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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0103200 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0103200.3 |
| Related isoforms 8 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Multidrug resistance protein ABC transporter family protein; TAIR: AT1G30410.2 multidrug resistance-associated protein 13; Swiss-Prot: sp|Q9C8H0|AB12C_ARATH ABC transporter C family member 12; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3SIW7|A0A0S3SIW7_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0103200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:12777031..12799571) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TGATTTGAAATATAGAGATATAAAAAAAGTGTAAAAATAAATTGATTATCACTTAGTGTTCTTACCATTCCTCTAAAGGG CATATGTACAATCCGTCAGCCGTGACGCTAGCATTGAAGATTTATTTGTCATTTTGTGGTTTGTTTCAAACGTCGATTGT AAGAGAAGTCCTCGTGGTTGTGTTTGTGGAAGACGAAGTTGTATTAATTATCCACCACTCACGGTCACATGAACATGCAT GTATGTAATGACTAATGAGTCAACTTCTATATTCCTTTTTTACTTGACTTGTTTCAGCACCACAATTATTCAGTCTTCGG AGATTATGTTCACTTCTAACTTCTCCCCCCACTTTATGTAACTGTCTGTCACTATCAGTTAGCAACACTTTGCTATTTCT CCTTTGCTACTACTAGACTACTACTTTATTTCCTTCTAAGTTGTATCTATCTTCATTTGCTGCATGAAGTAATCTTGCTA AGAGGATAAAACATGTGTTGCCTTCAAATTGATTGGTAAAAGTCTCAGATGGGTTTCCCTGCAAACTTATTGGAGCTTAT CTACTTGAAAATACATTGAATAAGCTCCAATAAGTGTTTTCTGGTTTGCATCCAAAAAGGTACTAACATAGTTAGTTACC TGTAGCTGGGTTTAGGTTGGTTTTATTTTCTGAATGAAAAATGTGGGAATCACACTCACATTCTTCTTCCTTTAATTTCA TCTAAGGTGATTTATTTTCTCTTGTTGTAACATGATGATGTTTTTTTGTGTGGTTTAATGTTGCAGTTACACCTCACTCT TGAGTTAGAAAAAGAGCTCTTTTTGAAGCATCATTGGTTAAAATCTGTGTAGGGTTTGAGTCAATTGAGTCAGGCAAAGA TGGGGTTTGAACCAGTGGTTTGGTATTGCCAGCCAGAAGCAAACAGTGTTTGGGGTAAAATGGTGGATAGTGCTTTTGGG 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TTATAACTGGTTCTCATACAAAAAGAGTTTTCAATGTAGTGCCTATATGTACAACCCCCATCTTTGGTATTGTCCCAGCC GTCTATGGCTGTTATACCACTACGAGATTGGCATTGAACTACCAAGAAATACAGGGACCAAATTGAAAATGATTGTTACA TGTAAGGACCAAGATATTTCTAGTCCCAACACCTGATACTGATCTTCAATTTTCTCCCTTTGCACTCTTCTAGGATGGTA TATAATTTCTCAATATGGAAATATGGATCGTGTTTAAAACAGTTTTTCTTACAATTTGGATTAGGCCTAACTCTACCTCA AAAGCTAGTTTAGGAGTGAGGATTGTTCTACCCTTTATAAGAACTAGCCATATCTCTAGTCAATGTGAGACTTTTCATCA