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LotjaGi2g1v0417400.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0417400
Transcript ID LotjaGi2g1v0417400.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Pleckstrin (PH) domain-containing protein isoform 2; TAIR: AT4G17140.3 pleckstrin homology (PH) domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8BX70|VP13C_MOUSE Vacuolar protein sorting-associated protein 13C; TrEMBL-Plants: tr|G7JYP4|G7JYP4_MEDTR Vacuolar protein sorting protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0417400
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:91545297..91593826) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTTATTTCTTGGAGTAGCAACGTGGCCTACAAGTTCCGAATCACGCATTTCGTGAGGAGTTCATTTTTCATCTCTCACTC CTTTCTTCTTGTTCTTCGTCTTCTCACCTTAGCTACTCGGTGCCGTCTTCGCCGTTGTAACCGTCGCGATCATCATCGTC GTGGTGATATATGATCCTTTGGCAACACGATGCTGGAGGATCAGGTAGCGTACCTTTTGCAGAGGTACCTTGGCAATTAT GTCAGGGGTCTCAACAAAGAAGCTCTCAAAATCAGTGTCTGGAAAGGTGAACAATCCTCAATTCTTCTGCTCCTCTTCTT CTTAAGCACTTTCTATTCATTTCTGTAAGGTTTAACGCTTTTTATTGTAACCTCAGTGATGAACTGAAATTACAGTGAGG TTTTGAGTTTGTGTGGTTTAAATTAAATACATGGCGTTCATATCTGTGAATTGAATTTCAAGTGTTCAATCGGTTATTGA CTGTGCCAACGCAATCGAAGCGATAATGCGCGAGTAATTTTATTTGCAAATTGGGTTTGAACATTGTTGTTTGGTGAATT TGATGTTTCTGCATAGTTCAAGTCATTATAGTTCTGAATGTGAGGGAAGAAGGTTTTAGATAAATCATAAATGGTTCTGC AAATAGCAAGTGACATTTAGGGCGTGTTTGGATACCAGCTTATTAGAGCTTATTGGAGCGTATGTACTTAAAAATGCACT GAATAAGCTCCAATAAGTGCTTTTTTGTTTGCATCCAAACAGGCTTTTAGCTATATTGGTTGTTTACTATTTTCTTTTAT TTCATACTCCTGGAAATGTGTTGGTATGTTGGAGTATTCAATACTTAATTTGTTACTTAGTTCTACTAATTCCAAGTTCA TTGTGCATTTGTGGGAAAGGTCAATCCATGCATACATATATCATATATGTATCACAGTCAGTCACTAACTATTGAAAGAT 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0417400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCTGGAGGATCAGGTAGCGTACCTTTTGCAGAGGTACCTTGGCAATTATGTCAGGGGTCTCAACAAAGAAGCTCTCAA AATCAGTGTCTGGAAAGGCGATGTAGAGCTGAAGAATATGCAGCTGAAGCCCGAGGCTCTCAATGCTTTAAAATTGCCAG TGAAGGTTAAGGCAGGTTTTCTTGGATCAGTGAAACTCAAGGTTCCATGGAGCAGGCTCGGTCAAGATCCCGTTTTGGTA TATTTGGATCGCATTTTCTTATTAGCTGAACCTGCTACCCAAGTTGAGGGATGTAGTGAAGATGCTGTGCAAGAAGCCAA GAAGATCCGAATAGAGGAGATGGAATTGAAACTATGGGAGAAGTCACAACAACTAAAGTCAGAAATGAATAAATCATGGT TGGGATCCCTCATCAGCACCATAATTGGAAATTTGAAGCTTTCAATTTCTAATATTCACATCAGATATGAGGATGGTGAG AGCAATCCAGGGCACCCATTTGCAGCTGGTGTTATGTTGGACAAACTTTCAGCTGTGACAGTTGATGATACTGGGAAAGA AACTTTTATCACTGGAGGTGCACTGGATCTTATCCAAAAGTCCGTTGAACTTGATCGCCTAGCAGTTTATTTAGATTCAG ATATTATTCCATGGCATGCAAGCAAAGAATGGGAAGATTTGCTTCCTTCCGAGTGGTTTCAGATATTTAAATTTGGCACT