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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0111300 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0111300.3 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Valine--tRNA ligase; TAIR: AT5G16715.1 protein EMBRYO DEFECTIVE 2247; Swiss-Prot: sp|F4KE63|SYVM2_ARATH Valine--tRNA ligase, chloroplastic/mitochondrial 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2SHS3|A0A0B2SHS3_GLYSO Valine--tRNA ligase; Found in the gene: LotjaGi2g1v0111300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:39877264..39918978) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AACCCTTACAAAAATGATCTTTCAAGAGTGCTTGTAAGTCACTGTAAGTTTGCTTGAAAAGTTCAGATTTCTCACCTCAC AAATTTGTTTCTTGCTGTCTTTATTTTCTGCTTATGTGGCTGAGGTGTTTGTCTATCATCTCACCAGAATATACGAATTG GACATCTTTTCAAGTGATGTCTAGAAGCTTGTATTATCTTTTCATTTGAATTGGATTATTTGTGTGTTTGCCTTATTTTC TTATTTTGCTTATGGTTACACCTTGTAAGCATTGTTATTCTGATGATTACTCATTTTTTAGGAGTGACTACTTGACTGTG GCTACAACGCGCCCAGAAACTTTATTTGGTGATGTAGCACTAGCAGTTAATCCACACGTAAGATGAATTTTTTGACTTCT TGTCTTTGTACGGTTGGGCCCAACACAAGCTATTCTATTTTCTGTTCCATATTAATTGAAAGCCGAAATCACTTGACCTA CTCGCACAGTTGTGTAACTGTAGCATAATTGAACATTCACATAGCCATACCCACTATAATGAGTGGATCCAAAAGTGTGG AGATATCCATTAGGACAGTTTGTTGAGATAATTCTTTTAGGATACAGTCGGTTGTGATAGTTCTGTTAGAGGTTATTTTG TAAGGATAAGATTTTATTTTATGATTATTCCTTGTTATCTTAGGGTTCATTTATTGTACACAAAGAAATACTTGTGCAAA GTTACACAAACCTAGGTTGACCTGTTATATCAGGTTACAACAAGTTAAATCATTTTTTTTAAGAATAAATAAATTATTGT AAGAAAATCACATCTCCTTAATCTCTAATCTTTAATATTATCACCTACTTACTTTAACAATAAAATTCAGAAAAGAAAAT GTATTCAATTATTCATCATCAACCCTCTTTTTTTTTATTTGAAATAGAAATTGATGATTAATAGGATGAGATTGATGATT 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GTTCCACCCAGATGTACTGAAGTGCTGTAAATATAGCACATTGCCACCATATGATTCAAATCAATCCTTTGTTTGAAGTT TCGAAGTATACCTTGAGAAATCATCCATAAAGGTTGGATACTGGATGCAGAAATCATTAAGGAAGTTCTAGGAAAGTGTC TCATGTATAAAGACAAAGGTTGGACACATTCTACTGGATGCAGATTGGACACGTTCTACTTTTGACAGGAGATCCACTTC TGAGCACTGCATTTTCATTGGTGATAACTTGATCGCCTCGAAGACCAAGACATGGAATGCATTGGTAAAGTCAAGTGCAA AACTACAATATCGAGCCATGGCATCAGTAGCATGTGAACTTTGATGGCTCTGACAGCTACTTAATTAAATTAGTGTTGAA TGACAAGAAAAGAAACAAGAGGAATTGGTGAATCTGTGTGTTGAACTACACAGCGGAGTTCATTATATATAATAGGTACC ATAAAGGTACAATAAATACAGAATATCTTATTTCTCTAATTACATGATTATTCTACCTATTTACAATTAGTAGAAGATAT