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LotjaGi3g1v0057700.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0057700
Transcript ID LotjaGi3g1v0057700.2
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class), putative; TAIR: AT5G17680.2 disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class); Swiss-Prot: sp|Q40392|TMVRN_NICGU TMV resistance protein N; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RE93|A0A151RE93_CAJCA TMV resistance protein N; Found in the gene: LotjaGi3g1v0057700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:5979025..6001958) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACAAAAAAGAAAAGACTGCAGCTAGTTGGTCGTTTATATATATTGCCTTAACAACTTGTAACCAATTGACGACAACTAAT GTTCACACTTGATATTTCTCTTGGCCTCACTTTCAGTATTAAATACCGATCAGGACGACATATGCAAAATATGCAACCAA TCAACAACCTGTGTGCTAGCTTCAGATGACGCGTTAGTCAAATCCAGTTTTTTATTTTTGAAATAAGAATTTGCCTCAAG AAAGGTGAGTGTCAACAAATCACACCCTATACTAACTACAATATTTTCATAGTATTTATTGATTCATTGCAATTAATAAA CATTAGTGTCACTGTTTTCTCTCCCCCATCGATCTGCGCTTAGAAATTTCACTGTATTTTCGCAAGCAAGGAGCCTAATT AAGGCAAATGTTATTTAAAAACAATAAATAATGAAATGAGTGTGAATGCATCGTGTTATAAAAATGCCAATGACAAGCAC ATACACACCCACTAACATTTGCAAAGCAAGACAGAGAGCAACAAATATTAATTTTTTTCCCACCACTCCCACTGTCATGG ATGAATTCTTCTATGATGTTTTCCTGAGTTTTAGAGGTGAAGGTGGAACCCGCTACGGGTTCACAGATCATCTCTTCACT GCTTTGAGGCAAAAGGGAATCCACACTTTCAGAGATGATAAGGAGCTGAAAATTGGAGCAGAAATCGGACCTGCTCTTTT GAAAGCAATCAGAAATTCCAGAATGTTAATTGTTGTTCTGTGCCAGAACTATGCATCTTCCACTTGGTGTCTAAACGAAC TCGTTGAGATTATTGACTGTTATGACAAGAAAGGAACGCAGGTTTTGATTGTTTTTTATAAGGTGGAACCTTCTGATGTG TGGGAACTCAAGAATAGTTATGCAGATGCCATGGCTGAACATGAAATGAGATTTGGAAAAGACTCGAAGGAGGTCAAAAC 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AGTTCTCTAATATTTGCAGAGCCACTTCAGGTACACACATTAGCACTTTCTCTCTCTTTGTCTCAAATGAAAATGTAACA TAATTTTCCTTTTAACTAGCATGATCTGAAATTTCTTATAGTTGACTAACCTAACCCTTATAATATATTTTACAGGCATT TAAAGATTTGATATTCATGAATATCTCCCAATGTCAATCCATAACTCACATACCAAACCTGTCTGGAGCAAAAAGCTTAA GAGCATTGACACTTGACAGATGTTATAAATTGGAAGGGTTTGATAAATCCTTTGGATTATACATGACAAATCTTGTGTAT