AAAGATGGGAAGCCAGCTGACCGTTTGTTACAAAAGCACTCATACGTTCTGGAACCAGTGACTGGGAAAGGAAATTATTC CAAGCTGCTTCTGAATGAAGTTGCTGATAGCAAACAACCTTTACAGAAGGCGGTGGTGAATTTGGATGATGTTACAATCA GCTTGTCTAAGGATGGATACAGGGATATCATGAAACTAGCAGACAACTTTGCTGCATTTAACCAACGTCTTAAGTATGCT CATTTCCGTCCTCCGGTACCGGTAAAAGCGGATCCCAGGTCTTGGTGGAAGTATGCTTACAGAGCTGTATCTGACCAGAT GAAGAAGGCAAGTGGAAAAATGTCATGGGAGCAAGTTTTAAGATATACAAGCTTGCGTAAGAGATATATCTATCTCTATG CTTCATTGCTTAAATCTGACCCCAGTCAGGTGACAATTAGTGGGAACAAAGAGATTGAAGACCTAGATCATGAACTTGAT ATTGAACTTATATTGCAATGGAGAATGTTGGCTCACAAATTTGTGGAGCAATCAGCGGAACCAAATCTCAGTGTGAGAAA ACAGAAAGCGGGGAACTCTTGGTGGTCATTTGGATGGACCGGTAAATCTCCTAAAGAGGACAGTGAGGAATTATCTTTCA GTGAAGAGGACTGGAACCGGTTAAATAAAATAATTGGGTACAAGGAAGGTGATGATGGGCAATCGCCTGTAAATAGCAAG GCAGATGTTATGCATACCTTCCTGGTAGTTCACATGAATCACAATGCTTCAAAGCTTATTGGGGAAGCCCAAGATCTTGT TGCTGAGTTATCATGTGAAGACCTCAGTTGCTCAGTGAAGCTTTATCCAGAAACAAAGGTCTTTGACATTAAGTTGGGTT CATATCAGTTATCATCACCTAAAGGTCTCCTTGCAGAGAGTGCAGCTTCCTTTGACTCATTAGTTGGCGTCTTCAAGTAC AAGCCTTTTGATGACAAGGTGGACTGGAGTATGGTTGCCAAAGCTTCTCCATGTTACATGACTTATATGAAGGATAGCAT CAATCAAATTGTGAAATTCTTTGAAACTAATGCCACTGTGAGTCAGACCATAGCACTAGAAACTGCAGCTGCTGTGCAGT TGAAAATTGATGAGGTGAAGCGCACTGCACAGCAACAAATGAACAGAGCACTAAAGGATCATGCCAGGTTTTCATTGGAT TTGGATATTGCAGCTCCCAAGATCACTATTCCTACTGATTTTTATCCTGATAATACCCATGCTACAAAGCTTTTACTGGA CCTGGGGAACTTGATGATTCGTACACAGGACGACAGTCGACAGGAATCAGCTGAGGATAATATGTACCTGCGATTTGATT TGGTTTTAAGTGATGTATCAGCATTTTTGTTTGATGGTGACTATCATTGGAGCGAAATTTCTGTGAATAAATTGACCCAT TCCACCAATACTAGTTTCTTTCCAATTATTGACAGATGTGGAGTCATCCTACAGCTTCAACAGATTCTGTTAGAGACCCC ATATTATCCTTCAACACGCCTTGCTGTGAGGCTTCCATCATTGGCGTTTCATTTTTCTCCTGCTCGGTATCATCGATTGA TGCATGTTATAAAGATCTTTGAGGAAGGGGATGATGGAAGCTCTGAGTTTCTTCGACCCTGGAATCAGGCTGACCTAGAG GGGTGGTTATCTCTTTTAACTTGGAAGGGCGTGGGAAACAGGGAAGCTGTGTGGCAGCGGAGATACTTCTGCTTAACTGG ACCTTTTCTTTATGTTCTTGAAAGCCCTCACTCGAAATCTTACAAACAGTATACCAGCCTACGAGGGAAACAAGTATATC AGGTTCCACCAGAATTTGTTGGTGATGTAGAGCATGTTTTGGTTGTTTGTAGTCCCACACGACCCAACAATAAGGTTGTG GAGGATACAAATGCACTGATTTTACGTTGTGAAAATGAGGATTCAAGGAAAACCTGGCATACTCGCTTACAAGGGGCTAT TTATTATGCATCGAGTACTGACCCTATTTCTGGTCTATCGGAAACCTCTTCAGATCATGATGATATTGAATCAGAACTTG ATAATCAGGGTGTGATTGATGTAGCAATTTCTGAAAGATTGTTTGTAACAGGTGTTCTTGATGAATTAAAGGTTTGCTTC AGTTATAGTTATCAGCCTGATCAAAGTCTAATGAAGGTGCTTTTAAACCAAGAGAAGCGTTTGTTTGAATTTCGAGCAAT AGGTGGTCAGGTGGAGGTTTCTATGAAAGACAATGACATTTTCATTGGCACTATCTTGAAGTCTTTGGAAGTAGAAGATT TAGTTTGCTATAGCCAACCGTCGCAGCCTCGTTATTTGGCTAGATCATTTATTGGAGCTGCAGATGAGAAATCGTTATTC TATGATACCATGAGAGAAAATGTTGAAAGTAGCGGATTAATTCCTACTGAATCTGATGATAAATTTTACGAGGCACCTGA