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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0381400 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0381400.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Transcription-associated protein 1; TAIR: AT2G17930.1 Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein with FAT domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8I8U7|TRA1_DROME Transcription-associated protein 1; TrEMBL-Plants: tr|V7CI88|V7CI88_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0381400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:87778332..87801640) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCAGGAATGAAAACCATCATATGGAGCATCACTCATGCACATTCCCCTAGATCGCAGGTAATAAATAATTTGTATAATAA TTTTCTGTGGATTTGCCACCTCCTGCACTCCCATATTATGTTTCTCGTGTATGAAATTTGCTCTACCCATGAAACATTAC AGGTGCTTGTCTCGTCTTCATCTAATTTATCACCACCTCAAGCATTGAGAGGCATGAGAGAAGATGAGGTAATATGGATT GGCTTAACTCTAACATTGGTGTTTCTAAGCTTAACAGTTTAAGTTGACTTAAGAGTCTTGTGTAGGTCTGCAAAGCCTCT GGTGTTCTAAAAAGTGGGGTTCATTGCTTAGCACTGTTTAAGGAGAAGGATGAGGAGAGGGAAATGCTTCATCTCTTCTC ACAGATTTTAGCCATCATGGAACCTCGAGATCTTATGGATATGTTCTCTCTGTGTATGCCCGAGCTTTTTGAGTGCATGA TCTCCAACACTCAACTTGTCCATATATTTTCTACTCTTCTTGCAGCCCCAAAAGTGTACCGGCCATTTGCTGATGTGCTT GTTAATTTTCTTGTAAGCAGCAAGCTTGATGTCTTGAAGCAACCAGACTCACCCGCTTCAAAACTCGTTTTGCATCTCTT TCGCTTTATATTTGGTGCTGTTTCTAAAGCACCTTCAGATTTTGAAAGGATTTTGCAGCCTCACGTGCCTGTTATCATGG AATTTTGCATGAAAAATGCTACTGAAGTTGAAACACCTCTTGGTTACATGCAGTTGCTTCGAACAATGTTCAGGGCACTT TCAGGGTGCAAATTTGAACTTTTGCTACGGGACTTGATCCCCATGTTACAGCCATGCCTCAATATGCTGTTGGCTATGCT GGAAGGGCCAACTGGGGAAGATATGAGAGATCTTTTATTAGAGCTCTGCATGACCTTACCTGCTCGTTTGAGCTCTCTGT 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ATGTTACAAATTGGTGGGAGGTCTCCGAACAAGATTTTGTTTGCGAAGAACACTGGAAAAATATTTCAAACTGATTTTCA TCCTGCATATGATGCAAATGGACTGATCGAGTTCAGTGAGCCAGTTCCGTTCAGGCTAACAAGGAGTATGCAAGCATTCT TCACACATGGAGTAGAAGGTCTTATTGTATCATCAATGTGTGCAGCTGCACAAGCTGTCGCTTCCCCTAAGCAAAGTCAA CATTTGTGGCATCATCTAGCGATGTTTTTCCGCGATGAGCTACTGTCTTGGTCTTGGAGAAGACCGCTTGGGATGCCCAT GGTCCCTATGGCTGCGGGTGGTACTATGAGCCCTGTTGACTTCAAACAAAAGGTTATTACAAATGTGGAACATGTTGTAG CAAGGGTTAAGGGAATAGCACCGCAGAAATTTTCTGATGAGGAGGACAATGTGATGGATCCACCGCAATCGCTGCAGAGG GGTGTTACTGAGTTGGTTGAAGCTGCCTTGAATCCAAGGAACTTGTGCATGATGGATCCAACATGGCATCCCTGGTTCTA G
