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LotjaGi3g1v0103200.5

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0103200
Transcript ID LotjaGi3g1v0103200.5
Related isoforms 8
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Multidrug resistance protein ABC transporter family protein; TAIR: AT1G30410.2 multidrug resistance-associated protein 13; Swiss-Prot: sp|Q9C8H0|AB12C_ARATH ABC transporter C family member 12; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3SIW7|A0A0S3SIW7_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0103200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:12779803..12798686) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TTTGAACCAGTGGTTTGGTATTGCCAGCCAGAAGCAAACAGTGTTTGGGGTAAAATGGTGGATAGTGCTTTTGGGTCATA TACACCTTGTGCAATTAACACTCTTGTTATCTCCATCTCCAATTTGGCTCTGATGGGCCTGTGCTTGTGTCGAATATGGC TTACCATAAGCAATGCAAAAGCTCAGAGGTTTTGTTTGAAATCAAATTACTATAACTATGTTCTGGGAATGTTAGCTGGT TATTGTGCTGCTCAGCCTTTGTTGAGATTATTTACTGGAATTTCAGCCTTCAACCTGAATGGGGAAACTGGCTTTGCTCC TTTTGAGGTGGGTCTCTCATTAATTTAGATTCCCTGCAGTTAAAAATTCCTAAATTTACGCAGTCAAAAGAATTTGAGAC ATGCTATCATGATCGAATGGGTTAAACTTTAAGCTGATCACTGCGGTCCGATCTTGATGAAATATATGAGCCAACTGATC TTTGATCAAACGGTAGGGTTTAGATTTATTGACTGCGTGAATTTAAGATTGTCTTGACTGCAGGAAACCCAAATTCGTCT CTCATGCATACTCTGATTACATCCCTTTGCATGAATGCATAGTATCTTCTGTCTGTTAGAAATCCTATAGAACCACACAC CACAAAACCTTAGGCTTAAGGCAATGGGTGTGTGTGTTCTTTATTATATATGCACTTGTGCACTTGCTAATCTTGGCAAT GTGGAACTTCTTTGAGTCACCACTTTATTATCTCTATTACTGTCATCCAAAGGTGCAATTGATGATGACTTTAGTTCTTC TAGTGATGCCTAGGAATTATAGGCCATGCAGCAATAGAGAAATATGTACAATTTGGTTGGAATGTGCAATTTTAACCTGT TTCAATTTATGTTCTTGTAGATAACAGCTCTGATCATTGAATCACTAACTTGGTGCTCAATGATAATTCTCATCCTCATG 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ATCATTGTTCTATCTGACCATGAAGGAGATCTAGAAATCAATTGGTTAAAATATGTTTCTGACTGTATATGACACTTATA ACTGGTTCTCATACAAAAAGAGTTTTCAATGTAGTGCCTATATGTACAACCCCCATCTTTGGTATTGTCCCAGCCGTCTA TGGCTGTTATACCACTACGAGATTGGCATTGAACTACCAAGAAATACAGGGACCAAATTGAAAATGATTGTTACATGTAA GGACCAAGATATTTCTAGTCCCAACACCTGATACTGATCTTCAATTTTCTCCCTTTGCACTCTTCTAGGATGGTATATAA