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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi2g1v0381400 |
Transcript ID | LotjaGi2g1v0381400.4 |
Related isoforms 3 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Transcription-associated protein 1; TAIR: AT2G17930.1 Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein with FAT domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q9Y4A5|TRRAP_HUMAN Transformation/transcription domain-associated protein; TrEMBL-Plants: tr|V7CI88|V7CI88_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0381400 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:87778332..87807005) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAGTCCTGTTCAGAATTTCGAGCAGCATTCTCGTCATCTCGTCGATCCCGACCTCCGTAAGCCCTCTCTCTCTCCCTC TCTATCGATTGTCTTCAGTTCTGAACTTACTTGCAGTAGGAAAATTGATTTCAATTATGCTTGTGTTGTTTCGATTTGTT TTTCATTTCTCTGTTGCTTAGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTGTTGGGGGTGAAAACAGAGATTCAGGCGAGGCTGCA GATGGTGATGGAGGTTAGGGATAGTCTTGAGATTGCACACACAGCTGAGTACTTGAATTTCTTAAAGTGTTACTTCCGGG CGTTCTCTGCGGTGCTGCTGCAAATCACAAAGCCGCAGTTTGAGGACAATCCCGAGCACAAGCTTCGGAATATCGTGGTT GAGATATTGAATAGGCTTCCGCACAGCGAAGTTCTCCGGCCTTTTGTACAGGACCTCTTGAAGGTTGCTATGCAAGTGCT TACGACGGACAATGAGGAGAATGGGTTGATTTGTATCCGTATAATCTTTGACCTTTTGAGGAACTTTAGGCCTACTCTAG AAAATGAAGTCCAGCCGTTTCTGGACTTTGTCTGCAAGATTTACCAAAACTTTAAACTGACAGTTAGACATTTCTTTGAG AATATGGCAAAGACTGGGGAAGATGTCAAGCCGATGGAGACTTCGCTTTCGGATCAAGTTATAAGCGCTGCCAATCCTAC TGGTTCACAGCTTAATCCAAGTACTCGCTCATTCAAGATAGTTACAGAAAGTCCACTGGTGGTGATGTTTCTGTTTCAAT TATATAGTCGCCTTGTTCAAGCAAATATTCCTCAATTATTACCATTGATGGTTGCTGCTATATCAGTTCCTGGCCCTGAA AGGGTTCCTCCTCATTTGAAAACTCATTTCATTGAACTCAAGGGTGCACAGGTTAAGGTAAGGGCTTATGGTGAAAATAT 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0381400.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
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AGTCGCCTTGGATTGCCTTATAATACTACAGCAGAGAACAGACGTCTTGCCATTGAACTTGCTGGGTTAGTGGTTAACTG GGAGAGGCAAAGGCAAAATGAGATGAAAGTTGAGATGAAAGTTGTTACTGATTCTGATGCTCCCAGCCAAATCAATGATG TCTTTAATCCTAGTTCAGCAGAGTCTAAGCGATCTGTTGATGGGTCCACTTTTCCCGAAGACACAACTAAGCGAGTAAAA GCAGAACCTGGTCTGCAATCCTTATGTGTCATGTCACCTGGTGGTCCATCATCAATCCCTAATATTGAAACCCCAGGATC