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LotjaGi2g1v0381400.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0381400
Transcript ID LotjaGi2g1v0381400.2
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Transcription-associated protein 1; TAIR: AT2G17930.1 Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein with FAT domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8I8U7|TRA1_DROME Transcription-associated protein 1; TrEMBL-Plants: tr|V7CI88|V7CI88_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0381400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:87777745..87807507) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

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CDS sequence (LotjaGi2g1v0381400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

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ACATCTTCTCGTCAAGGTGCTGATGTTGGAGCTGTTATTTCAAATCTGAAATCCATCTTAAAACTTATCTCTGAGAGAGT GATGCTTGTTCCTGAGTGCAAGCGGTCTGTATCTCAAGTATTGAATGCCTTGCTCTCTGAGAAAGGTATTGATGCAAGTG TCCTTCTTTGCATACTTGATGTGATTAAAGGGTGGATTGAAGATGATTTCTGTAAACAAGGAAATTCAGCCACATCAAGT GCCTTTCTCACTCCCAAGGAGATAGTTACCTTTCTTCAGAAGCTTTCACAAGTTGATAAACAAAACTTCACACCGGTTTC TCTCGAAGAATGGGACCGGAAATATCTCGAGCTTCTTTATGGGACTTGTGCAGATTCAAATAAATACCATCAATCCTTGC GTGAAGAGGTTTTCAAGAAGGTGGAAAGGCAGTTTATGCTTGGTTTACGAGCTAGAGATCCTGAAATTCGGATGAAATTC TTCTCTATCTATCACGAGTCTCTTCAGAAAACTCTTTTCACCAGGCTTCAATTCATTATCCAAGTTCAAGACTGGGCGGC TTTGAGTGATGTCTTCTGGCTCAAACAAGGTCTTGATCTTCTCTTGGCAATATTAGTCGAGGACAAACCTATTACACTAG CTCCAAATTCAGCCAGGGTTCAACCACTTCTGGTTTCAAGCTCTCTTCTGGAATCATCTGGGATGCAGCACAAGGTTAAT GATGTATCTGAAGGAACTGATGATGCTCCACTAACGTTTGACACCCTTGTGTTTAAACATGCCCAGTTTCTTAATAATAT GAGCAAACTCCAGGTGGCTGATCTATTAATTCCATTGAGAGAGTTGGCCCATACAGAAGCTAATGTTGCATACCATTTGT GGGTTCTGGTATTTCCAATTGTCTGGGTTACATTAAATAAGGAAGATCAAGTCACACTTGCTAAACCAATGATTACCCTT TTGTCTAAAGATTACCATAAGAGGCAGCAAGGCAGCAGACCAAATGTAGTGCAAGCACTATTAGAAGGGCTTCAGTTGAG CCATCCTCAACCCAGAATGCCAAGTGAGCTCATTAAATATATCGGGAAAACATTCAATGCATGGCACATTGCACTGTCTT TGCTTGAAAGTCATGTTATGCTGTTCCCTACTGATTCCAAATGCTCTGAGTCTCTGGCTGAGCTCTATCGTTTGCTCAAT GAAGAGGATATGAGGTGTGGGCTGTGGAAGAAGAAATCAGTCACTGCAGAAACCAGGGCAGGGCTTTCTCTTGTTCAGCA