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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0604000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0604000.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA replication helicase dna2, putative; TAIR: AT1G08840.2 DNA replication helicase; Swiss-Prot: sp|Q8QHA5|DNA2_XENLA DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2; TrEMBL-Plants: tr|K7KYE7|K7KYE7_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0604000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:114863171..114873714) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGAAGAGGGTTTGAGAGGCAGAGGTTGGCTAGTCATTTGGTTGTAATTAAAATTATTGAGATTTCTGCTATTGAATACGT AGGAGTTGTATTCTTTCTTTCTCAGTTCATCTTGGAGCTGTGTTCAGTGAATACCATAATCTTACTGTTTGTCAGTCAGT CCAATTCTTTGTCACTTTGTTATACCAGTTCAATCAAATATGTTCATAAATGCATGCTACCTTGTCCTTGATGTTGTGCA ATTCACATAAAATGAGCATAATTTATACTTTTAGAGGCATCTGTGTTTAATGTAGGTAATAGATATTGAAGAAATGTCAT GGGCTCCAAAATATGGTTTGAAAGGGATGATTGATGCTTCGGTCAGAGTAAAAGTTCAATCAAGAAAAGATGAACAAGAG GAGAAGATCATGCCAGTGGAGTTCAAAACCGGAAAATCACCAAATAGTCAGGCAAGGTTCTGGTCTTCAATTCTAATGAG CCTATAAAAACTAAATAGTTAGATCAGATAGATACTCCAATGAATAAGATTCAAACATTGTGTAAGATTATTTGAATTAT TGATGATATTCTGCACTTATACCTGTTGAATGTCATGTCTGCAGTCATCAGTAGAACATAGTGCCCAAGTAATTTTGTAC ACTCTCCTGATGTCTGAAAGGTGCGAACTTTTCACTTCTAAAAGCATATATATTGAAGTTTTTTTTTTTCTGGAAGGTTT CTTTTATTTATTTTATCTTGATTGTGTTAATAGGTACCAGAAGACTATTGATTCTGGTCTTTTATATTATCTCCAATCAG ACCAGACACAGGTAAGATTGTGATGCTTTAAATATCGGTTTCTTTCTGCTGTGAAGAGAAGATAATATTGTTTTATTTGT TATGTACAAAGGGTATTATGGTTCAAAGATCTGACTTAGTTGGACTAATAATGAGACGTAATGAGCTAGCAAGTGATATT CTTAAGGCATTAACTTCGCAACAACTGCCACCAATGTTGCAGGTAATGTCTTTTCCATAATGCTACATAATGTACTTTTG ACAACTTCATATGACTATCATCACAAGCCTTTGTTTCTGATTGTAGAGTCTTGGCATTTGCAGAGGTTGTCGCCATCTTA ATGTCTGCAGCATTTATCATAAGGTACTATTTTACTTTTGGAAATGTAGAGAAATTACAAATAAGGGCCATATCTGCTTA TTGTTTTAAATTTCAAAATAATAATGATCTACTTGGACATGTTCTAAAATCTAAATGCATAGGAACACAGGTTAATAAGA ACAAAAATTATAGTCAACTTTCTGTCTAAATAAAACATTTCAGTAATTGCACTTTTACTTCTAAAGTTTAAGAAACCAAA