TGCCAGTCAACCAGATGAAGAATTTAAACCAAATGCCGCTATGGAGGAAATGATTATCAATTTTCTTATCAGAGTTGCTT TAGTTATAGAGCCTAAGGACAAAGAAGCAAGTGCAATGTACAAACAAGCTTTGGAGCTACTTTCACAAGCATTAGAAGTC TGGCCCAATGCGAATGTAAAATTTAATTATTTGGAGAAGCTGCTGAGCAGTATACAACCATCTCAAGCAAAAGATCCTTC CACTGCTCTGGCACAGGGTTTGGATGTCATGAACAAAGTCTTAGAGAAACAGCCTCACTTGTTCATAAGAAACAACATTA ACCAAATTTCTCAAATTCTTGAACCTTGTTTCAAGCATAAACTTTTAGATGCTGGGAAGTCTTTTTGCTCACTGTTGAAG ATGATTTTTGTTGCTTTTCCTCAAGAAGCTACTACAACACCTCCTGACGTTAAGCAGTTGTACCAGAAGCTTGATGATTT AATTCAAAAGCATGTTACAACTGTCACAGTTCCTCAAACTTCTAGTGATGATAATAATGCTAGTTCAATTAGTTTCCTGT TGCTTGTCATAAAAACCTTAACAGAGGTTCAAAGGAATTTCATTGATCCTTCAATTTTGGTTCGGATTCTTCAGCGGCTG CAACGTGATATGGGTTCATCAGTAGGTTCTCATATAAAACAAGGTCAGAGAACAGATCCAGATTCAGCTGTCACATCTTC TCGTCAAGGTGCTGATGTTGGAGCTGTTATTTCAAATCTGAAATCCATCTTAAAACTTATCTCTGAGAGAGTGATGCTTG TTCCTGAGTGCAAGCGGTCTGTATCTCAAGTATTGAATGCCTTGCTCTCTGAGAAAGGTATTGATGCAAGTGTCCTTCTT TGCATACTTGATGTGATTAAAGGGTGGATTGAAGATGATTTCTGTAAACAAGGAAATTCAGCCACATCAAGTGCCTTTCT CACTCCCAAGGAGATAGTTACCTTTCTTCAGAAGCTTTCACAAGTTGATAAACAAAACTTCACACCGGTTTCTCTCGAAG AATGGGACCGGAAATATCTCGAGCTTCTTTATGGGACTTGTGCAGATTCAAATAAATACCATCAATCCTTGCGTGAAGAG GTTTTCAAGAAGGTGGAAAGGCAGTTTATGCTTGGTTTACGAGCTAGAGATCCTGAAATTCGGATGAAATTCTTCTCTAT CTATCACGAGTCTCTTCAGAAAACTCTTTTCACCAGGCTTCAATTCATTATCCAAGTTCAAGACTGGGCGGCTTTGAGTG ATGTCTTCTGGCTCAAACAAGGTCTTGATCTTCTCTTGGCAATATTAGTCGAGGACAAACCTATTACACTAGCTCCAAAT TCAGCCAGGGTTCAACCACTTCTGGTTTCAAGCTCTCTTCTGGAATCATCTGGGATGCAGCACAAGGTTAATGATGTATC TGAAGGAACTGATGATGCTCCACTAACGTTTGACACCCTTGTGTTTAAACATGCCCAGTTTCTTAATAATATGAGCAAAC TCCAGGTGGCTGATCTATTAATTCCATTGAGAGAGTTGGCCCATACAGAAGCTAATGTTGCATACCATTTGTGGGTTCTG GTATTTCCAATTGTCTGGGTTACATTAAATAAGGAAGATCAAGTCACACTTGCTAAACCAATGATTACCCTTTTGTCTAA AGATTACCATAAGAGGCAGCAAGGCAGCAGACCAAATGTAGTGCAAGCACTATTAGAAGGGCTTCAGTTGAGCCATCCTC AACCCAGAATGCCAAGTGAGCTCATTAAATATATCGGGAAAACATTCAATGCATGGCACATTGCACTGTCTTTGCTTGAA AGTCATGTTATGCTGTTCCCTACTGATTCCAAATGCTCTGAGTCTCTGGCTGAGCTCTATCGTTTGCTCAATGAAGAGGA TATGAGGTGTGGGCTGTGGAAGAAGAAATCAGTCACTGCAGAAACCAGGGCAGGGCTTTCTCTTGTTCAGCATGGTTACT GGCACCGTGCTCAAAGTCTCTTTTATCAAGCCATGGTGAAGGCAACTCAAGGAACATATAACAACACTGTACCTAAGGCT