TGGTTACTGGCACCGTGCTCAAAGTCTCTTTTATCAAGCCATGGTGAAGGCAACTCAAGGAACATATAACAACACTGTAC CTAAGGCTGAGATGTGTCTATGGGAAGAGCAATGGCTATACTGTGCGAGTCAACTTTGTCAATGGGATGCATTGGCAGAC TTTGGCAAGAGTATTGAGAATTATGAAATTCTGCTTGACAGTCTTTGGAAATCGCCTGATTGGACATATATGAAGGAGCA TGTCATTTCTAAAGCTCAAGTAGAAGAAACTCCAAAACTTCGTTTAATCCAATCATACTTTGCCCTTCATGACAAAAATA CAAATGGTGTGGGGGACGCTGAGAACACAGTGGGTAAAGGTGTTGATCTTGCTCTAGAACAATGGTGGCAGCTGCCTGAA ATGTCTGTTCATTCCAGAATTCCCCTTCTGCAGCAATTCCAACAATTAGTTGAGGTTCAAGAATCAGCTAGGATTCTAAT TGACATTTCCAATGGAAATAAACTCAATGGAAATTCGGTGGTTGGTGTGCAAGGAAACCTTTATGCCGATCTGAAGGACA TCCTAGAGACTTGGAGACTCAGAACTCCAAATGAATGGGACCATATGTCTGTTTGGTACGATTTGCTACAGTGGAGGAAT GAAATGTATAATTCTGTCATAGAAGCTTTCAAAGATTTTGGTGCCACAAATTCAGCGCTTCATCATCTTGGGTACCGCGA CAAAGCTTGGACTGTCAACAGGCTTGCTCATATTGCTCGTAAGCAGGGCCTGTTTGATGTTTGTGTCACCATACTTGAAA AATTATATGGCCATTCAACCATGGAAGTGCAGGAAGCATTTGTTAAGATTACTGAGCAGGCAAAGGCGAATTTGGAAACC AAGGGAGAACTCACAACCGGTCTTAATCTGATAAACAGCACTAATCTAGAGTATTTTCCTGCAAAGCACAAGGCTGAAAT TTTCCGTCTGAAAGGGGATTTCTTGTTAAAAGTGAATGACTCGGACGGTGCTAATCTTGCTTATTCTAATGCCATTAGTC TTTTTAAAAACTTGCCTAAGGGATGGATAAGCTGGGGAAATTATTGTGACATGGCTTACAGAGATACTCATGAAGAAATT TGGTTGGAATATGCTGTCAGTTGCTTTTTGCAAGGTATAAAATTTGGTGTGTCCAATTCAAGAAGTCATCTTGCCCGTGT TCTTTATCTTCTTAGCTTTGATACTCCTAATGAGCCTGTTGGGAGGGCGTTTGATAAGTTATATGAACAAGTACCGCATT GGGTTTGGCTCTCTTGGATACCACAGCTCTTGCTCTCTCTCCAGAGGACAGAAGCTCCTCATTGTAAACTTGTTCTTCTG AAGATCGCAACCTTGTACCCTCAGGCTCTCTATTATTGGCTGCGTACGTACTTGTTGGAACGGCGTGATGTTGCTAATAA ATCTGAACTTGGTAGAATACAAATGGCACAGCAAAGAACGCAGCAAAGTGTCTCCGGTACTAGTGGAGGTTCTCTTGGTG GATTGGCAGATGGAAATGCAAGACTGCAAGGTCCAGGTGGGAGTGCCTTATCATCTGATATTCAAGTTCACCAAGGCTCT CAGTCTGCTAGTGGGATTGGATCTCATGATGGTGGGAACTCTCACGGGCAAGAGCCTGAAAGATCTACAAGTGCAGAAAG CAACATGCACAATGGCAATGACCAACCATTGCAGCAAGGTTCTGCAAACCTCAATGAGGGTGGTCAGAATAATTTAAGGC GTGCTGGTGCTTTAGGTTTTGTGGCTTCAGCTGCCAGTGCTTTCGATGCTGCCAAGGATATAATGGAGGCTCTTAGAGGC AAGCATGCTAACTTGGCTGGTGAACTCGAGGTTCTACTAACAGAAATTGGTTCAAGGTTTGTCACTCTGCCTGAAGAGAG GCTTTTGGCAGTGGTTAATGCTTTGCTCCACCGCTGCTACAAATATCCAACAGCTACAACTGCTGAAGTTCCTCAGTCTC TGAAGAAAGAGCTCTCAGGTGTTTGCAGGGCTTGCTTTTCCGCAGATGCTGTAAATAAGCATGTTGATTTTGTGAGGGAG TACAAACAGGATTTTGAACGTGATCTGGATCCCGAAAGCACTGCCACTTTCCCATCTACCCTCTCTCAACTGACCGAGCG