TTAAGTGCATCGGAGTGCACCATGCTAAAAAGTTTTGTGCCAACAATGTACTTTCCATCTCTCGAAGTTCTTTCATTTAA CTTCTGCACATCACTTGAAAGCTTCCCTGACGTAAAACGGAAGATGGATAAGCTGTTAAAGATTCACCTGAAAAATACTT CTATTAAAGAGTTCCCGAACTCCATTCCTAAACTTACTGGGCTTGAGTATGTAGACCTGTCAAATTGTGAAGGGGTCAGA GATTTATCAAGAAGCTTTTTATTGTTGCCAAAACTTGTCACGTTAAAAGTTGATGGATGTTCTCAACTTGGACAATCATT TAAAAAGTTCAAAGAGAGCCTTTCAGTGGGAAATCCTTGCTCAAGTTTAAAGGCACTATATTTCAGCAAGGCTAATCTAT CATATGAAGATCTTTACACAATTCTTGAAATATTTCCAAAATTGGAATTCTTGAATGTACCGCACAATGCATTTGTATCC CTCCCAGAATGCATCAAAGGATCTTTGCTGCTGAAAAGTCTTGACATAAGCTTTTGCAGGAACCTTGTGGAAATCCCAGA ACTTCCATTAACTGTTCAGAATGTAGATGCAAGATACTGTCAGTCCTTAAGTACAACAGCATCAAGTGTGCTATGGTCTC AGGTTTTACTACACTTTCCTATATATTTTACTATGTTTTACAACAGCATCAAGTCCTTAATGTATTTCAGCCAAAAAATT CTCCTTGGGGATGCTTTCACAATTAGTTACCATTTTGGTAATTGTATCTTTTTTTTTTTATTCCATTGACTGGTTTACTT GATAATCCCATGTAATATTTAATTTTTTTTCAACACTAGACCAATTTTAACTGTTTAGTAAAAGGCCTAATTCTACTACT CATTAATTATTTGGCTTAACAGTTTACTATCTTTTCAATGTCAGGTTTTTAAAGAGACAGAAAGAATACAGGTCGTGATG CCAAAAACAGAAATTCCGAATTGGTTTGACTGTGTTGGAAGTGAAGATATTCTGGTTTTCTGGGCTCGCCACAAGTTCCC TATTATTGCACTAGCATTTGGGCTCCATGAGATACAAATGGACAGCTCAGCATTCTTCCCTGGAATCATATCAGCTAACC AGTCCCACAATGTTGGCCTGTACTTGTTTATAGACGGCCAAGAAATATGTCACAAAGATTACAATGTTGGGAAAAATCAT GTGTTAGTGTGTGAGTTAAGGGCTTTGTTCAATGATGAAGAGTGGAAGGGTCTTGATGCGCGCCTTGGAGATGATTGGAA GCCTGTTCAGGTTCAATGTAAATCAAACTTGATATTGAATCGTTGGGGAGTTTATGTCTACAAGAGGAAAACTAATGCTG ATGATATCCGGTTTAGTTTTCCCGATTCAATAGACAATGTGCCATCATCATGTTTGGTTCCAAAACCAACTCCAGATCAG AAAATAAAACAAGGTCTTGATTTTGTTGAAATATTTGGCCAGTATTTGAATACTCTTAAATTAGAGCAATCTGCCTATGT TGCAAATGAGCTATTGAGATGGTGGAGGAATTCTAAGGGTGATGTCAAAGAGGAAGTTTCATCCTCTACATATGGAGCTA GTTTAATGCAAGAACACGAACAATGTTTGTGGGATTTGGCACATATTTTAGAGATGATGGAGAATGTAGCAAAACACATC ACTGATTCAAAAGTTCAAAGTGCAGGCCAGTTGGTGATACAATTATTGATGGCGCGTGCACAACCTATGAAGGAAAAAGG CCATGAGACGTTGCACATTAATACAAGCATTCCTGTTATACTGGAGGAATGTGAGTACCACCCTTGTACAGATTTAGCAG AAGCTCCGAGACGTCGCTATTGGGGAAGCGTGGAGCTAGAAGAAGGAGATCCATTTGTGTGGAGAATTTGGAAAAGCAAA GAATCCTTTCAGGAGAGGGTAAGCATTGTTTTGTCAAAATATCAGCATACCTCTACAGAGGGAGCTTCAAGCTCTTGCCA