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LotjaGi2g1v0381400.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0381400
Transcript ID LotjaGi2g1v0381400.1
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Transcription-associated protein 1; TAIR: AT2G17930.1 Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein with FAT domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8I8U7|TRA1_DROME Transcription-associated protein 1; TrEMBL-Plants: tr|V7CI88|V7CI88_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0381400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:87777440..87807436) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CACAACACCATTTACCCTCTGGCCTATTTCCACACCGCGTAGTGGAGTCAGGTATACAAGGCGAAGCTGAAGAAACAGGA GGGAAAAGTACTGTTACTCAAAACCCCTCTTTCTTAAAGCCCTAACAAACAAACACCATACTCTAACTCCTAGTTACTCC ACTCGCTCCCAGTATTTATGGTGTTGCGCTCGGCGATCGCAACCACCGTCAGTGCTCAATTCCGCCACCGCAGAGGGAGC GGTGCGGTTAGATTTTAGCGTTTTTGTTCAGTAGCGTTTAGATTAGCGTTGATTTATTGAACCCTAGAAATACAATTGAA CCATACCAAACGTGAATTGAACTCTGAATTGTTGTTGTTGTTCTTCTTCTAGTCTTCAAGCATTGAAGCTAGGGTTTGAG GTCGCTCTGGTTTCCCTTATACGACTCCATCATGAGTCCTGTTCAGAATTTCGAGCAGCATTCTCGTCATCTCGTCGATC CCGACCTCCGTAAGCCCTCTCTCTCTCCCTCTCTATCGATTGTCTTCAGTTCTGAACTTACTTGCAGTAGGAAAATTGAT TTCAATTATGCTTGTGTTGTTTCGATTTGTTTTTCATTTCTCTGTTGCTTAGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTGTTGG GGGTGAAAACAGAGATTCAGGCGAGGCTGCAGATGGTGATGGAGGTTAGGGATAGTCTTGAGATTGCACACACAGCTGAG TACTTGAATTTCTTAAAGTGTTACTTCCGGGCGTTCTCTGCGGTGCTGCTGCAAATCACAAAGCCGCAGTTTGAGGACAA TCCCGAGCACAAGCTTCGGAATATCGTGGTTGAGATATTGAATAGGCTTCCGCACAGCGAAGTTCTCCGGCCTTTTGTAC AGGACCTCTTGAAGGTTGCTATGCAAGTGCTTACGACGGACAATGAGGAGAATGGGTTGATTTGTATCCGTATAATCTTT 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0381400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