CGCCTCTCACACCCAAGGCTAGACATGGAATGAACATTTGCGGTGGCCCATATATGAGAGGTCTCCAATAAGTTGATGTA GGATAGACACTGATATCATCTTAAAATTTGGGTTAGATATGACTCTATCCCAAAAGCTAGCTTAGGAGTGAGGTTTGCTC TACCTTTATAAGGATTATTTTGATCATATCTCTAGTCAATGTGAGACTTCTAAACAATTTTACATGCCATAAAGATTTGA CAAAGTTTTTTACTTTGACTTTATCTTTTCTGAGTTTGGTACTGGCTATGTTTAATTCCTAAAAACTTAGTTATAATTAT GCATATAGGACTAAATTGAAAACTTTTTCACACAAGGACCAAATTAAGAATTAGTGTCATGAAAAAGGACTCAAAGTACA TCACCAAATGAGTTTAAGCATTCTACATGGAGTGGATTCTTTTTTCCCAATCAAATTAGTCAACATTTGATAATCCAATA TTAAGATTCGTCTTTCGTATACTTTCCAGGTTCTTGAATATGGTTCACCAGAGGAGCTCTTAAAAAATGAAGAAAGTGCA TTCAATAAGATGGTTCAAAGCACTGGACCTGCAAATGCTGAGTATTTATGTAGCCTAGTGTTTGGAAGGACAAAGAACAA TTCTGGTGAATATAACAAGGGGCAAGAAAGCCACACGAGACAGTTAGCTTTTACCCATTGGGCTGCTGCTACCAAGTTTG CCATAGCTTCTACCCTTTCTTCTGTACACAATAACCTTCAAAAGCCTAGTTCTAAGGAGAATAAAGATTTCCTTGATGAA ACAAAGGATGCAGTGACAACACTTCAGGAAGTTCTAGAGGGGAAGCATGATGAAGCCATAGAAGAGACACTGACTAAATT CCATGTTCCAACATATAGATGGTGGTCCACCCTCCATCAAGTTATTGAAGGTAAACATACATAATCATGATATTATTAAG GCTTAATACATCAGAAGGCCCCTGAAATTGTAAAGGGAATCAGTTCCAGGGCCTGGAAAATTTTCGCATCAAATTGGGTC CCTAAAATTTTTTTTTTAATTCAATTAAGGCCAAATCTCAATTTTGTCCTAGTCATCAGTGACACCTGGCTTTTATAATT TTTTTTTAATTAAAAAATATTAAAAAAATAATTTTTAATTCCAAGTCAACAAAATAATCAAAAAAAAAAATTAAAAACTT AATAAAAACCTAATCTAATAATCATAAACTAAACAACCTAATAAACCTAATTTAAAAATCTAATCTTCAACACCATCATC TTCATCATTCTCATCTTCAACACCCAACACCTTCATCTTCTAAACCCAGCAACATCCACCCCACCTGCAACCTCAACATC CACCTCCAACACCATCCCCAAACCTCAACCTCAACCTCCAACCCCCACCCCCAAACGGCCAAACCAAAACTCCACCCAAC CCCCAACTCCACCTACAACCGAAACCCCATCCCCACCCCCACCTGCAACTGAAACCTCCACCCCCACCCCCACCCGAAAC CAAAACCCCAAATCCCCAAATCCACCACCAGGCGATGCAAGGAGAAGGAGTGATTGAGAGAGAGAAAGAAAATCTCAACC TCCTTGAGTCCCAAAACCCCGATTTAGAGGCGGTGGCGCTCCATCCGACACACCGCTGCAGCCACTGCGTGAAGCTTCTG TGGATGTTGGATGTGGTTTGCATGTGGGTTTTAGTCTCTTTGATTTTCTCGATCTGGACCGATTCTTTCAGATCTGGTCT CTTTTGTTTCTCTTTTTCTTTGTTTCTTGATCTGGTTTCTTTTTCAGATCTGGTTTCCTTTGTCCTTTAGGTTCTATGTG TTTTCCCCTTTATCTTTTCCTGGAGTTGAACACAAAATGGGTTGAAGTACATATAACATTCTTATATATGTCAAATTTCT TCAATTCTTTAGGGCCAGTAGTTGATTAACGAACAAGAGGTGCTGCTCAAACAGGTACCAGTTACAAGAGAAATAAAAAA CAAAGACAGGGGAAAATGAAACAGGGGAAAAGATAGACAAAATTCAAATCAAAATAAAAAGATGTGCAGGTTCACGCAGC