TGGGGGATCCTTGGAGGAAGAAAACAAATATCCTCCTGCATTGGAAGAATTAACTAGGAGGATAGAGCAAGATGCAATGA GGTTGAACAAATCTTATGGGAAGTTGAAGGCTTATTTTGTTCCAATAGATGTCCCAGTTTCTGACAAATATAATTTGGAA ACAGCAATCATCAGAGGACAAGAAAGGTTGGGAAGGTTAGGGTCTAATTTCAACAAGACACCTTATGGGAAGTTGAGGGT GGCGCATGATGATGCTCTGGATACTGTTCATATGCAGCCTGAGTTGAGGGTGGAGCATGATGATGCTTTAGGTACTGTTC ATATGCAGCCTGAGTTGAGGGTGGATCATGATGCTCAGAACACTAGTCAGAGTCAGAAGCAATATGAGTTGGGGGTGAAG CATGTTGCTCAGAGTCAGAGCACTGTCCAGAATCAAAGTAAGAAGGGTTGGACTAAGATTCTTAATTGGTGGATCCGCTG ATGCCTGACGCTCTTGTACTCCCAGCGATGCGATAGGCAAATCCATTAAGGCCACAGCCAATTATGTGATTGCATTAAAA TTGATTTAGATGATATTCATATACGACTTTTTGTACCCCTCGGGTGTAAGCTTCAGCCTTTTAATCTCCTCCCAACAGAT TTGAGAGTGCACTTGTGAAGCAAAGTAGGAGGACAAAGGACAGTCTTTTTTATCCAACCCTTTATGCTTTGAATCTGAAA AGAAAAGATGTCAAACTTTTCAACTGCATTAAGGTATCTGTTTTAGCTACATCCTGAAATGTTTTAGCTTTTTATCTTTT GCTATTGAATGAATGAACTTGTTTATTGGGTGGTCAGTATGTATGCGTGTATCCTGTCGTTAAACTATGTGCTATGAAGC AGAAGAGGATGATAGGATCCTTGATTCTGACACCACTGGCCAAGTGCTTTCAAGGTCCCAGCAGTGGGATAATAATATTG CTGCTAAAATTGCTGAGTTTACAGCAACTTTTGAGAAACAAGCACTTGCCTTCAACATAATATCCCAAAAGAGAAACTTG GGTGAATTCCGGTCTGAGGAGAGATTGATGATTGAACAGGCACTTCTCCAAGAAGAAAAGCGAGCTCTGATGGCCGGTCG TGAAGCACATGAGGCTAAACTTCGGATGGCAGCAATGTATCAAGCTGAGCAGGCCCGGGCAGAATCACACTCTCATGCTG AAATGATGTCGCGAGCCCCCATAAGAGGGAGTGCACTTGGGTCCCAAGGCAGTGGTGATATGATGGGCCATGACATGGGA GAGCAGGATCAGGGAGGTAACCCAGGTGATATGATGAATGGATGGGGGAACAATGCACAGAGAGAAGAGAAGGAGCCATC TGAGGATTTCTTGAATGATGAAGCTGAGAATGGAGACACAGGCACACAGGATGGTTGGCGTGAAGTTGGTGAATTTGATT TGAATGCTAGGTGATTCTCCATAGTGACTGTATAAAACTTTTAAGGGAGAGTTTGAATTATGTTAAGAGATCAATATCCG TTTTAAAAGAATCATTGTCCTTGGTATCTTCAAGTTACCTATCTTAAGATTACTTTCTCGATCAATATCCATTCACAGGG GGGAAGGAAAACTATTGAACCAGTCAAATGTTGAATTGGATGAATGTTCAGTTTATGCTCCTAGATTAGTGTAGTGCACA TGATTGGATTATTAGCTCCAATGGAGTGTTATATAAGCATACAAATTAAGTCCAATATGTATAGGAAACTTTGGTTTCAA AAAAAAAACTATGTGCTATGATAATATACAGTTTAGCTATCCTTTTGTTTCCTTGGAAACATAAATTACAGTGTAAGTTT GGAAACCATCTACAGTTAATTTTGAAGACAAAATCAATTCTGATGAGAAGCTTATGTGAGTAACTTTTGGGTTTTAGAAC CGATTCTGATGAAAGATAAGCTAATCCAAAACATGCTAATAGTCTCTTTTAAGACTTGTACGGTTAACATCATGTAGTAT