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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0071300 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0071300.1 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | VAC14-like protein; TAIR: AT2G01690.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q9ZU97|VAC14_ARATH Protein VAC14 homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VR25|A0A072VR25_MEDTR VAC14-like protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0071300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:17548365..17560860) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AATTCAACAAATTACGAAGAAACACAATGCGCGCAGTTACTCAGTGCTTAAATATCATTATTGTCATCTTAAAAAAACTC CAAATTTTCATGTAAAATTTCGCAGAAACGGAAACTTTCGAAGAAAATTGAAAAGAAAAGAAAAGAAACTTGACATTTCA GTTGCAGTTTCAATTTTCCTTTTCATTTTCACAGATCTGGTTTCCAATTCCAAAATCCTCACTCAATCAATCGCATTTGC ACAGCACGTCAATCAATCACGCAAATCATGCCCTCCAAAAATCTCGCGAATTCCAATTCTCGATCTCTGAATCAGAAGCT GATATGATATAGTGATATGTTTCGTTTCGAGGAGGAAAAGATCCGGAAGCGCATTTGATCTTTTTTTCTTCCATCGAGTT TGTTTGCATTTCTCCCACAGCCATGGTGGACGCTCTCTCGGTGGTTCCGGCGGCCGTGCTCCGCAACCTCGCCGACAAGC TCTACGAGAAGCGCAAGAATGCTGCTCTCGAGGTTTTTCGATTTTCGTTTTCGTTTTCGTTTTTGTTTGTTAATAATGCA ATTGCAATTTGGTGAATGTTGTTGTGGGTTTTGTGTTGTTGGTTAGGTTGAGGGGATACTGAAGCAGCTTGCTACTGCCG GGGATCATGACAAGATAACTGCTGTGATCAATTTGCTGACTACGGAATACACTTACTCCCCACAAGCAAATCACCGCAAG GTAGCACAATTATTTATTATTATCTGGGTTGATTCAAGTTTGAAGTAATGATTTGAGAATGTTATTTGTTTTTTTTTTGT TTTGAAATTTAATTTAGGGAGGGTTAATAGGCTTAGCTGCTGCTACTGTTGGGTTGACTAATGAAGCTTCTCAGCATCTT GAGGTAAGGGTTTAACCACTAGTTACTGGAATGTAGAATTTTAAGTCTGAATTTCTTTACTTTGATTGGATTGTTTTTGT TTCTGTTTTAAACTTGTGTATGATGGGTTGCAATTTGAACTGTTTACTGTCGTGAGATTATATGCAAAACTAATTCTGAG TGTATCTTAGAAACTTGGTAGTGGTAACTGGGTCTAGTGGAAGCAATCACTTTTTCATGTTGCATTCATTTCTTTATTTA GTTTATGTATCCACTACTTGTTAGTTGTTAGACTCATTGTTCCTATGGCGATATTGCCACAAAAATAGTTCATTTCCAGT TTTGAAGTTGTGTACATTTAGATGCTCAATAATTCATAAGAAGCTATCCTGTGTGAATGTGTAATTCATAAGAAGAAGCT ATTCTGTGTCAAATGTGTAATTCATAAGAAGCTCTGAGGACTTTTTACAATAGTTCTTAACATTCTTCAATAGCATTTCT GTAGCATATGCACAAGGCAATTTGAAAAACCACTGCATTCTGGAACTGCAATTGCAAGCATGTCAGTTCATGGAATAGTA GGTGTAATTTTGCAATTCTTGTTACCAACACTAGACACGCTAATTACTTTTAGATGCTGGCCCTGTTCTGTTTTTTTTAC CTTGGTTGACCTGGTTTTAACATGGCTTGAAATTTCTGGAATCGGAACATTGAAGAACAAAAATGGTGATTTCACCTTAA