AGCATAACAAGCAGCAAGTTTAGCATATCAGTAGGCACAGGTTTGCAGGAGAGCAAAAGCAAATCAACCCCCCATGGTCG TTTGAACCTGAACCATGGTGTGCGAGGATGGTGCTTGATCTTGCATTAGTGATTATTAGATTAGGTTTCTATTTAGATTA TAGATTTTATTAATTTTTTTATTTTTTATTTATGCTTCAATATATGAGTTGGTATTAAAAAATAAAGTTTTAGAAATTTT CAGGTAAAAAATAATTCCAAATGCCACGTGGAAAAGCTGAGTAGGCTAAAATTGAAGCCACTTCAGCATCAGACACACTT TGTCCTTAATTGAATTAAAAAAAAAATTTTAGGGACCCAATTTGATGCGAAAATTTTCCAGGTCCTGGAACTGATTCCCT TTACAATTTCAGGGGCCTTCTGATGTATTAAGCCTATTATTAAAATGGTTAAAATATGCTTTTTGTTCCGCACTATTGGA AATTATTGTTTAGTCCCTCTTTGTTTTTTTTTTAGACTTCAATTACTACCTTTTCGAAATAGTTATGTTTCAGTCGCCGT GAGGACCAATGCCAAAAGAAAAAAAAGAAATTTTGAGGACCATCTTTTTTAATAAAATTTCAGTCCTCGAAATCTTTTTT TCTTTTGGTATTGATCCACGCAGGGACTCTAAAATATGGCAATTTTAAAAATGCTGAAACTGAAGTCAAACAAAAAAAAC AAGGTTAACTATGTTTTTGGTCCTCAAAATATAACAAATGTTGGTTTTAGTCTCTAAAAGAATATTTCTTAGTTTTTAAT CCCTGGAAATACACATTTGCTATATTTCTTTTTTTTGTTACATCGGAAAGATAAATTACAACGTGCAGGAATTGAACCTT GGACCTCCCTCACCCAACTCATAGGTCCCTTAACTCTTACCACTTGAGTTATCATTCGGGAACAACATTTGCTATATTTC CAGTGGACTAAAAACAGACTTAAGCAAAAAAAAAAACAAAGGGGGACTAAAACCAATAATGCTGGGACAAAAACATATTT AAGCCTATTAAAAAAAACCTTCCTGATGGGCTCTGGGCTCATATGGAAGCATGGTCTCTGATTTTTCTAAGCAAGTACTC ATGTTTCCTTTTTACTTCAAGTAATTTACTGAGTTGTCCTCAAGTCCTCATATATTTTCAGTTTCACACTTAAAGTAACA TTATTTGTTGGAGCACAAGTTTTTCCATCAAACCACTACAAAATTAAAGCTGTTGATGCAATCATAAAAAACAATAACTT AACATATTTTAAGTTTAACAATAATATTTCAGCAACCAAAAATCCTTTTATTTTCCCTATTTGGAGGTATTTTAGTTACG TTATACCATGGTTTACAAAAAAACTATGCGTGCATCTGCACTTTGCTGATTCTATATTCAACTATTTCTTCAGGTCTTGC TATCTTGATCAGGTTGCCTCCAGACAACATTCAACAATTAGAACCTGATTTTGAAGGAAGATCCTTTGACTAACACATTT TGAGATATGAAGAGAGGAGTAATTATATCCAATCACATCTCGATCTAAAGGACAGTTGCAATCACAAAGATCCCTTAGAT TTTCCCCCCTCTATAATTCTATCCTCTTTTTGTATTTTTTTTTTACATTTTCTATTTTCCCTCGTGTTAACAGGTTACTT TCCTCAGGAAGAAAATTGAGTTATCCAATTCAACACACGTTATTCTATAGGACCTGTATAACTCAAGTGGAATGGAGCAC GAGTATCTAATTATATGGTACTTAGTTATATATAGTAAATCTAATGGTCATGAGTTATTAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0103200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGGGTTTGAACCAGTGGTTTGGTATTGCCAGCCAGAAGCAAACAGTGTTTGGGGTAAAATGGTGGATAGTGCTTTTGG