CTTCAAAATTGTAGTATTTTAGCGAATTAAACTATTTATTAATGTCTTGTGCTGCTTTGTTTCCCTTCCATATCATGACT TAGGAAATAATATTTCTGTAGTCTAGTGTAATGTTAAAAACTGTTTCACACTATGTTATTAAAAATCTGAAATAATGTCT TTATAGAGATTGTCTGAATGTTATTGCTTAATTTGAGTAAAAACCTACTCTAGGTATATGTATTCATATTTTGAGGCACT TTACAAAATTCTTTAGGCCCATGGTGGAAGCACAGAGAGCAGTGGATTGGGAGATGTGTTTGATTCTCATAGTAATCACC TGACATCATCTCATTCTAAGTTCCTCTGCCATTGGGATCGGTTGATTGACTTAGAAGCTAAAGGGACTGAGGTGCAGCTT TTGAAATCCCTCTATTTTACTTTTTGTCTTAAATATTTGTAATTAATCTGTCATCCTATAAAATACTTTCCTCTTGTTTT TAAAATGTCTCTTTCCCCAACTGTTTCAGCTCTCAAAGAAAGAGGTGTGGCGATCACATAGTTTAAAGACTCGAAACAGT GGTGGCCTTTCTTCTATTGTTCTTGATGCTTCACAAGGAATACCTCATCAGAAATCTCTTAAAGATAATTGTTTCGTCTA TCGTTTTGTACAAGATACTTCTTGCCTCTCTGATGTTTCTGATGGTGATCCTTCTAGTGCTGCTTTGAAAAGTGATTTAG ATCTCACACTTAAAAGTGGAGACCATGTGGTATGGATAATTTCCTTTTACTCTTTTTCATTCAAGTGACTTTAGTTGTGA TGTAGACATATTTTGATTAATTTTGGGAATGAGTTATTGAGTGACCATTCCCTAAAAGTTCTATAGAAGCAATGCTAATA ATGACATAGATGACGAAAGGAAGCAAGCTAAAAATCAGCAGAAAGAGTATGGCGGCGGATGGCATTGCAGCCTTTGGCAG CTATACGCCTATACCAAAATATAAGTATATAACATATGCAAATTGCAAAATGTAAAAATACTAAAGAGAAAAAATAGTGG AGAACCATTAAACAAAGAGGGAAAAGTCACATAAGAGTATGTACTATGTACTCCCTCCGGTCCTATTTATAAGCAACAAA AAAAAAATTCACATAGTTTAAGAAATGTAGTTAAACTAGATAAAATGCATTAAATTTGTCTTAAATTAAAATGAACTTCC AAAATTACCCTTTGTTATTAGTGTTGGAAAGTGGAAAAGAGAGAATAATTAATGAGACACATTTTACAAGTTAGAATTAA TAAGGGCATCATTGGAAAAAATTAATTAATATAGCTCAAACTTTCATTTGGTTCTTATAAAAAGGACCAAGATTTTTCTT CTCTTTCATGCTTATAAATAGGACCGGAGGGAGTAATATGTATTATATGGTTAAGCTATGCGCACAATGCATAGTTCAAC TGTTCACATTAAGCTATGGACCATCCTGATTCAACTGTTCGGACCAGCTGGACCAGTCCGGTTTTGACAGCTATGTGCAC GATACAAACCTAGCCAGTAGTTTCTGAGGACCTTCTATGTATCGAGACTATATCGGATTTCATTTGTGCAATTGGAGATC CAGTCCTAATCAAGGAAGATGTTATTTTCGAAGTATTGACACTTGAATGAGTCTTTGGTTAATATGGTGAAAATTGATGA AATTAAATCCTTACTTTTGGCTTAAGAAGTATGAATTGGAAAGAATCGAAAGGTTGTAACAGAAGCTGTTACTAACTCCC TGAAAGTAATCATAACCAAAACTAACAACAAAATATCAATAACAGGATTACAGCAAGCATAACAAAATTACAATAAGCAA CAACACAGTCTAATACTCCGCAATGTTGGTATTTAGCAACCTTGACTAGCGGTACACCTATGGTTCCATGTATGAAGCTC AACATCTCAAGAGTTATAGGTAGTTGGAATGCTGAACTAACTTGTTGACTATGTGATGCATCGAAGTATCTTTTTCCTAG