GACTTTGGCAGACAGTGATGTTTATATGCAGTCTCCTGGAGGTACATCTGAGTACCCATCTAGTTCCTCCAATGAGATAA AATTCAATTATTCATCACTGGAACCCCCAAAGTTCAGTCGAATTATTGGACTTCTTCCTACTGATGCTCCTTCTACCAGT ACTAAGGAACATGAACTGAATGACACATTGGAGAGTTTTGTTAAAGCGCAAATAATCATCTATGACCAGAACTCTACTCG GTATAATAATATAGATAAGCAGGTGATAGTGACTCTGGCTACCTTGACATTCTTTTGTCGCAGACCAACAATCCTAGCCA TTATGGAATTTATTAATTCTATTAACATTGAGAATGGAAACCTGGCAACTTCTAGTGACAGCTCTTCAACATCCATGGTA AAAAATGATTTATCAAATGATTTGGATGTTTTACATGTTACAACTGTTGAGGAACATGCTGTCAAGGGTTTACTTGGAAA AGGGAAGTCCAGGGTTATGTTCAGTCTCACATTAAAAATGGCCCAGGCCCAAATCCTTTTGATGAAGGAAAATGAAACCA AGCTTGCTTGTTTGTCCCAAGAAAGTTTGCTTGCAGAGATTAAGGTTTTCCCTTCCTCCTTTAGTATTAAAGCAGCCTTG GGGAATCTGAAAATAAGTGATGACAGCCTATCCAGCAGTCATTTCTATTACTGGGCATGCGATATGAGAAATCCTGGGGG AAGATCTTTTGTGGAGTTGGAGTTCACGTCATTTAGCTGCGATGATGAAGACTATGAAGGTTATGATTTTAGTCTTTTTG GTGAGCTTTCAGAAGTGCGAATTGTTTATCTGAATCGATTTTTGCAAGAGATAGTTGGTTATTTTATGGGTCTTGTTCCA AATAGCCCGAGAAGTGTTGTCAAAGTAACAGATCAAGTTACAAATTCAGAGAAGTGGTTTTCAGCAAGTGACATTGAAGG ATCACCTGCTGTTAAGTTTGATCTTTCTCTCAGGAAGCCTATAATATTAATGCCTCGGAATAGAGACAGCCTTGATTTCT TGAGGCTTGACATTGTTCATATAACTGTGAGGAACACCTTTCAGTGGATTGGTGGAAGTAAAAGTGAAATCAATGCAGTG CACTTGGAAACTTTGATGGTCCAGGTTGAAGACATCAACCTAAATGTTGGAACTGGAACAGACTTAGGCGAAAGTATAAT TAAGGATGTGAATGGGCTATCTGTGATTATTCATAGGTCACTCCGAGATTTATCACATCAATTTCCAAGTATTGAAATCA TAATTAAGATGGAAGAGTTGAAAGCGGCAATGTCAAATAAAGAATATCAGATTATTACCGAGTGTGCTGTGTCTAACTTT TCTGAGGTCCCAGATATTCCTTCACCACTGAATCAATATTCCTCCAAGACATTAAATGGGGCAACCGATGATATAGTCCC TGAGGTTACAAGCGGTGCTGATTCAGTGACTACAGATGTTGAAGCTTCTGTTTTGCTGAAAATCTGGGTGTCCATAAATC TGGTGGAGTTGAGCTTATATACAGGGATAAGCAGAGATGCATCCCTGGCCACTGTTCAGGTCAGCAGTGCATGGCTGCTG TATAAATCTAGTACAGCAGGAAATGGATTCCTTTCTGCAACACTACAAGGTTTCAGTGTTTTTGATGATCGTGAGGGAGT TGAACAACAATTTCGCTTAGCAATAGGAAAGCCTGAGAATGTTGGAGCCAGTCCTCTAAATTCTTTTTCATATCATCAGA ACCAAGACTCAGTTGATAGTATCTTAATTAAGGGGGATAGTTTTGACCCAGTTCAGACGATGCTCATTGTTGATGTGAAA TTTGGTCCGGACTCAACATTTGTTTCTTTGTGTGTCCAGAGGCCTCAGCTGCTCGTTGCATTAGATTTTCTTCTTGCTGT TGTTGAGTTTTTCGTACCAACTGTCAGCAGCATGCTATCATCTGAAGAAGGCAATAGGTCTCACATGCAGGAAGCTATCA TCATAGATAGGTCAATCTACAGGCAACCCTGTGCTGAATTTTCCCTCTCACCGCAAAAGCCTTTGATAGTTGATTATGAA AGTTTTGATCATTACATTTATGATGGTGATGGTGGAATTTTGTATTTAAAAGATATACAAGGTTTGAATCTCTCAGAAGC TAGCTCAGAGCCTATAATATATGTTGGAAATGGGAAGAAGTTACAATTCAGAAATGTTGTTATCAAGGGAGGACGTTACT TGGATTCTTGTGTTTTTCTTGGAGCAAATAGTAGCTATTCAGTTTTAAAAGATGACCATGTGTACTTGGAAGGATTAGTT GAAAGTCCTCAGCCAAGGTCTTCGAGAGGAAGTGTGGATGAAGTACCGTCTCAGAATAATGCTGTTAGCAATTCTACGGA GTTGATCATTGAACTTCAGGCTGTTGGTCCGGAGCTTACTTTTTATAACACATCAAAAGATGTAGGAGAATCATTAAACC