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AATGTGTCCGCTCCTGCTCCCAATGCGAATTCCGATGCTTACTTTCAGGGACTAGCACTTATAAAAACATTGGTCAAATT GCTCCCTTGTTGGTTACGAAGTAATCGAACTGTGTTTGATACATTAGTGCTTGTTTGGAAGTCTCCTGCAAGAATATCCC GGCTGCAAAATGAACAGGAGCTGATCCTCGTGCAAGTAAAAGAAAGTAAATGGCTTGTCAAATGCTTCCTGAATTACTTG AGACATGACAAAGATGAAGTAAATGTTCTCTTTGATATACTTACCATATTCTTGTTTCATAGTCGAATTGACTACACATT CCTGAAGGAGTTTTACATCATTGAGGTTGCAGAAGGTTATTTACCGAGCTTGAAAAAGAACCTCCTATTACATTTTCTGA ACCTTTTCCAATCAAAACAACTTGGTCACGACCATTTGGTGATAGTAATGCAAATGCTCATTCTTCCAATGCTTGCACAT GCCTTTCAAAATGACCAAAGTTGGGAGGTTGTTGATTCTGCTATTATAAAAACAATAGTTGATAAACTTCTTGATCCTCC AGACGAGGTTTCGGCTGAGTATGATGAGCCTCTAAGAATAGAACTATTGCAGCTTGCCACTTTGCTTCTTAAATATCTCC AGACTGATCTCGTCCATCATAGGAAGGAACTGATAAAGTTTGGATGGAATCATCTTAAGCGTGAAGATACTGCTAGCAAA CAATGGGCATTTGTGAATGTTTGCCATTTCTTGGAGGCATATCAAGCCCCTGAAAAAATTATACTTCAGGTTTTTGTAGC TCTTCTTAGGACTTGCCAACCAGAAAATAAAATGTTGGTCAAGCAGGCTCTTGACATTCTAATGCCTGCACTGCCACGAC GTTTGCCCCTTGGCGATTCTCGGATGCCCATATGGATAAGATACACTAAGAAAATCCTTGTTGAAGAAGGTCATTCAATT CCAAATCTTATTCACATATTTCAACTTATTGTCCGTCATTCAGATCTCTTCTACAGCTGTAGAGCACAGTTTGTTCCTCA GATGGTGAATTCTCTTAGTCGCCTTGGATTGCCTTATAATACTACAGCAGAGAACAGACGTCTTGCCATTGAACTTGCTG GGTTAGTGGTTAACTGGGAGAGGCAAAGGCAAAATGAGATGAAAGTTGAGATGAAAGTTGTTACTGATTCTGATGCTCCC AGCCAAATCAATGATGTCTTTAATCCTAGTTCAGCAGAGTCTAAGCGATCTGTTGATGGGTCCACTTTTCCCGAAGACAC AACTAAGCGAGTAAAAGCAGAACCTGGTCTGCAATCCTTATGTGTCATGTCACCTGGTGGTCCATCATCAATCCCTAATA TTGAAACCCCAGGATCTGCCAGTCAACCAGATGAAGAATTTAAACCAAATGCCGCTATGGAGGAAATGATTATCAATTTT CTTATCAGAGTTGCTTTAGTTATAGAGCCTAAGGACAAAGAAGCAAGTGCAATGTACAAACAAGCTTTGGAGCTACTTTC ACAAGCATTAGAAGTCTGGCCCAATGCGAATGTAAAATTTAATTATTTGGAGAAGCTGCTGAGCAGTATACAACCATCTC AAGCAAAAGATCCTTCCACTGCTCTGGCACAGGGTTTGGATGTCATGAACAAAGTCTTAGAGAAACAGCCTCACTTGTTC ATAAGAAACAACATTAACCAAATTTCTCAAATTCTTGAACCTTGTTTCAAGCATAAACTTTTAGATGCTGGGAAGTCTTT TTGCTCACTGTTGAAGATGATTTTTGTTGCTTTTCCTCAAGAAGCTACTACAACACCTCCTGACGTTAAGCAGTTGTACC AGAAGCTTGATGATTTAATTCAAAAGCATGTTACAACTGTCACAGTTCCTCAAACTTCTAGTGATGATAATAATGCTAGT TCAATTAGTTTCCTGTTGCTTGTCATAAAAACCTTAACAGAGGTTCAAAGGAATTTCATTGATCCTTCAATTTTGGTTCG GATTCTTCAGCGGCTGCAACGTGATATGGGTTCATCAGTAGGTTCTCATATAAAACAAGGTCAGAGAACAGATCCAGATT CAGCTGTCACATCTTCTCGTCAAGGTGCTGATGTTGGAGCTGTTATTTCAAATCTGAAATCCATCTTAAAACTTATCTCT GAGAGAGTGATGCTTGTTCCTGAGTGCAAGCGGTCTGTATCTCAAGTATTGAATGCCTTGCTCTCTGAGAAAGGTATTGA