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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0157200 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0157200.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Myotubularin; TAIR: AT3G10550.1 Myotubularin-like phosphatases II superfamily; Swiss-Prot: sp|F4J3T8|MYTM1_ARATH Phosphatidylinositol-3-phosphatase myotubularin-1; TrEMBL-Plants: tr|V7BH90|V7BH90_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0157200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:55643415..55657924) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAAAATCATAAATTAATTATAATACGGGGACTAAAAATAAAATTAACATCGCTTATGAGCAGCAGTTGAGGGCGCAGAAT TACGAGCGTCGGGTCACAACAACAACTACCCGCTTGAACGTTTGGTAATCTTCATTTCAACATTCATCCCTCTCTCTCTC TTCTCTCTCTCTCTCTACACTCGCCGGAGTCACCGTCACCGTCGCCGTTGCCGGCATGGACGAACGGAAACACCGCACCA CTAGAACAACGTCTCTCAGGGACGACTCCGAGTCCTCCACTGGTAGCTGGGACGTTCTCGAATGGACCAAGATTGAGGTT ATTCCTTCTCGTTTTCAATTCATTCTTCTTCTTCGTTTCGTTTTGGTTTCCATTTTTGGTAATTTTTTTGAGTTGTGATT TATTTGCAGCCAATTTCACAGTTCGCGTCGCATGAGAATCTCGATTTCTTGCTCGAGGCGGAACAAGTTGTAGCCGAAGT ATGCAATTTCACATTCAATTCTTCTTCTGTTTTCAAGAATTTTGCTGTATCTGCGTTGATTGTTATGGGAACCTTTATTT TGTTCTTTCGGAATTGATTAATTTGGTTTTATCTTGCTTGCTGAATCTGCAAGAATGTGTGGAATGTGAGGATAGTGCGA GGAATGGTAAGGGTGGTTTGAGATTTTCTGAACACGCATGTTAGGTTTGGTGCCAGCTCCTTAAAGAATCTTGGGTTGTA TTGAATTTGATGTGTTCTTTGCCTAAGGAGATAACTAGCTTCGGTTCCTATTTGATTAGGGTTTGTAGATCTGTAGGTCT GTAGGTTTGTGTTTGTTATGCATACTTTGTGTGATCTCTATGTCTTGAGTTGATATGTTTGACATATAAGCACTCTGTTA ATTGACTATACATATGGAAATTCTGTCTTGCAAGTTGCAACTACTAACTTTTTCTGAATCATTGCATTGATGCAGTTATA 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TGTGGTTGGCTATTACTCATTTTAACACACCATGTAAGCTTATCAATTATCTGAACAATTCAGGGTATTTCTTTCCATTG TCTCAATTGTTGACCTGTTCGGCTTTTCTTTTTAATGGTCTTGGTGCTGTGTCTGACGGTAACAGGCTAAAGAAGTGGCA GAAAGGAAAGCTAAAGAAATCACAAATGCCATGGAATCATTGAATACAGAACTGCGTCGCGAGAAACTGCAAAACAGCTC AGCTTTGAACATGGCCAAGAGATTAAGCAAGGAAAATATGGCCATAAAGCGCGCAGTTCAGTCAATTGGGTGCAAGGTTC ACTTCTCTGGTAACGGTGGTGACTGCATTGTTGACATTGAAAACAGCCCAGCCGAAGCAACAAACTTTTTGCATTGCTCC TCTAGGCAAGAATCAAATAATGCATTGCTTGATGACAAAAAGAATCTATCCGCTTCTCTAACAGTTACAGCAGATAATGT TGATGATGTTAATGATGATGGAAGGAATTCTATTGGTCGAATATGCGAAACGCTATGCCAATTTCGCGCTGGAGAAGGAG GTTGTAGGTGGCCAGAAGGTGAGTGTGCTCAACTATGTAGTCAATTTGTTGGTGTGAAGGCAAATTTTGATGCGCTTGAC CAACTTTCGATTGATGATAGTTATTTCAATTGAGAGTAGATAGGGACTTTAGTTCCCAATAGACTCTGACAGTGAACAGT CACATCAACCAATTTTGGTTTTCTTTCTGCAAATGAGAACACAATATTCTTTGAGAAGTCCTTTACGATGAAAATGGCGG ACCCTGTATTATTGGGTCTCGGGAATTGTACAGGCTATGAGAGTTGGCTGGATACTACCTTGGTGCGAAATCTGTTTGGG