TGTCTAACAAACTTCTTCTTGCACAGTTGGATGCCTTTTGCAGGCTTGTTTTGAAAGGAAGTAATACTGAGATGAGTGCA GATATACTTGGTTTGACTATGGAGAGTAATGGAATCAGGATTTTGGAGCCATTTGATACAAGCTTGAAGTACTCAAATGC TTCTGGGAAGACCAATATCCATTTATCTGTTTCTGATGTTTTCATGAATTTCACATTCAGTATATTGAGACTATTTCTGG CGGTGGAAGATGATATTCTAGCATTTTTAAGGATGACATCAAAGAAGATGACAGTTGTTTGCTCTCACTTTGACAAAGTT GGAACCATAAAAAATTCTCGTACTGATCAAACTTATGCCTTTTGGAGGCCTCATGCTCCTCCTGGTTTTGCTGTGCTTGG TGACTACCTGACACCACTAGACAAGCCACCAACGAAAGGAGTTCTTGCAGTAAATACCAATTCTTTAACAGTTAAGAGAC CCATTAATTTCAGATTAATTTGGCCACCTTTAACATCTGTGGGCATTAATGGTGAAAAAATGGACAATTTCGAGTTACAT TGGAAAAGTGAGGATGATGGTGGCTGTTCTATATGGTTCCCTGAAGCTCCCAAAGGTTATGTTGCAGTAGGCTGTATAGT TTCGCGTGGAAGGACACCACCCCCAATATCTTCTGTTTTTTGCATCCCGTCTTCTTCGGTGTCTCCATGTTCATTAAGAG ATTGTATCATAATTGGCACACCTGATATACCATCATCCCATGTGGCATTTTGGCGAGTGGATAATTCGTTTGGCACTTTC TTGCCAGTAGATCCTATTTCACTTAGTTTGATGGGTAAAGCATATGAATTGCGTTTCGTTAAATATGGTTATCTGATGGC ATCTCCGACAGCAATAAATAGTCCAGATTCTTTTGCTCATTCTGGAGGACATCAAACCTTGCAATTTGACCAGTCTTCAG ATGCAAATTCTAATAGGCGTCTGGAACCTGTTGCTAGCTTTCAGTTAATATGGTGGAATCAGGGATCAAACGCGAGAAAG AAGTTATCCGTATGGCGTCCAGTTGTCCCAATGGGAATGGTATATTTTGGGGATATAGCTGTTAAAGGGTTTGAGCCTCC AAACACCTGCATTGTTGTTCATGATTCCAGTGATGAAAATATTTTTAAAACTCCCCTAGATTTTGAACTTGTTGGACAAA TAAAAAAGCAGAGGGGAATGGAAAGTATATCATTCTGGCTTCCACAAGCTCCTCCTGGCTTTGTTTCCTTGGGTTGTGTT GCATGTAAAGGGAAACCTAAGCAAAATGAATTTAGCACATTAAGATGCATGCGCAGTGATTTGGTGGCAGGAGATAAATT TCTGGAAGAAAGTGTATGGGATACATCTGACGCCAAACATGTAACAGAGCCATTCAGTATATGGGCTGTTGGCAATGAGT TGGGGACTTTTATAGCTCGTGGTGGTTTTAAAAGACCCCCAAGAAGGTTTGCTTTGAGGCTAGCAGATTTTAGTATACCA AGCGGTTCAGATGTTACAGTCATTGATGCTGAAATTGGAACCTTCTCAACAGCTCTTTTTGATGACTACAGTGGTTTGAT GGTTCCTTTGTTCAATATATCTTTGAGTGGAATAACATTCAGTTTGCATGGAAGAACTGGGTATATGAATTGCACTGTTG GCTTCTCCTTGGCTGCCAGGTCATATAATGACAAGTATGAAGCCTGGGAGCCTCTTGTTGAGCCAGTAGATGGATTCCTA AGGTACCAATATGACCTCAATGCCCCAGCAGCAGCCTCTCAATTACGTTTGACATCAACCCGAGATCTGAATTTGAATGT TTCAGTTTCTAATGCTAATATGATCATTCAAGCTTATGCAAGCTGGAATAACCTAAGCCATGCTCATGAATCTTATAAAA ATAGAGATGCATTTTCTCCAACGTATGGTGGAAACTCTATTATGGACAATGTCCACAAAAGGAATTATTATATAATCCCT CAAAACAAACTTGGTCAGGATATTTATATCCGTGCTACTGAAGCTAGGGGTCTGCAAAATATAATTAGAATGCCGTCTGG GGATATGAAGGCTGTGAAAGTTCCTGTGTCAAAAAATATGCTAGAATCTCATTTGAAGGGTAAACTTTGTAGAAAGATAA GAACAATGGTGACAGTCATCATTGCAGAAGCACAGTTCCCTCAAGTTGAAGGTTCAGATGCCCGGCAATGCACAGTGGCT GTCCGGCTTTCTCCTAGTCAGAGCCGCGCTACTGATGCATTGGTTCATCAACAGAGTGCACGCACATGTGGAAGAAGGGC AAAACATTTATTGCCTTCGGATCTTGAGTTAGTCAAGTGGAATGAAATATTTTTCTTCAAAGTTGATTCTCTGGACCATT ACTCTTTGGAGTTAATTGTGACAGATATGAGCAAAGGTGTTCCCATGGGATTTTTTTCTGCTTCCTTGAACCAGGTAGCA