TGCAAGTGTCCTTCTTTGCATACTTGATGTGATTAAAGGGTGGATTGAAGATGATTTCTGTAAACAAGGAAATTCAGCCA CATCAAGTGCCTTTCTCACTCCCAAGGAGATAGTTACCTTTCTTCAGAAGCTTTCACAAGTTGATAAACAAAACTTCACA CCGGTTTCTCTCGAAGAATGGGACCGGAAATATCTCGAGCTTCTTTATGGGACTTGTGCAGATTCAAATAAATACCATCA ATCCTTGCGTGAAGAGGTTTTCAAGAAGGTGGAAAGGCAGTTTATGCTTGGTTTACGAGCTAGAGATCCTGAAATTCGGA TGAAATTCTTCTCTATCTATCACGAGTCTCTTCAGAAAACTCTTTTCACCAGGCTTCAATTCATTATCCAAGTTCAAGAC TGGGCGGCTTTGAGTGATGTCTTCTGGCTCAAACAAGGTCTTGATCTTCTCTTGGCAATATTAGTCGAGGACAAACCTAT TACACTAGCTCCAAATTCAGCCAGGGTTCAACCACTTCTGGTTTCAAGCTCTCTTCTGGAATCATCTGGGATGCAGCACA AGGTTAATGATGTATCTGAAGGAACTGATGATGCTCCACTAACGTTTGACACCCTTGTGTTTAAACATGCCCAGTTTCTT AATAATATGAGCAAACTCCAGGTGGCTGATCTATTAATTCCATTGAGAGAGTTGGCCCATACAGAAGCTAATGTTGCATA CCATTTGTGGGTTCTGGTATTTCCAATTGTCTGGGTTACATTAAATAAGGAAGATCAAGTCACACTTGCTAAACCAATGA TTACCCTTTTGTCTAAAGATTACCATAAGAGGCAGCAAGGCAGCAGACCAAATGTAGTGCAAGCACTATTAGAAGGGCTT CAGTTGAGCCATCCTCAACCCAGAATGCCAAGTGAGCTCATTAAATATATCGGGAAAACATTCAATGCATGGCACATTGC ACTGTCTTTGCTTGAAAGTCATGTTATGCTGTTCCCTACTGATTCCAAATGCTCTGAGTCTCTGGCTGAGCTCTATCGTT TGCTCAATGAAGAGGATATGAGGTGTGGGCTGTGGAAGAAGAAATCAGTCACTGCAGAAACCAGGGCAGGGCTTTCTCTT GTTCAGCATGGTTACTGGCACCGTGCTCAAAGTCTCTTTTATCAAGCCATGGTGAAGGCAACTCAAGGAACATATAACAA CACTGTACCTAAGGCTGAGATGTGTCTATGGGAAGAGCAATGGCTATACTGTGCGAGTCAACTTTGTCAATGGGATGCAT TGGCAGACTTTGGCAAGAGTATTGAGAATTATGAAATTCTGCTTGACAGTCTTTGGAAATCGCCTGATTGGACATATATG AAGGAGCATGTCATTTCTAAAGCTCAAGTAGAAGAAACTCCAAAACTTCGTTTAATCCAATCATACTTTGCCCTTCATGA CAAAAATACAAATGGTGTGGGGGACGCTGAGAACACAGTGGGTAAAGGTGTTGATCTTGCTCTAGAACAATGGTGGCAGC TGCCTGAAATGTCTGTTCATTCCAGAATTCCCCTTCTGCAGCAATTCCAACAATTAGTTGAGGTTCAAGAATCAGCTAGG ATTCTAATTGACATTTCCAATGGAAATAAACTCAATGGAAATTCGGTGGTTGGTGTGCAAGGAAACCTTTATGCCGATCT GAAGGACATCCTAGAGACTTGGAGACTCAGAACTCCAAATGAATGGGACCATATGTCTGTTTGGTACGATTTGCTACAGT GGAGGAATGAAATGTATAATTCTGTCATAGAAGCTTTCAAAGATTTTGGTGCCACAAATTCAGCGCTTCATCATCTTGGG TACCGCGACAAAGCTTGGACTGTCAACAGGCTTGCTCATATTGCTCGTAAGCAGGGCCTGTTTGATGTTTGTGTCACCAT ACTTGAAAAATTATATGGCCATTCAACCATGGAAGTGCAGGAAGCATTTGTTAAGATTACTGAGCAGGCAAAGGCGAATT