CCTACTTATTTACAAGATATCTAACACTCCCCCTCAAGCTGGAGCATATATGTCATATGCACCAAGCTTGTTACAAATAT AATTAACTCGAGGACCTCTCAAAGACTTAGTAAAAACATCAACTAACTGATCATTTGAATTGACGAATCTAGTGCTGATG TCTCCAGATAAAATCTTCTCTCTGATGAAATGGCAATCAATCTCAATGTGTTTAGTCCTCTCATGAAACACTGGGTTTGA GGCAATATGTAAGGCTGCCTGATTGTCACAAATAAGTGTCATCTGTGAGACATCACCAAACCTCAAGTCATGTAGCAACT GTTTGAGCCATACAAGTTCACAAGTAGCTGCAGCCATGGCTCGATATTCAGCCTCTGCAGTTGATCTTGCCACTACACTT TGTTTCTTACTCTTCCAGGAAATTAAGTTATCATCAAGAAAAACACAATACCCAGAGGTTGATCTCCTATCAGAAGGAGA ACCTGCCCAATCTGCATCTGAGTATCCTACAACCTGTGTATGTCCCTTGTCTTCGTACAATAAACCTTTTCCTGGAGCCC CTTTAATATATTTTAGTATGCGAATCACAGCCTCCCAATGCCCTTCACAAGGAGAATTAAGAAATTGACTCACCACACTA GCAGAAAATGAAATGTCTGGACGAGTAATAGTTAGGTAATTCAATTTTCCAACTAATCTCCTATATTTTTCTGGATCCAA GAGTCGCTCCCCCTGAGTTGGCATAGGCTTGGCATTGGGATCCATAGGAGTGTCAACTGGCTTGGCATTTAACAATCCTG TCTCTTCTAAAATATCCATAGCATACTTTCTTTGTGAAATCACAATCCCTTGTTTGGATTGTGCAACCTCTATGCCCAAG AAATAACGAAGTCTGCCAAGGTCTTTTGTCTGGAAGTGATGACAAAGGTGTTGTTTTACTTGTGTGATTCCATGATGATC ATTGCCTGTAATGACAATGTCATCCACATACACAATCAAGTAAATACTCCCAGCAGCCGAGTGACGATAAACAACTGAGT GATCAGCCTCACTTCGTGTCATGCCAAACTGCTGTATAACAGTGCTAAATCTCCCAAACCAGGCCCTAGGAGATTGCTTG AGACCATATAAAGACTTCCGAAGACGACAAACTAGTCCAGAAGACTCCCCCTGAGCAACAAATCCAGGAGGCTGCTCCAT ATAAACCTCTTCAGTGAGATCACCATGTAGGAAAGCATTCTTAATGTCAAGCTGATAAAGGGGCCAATGGCGAATACCTA CCATAGAGAGGAATAATCTGACCGAGGCCATTTTAGCCACGGGAGAAAACGTGTCACCATAATCCAAGCCAAACACTTGT GTATAACCTTTGGCCACCAAACGAGCCTGCATGTGCAAAAGTCTGAAGTGGGTAAAGGCCATTAGACTCACATCCGGTGC CAATCATCCGCCCCGAACTCCGGTCCTGCAAGAAAACAGAATCTTTAGTGAAGGAGACAATACAGTCAAGAGAATGAGTC AAACGACTCAAAGACAATAAGTTAAAAGGAGACCCGGGGACATAAAGGACATGAGACATGGATAGAGATGGAAAAAGACA GACAGTACCAGTACCCTGAGATGGAGTTTGTGAACCATTTGCCATAGTGACAGATTGTAATAAACCAGAAGTAGAGAATG AGGAAAAAAGAGATTTATTACCAGTAATATGATCAGTGGCTCCTGAATCAAGCATCCATGGGCCAAGAGATGTGGAGTGA GATAGACCAGCAAAGGAATTACCCATGTGCGCGACAAAAGCAATGGAACCAGCAACCTGTCGTTCCTCATACCACTTGAT GAAGTCATTGAAGATGGCCGGTGGAGCTGTAGAATTAGGCAGAGATGGAGTAGTAGGTTGAACCGCTTGTGCAATGTTGG CATTTCAAGGAGGGGGGGGGGGGGTTTCAAAGCAAAACATCGATCAATAGTGTGGCCAAGCTTATGACAATGATCACACT TGGGACGAGGCTTGCCCGTCTTCTGGAATCGGCCACGATCATTGCCTTGAGGACGATCACCTCCCTGAGTACGATCACGC CCCTGAGAAACCAAGGCAGATGAATCAACTGGTGTAGGTAGCATCCTCCTTCAGAGGATGATTTGGCTGGGACACGCAGC AAAGTAGACCAAGTAGCATTCAAAGTGGGGATTGTAGGAGAGCCCAATATCTAATCACGAACAGATGAATACTCCGTAGG