TTTCTCAATATGGAAATATGGATCGTGTTTAAAACAGTTTTTCTTACAATTTGGATTAGGCCTAACTCTACCTCAAAAGC TAGTTTAGGAGTGAGGATTGTTCTACCCTTTATAAGAACTAGCCATATCTCTAGTCAATGTGAGACTTTTCATCACGCCT CTCACACCCAAGGCTAGACATGGAATGAACATTTGCGGTGGCCCATATATGAGAGGTCTCCAATAAGTTGATGTAGGATA GACACTGATATCATCTTAAAATTTGGGTTAGATATGACTCTATCCCAAAAGCTAGCTTAGGAGTGAGGTTTGCTCTACCT TTATAAGGATTATTTTGATCATATCTCTAGTCAATGTGAGACTTCTAAACAATTTTACATGCCATAAAGATTTGACAAAG TTTTTTACTTTGACTTTATCTTTTCTGAGTTTGGTACTGGCTATGTTTAATTCCTAAAAACTTAGTTATAATTATGCATA TAGGACTAAATTGAAAACTTTTTCACACAAGGACCAAATTAAGAATTAGTGTCATGAAAAAGGACTCAAAGTACATCACC AAATGAGTTTAAGCATTCTACATGGAGTGGATTCTTTTTTCCCAATCAAATTAGTCAACATTTGATAATCCAATATTAAG ATTCGTCTTTCGTATACTTTCCAGGTTCTTGAATATGGTTCACCAGAGGAGCTCTTAAAAAATGAAGAAAGTGCATTCAA TAAGATGGTTCAAAGCACTGGACCTGCAAATGCTGAGTATTTATGTAGCCTAGTGTTTGGAAGGACAAAGAACAATTCTG GTGAATATAACAAGGGGCAAGAAAGCCACACGAGACAGTTAGCTTTTACCCATTGGGCTGCTGCTACCAAGTTTGCCATA GCTTCTACCCTTTCTTCTGTACACAATAACCTTCAAAAGCCTAGTTCTAAGGAGAATAAAGATTTCCTTGATGAAACAAA GGATGCAGTGACAACACTTCAGGAAGTTCTAGAGGGGAAGCATGATGAAGCCATAGAAGAGACACTGACTAAATTCCATG TTCCAACATATAGATGGTGGTCCACCCTCCATCAAGTTATTGAAGGTAAACATACATAATCATGATATTATTAAGGCTTA ATACATCAGAAGGCCCCTGAAATTGTAAAGGGAATCAGTTCCAGGGCCTGGAAAATTTTCGCATCAAATTGGGTCCCTAA AATTTTTTTTTTAATTCAATTAAGGCCAAATCTCAATTTTGTCCTAGTCATCAGTGACACCTGGCTTTTATAATTTTTTT TTAA 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0103200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTGGATAGTGCTTTTGGGTCATATACACCTTGTGCAATTAACACTCTTGTTATCTCCATCTCCAATTTGGCTCTGAT GGGCCTGTGCTTGTGTCGAATATGGCTTACCATAAGCAATGCAAAAGCTCAGAGGTTTTGTTTGAAATCAAATTACTATA ACTATGTTCTGGGAATGTTAGCTGGTTATTGTGCTGCTCAGCCTTTGTTGAGATTATTTACTGGAATTTCAGCCTTCAAC CTGAATGGGGAAACTGGCTTTGCTCCTTTTGAGATAACAGCTCTGATCATTGAATCACTAACTTGGTGCTCAATGATAAT TCTCATCCTCATGGAAACCAAGGTTTATATCCGGCAATTTAGATGGTGGGTGCGGTGTGGAGTTATTTATGTTTGGGTAG GAGATATTGTAATGCTTAACCTTCTTCTGTCCGTGAAAGATTCCTGCAGCAGATCTGCTCTGTTTCTCTATATTAGCACT GTTATCTGCCAGGTGTTGTTTGGTACCTTGCTTCTTGTTTACATTCCTAAATTGGTTCCTTATTCTGGATCTGATCATGT AACAATGTACGCTGAGCTACCTGACAATGGTGAATATGAACCACTTTGTGGAGAAGATCAAGTTTGCCCTGAGATGCGTG