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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0133000 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0133000.3 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ABC transporter family protein; TAIR: AT3G59140.1 multidrug resistance-associated protein 14; Swiss-Prot: sp|Q9LYS2|AB10C_ARATH ABC transporter C family member 10; TrEMBL-Plants: tr|A0A072UJ05|A0A072UJ05_MEDTR ABC transporter family protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0133000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:48182786..48207053) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGGGACCAACTTGAAAGCGATTGACACTTTCAAGGACAAAGTTGGCTATTTACCCAATATAATCTATATAGCAGTAAGTT TCAAGGTATAAGGCACGAGTAATTTTTTCTTTTAGTATTTATCAATTTAATTTAATTTTCCTAAACTCTAAATCCTTTGA AATTTGGGGAGTAGTAAGTGACACCACCTTAGGATTAGCTTACCATTCATCATCAATCACCACAAACACAAACCACTGTT CCGACTTCGGAGAAAACACCACTTCCGAGTGCACCGTTCTCACCGTCGCTTCCGCCGATACAGATCCGAAATCCGGCAAA CATGGCAGACAGGATTAGCATGTTATCAGATGAACTCCTCTCTCACATTCTCTCATTTCTCCCAACTCAACAAGCAGTTA CCACAAGCGTTCTCTCAAAGCGATGGAAACCCCTCTGGATCTCAGTCCCCGTTCTCGACTACGACGAAGAAATCTACCTC AGGAACAAGGAAAAACCTCAACCCCATTTTTGCTTCGAAAGGTTCGTACACGCAACCCTTCTAGCCAGAGATTTCCACCA ACAACCCATCACAAGCTTCCGTCTCAAATATGGTGTTTCTTGTGCTGCCCCCAATGTCGGTCATCGCCACGCGAACGCCG ATGTCAATGTTTGGGTAAACACGGCTGTACGACGCGGGCGGGGGATTGAGAATCTTGACATTGAGATGTTTTCTCGAAAT TATATTAGTTTGAGCTGCTGCATTTTCAGCTGTAGAACTCTTGTTGTTCTTAAGTTGAAAGGGCTATATCTTACTGATTA TTGTTCTGTTGAACTTCCCTCACTTAAATCCCTATATTTGGTTCAAGTTGAATTTGTAGAACCTCAAAATCTTATGGAGC TTCTTTATGGGTGTCCTGTTCTTGAGTATTTGAAAACATATGATATGTATTATGTTGATGAGGCTGATTTCTGTGAGGAA 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GTGGAGGCGCCGTAACTGCTTCCATGGTCTACAGAAACGGTTAGGCTCTGGATACCATAACAGAAAACCAGAAAGGGTGA ATACAACTATGACTTGACTACTATATTATACTAGAAGCAAAGCTTCTTACACAAGCTATTACTATTATACTCTAATATTG GTTTTTCTCTACGGTTCAGATAATTCTTTTTCTTGTAAAATCAGCTTCTTATAATGTTAGCAAGTTGGCTTCTTTTGCTG AAGCTTATAGACGTACATATGTTTTGAGTTTAACTATTGTTGAAGTTTCAGGACAAAGTTTTCAATGATATGCTTTTTGT TGCAATTGAAATTACAGAGTTTGAGAAGCAAAAGAAGCTGGAAGTAATATGGAAGGTTTTTGGAACATGATTTGTGGTGG GGATTCTGGTTGTTCTGGGACAGGAGGAGAGCCTTTCTGTTATGATTTCAAGCTTATGAAAGATCCTTCCACATGCATCA ACCATTTGTTGACCATTTTCTTTGATGTGTTACTTCTGATAATGATGTCACTCGTTATGATCCACAAGTGTTTGTCAGAA CCAGTTCGGGGTCTACTCCGGGTAGAAAGATTACCAAAGTTGCAGCTAGTTTCTGCCATAACTAGTGGCTCTCTTGGGAT