GTTGAAACACTGGAAAAATGTTCTGCAAAGTAATGTTGAGGACAGGTTTCCTGCAGTGTTGAAGCTAGAAGAAGAAAGCA GGGTATTGCGAGACTTCCATGTTATTGATGTTGAAGTTCCAGGCCAGTATTTCACCAATCAGGAAATTGCACCAGATCAC ACTGTGAAGTTAGATAGGGTCGCAGCTGATATTCCAATTGTGCGAAGGCATGGGAGCAGTTTTCGGCGTTTGACTCTGAT TGGCTCTGATGGTTCACAACGCCATTTTATTGTCCAGACCTCTTTGACTCCCAATGCTAGAAGTGATGAGCGCATATTGC AGCTTTTCCGTGTGATGAACCAAATGTTTGAGAAGCACAAGGAATCAAGACGCCGTCACATATGCATTCATACACCAATA ATTATTCCTGTTTGGTCCCAGGTTCGCATGGTAGAAGATGATTTGATGTATAGTACTTTCCTTGAGGTCTATGAGAATCA TTGTGCAAGGAATGATCGTGAGGCTGATCAGCCAATAACCTTTTTCAAGGAAAAGTTGAACCAGGCTATAAATGGACAAA TATCACCAGAAGCTGTTGTTGATCTCCGTTTGCAAGCTTATAATTTAATAACAAAACAAATGGTTAGTGACAACATCTTT TCACAGTATATGTACAAAACTCTGCCAAGTGGAAACCATATATGGGCTTTCAAGAAGCAATTTGCCATCCAGTTGGCCCT TTCGAGTTTCATGTCGTTCATGTTACAAATTGGTGGGAGGTCTCCGAACAAGATTTTGTTTGCGAAGAACACTGGAAAAA TATTTCAAACTGATTTTCATCCTGCATATGATGCAAATGGACTGATCGAGTTCAGTGAGCCAGTTCCGTTCAGGCTAACA AGGAGTATGCAAGCATTCTTCACACATGGAGTAGAAGGTCTTATTGTATCATCAATGTGTGCAGCTGCACAAGCTGTCGC TTCCCCTAAGCAAAGTCAACATTTGTGGCATCATCTAGCGATGTTTTTCCGCGATGAGCTACTGTCTTGGTCTTGGAGAA GACCGCTTGGGATGCCCATGGTCCCTATGGCTGCGGGTGGTACTATGAGCCCTGTTGACTTCAAACAAAAGGTTATTACA AATGTGGAACATGTTGTAGCAAGGGTTAAGGGAATAGCACCGCAGAAATTTTCTGATGAGGAGGACAATGTGATGGATCC ACCGCAATCGCTGCAGAGGGGTGTTACTGAGTTGGTTGAAGCTGCCTTGAATCCAAGGAACTTGTGCATGATGGATCCAA CATGGCATCCCTGGTTCTAG
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Protein sequence (LotjaGi2g1v0381400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MHDASLSLSIHTTCARLMLNLVEPIFEKGVDQQSTDEARILLGRILDAFVGKFSTFKRTIPQLLEEGEEGKGRATLRSKL ELPVQAVLNLQVPVEHSKEVNDCKHLIKTLVMGMKTIIWSITHAHSPRSQVLVSSSSNLSPPQALRGMREDEVCKASGVL KSGVHCLALFKEKDEEREMLHLFSQILAIMEPRDLMDMFSLCMPELFECMISNTQLVHIFSTLLAAPKVYRPFADVLVNF LVSSKLDVLKQPDSPASKLVLHLFRFIFGAVSKAPSDFERILQPHVPVIMEFCMKNATEVETPLGYMQLLRTMFRALSGC KFELLLRDLIPMLQPCLNMLLAMLEGPTGEDMRDLLLELCMTLPARLSSLLPYLSRLMKPLVLCLKGNDELVSLGLRTLE FWVDSLNPDFLEPSMANVMSAVILALWSHLRPAPYPWGAKALQLLGKLGGRNRRFLKEPLALECKENPEHGLRLILTFEP ATPFLVPLDRCINLAVEAVMNKNCGMDAFYRKQALKFLCVCLSSQLNLPGAVADEGSTSKQLSTLLVSAVDQSSRRSEST DVKADLGVKTKTQLMAEKSVFKILLTTVIAANGEPDLTDPTDDFVVNICRHFAMIFHIDSSSSNASSAVLGGSSLSNNIH VGSRPKMSTCSNLKELDPLIFLDALVDVLADDNRLHAKAALGSLNVFAETLVFLARSKHTDFIMSRGPGTPMIVSSPSMN