TGAGTTTAGATAGTTAATTCTTGGCATTGCCTTGAGATTCTTTAATGTGGTTTTATGTTAAATATCTTTGTATGTTCCTC AGAGGAAATTGATCTATTGGAAACACATGAAATAGCTGCCTTTGCTTAAAGGATTGCTATATGCATCTTGCTTCATCATT GATTCATACTTGATTTTAAATTAGGTTATTTTTCTTTTAATTTTCTTTTTAGATATTAAGCAATGAATCTAGCCATCAAA CTATTGCAAAAGGGGTGATCTCAGATATTAGTCAGATCCACGTATCAGTAAGTATTGTCATTATTGCTCCTCTTCTATTT GATCTTTACTGCTTTTTGCCTGAAGTTAGTATTTTAATTCCTATGATAAATTTTAGAAGTACGCGGGTACGGCTCCTCTA AAGTGAGTTACATGGTAAAGTAAGCATCCCAACCATTGATTGAGTTATTTTATTTACTTTTCAAAGCAGGTAATCACTGT TAATGGTTGTGATGCTTACTTAACCATGTAAAGTGAGTCCACTCACTTGACTCACTTTAGAGGAGCTAAATCCGAAGTAC GCATAGCCATATACAAGGTAGCCTAATCCTTGGTTGGCAGTTTTGTCTTGCTCAGTTGATAGTTTCACATAATTACTTTT AAAATTTCTTTAGGTTTCTTTTACTAAGTGCTTGCGAATTCCTGGGAGGCCTTCCACCACACATGATCTCCTTCAACAAG TTTGGAGAATTGACAAGGATGAATTTGTGACCTCATTTGCAATTATGAGGTGCTTCTCTACTGCTTTGTTCAAACTTCTG ATTTTCCTGGAGTCGGCTAGTGTGGAAATGGATTTAATTCTTGTTATTTTTTAATATTTTTTTCTGAAGGTTTAATCTCG TACAACTTTTTCTTCAAAATGATCAAAGTGCTCATCTCCGGAGGATGATTGTTGACCTTGAGGTGAATCACTTGCTAATT CTGCATACCTTCCCCTATCCCAAAATGGTATATTTACTAACTACTTGCTCCTTTTCTCTGTCTACCGGATGGCGTGCTGG CTCTAGGCTCCTAGATTTGACAGTGGATCTATAGTTAGCCAGGATCCAGCAATATCCTATGTTTGGTCAGAGAAGAGTTT GAATGATGATCAACGTAGAGCCATTCTCAAGGTTTGCAATGAATCTGGAATTTAATGCTTCCCTAAATTTAATTTTCAAG TTCCTTTTGTTTATCATTAGATTAATTTGTCATTCTGCTTTGTTACTTATGGTCAGATACTTACGGCAAAAGACTATGCC CTTATATTAGGGATGCCGGGAACAGGGAAGACATCCACCATGGTCCATGCTGTGAAAGCCTTGTTGATTAGAGGCACATC CATTTTGCTAACAGCCTATACAAATTCTGCTGTTGATAATTTACTCATCAAATTAAAAGCACAGGTACCCATGCTTGCAT 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TTACTAAGTAAAAATATATACAGTACCGTATGTGTCAGGGAATTATGGACCTTTCAAATGCCTTGATATATGGTGACAGA TTAAGGTGTGGTTCATCTGAGATAGCTGATGCAAAACTTGAGTTTACTGGTTTCAAATGTGGTGTGCCTTGGCTAGAGAA TGTGAGGCTATTCTTCTCTTCCGAATTCTCATTATCTTATATTTGAAGGATTTGCATGTATTGCTGAATTTGATCTATTT AAAGGAGCTTCTTCTGATTGGATCATTGATGATGGAAGTAATTTTTATTTTGTTTTTTGGTAGAACTTTTCTCAAAGCTT ATTTTACTATATTTTCAATGCCACTTTGTTAGATCGTTTTCCTCATATTCTTCTTTAGTCAACTATTTTTGGATGTGCAT TGGATACTGCGTGTTAAATTTCAATGACCAAGCCAGTAAAACATGCCCCCCCCCCCCCCTCCAATACTCAAGTTGGGTGA