GTTGCATTTGTGCATAGGCATTTGGGTTTTTGAAGAGAAGTTAAGGAAAACCCACAGTGTTCTCCCTCTAAATTGGTGGT TACTAGAATTCTTTCAAGGATTCACATGGATGTTAATCAGTTTAACTCAAAGTTTTCAGCTGAAACAAATTTCAAGAGCA TGGTTGTGGGTGTTTTCTATTCTTGTAATCTTTGTTTCTGGCATTTTCTGTGCTTTATCCATATCTTATGCTTTTAGCAG CAGAGAACTTTCCCTCAAGGTAGCTTTAGATGTTCTGTCATTTCCAGGAGCAGCTTTACTCCTCTTATGCACATACAAAA CATGCAAATCTGAAGACACTGACAGAGAAATTGATGAAAGCCTTTATGCCCCTTTAAATACCAAGTTCAATGAAGTTGAT CCTGTTAGCTATGTAACTGCATTTGCCAAAGCTGGATTTTTTAGTAGGATGTCATTTTGGTGGTTGAATCCATTGATGAA AAGGGGTCAGGAAAGAACACTTCAGGATGAGGATATGCCAAGGTTGAGGGAGCCTGAACGAGCAGAAAGGTGCTATTTCT TTTTTGAAGATCAGTTAAACAGGCAGAAGCAAAAGGACCGATCATCATCACGTTCATCCATTTTATGGGCAATAGTTTCT TGCCACAAGAGAGAGATTTTGATATCAGGGTTCTTTGCACTACTCAAGGTACTCAGTTTGTCTTCTTGCCCTGTAATCCT GAATGCCTTTGTATTAGTTTCTGAGGATAATGGAAGTTTCAAATATGAAGGTCATGTATTGGCCATATCACTTTTCTTTA TAAAGATCATAGAATCCCTATCTCAAAGGCAATGGTATTTTCGTAGTAGACTAGTTGGTATGAAAGTTAAATCATTACTT ACTGCAGCCATTTATAAAAAACAATTGAGGTTATCCAATGCTGCTAGATTGGTTCACTCTGGTGGTGAGATAATGAGTTA TGTGACAGTAGATTCTTACAGAGTTGGAGAATTTCCATTTTGGTTTCACCAGACTTGGACAACGATCCTCCAACTATGTA TTGCACTAGTAATTCTCGTTCGTGCTGTTGGACTTGCAACAATTGCCTCATTGGTGGTGATAGTTCTCACTGTTCTTTTC AATGCTCCAATAGCAAAGTTACAGCATAAGTTTATGAGCAAACTGTTAAGGGCACAAGATGAAAGATTAAAGGCTAGTTC GGAGGCTCTAGTGAATGTCAAAGTGTTGAAGTTTTATGCGTGGGAAATCCATTTTAAAAATGCTATAGAAAGCTTAAGAA ATGTGGAACTTAAATGGTTATCTTCAGTGCTGTTACAAAAAGGATATAATGTCATTATCTTTTGGTCTGCACCCATGTTT GTCTCTGCTGCTACCTTTGTGGCATGTTACTTCTTGAAAGTTCCTTTACATGCAAATAATCTTTTCACTTTTGTGGCAAC TTTACGTCTTGTGCAATATCCAATTGCAACCATCCCAGATGTTATTGGAGTTGTTATTCAAGCAAATATTGCATTTACCC GGATTGTAAACTTCCTTGATGCACCAGAGCTGCAGAGAGAAAAAGTCAGAAACATGTGCTTTGACGAGAAGCTCAAGGGC ACAATTTTAATTAACTCTGCTGAATTTTCATGGGAAGGTAATGCATCAAAGCCAACATTAAGAAACATAAATTTAAATGT TAGTCCTGGGAAAAAGATAGCTATTTGTGGAGAAGTTGGCTCAGGCAAATCAACTCTCTTAGCAGCAATTCTTGGAGAAG TCCCCAATACCAAAGGAAATGTAAGTTTTTGCTCCTTTTACGCTTATTACAGATTTATGTTATTTAGTTCCAAAACTCAA CTTTCATTTTAGCAGTATTTTTAAATTGATGTCAGATTCTATTTTGTGATTTACAGATTGAAGTTTATGGGAAATTTGCT TATGTTTCTCAAACAGCATGGATACAAAGAGGAACAATACAGGAAAATATTTTGTTTGGATCAGCTTTAGATGTTCAAAG GTATCAAGAAACACTTCATAGATCCTCCCTTGTTAAGGACCTTGAGTTGTTTCCCCATGGTGACCTCACTGAAATAGGCG AGAGAGGAGTTAACCTAAGTGGAGGTCAGAAGCAGCGAATTCAACTAGCCCGTGCTCTTTATCAGAATGCTGATGTATAT CTCCTGGATGATCCATTCAGTGCTGTTGATGCTCACACAGCCACAAATTTGATCAATGTAATGATTCCTTGCTTTTTTCA CAAACTGTATTTGTATCTTCAACATCATTTTTACTGAATTTTTTTGAAATTTGACAGGAATACATATTTGAAGGACTTAC