TGATTGCTGTAATAATGGATCTTCAAAAGGAGTACTTTGCTGAGGCATTTGTGCCTATAGGACATCTTCTGTGCATTTCA TATCATCCAATTTTATTGTCAGTACGATCAATGGCTGCTCCTATAGGAGCTACATTAGCGCTCAAGTTGGACCAAGATTC TTAATTGGATTCGACGCTGACACTCTTGTACCCCTGGTGATATGGTAGGTAAATTCATTAAGGGCACAACCAAATTATGT GATCACACTAAAATCTCAGAATCCTCCAAAAGATTTGAAGCACAAGTGCATTTGTCAGGTGAAGTAGGAGGACAAAGCAC ATAGTGAACTGTTTAATAGTGAACTTGTTTATTGGGTGGTAAGTATGTATGGTG 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0057700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCTGAGAGAAGTGACACCAATAAAGCACACACTTGCAAAACTCTTCAAGTCAATGCCTAACATGTCAAACCGTTCTGC AACATCCTTAGATTTCAGCTATGATGTTTTCTTGGGTTATTTCAATGGCGGAACCAGCAAAGCATTTGTTGATCGTCTCA ATGGAGCTTTGCTTGCCAAGGCAATCAGCACCTTCAGAGATGGTGAAACTAGACCTGCCATTGAAGGAATTCAAAAATCT AGAGTACCCATTCTTGTGCTCTGTGAAAACTATGCATCTTCCCCTGCATGCCTTGATGAACTAGCCAAAATCGCTGAGTA TGTTGACAACAAAGCAAAGCAGGTTACTGTGATCTTTTACAAAGTGGAACCTACAGTTATAAGGAAACAAAAAGAATCTT ATGCAGAAGCCATGAATGAACATGAGAAGAGAGAAGGAGAAGACTCAAAGAAGAAGGTACAAACATGGAGGGAAGCTCTG AAAAGAGTATGTGACCTCAGTGGTATACATTTTAAGGACAATATGGATGAATCTGAGCTAATAGAGAAGATTGTTAAAGA CACATTCACTAAATTAGCTCCTGTGCCTTTTCAAATCCCCCACGTAGTTGGCCTTGATGCTCACTTCGAATGTGTGATGT CAGTTTTAGATATTGAGTCTAAAGATACCGTTGGCATGTTGGGAATTTATGGATCTGGTGGAATTGGCAAAACCACGTTT GCCGCCTATCTGTATGACAACATCAGGCATAAATTTGAAGCAGCAACATTTCTTATCCATGATAGAGAAAGAACAAACAG AAGCATTGTAGAGGGCCTAGATGATCTCCAGAAGACACTTCTATCTCAGATGGGAGAGGAAGCAAAAACCTTGGTGGGTA GTACATTAGATAGATGCAATGAAATCAAACTGAGGCTTCGCAAGAGTAGAGTTCTTCTGGTTTTGGATGATGTTGATAAT AAAGTAATATTGAAATCACTGGCTGGAGGATGTGATTGGTTTGGTCCAGGTAGCAGGATCATTATAACAACAAGGGATGC AGCTGTGCTAGACAATCATGATGTTGAAATTAAGAAATACAAATTGGAGGAGCTAAATGACCATGACTCTCTTGAACTTT TTTGTTCGAAAGCCTTTGGTATGAGCAGACCTGCAGAAAACTTTGAAAACATGTCAAGTCGTGCTGTAAGTTATGCAAAG GGTATTCCATTGGCTTTACGAGTAATTGGTTCCAATTTGAAGGATCGAAGCATAGAGGAATGGGAAATTGAATTGGGCAA ATATAGGAAGGTTCCAGATGCTGAGATTCAAAGGGTACTAGAAATAAGCTACGATAGTCTATCTGAACTGGATCAGAGAA TTTTCTTGGACATTGCTTGTTTCTTCATAAGGGAGAAATGGATATATGTTCAAAGGATATTAGAGGCTTGTGATTTCAGT CCAAGTTTTCGAGTCTTTGATTCTAAATGCCTCATATCTATTGATGAAAATGGTTGCTTGGAGATGCATGATCTAATAAG