CAACCCATATAATGCGAGAAGCATGAAAAAAGATTGTCGTTGTTCGATCTCCTTTTCAGATGTGGTAGCTGGAGGTAAAA ACGGCGGAATCTGGAGAGAGCAGGAGAAGGCGAGCATGGCGGAAGAAGCGGCGGTCTGAACGGAGCCGGGACGCGCCGTA TCGCGCGGCTGAGGTGAGCGGCGCGTGGGATTCATGCGCAGAGAGCGGTGGCGCGTGAAGGCGCGTGGAATGCGCATTCA GGTTGAAATCGCCGGGAACAAACAGCACTTCTCCAGGAGATCCTTTTGGGGTGGTTGGAGTCGGTTTCCGTCGGGTGAAG GCGGCGGTAGCGGCTGGACAGCAGCGGTGCGAGCCAAAAAGGGTTGTCGGAATGCGGCACGACAACACTAAGAGCCAGAA ACCGGAGATGCAACACGGTTTCTGGAAAAAAAAATATCCCCGATAGACAGTGGGTCTACCGAAACACGGATTAGGATTAG GGTTGCCTCTTGTTAGGCTCTTGATACCATGTTGAATGACAAGAAAAGAAACAAGAGGAATTGGTGAATCCGTGTGTTGA ACTACACAGCGGAGTTCATTATATATAATAGGTACCATAAAGGTACAATAAATACAGAATATCTTATTTCTCTAATTACA TGATTATTCTACCTATTTTCAATTAGTAGAAGATATCCTACTTATTTACAAGATATCTAACAATTAGGTTTAAAGATATT GCAAAGGTGAACTCATTTGTGACAATTAGGAAGCCCTGCACATTGATTTTTGTAAGTAGGACGCCCTGCACTCATTTTGT GACAATTAGGAAGCCCTGCACATTTAAAGATATTGCTCTGGAAATAATGTAAGTATGTTAATTTTAGACTGATCTTCTGT TGTGTATTATTTATGTATTTATAGTAGAGGGTAACTATTGATTTCTGTATTTATGACATAATTATTCTGTATGTAATTGA GACACGCGGATTCACTCAAGTGCTTGCTCATTCCACTCGTTTGACCAAAACTAAACGTATTCTATACCAGTATTCCTTCA AAATCAGTTACGATGCAAGCTTTTTGAAGTAGTCATTTTTGTTTATCAACAGGCACTCCCTTACCGGAAGCAAGCCCTTA TTGTATCACCTTGGCCAGAGAGTCAACTACCAAGGAACACCAGCTCTATAAGAAAATTTGAAAATTTGCAAGCTTTGGTC CGTTTTTTTTCTTCCTCATTTTAGCTAACACTGCTTTGTTATTTATTTACGGTCATCATAATGATTTTATAGAACCATAG GATCATTTTATCTCATTTTATCTTCTTTTTAGGTTCGAGCTATCCGGAATGCTCGGGCAGAATATTCTGTTGAGCCTGCA AAACGGATATCAGCATCTGTGGTTGCAAGCAATGAAGTTATTGAATATATTGCTGTACGTGTGGTTTAATCCCCATTTCT CAAATTCCCAGTCTTTGGGGAAAAATTGATAGTTCCTATCTTTGAATTGCAATTTTAATTGTCAGTCCAATTTTTAATCT TTGTATCATGCACCTCTTTTTTTAATCTATAAATCCTGTCCCTATGCTTTTGATACTTTGTATTTTCATATAGCTGCTAA CAATATGACCTGCCACATTGGAGTCATGTGATTTCGGTTACTAGGATATACTGTTATGATTTGTCTTGTGGTTTTTCAGG AAGAAAAAGAGGTTTTAGCACTTCTCTCCCGGCTGGATATACCAAATCTGCATTTTTCAAATTCTTCTCCAGGCATGATT TCTACTTAATTTTGTACTATCGGGTTGAAGACTGAATTTTACCCTTTTTTCCCCCCTTGACACTTGTTTATTGGGTCCAA ATGAGTACCGGTCTCTGACTAATTTCTCTGGTGGATGTCATGTAACATACTTCAGGAAATGCAGATCAATCAGTTCATCT CGTGGCTGGTGAAGGGCTTGAGGCATATCTTCCTCTGGCCGATATGGTTGATATTTCTGCAGAAGCTCAACGTCTCTCAA AACGCCTTTCCAAGATGCAGAAGGAGTATGACGCATTGATAGCTAAAATCAGTTCTCCTCAAGTATGAAAAGAAATTTAC TTTATCCACTTGATAAATGTGCACAAACATTTACTTTTTCCATTGTCCATATATGCTGTTAAGTATTAAAATCAGCTTGC AAACCCATTGGAGTTAAATGCACAGACAAATACAGAGCTGATTATTTACATGCATTTTAATCTGTAAGTCCCCCCGAATC