AATAATGAAAATAAAATAAATGAATCACTTAAATTTGTGGCACATTTCAAAGATCTGTGTGAGGATAATGCCTTCGAATG TTAGTATACTGATCCTGGGTTGGGATGTGAGAACTCAGAAGCACAATAGTGATAAGACAGGTCATGGAGAATGGTATTAT GTTGAAGTTGCTGGTTGCTACTTCAGGAAGGAAGGATTGTGATTATTGTTTGATACAAATGACTAAAAAATCCTAATTAA ATAAAACACTATAATGGCAATAGCTTGACTCCTAATCGTAATTTAAAAGGAAACAAATGATGAAATATAAAGAAATATCA AAACCAATCTAAGATAGTATACAATCCAAATATTATGAGATATTTTTCATATATTCCAACACTAACATAGGTATACTTGT AACTGGATGCAGATATTTTGTTTGGTTTTTTGTGTTATACCACTGGATGCAGAAGGTTGTATAAAGTAGTTTGCATTTTG TTAGACTATAGGTAGAGAACTAATGCTGAATAAAATCACATCTCCTGTTGAATTGAATCTTTTTTCTGTTTCTATGAACA CATGCAGGTTTTGAATCCAGGAAGGCCCGTGATATTTATTGATACTGGTTTGTAAATATCACTTTTTTTTTCCTTTATAC TAAAGGTCTTTTGAATGGGATTGCTTATATACTTATTTATTTCTCTCTTTAGACATGTTGCCTGCTTTGGAGGCAAGAGA TCAGAAGGTTGTGAATAACCCAATTGAAGCTTTCATAATTGCTGAGGTATGTCAAGAGGACTAAATTATGGTGATTTAAA AAAATTGTGGACCCAAACCAGTAAACAAATGTGGGACCAAAACTATTTTTTTCTTATATTATAGGGATAAAAATAATTAA GCCAAAATCAATCCTCAGAGTTGGTCCAAAAATCTTCCTCTTGACTGATTGATGGTTTGTTTAACCGAATAAAGGTAATA TTAGCTATATTATATTGTTTAGCTTAATATAAACTAGTAATTATTTATATCAAGCTAGCCGATATATTTTCTAGGTGAAA TTAATTCACATAATATAATCAATATTTAACCATTGATAGACTTCTTTTTTTTTATTTTTGACTGGGTATCCCCATAGGCT ATGTTATGGGACTAACCCTCTGGTTCACATTCCGACCAAATACTTTATGGTAACAGAGATTTTGTTTAACTCATTTTATT TTGGGTAATGAACTTGAGTGTTTTTGTATCGAAGTGATCCTACTTGATAAATATGCTTGTGGCAATCTGTTAATGGAAAC AGTTTGGCATGCAAACCTCAAAAGTTGAACAATTTTGTGGTTTGAGTTTGTACTTTTCCCTTTTCTAATTATTAATTAAT GATTCATGCTGTTTGACCATCACAAGTTCGTTAACCAATTTTCCATTGATTTTATAATGCAGATTGCAAAGGAATTGGTA AAAAATGGAATTGAAGGAGAACACATTGGCATTATTACTCCTTATAATTCACAGGCAAACCTCATCCGGCATGCTGCTTG CATAACATCCTTGGAGATACATACCATTGACAAATACCAGGTGAGGCTGAAGCAAATATGTAGAATTATGTTCAAACAAT TAGGCCTGCATTACAAAAAATTAGTCCTCTTATCCAAACGCATTGTGTTTAGCATTTCACTAACATGTAATGCATGCATT TCACTAACATGTAATGCATAACTTAGTGTTTCTGTCTTGTGATTTTAAACATGATCACATTGATAATGGTCCTCACAAAC CGGTCATCTGATTGTACAGGGAAGAGATAAGGACTGTATATTAGTTTCTTTTGTGAGGTCTAGTGAAAACCCAACAAGCT ATGCTGCTTCTCTTCTTGGAGACTGGCACAGGATAAACGTGGCTCTTACGCGTGCTAAGGTACTTCTGTTATGCTCAAAC