GTCATATACACCTTGTGCAATTAACACTCTTGTTATCTCCATCTCCAATTTGGCTCTGATGGGCCTGTGCTTGTGTCGAA TATGGCTTACCATAAGCAATGCAAAAGCTCAGAGGTTTTGTTTGAAATCAAATTACTATAACTATGTTCTGGGAATGTTA GCTGGTTATTGTGCTGCTCAGCCTTTGTTGAGATTATTTACTGGAATTTCAGCCTTCAACCTGAATGGGGAAACTGGCTT TGCTCCTTTTGAGATAACAGCTCTGATCATTGAATCACTAACTTGGTGCTCAATGATAATTCTCATCCTCATGGAAACCA AGGTTTATATCCGGCAATTTAGATGGTGGGTGCGGTGTGGAGTTATTTATGTTTGGGTAGGAGATATTGTAATGCTTAAC CTTCTTCTGTCCGTGAAAGATTCCTGCAGCAGATCTGCTCTGTTTCTCTATATTAGCACTGTTATCTGCCAGGTGTTGTT TGGTACCTTGCTTCTTGTTTACATTCCTAAATTGGTTCCTTATTCTGGATCTGATCATGTAACAATGTACGCTGAGCTAC CTGACAATGGTGAATATGAACCACTTTGTGGAGAAGATCAAGTTTGCCCTGAGATGCGTGCCAATCTATTCTCTAGATTG TGTTTTGGATGGATAACTCCACTCATGCAACAAGGATACAAAAAACCCGTCACTGAGAAGGATGTTTGGAAGCTAGACAA ATGGGATCAAACAGAGACATTAACTGAAAAGTTCCGAAGATGTTGGATGTTAGAATTTCAAAGCTCTAACCCTTGGCTTT TAAGAGCATTGAACAACAGCCTGGGAAAAAGGTTTTGGTGGGGAGGCTTCTGTAAGATTGGAAATGATCTTTCTCAGTTT GTGGGGCCTGTTTTGCTGAACCATCTTTTAGATTCGATGCAAAATGGAGATCCAACTTGGATTGGTTACGTCTACGCCTT CTCCATATTTGTTGGAGTGTCAGCTGGTGTTCTATGTGAAGCACAGTATTTCCAGAACGTTATGCGTGTTGGTTTTCAGC TTAGATCAACATTGGTGGCTGAGATATTTAGAAAATCTTTGAGGCTAACACAAGAAGATCGAAAGAATTTCACATCTGGG AAGCTTATGAATATGATAACAACAGATGCGAACGCACTACAGCAAGTATGTCAACAACTTCACGCACTGTGGTCAGCACC ATTCCGTATCATCGTAGCTATGGTTCTCCTATACCAGCAATTAGGTGTTGCGTCCCTTCTTGGATCACTAATGCTAGTTC TCATTGTCCCTCTACAGACATTTGTGATTGGCAAAACGCGAATGCTATCAAAGGAAGGACTAAAACAGACAGACAAAAGG GTTGGTCTCATGAATGAAATTCTGGCTGCCATGGACACAGTAAAATGTTATGCATGGGAAACAAGCTTTCAATCTAGAAT TCAGAGCATACGAGATGAAGAGCTATCATGGTTCCGCAAAGCACAGCTTGTATATGCTCTCAACTCTTTTATATTAAACA GCATGCCAGTTCTTGTGACAGTGACCACATTTGGAATGTTTACTTTACTTGGTGGAGAATTGACACCTTCAAGGGCATTT ACCTCGCTATCTCTGTTTTCAGTTTTGCGGTTTCCTTTATATATGCTTCCAAGTTTACTAAGTCAGATAGCAAATGCAAA GGTCTCCTTGCAGCGTTTGGAGGAACTGTTCTTGGCTGAGGAGCGAAATTTAAAACAAAATCCACCTATTGTACCAGGAC TTCCTGCCATCTCAATTAGTAATGGATACTTTTCATGGGATCCTAAGGCAGAGAAGCCTACATTATCAAATATCAATTTG GAAATACCAATTGGCAGCTTAGTTGCAATTATTGGTGGTACTGGAGAAGGGAAAACATCACTTATTTCAGCAATGATTGG AGAGCTACCTCCATTAGCAGATGCAAATGCTACAATCAGAGGCACTGTTGCTTATGTTCCTCAGGTTTCATGGATTTACA ATGCTACAGTTCGTGAAAATATATTATTTGGATCAAAATTCGAACATGAAAGATATTGGAAGGCTATCGACGTCGCTGCT