TGGAAACCAAGGGAGAACTCACAACCGGTCTTAATCTGATAAACAGCACTAATCTAGAGTATTTTCCTGCAAAGCACAAG GCTGAAATTTTCCGTCTGAAAGGGGATTTCTTGTTAAAAGTGAATGACTCGGACGGTGCTAATCTTGCTTATTCTAATGC CATTAGTCTTTTTAAAAACTTGCCTAAGGGATGGATAAGCTGGGGAAATTATTGTGACATGGCTTACAGAGATACTCATG AAGAAATTTGGTTGGAATATGCTGTCAGTTGCTTTTTGCAAGGTATAAAATTTGGTGTGTCCAATTCAAGAAGTCATCTT GCCCGTGTTCTTTATCTTCTTAGCTTTGATACTCCTAATGAGCCTGTTGGGAGGGCGTTTGATAAGTTATATGAACAAGT ACCGCATTGGGTTTGGCTCTCTTGGATACCACAGCTCTTGCTCTCTCTCCAGAGGACAGAAGCTCCTCATTGTAAACTTG TTCTTCTGAAGATCGCAACCTTGTACCCTCAGGCTCTCTATTATTGGCTGCGTACGTACTTGTTGGAACGGCGTGATGTT GCTAATAAATCTGAACTTGGTAGAATACAAATGGCACAGCAAAGAACGCAGCAAAGTGTCTCCGGTACTAGTGGAGGTTC TCTTGGTGGATTGGCAGATGGAAATGCAAGACTGCAAGGTCCAGGTGGGAGTGCCTTATCATCTGATATTCAAGTTCACC AAGGCTCTCAGTCTGCTAGTGGGATTGGATCTCATGATGGTGGGAACTCTCACGGGCAAGAGCCTGAAAGATCTACAAGT GCAGAAAGCAACATGCACAATGGCAATGACCAACCATTGCAGCAAGGTTCTGCAAACCTCAATGAGGGTGGTCAGAATAA TTTAAGGCGTGCTGGTGCTTTAGGTTTTGTGGCTTCAGCTGCCAGTGCTTTCGATGCTGCCAAGGATATAATGGAGGCTC TTAGAGGCAAGCATGCTAACTTGGCTGGTGAACTCGAGGTTCTACTAACAGAAATTGGTTCAAGGTTTGTCACTCTGCCT GAAGAGAGGCTTTTGGCAGTGGTTAATGCTTTGCTCCACCGCTGCTACAAATATCCAACAGCTACAACTGCTGAAGTTCC TCAGTCTCTGAAGAAAGAGCTCTCAGGTGTTTGCAGGGCTTGCTTTTCCGCAGATGCTGTAAATAAGCATGTTGATTTTG TGAGGGAGTACAAACAGGATTTTGAACGTGATCTGGATCCCGAAAGCACTGCCACTTTCCCATCTACCCTCTCTCAACTG ACCGAGCGGTTGAAACACTGGAAAAATGTTCTGCAAAGTAATGTTGAGGACAGGTTTCCTGCAGTGTTGAAGCTAGAAGA AGAAAGCAGGGTATTGCGAGACTTCCATGTTATTGATGTTGAAGTTCCAGGCCAGTATTTCACCAATCAGGAAATTGCAC CAGATCACACTGTGAAGTTAGATAGGGTCGCAGCTGATATTCCAATTGTGCGAAGGCATGGGAGCAGTTTTCGGCGTTTG ACTCTGATTGGCTCTGATGGTTCACAACGCCATTTTATTGTCCAGACCTCTTTGACTCCCAATGCTAGAAGTGATGAGCG CATATTGCAGCTTTTCCGTGTGATGAACCAAATGTTTGAGAAGCACAAGGAATCAAGACGCCGTCACATATGCATTCATA CACCAATAATTATTCCTGTTTGGTCCCAGGTTCGCATGGTAGAAGATGATTTGATGTATAGTACTTTCCTTGAGGTCTAT GAGAATCATTGTGCAAGGAATGATCGTGAGGCTGATCAGCCAATAACCTTTTTCAAGGAAAAGTTGAACCAGGCTATAAA TGGACAAATATCACCAGAAGCTGTTGTTGATCTCCGTTTGCAAGCTTATAATTTAATAACAAAACAAATGGTTAGTGACA ACATCTTTTCACAGTATATGTACAAAACTCTGCCAAGTGGAAACCATATATGGGCTTTCAAGAAGCAATTTGCCATCCAG