GAGATGTGTCTATGGGAAGAGCAATGGCTATACTGTGCGAGTCAACTTTGTCAATGGGATGCATTGGCAGACTTTGGCAA GAGTATTGAGAATTATGAAATTCTGCTTGACAGTCTTTGGAAATCGCCTGATTGGACATATATGAAGGAGCATGTCATTT CTAAAGCTCAAGTAGAAGAAACTCCAAAACTTCGTTTAATCCAATCATACTTTGCCCTTCATGACAAAAATACAAATGGT GTGGGGGACGCTGAGAACACAGTGGGTAAAGGTGTTGATCTTGCTCTAGAACAATGGTGGCAGCTGCCTGAAATGTCTGT TCATTCCAGAATTCCCCTTCTGCAGCAATTCCAACAATTAGTTGAGGTTCAAGAATCAGCTAGGATTCTAATTGACATTT CCAATGGAAATAAACTCAATGGAAATTCGGTGGTTGGTGTGCAAGGAAACCTTTATGCCGATCTGAAGGACATCCTAGAG ACTTGGAGACTCAGAACTCCAAATGAATGGGACCATATGTCTGTTTGGTACGATTTGCTACAGTGGAGGAATGAAATGTA TAATTCTGTCATAGAAGCTTTCAAAGATTTTGGTGCCACAAATTCAGCGCTTCATCATCTTGGGTACCGCGACAAAGCTT GGACTGTCAACAGGCTTGCTCATATTGCTCGTAAGCAGGGCCTGTTTGATGTTTGTGTCACCATACTTGAAAAATTATAT GGCCATTCAACCATGGAAGTGCAGGAAGCATTTGTTAAGATTACTGAGCAGGCAAAGGCGAATTTGGAAACCAAGGGAGA ACTCACAACCGGTCTTAATCTGATAAACAGCACTAATCTAGAGTATTTTCCTGCAAAGCACAAGGCTGAAATTTTCCGTC TGAAAGGGGATTTCTTGTTAAAAGTGAATGACTCGGACGGTGCTAATCTTGCTTATTCTAATGCCATTAGTCTTTTTAAA AACTTGCCTAAGGGATGGATAAGCTGGGGAAATTATTGTGACATGGCTTACAGAGATACTCATGAAGAAATTTGGTTGGA ATATGCTGTCAGTTGCTTTTTGCAAGGTATAAAATTTGGTGTGTCCAATTCAAGAAGTCATCTTGCCCGTGTTCTTTATC TTCTTAGCTTTGATACTCCTAATGAGCCTGTTGGGAGGGCGTTTGATAAGTTATATGAACAAGTACCGCATTGGGTTTGG CTCTCTTGGATACCACAGCTCTTGCTCTCTCTCCAGAGGACAGAAGCTCCTCATTGTAAACTTGTTCTTCTGAAGATCGC AACCTTGTACCCTCAGGCTCTCTATTATTGGCTGCGTACGTACTTGTTGGAACGGCGTGATGTTGCTAATAAATCTGAAC TTGGTAGAATACAAATGGCACAGCAAAGAACGCAGCAAAGTGTCTCCGGTACTAGTGGAGGTTCTCTTGGTGGATTGGCA GATGGAAATGCAAGACTGCAAGGTCCAGGTGGGAGTGCCTTATCATCTGATATTCAAGTTCACCAAGGCTCTCAGTCTGC TAGTGGGATTGGATCTCATGATGGTGGGAACTCTCACGGGCAAGAGCCTGAAAGATCTACAAGTGCAGAAAGCAACATGC ACAATGGCAATGACCAACCATTGCAGCAAGGTTCTGCAAACCTCAATGAGGGTGGTCAGAATAATTTAAGGCGTGCTGGT GCTTTAGGTTTTGTGGCTTCAGCTGCCAGTGCTTTCGATGCTGCCAAGGATATAATGGAGGCTCTTAGAGGCAAGCATGC TAACTTGGCTGGTGAACTCGAGGTTCTACTAACAGAAATTGGTTCAAGGTTTGTCACTCTGCCTGAAGAGAGGCTTTTGG CAGTGGTTAATGCTTTGCTCCACCGCTGCTACAAATATCCAACAGCTACAACTGCTGAAGTTCCTCAGTCTCTGAAGAAA GAGCTCTCAGGTGTTTGCAGGGCTTGCTTTTCCGCAGATGCTGTAAATAAGCATGTTGATTTTGTGAGGGAGTACAAACA GGATTTTGAACGTGATCTGGATCCCGAAAGCACTGCCACTTTCCCATCTACCCTCTCTCAACTGACCGAGCGGTTGAAAC ACTGGAAAAATGTTCTGCAAAGTAATGTTGAGGACAGGTTTCCTGCAGTGTTGAAGCTAGAAGAAGAAAGCAGGGTATTG