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LotjaGi3g1v0103200.6

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0103200
Transcript ID LotjaGi3g1v0103200.6
Related isoforms 8
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Multidrug resistance protein ABC transporter family protein; TAIR: AT1G30410.2 multidrug resistance-associated protein 13; Swiss-Prot: sp|Q9C8H0|AB12C_ARATH ABC transporter C family member 12; TrEMBL-Plants: tr|A0A0S3SIW7|A0A0S3SIW7_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0103200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:12779922..12798692) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ATGGGGTTTGAACCAGTGGTTTGGTATTGCCAGCCAGAAGCAAACAGTGTTTGGGGTAAAATGGTGGATAGTGCTTTTGG GTCATATACACCTTGTGCAATTAACACTCTTGTTATCTCCATCTCCAATTTGGCTCTGATGGGCCTGTGCTTGTGTCGAA TATGGCTTACCATAAGCAATGCAAAAGCTCAGAGGTTTTGTTTGAAATCAAATTACTATAACTATGTTCTGGGAATGTTA GCTGGTTATTGTGCTGCTCAGCCTTTGTTGAGATTATTTACTGGAATTTCAGCCTTCAACCTGAATGGGGAAACTGGCTT TGCTCCTTTTGAGGTGGGTCTCTCATTAATTTAGATTCCCTGCAGTTAAAAATTCCTAAATTTACGCAGTCAAAAGAATT TGAGACATGCTATCATGATCGAATGGGTTAAACTTTAAGCTGATCACTGCGGTCCGATCTTGATGAAATATATGAGCCAA CTGATCTTTGATCAAACGGTAGGGTTTAGATTTATTGACTGCGTGAATTTAAGATTGTCTTGACTGCAGGAAACCCAAAT TCGTCTCTCATGCATACTCTGATTACATCCCTTTGCATGAATGCATAGTATCTTCTGTCTGTTAGAAATCCTATAGAACC ACACACCACAAAACCTTAGGCTTAAGGCAATGGGTGTGTGTGTTCTTTATTATATATGCACTTGTGCACTTGCTAATCTT GGCAATGTGGAACTTCTTTGAGTCACCACTTTATTATCTCTATTACTGTCATCCAAAGGTGCAATTGATGATGACTTTAG TTCTTCTAGTGATGCCTAGGAATTATAGGCCATGCAGCAATAGAGAAATATGTACAATTTGGTTGGAATGTGCAATTTTA ACCTGTTTCAATTTATGTTCTTGTAGATAACAGCTCTGATCATTGAATCACTAACTTGGTGCTCAATGATAATTCTCATC 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GTAATTATCATTGTTCTATCTGACCATGAAGGAGATCTAGAAATCAATTGGTTAAAATATGTTTCTGACTGTATATGACA CTTATAACTGGTTCTCATACAAAAAGAGTTTTCAATGTAGTGCCTATATGTACAACCCCCATCTTTGGTATTGTCCCAGC CGTCTATGGCTGTTATACCACTACGAGATTGGCATTGAACTACCAAGAAATACAGGGACCAAATTGAAAATGATTGTTAC ATGTAAGGACCAAGATATTTCTAGTCCCAACACCTGATACTGATCTTCAATTTTCTCCCTTTGCACTCTTCTAGGATGGT ATATAATTTCTCAATATGGAAATATGGATCGTGTTTAAAACAGTTTTTCTTACAATTTGGATTAGGCCTAACTCTACCTC AAAAGCTAGTTTAGGAGTGAGGATTGTTCTACCCTTTATAAGAACTAGCCATATCTCTAGTCAATGTGAGACTTTTCATC ACGCCTCTCACACCCAAGGCTAGACATGGAATGAACATTTGCGGTGGCCCATATATGAGAGGTCTCCAATAAGTTGATGT AGGATAGACACTGATATCATCTTAAAATTTGGGTTAGATATGACTCTATCCCAAAAGCTAGCTTAGGAGTGAGGTTTGCT CTACCTTTATAAGGATTATTTTGATCATATCTCTAGTCAATGTGAGACTTCTAAACAATTTTACATGCCATAAAGATTTG