TTGGCCCTTTCGAGTTTCATGTCGTTCATGTTACAAATTGGTGGGAGGTCTCCGAACAAGATTTTGTTTGCGAAGAACAC TGGAAAAATATTTCAAACTGATTTTCATCCTGCATATGATGCAAATGGACTGATCGAGTTCAGTGAGCCAGTTCCGTTCA GGCTAACAAGGAGTATGCAAGCATTCTTCACACATGGAGTAGAAGGTCTTATTGTATCATCAATGTGTGCAGCTGCACAA GCTGTCGCTTCCCCTAAGCAAAGTCAACATTTGTGGCATCATCTAGCGATGTTTTTCCGCGATGAGCTACTGTCTTGGTC TTGGAGAAGACCGCTTGGGATGCCCATGGTCCCTATGGCTGCGGGTGGTACTATGAGCCCTGTTGACTTCAAACAAAAGG TTATTACAAATGTGGAACATGTTGTAGCAAGGGTTAAGGGAATAGCACCGCAGAAATTTTCTGATGAGGAGGACAATGTG ATGGATCCACCGCAATCGCTGCAGAGGGGTGTTACTGAGTTGGTTGAAGCTGCCTTGAATCCAAGGAACTTGTGCATGAT GGATCCAACATGGCATCCCTGGTTCTAG
Download CDS Sequence

Protein sequence (LotjaGi2g1v0381400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MSPVQNFEQHSRHLVDPDLQIQARLQMVMEVRDSLEIAHTAEYLNFLKCYFRAFSAVLLQITKPQFEDNPEHKLRNIVVE ILNRLPHSEVLRPFVQDLLKVAMQVLTTDNEENGLICIRIIFDLLRNFRPTLENEVQPFLDFVCKIYQNFKLTVRHFFEN MAKTGEDVKPMETSLSDQVISAANPTGSQLNPSTRSFKIVTESPLVVMFLFQLYSRLVQANIPQLLPLMVAAISVPGPER VPPHLKTHFIELKGAQVKTVSFLTYLLKSYAEYIRPHEESICKSIVNLLVTCSDSVSIRKELLISLKHVLGTDFRRGLFP LIDTLLEERVLVGTGRACFETLRPLAYSLLAEIVHHVRQDLSLSQLSRIIYLFSSNMHDASLSLSIHTTCARLMLNLVEP IFEKGVDQQSTDEARILLGRILDAFVGKFSTFKRTIPQLLEEGEEGKGRATLRSKLELPVQAVLNLQVPVEHSKEVNDCK HLIKTLVMGMKTIIWSITHAHSPRSQVLVSSSSNLSPPQALRGMREDEVCKASGVLKSGVHCLALFKEKDEEREMLHLFS QILAIMEPRDLMDMFSLCMPELFECMISNTQLVHIFSTLLAAPKVYRPFADVLVNFLVSSKLDVLKQPDSPASKLVLHLF RFIFGAVSKAPSDFERILQPHVPVIMEFCMKNATEVETPLGYMQLLRTMFRALSGCKFELLLRDLIPMLQPCLNMLLAML EGPTGEDMRDLLLELCMTLPARLSSLLPYLSRLMKPLVLCLKGNDELVSLGLRTLEFWVDSLNPDFLEPSMANVMSAVIL ALWSHLRPAPYPWGAKALQLLGKLGGRNRRFLKEPLALECKENPEHGLRLILTFEPATPFLVPLDRCINLAVEAVMNKNC GMDAFYRKQALKFLCVCLSSQLNLPGAVADEGSTSKQLSTLLVSAVDQSSRRSESTDVKADLGVKTKTQLMAEKSVFKIL LTTVIAANGEPDLTDPTDDFVVNICRHFAMIFHIDSSSSNASSAVLGGSSLSNNIHVGSRPKMSTCSNLKELDPLIFLDA LVDVLADDNRLHAKAALGSLNVFAETLVFLARSKHTDFIMSRGPGTPMIVSSPSMNPVYSPPPSIRVPVFEQLLPRLLHC CYGLTWQAQMGGVMGLGALVGKVTVETLCLFQVRIVRGLIYVLKKLPIYASKEQEETSQVLTQVLRVVNNADEANSEARR QSFQGVVDFLAQELFNQNASIIVRKNVQSCLALLASRTGSEVSELLESLYQPFLQPLIMRPLKLKTVDQQVGTVTALNFC LALRPPLLKLTPELVNFLQDALQIAESDENAWVAKFINPKVVTSLTKLRTACIELLCTTMAWADFKTPNHSELRAKIISM