CCAATCTATTCTCTAGATTGTGTTTTGGATGGATAACTCCACTCATGCAACAAGGATACAAAAAACCCGTCACTGAGAAG GATGTTTGGAAGCTAGACAAATGGGATCAAACAGAGACATTAACTGAAAAGTTCCGAAGATGTTGGATGTTAGAATTTCA AAGCTCTAACCCTTGGCTTTTAAGAGCATTGAACAACAGCCTGGGAAAAAGGTTTTGGTGGGGAGGCTTCTGTAAGATTG GAAATGATCTTTCTCAGTTTGTGGGGCCTGTTTTGCTGAACCATCTTTTAGATTCGATGCAAAATGGAGATCCAACTTGG ATTGGTTACGTCTACGCCTTCTCCATATTTGTTGGAGTGTCAGCTGGTGTTCTATGTGAAGCACAGTATTTCCAGAACGT TATGCGTGTTGGTTTTCAGCTTAGATCAACATTGGTGGCTGAGATATTTAGAAAATCTTTGAGGCTAACACAAGAAGATC GAAAGAATTTCACATCTGGGAAGCTTATGAATATGATAACAACAGATGCGAACGCACTACAGCAAGTATGTCAACAACTT CACGCACTGTGGTCAGCACCATTCCGTATCATCGTAGCTATGGTTCTCCTATACCAGCAATTAGGTGTTGCGTCCCTTCT TGGATCACTAATGCTAACATTTGTGATTGGCAAAACGCGAATGCTATCAAAGGAAGGACTAAAACAGACAGACAAAAGGG TTGGTCTCATGAATGAAATTCTGGCTGCCATGGACACAGTAAAATGTTATGCATGGGAAACAAGCTTTCAATCTAGAATT CAGAGCATACGAGATGAAGAGCTATCATGGTTCCGCAAAGCACAGCTTGTATATGCTCTCAACTCTTTTATATTAAACAG CATGCCAGTTCTTGTGACAGTGACCACATTTGGAATGTTTACTTTACTTGGTGGAGAATTGACACCTTCAAGGGCATTTA CCTCGCTATCTCTGTTTTCAGTTTTGCGGTTTCCTTTATATATGCTTCCAAGTTTACTAAGTCAGATAGCAAATGCAAAG GTCTCCTTGCAGCGTTTGGAGGAACTGTTCTTGGCTGAGGAGCGAAATTTAAAACAAAATCCACCTATTGTACCAGGACT TCCTGCCATCTCAATTAGTAATGGATACTTTTCATGGGATCCTAAGGCAGAGAAGCCTACATTATCAAATATCAATTTGG AAATACCAATTGGCAGCTTAGTTGCAATTATTGGTGGTACTGGAGAAGGGAAAACATCACTTATTTCAGCAATGATTGGA GAGCTACCTCCATTAGCAGATGCAAATGCTACAATCAGAGGCACTGTTGCTTATGTTCCTCAGGTTTCATGGATTTACAA TGCTACAGTTCGTGAAAATATATTATTTGGATCAAAATTCGAACATGAAAGATATTGGAAGGCTATCGACGTCGCTGCTT TACATCATGATCTCAACTTCCTACCTGGACGTGATTTAACAGAGATTGGAGAAAGAGGAGTGAATATTAGTGGTGGACAA AAGCAAAGAGTTTCCTTAGCTAGGGCTGTATACTCGAATTCGGATGTGTATATATTTGATGATCCTTTGAGTGCTCTTGA TGCTCATGTTGCACAGGAGGTTTTCGGCAACTGTATAAAGGAAGGGCTGCGAGGAAAAACCAGGGTTCTTGTCACCAATC AACTACACTTTCTCCCTCAGGTGGATAAAATTATTCTGGTTAGTGAAGGCATGATTAAGGAGCAGGGAACCTTTGAGGAG TTGTCAAAATGTGGGCATCTATTTCAGAAACTAATGGAAAATGCAGGGAAAATGGAACATCAAGCAGATAGTAACGAAGA TAGAGATAGTCATGATAACGATTTACCCTTAAACAATGAGGCAATTGTAGAGTTACCAAATGGTGCAAGCTATGAAAAGA AGGGAAAATTACAAAAATCAGTACTTGTTAAGAAAGAAGAGCGGGAGACAGGTGTGGTTAGCTGGAAAGTTATAACGAGG