TTTCTCTCTCAGACAAATTTTCAACACACTTGATAATAAATAGGCTTAATTGCAACTTTGGTCCCTGACATTTACAAAAG CCACGATTTTGGTCCCTCACCTAATTTAATTACAAAAATCGCCCCTCACCTAACACTTCGTGAACAACGTTGGTCCAACC GTCAATTTTTTAACGGAAGAAGCTTACGTGGCGTCTGAAAGCTTATGTGGAAGTGCCACTGGCGTCAGAATCGATTTTTT CTCTCCTCTCGGCTGTTTTTTTTATCTCATAGTGAAGCTTTGCTGTTGGGAGGCCTAGTTGTTGGAACGCTGGGATTGAG GTTGTGTCCTATTCCTCTGAGTTTTTTTGTTGTTTTTTCCTCTGAGATGTAGAGGCATGTGCCTCCCTCTCTCCAGTGGC ACTTCCACCTAAGTTTTCAAACACCACATAAGCTTCTTCCGTTAAAAAATTGACGGTGGGACCAACTTTGTTCACAGAGT GTTAGGTGAGGGATGATTTTTGTAATTAAATTAGGTGAGGGACCAAAATCGTGGCTTTTATAAATGTCAGGGACCAAAGA TGCAATTAAGCCTAATAAATAAGCTTTACTTATCATCATGCTAAGGCTATCCTTGTACTCTTATCTGGCAGATAACTAAT GAGTAAATTTAAATCGATAATTATTGGGTTAATAACCCTAGTGCTATTCTTTGGTTGTATTACATTTTTATCATTATAAA CCAAGTACTAAATAACGATTTTATTAATTTAAAAAAAATAACGATTTTATTTATTAAAGTAAATACATTTTAACCTCTTC AAGAAAGAGTGAAACTTTAATTACATGCTATAGCCAAAAGGAAAAACAGAATGAAAGCTTTCCTCAAATCAGAACCTCCA ATTTTTAAGTGAGGAATCTGATCCTTTTGCTGCTAGCGTTAATTTTCTAGTTTTTCTGTAACATTCACCACCCCTATCAG TTATTTCCTTTCTCAAATATTTCAATGCCTGTTGTAAAGATGTTTAAATTTTGAAGACCTGTCTCTTATTATGATTTATG GTTACAGAGAAAGTTGATAATGGTGGGGTCTCGTAGAACTCTATTGAAGGTTCCTCTACTGAAGCTTCTCATTAAGAAGG TTGAGGAGCAATCTGGAATTGTATGTGTGTCTAAGACGGATATCTATCGAAAATGTGAGCTCAAGAGATGTTCGCAAATG AGATGAGTGAAAATTCCTTCCCCCTATTTTTTGATGGGTTGTGTAATTGTTATATCATTGTCCAAGTATATGTAACGAGT GTATTCTATTATTGATTACTCATTCAATAAAGTAAAGGTAACTGGTAAAATTTGTAAATACATGTTAGGTTAATTATCAA ATTAGTCCTTATATTTGCATGAGAATCCGTGTTTAATCCTTCTCGGAAAAAAGTTTGATTCATA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0604000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTGAAAGGTACCAGAAGACTATTGATTCTGGTCTTTTATATTATCTCCAATCAGACCAGACACAGGGTATTATGGT TCAAAGATCTGACTTAGTTGGACTAATAATGAGACGTAATGAGCTAGCAAGTGATATTCTTAAGGCATTAACTTCGCAAC AACTGCCACCAATGTTGCAGAGTCTTGGCATTTGCAGAGGTTGTCGCCATCTTAATGTCTGCAGCATTTATCATAAGGCC CATGGTGGAAGCACAGAGAGCAGTGGATTGGGAGATGTGTTTGATTCTCATAGTAATCACCTGACATCATCTCATTCTAA GTTCCTCTGCCATTGGGATCGGTTGATTGACTTAGAAGCTAAAGGGACTGAGCTCTCAAAGAAAGAGGTGTGGCGATCAC ATAGTTTAAAGACTCGAAACAGTGGTGGCCTTTCTTCTATTGTTCTTGATGCTTCACAAGGAATACCTCATCAGAAATCT