FFKSLTCRIPEIVAVAKEGLRQVINQRMPKELLQSSLRPILVNLAHTKNLSMPLLLGLARLLELLSNWFNVTLGGKLLEH LKRWLEPEKLAQSQKSWKAGEEPKIAAAIIELFHLLPSAASKFLDELVTLTIDLEGALPPGQVYSEINSPYRLPLTKFLN RYAPLAVDYFLARLSEPKYFRRFMYIIRSEAGQPLRDELAKSPQKILASAFSEFLPKSDVAMAPASIGEESLVAPSTDAS NVSAPAPNANSDAYFQGLALIKTLVKLLPCWLRSNRTVFDTLVLVWKSPARISRLQNEQELILVQVKESKWLVKCFLNYL RHDKDEVNVLFDILTIFLFHSRIDYTFLKEFYIIEVAEGYLPSLKKNLLLHFLNLFQSKQLGHDHLVIVMQMLILPMLAH AFQNDQSWEVVDSAIIKTIVDKLLDPPDEVSAEYDEPLRIELLQLATLLLKYLQTDLVHHRKELIKFGWNHLKREDTASK QWAFVNVCHFLEAYQAPEKIILQVFVALLRTCQPENKMLVKQALDILMPALPRRLPLGDSRMPIWIRYTKKILVEEGHSI PNLIHIFQLIVRHSDLFYSCRAQFVPQMVNSLSRLGLPYNTTAENRRLAIELAGLVVNWERQRQNEMKVEMKVVTDSDAP SQINDVFNPSSAESKRSVDGSTFPEDTTKRVKAEPGLQSLCVMSPGGPSSIPNIETPGSASQPDEEFKPNAAMEEMIINF LIRVALVIEPKDKEASAMYKQALELLSQALEVWPNANVKFNYLEKLLSSIQPSQAKDPSTALAQGLDVMNKVLEKQPHLF IRNNINQISQILEPCFKHKLLDAGKSFCSLLKMIFVAFPQEATTTPPDVKQLYQKLDDLIQKHVTTVTVPQTSSDDNNAS SISFLLLVIKTLTEVQRNFIDPSILVRILQRLQRDMGSSVGSHIKQGQRTDPDSAVTSSRQGADVGAVISNLKSILKLIS ERVMLVPECKRSVSQVLNALLSEKGIDASVLLCILDVIKGWIEDDFCKQGNSATSSAFLTPKEIVTFLQKLSQVDKQNFT PVSLEEWDRKYLELLYGTCADSNKYHQSLREEVFKKVERQFMLGLRARDPEIRMKFFSIYHESLQKTLFTRLQFIIQVQD WAALSDVFWLKQGLDLLLAILVEDKPITLAPNSARVQPLLVSSSLLESSGMQHKVNDVSEGTDDAPLTFDTLVFKHAQFL NNMSKLQVADLLIPLRELAHTEANVAYHLWVLVFPIVWVTLNKEDQVTLAKPMITLLSKDYHKRQQGSRPNVVQALLEGL QLSHPQPRMPSELIKYIGKTFNAWHIALSLLESHVMLFPTDSKCSESLAELYRLLNEEDMRCGLWKKKSVTAETRAGLSL VQHGYWHRAQSLFYQAMVKATQGTYNNTVPKAEMCLWEEQWLYCASQLCQWDALADFGKSIENYEILLDSLWKSPDWTYM KEHVISKAQVEETPKLRLIQSYFALHDKNTNGVGDAENTVGKGVDLALEQWWQLPEMSVHSRIPLLQQFQQLVEVQESAR ILIDISNGNKLNGNSVVGVQGNLYADLKDILETWRLRTPNEWDHMSVWYDLLQWRNEMYNSVIEAFKDFGATNSALHHLG YRDKAWTVNRLAHIARKQGLFDVCVTILEKLYGHSTMEVQEAFVKITEQAKANLETKGELTTGLNLINSTNLEYFPAKHK AEIFRLKGDFLLKVNDSDGANLAYSNAISLFKNLPKGWISWGNYCDMAYRDTHEEIWLEYAVSCFLQGIKFGVSNSRSHL ARVLYLLSFDTPNEPVGRAFDKLYEQVPHWVWLSWIPQLLLSLQRTEAPHCKLVLLKIATLYPQALYYWLRTYLLERRDV ANKSELGRIQMAQQRTQQSVSGTSGGSLGGLADGNARLQGPGGSALSSDIQVHQGSQSASGIGSHDGGNSHGQEPERSTS AESNMHNGNDQPLQQGSANLNEGGQNNLRRAGALGFVASAASAFDAAKDIMEALRGKHANLAGELEVLLTEIGSRFVTLP