AATCTAGAATAGTACTTGTATGTACCCTGAGTTGGTTATATTGATATAACCATCATTGTGGTCGACATCATTATATGCAT 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GTGAAGTGACGCGGTTTTGATTTGCGTTGAGGTATTTATGAAGCAAACCAACACTTTCCGCGACGGTTCAAGAGATGTTT TAGGCACACAAGGTTATCAATTTAGTTTGG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0157200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGACGAACGGAAACACCGCACCACTAGAACAACGTCTCTCAGGGACGACTCCGAGTCCTCCACTGGTAGCTGGGACGT TCTCGAATGGACCAAGATTGAGCCAATTTCACAGTTCGCGTCGCATGAGAATCTCGATTTCTTGCTCGAGGCGGAACAAG TTGTAGCCGAAGGACATGGTGTTGTTCTTGTTAATACTGATGATGCGGGCATGTTGATGGTAACAAATTTTCGTCTTCTT TTTCTGAGTGAGGGAACTAGAAAAGTTATTGCCCTTGGAACAATACCACTAGCAACCATTGAGAAGTTCAACAAGATAGT TGTAAAAGTTCAGTCAAACACACGTCAATTAGACAAGACACCAACTCAGAGACTGCTCCAGGTGATTGGAAAAGATATGA GAATTATAGTCTTTGGTTTTAGGCCTCGTACAAAACAGAGACGTGTGATATTTGATGCACTACTGAGGTGTACAAAGTCA ACGAGATTATGGGATCTCTATGCTTTTGTATCTGGACCTTCTAGGTTTAAGAACACTACTCCACAGGTGCGCTTATTGGA TGAGTATTTTCGACTTCTTGGCAAAGGTTCATATCATGCATCAACCAACATGATTGAAAGTGGGTCCTACACCTTGTCAA ATGACTTATGGAGAATAAGTAGTGTGAATTCCAATCATTCAATGTGCCAGACCTATCCATTTGCTTTGATTTTTCCAAAG GTCATTAGTGATGATGAAGTGCTCCAGGCTTGTAGCTTCCGTGCAAGATCTCGACTACCTGTAATTTCATGGTGTCATCC TGTTACTGGAGCAGTTCTTGCCCGCTCTTCCCAACCTTTAGTTGGTCTCATGATGAATATGAGGAGTAACATGGATGAAA AACTTGTGGCTGCACTTTGCAGTAAACTTGATGATGGCTCACGGAGAAAGCTATATATTGCTGATGCAAGACCAAGGAAA AATGCATTAGCTAATGGAGCCATGGGAGGTGGTTCGGAATCATCATCAAACTATTTTCAATCTGAGGTAGTCTTTTTTGG GATAGACAACATCCATGCAATGAGAGAGAGCTTTGTTCGGCTCCGAGAATACATGGACACTCATGGCAGAGCGTCATCAG ATGGAATGTTATCTTTTTTGAGACATGGTGGGTCGACATGGGGAGGTGGCAATTTAAGTAGTATGTCTGCTTCAGTATCA ACCCTTGGGGACAGTGGATGGCTATTGCATGTTCAGAATGTCTTGGCCGGTGCAGCTTGGATTGCAGCTCGTGTTCATAT GGAAAAGGCTTCTGTTCTTGTACATTGCAGTGATGGATGGGATAGGACAAGCCAGTTGGTTGCACTTGCTAATTTGTTGC TTGATCCATATTATCGGACTTTGGCAGGGTTTCAGGCACTCGTTGAAAAAGACTGGCTAGCATTTGGTCATCCATTTTCC GATCGTGTGGGAATACCTTGTACCTCTGGAAGTGGTAACACACCTTTTGAGTTACCTAGGCAGCCTTCTGCTGGAAATTT CCCATCATCGCCGATGCGCCCGTCATCAGGAGCATTCTCTTCTCAACCTCCAACCTCATCTCATGCACATACCTCAAATA ATTACTCTCCCATTTTTTTGCAGTGGGTTGATTGTGTTTCACAATTGTTGCGGATGTATCCTTTTGCTTTTGAGTTTTCA GCGGCTTTCCTGGTGGACTTCTTAGACTGCATGCTTTCTTGTCGCTTTGGAAACTTCTTCTTTAATAGTGAGAAGGAGAG ACTGCAATACAGTGTTTATGAAACATGTGGATGTTTGTGGGTTTACTTGGCTGATTTGCGGGCATCAGACGGAGGTTCCC ACGTGCATTATAATCCTTTTTATGATCCGTTGAGGAACAACGGTCCCCTTCTGCCACCAGCAGCAGCGTTAGCCCCAACT TTGTGGCCCCAATTCCACCTACGTTGGGCATGCCCGGACGAAGTACAAGCTGGGGAGGTTGAAGCACAATGTAGAAAGAT AATCACGAAATCCTCTGAGATGCAGAAGGCTAAAGAAGTGGCAGAAAGGAAAGCTAAAGAAATCACAAATGCCATGGAAT