GGGGTATAAAGCTGAAATATGTGGAATTTTATCAAGCTAGAGTATGTCTAATATTAATAGAAATATCTTCTTATAAGATG TATTTGTCAAAAGCATGTATCACCATTGTAATCATCTTTCACTTTATTATAAACTTAATTTGACAAGGCCTGGCATATGT ATGTGTTTGCATGTCCCTGCTGCAGTGGCGACCTAATCTAATAAATTGAAAAAATCAATAAAGAAACCCAAAACCAAACA CACCGTAAACCCAATTATTTTTTCTTTTAGAATTTTCTGGATTTCATATAGCATATTGACAAAAGGATGAGTTGCTTCTT 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AGGTAGCCGCTATAGCGGCGCTATATCGCGCAGGAACAGAACTGGAGCAGGACGAAGATAAAATGTTTTTGAAAAGTTAC ACAGGTGGAACTCATTGACTGGGTTTTTGGCTTCCCTTTTACGAAAAGAGAAGGCAATTAAAAGAATATATCAGTTGTAT TATAACTTGAATTCTTTTTTGCTTCTATACCCAGAAGAATGTATATACAAATCTTTATCAGCTGTATTATAAATTGAATT CTTCTTTGCATGTGCTGATCCTCATGTTAGCTTTTATCCTTTCTTCATTGCGTATGGTATGGTCAGTCCTCTTTTTAATG TGGTAAGGTATAATTTTATTTGTAAATGACTTCTCTCATGTGCCCAAACTGTGATATAACTTCGCAGCTTCTTGAACCTG GAAGATATATCTGGTTATTCAAAGCATTGTATGGTCTTCTGATGTTGCTTCCTCAGGTATCCACGAATTTATCAATTTCT TTTTATCTTAAGAAAAGCTGTTAAGACATTAATTTCCTACTAATAAGGTGTGTTCAAATGTCCTTTCACATAGGTTACAT ATTTGAATTCTCTCGTATTTTTTCTAAGCATTTAGAAGTGAAATTTTTCTTTGTATTATTCTCTGTTTACTGGGTTTCAT TACTACATTCTTGTATAGCTAATTTTCTTATTTCAATGCAGTTAATCAAACTGCATTAATGTTGTTTAGTAGTTTAGAAT AACAAGTCTTCTATGTGGGTGAAAATGATTTAATCTAGTTGTTGCACAACTAAATACATTTGGATAAAAACAAGGAAAAA TACATACATAAAGGACATTGTGTAATTGTGATCTCTGAAACACTGACACCTGTCTGTAAAGCACTGTCCCGTTGTAGGAC TCCAACATGAGACCTTTTGGTAGTCTCTAAGCAACTTTTTTTTTTCTTTCGGCTTAGACATTTCAAGCCGACACCTCTTG ATGGCTGGATACTCGTGGGACTAATATATTTTTTCAAAGTCAAATAATAATTTTGTTTTTGTATGTTAGATACAATAGAA GATGAGTTGGGAACACTTGATGAGGGTTGTATTCTTCATGTTTATCTAATTTGTCATTTGATAAATCAGAACTTTAGAGT GTATTTTTTTCAATCATGATCAAGAAGGAAGCGAAACCATTAGATATATTACCTGTTTCTTTTTGAGACATAATGCTTAC TCTGTAAAATGAGTTTTACAATTTTTAAGCTCATTGCCGCCTTGCCAGGACAGGGCACGGGATGTTTAATGTTTTCTTTA TAAATATTCGTACTTGTCTGTAAAATGAGCTTTAGAGTGTATTTTTTTCAATCATGATCAAGAAGGAAGCGAAACCATTA GGTATATTACCTGTTTCTTTTTGAGACATAATGCTTACTCTGTAAAACGCGTTTTACGTTTTTTTAAGGTCATTGCCGCC TTGCCAGGACAGGGCACGAGATGTTTAATGTTTTCTTTATAAAAATTCTTACTTGTCTTGATTTTGAGAAGATTAGTATA CACGCAGACACACGTTGTCCCAATGTCCTACTTTTTGGATGTTATTTGTTTCACTATGTCCGTGGCGTGTCATGTCTCGT GTCTGTGTGGTGTCATGTGATGTCTCGTGTCCGTGTCGGAGTTGGTACTTCATAGGTTGAGATTTAGGAGAAAGACATAT CGTAGTAGAGGTTCCGGAAAAAAGACATCTAGTGTTATAATATGGCTAGTTACCACCAGTTCACATAGTTACTAGTTGTT CATGTATGGTTGTTATCTTGTGTTAGTTACCTTATGTTAGTTGGTTATGTGTTCGTTGGCAGGTTGAGGGGGCATGCTCC