CGGAAAGACAGTTCTACTTGTGACTCATCAAGTTGACTTCCTCCCAGCATTTGATTCTGTTTTGGTAATTTCTATCATCT TCAGGCTTTGTATTTATTTCTTTATTGTGTCTCTAACTATAAATTGTAAATATATAACAAATTTGAAGTTATATTTTTTT GTAATCTTTGGTCTCCACAAACATTCTGGAACGGAGACAGTAACTTTTATCTCTGCAGTTGATGTCAGATGGAAAATCCC TACAAGCTGCTCCTTATCACAATCTATTGACCTCAAGCCAAGAATTCCAGGACCTAGTCAATGCTCACAAAGAGACTGCT GGTTCTGACCGGCTTGTAGACGTTACTTCTTCCCAGAGACATTCAAATTCTGGTAGAGAGATTATACAATCTTTCAAACA GGAGCAGTTTAAAGCATTAAATGGTGATGAATTAATTAAGCAAGAAGAGAGAGAAAGAGGATACAAAGGGCTCAAGCCTT ATTTACAGTATCTGAATCAGAGCAGAGGTTACATATACTTCTCTGTAGGCACTCTTTCTTTCCTTATGTTTGTGATTTGC CAGATAATTCAAAACTCATGGATGGCTGCTAATGTTGACAACCCCCACGTCGGAACGTTGCAATTAATTCTTGTTTACTT GCTCATAGGACTTGGATCCGTAATTTTCTTAACGATTAGAAGTTTTCTTGTTGTTGCTTTGGGTGTTCAATCATCAAAAT CGTTATTTTCACAGTTAATGAACTCCCTTTTCCGTGCACCAATGTTTTTTTATGACTCCACACCTTTGGGAAGGATACTT AGTCGGGTAAGCTTCCTAGCTAGTTTTTACCCTTCAATGAGATGTAGTGAAAATATCACTGTTTGCTTCCTGGTTTAGGT CTCGGCAGATCTGAGCATTCTGGATCTTGATATCCCATTTAACCTCACTTTTACTTAGGATTTTGACTGTTTGCTTCCTG GTTTAGGTCTCGGCAGATCTGAGCATTCTGGATCTTGATATCCCATTTAACCTCACTTTTGCTGTGGGAAGTTCTATGTG CTGTTATGCTGATCTTTTAGTCTTAACAGCCATCACTTGGCAAGTCTTGTTTATCTCTATACCAATGGTTTATGTCGTAA TACGCTTGCAGGTAATGTAACATATTCTAATTTTAATTATATTACGAATTGCAGTAATTAAACGGTGCTTCTTTTTAAAC TAACTAGATCAGAAAGCAACCATATTTAACTTCACATATTCATTCTTCTTTGAAAGAAAGGGTTGGGGGGATGCTTTAGG TAATTTCTGGAATCTTTTGGTAACATGCTTAAACCACAGAATTTACAAATTTTTTGGTTGGTATCATGAACCAATATTGC AAAACTGAAGCAGGAATAACTCACAAAACCTACCAATATTAAGGTTAAATTCAATTTATTTAAGGAATGGAAATGTTAAC GGACCTTATTCTTCACCACTTTGTTAAATCATTTATATGGTATCATGATGACCATCCCAAAAGCTCAAGGTATTGAGTAA AGAGTAAAGACAATAAATGATTTTTATATTTTCAATAGTTGGATATAGTGAAAATGTGAAGGATTAATCTTCTTTTTTAC AATAGAGACACTACTATGCATGTGCAAAAGAATTTATGCGGATGGATGGCACAACAAAATCCTCTGTGGCTAATCATGTA GCTGAAACTGTTGCTGGATCTATGACAATAAGGGCATTTGCGGGGCAAGATCGTTTTATCAGGAAGAATCTTGATCTAAT TGATGCCAATGCTAGTCCTTTCTTCCATAGTTTTTCCTCAAATGAGTGGTTGATCCAACAGTTAGAAACAGTCTATGCGA TTGTTCTTGCCGCCACGACACTTTGCATGGTTATGCTTCCAACTGGGACTTTAACTTCTGGTGAGAATTCAGTTATTGTT ACCATATTCTTTGAGTCTTGTAATGATCTTATGAATCATCTTCTTTTACCCTATAACAATAGCATTATCTCGCTTATGCA AATCTTTTATATTCATTATCTGTTATATCAGGATTTATTGGCATGGCTCTATCTTATGGCTTTTCACTAAACGACTCCTT AGTATATTCAATTCGAAGCCAATGCATTTTAGAAAATTACATAGTATCTGTAGAGAGGCTAAATCAATACATGCATATAC CAAGTGAGGCCCGAGAAGTCACAGAAGAAAATCGTCCTCCAGTTAATTGGCCAGCTGCAGGCAAAGTAGAAATACAGGAT TTGCAGGTAGTTATTACTTAAAATTTGCAGCATAAAGTTCAAAAATACAAAAAACTACATAATTTAACTTGCTTGCTTAT