CGAGACTTCCATGTTATTGATGTTGAAGTTCCAGGCCAGTATTTCACCAATCAGGAAATTGCACCAGATCACACTGTGAA GTTAGATAGGGTCGCAGCTGATATTCCAATTGTGCGAAGGCATGGGAGCAGTTTTCGGCGTTTGACTCTGATTGGCTCTG ATGGTTCACAACGCCATTTTATTGTCCAGACCTCTTTGACTCCCAATGCTAGAAGTGATGAGCGCATATTGCAGCTTTTC CGTGTGATGAACCAAATGTTTGAGAAGCACAAGGAATCAAGACGCCGTCACATATGCATTCATACACCAATAATTATTCC TGTTTGGTCCCAGGTTCGCATGGTAGAAGATGATTTGATGTATAGTACTTTCCTTGAGGTCTATGAGAATCATTGTGCAA GGAATGATCGTGAGGCTGATCAGCCAATAACCTTTTTCAAGGAAAAGTTGAACCAGGCTATAAATGGACAAATATCACCA GAAGCTGTTGTTGATCTCCGTTTGCAAGCTTATAATTTAATAACAAAACAAATGGTTAGTGACAACATCTTTTCACAGTA TATGTACAAAACTCTGCCAAGTGGAAACCATATATGGGCTTTCAAGAAGCAATTTGCCATCCAGTTGGCCCTTTCGAGTT TCATGTCGTTCATGTTACAAATTGGTGGGAGGTCTCCGAACAAGATTTTGTTTGCGAAGAACACTGGAAAAATATTTCAA ACTGATTTTCATCCTGCATATGATGCAAATGGACTGATCGAGTTCAGTGAGCCAGTTCCGTTCAGGCTAACAAGGAGTAT GCAAGCATTCTTCACACATGGAGTAGAAGGTCTTATTGTATCATCAATGTGTGCAGCTGCACAAGCTGTCGCTTCCCCTA AGCAAAGTCAACATTTGTGGCATCATCTAGCGATGTTTTTCCGCGATGAGCTACTGTCTTGGTCTTGGAGAAGACCGCTT GGGATGCCCATGGTCCCTATGGCTGCGGGTGGTACTATGAGCCCTGTTGACTTCAAACAAAAGGTTATTACAAATGTGGA ACATGTTGTAGCAAGGGTTAAGGGAATAGCACCGCAGAAATTTTCTGATGAGGAGGACAATGTGATGGATCCACCGCAAT CGCTGCAGAGGGGTGTTACTGAGTTGGTTGAAGCTGCCTTGAATCCAAGGAACTTGTGCATGATGGATCCAACATGGCAT CCCTGGTTCTAG
Protein sequence (LotjaGi2g1v0381400.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSPVQNFEQHSRHLVDPDLQIQARLQMVMEVRDSLEIAHTAEYLNFLKCYFRAFSAVLLQITKPQFEDNPEHKLRNIVVE ILNRLPHSEVLRPFVQDLLKVAMQVLTTDNEENGLICIRIIFDLLRNFRPTLENEVQPFLDFVCKIYQNFKLTVRHFFEN MAKTGEDVKPMETSLSDQVISAANPTGSQLNPSTRSFKIVTESPLVVMFLFQLYSRLVQANIPQLLPLMVAAISVPGPER VPPHLKTHFIELKGAQVKTVSFLTYLLKSYAEYIRPHEESICKSIVNLLVTCSDSVSIRKELLISLKHVLGTDFRRGLFP LIDTLLEERVLVGTGRACFETLRPLAYSLLAEIVHHVRQDLSLSQVEPIFEKGVDQQSTDEARILLGRILDAFVGKFSTF KRTIPQLLEEGEEGKGRATLRSKLELPVQAVLNLQVPVEHSKEVNDCKHLIKTLVMGMKTIIWSITHAHSPRSQVLVSSS SNLSPPQALRGMREDEVCKASGVLKSGVHCLALFKEKDEEREMLHLFSQILAIMEPRDLMDMFSLCMPELFECMISNTQL VHIFSTLLAAPKVYRPFADVLVNFLVSSKLDVLKQPDSPASKLVLHLFRFIFGAVSKAPSDFERILQPHVPVIMEFCMKN ATEVETPLGYMQLLRTMFRALSGCKFELLLRDLIPMLQPCLNMLLAMLEGPTGEDMRDLLLELCMTLPARLSSLLPYLSR LMKPLVLCLKGNDELVSLGLRTLEFWVDSLNPDFLEPSMANVMSAVILALWSHLRPAPYPWGAKALQLLGKLGGRNRRFL KEPLALECKENPEHGLRLILTFEPATPFLVPLDRCINLAVEAVMNKNCGMDAFYRKQALKFLCVCLSSQLNLPGAVADEG