TACAAATCTGCTCTGGGAGGACTGTGGGTAGTTCTCATACTCTTTGGATGCTATACGTTAACAGAAGTTCTTCGAATTTC AAGTAGCACATGGTTAAGCGTTTGGACATCTCAAGATTCTGCTGCAGCTGATGAAACAGAATATTTTCTTTTCATCTATG CACTTTTCTCATTTGGACAGGTAACTGTGACACTTGCAAACTCTTATTGGTTGATCATTTCAAGTCTTCGCGCTGCCAAA AGATTGCATGATGCCATGCTAGATAAAATCCTGAGCGCTCCAATGATATTCTTCCAAACCAACCCTGTTGGTCGCATAAT TAATAGGTTTGCAAAAGACACGGGAGATATAGATATGTATGTTTTTGCGTTGGTGAATGGGTTTCTGGGGCAAGTGTGGC AGTTAGTTTCGACATTTGTTCTTATCGGCACAGTGAGCACCATATCCCTGTGGGCCATAATGCCACTACTTACCATCTTT TATGCAGCTTATATTTATTACCAGAGCACAGCTCGAGAGGTGAAGCGCTTGGATTCCATTACAAGATCTCCTGTTTATGC GCATTTTGGGGAATCATTGAATGGTTTGTCAAGCATTCGCGCTTACAAAGCATATGATAGGATGGCACAGATCAATGGAA AATTCATGGATAACAACATAAGATTCACTCTTGTCAACATTAGTTCGAACCGGTGGTTGACCATAAGGTTAGAATCATTA GGAGGCCTCATGATTTGGTTGATAGCAACATTCGCTGTCCTGCAAAATGGAAGAGCTGAAAACAAGGCAATGATTGCGTC TTCAATGGGCCTACTTCTCAGTTACACTTTGAACATAACAAATCTCTTGAGCGGTGCCCTCAGACAAGCAAGCAGAGCTG AGAACAGTCTAAATGCGGTTGAGCGCGTTGACACCTATATAAATTTAGAATCCGAGGCTCCAGGTATAGTTGAGGAAAAC CGTCCACCACCAGGATGGCCGACAACTGGATCGATTGAGTTTGAGAATGTTGTTCTCACATACAGGCCTGAACTTCCTCC AGTTCTGCATGGAGTGTCTTTCACAGTATGTCCAACTGAGAAGATAGGGGTAGTTGGAAGAACTGGTGCAGGAAAGTCTA GCATGCTTAATGCGTTATTCCGGATTGTGGAACTACAAAGAGGAAGAATCACTATTGATGGTTGTGATGTTTCGACAATT GGACTAGCAGATCTGCGAAAAGTTCTCACCATCATACCGCAATCGCCAGTTCTGTTCTCTGGAACTGTTCGCTTCAATCT TGATCCATTTAATGAACACAATGATGCTGACCTATGGGAATCTTTAGAAAGGGCGCATTTGAAGGATGTAATTAGAAGAA ATCCACTTGGCCTAGATGCTCAGGTTTCAGAGGGAGGAGACAATTTCAGTGTTGGACAGAGGCAACTCATAAGTCTAGCA AGAGCATTGCTACGAAGATCAAAGGTTCTTGTCCTGGATGAAGCTACTGCTGCTGTAGATGTTAGAACAGATGCCCTTAT CCAGAAAACTATCCGACAAGAATTCCAGTCTTGCACCATGCTCATCATTGCACACAGATTAAATACAATTATTGACTGCG ATCGGATTCTGTTGCTTGATGCTGGCCGGGTTCTTGAATATGGTTCACCAGAGGAGCTCTTAAAAAATGAAGAAAGTGCA TTCAATAAGATGGTTCAAAGCACTGGACCTGCAAATGCTGAGTATTTATGTAGCCTAGTGTTTGGAAGGACAAAGAACAA TTCTGGTGAATATAACAAGGGGCAAGAAAGCCACACGAGACAGTTAGCTTTTACCCATTGGGCTGCTGCTACCAAGTTTG CCATAGCTTCTACCCTTTCTTCTGTACACAATAACCTTCAAAAGCCTAGTTCTAAGGAGAATAAAGATTTCCTTGATGAA ACAAAGGATGCAGTGACAACACTTCAGGAAGTTCTAGAGGGGAAGCATGATGAAGCCATAGAAGAGACACTGACTAAATT CCATGTTCCAACATATAGATGGTGGTCCACCCTCCATCAAGTTATTGAAGAAATTTTTTTTTTAATTCAATTAAGGCCAA