GCCGCAATAGATACGATACAGGCCTGGGGGGCCACTTGTACTACATGGTATCACATGCACATTTGAAGGAGGGCACAAGA TTGGTATTGTTGGTAGGACAGGCAGTGGAAAGTCCACACTTATGGGTGCTTTGTTTCGTCTTGTCGAGCCAGCAGGAGGA AAAATTGTAGTTGATGGCATAGACATCTCTTCTATTGGCCTTCATGATTTGAGATCAAGTATTGGAATTATACCTCAGGA TCCTACCCTTTTCATTGGAACAGTTAGATATAATTTGGACCCTTTATCTCAACACTCTGATCAAGAAATATGGGAGGTAA CACTAATACCTGCAACATTATGCTTTTCCATGCTATTCATAGAAAATGTTGACTAATTTGTAGCTTCCATGAAGGTTCTT GGCAAGTGTCAGTTGCGAGAGTCTGTGCAGGATAAAGGTGGCTTAGACTCTTCAGGTACGCTTTCTACATTCCAATTTCA TTAAAAGGCAAATGCTCCCGCTATGTGCGGGATTTGCGAAAAGGTCTTAGTTTGACCACTTGGTCTATTGTAGACAGCCT TACGTTGTTTTACATAAGAGGCTGTTTCCAGAACTTGAACTTGTGACTTGTCTCTTGGCAACAAGGTTTTTACCGTTGCG CCAAGGCTCCCTTGTTAGAATTTTGGGTCACAAATGTAACTTTTAATTGTGTTAGGGTCATTATTTAATTAGCCAAAACT AAAGTGGTCTATTTAATATTGATCTTAT
CDS sequence (LotjaGi2g1v0133000.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGGTTTTTGGAACATGATTTGTGGTGGGGATTCTGGTTGTTCTGGGACAGGAGGAGAGCCTTTCTGTTATGATTT CAAGCTTATGAAAGATCCTTCCACATGCATCAACCATTTGTTGACCATTTTCTTTGATGTGTTACTTCTGATAATGATGT CACTCGTTATGATCCACAAGTGTTTGTCAGAACCAGTTCGGGGTCTACTCCGGGTAGAAAGATTACCAAAGTTGCAGCTA GTTTCTGCCATAACTAGTGGCTCTCTTGGGATGTTGCATTTGTGCATAGGCATTTGGGTTTTTGAAGAGAAGTTAAGGAA AACCCACAGTGTTCTCCCTCTAAATTGGTGGTTACTAGAATTCTTTCAAGGATTCACATGGATGTTAATCAGTTTAACTC AAAGTTTTCAGCTGAAACAAATTTCAAGAGCATGGTTGTGGGTGTTTTCTATTCTTGTAATCTTTGTTTCTGGCATTTTC TGTGCTTTATCCATATCTTATGCTTTTAGCAGCAGAGAACTTTCCCTCAAGGTAGCTTTAGATGTTCTGTCATTTCCAGG AGCAGCTTTACTCCTCTTATGCACATACAAAACATGCAAATCTGAAGACACTGACAGAGAAATTGATGAAAGCCTTTATG CCCCTTTAAATACCAAGTTCAATGAAGTTGATCCTGTTAGCTATGTAACTGCATTTGCCAAAGCTGGATTTTTTAGTAGG ATGTCATTTTGGTGGTTGAATCCATTGATGAAAAGGGGTCAGGAAAGAACACTTCAGGATGAGGATATGCCAAGGTTGAG GGAGCCTGAACGAGCAGAAAGGTGCTATTTCTTTTTTGAAGATCAGTTAAACAGGCAGAAGCAAAAGGACCGATCATCAT CACGTTCATCCATTTTATGGGCAATAGTTTCTTGCCACAAGAGAGAGATTTTGATATCAGGGTTCTTTGCACTACTCAAG GTACTCAGTTTGTCTTCTTGCCCTGTAATCCTGAATGCCTTTGTATTAGTTTCTGAGGATAATGGAAGTTTCAAATATGA AGGTCATGTATTGGCCATATCACTTTTCTTTATAAAGATCATAGAATCCCTATCTCAAAGGCAATGGTATTTTCGTAGTA GACTAGTTGGTATGAAAGTTAAATCATTACTTACTGCAGCCATTTATAAAAAACAATTGAGGTTATCCAATGCTGCTAGA TTGGTTCACTCTGGTGGTGAGATAATGAGTTATGTGACAGTAGATTCTTACAGAGTTGGAGAATTTCCATTTTGGTTTCA CCAGACTTGGACAACGATCCTCCAACTATGTATTGCACTAGTAATTCTCGTTCGTGCTGTTGGACTTGCAACAATTGCCT CATTGGTGGTGATAGTTCTCACTGTTCTTTTCAATGCTCCAATAGCAAAGTTACAGCATAAGTTTATGAGCAAACTGTTA