CCAATAAAGGTTTATATATATTACGAATAAAATGAGGATAAAGGTTTATATTAGAAATAAAAATGAGGATAGGCATTTAT GGTCCGGAGCAGTCTGTTTCAACATTTAGGGCAACATATATAGGGAGGAAGAGGAACATCAGAAGGATATATTGAGAAGA GAAGCACCGTGGATTGAAAACCTGTAAGTTCAGAGAGTAGAGATTATATACTTGAGTACGCTATTGATACTGTCAGAGGT ATTCATTCTTCAATAGACACATTAAACAGAAGTGGGGGAATGAAATGGGTTTTTCTGATTTTTTAACACTATCTTTAGGA GGGCAATCTAAAATTAAGATTAAACATTCTAATGTAAATTAATATAAACCCATTGAAGTTTTGACTTTGAGTGTTATCTG GTAGCTGTTTTTGAACTCTTGTGGAACTAACTTTTGTGGTTGCCATTCTAGTATTGTTGCGAATATCAAAGATGATATGT CAGCAGAGTCGATTTGGTGAGAGATAAATTCATTTGGCAGATGGCAATTAATATGAATTAAAACTTATATAACTGGGATT AGGGTTATTGCTGTTATAAATGCGGATGCTTCTCTAAAGACTTCCAATCCTTACGTTTAGTTTTAATTAAAATTAAAATT GTAAATTCTTCCCACTCTGATCTTCATTTTATTGTCTCTTTTTATTTTTGTTTTTTAACTTGTCAACATGTCATAATATC TTGTGTTACTTTAGTAATTAGCAAGACGTCTGTTACTGTGAGGTTGTTTATGTTAATATACTCTCTCTTTTAAAAAATTT CTCATTGTTCATTGATTTGTTGAAACTTTTGTGGGTCCCCACTAAATTGGATGTGGGGAAATGTGTCCCCCTATCATTTT TAACCTATCAATGTAAGTGTTAGAAAATGTATTAAATTGAGTGTTGCTAGCATTTTTTAATACTAGAATTGTCTGTGTAG ATCTCTTCTGCAATGTTCATACAAAATTAATCTGTTCCAATTGCCACTGGCTATTACTTTCTGCAGTTTGTGGAGAAGGC CCCAGAAAATGTGGTCCGTGGGGTGCAGGAAAAAGCAGCGGAAGCAGAAGAAAAGATCACTTTAACCAAAAAACGCCTTG AATTCCTGAACTCTAGTGTTCTAGCTTCAAAATAG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0111300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAATTGTGCCTCAGACATTTGGCCGTCATGTTCCTATTATTTATGACAAGCATGTTGATAAAGAGTTTGGAACGGG AGTATTGAAAATTAGTCCAGGACATGATCATAATGACTATCTACTTGCTCGCAAGCTTGGTCTTCCTATACTCAATGTGA TGAACAAGGATGGTACATTAAATGATGTTGCTGGCTTATACAGTGGCCTTGATCGATTTGAGGCTCGAAAGAAACTGTGG GCGGAACTTGAGGAGACAGGGTTAGCTGTGAAAAAGGAACCACACACTTTACGCGTTCCCAGATCTCAGCGTGGTGGAGA AGTGATAGAGCCACTTGTAAGTAAGCAATGGTTTGTAAGTATGGAGCCTCTTGCCGAGAAAGCTCTTCAAGCAGTTGAAA AAGGAGAGCTGACTATAATTCCGGAAAGATTTGAGAAGATTTACAACCATTGGCTTTCCAACATTAAGGATTGGTGTATA AGCAGACAACTATGGTGGGGACACCGGATACCTGTTTGGTACATTGTCGGAAAACGTAATGAAGAAGACTATATAGTTGC TAGGAATGCTGATGAAGCACTTGAGAAAGCTCGCAAGAAATATGGAAAGGATGTAGAAATATATCAGGATCCTGATGTTC TTGACACTTGGTTTTCAAGTGCCTTATGGCCTTTTAGTACACTTGGATGGCCAGATTTAAATGCAGAAGATTTTAAGAGG TTATATCCAACTACAGTGCTTGAAACTGGGCATGACATATTGTTCTTTTGGGTGGCGAGAATGGTGATGATGGGAATCGA GTTCACAGGAACTGTTCCATTTTCTTATGTTTATTTGCATGGACTCATCAGGGATTCACAGGGTAGAAAAATGTCTAAGA CCTTAGGGAATGTAATAGACCCCATTGACACTATCAAAGACTTTGGGACAGATGCTTTACGATTCACACTAGCTTTAGGA