AGACATGGGTAGAGAGATTGTTAGGAAGAAATCACCGTCAAACCCTGGTGAACGGAGCAGACTATGGTCTTGTGAAGACA TTCTTCAAGTACTTCAAGAAAACTCAGGAGGCAGCAAAATTGAAGGAATAATGCTTCATCCCCCTATACATGAAGAAATA GATCATTGGACTAATACTTCCTTTGAGAAGATGAGCAATCTCAGAATTCTTATTGTTCGGAATGCAACATTTTCAACTGG ACCTAGTTATCTGCCGAATAGTTTACGCCTACTTGACTGGATGGGATTCCCATCGAAGTCTCTTCCAACTGATTTTCATC CCGAGAGAATTGTTGACTTCAAGTTATCTTATAGTTCTCTAATATTTGCAGAGCCACTTCAGGCATTTAAAGATTTGATA TTCATGAATATCTCCCAATGTCAATCCATAACTCACATACCAAACCTGTCTGGAGCAAAAAGCTTAAGAGCATTGACACT TGACAGATGTTATAAATTGGAAGGGTTTGATAAATCCTTTGGATTATACATGACAAATCTTGTGTATTTAAGTGCATCGG AGTGCACCATGCTAAAAAGTTTTGTGCCAACAATGTACTTTCCATCTCTCGAAGTTCTTTCATTTAACTTCTGCACATCA CTTGAAAGCTTCCCTGACGTAAAACGGAAGATGGATAAGCTGTTAAAGATTCACCTGAAAAATACTTCTATTAAAGAGTT CCCGAACTCCATTCCTAAACTTACTGGGCTTGAGTATGTAGACCTGTCAAATTGTGAAGGGGTCAGAGATTTATCAAGAA GCTTTTTATTGTTGCCAAAACTTGTCACGTTAAAAGTTGATGGATGTTCTCAACTTGGACAATCATTTAAAAAGTTCAAA GAGAGCCTTTCAGTGGGAAATCCTTGCTCAAGTTTAAAGGCACTATATTTCAGCAAGGCTAATCTATCATATGAAGATCT TTACACAATTCTTGAAATATTTCCAAAATTGGAATTCTTGAATGTACCGCACAATGCATTTGTATCCCTCCCAGAATGCA TCAAAGGATCTTTGCTGCTGAAAAGTCTTGACATAAGCTTTTGCAGGAACCTTGTGGAAATCCCAGAACTTCCATTAACT GTTCAGAATGTAGATGCAAGATACTGTCAGTCCTTAAGTACAACAGCATCAAGTGTGCTATGGTCTCAGGTTTTTAAAGA GACAGAAAGAATACAGGTCGTGATGCCAAAAACAGAAATTCCGAATTGGTTTGACTGTGTTGGAAGTGAAGATATTCTGG TTTTCTGGGCTCGCCACAAGTTCCCTATTATTGCACTAGCATTTGGGCTCCATGAGATACAAATGGACAGCTCAGCATTC TTCCCTGGAATCATATCAGCTAACCAGTCCCACAATGTTGGCCTGTACTTGTTTATAGACGGCCAAGAAATATGTCACAA AGATTACAATGTTGGGAAAAATCATGTGTTAGTGTGTGAGTTAAGGGCTTTGTTCAATGATGAAGAGTGGAAGGGTCTTG ATGCGCGCCTTGGAGATGATTGGAAGCCTGTTCAGGTTCAATGTAAATCAAACTTGATATTGAATCGTTGGGGAGTTTAT GTCTACAAGAGGAAAACTAATGCTGATGATATCCGGTTTAGTTTTCCCGATTCAATAGACAATGTGCCATCATCATGTTT GGTTCCAAAACCAACTCCAGATCAGAAAATAAAACAAGGTCTTGATTTTGTTGAAATATTTGGCCAGTATTTGAATACTC TTAAATTAGAGCAATCTGCCTATGTTGCAAATGAGCTATTGAGATGGTGGAGGAATTCTAAGGGTGATGTCAAAGAGGAA GTTTCATCCTCTACATATGGAGCTAGTTTAATGCAAGAACACGAACAATGTTTGTGGGATTTGGCACATATTTTAGAGAT GATGGAGAATGTAGCAAAACACATCACTGATTCAAAAGTTCAAAGTGCAGGCCAGTTGGTGATACAATTATTGATGGCGC