TTACATCATGATCTCAACTTCCTACCTGGACGTGATTTAACAGAGATTGGAGAAAGAGGAGTGAATATTAGTGGTGGACA AAAGCAAAGAGTTTCCTTAGCTAGGGCTGTATACTCGAATTCGGATGTGTATATATTTGATGATCCTTTGAGTGCTCTTG ATGCTCATGTTGCACAGGAGGTTTTCGGCAACTGTATAAAGGAAGGGCTGCGAGGAAAAACCAGGGTTCTTGTCACCAAT CAACTACACTTTCTCCCTCAGGTGGATAAAATTATTCTGGTTAGTGAAGGCATGATTAAGGAGCAGGGAACCTTTGAGGA GTTGTCAAAATGTGGGCATCTATTTCAGAAACTAATGGAAAATGCAGGGAAAATGGAACATCAAGCAGATAGTAACGAAG ATAGAGATAGTCATGATAACGATTTACCCTTAAACAATGAGGCAATTGTAGAGTTACCAAATGGTGCAAGCTATGAAAAG AAGGGAAAATTACAAAAATCAGTACTTGTTAAGAAAGAAGAGCGGGAGACAGGTGTGGTTAGCTGGAAAGTTATAACGAG GTACAAATCTGCTCTGGGAGGACTGTGGGTAGTTCTCATACTCTTTGGATGCTATACGTTAACAGAAGTTCTTCGAATTT CAAGTAGCACATGGTTAAGCGTTTGGACATCTCAAGATTCTGCTGCAGCTGATGAAACAGAATATTTTCTTTTCATCTAT GCACTTTTCTCATTTGGACAGGTAACTGTGACACTTGCAAACTCTTATTGGTTGATCATTTCAAGTCTTCGCGCTGCCAA AAGATTGCATGATGCCATGCTAGATAAAATCCTGAGCGCTCCAATGATATTCTTCCAAACCAACCCTGTTGGTCGCATAA TTAATAGGTTTGCAAAAGACACGGGAGATATAGATATGTATGTTTTTGCGTTGGTGAATGGGTTTCTGGGGCAAGTGTGG CAGTTAGTTTCGACATTTGTTCTTATCGGCACAGTGAGCACCATATCCCTGTGGGCCATAATGCCACTACTTACCATCTT TTATGCAGCTTATATTTATTACCAGAGCACAGCTCGAGAGGTGAAGCGCTTGGATTCCATTACAAGATCTCCTGTTTATG CGCATTTTGGGGAATCATTGAATGGTTTGTCAAGCATTCGCGCTTACAAAGCATATGATAGGATGGCACAGATCAATGGA AAATTCATGGATAACAACATAAGATTCACTCTTGTCAACATTAGTTCGAACCGGTGGTTGACCATAAGGTTAGAATCATT AGGAGGCCTCATGATTTGGTTGATAGCAACATTCGCTGTCCTGCAAAATGGAAGAGCTGAAAACAAGGCAATGATTGCGT CTTCAATGGGCCTACTTCTCAGTTACACTTTGAACATAACAAATCTCTTGAGCGGTGCCCTCAGACAAGCAAGCAGAGCT GAGAACAGTCTAAATGCGGTTGAGCGCGTTGACACCTATATAAATTTAGAATCCGAGGCTCCAGGTATAGTTGAGGAAAA CCGTCCACCACCAGGATGGCCGACAACTGGATCGATTGAGTTTGAGAATGTTGTTCTCACATACAGGCCTGAACTTCCTC CAGTTCTGCATGGAGTGTCTTTCACAGTATGTCCAACTGAGAAGATAGGGGTAGTTGGAAGAACTGGTGCAGGAAAGTCT AGCATGCTTAATGCGTTATTCCGGATTGTGGAACTACAAAGAGGAAGAATCACTATTGATGGTTGTGATGTTTCGACAAT TGGACTAGCAGATCTGCGAAAAGTTCTCACCATCATACCGCAATCGCCAGTTCTGTTCTCTGGAACTGTTCGCTTCAATC TTGATCCATTTAATGAACACAATGATGCTGACCTATGGGAATCTTTAGAAAGGGCGCATTTGAAGGATGTAATTAGAAGA AATCCACTTGGCCTAGATGCTCAGGTTTCAGAGGGAGGAGACAATTTCAGTGTTGGACAGAGGCAACTCATAAGTCTAGC AAGAGCATTGCTACGAAGATCAAAGGTTCTTGTCCTGGATGAAGCTACTGCTGCTGTAGATGTTAGAACAGATGCCCTTA