ATCTCAATTTTGTCCTAGTCATCAGTGACACCTGGCTTTTATAA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0103200.5) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVDSAFGSYTPCAINTLVISISNLALMGLCLCRIWLTISNAKAQRFCLKSNYYNYVLGMLAGYCAAQPLLRLFTGISAFN LNGETGFAPFEITALIIESLTWCSMIILILMETKVYIRQFRWWVRCGVIYVWVGDIVMLNLLLSVKDSCSRSALFLYIST VICQVLFGTLLLVYIPKLVPYSGSDHVTMYAELPDNGEYEPLCGEDQVCPEMRANLFSRLCFGWITPLMQQGYKKPVTEK DVWKLDKWDQTETLTEKFRRCWMLEFQSSNPWLLRALNNSLGKRFWWGGFCKIGNDLSQFVGPVLLNHLLDSMQNGDPTW IGYVYAFSIFVGVSAGVLCEAQYFQNVMRVGFQLRSTLVAEIFRKSLRLTQEDRKNFTSGKLMNMITTDANALQQVCQQL HALWSAPFRIIVAMVLLYQQLGVASLLGSLMLTFVIGKTRMLSKEGLKQTDKRVGLMNEILAAMDTVKCYAWETSFQSRI QSIRDEELSWFRKAQLVYALNSFILNSMPVLVTVTTFGMFTLLGGELTPSRAFTSLSLFSVLRFPLYMLPSLLSQIANAK VSLQRLEELFLAEERNLKQNPPIVPGLPAISISNGYFSWDPKAEKPTLSNINLEIPIGSLVAIIGGTGEGKTSLISAMIG ELPPLADANATIRGTVAYVPQVSWIYNATVRENILFGSKFEHERYWKAIDVAALHHDLNFLPGRDLTEIGERGVNISGGQ KQRVSLARAVYSNSDVYIFDDPLSALDAHVAQEVFGNCIKEGLRGKTRVLVTNQLHFLPQVDKIILVSEGMIKEQGTFEE LSKCGHLFQKLMENAGKMEHQADSNEDRDSHDNDLPLNNEAIVELPNGASYEKKGKLQKSVLVKKEERETGVVSWKVITR YKSALGGLWVVLILFGCYTLTEVLRISSSTWLSVWTSQDSAAADETEYFLFIYALFSFGQVTVTLANSYWLIISSLRAAK RLHDAMLDKILSAPMIFFQTNPVGRIINRFAKDTGDIDMYVFALVNGFLGQVWQLVSTFVLIGTVSTISLWAIMPLLTIF YAAYIYYQSTAREVKRLDSITRSPVYAHFGESLNGLSSIRAYKAYDRMAQINGKFMDNNIRFTLVNISSNRWLTIRLESL GGLMIWLIATFAVLQNGRAENKAMIASSMGLLLSYTLNITNLLSGALRQASRAENSLNAVERVDTYINLESEAPGIVEEN RPPPGWPTTGSIEFENVVLTYRPELPPVLHGVSFTVCPTEKIGVVGRTGAGKSSMLNALFRIVELQRGRITIDGCDVSTI GLADLRKVLTIIPQSPVLFSGTVRFNLDPFNEHNDADLWESLERAHLKDVIRRNPLGLDAQVSEGGDNFSVGQRQLISLA RALLRRSKVLVLDEATAAVDVRTDALIQKTIRQEFQSCTMLIIAHRLNTIIDCDRILLLDAGRVLEYGSPEELLKNEESA FNKMVQSTGPANAEYLCSLVFGRTKNNSGEYNKGQESHTRQLAFTHWAAATKFAIASTLSSVHNNLQKPSSKENKDFLDE TKDAVTTLQEVLEGKHDEAIEETLTKFHVPTYRWWSTLHQVIEEIFFLIQLRPNLNFVLVISDTWLL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 5 5 -
Phobius 6 31 26 -
PANTHER 10 1486 1477 0.0
PANTHER 10 1486 1477 0.0
TMHMM 15 37 23 -
Phobius 32 51 20 -
TMHMM 50 72 23 -
Phobius 52 70 19 -
Phobius 71 89 19 -
TMHMM 87 109 23 -
Phobius 90 110 21 -