ACAGCTGGCCAGGACCTTAATTTGTCCTCTGAGCGCTTAACGTCCAACAAGGCCTTCACAAACAAATTGTGGAACGCTGG CAAATTTATATTACAGAATTTGCCCAATGAGAATGATACATCTGCTTGGGAAAACATATTGTCTCATAAGTTTGATGGTG AAGGCTCTGTACTTAATCTTCCTTTGCCAGAGTGTTGGGTGGTGTCAAAACTTCACTTGCTCATTGATTCTGTCAGTGCA AGCTACGATAAATTTTACTTTGGAGAAGTGGGAAGAGAAACATATGATTTCTTTTGGGCTGATTTTGCTGATTGGTATAT TGAGGCCAGCAAAGTGCGGCTTTATAACTCTGGAACTGGAGGCAGCTCGGATGCTTCAGTGGCACAGGCTGTTTTATTGT ATACTTTTGAGAACGTACTCAAAGTGCTGCATCCTTTCATGCCATTTGTAACTGAGGAACTATGGCAGGCACTCCCTTAC CGGAAGCAAGCCCTTATTGTATCACCTTGGCCAGAGAGTCAACTACCAAGGAACACCAGCTCTATAAGAAAATTTGAAAA TTTGCAAGCTTTGGTTCGAGCTATCCGGAATGCTCGGGCAGAATATTCTGTTGAGCCTGCAAAACGGATATCAGCATCTG TGGTTGCAAGCAATGAAGTTATTGAATATATTGCTGAAGAAAAAGAGGTTTTAGCACTTCTCTCCCGGCTGGATATACCA AATCTGCATTTTTCAAATTCTTCTCCAGGAAATGCAGATCAATCAGTTCATCTCGTGGCTGGTGAAGGGCTTGAGGCATA TCTTCCTCTGGCCGATATGGTTGATATTTCTGCAGAAGCTCAACGTCTCTCAAAACGCCTTTCCAAGATGCAGAAGGAGT ATGACGCATTGATAGCTAAAATCAGTTCTCCTCAATTTGTGGAGAAGGCCCCAGAAAATGTGGTCCGTGGGGTGCAGGAA AAAGCAGCGGAAGCAGAAGAAAAGATCACTTTAACCAAAAAACGCCTTGAATTCCTGAACTCTAGTGTTCTAGCTTCAAA ATAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0111300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAIVPQTFGRHVPIIYDKHVDKEFGTGVLKISPGHDHNDYLLARKLGLPILNVMNKDGTLNDVAGLYSGLDRFEARKKLW AELEETGLAVKKEPHTLRVPRSQRGGEVIEPLVSKQWFVSMEPLAEKALQAVEKGELTIIPERFEKIYNHWLSNIKDWCI SRQLWWGHRIPVWYIVGKRNEEDYIVARNADEALEKARKKYGKDVEIYQDPDVLDTWFSSALWPFSTLGWPDLNAEDFKR LYPTTVLETGHDILFFWVARMVMMGIEFTGTVPFSYVYLHGLIRDSQGRKMSKTLGNVIDPIDTIKDFGTDALRFTLALG TAGQDLNLSSERLTSNKAFTNKLWNAGKFILQNLPNENDTSAWENILSHKFDGEGSVLNLPLPECWVVSKLHLLIDSVSA SYDKFYFGEVGRETYDFFWADFADWYIEASKVRLYNSGTGGSSDASVAQAVLLYTFENVLKVLHPFMPFVTEELWQALPY RKQALIVSPWPESQLPRNTSSIRKFENLQALVRAIRNARAEYSVEPAKRISASVVASNEVIEYIAEEKEVLALLSRLDIP NLHFSNSSPGNADQSVHLVAGEGLEAYLPLADMVDISAEAQRLSKRLSKMQKEYDALIAKISSPQFVEKAPENVVRGVQE KAAEAEEKITLTKKRLEFLNSSVLASK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 661 | 660 | 2.9E-280 | – | |
| PANTHER | 2 | 661 | 660 | 2.9E-280 | – | |
| Gene3D | 4 | 100 | 97 | 3.6E-189 | ||
| TIGRFAM | 7 | 641 | 635 | 5.1E-198 | ||
| SUPERFAMILY | 7 | 100 | 94 | 8.89E-30 | ||
| Pfam | 9 | 329 | 321 | 3.7E-118 | ||
| SUPERFAMILY | 70 | 335 | 266 | 1.82E-75 | – | |
| Gene3D | 102 | 291 | 190 | 3.6E-189 | ||