PVYSPPPSIRVPVFEQLLPRLLHCCYGLTWQAQMGGVMGLGALVGKVTVETLCLFQVRIVRGLIYVLKKLPIYASKEQEE TSQVLTQVLRVVNNADEANSEARRQSFQGVVDFLAQELFNQNASIIVRKNVQSCLALLASRTGSEVSELLESLYQPFLQP LIMRPLKLKTVDQQVGTVTALNFCLALRPPLLKLTPELVNFLQDALQIAESDENAWVAKFINPKVVTSLTKLRTACIELL CTTMAWADFKTPNHSELRAKIISMFFKSLTCRIPEIVAVAKEGLRQVINQRMPKELLQSSLRPILVNLAHTKNLSMPLLL GLARLLELLSNWFNVTLGGKLLEHLKRWLEPEKLAQSQKSWKAGEEPKIAAAIIELFHLLPSAASKFLDELVTLTIDLEG ALPPGQVYSEINSPYRLPLTKFLNRYAPLAVDYFLARLSEPKYFRRFMYIIRSEAGQPLRDELAKSPQKILASAFSEFLP KSDVAMAPASIGEESLVAPSTDASNVSAPAPNANSDAYFQGLALIKTLVKLLPCWLRSNRTVFDTLVLVWKSPARISRLQ NEQELILVQVKESKWLVKCFLNYLRHDKDEVNVLFDILTIFLFHSRIDYTFLKEFYIIEVAEGYLPSLKKNLLLHFLNLF QSKQLGHDHLVIVMQMLILPMLAHAFQNDQSWEVVDSAIIKTIVDKLLDPPDEVSAEYDEPLRIELLQLATLLLKYLQTD LVHHRKELIKFGWNHLKREDTASKQWAFVNVCHFLEAYQAPEKIILQVFVALLRTCQPENKMLVKQALDILMPALPRRLP LGDSRMPIWIRYTKKILVEEGHSIPNLIHIFQLIVRHSDLFYSCRAQFVPQMVNSLSRLGLPYNTTAENRRLAIELAGLV VNWERQRQNEMKVEMKVVTDSDAPSQINDVFNPSSAESKRSVDGSTFPEDTTKRVKAEPGLQSLCVMSPGGPSSIPNIET PGSASQPDEEFKPNAAMEEMIINFLIRVALVIEPKDKEASAMYKQALELLSQALEVWPNANVKFNYLEKLLSSIQPSQAK DPSTALAQGLDVMNKVLEKQPHLFIRNNINQISQILEPCFKHKLLDAGKSFCSLLKMIFVAFPQEATTTPPDVKQLYQKL DDLIQKHVTTVTVPQTSSDDNNASSISFLLLVIKTLTEVQRNFIDPSILVRILQRLQRDMGSSVGSHIKQGQRTDPDSAV TSSRQGADVGAVISNLKSILKLISERVMLVPECKRSVSQVLNALLSEKGIDASVLLCILDVIKGWIEDDFCKQGNSATSS AFLTPKEIVTFLQKLSQVDKQNFTPVSLEEWDRKYLELLYGTCADSNKYHQSLREEVFKKVERQFMLGLRARDPEIRMKF FSIYHESLQKTLFTRLQFIIQVQDWAALSDVFWLKQGLDLLLAILVEDKPITLAPNSARVQPLLVSSSLLESSGMQHKVN DVSEGTDDAPLTFDTLVFKHAQFLNNMSKLQVADLLIPLRELAHTEANVAYHLWVLVFPIVWVTLNKEDQVTLAKPMITL LSKDYHKRQQGSRPNVVQALLEGLQLSHPQPRMPSELIKYIGKTFNAWHIALSLLESHVMLFPTDSKCSESLAELYRLLN EEDMRCGLWKKKSVTAETRAGLSLVQHGYWHRAQSLFYQAMVKATQGTYNNTVPKAEMCLWEEQWLYCASQLCQWDALAD FGKSIENYEILLDSLWKSPDWTYMKEHVISKAQVEETPKLRLIQSYFALHDKNTNGVGDAENTVGKGVDLALEQWWQLPE MSVHSRIPLLQQFQQLVEVQESARILIDISNGNKLNGNSVVGVQGNLYADLKDILETWRLRTPNEWDHMSVWYDLLQWRN EMYNSVIEAFKDFGATNSALHHLGYRDKAWTVNRLAHIARKQGLFDVCVTILEKLYGHSTMEVQEAFVKITEQAKANLET KGELTTGLNLINSTNLEYFPAKHKAEIFRLKGDFLLKVNDSDGANLAYSNAISLFKNLPKGWISWGNYCDMAYRDTHEEI WLEYAVSCFLQGIKFGVSNSRSHLARVLYLLSFDTPNEPVGRAFDKLYEQVPHWVWLSWIPQLLLSLQRTEAPHCKLVLL