AGGGCACAAGATGAAAGATTAAAGGCTAGTTCGGAGGCTCTAGTGAATGTCAAAGTGTTGAAGTTTTATGCGTGGGAAAT CCATTTTAAAAATGCTATAGAAAGCTTAAGAAATGTGGAACTTAAATGGTTATCTTCAGTGCTGTTACAAAAAGGATATA ATGTCATTATCTTTTGGTCTGCACCCATGTTTGTCTCTGCTGCTACCTTTGTGGCATGTTACTTCTTGAAAGTTCCTTTA CATGCAAATAATCTTTTCACTTTTGTGGCAACTTTACGTCTTGTGCAATATCCAATTGCAACCATCCCAGATGTTATTGG AGTTGTTATTCAAGCAAATATTGCATTTACCCGGATTGTAAACTTCCTTGATGCACCAGAGCTGCAGAGAGAAAAAGTCA GAAACATGTGCTTTGACGAGAAGCTCAAGGGCACAATTTTAATTAACTCTGCTGAATTTTCATGGGAAGGTAATGCATCA AAGCCAACATTAAGAAACATAAATTTAAATGTTAGTCCTGGGAAAAAGATAGCTATTTGTGGAGAAGTTGGCTCAGGCAA ATCAACTCTCTTAGCAGCAATTCTTGGAGAAGTCCCCAATACCAAAGGAAATATTGAAGTTTATGGGAAATTTGCTTATG TTTCTCAAACAGCATGGATACAAAGAGGAACAATACAGGAAAATATTTTGTTTGGATCAGCTTTAGATGTTCAAAGGTAT CAAGAAACACTTCATAGATCCTCCCTTGTTAAGGACCTTGAGTTGTTTCCCCATGGTGACCTCACTGAAATAGGCGAGAG AGGAGTTAACCTAAGTGGAGGTCAGAAGCAGCGAATTCAACTAGCCCGTGCTCTTTATCAGAATGCTGATGTATATCTCC TGGATGATCCATTCAGTGCTGTTGATGCTCACACAGCCACAAATTTGATCAATGAATACATATTTGAAGGACTTACCGGA AAGACAGTTCTACTTGTGACTCATCAAGTTGACTTCCTCCCAGCATTTGATTCTGTTTTGTTGATGTCAGATGGAAAATC CCTACAAGCTGCTCCTTATCACAATCTATTGACCTCAAGCCAAGAATTCCAGGACCTAGTCAATGCTCACAAAGAGACTG CTGGTTCTGACCGGCTTGTAGACGTTACTTCTTCCCAGAGACATTCAAATTCTGGTAGAGAGATTATACAATCTTTCAAA CAGGAGCAGTTTAAAGCATTAAATGGTGATGAATTAATTAAGCAAGAAGAGAGAGAAAGAGGATACAAAGGGCTCAAGCC TTATTTACAGTATCTGAATCAGAGCAGAGGTCTCGGCAGATCTGAGCATTCTGGATCTTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0133000.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEGFWNMICGGDSGCSGTGGEPFCYDFKLMKDPSTCINHLLTIFFDVLLLIMMSLVMIHKCLSEPVRGLLRVERLPKLQL VSAITSGSLGMLHLCIGIWVFEEKLRKTHSVLPLNWWLLEFFQGFTWMLISLTQSFQLKQISRAWLWVFSILVIFVSGIF CALSISYAFSSRELSLKVALDVLSFPGAALLLLCTYKTCKSEDTDREIDESLYAPLNTKFNEVDPVSYVTAFAKAGFFSR MSFWWLNPLMKRGQERTLQDEDMPRLREPERAERCYFFFEDQLNRQKQKDRSSSRSSILWAIVSCHKREILISGFFALLK VLSLSSCPVILNAFVLVSEDNGSFKYEGHVLAISLFFIKIIESLSQRQWYFRSRLVGMKVKSLLTAAIYKKQLRLSNAAR LVHSGGEIMSYVTVDSYRVGEFPFWFHQTWTTILQLCIALVILVRAVGLATIASLVVIVLTVLFNAPIAKLQHKFMSKLL RAQDERLKASSEALVNVKVLKFYAWEIHFKNAIESLRNVELKWLSSVLLQKGYNVIIFWSAPMFVSAATFVACYFLKVPL HANNLFTFVATLRLVQYPIATIPDVIGVVIQANIAFTRIVNFLDAPELQREKVRNMCFDEKLKGTILINSAEFSWEGNAS KPTLRNINLNVSPGKKIAICGEVGSGKSTLLAAILGEVPNTKGNIEVYGKFAYVSQTAWIQRGTIQENILFGSALDVQRY QETLHRSSLVKDLELFPHGDLTEIGERGVNLSGGQKQRIQLARALYQNADVYLLDDPFSAVDAHTATNLINEYIFEGLTG KTVLLVTHQVDFLPAFDSVLLMSDGKSLQAAPYHNLLTSSQEFQDLVNAHKETAGSDRLVDVTSSQRHSNSGREIIQSFK QEQFKALNGDELIKQEERERGYKGLKPYLQYLNQSRGLGRSEHSGS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 36 | 36 | - | – | |