Phobius 111 121 11 -
TMHMM 121 143 23 -
Phobius 122 142 21 -
Phobius 143 153 11 -
TMHMM 153 175 23 -
Phobius 154 175 22 -
Phobius 176 319 144 -
SUPERFAMILY 271 566 296 2.75E-39
Gene3D 278 572 295 4.6E-27
ProSiteProfiles 286 558 273 35.756
CDD 287 566 280 8.13148E-102
Pfam 288 546 259 1.2E-31
Phobius 320 344 25 -
TMHMM 322 344 23 -
Phobius 345 409 65 -
TMHMM 410 432 23 -
Phobius 410 436 27 -
Phobius 437 495 59 -
Phobius 496 520 25 -
TMHMM 500 522 23 -
Phobius 521 531 11 -
TMHMM 532 554 23 -
Phobius 532 553 22 -
Phobius 554 883 330 -
Coils 556 576 21 -
Gene3D 573 837 265 9.4E-71
SUPERFAMILY 585 813 229 1.41E-54
CDD 590 790 201 7.17056E-102
ProSiteProfiles 590 814 225 22.269
Pfam 608 743 136 6.5E-18
SMART 617 797 181 3.1E-6
ProSitePatterns 716 730 15 -
Gene3D 854 1194 341 2.4E-33
TMHMM 884 906 23 -
Phobius 884 908 25 -
SUPERFAMILY 888 1192 305 6.15E-46
CDD 891 1187 297 2.30128E-89
ProSiteProfiles 892 1175 284 31.236
Pfam 892 1139 248 3.4E-30
Phobius 909 927 19 -
Phobius 928 952 25 -
TMHMM 929 951 23 -
Phobius 953 998 46 -
TMHMM 999 1021 23 -
Phobius 999 1022 24 -
Phobius 1023 1027 5 -
TMHMM 1025 1047 23 -
Phobius 1028 1047 20 -
Phobius 1048 1119 72 -
TMHMM 1112 1134 23 -
Phobius 1120 1137 18 -
Phobius 1138 1142 5 -
Phobius 1143 1163 21 -
Phobius 1164 1587 424 -
Gene3D 1196 1448 253 7.6E-90
SUPERFAMILY 1202 1444 243 2.24E-74
CDD 1210 1430 221 4.97224E-130
ProSiteProfiles 1212 1446 235 18.441
Pfam 1229 1377 149 3.2E-27
SMART 1238 1431 194 1.2E-11
ProSitePatterns 1349 1363 15 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.
Molecular function ATPase activity Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate + 2 H+. May or may not be coupled to another reaction.
Molecular function ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate, to directly drive the active transport of a substance across a membrane.
Biological process Transmembrane transport The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0103200.5, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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