KIATLYPQALYYWLRTYLLERRDVANKSELGRIQMAQQRTQQSVSGTSGGSLGGLADGNARLQGPGGSALSSDIQVHQGS QSASGIGSHDGGNSHGQEPERSTSAESNMHNGNDQPLQQGSANLNEGGQNNLRRAGALGFVASAASAFDAAKDIMEALRG KHANLAGELEVLLTEIGSRFVTLPEERLLAVVNALLHRCYKYPTATTAEVPQSLKKELSGVCRACFSADAVNKHVDFVRE YKQDFERDLDPESTATFPSTLSQLTERLKHWKNVLQSNVEDRFPAVLKLEEESRVLRDFHVIDVEVPGQYFTNQEIAPDH TVKLDRVAADIPIVRRHGSSFRRLTLIGSDGSQRHFIVQTSLTPNARSDERILQLFRVMNQMFEKHKESRRRHICIHTPI IIPVWSQVRMVEDDLMYSTFLEVYENHCARNDREADQPITFFKEKLNQAINGQISPEAVVDLRLQAYNLITKQMVSDNIF SQYMYKTLPSGNHIWAFKKQFAIQLALSSFMSFMLQIGGRSPNKILFAKNTGKIFQTDFHPAYDANGLIEFSEPVPFRLT RSMQAFFTHGVEGLIVSSMCAAAQAVASPKQSQHLWHHLAMFFRDELLSWSWRRPLGMPMVPMAAGGTMSPVDFKQKVIT NVEHVVARVKGIAPQKFSDEEDNVMDPPQSLQRGVTELVEAALNPRNLCMMDPTWHPWF
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Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER
PTHR11139:SF105
1 3499 3499 0.0 –
PANTHER
PTHR11139
1 3499 3499 0.0 –
SUPERFAMILY
SSF48371
174 1145 972 2.61E-33
IPR016024
SUPERFAMILY
SSF48371
908 1972 1065 1.58E-14
IPR016024
MobiDBLite
mobidb-lite
1632 1651 20 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
1903 1923 21 - –
ProSiteProfiles
PS51189
2277 2820 544 21.125
IPR014009
Pfam
PF02259
2410 2748 339 1.7E-41
IPR003151
MobiDBLite
mobidb-lite
2836 2852 17 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2836 2929 94 - –
MobiDBLite
mobidb-lite
2865 2929 65 - –
Coils
Coil
2955 2975 21 - –
SUPERFAMILY
SSF56112
3059 3420 362 9.69E-51
IPR011009
CDD
cd05163
3124 3412 289 1.29611E-111 –
ProSiteProfiles
PS50290
3154 3363 210 14.022
IPR000403
SMART
SM00146
3160 3467 308 1.7E-9
IPR000403
Pfam
PF00454
3166 3411 246 6.4E-25
IPR000403
Gene3D
G3DSA:1.10.1070.11
3261 3410 150 6.0E-8
IPR036940
ProSiteProfiles
PS51190
3463 3499 37 13.446
IPR003152
SMART
SM01343
3467 3499 33 2.3E-6
IPR003152
Pfam
PF02260
3474 3499 26 7.3E-6
IPR003152

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
GO:0005515
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Subterm of
GO:0016301
Molecular function Kinase activity Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule.
Subterm of

Genome browser

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0381400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…