STSKQLSTLLVSAVDQSSRRSESTDVKADLGVKTKTQLMAEKSVFKILLTTVIAANGEPDLTDPTDDFVVNICRHFAMIF HIDSSSSNASSAVLGGSSLSNNIHVGSRPKMSTCSNLKELDPLIFLDALVDVLADDNRLHAKAALGSLNVFAETLVFLAR SKHTDFIMSRGPGTPMIVSSPSMNPVYSPPPSIRVPVFEQLLPRLLHCCYGLTWQAQMGGVMGLGALVGKVTVETLCLFQ VRIVRGLIYVLKKLPIYASKEQEETSQVLTQVLRVVNNADEANSEARRQSFQGVVDFLAQELFNQNASIIVRKNVQSCLA LLASRTGSEVSELLESLYQPFLQPLIMRPLKLKTVDQQVGTVTALNFCLALRPPLLKLTPELVNFLQDALQIAESDENAW VAKFINPKVVTSLTKLRTACIELLCTTMAWADFKTPNHSELRAKIISMFFKSLTCRIPEIVAVAKEGLRQVINQRMPKEL LQSSLRPILVNLAHTKNLSMPLLLGLARLLELLSNWFNVTLGGKLLEHLKRWLEPEKLAQSQKSWKAGEEPKIAAAIIEL FHLLPSAASKFLDELVTLTIDLEGALPPGQVYSEINSPYRLPLTKFLNRYAPLAVDYFLARLSEPKYFRRFMYIIRSEAG QPLRDELAKSPQKILASAFSEFLPKSDVAMAPASIGEESLVAPSTDASNVSAPAPNANSDAYFQGLALIKTLVKLLPCWL RSNRTVFDTLVLVWKSPARISRLQNEQELILVQVKESKWLVKCFLNYLRHDKDEVNVLFDILTIFLFHSRIDYTFLKEFY IIEVAEGYLPSLKKNLLLHFLNLFQSKQLGHDHLVIVMQMLILPMLAHAFQNDQSWEVVDSAIIKTIVDKLLDPPDEVSA EYDEPLRIELLQLATLLLKYLQTDLVHHRKELIKFGWNHLKREDTASKQWAFVNVCHFLEAYQAPEKIILQVFVALLRTC QPENKMLVKQALDILMPALPRRLPLGDSRMPIWIRYTKKILVEEGHSIPNLIHIFQLIVRHSDLFYSCRAQFVPQMVNSL SRLGLPYNTTAENRRLAIELAGLVVNWERQRQNEMKVEMKVVTDSDAPSQINDVFNPSSAESKRSVDGSTFPEDTTKRVK AEPGLQSLCVMSPGGPSSIPNIETPGSASQPDEEFKPNAAMEEMIINFLIRVALVIEPKDKEASAMYKQALELLSQALEV WPNANVKFNYLEKLLSSIQPSQAKDPSTALAQGLDVMNKVLEKQPHLFIRNNINQISQILEPCFKHKLLDAGKSFCSLLK MIFVAFPQEATTTPPDVKQLYQKLDDLIQKHVTTVTVPQTSSDDNNASSISFLLLVIKTLTEVQRNFIDPSILVRILQRL QRDMGSSVGSHIKQGQRTDPDSAVTSSRQGADVGAVISNLKSILKLISERVMLVPECKRSVSQVLNALLSEKGIDASVLL CILDVIKGWIEDDFCKQGNSATSSAFLTPKEIVTFLQKLSQVDKQNFTPVSLEEWDRKYLELLYGTCADSNKYHQSLREE VFKKVERQFMLGLRARDPEIRMKFFSIYHESLQKTLFTRLQFIIQVQDWAALSDVFWLKQGLDLLLAILVEDKPITLAPN SARVQPLLVSSSLLESSGMQHKVNDVSEGTDDAPLTFDTLVFKHAQFLNNMSKLQVADLLIPLRELAHTEANVAYHLWVL VFPIVWVTLNKEDQVTLAKPMITLLSKDYHKRQQGSRPNVVQALLEGLQLSHPQPRMPSELIKYIGKTFNAWHIALSLLE SHVMLFPTDSKCSESLAELYRLLNEEDMRCGLWKKKSVTAETRAGLSLVQHGYWHRAQSLFYQAMVKATQGTYNNTVPKA EMCLWEEQWLYCASQLCQWDALADFGKSIENYEILLDSLWKSPDWTYMKEHVISKAQVEETPKLRLIQSYFALHDKNTNG VGDAENTVGKGVDLALEQWWQLPEMSVHSRIPLLQQFQQLVEVQESARILIDISNGNKLNGNSVVGVQGNLYADLKDILE TWRLRTPNEWDHMSVWYDLLQWRNEMYNSVIEAFKDFGATNSALHHLGYRDKAWTVNRLAHIARKQGLFDVCVTILEKLY