TCCAGAAAACTATCCGACAAGAATTCCAGTCTTGCACCATGCTCATCATTGCACACAGATTAAATACAATTATTGACTGC GATCGGATTCTGTTGCTTGATGCTGGCCGGGTTCTTGAATATGGTTCACCAGAGGAGCTCTTAAAAAATGAAGAAAGTGC ATTCAATAAGATGGTTCAAAGCACTGGACCTGCAAATGCTGAGTATTTATGTAGCCTAGTGTTTGGAAGGACAAAGAACA ATTCTGGTGAATATAACAAGGGGCAAGAAAGCCACACGAGACAGTTAGCTTTTACCCATTGGGCTGCTGCTACCAAGTTT GCCATAGCTTCTACCCTTTCTTCTGTACACAATAACCTTCAAAAGCCTAGTTCTAAGGAGAATAAAGATTTCCTTGATGA AACAAAGGATGCAGTGACAACACTTCAGGAAGTTCTAGAGGGGAAGCATGATGAAGCCATAGAAGAGACACTGACTAAAT TCCATGTTCCAACATATAGATGGTGGTCCACCCTCCATCAAGTTATTGAAGGTCTTGCTATCTTGATCAGGTTGCCTCCA GACAACATTCAACAATTAGAACCTGATTTTGAAGGAAGATCCTTTGACTAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0103200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGFEPVVWYCQPEANSVWGKMVDSAFGSYTPCAINTLVISISNLALMGLCLCRIWLTISNAKAQRFCLKSNYYNYVLGML AGYCAAQPLLRLFTGISAFNLNGETGFAPFEITALIIESLTWCSMIILILMETKVYIRQFRWWVRCGVIYVWVGDIVMLN LLLSVKDSCSRSALFLYISTVICQVLFGTLLLVYIPKLVPYSGSDHVTMYAELPDNGEYEPLCGEDQVCPEMRANLFSRL CFGWITPLMQQGYKKPVTEKDVWKLDKWDQTETLTEKFRRCWMLEFQSSNPWLLRALNNSLGKRFWWGGFCKIGNDLSQF VGPVLLNHLLDSMQNGDPTWIGYVYAFSIFVGVSAGVLCEAQYFQNVMRVGFQLRSTLVAEIFRKSLRLTQEDRKNFTSG KLMNMITTDANALQQVCQQLHALWSAPFRIIVAMVLLYQQLGVASLLGSLMLVLIVPLQTFVIGKTRMLSKEGLKQTDKR VGLMNEILAAMDTVKCYAWETSFQSRIQSIRDEELSWFRKAQLVYALNSFILNSMPVLVTVTTFGMFTLLGGELTPSRAF TSLSLFSVLRFPLYMLPSLLSQIANAKVSLQRLEELFLAEERNLKQNPPIVPGLPAISISNGYFSWDPKAEKPTLSNINL EIPIGSLVAIIGGTGEGKTSLISAMIGELPPLADANATIRGTVAYVPQVSWIYNATVRENILFGSKFEHERYWKAIDVAA LHHDLNFLPGRDLTEIGERGVNISGGQKQRVSLARAVYSNSDVYIFDDPLSALDAHVAQEVFGNCIKEGLRGKTRVLVTN QLHFLPQVDKIILVSEGMIKEQGTFEELSKCGHLFQKLMENAGKMEHQADSNEDRDSHDNDLPLNNEAIVELPNGASYEK KGKLQKSVLVKKEERETGVVSWKVITRYKSALGGLWVVLILFGCYTLTEVLRISSSTWLSVWTSQDSAAADETEYFLFIY ALFSFGQVTVTLANSYWLIISSLRAAKRLHDAMLDKILSAPMIFFQTNPVGRIINRFAKDTGDIDMYVFALVNGFLGQVW QLVSTFVLIGTVSTISLWAIMPLLTIFYAAYIYYQSTAREVKRLDSITRSPVYAHFGESLNGLSSIRAYKAYDRMAQING KFMDNNIRFTLVNISSNRWLTIRLESLGGLMIWLIATFAVLQNGRAENKAMIASSMGLLLSYTLNITNLLSGALRQASRA ENSLNAVERVDTYINLESEAPGIVEENRPPPGWPTTGSIEFENVVLTYRPELPPVLHGVSFTVCPTEKIGVVGRTGAGKS SMLNALFRIVELQRGRITIDGCDVSTIGLADLRKVLTIIPQSPVLFSGTVRFNLDPFNEHNDADLWESLERAHLKDVIRR