CATTGAATACAGAACTGCGTCGCGAGAAACTGCAAAACAGCTCAGCTTTGAACATGGCCAAGAGATTAAGCAAGGAAAAT ATGGCCATAAAGCGCGCAGTTCAGTCAATTGGGTGCAAGGTTCACTTCTCTGGTAACGGTGGTGACTGCATTGTTGACAT TGAAAACAGCCCAGCCGAAGCAACAAACTTTTTGCATTGCTCCTCTAGGCAAGAATCAAATAATGCATTGCTTGATGACA AAAAGAATCTATCCGCTTCTCTAACAGTTACAGCAGATAATGTTGATGATGTTAATGATGATGGAAGGAATTCTATTGGT CGAATATGCGAAACGCTATGCCAATTTCGCGCTGGAGAAGGAGGTTGTAGGTGGCCAGAAGGTGAGTGTGCTCAACTATG TAGTCAATTTGTTGGTGTGAAGGCAAATTTTGATGCGCTTGACCAACTTTCGATTGATGATAGTTATTTCAATTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0157200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDERKHRTTRTTSLRDDSESSTGSWDVLEWTKIEPISQFASHENLDFLLEAEQVVAEGHGVVLVNTDDAGMLMVTNFRLL FLSEGTRKVIALGTIPLATIEKFNKIVVKVQSNTRQLDKTPTQRLLQVIGKDMRIIVFGFRPRTKQRRVIFDALLRCTKS TRLWDLYAFVSGPSRFKNTTPQVRLLDEYFRLLGKGSYHASTNMIESGSYTLSNDLWRISSVNSNHSMCQTYPFALIFPK VISDDEVLQACSFRARSRLPVISWCHPVTGAVLARSSQPLVGLMMNMRSNMDEKLVAALCSKLDDGSRRKLYIADARPRK NALANGAMGGGSESSSNYFQSEVVFFGIDNIHAMRESFVRLREYMDTHGRASSDGMLSFLRHGGSTWGGGNLSSMSASVS TLGDSGWLLHVQNVLAGAAWIAARVHMEKASVLVHCSDGWDRTSQLVALANLLLDPYYRTLAGFQALVEKDWLAFGHPFS DRVGIPCTSGSGNTPFELPRQPSAGNFPSSPMRPSSGAFSSQPPTSSHAHTSNNYSPIFLQWVDCVSQLLRMYPFAFEFS AAFLVDFLDCMLSCRFGNFFFNSEKERLQYSVYETCGCLWVYLADLRASDGGSHVHYNPFYDPLRNNGPLLPPAAALAPT LWPQFHLRWACPDEVQAGEVEAQCRKIITKSSEMQKAKEVAERKAKEITNAMESLNTELRREKLQNSSALNMAKRLSKEN MAIKRAVQSIGCKVHFSGNGGDCIVDIENSPAEATNFLHCSSRQESNNALLDDKKNLSASLTVTADNVDDVNDDGRNSIG RICETLCQFRAGEGGCRWPEGECAQLCSQFVGVKANFDALDQLSIDDSYFN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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| MobiDBLite | 1 | 22 | 22 | - | – | |
| PANTHER | 5 | 850 | 846 | 0.0 | ||
| PANTHER | 5 | 850 | 846 | 0.0 | – | |
| SMART | 37 | 107 | 71 | 1.7E-4 | ||
| SUPERFAMILY | 48 | 170 | 123 | 4.79E-16 | – | |
| Gene3D | 61 | 158 | 98 | 9.0E-9 | ||
| Pfam | 167 | 587 | 421 | 1.4E-124 | ||
| ProSiteProfiles | 197 | 646 | 450 | 101.952 | ||
| SUPERFAMILY | 209 | 650 | 442 | 3.14E-116 | ||
| CDD | 258 | 548 | 291 | 1.04007E-108 | – | |
| ProSitePatterns | 434 | 444 | 11 | - | ||
| MobiDBLite | 507 | 531 | 25 | - | – | |
| Coils | 671 | 705 | 35 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein tyrosine phosphatase activity | Catalysis of the reaction: protein tyrosine phosphate + H2O = protein tyrosine + phosphate. | ||
| Biological process | Dephosphorylation | The process of removing one or more phosphoric (ester or anhydride) residues from a molecule. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0157200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…