ACAAAGTTTTTTACTTTGACTTTATCTTTTCTGAGTTTGGTACTGGCTATGTTTAATTCCTAAAAACTTAGTTATAATTA TGCATATAGGACTAAATTGAAAACTTTTTCACACAAGGACCAAATTAAGAATTAGTGTCATGAAAAAGGACTCAAAGTAC ATCACCAAATGAGTTTAAGCATTCTACATGGAGTGGATTCTTTTTTCCCAATCAAATTAGTCAACATTTGATAATCCAAT ATTAAGATTCGTCTTTCGTATACTTTCCAGGTTCTTGAATATGGTTCACCAGAGGAGCTCTTAAAAAATGAAGAAAGTGC ATTCAATAAGATGGTTCAAAGCACTGGACCTGCAAATGCTGAGTATTTATGTAGCCTAGTGTTTGGAAGGACAAAGAACA ATTCTGGTGAATATAACAAGGGGCAAGAAAGCCACACGAGACAGTTAGCTTTTACCCATTGGGCTGCTGCTACCAAGTTT GCCATAGCTTCTACCCTTTCTTCTGTACACAATAACCTTCAAAAGCCTAGTTCTAAGGAGAATAAAGATTTCCTTGATGA AACAAAGGATGCAGTGACAACACTTCAGGAAGTTCTAGAGGGGAAGCATGATGAAGCCATAGAAGAGACACTGACTAAAT TCCATGTTCCAACATATAGATGGTGGTCCACCCTCCATCAAGTTATTGAAGGTAAACATACATAATCATGATATTATTAA GGCTTAATACATCAGAAGGCCCCTGAAATTGTAAAGGGAATCAGTTCCAGG 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0103200.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGGGTTTGAACCAGTGGTTTGGTATTGCCAGCCAGAAGCAAACAGTGTTTGGGGTAAAATGGTGGATAGTGCTTTTGG GTCATATACACCTTGTGCAATTAACACTCTTGTTATCTCCATCTCCAATTTGGCTCTGATGGGCCTGTGCTTGTGTCGAA TATGGCTTACCATAAGCAATGCAAAAGCTCAGAGGTTTTGTTTGAAATCAAATTACTATAACTATGTTCTGGGAATGTTA GCTGGTTATTGTGCTGCTCAGCCTTTGTTGAGATTATTTACTGGAATTTCAGCCTTCAACCTGAATGGGGAAACTGGCTT TGCTCCTTTTGAGATAACAGCTCTGATCATTGAATCACTAACTTGGTGCTCAATGATAATTCTCATCCTCATGGAAACCA AGGTTTATATCCGGCAATTTAGATGGTGGGTGCGGTGTGGAGTTATTTATGTTTGGGTAGGAGATATTGTAATGCTTAAC CTTCTTCTGTCCGTGAAAGATTCCTGCAGCAGATCTGCTCTGTTTCTCTATATTAGCACTGTTATCTGCCAGGTGTTGTT TGGTACCTTGCTTCTTGTTTACATTCCTAAATTGGTTCCTTATTCTGGATCTGATCATGTAACAATGTACGCTGAGCTAC CTGACAATGGTGAATATGAACCACTTTGTGGAGAAGATCAAGTTTGCCCTGAGATGCGTGCCAATCTATTCTCTAGATTG TGTTTTGGATGGATAACTCCACTCATGCAACAAGGATACAAAAAACCCGTCACTGAGAAGGATGTTTGGAAGCTAGACAA ATGGGATCAAACAGAGACATTAACTGAAAAGTTCCGAAGATGTTGGATGTTAGAATTTCAAAGCTCTAACCCTTGGCTTT TAAGAGCATTGAACAACAGCCTGGGAAAAAGGTTTTGGTGGGGAGGCTTCTGTAAGATTGGAAATGATCTTTCTCAGTTT GTGGGGCCTGTTTTGCTGAACCATCTTTTAGATTCGATGCAAAATGGAGATCCAACTTGGATTGGTTACGTCTACGCCTT CTCCATATTTGTTGGAGTGTCAGCTGGTGTTCTATGTGAAGCACAGTATTTCCAGAACGTTATGCGTGTTGGTTTTCAGC TTAGATCAACATTGGTGGCTGAGATATTTAGAAAATCTTTGAGGCTAACACAAGAAGATCGAAAGAATTTCACATCTGGG AAGCTTATGAATATGATAACAACAGATGCGAACGCACTACAGCAAGTATGTCAACAACTTCACGCACTGTGGTCAGCACC ATTCCGTATCATCGTAGCTATGGTTCTCCTATACCAGCAATTAGGTGTTGCGTCCCTTCTTGGATCACTAATGCTAGTTC TCATTGTCCCTCTACAGACATTTGTGATTGGCAAAACGCGAATGCTATCAAAGGAAGGACTAAAACAGACAGACAAAAGG