TCACCAATTCTGACCAAAGTGCACGCATGCCCCTCGCCAGTTTGCAGGGGCATATATCTACATATATATTTACATGTTCC TATAGTTCCTAGTTGTCTATGAATTAGGCTGAGTTTTTTGGACTGTTTAGAGAATAGTTACTCCTCCGCTTTCGCTTTCT ATGAATAAGTGATGTATCTCTTCTTTATATCAATGTAATTCAATATGGTTTGAAACTTTTCCCTCTTCTTGGTAATTGGT GTGGTCCGTTATGTTATTGAATATAGTGGCCGATGTGAGTTCATCTTTATATGTTTTATCCCTTATGTTATTCCTTTTTT TATAGAATTGTTTCTGTCTGGCCAGTAAAAATTGTGATTCTGATATTTTGATAACAGTAACTATTGTTGGATGTATCAAC TTGATCTTTATGCTAGTTACCTTCGACAGATTGATGTGTACCCAAGGCAATTTTTTTTTGGGGGGGTGGGGTGGGGGAGA TGATTGTGTTAATGATCCTTTCTAAGGAAAGTCTTCTTTCATGAATTCATGATATGCTGTTTATATATGGACTTTGCAGC AAAGTGCCGCCTTTAAGATACTAAAAACTCGTTTAAAAGCTGTGCCGTCAAATTCTTTCAATGTTGAGCAATTGAAGAGA ATGCCTTCAGCGGATCCCTACCAATTCAATCATCGGATGCCTGATGGATATTCAACCATTGAGGATGGTGACTCAACTGA AGATGGTGAAAGCTACAATGCAATAAATTTTCCTGCAAGGTTACAACAGTTTCAGCAAATGCAAAACCAGCATCGGATGC ACCATAAAGCACGGACAAAGTCCTGTAATATTTCCAGCTCATTACTAAAGGTTACTGACATCTTCATTCTACGAGTCGAT ATTTTTTGTTTCATTAGTTTATTCATATAATTTATAGAGAATTTTGGAATTGGAGATGAAGAGGGATGTGTTGCATGATT TATAACTTCTCGATGATTATTTTCTTAATTTTGTTATTTTTGCCCTCATTTAAGACATCCTTTTGCTTTGTTCTGTATTC TGATGTCATTATCAAAACTGTATGCAGGAGGCACAAAGAGAGGAAGAGCCAAGGAGACCCCAGTCTATTGACCTAAATGT TCCTCCTTCAAGGTCAAAGAGAGGTCCAGGACAGCCACAATTATAATTCTAATGTAAATTGTAAATCATAGTAGGTTGGA ATGGTAAAATTTCGGTTTTTCTGAATCGCGAAAAATCATGGGGCTTTTCTAGGTTATTCTTTTGACCTTGTAAAACATGA TACCCACCTGGTTCTGTTATTTTTGGTTATGACCATGTGGGCTAGAGTTGATATTTTACCTGGAAAAGTTTCTTTTTGAT TACCTGTTTATACTTACTGCCATGTGATAAAAGGATGTAGTTACTTTGTTGGACAAGGTTTGTGTGAGCGAGAAAGTGAG AAAATAATGGAAAATGTAAAGACAAGACTGAGTGTTTCTGTAATATGAGTAATTCTATGTCTCCAAATGAACATAAGATT GAGGAGGGCTACCAATACACTTGTAAGGATGCACTACAACACACTCACTGTGATTGTTTTTATTTATTTATTTTAGAAGT CAAAATATTTCTGGCTTTTCATAAAAAAATGTGTTGATTTCTTAATAAATCAATCACAATGAGTTTATTGAAGTGCGCCC TCTTAATTATTACAGAATCACTCATATTGCAGAAACACTGTTTTCTCGAATTACATTTTCCTTTTTTTTTTTCTCCCTAA ACCCTAAAAATTTGAAACACGTAGTAGTTGTACCTTGGTTTTGATAGACACTAATGTGTGAACAGATTTCAACGAAACAG CATCATCAGTTTGGTTTTTTAACATCCTGTACTTTAATAGTCTCCCTTAAAGTCAGGTGGATATGTGAATTGAAGACAGG GTTAAAGTTGGGTGGAGTTTCAAGAGTTGGTGTGTTTGGAAATCTCGTAACACTTCAAAGGTCGTAAATGGAATTGCTAC CTTCAGAGAATTTTTC