NPLGLDAQVSEGGDNFSVGQRQLISLARALLRRSKVLVLDEATAAVDVRTDALIQKTIRQEFQSCTMLIIAHRLNTIIDC DRILLLDAGRVLEYGSPEELLKNEESAFNKMVQSTGPANAEYLCSLVFGRTKNNSGEYNKGQESHTRQLAFTHWAAATKF AIASTLSSVHNNLQKPSSKENKDFLDETKDAVTTLQEVLEGKHDEAIEETLTKFHVPTYRWWSTLHQVIEGLAILIRLPP DNIQQLEPDFEGRSFD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 27 | 27 | - | – | |
| PANTHER | 23 | 1514 | 1492 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 23 | 1514 | 1492 | 0.0 | – | |
| Phobius | 28 | 51 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 36 | 58 | 23 | - | – | |
| Phobius | 52 | 71 | 20 | - | – | |
| TMHMM | 71 | 93 | 23 | - | – | |
| Phobius | 72 | 90 | 19 | - | – | |
| Phobius | 91 | 109 | 19 | - | – | |
| TMHMM | 108 | 130 | 23 | - | – | |
| Phobius | 110 | 130 | 21 | - | – | |
| Phobius | 131 | 141 | 11 | - | – | |
| TMHMM | 142 | 164 | 23 | - | – | |
| Phobius | 142 | 162 | 21 | - | – | |
| Phobius | 163 | 173 | 11 | - | – | |
| Phobius | 174 | 195 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 174 | 196 | 23 | - | – | |
| Phobius | 196 | 339 | 144 | - | – | |
| Gene3D | 287 | 599 | 313 | 1.5E-28 | ||
| SUPERFAMILY | 291 | 593 | 303 | 3.27E-43 | ||
| ProSiteProfiles | 306 | 585 | 280 | 39.502 | ||
| CDD | 307 | 593 | 287 | 8.04606E-109 | – | |
| Pfam | 308 | 573 | 266 | 2.7E-37 | ||
| Phobius | 340 | 364 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 342 | 364 | 23 | - | – | |
| Phobius | 365 | 429 | 65 | - | – | |
| Phobius | 430 | 458 | 29 | - | – | |
| TMHMM | 436 | 458 | 23 | - | – | |
| Phobius | 459 | 522 | 64 | - | – | |
| Phobius | 523 | 547 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 527 | 549 | 23 | - | – | |
| Phobius | 548 | 558 | 11 | - | – | |
| Phobius | 559 | 580 | 22 | - | – | |
| TMHMM | 559 | 581 | 23 | - | – | |
| Phobius | 581 | 910 | 330 | - | – | |
| Coils | 583 | 603 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 600 | 864 | 265 | 9.6E-71 | – | |
| SUPERFAMILY | 612 | 840 | 229 | 1.52E-54 | ||
| CDD | 617 | 817 | 201 | 5.5299E-102 | – | |
| ProSiteProfiles | 617 | 841 | 225 | 22.269 | ||
| Pfam | 635 | 770 | 136 | 6.7E-18 | ||