GTTGGTCTCATGAATGAAATTCTGGCTGCCATGGACACAGTAAAATGTTATGCATGGGAAACAAGCTTTCAATCTAGAAT TCAGAGCATACGAGATGAAGAGCTATCATGGTTCCGCAAAGCACAGCTTGTATATGCTCTCAACTCTTTTATATTAAACA GCATGCCAGTTCTTGTGACAGTGACCACATTTGGAATGTTTACTTTACTTGGTGGAGAATTGACACCTTCAAGGGCATTT ACCTCGCTATCTCTGTTTTCAGTTTTGCGGTTTCCTTTATATATGCTTCCAAGTTTACTAAGTCAGATAGCAAATGCAAA GGTCTCCTTGCAGCGTTTGGAGGAACTGTTCTTGGCTGAGGAGCGAAATTTAAAACAAAATCCACCTATTGTACCAGGAC TTCCTGCCATCTCAATTAGTAATGGATACTTTTCATGGGATCCTAAGGCAGAGAAGCCTACATTATCAAATATCAATTTG GAAATACCAATTGGCAGCTTAGTTGCAATTATTGGTGGTACTGGAGAAGGGAAAACATCACTTATTTCAGCAATGATTGG AGAGCTACCTCCATTAGCAGATGCAAATGCTACAATCAGAGGCACTGTTGCTTATGTTCCTCAGGTTTCATGGATTTACA ATGCTACAGTTCGTGAAAATATATTATTTGGATCAAAATTCGAACATGAAAGATATTGGAAGGCTATCGACGTCGCTGCT TTACATCATGATCTCAACTTCCTACCTGGACGTGATTTAACAGAGATTGGAGAAAGAGGAGTGAATATTAGTGGTGGACA AAAGCAAAGAGTTTCCTTAGCTAGGGCTGTATACTCGAATTCGGATGTGTATATATTTGATGATCCTTTGAGTGCTCTTG ATGCTCATGTTGCACAGGAGGTTTTCGGCAACTGTATAAAGGAAGGGCTGCGAGGAAAAACCAGGGTTCTTGTCACCAAT CAACTACACTTTCTCCCTCAGGTGGATAAAATTATTCTGGTTAGTGAAGGCATGATTAAGGAGCAGGGAACCTTTGAGGA GTTGTCAAAATGTGGGCATCTATTTCAGAAACTAATGGAAAATGCAGGGAAAATGGAACATCAAGCAGATAGTAACGAAG ATAGAGATAGTCATGATAACGATTTACCCTTAAACAATGAGGCAATTGTAGAGTTACCAAATGGTGCAAGCTATGAAAAG AAGGGAAAATTACAAAAATCAGTACTTGTTAAGAAAGAAGAGCGGGAGACAGGTGTGGTTAGCTGGAAAGTTATAACGAG GTACAAATCTGCTCTGGGAGGACTGTGGGTAGTTCTCATACTCTTTGGATGCTATACGTTAACAGAAGTTCTTCGAATTT CAAGTAGCACATGGTTAAGCGTTTGGACATCTCAAGATTCTGCTGCAGCTGATGAAACAGAATATTTTCTTTTCATCTAT GCACTTTTCTCATTTGGACAGGTAACTGTGACACTTGCAAACTCTTATTGGTTGATCATTTCAAGTCTTCGCGCTGCCAA AAGATTGCATGATGCCATGCTAGATAAAATCCTGAGCGCTCCAATGATATTCTTCCAAACCAACCCTGTTGGTCGCATAA TTAATAGGTTTGCAAAAGACACGGGAGATATAGATATGTATGTTTTTGCGTTGGTGAATGGGTTTCTGGGGCAAGTGTGG CAGTTAGTTTCGACATTTGTTCTTATCGGCACAGTGAGCACCATATCCCTGTGGGCCATAATGCCACTACTTACCATCTT TTATGCAGCTTATATTTATTACCAGAGCACAGCTCGAGAGGTGAAGCGCTTGGATTCCATTACAAGATCTCCTGTTTATG CGCATTTTGGGGAATCATTGAATGGTTTGTCAAGCATTCGCGCTTACAAAGCATATGATAGGATGGCACAGATCAATGGA AAATTCATGGATAACAACATAAGATTCACTCTTGTCAACATTAGTTCGAACCGGTGGTTGACCATAAGGTTAGAATCATT AGGAGGCCTCATGATTTGGTTGATAGCAACATTCGCTGTCCTGCAAAATGGAAGAGCTGAAAACAAGGCAATGATTGCGT CTTCAATGGGCCTACTTCTCAGTTACACTTTGAACATAACAAATCTCTTGAGCGGTGCCCTCAGACAAGCAAGCAGAGCT GAGAACAGTCTAAATGCGGTTGAGCGCGTTGACACCTATATAAATTTAGAATCCGAGGCTCCAGGTATAGTTGAGGAAAA CCGTCCACCACCAGGATGGCCGACAACTGGATCGATTGAGTTTGAGAATGTTGTTCTCACATACAGGCCTGAACTTCCTC CAGTTCTGCATGGAGTGTCTTTCACAGTATGTCCAACTGAGAAGATAGGGGTAGTTGGAAGAACTGGTGCAGGAAAGTCT