CDS sequence (LotjaGi2g1v0071300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTGGACGCTCTCTCGGTGGTTCCGGCGGCCGTGCTCCGCAACCTCGCCGACAAGCTCTACGAGAAGCGCAAGAATGC TGCTCTCGAGGTTGAGGGGATACTGAAGCAGCTTGCTACTGCCGGGGATCATGACAAGATAACTGCTGTGATCAATTTGC TGACTACGGAATACACTTACTCCCCACAAGCAAATCACCGCAAGGGAGGGTTAATAGGCTTAGCTGCTGCTACTGTTGGG TTGACTAATGAAGCTTCTCAGCATCTTGAGCAAATTGTGCCTCCTGTACTAAATTCTTTTTCTGATCAAGATAGCAGAGT TCGATATTATGCTTGTGAAGCACTATATAACATAGCTAAGGTTGTGAGAGGAGAGTTTATTATATACTTCAACCAGATCT TTGATGCCTTATGCAAGCTTTCCGCTGACTCAGATGGCAATGTACAAAGTGCTGCTCATCTCTTAGACCGACTCGTGAAG GATATTGTGACTGAAAGTGACCAGTTCAGTATTGAAGAATTTATACCATTGTTGAGGGAGCGCATGAGTGTATTGAATCC ATTTGTTCGCCAGTTTTTGGTAGGATGGATTACTGTGTTGGACAGTGTTCCAGATATTGATATGCTGGGTTTTCTTCCTG ATTTTCTTGACGGTTTGTTTAATATGTTGAGCGATTCAAGTCATGAAATACGTCAACAAGCTGATTCTGCTCTTTCTGAG TTTCTTCAAGAGATTAGGACCTCCCCATCTGTAGATTATGGTCGAATGGCTGAAATACTGGTCCAGAGGGGAGGTTCTCC AGATGAATTTACGAGGTTAACCGCTATCACATGGATAAATGAGTTTGTCAAACTTGCTGGAGACCAGCTTGTTCCATATT ATGCTGACATTCTTGGAGCCATTTTGCCTTGCATATCTGATAAAGAGGAGAAAATTAGAGTGGTTGCCCGTGAAACCAAT GAAGAGTTACGAGCAATCAAGGCTGATCCAGCAGAAGTGTTTGATGCAGGAGCAATCCTATCCATTGCTAGGAGGCAACT ATCTAGTGAATGGGAAGCTACTCAAATTGAAGCATTGCATTGGATATCAACCCTTTTAAGCAGACATCGTACTGAGGTTT TGACATACCTTGATGACATATTTGACACCCTACTCAAAGCACTTTCCGATCCATCTGATGAGGTTGTGCTTTTAGTTCTT GATGTTCATGCGTGCATTGCAAGAGATCCTCAGCACTTCCGTCAGCTTGTTGTTTTCCTAGTGCACAGTTTTCGGCTAGA TAATTCTCTTCTGGAGAAGCGTGGTGCTTTGATAATCCGTCGTCTTTGTGTTCTTTTGAATGCTGAGAGAGTCTACCGGG AACTTTCGATAATACTAGAAGGAGAATCAGATTTGGATTTTGCGTCAATTATGGTTCAGGCTTTGAATTTGATCTTACTT ACATCATTGGAATTATCTGAGATTCGAGATCTTTTGAAGCAATCACTGGTTAATCCTGCTGGGAAGGACTTGTATGTTTC TCTGTATGCCTCTTGGTGTCATTCTCCAATGGCAATTATAAGTCTTTGCTTTTTAGCACAGACTTACAGACATGCAAGTG CTGTGATTCAATCTCTGGTAGAGGAGGATATACATGTCAAGTTTCTGGTCCATCTGGATAAATTGATTCGCTTGATGGAA ACTCCAATATTCGCTTATCTTAGATTACAGCTTCTTGAACCTGGAAGATATATCTGGTTATTCAAAGCATTGTATGGTCT TCTGATGTTGCTTCCTCAGCAAAGTGCCGCCTTTAAGATACTAAAAACTCGTTTAAAAGCTGTGCCGTCAAATTCTTTCA ATGTTGAGCAATTGAAGAGAATGCCTTCAGCGGATCCCTACCAATTCAATCATCGGATGCCTGATGGATATTCAACCATT GAGGATGGTGACTCAACTGAAGATGGTGAAAGCTACAATGCAATAAATTTTCCTGCAAGGTTACAACAGTTTCAGCAAAT GCAAAACCAGCATCGGATGCACCATAAAGCACGGACAAAGTCCTGTAATATTTCCAGCTCATTACTAAAGGAGGCACAAA GAGAGGAAGAGCCAAGGAGACCCCAGTCTATTGACCTAAATGTTCCTCCTTCAAGGTCAAAGAGAGGTCCAGGACAGCCA CAATTATAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0071300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVDALSVVPAAVLRNLADKLYEKRKNAALEVEGILKQLATAGDHDKITAVINLLTTEYTYSPQANHRKGGLIGLAAATVG