| SMART | 644 | 824 | 181 | 3.1E-6 | ||
| ProSitePatterns | 743 | 757 | 15 | - | ||
| Gene3D | 881 | 1221 | 341 | 2.5E-33 | ||
| TMHMM | 911 | 933 | 23 | - | – | |
| Phobius | 911 | 935 | 25 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 915 | 1219 | 305 | 6.28E-46 | ||
| CDD | 918 | 1214 | 297 | 5.69182E-90 | – | |
| Pfam | 919 | 1166 | 248 | 3.5E-30 | ||
| ProSiteProfiles | 919 | 1202 | 284 | 31.236 | ||
| Phobius | 936 | 954 | 19 | - | – | |
| Phobius | 955 | 979 | 25 | - | – | |
| TMHMM | 956 | 978 | 23 | - | – | |
| Phobius | 980 | 1025 | 46 | - | – | |
| Phobius | 1026 | 1049 | 24 | - | – | |
| TMHMM | 1026 | 1048 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1050 | 1054 | 5 | - | – | |
| TMHMM | 1052 | 1074 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1055 | 1074 | 20 | - | – | |
| Phobius | 1075 | 1146 | 72 | - | – | |
| TMHMM | 1139 | 1161 | 23 | - | – | |
| Phobius | 1147 | 1164 | 18 | - | – | |
| Phobius | 1165 | 1169 | 5 | - | – | |
| Phobius | 1170 | 1190 | 21 | - | – | |
| Phobius | 1191 | 1616 | 426 | - | – | |
| Gene3D | 1223 | 1475 | 253 | 7.9E-90 | – | |
| SUPERFAMILY | 1229 | 1471 | 243 | 2.24E-74 | ||
| CDD | 1237 | 1457 | 221 | 3.89705E-130 | – | |
| ProSiteProfiles | 1239 | 1473 | 235 | 18.441 | ||
| Pfam | 1256 | 1404 | 149 | 3.3E-27 | ||
| SMART | 1265 | 1458 | 194 | 1.2E-11 | ||
| ProSitePatterns | 1376 | 1390 | 15 | - |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Cellular component | Integral component of membrane | The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane. | ||
| Molecular function | ATPase activity | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate + 2 H+. May or may not be coupled to another reaction. | ||
| Molecular function | ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances | Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate, to directly drive the active transport of a substance across a membrane. | ||
| Biological process | Transmembrane transport | The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0103200.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…