AGCATGCTTAATGCGTTATTCCGGATTGTGGAACTACAAAGAGGAAGAATCACTATTGATGGTTGTGATGTTTCGACAAT TGGACTAGCAGATCTGCGAAAAGTTCTCACCATCATACCGCAATCGCCAGTTCTGTTCTCTGGAACTGTTCGCTTCAATC TTGATCCATTTAATGAACACAATGATGCTGACCTATGGGAATCTTTAGAAAGGGCGCATTTGAAGGATGTAATTAGAAGA AATCCACTTGGCCTAGATGCTCAGGTTTCAGAGGGAGGAGACAATTTCAGTGTTGGACAGAGGCAACTCATAAGTCTAGC AAGAGCATTGCTACGAAGATCAAAGGTTCTTGTCCTGGATGAAGCTACTGCTGCTGTAGATGTTAGAACAGATGCCCTTA TCCAGAAAACTATCCGACAAGAATTCCAGTCTTGCACCATGCTCATCATTGCACACAGATTAAATACAATTATTGACTGC GATCGGATTCTGTTGCTTGATGCTGGCCGGGTTCTTGAATATGGTTCACCAGAGGAGCTCTTAAAAAATGAAGAAAGTGC ATTCAATAAGATGGTTCAAAGCACTGGACCTGCAAATGCTGAGTATTTATGTAGCCTAGTGTTTGGAAGGACAAAGAACA ATTCTGGTGAATATAACAAGGGGCAAGAAAGCCACACGAGACAGTTAGCTTTTACCCATTGGGCTGCTGCTACCAAGTTT GCCATAGCTTCTACCCTTTCTTCTGTACACAATAACCTTCAAAAGCCTAGTTCTAAGGAGAATAAAGATTTCCTTGATGA AACAAAGGATGCAGTGACAACACTTCAGGAAGTTCTAGAGGGGAAGCATGATGAAGCCATAGAAGAGACACTGACTAAAT TCCATGTTCCAACATATAGATGGTGGTCCACCCTCCATCAAGTTATTGAAGGTAAACATACATAA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0103200.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MGFEPVVWYCQPEANSVWGKMVDSAFGSYTPCAINTLVISISNLALMGLCLCRIWLTISNAKAQRFCLKSNYYNYVLGML AGYCAAQPLLRLFTGISAFNLNGETGFAPFEITALIIESLTWCSMIILILMETKVYIRQFRWWVRCGVIYVWVGDIVMLN LLLSVKDSCSRSALFLYISTVICQVLFGTLLLVYIPKLVPYSGSDHVTMYAELPDNGEYEPLCGEDQVCPEMRANLFSRL CFGWITPLMQQGYKKPVTEKDVWKLDKWDQTETLTEKFRRCWMLEFQSSNPWLLRALNNSLGKRFWWGGFCKIGNDLSQF VGPVLLNHLLDSMQNGDPTWIGYVYAFSIFVGVSAGVLCEAQYFQNVMRVGFQLRSTLVAEIFRKSLRLTQEDRKNFTSG KLMNMITTDANALQQVCQQLHALWSAPFRIIVAMVLLYQQLGVASLLGSLMLVLIVPLQTFVIGKTRMLSKEGLKQTDKR VGLMNEILAAMDTVKCYAWETSFQSRIQSIRDEELSWFRKAQLVYALNSFILNSMPVLVTVTTFGMFTLLGGELTPSRAF TSLSLFSVLRFPLYMLPSLLSQIANAKVSLQRLEELFLAEERNLKQNPPIVPGLPAISISNGYFSWDPKAEKPTLSNINL EIPIGSLVAIIGGTGEGKTSLISAMIGELPPLADANATIRGTVAYVPQVSWIYNATVRENILFGSKFEHERYWKAIDVAA LHHDLNFLPGRDLTEIGERGVNISGGQKQRVSLARAVYSNSDVYIFDDPLSALDAHVAQEVFGNCIKEGLRGKTRVLVTN QLHFLPQVDKIILVSEGMIKEQGTFEELSKCGHLFQKLMENAGKMEHQADSNEDRDSHDNDLPLNNEAIVELPNGASYEK KGKLQKSVLVKKEERETGVVSWKVITRYKSALGGLWVVLILFGCYTLTEVLRISSSTWLSVWTSQDSAAADETEYFLFIY ALFSFGQVTVTLANSYWLIISSLRAAKRLHDAMLDKILSAPMIFFQTNPVGRIINRFAKDTGDIDMYVFALVNGFLGQVW QLVSTFVLIGTVSTISLWAIMPLLTIFYAAYIYYQSTAREVKRLDSITRSPVYAHFGESLNGLSSIRAYKAYDRMAQING KFMDNNIRFTLVNISSNRWLTIRLESLGGLMIWLIATFAVLQNGRAENKAMIASSMGLLLSYTLNITNLLSGALRQASRA ENSLNAVERVDTYINLESEAPGIVEENRPPPGWPTTGSIEFENVVLTYRPELPPVLHGVSFTVCPTEKIGVVGRTGAGKS