GTGCACAACCTATGAAGGAAAAAGGCCATGAGACGTTGCACATTAATACAAGCATTCCTGTTATACTGGAGGAATGTGAG TACCACCCTTGTACAGATTTAGCAGAAGCTCCGAGACGTCGCTATTGGGGAAGCGTGGAGCTAGAAGAAGGAGATCCATT TGTGTGGAGAATTTGGAAAAGCAAAGAATCCTTTCAGGAGAGGGTAAGCATTGTTTTGTCAAAATATCAGCATACCTCTA CAGAGGGAGCTTCAAGCTCTTGCCATGGGGGATCCTTGGAGGAAGAAAACAAATATCCTCCTGCATTGGAAGAATTAACT AGGAGGATAGAGCAAGATGCAATGAGGTTGAACAAATCTTATGGGAAGTTGAAGGCTTATTTTGTTCCAATAGATGTCCC AGTTTCTGACAAATATAATTTGGAAACAGCAATCATCAGAGGACAAGAAAGGTTGGGAAGGTTAGGGTCTAATTTCAACA AGACACCTTATGGGAAGTTGAGGGTGGCGCATGATGATGCTCTGGATACTGTTCATATGCAGCCTGAGTTGAGGGTGGAG CATGATGATGCTTTAGGTACTGTTCATATGCAGCCTGAGTTGAGGGTGGATCATGATGCTCAGAACACTAGTCAGAGTCA GAAGCAATATGAGTTGGGGGTGAAGCATGTTGCTCAGAGTCAGAGCACTGTCCAGAATCAAAGTAAGAAGGGTTGGACTA AGATTCTTAATTGGTGGATCCGCTGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0057700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLREVTPIKHTLAKLFKSMPNMSNRSATSLDFSYDVFLGYFNGGTSKAFVDRLNGALLAKAISTFRDGETRPAIEGIQKS RVPILVLCENYASSPACLDELAKIAEYVDNKAKQVTVIFYKVEPTVIRKQKESYAEAMNEHEKREGEDSKKKVQTWREAL KRVCDLSGIHFKDNMDESELIEKIVKDTFTKLAPVPFQIPHVVGLDAHFECVMSVLDIESKDTVGMLGIYGSGGIGKTTF AAYLYDNIRHKFEAATFLIHDRERTNRSIVEGLDDLQKTLLSQMGEEAKTLVGSTLDRCNEIKLRLRKSRVLLVLDDVDN KVILKSLAGGCDWFGPGSRIIITTRDAAVLDNHDVEIKKYKLEELNDHDSLELFCSKAFGMSRPAENFENMSSRAVSYAK GIPLALRVIGSNLKDRSIEEWEIELGKYRKVPDAEIQRVLEISYDSLSELDQRIFLDIACFFIREKWIYVQRILEACDFS PSFRVFDSKCLISIDENGCLEMHDLIRDMGREIVRKKSPSNPGERSRLWSCEDILQVLQENSGGSKIEGIMLHPPIHEEI DHWTNTSFEKMSNLRILIVRNATFSTGPSYLPNSLRLLDWMGFPSKSLPTDFHPERIVDFKLSYSSLIFAEPLQAFKDLI FMNISQCQSITHIPNLSGAKSLRALTLDRCYKLEGFDKSFGLYMTNLVYLSASECTMLKSFVPTMYFPSLEVLSFNFCTS LESFPDVKRKMDKLLKIHLKNTSIKEFPNSIPKLTGLEYVDLSNCEGVRDLSRSFLLLPKLVTLKVDGCSQLGQSFKKFK ESLSVGNPCSSLKALYFSKANLSYEDLYTILEIFPKLEFLNVPHNAFVSLPECIKGSLLLKSLDISFCRNLVEIPELPLT VQNVDARYCQSLSTTASSVLWSQVFKETERIQVVMPKTEIPNWFDCVGSEDILVFWARHKFPIIALAFGLHEIQMDSSAF FPGIISANQSHNVGLYLFIDGQEICHKDYNVGKNHVLVCELRALFNDEEWKGLDARLGDDWKPVQVQCKSNLILNRWGVY VYKRKTNADDIRFSFPDSIDNVPSSCLVPKPTPDQKIKQGLDFVEIFGQYLNTLKLEQSAYVANELLRWWRNSKGDVKEE