AGAACTATTGAGGACTGGTCATATTCCCAAAATCTTGCCAATATGTTGAACTGGATAGATTTGTCTGCAGAAAACTCCAT GGATGCTTATTATAAGAAGTCTTGCAAATTACGATGTGCCGTTCTAGTGCAAGGTTCTCAAATTGATAATAACAATCTAC ACTCTGACAATGACGCCCATAAATCTGGGTTTATTCAAATTAGTCCCAGCAAAGAAGGTCCTTGGACTACTGTAAGGCTA AACTATGCTGCCCCCGCTGCTTGCTGGCGGTTAGGTAATGTTGTTGTTGCCAGTGAAGCTAGTGTAAAGGATGGGAATAG ATATGTAAATATTCGATCTTTGGTTTCTGTTCGTAACAACACAAATTTTGTACTTGATTTATGCCTTGCTTCAAAAATTT CATCGGAGAAAGTGAGTTTGCTGAAAAATTCAAGTGGTTCTGAATCTATCCAAACAAAAAGGGACCAAATTCAGACAGAT GAGTTTTATGAGATTCAAAAGTTAACTCCACACATTGGTTGGGTTGGTTGTTCTAGTCATCCTGGGCAGCATGTGTCGGA CGTGGGAAAATCCAATCAGGATTTTCCTGAAATTGATCTACCGCCTGGTTGGGAATGGATTGATGATTGGCATTTGGATA CAAAATCTACCAATACCTCTGATTGCTGGAGTTATGCTCCTGATTTTGAGAGTTTGAGATGGCCTGGATCCTCCGATCCA AAGGAATCCTTTAATGCTGCTAGGCAGAGGAGATGGCTAAGAAGCAGGAAGCTAATAGCAGATGATCTTAAGCATGAAAT TTCTGTCGGGCTACTGCAACCAGGAGAAATTGCTCCACTTCCTCTATCTGGCTTGACACAATCTATCCGATATTTCTTGC AGTTAAGGCCTTGGACTTCAGCAAACCCATATGAGTATTCTTGGAGTACTGTAGTGGACAAACCTGGGCTATCAGAGGAT ACTGGTAAGGGGGAGAAATGCTTAAACCTCTGTGTTTCAGATCTTTCGGAGTCAGAGGAACTGCTGTGCTGCAGTGAGAT GCATGGAACGTCAGGTGGCTCCCACAAGTTGTGGTTTTGCGTAAGCATACAAGCAACAGAGATTTCTAAAGACATCCATT CTGACGCTATTCAGGATTGGTGTTTGGTGATCAAATCCCCGCTAATAATTAGCAACTTTCTTCCTCTTGCTGCTGAATAT TCTGTTCTTGAAATGCAATCAAGTGGCCACTTTCTTGCATGCTCAAGAGGTGTATTTTCACCTGGAAATACTGTGCAGAT ATACAGTTCGGATATTAGGAACCCTTTGTTCTTATCTTTGCTTCCGCAGAGGGGTTGGCTTCCCGTACATGAAGCTGTTC TTATATCTCATCCTCATGGGAGTCCAGCAAAAACAATTAGTTTGAGAAGTTCAATATCTGGAAGGGTTACCCAAATCATT CTTGAACAAAACTATGACAAGGAGCACACCTTGCTGGCTAAAACAATTAGAGTCTATGCTCCTTACTGGTTGGGAGTAGC TAGATGTCTTCCACTTACATTCAGGATTCTTGATATGTCTAGAAAAAGACATGTGCCAAAGGTTGCTGCTCAATTTCAAA ATAAAAAGGGAACTGGGTTAATCCTTGAAGAAATAACTGAAGAGGAGATATATGATGGCCATACAATTGTATCTGCTCTA AACTTTAATATGTTAGCACTTTCAGTGGCTATTGCTCAATCAGGAAATGAGCATTTTGGACCTGTTAAAGATCTTTCGCC TCTTGGTGATATGGATGGCTCTTTGGATATATATGCGTACGATGGTGATGGAAATTGCATGCGGCTTATTATTTCTACAA AACCATGCCCCTATCAGTCTGTCCCAACTAAGGTAATTTCTGTTCGGCCATTTATGACTTTCACAAATAGAACTGGTGAA GATATATTCATCAAGTTGAGCACTGAAGATGAACCAAAGGTTTTGCGTGCTTCTGATTCGAGGGTTTCCTTTGTATGTCG AGGAATTAATGAAAATGAAAAACTCCAGGTGAAACTAGAAAGTACCAATTGGTCATATCCCCTTCAAATTTCAAGAGAAG ACACGATTTCTCTTGTTTTGAGGATGAATGATGGATCTCTAAAATTTTTGAGAACTGAAATCCGTGGATATGAAGAAGGA TCCCGATTTGTCGTGGTATTCCGTCTTGGATCTACTGATGGTCCTATCAGAATTGAGAACAGAACGGAAAACAAAGAAAT TAGCATTCGACAGTCTGGATTTGGTGAAGATGCCTGGATTCAGTTGCAACCTCTGTCAACAACTAATTTTTCTTGGGAAG ATCCATATGGCGATAAGTTTTTAGATGCTAAGCTTAGTGCTGATGATATCAGTGCAATTTGGAAACTTGATTTGGAAAGG ACTGGATCATGTTCTGCAGAACTTGGACTGCAATTCGATGTTATTGATGCGGGAGATATAATAATTGCAAAATTCAGAGA TGATAGAATGTCAAGTTCAAGTTCGTTTGGAGAGATTAGAGGTCCAACACCTAATCTGAACAGTGTTACACCGTTTGAGA TCTTAATTGAGTTGGGAGTGGTCGGAATTTCGATAGTGGATCAAAGACCGAAGGAGCTCTTCTACTTATACTTCGAAAGG GTCTTTCTAACATATTCAACTGGTTATGATGGTGGAAGGACAAGCAGGTTCAAGCTCATATTCGGTTATTTACAACTGGA CAACCAGCTTCCTCTAACATTAATGCCTGTTCTCTTGGCTCCAGATCAGACCTCTGATGTGCGACACCCAGTATTTAAGA TGACAATTACTATGCAGAATGAGAATAAAGATGGAATTCAAGTTTTCCCATATGTTTATATACGGGTGACAGATAAATGC TGGAGACTCGATATTCATGAACCTATTATCTGGGCTATTGTGGACTTTTATAACAATTTGCAGCTAGATCGCTTTCCTAA AAGTTCTACAGTCACAGAAGCTGACCCCGAGATACGTTTCGACCTAATAGACGTTTCAGAAGTAAGGTTGAAGTTGTCAC TAGAGACTGCTCCAGGACAGAGACCTCGTGGGGTCCTAGGCATATGGAGCCCTATACTTTCTGCTGTTGGAAATGCCTTC AAGATCCAGGTGCACCTGAGGAGGGTGATGCACCGAGACAGATTCATGCGTAAAAGTTCTATTGTTCCGGCGATTGGAAA TCGTGTTTGGAGAGATTTGATTCACAATCCGTTACATTTAATATTTTCAGTGGATGTACTAGGTATGACAAGTTCGACAT TAGCTTCTCTTAGTAGAGGGTTTGCTGAGCTTTCCACAGATGGACAATTTTTGCAATTACGTGCAAAGCAGGTAAGATCA AGGAGAATCACCGGGGTTGGGGATGGGATCATGCAAGGAACAGAAGCTCTTGCCCAAGGTTTTGCATTTGGCGTCTCTGG CGTGGTGAGAAAGCCTGTTGAGAGTGCCCGACAGAATGGTCTCCTGGGATTCGCTCATGGGCTTGGACGTGCCTTTTTAG GTTTTGTTGTGCAGCCAGTGAGCGGAGCACTGGATTTTTTCTCATTGACTGTTGATGGGATTGGTGCAAGTTGTTCCAAA TGCCTTGAGGTTTTCAACAGCAAGGCTCAATTCCGCCGAATTAGAAATCCTCGGGCTTTACATGCTGATGGGATACTTAG AGAATACTGTGAGAGAGAAGCTGTTGGACAGATGGTTCTTTACCTTGGAGAGGCAAGCCGGCAATTTGGCTGTACTGAAA TTTTCAAGGAACCTTCAAAATATGCATTGTCTGATTATTATGAAGTGCATTTTACTGTGCCACATCAGAGAATTGTTTTA GTTACCAACAAACGACTCATGTTGCTGCAGTGTCTTGCTCCTGACAAGATGGATAAAAAACCTTGCAAGATTATGTGGGA TGTACCTTGGGATGAGTTGATGGCACTGGAGTTAGCAAAAGCAGGCTGTTCTCAACCCTCTCACTTGATCCTCCATCTGA AACATTTTCGTAGATCTGAAAATTTTGTTCGAGTGATAAAATGCAGTAGTGCAGAAGAAATTGAAGGGAGAGAATCCCAT GCTGTTAAGATATGTTCAGCAGTGCGTAGAACATGGAAGGCATATCAGTCTGACAAGAAAAGCTTGATTCTTAAAGTTCC TTCAAGTCAGAGACATGTATACTTTTCTTATACTGAGGTGGATAGAGAACCACGTACGCCCAATAAGGCCATTGTTAGTT CAAGAGATATCTCATCATATAGCACTTCATCTGATGACGGGCGATTTGTTAGACACTGCATTACTTTTTCAAAGATATGG AGCAGTGAACAAGAATACAAAGGTCGATGCTCGTTGTGCAGAAAACAGACCTCACAAGATGGTGGAATATGTAGCATTTG GAGGCCTACCTGTCCTGACGGGTTTACATATATTGGGGATATTGCTCGTGTTGGCGTCCATCCTCCAAATGTTGCTGCTG TCTACCGCAAGATTGATGGACTTTTTGTTCACCCGTTGGGGTATGACCTGGTATGGCGAAATTGTTTAGAAGATTTTGTC ACCCCTGTGTCAATTTGGCACCCACGGGCCCCAGATGGATTTGTGTCTCCCGGATGTGTTGCCGTTGCTGGTTATACGGA ACCAGAGCCTGATCTTGTGCACTGTATTGCTGAGTCACTCATTGAGGAAGCAGAATTTGAAGATCTAAAGGTTTGGTCTG CACCTGATTCATATCCATGGACCTGTCATATGTATCAAGTACAGAGTGATGCTTTGCATTTTGTTGCTCTACGGCAAAGC AAAGAAGAATCTGAGATGATTATGAAGCCCAAGAGGGTCCGTGATGACCCGCAGGCTCAGTTGCAAGCAATAGGATCCTC TCATGCCACATGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0417400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLEDQVAYLLQRYLGNYVRGLNKEALKISVWKGDVELKNMQLKPEALNALKLPVKVKAGFLGSVKLKVPWSRLGQDPVLV