| PRINTS | 104 | 117 | 14 | 1.4E-22 | ||
| PRINTS | 210 | 231 | 22 | 1.4E-22 | ||
| PRINTS | 242 | 260 | 19 | 1.4E-22 | ||
| Gene3D | 297 | 520 | 224 | 3.6E-189 | – | |
| CDD | 328 | 478 | 151 | 1.27442E-50 | ||
| SUPERFAMILY | 341 | 610 | 270 | 5.61E-50 | ||
| Pfam | 386 | 530 | 145 | 8.5E-38 | ||
| Gene3D | 588 | 659 | 72 | 2.3E-15 | ||
| Coils | 593 | 620 | 28 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 595 | 659 | 65 | 1.83E-12 | ||
| Pfam | 595 | 659 | 65 | 6.3E-15 | ||
| Coils | 635 | 662 | 28 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleotide binding | Interacting selectively and non-covalently with a nucleotide, any compound consisting of a nucleoside that is esterified with (ortho)phosphate or an oligophosphate at any hydroxyl group on the ribose or deoxyribose. | ||
| Molecular function | Aminoacyl-tRNA editing activity | The hydrolysis of an incorrectly aminoacylated tRNA. | ||
| Molecular function | Aminoacyl-tRNA ligase activity | Catalysis of the formation of aminoacyl-tRNA from ATP, amino acid, and tRNA with the release of diphosphate and AMP. | ||
| Molecular function | Valine-tRNA ligase activity | Catalysis of the reaction: L-valine + ATP + tRNA(Val) = L-valyl-tRNA(Val) + AMP + diphosphate + 2 H(+). | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Cellular component | Cytoplasm | All of the contents of a cell excluding the plasma membrane and nucleus, but including other subcellular structures. | ||
| Biological process | TRNA aminoacylation for protein translation | The synthesis of aminoacyl tRNA by the formation of an ester bond between the 3'-hydroxyl group of the most 3' adenosine of the tRNA and the alpha carboxylic acid group of an amino acid, to be used in ribosome-mediated polypeptide synthesis. | ||
| Biological process | Valyl-tRNA aminoacylation | The process of coupling valine to valyl-tRNA, catalyzed by valyl-tRNA synthetase. The valyl-tRNA synthetase is a class-I synthetase. The activated amino acid is transferred to the 2'-OH group of a valine-accetping tRNA. The 2'-O-aminoacyl-tRNA will ultimately migrate to the 3' position via transesterification. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0111300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…