EERLLAVVNALLHRCYKYPTATTAEVPQSLKKELSGVCRACFSADAVNKHVDFVREYKQDFERDLDPESTATFPSTLSQL TERLKHWKNVLQSNVEDRFPAVLKLEEESRVLRDFHVIDVEVPGQYFTNQEIAPDHTVKLDRVAADIPIVRRHGSSFRRL TLIGSDGSQRHFIVQTSLTPNARSDERILQLFRVMNQMFEKHKESRRRHICIHTPIIIPVWSQVRMVEDDLMYSTFLEVY ENHCARNDREADQPITFFKEKLNQAINGQISPEAVVDLRLQAYNLITKQMVSDNIFSQYMYKTLPSGNHIWAFKKQFAIQ LALSSFMSFMLQIGGRSPNKILFAKNTGKIFQTDFHPAYDANGLIEFSEPVPFRLTRSMQAFFTHGVEGLIVSSMCAAAQ AVASPKQSQHLWHHLAMFFRDELLSWSWRRPLGMPMVPMAAGGTMSPVDFKQKVITNVEHVVARVKGIAPQKFSDEEDNV MDPPQSLQRGVTELVEAALNPRNLCMMDPTWHPWF
Download Protein Sequence

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER
PTHR11139:SF105
1 3875 3875 0.0 –
PANTHER
PTHR11139
1 3875 3875 0.0 –
SUPERFAMILY
SSF48371
65 830 766 3.15E-15
IPR016024
SUPERFAMILY
SSF48371
556 1521 966 1.2E-32
IPR016024
SUPERFAMILY
SSF48371
1287 2348 1062 2.38E-14
IPR016024
MobiDBLite
mobidb-lite
2008 2027 20 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2279 2299 21 - –
ProSiteProfiles
PS51189
2653 3196 544 21.125
IPR014009
Pfam
PF02259
2786 3124 339 1.9E-41
IPR003151
MobiDBLite
mobidb-lite
3212 3228 17 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
3212 3305 94 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
3241 3305 65 - –
Coils
Coil
3331 3351 21 - –
SUPERFAMILY
SSF56112
3435 3796 362 1.12E-50
IPR011009
CDD
cd05163
3500 3788 289 5.74752E-111 –
ProSiteProfiles
PS50290
3530 3739 210 14.022
IPR000403
SMART
SM00146
3536 3843 308 1.7E-9
IPR000403
Pfam
PF00454
3542 3787 246 7.3E-25
IPR000403
Gene3D
G3DSA:1.10.1070.11
3637 3786 150 6.8E-8
IPR036940
ProSiteProfiles
PS51190
3839 3875 37 13.446
IPR003152
SMART
SM01343
3843 3875 33 2.3E-6
IPR003152
Pfam
PF02260
3850 3875 26 8.1E-6
IPR003152

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
GO:0005515
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Subterm of
GO:0016301
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.
Subterm of

Genome browser

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0381400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…