| PANTHER | 34 | 917 | 884 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 34 | 917 | 884 | 0.0 | – | |
| TMHMM | 36 | 58 | 23 | - | – | |
| Phobius | 37 | 58 | 22 | - | – | |
| Phobius | 59 | 77 | 19 | - | – | |
| Phobius | 78 | 101 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 79 | 101 | 23 | - | – | |
| Phobius | 102 | 112 | 11 | - | – | |
| Phobius | 113 | 132 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 116 | 138 | 23 | - | – | |
| Phobius | 133 | 143 | 11 | - | – | |
| Phobius | 144 | 169 | 26 | - | – | |
| TMHMM | 145 | 167 | 23 | - | – | |
| Phobius | 170 | 174 | 5 | - | – | |
| Phobius | 175 | 196 | 22 | - | – | |
| Phobius | 197 | 309 | 113 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 295 | 607 | 313 | 4.32E-27 | ||
| Gene3D | 297 | 601 | 305 | 2.6E-16 | ||
| Phobius | 310 | 336 | 27 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 311 | 591 | 281 | 27.89 | ||
| Pfam | 311 | 576 | 266 | 9.2E-20 | ||
| CDD | 312 | 599 | 288 | 1.58676E-88 | – | |
| Phobius | 337 | 347 | 11 | - | – | |
| Phobius | 348 | 365 | 18 | - | – | |
| Phobius | 366 | 435 | 70 | - | – | |
| Phobius | 436 | 464 | 29 | - | – | |
| TMHMM | 446 | 468 | 23 | - | – | |
| Phobius | 465 | 535 | 71 | - | – | |
| TMHMM | 536 | 558 | 23 | - | – | |
| Phobius | 536 | 556 | 21 | - | – | |
| Phobius | 557 | 926 | 370 | - | – | |
| Gene3D | 602 | 868 | 267 | 1.5E-75 | – | |
| SUPERFAMILY | 620 | 849 | 230 | 6.66E-55 | ||
| CDD | 626 | 826 | 201 | 9.9241E-105 | – | |
| ProSiteProfiles | 628 | 849 | 222 | 22.222 | ||
| Pfam | 644 | 778 | 135 | 8.4E-24 | ||
| SMART | 653 | 826 | 174 | 5.6E-16 | ||
| ProSitePatterns | 751 | 765 | 15 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Molecular function | ATPase activity | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate + 2 H+. May or may not be coupled to another reaction. | ||
| Molecular function | ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate, to directly drive the active transport of a substance across a membrane. | ||
| Biological process | Transmembrane transport | The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0133000.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…