GHSTMEVQEAFVKITEQAKANLETKGELTTGLNLINSTNLEYFPAKHKAEIFRLKGDFLLKVNDSDGANLAYSNAISLFK NLPKGWISWGNYCDMAYRDTHEEIWLEYAVSCFLQGIKFGVSNSRSHLARVLYLLSFDTPNEPVGRAFDKLYEQVPHWVW LSWIPQLLLSLQRTEAPHCKLVLLKIATLYPQALYYWLRTYLLERRDVANKSELGRIQMAQQRTQQSVSGTSGGSLGGLA DGNARLQGPGGSALSSDIQVHQGSQSASGIGSHDGGNSHGQEPERSTSAESNMHNGNDQPLQQGSANLNEGGQNNLRRAG ALGFVASAASAFDAAKDIMEALRGKHANLAGELEVLLTEIGSRFVTLPEERLLAVVNALLHRCYKYPTATTAEVPQSLKK ELSGVCRACFSADAVNKHVDFVREYKQDFERDLDPESTATFPSTLSQLTERLKHWKNVLQSNVEDRFPAVLKLEEESRVL RDFHVIDVEVPGQYFTNQEIAPDHTVKLDRVAADIPIVRRHGSSFRRLTLIGSDGSQRHFIVQTSLTPNARSDERILQLF RVMNQMFEKHKESRRRHICIHTPIIIPVWSQVRMVEDDLMYSTFLEVYENHCARNDREADQPITFFKEKLNQAINGQISP EAVVDLRLQAYNLITKQMVSDNIFSQYMYKTLPSGNHIWAFKKQFAIQLALSSFMSFMLQIGGRSPNKILFAKNTGKIFQ TDFHPAYDANGLIEFSEPVPFRLTRSMQAFFTHGVEGLIVSSMCAAAQAVASPKQSQHLWHHLAMFFRDELLSWSWRRPL GMPMVPMAAGGTMSPVDFKQKVITNVEHVVARVKGIAPQKFSDEEDNVMDPPQSLQRGVTELVEAALNPRNLCMMDPTWH PWF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 1 | 3843 | 3843 | 0.0 | – | |
PANTHER | 1 | 3843 | 3843 | 0.0 | – | |
SUPERFAMILY | 65 | 798 | 734 | 4.99E-14 | ||
SUPERFAMILY | 524 | 1489 | 966 | 7.82E-34 | ||
SUPERFAMILY | 1255 | 2316 | 1062 | 3.62E-14 | ||
MobiDBLite | 1976 | 1995 | 20 | - | – | |
MobiDBLite | 2247 | 2267 | 21 | - | – | |
ProSiteProfiles | 2621 | 3164 | 544 | 21.125 | ||
Pfam | 2754 | 3092 | 339 | 1.9E-41 | ||
MobiDBLite | 3180 | 3196 | 17 | - | – | |
MobiDBLite | 3180 | 3273 | 94 | - | – | |
MobiDBLite | 3209 | 3273 | 65 | - | – | |
Coils | 3299 | 3319 | 21 | - | – | |
SUPERFAMILY | 3403 | 3764 | 362 | 1.12E-50 | ||
CDD | 3468 | 3756 | 289 | 3.98442E-111 | – | |
ProSiteProfiles | 3498 | 3707 | 210 | 14.022 | ||
SMART | 3504 | 3811 | 308 | 1.7E-9 | ||
Pfam | 3510 | 3755 | 246 | 7.2E-25 | ||
Gene3D | 3605 | 3754 | 150 | 6.7E-8 | ||
ProSiteProfiles | 3807 | 3843 | 37 | 13.446 | ||
SMART | 3811 | 3843 | 33 | 2.3E-6 | ||
Pfam | 3818 | 3843 | 26 | 8.0E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). | ||
Molecular function | Kinase activity | Catalysis of the transfer of a phosphate group, usually from ATP, to a substrate molecule. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0381400.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…