VSSSTYGASLMQEHEQCLWDLAHILEMMENVAKHITDSKVQSAGQLVIQLLMARAQPMKEKGHETLHINTSIPVILEECE YHPCTDLAEAPRRRYWGSVELEEGDPFVWRIWKSKESFQERVSIVLSKYQHTSTEGASSSCHGGSLEEENKYPPALEELT RRIEQDAMRLNKSYGKLKAYFVPIDVPVSDKYNLETAIIRGQERLGRLGSNFNKTPYGKLRVAHDDALDTVHMQPELRVE HDDALGTVHMQPELRVDHDAQNTSQSQKQYELGVKHVAQSQSTVQNQSKKGWTKILNWWIR 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SUPERFAMILY 25 168 144 2.22E-19
PANTHER 29 1183 1155 0.0
PANTHER 29 1183 1155 0.0
Gene3D 32 189 158 2.2E-40
SMART 33 166 134 3.3E-18
Pfam 34 195 162 1.4E-21
ProSiteProfiles 51 166 116 15.269
Coils 127 147 21 -
Gene3D 190 362 173 4.4E-29
SUPERFAMILY 195 458 264 5.01E-57
Pfam 210 423 214 5.4E-27
PRINTS 226 241 16 1.0E-20
PRINTS 305 319 15 1.0E-20
PRINTS 399 413 15 1.0E-20
SUPERFAMILY 435 539 105 1.55E-12
SUPERFAMILY 551 896 346 2.55E-39
Gene3D 557 730 174 3.9E-18
Gene3D 731 907 177 2.6E-21
PRINTS 752 768 17 1.0E-20

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process Signal transduction The cellular process in which a signal is conveyed to trigger a change in the activity or state of a cell. Signal transduction begins with reception of a signal (e.g. a ligand binding to a receptor or receptor activation by a stimulus such as light), or for signal transduction in the absence of ligand, signal-withdrawal or the activity of a constitutively active receptor. Signal transduction ends with regulation of a downstream cellular process, e.g. regulation of transcription or regulation of a metabolic process. Signal transduction covers signaling from receptors located on the surface of the cell and signaling via molecules located within the cell. For signaling between cells, signal transduction is restricted to events at and within the receiving cell.
Molecular function ADP binding Interacting selectively and non-covalently with ADP, adenosine 5'-diphosphate.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0057700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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