CTTAAAGATAATTGTTTCGTCTATCGTTTTGTACAAGATACTTCTTGCCTCTCTGATGTTTCTGATGGTGATCCTTCTAG TGCTGCTTTGAAAAGTGATTTAGATCTCACACTTAAAAGTGGAGACCATGTGATATTAAGCAATGAATCTAGCCATCAAA CTATTGCAAAAGGGGTGATCTCAGATATTAGTCAGATCCACGTATCAGTTTCTTTTACTAAGTGCTTGCGAATTCCTGGG AGGCCTTCCACCACACATGATCTCCTTCAACAAGTTTGGAGAATTGACAAGGATGAATTTGTGACCTCATTTGCAATTAT GAGGTTTAATCTCGTACAACTTTTTCTTCAAAATGATCAAAGTGCTCATCTCCGGAGGATGATTGTTGACCTTGAGGCTC CTAGATTTGACAGTGGATCTATAGTTAGCCAGGATCCAGCAATATCCTATGTTTGGTCAGAGAAGAGTTTGAATGATGAT CAACGTAGAGCCATTCTCAAGATACTTACGGCAAAAGACTATGCCCTTATATTAGGGATGCCGGGAACAGGGAAGACATC CACCATGGTCCATGCTGTGAAAGCCTTGTTGATTAGAGGCACATCCATTTTGCTAACAGCCTATACAAATTCTGCTGTTG ATAATTTACTCATCAAATTAAAAGCACAGGGCATTGATTTTGTACGTATTGGAAGGCATGAGGCCGTGAATGAAGAGGTC AGAGGTCACTGCCTCTCAGTAACGAATGTACAAAGTGTTGAAGATATTAAAATAAGGTTAGAACAAGTCAAAGTTGTTGC AGTTACTTGTCTGGGCATCTCCAGTCCCTTGCTTACTAACATGAGATTCGATGTATGCATTATGGATGAAGCTGGACAGA CAACTTTACCGGTGTCCTTGGGCCCTCTAACATTTGCTTCGACGTTTGTTCTTGTTGGGGATCATTATCAACTTCCACCA CTTGTCCAAAGTACAGAAGCCCGAGAGAATGGCATGGGGATGAGTTTATTTTGTAGGCTCTCAGAAGCACATCCACAGGC AATTTCAGCTTTACAGAGTCAGTACCGTATGTGTCAGGGAATTATGGACCTTTCAAATGCCTTGATATATGGTGACAGAT TAAGGTGTGGTTCATCTGAGATAGCTGATGCAAAACTTGAGTTTACTGGTTTCAAATGTGGTGTGCCTTGGCTAGAGAAT GTTTTGAATCCAGGAAGGCCCGTGATATTTATTGATACTGACATGTTGCCTGCTTTGGAGGCAAGAGATCAGAAGGTTGT GAATAACCCAATTGAAGCTTTCATAATTGCTGAGATTGCAAAGGAATTGGTAAAAAATGGAATTGAAGGAGAACACATTG GCATTATTACTCCTTATAATTCACAGGCAAACCTCATCCGGCATGCTGCTTGCATAACATCCTTGGAGATACATACCATT GACAAATACCAGGGAAGAGATAAGGACTGTATATTAGTTTCTTTTGTGAGGTCTAGTGAAAACCCAACAAGCTATGCTGC TTCTCTTCTTGGAGACTGGCACAGGATAAACGTGGCTCTTACGCGTGCTAAGAGAAAGTTGATAATGGTGGGGTCTCGTA GAACTCTATTGAAGGTTCCTCTACTGAAGCTTCTCATTAAGAAGGTTGAGGAGCAATCTGGAATTGTATGTGTGTCTAAG ACGGATATCTATCGAAAATGTGAGCTCAAGAGATGTTCGCAAATGAGATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0604000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSERYQKTIDSGLLYYLQSDQTQGIMVQRSDLVGLIMRRNELASDILKALTSQQLPPMLQSLGICRGCRHLNVCSIYHKA