YLDRIFLLAEPATQVEGCSEDAVQEAKKIRIEEMELKLWEKSQQLKSEMNKSWLGSLISTIIGNLKLSISNIHIRYEDGE SNPGHPFAAGVMLDKLSAVTVDDTGKETFITGGALDLIQKSVELDRLAVYLDSDIIPWHASKEWEDLLPSEWFQIFKFGT KDGKPADRLLQKHSYVLEPVTGKGNYSKLLLNEVADSKQPLQKAVVNLDDVTISLSKDGYRDIMKLADNFAAFNQRLKYA HFRPPVPVKADPRSWWKYAYRAVSDQMKKASGKMSWEQVLRYTSLRKRYIYLYASLLKSDPSQVTISGNKEIEDLDHELD IELILQWRMLAHKFVEQSAEPNLSVRKQKAGNSWWSFGWTGKSPKEDSEELSFSEEDWNRLNKIIGYKEGDDGQSPVNSK ADVMHTFLVVHMNHNASKLIGEAQDLVAELSCEDLSCSVKLYPETKVFDIKLGSYQLSSPKGLLAESAASFDSLVGVFKY KPFDDKVDWSMVAKASPCYMTYMKDSINQIVKFFETNATVSQTIALETAAAVQLKIDEVKRTAQQQMNRALKDHARFSLD LDIAAPKITIPTDFYPDNTHATKLLLDLGNLMIRTQDDSRQESAEDNMYLRFDLVLSDVSAFLFDGDYHWSEISVNKLTH STNTSFFPIIDRCGVILQLQQILLETPYYPSTRLAVRLPSLAFHFSPARYHRLMHVIKIFEEGDDGSSEFLRPWNQADLE GWLSLLTWKGVGNREAVWQRRYFCLTGPFLYVLESPHSKSYKQYTSLRGKQVYQVPPEFVGDVEHVLVVCSPTRPNNKVV EDTNALILRCENEDSRKTWHTRLQGAIYYASSTDPISGLSETSSDHDDIESELDNQGVIDVAISERLFVTGVLDELKVCF SYSYQPDQSLMKVLLNQEKRLFEFRAIGGQVEVSMKDNDIFIGTILKSLEVEDLVCYSQPSQPRYLARSFIGAADEKSLF YDTMRENVESSGLIPTESDDKFYEAPETLADSDVYMQSPGGTSEYPSSSSNEIKFNYSSLEPPKFSRIIGLLPTDAPSTS TKEHELNDTLESFVKAQIIIYDQNSTRYNNIDKQVIVTLATLTFFCRRPTILAIMEFINSINIENGNLATSSDSSSTSMV KNDLSNDLDVLHVTTVEEHAVKGLLGKGKSRVMFSLTLKMAQAQILLMKENETKLACLSQESLLAEIKVFPSSFSIKAAL GNLKISDDSLSSSHFYYWACDMRNPGGRSFVELEFTSFSCDDEDYEGYDFSLFGELSEVRIVYLNRFLQEIVGYFMGLVP NSPRSVVKVTDQVTNSEKWFSASDIEGSPAVKFDLSLRKPIILMPRNRDSLDFLRLDIVHITVRNTFQWIGGSKSEINAV HLETLMVQVEDINLNVGTGTDLGESIIKDVNGLSVIIHRSLRDLSHQFPSIEIIIKMEELKAAMSNKEYQIITECAVSNF SEVPDIPSPLNQYSSKTLNGATDDIVPEVTSGADSVTTDVEASVLLKIWVSINLVELSLYTGISRDASLATVQVSSAWLL YKSSTAGNGFLSATLQGFSVFDDREGVEQQFRLAIGKPENVGASPLNSFSYHQNQDSVDSILIKGDSFDPVQTMLIVDVK FGPDSTFVSLCVQRPQLLVALDFLLAVVEFFVPTVSSMLSSEEGNRSHMQEAIIIDRSIYRQPCAEFSLSPQKPLIVDYE SFDHYIYDGDGGILYLKDIQGLNLSEASSEPIIYVGNGKKLQFRNVVIKGGRYLDSCVFLGANSSYSVLKDDHVYLEGLV ESPQPRSSRGSVDEVPSQNNAVSNSTELIIELQAVGPELTFYNTSKDVGESLNLSNKLLLAQLDAFCRLVLKGSNTEMSA DILGLTMESNGIRILEPFDTSLKYSNASGKTNIHLSVSDVFMNFTFSILRLFLAVEDDILAFLRMTSKKMTVVCSHFDKV GTIKNSRTDQTYAFWRPHAPPGFAVLGDYLTPLDKPPTKGVLAVNTNSLTVKRPINFRLIWPPLTSVGINGEKMDNFELH WKSEDDGGCSIWFPEAPKGYVAVGCIVSRGRTPPPISSVFCIPSSSVSPCSLRDCIIIGTPDIPSSHVAFWRVDNSFGTF LPVDPISLSLMGKAYELRFVKYGYLMASPTAINSPDSFAHSGGHQTLQFDQSSDANSNRRLEPVASFQLIWWNQGSNARK KLSVWRPVVPMGMVYFGDIAVKGFEPPNTCIVVHDSSDENIFKTPLDFELVGQIKKQRGMESISFWLPQAPPGFVSLGCV ACKGKPKQNEFSTLRCMRSDLVAGDKFLEESVWDTSDAKHVTEPFSIWAVGNELGTFIARGGFKRPPRRFALRLADFSIP SGSDVTVIDAEIGTFSTALFDDYSGLMVPLFNISLSGITFSLHGRTGYMNCTVGFSLAARSYNDKYEAWEPLVEPVDGFL