Protein sequence (LotjaGi2g1v0381400.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKTIIWSITHAHSPRSQVLVSSSSNLSPPQALRGMREDEVCKASGVLKSGVHCLALFKEKDEEREMLHLFSQILAIMEPR DLMDMFSLCMPELFECMISNTQLVHIFSTLLAAPKVYRPFADVLVNFLVSSKLDVLKQPDSPASKLVLHLFRFIFGAVSK APSDFERILQPHVPVIMEFCMKNATEVETPLGYMQLLRTMFRALSGCKFELLLRDLIPMLQPCLNMLLAMLEGPTGEDMR DLLLELCMTLPARLSSLLPYLSRLMKPLVLCLKGNDELVSLGLRTLEFWVDSLNPDFLEPSMANVMSAVILALWSHLRPA PYPWGAKALQLLGKLGGRNRRFLKEPLALECKENPEHGLRLILTFEPATPFLVPLDRCINLAVEAVMNKNCGMDAFYRKQ ALKFLCVCLSSQLNLPGAVADEGSTSKQLSTLLVSAVDQSSRRSESTDVKADLGVKTKTQLMAEKSVFKILLTTVIAANG EPDLTDPTDDFVVNICRHFAMIFHIDSSSSNASSAVLGGSSLSNNIHVGSRPKMSTCSNLKELDPLIFLDALVDVLADDN RLHAKAALGSLNVFAETLVFLARSKHTDFIMSRGPGTPMIVSSPSMNPVYSPPPSIRVPVFEQLLPRLLHCCYGLTWQAQ MGGVMGLGALVGKVTVETLCLFQVRIVRGLIYVLKKLPIYASKEQEETSQVLTQVLRVVNNADEANSEARRQSFQGVVDF LAQELFNQNASIIVRKNVQSCLALLASRTGSEVSELLESLYQPFLQPLIMRPLKLKTVDQQVGTVTALNFCLALRPPLLK LTPELVNFLQDALQIAESDENAWVAKFINPKVVTSLTKLRTACIELLCTTMAWADFKTPNHSELRAKIISMFFKSLTCRI PEIVAVAKEGLRQVINQRMPKELLQSSLRPILVNLAHTKNLSMPLLLGLARLLELLSNWFNVTLGGKLLEHLKRWLEPEK LAQSQKSWKAGEEPKIAAAIIELFHLLPSAASKFLDELVTLTIDLEGALPPGQVYSEINSPYRLPLTKFLNRYAPLAVDY FLARLSEPKYFRRFMYIIRSEAGQPLRDELAKSPQKILASAFSEFLPKSDVAMAPASIGEESLVAPSTDASNVSAPAPNA NSDAYFQGLALIKTLVKLLPCWLRSNRTVFDTLVLVWKSPARISRLQNEQELILVQVKESKWLVKCFLNYLRHDKDEVNV LFDILTIFLFHSRIDYTFLKEFYIIEVAEGYLPSLKKNLLLHFLNLFQSKQLGHDHLVIVMQMLILPMLAHAFQNDQSWE VVDSAIIKTIVDKLLDPPDEVSAEYDEPLRIELLQLATLLLKYLQTDLVHHRKELIKFGWNHLKREDTASKQWAFVNVCH FLEAYQAPEKIILQVFVALLRTCQPENKMLVKQALDILMPALPRRLPLGDSRMPIWIRYTKKILVEEGHSIPNLIHIFQL IVRHSDLFYSCRAQFVPQMVNSLSRLGLPYNTTAENRRLAIELAGLVVNWERQRQNEMKVEMKVVTDSDAPSQINDVFNP SSAESKRSVDGSTFPEDTTKRVKAEPGLQSLCVMSPGGPSSIPNIETPGSASQPDEEFKPNAAMEEMIINFLIRVALVIE PKDKEASAMYKQALELLSQALEVWPNANVKFNYLEKLLSSIQPSQAKDPSTALAQGLDVMNKVLEKQPHLFIRNNINQIS QILEPCFKHKLLDAGKSFCSLLKMIFVAFPQEATTTPPDVKQLYQKLDDLIQKHVTTVTVPQTSSDDNNASSISFLLLVI KTLTEVQRNFIDPSILVRILQRLQRDMGSSVGSHIKQGQRTDPDSAVTSSRQGADVGAVISNLKSILKLISERVMLVPEC KRSVSQVLNALLSEKGIDASVLLCILDVIKGWIEDDFCKQGNSATSSAFLTPKEIVTFLQKLSQVDKQNFTPVSLEEWDR KYLELLYGTCADSNKYHQSLREEVFKKVERQFMLGLRARDPEIRMKFFSIYHESLQKTLFTRLQFIIQVQDWAALSDVFW LKQGLDLLLAILVEDKPITLAPNSARVQPLLVSSSLLESSGMQHKVNDVSEGTDDAPLTFDTLVFKHAQFLNNMSKLQVA DLLIPLRELAHTEANVAYHLWVLVFPIVWVTLNKEDQVTLAKPMITLLSKDYHKRQQGSRPNVVQALLEGLQLSHPQPRM PSELIKYIGKTFNAWHIALSLLESHVMLFPTDSKCSESLAELYRLLNEEDMRCGLWKKKSVTAETRAGLSLVQHGYWHRA QSLFYQAMVKATQGTYNNTVPKAEMCLWEEQWLYCASQLCQWDALADFGKSIENYEILLDSLWKSPDWTYMKEHVISKAQ VEETPKLRLIQSYFALHDKNTNGVGDAENTVGKGVDLALEQWWQLPEMSVHSRIPLLQQFQQLVEVQESARILIDISNGN KLNGNSVVGVQGNLYADLKDILETWRLRTPNEWDHMSVWYDLLQWRNEMYNSVIEAFKDFGATNSALHHLGYRDKAWTVN RLAHIARKQGLFDVCVTILEKLYGHSTMEVQEAFVKITEQAKANLETKGELTTGLNLINSTNLEYFPAKHKAEIFRLKGD FLLKVNDSDGANLAYSNAISLFKNLPKGWISWGNYCDMAYRDTHEEIWLEYAVSCFLQGIKFGVSNSRSHLARVLYLLSF DTPNEPVGRAFDKLYEQVPHWVWLSWIPQLLLSLQRTEAPHCKLVLLKIATLYPQALYYWLRTYLLERRDVANKSELGRI QMAQQRTQQSVSGTSGGSLGGLADGNARLQGPGGSALSSDIQVHQGSQSASGIGSHDGGNSHGQEPERSTSAESNMHNGN DQPLQQGSANLNEGGQNNLRRAGALGFVASAASAFDAAKDIMEALRGKHANLAGELEVLLTEIGSRFVTLPEERLLAVVN ALLHRCYKYPTATTAEVPQSLKKELSGVCRACFSADAVNKHVDFVREYKQDFERDLDPESTATFPSTLSQLTERLKHWKN VLQSNVEDRFPAVLKLEEESRVLRDFHVIDVEVPGQYFTNQEIAPDHTVKLDRVAADIPIVRRHGSSFRRLTLIGSDGSQ RHFIVQTSLTPNARSDERILQLFRVMNQMFEKHKESRRRHICIHTPIIIPVWSQVRMVEDDLMYSTFLEVYENHCARNDR EADQPITFFKEKLNQAINGQISPEAVVDLRLQAYNLITKQMVSDNIFSQYMYKTLPSGNHIWAFKKQFAIQLALSSFMSF MLQIGGRSPNKILFAKNTGKIFQTDFHPAYDANGLIEFSEPVPFRLTRSMQAFFTHGVEGLIVSSMCAAAQAVASPKQSQ HLWHHLAMFFRDELLSWSWRRPLGMPMVPMAAGGTMSPVDFKQKVITNVEHVVARVKGIAPQKFSDEEDNVMDPPQSLQR GVTELVEAALNPRNLCMMDPTWHPWF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 28 | 3386 | 3359 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 28 | 3386 | 3359 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 67 | 1032 | 966 | 8.45E-33 | ||
| SUPERFAMILY | 795 | 1859 | 1065 | 1.81E-14 | ||
| MobiDBLite | 1519 | 1538 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 1790 | 1810 | 21 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 2164 | 2707 | 544 | 21.125 | ||
| Pfam | 2297 | 2635 | 339 | 1.6E-41 | ||
| MobiDBLite | 2723 | 2739 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 2723 | 2816 | 94 | - | – | |
| MobiDBLite | 2752 | 2816 | 65 | - | – | |
| Coils | 2842 | 2862 | 21 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 2946 | 3307 | 362 | 9.28E-51 | ||
| CDD | 3011 | 3299 | 289 | 1.33984E-111 | – | |
| ProSiteProfiles | 3041 | 3250 | 210 | 14.022 | ||
| SMART | 3047 | 3354 | 308 | 1.7E-9 | ||
| Pfam | 3053 | 3298 | 246 | 6.2E-25 | ||
| Gene3D | 3148 | 3297 | 150 | 5.8E-8 | ||
| ProSiteProfiles | 3350 | 3386 | 37 | 13.446 | ||
| SMART | 3354 | 3386 | 33 | 2.3E-6 | ||
| Pfam | 3361 | 3386 | 26 | 7.0E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
| Molecular function | Kinase activity | Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0381400.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…