HGGSTESSGLGDVFDSHSNHLTSSHSKFLCHWDRLIDLEAKGTELSKKEVWRSHSLKTRNSGGLSSIVLDASQGIPHQKS LKDNCFVYRFVQDTSCLSDVSDGDPSSAALKSDLDLTLKSGDHVILSNESSHQTIAKGVISDISQIHVSVSFTKCLRIPG RPSTTHDLLQQVWRIDKDEFVTSFAIMRFNLVQLFLQNDQSAHLRRMIVDLEAPRFDSGSIVSQDPAISYVWSEKSLNDD QRRAILKILTAKDYALILGMPGTGKTSTMVHAVKALLIRGTSILLTAYTNSAVDNLLIKLKAQGIDFVRIGRHEAVNEEV RGHCLSVTNVQSVEDIKIRLEQVKVVAVTCLGISSPLLTNMRFDVCIMDEAGQTTLPVSLGPLTFASTFVLVGDHYQLPP LVQSTEARENGMGMSLFCRLSEAHPQAISALQSQYRMCQGIMDLSNALIYGDRLRCGSSEIADAKLEFTGFKCGVPWLEN VLNPGRPVIFIDTDMLPALEARDQKVVNNPIEAFIIAEIAKELVKNGIEGEHIGIITPYNSQANLIRHAACITSLEIHTI DKYQGRDKDCILVSFVRSSENPTSYAASLLGDWHRINVALTRAKRKLIMVGSRRTLLKVPLLKLLIKKVEEQSGIVCVSK TDIYRKCELKRCSQMR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 43 | 714 | 672 | 2.3E-129 | – | |
| PANTHER | 43 | 714 | 672 | 2.3E-129 | ||
| Gene3D | 255 | 514 | 260 | 2.7E-60 | – | |
| CDD | 316 | 516 | 201 | 2.83007E-104 | – | |
| SUPERFAMILY | 316 | 701 | 386 | 6.56E-59 | ||
| Pfam | 317 | 406 | 90 | 3.5E-15 | ||
| Pfam | 419 | 484 | 66 | 5.1E-17 | ||
| Pfam | 493 | 693 | 201 | 1.0E-49 | ||
| Gene3D | 515 | 723 | 209 | 9.3E-52 | – | |
| CDD | 517 | 695 | 179 | 1.86491E-49 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | 5'-flap endonuclease activity | Catalysis of the cleavage of a 5' flap structure in DNA, but not other DNA structures; processes the 5' ends of Okazaki fragments in lagging strand DNA synthesis. | ||
| Molecular function | Single-stranded DNA-dependent ATP-dependent DNA helicase activity | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate, in the presence of single-stranded DNA; drives the unwinding of a DNA helix. | ||
| Biological process | DNA replication, Okazaki fragment processing | The DNA metabolic process, occurring during lagging strand synthesis, by which RNA primers are removed from Okazaki fragments, the resulting gaps filled by DNA polymerization, and the ends ligated to form a continuous strand. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0604000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…