LTNEASQHLEQIVPPVLNSFSDQDSRVRYYACEALYNIAKVVRGEFIIYFNQIFDALCKLSADSDGNVQSAAHLLDRLVK DIVTESDQFSIEEFIPLLRERMSVLNPFVRQFLVGWITVLDSVPDIDMLGFLPDFLDGLFNMLSDSSHEIRQQADSALSE FLQEIRTSPSVDYGRMAEILVQRGGSPDEFTRLTAITWINEFVKLAGDQLVPYYADILGAILPCISDKEEKIRVVARETN EELRAIKADPAEVFDAGAILSIARRQLSSEWEATQIEALHWISTLLSRHRTEVLTYLDDIFDTLLKALSDPSDEVVLLVL DVHACIARDPQHFRQLVVFLVHSFRLDNSLLEKRGALIIRRLCVLLNAERVYRELSIILEGESDLDFASIMVQALNLILL TSLELSEIRDLLKQSLVNPAGKDLYVSLYASWCHSPMAIISLCFLAQTYRHASAVIQSLVEEDIHVKFLVHLDKLIRLME TPIFAYLRLQLLEPGRYIWLFKALYGLLMLLPQQSAAFKILKTRLKAVPSNSFNVEQLKRMPSADPYQFNHRMPDGYSTI EDGDSTEDGESYNAINFPARLQQFQQMQNQHRMHHKARTKSCNISSSLLKEAQREEEPRRPQSIDLNVPPSRSKRGPGQP QL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 715 | 715 | 0.0 | ||
| PANTHER | 1 | 715 | 715 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 10 | 558 | 549 | 2.84E-61 | ||
| Gene3D | 18 | 155 | 138 | 3.3E-16 | ||
| Pfam | 65 | 161 | 97 | 1.0E-40 | ||
| ProSiteProfiles | 92 | 127 | 36 | 10.461 | ||
| Gene3D | 205 | 331 | 127 | 8.8E-12 | ||
| Gene3D | 332 | 481 | 150 | 5.1E-5 | ||
| Pfam | 429 | 608 | 180 | 2.1E-68 | ||
| MobiDBLite | 625 | 651 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 667 | 722 | 56 | - | – | |
| MobiDBLite | 706 | 722 | 17 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Phosphatidylinositol biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of phosphatidylinositol, any glycophospholipid in which the sn-glycerol 3-phosphate residue is esterified to the 1-hydroxyl group of 1D-myo-inositol. | ||
| Cellular component | PAS complex | A class III phosphatidylinositol 3-kinase complex that contains a phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase subunit (Fab1p in yeast; PIKfyve in mammals), a kinase activator, and a phosphatase, and may also contain additional proteins; it is involved in regulating the synthesis and turnover of phosphatidylinositol 3,5-bisphosphate. In mammals the complex is composed of PIKFYVE, FIG4 and VAC14. In yeast it is composed of Atg18p, Fig4p, Fab1p, Vac14p and Vac7p. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0071300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…