRIGRHEAVNEEVRGHCLSVTNVQSVEDIKIRLEQVKVVAVTCLGI SSPLLTNMRFDVCIMDEAGQTTLPVSLGPLTFASTFVLVGDHYQLPPLVQSTEARENGMGMSLFCRLSEAHPQAISALQS QYRMCQGIMDLSNALIYGDRLRCGSSEIADAKLEFTGFKCGVPWLENVLNPGRPVIFIDTDMLPALEARDQKVVNNPIEA FIIAEIAKELVKNGIEGEHIGIITPYNSQANLIRHAACITSLEIHTIDKYQGRDKDCILVSFVRSSENPTSYAASLLGDW HRINVALTRAKRKLIMVGSRRTLLKVPLLKLLIKKVEEQSGIVCVSKTDIYRKCELKRCSQMR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 105 | 105 | - | – | |
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 15 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 7 | 28 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 39 | 70 | 32 | - | – | |
| MobiDBLite | 71 | 85 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 86 | 101 | 16 | - | – | |
| PANTHER | 352 | 1321 | 970 | 1.4E-163 | – | |
| PANTHER | 352 | 1321 | 970 | 1.4E-163 | ||
| Pfam | 363 | 565 | 203 | 1.4E-60 | ||
| Pfam | 573 | 682 | 110 | 4.6E-6 | ||
| Gene3D | 863 | 1121 | 259 | 7.9E-60 | – | |
| SUPERFAMILY | 923 | 1308 | 386 | 2.57E-58 | ||
| CDD | 923 | 1123 | 201 | 1.18638E-101 | – | |
| Pfam | 924 | 1013 | 90 | 7.8E-15 | ||
| Pfam | 1026 | 1091 | 66 | 1.1E-16 | ||
| Pfam | 1100 | 1300 | 201 | 2.8E-49 | ||
| Gene3D | 1122 | 1329 | 208 | 2.6E-51 | – | |
| CDD | 1124 | 1302 | 179 | 4.07777E-49 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | 5'-flap endonuclease activity | Catalysis of the cleavage of a 5' flap structure in DNA, but not other DNA structures; processes the 5' ends of Okazaki fragments in lagging strand DNA synthesis. | ||
| Molecular function | Single-stranded DNA-dependent ATP-dependent DNA helicase activity | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate, in the presence of single-stranded DNA; drives the unwinding of a DNA helix. | ||
| Biological process | DNA replication, Okazaki fragment processing | The DNA metabolic process, occurring during lagging strand synthesis, by which RNA primers are removed from Okazaki fragments, the resulting gaps filled by DNA polymerization, and the ends ligated to form a continuous strand. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0604000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…