RYQYDLNAPAAASQLRLTSTRDLNLNVSVSNANMIIQAYASWNNLSHAHESYKNRDAFSPTYGGNSIMDNVHKRNYYIIP QNKLGQDIYIRATEARGLQNIIRMPSGDMKAVKVPVSKNMLESHLKGKLCRKIRTMVTVIIAEAQFPQVEGSDARQCTVA VRLSPSQSRATDALVHQQSARTCGRRAKHLLPSDLELVKWNEIFFFKVDSLDHYSLELIVTDMSKGVPMGFFSASLNQVA RTIEDWSYSQNLANMLNWIDLSAENSMDAYYKKSCKLRCAVLVQGSQIDNNNLHSDNDAHKSGFIQISPSKEGPWTTVRL NYAAPAACWRLGNVVVASEASVKDGNRYVNIRSLVSVRNNTNFVLDLCLASKISSEKVSLLKNSSGSESIQTKRDQIQTD EFYEIQKLTPHIGWVGCSSHPGQHVSDVGKSNQDFPEIDLPPGWEWIDDWHLDTKSTNTSDCWSYAPDFESLRWPGSSDP KESFNAARQRRWLRSRKLIADDLKHEISVGLLQPGEIAPLPLSGLTQSIRYFLQLRPWTSANPYEYSWSTVVDKPGLSED TGKGEKCLNLCVSDLSESEELLCCSEMHGTSGGSHKLWFCVSIQATEISKDIHSDAIQDWCLVIKSPLIISNFLPLAAEY SVLEMQSSGHFLACSRGVFSPGNTVQIYSSDIRNPLFLSLLPQRGWLPVHEAVLISHPHGSPAKTISLRSSISGRVTQII LEQNYDKEHTLLAKTIRVYAPYWLGVARCLPLTFRILDMSRKRHVPKVAAQFQNKKGTGLILEEITEEEIYDGHTIVSAL NFNMLALSVAIAQSGNEHFGPVKDLSPLGDMDGSLDIYAYDGDGNCMRLIISTKPCPYQSVPTKVISVRPFMTFTNRTGE DIFIKLSTEDEPKVLRASDSRVSFVCRGINENEKLQVKLESTNWSYPLQISREDTISLVLRMNDGSLKFLRTEIRGYEEG SRFVVVFRLGSTDGPIRIENRTENKEISIRQSGFGEDAWIQLQPLSTTNFSWEDPYGDKFLDAKLSADDISAIWKLDLER TGSCSAELGLQFDVIDAGDIIIAKFRDDRMSSSSSFGEIRGPTPNLNSVTPFEILIELGVVGISIVDQRPKELFYLYFER VFLTYSTGYDGGRTSRFKLIFGYLQLDNQLPLTLMPVLLAPDQTSDVRHPVFKMTITMQNENKDGIQVFPYVYIRVTDKC WRLDIHEPIIWAIVDFYNNLQLDRFPKSSTVTEADPEIRFDLIDVSEVRLKLSLETAPGQRPRGVLGIWSPILSAVGNAF KIQVHLRRVMHRDRFMRKSSIVPAIGNRVWRDLIHNPLHLIFSVDVLGMTSSTLASLSRGFAELSTDGQFLQLRAKQVRS RRITGVGDGIMQGTEALAQGFAFGVSGVVRKPVESARQNGLLGFAHGLGRAFLGFVVQPVSGALDFFSLTVDGIGASCSK CLEVFNSKAQFRRIRNPRALHADGILREYCEREAVGQMVLYLGEASRQFGCTEIFKEPSKYALSDYYEVHFTVPHQRIVL VTNKRLMLLQCLAPDKMDKKPCKIMWDVPWDELMALELAKAGCSQPSHLILHLKHFRRSENFVRVIKCSSAEEIEGRESH AVKICSAVRRTWKAYQSDKKSLILKVPSSQRHVYFSYTEVDREPRTPNKAIVSSRDISSYSTSSDDGRFVRHCITFSKIW SSEQEYKGRCSLCRKQTSQDGGICSIWRPTCPDGFTYIGDIARVGVHPPNVAAVYRKIDGLFVHPLGYDLVWRNCLEDFV TPVSIWHPRAPDGFVSPGCVAVAGYTEPEPDLVHCIAESLIEEAEFEDLKVWSAPDSYPWTCHMYQVQSDALHFVALRQS KEESEMIMKPKRVRDDPQAQLQAIGSSHAT 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Pfam 2 107 106 4.8E-31
PANTHER 24 311 288 0.0
Coils 111 131 21 -
Pfam 133 374 242 8.6E-67
PANTHER 319 4005 3687 0.0
Pfam 558 778 221 5.0E-36
Coils 609 629 21 -
SUPERFAMILY 792 911 120 5.04E-14
Gene3D 794 911 118 1.9E-10
ProSiteProfiles 796 908 113 10.623
SMART 797 910 114 2.4E-12
Pfam 799 907 109 2.0E-10
CDD 799 903 105 2.54571E-5
Pfam 1994 2151 158 1.0E-10
Pfam 2223 2370 148 2.6E-10
SMART 2875 2933 59 0.0079
Pfam 3331 3497 167 2.5E-12
MobiDBLite 4326 4350 25 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0417400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…