SMLNALFRIVELQRGRITIDGCDVSTIGLADLRKVLTIIPQSPVLFSGTVRFNLDPFNEHNDADLWESLERAHLKDVIRR NPLGLDAQVSEGGDNFSVGQRQLISLARALLRRSKVLVLDEATAAVDVRTDALIQKTIRQEFQSCTMLIIAHRLNTIIDC DRILLLDAGRVLEYGSPEELLKNEESAFNKMVQSTGPANAEYLCSLVFGRTKNNSGEYNKGQESHTRQLAFTHWAAATKF AIASTLSSVHNNLQKPSSKENKDFLDETKDAVTTLQEVLEGKHDEAIEETLTKFHVPTYRWWSTLHQVIEGKHT 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Phobius 1 27 27 -
PANTHER 23 1510 1488 0.0
PANTHER 23 1510 1488 0.0
Phobius 28 51 24 -
TMHMM 36 58 23 -
Phobius 52 71 20 -
TMHMM 71 93 23 -
Phobius 72 90 19 -
Phobius 91 109 19 -
TMHMM 108 130 23 -
Phobius 110 130 21 -
Phobius 131 141 11 -
TMHMM 142 164 23 -
Phobius 142 162 21 -
Phobius 163 173 11 -
Phobius 174 195 22 -
TMHMM 174 196 23 -
Phobius 196 339 144 -
Gene3D 287 599 313 1.5E-28
SUPERFAMILY 291 593 303 3.14E-43
ProSiteProfiles 306 585 280 39.502
CDD 307 593 287 8.47238E-109
Pfam 308 573 266 2.7E-37
Phobius 340 364 25 -
TMHMM 342 364 23 -
Phobius 365 429 65 -
Phobius 430 458 29 -
TMHMM 436 458 23 -
Phobius 459 522 64 -
Phobius 523 547 25 -
TMHMM 527 549 23 -
Phobius 548 558 11 -
Phobius 559 580 22 -
TMHMM 559 581 23 -
Phobius 581 910 330 -
Coils 583 603 21 -
Gene3D 600 864 265 9.4E-71
SUPERFAMILY 612 840 229 1.41E-54
CDD 617 817 201 4.96282E-102
ProSiteProfiles 617 841 225 22.269
Pfam 635 770 136 6.6E-18
SMART 644 824 181 3.1E-6
ProSitePatterns 743 757 15 -
Gene3D 881 1221 341 2.5E-33
Phobius 911 935 25 -
TMHMM 911 933 23 -
SUPERFAMILY 915 1219 305 6.15E-46
CDD 918 1214 297 5.5281E-90
Pfam 919 1166 248 3.4E-30
ProSiteProfiles 919 1202 284 31.236
Phobius 936 954 19 -
Phobius 955 979 25 -
TMHMM 956 978 23 -
Phobius 980 1025 46 -
Phobius 1026 1049 24 -
TMHMM 1026 1048 23 -
Phobius 1050 1054 5 -
TMHMM 1052 1074 23 -
Phobius 1055 1074 20 -
Phobius 1075 1146 72 -
TMHMM 1139 1161 23 -
Phobius 1147 1164 18 -
Phobius 1165 1169 5 -
Phobius 1170 1190 21 -
Phobius 1191 1594 404 -
Gene3D 1223 1475 253 7.7E-90
SUPERFAMILY 1229 1471 243 2.24E-74
CDD 1237 1457 221 2.04822E-130
ProSiteProfiles 1239 1473 235 18.441
Pfam 1256 1404 149 3.3E-27
SMART 1265 1458 194 1.2E-11
ProSitePatterns 1376 1390 15 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Cellular component Integral component of membrane The component of a membrane consisting of the gene products and protein complexes having at least some part of their peptide sequence embedded in the hydrophobic region of the membrane.
Molecular function ATPase activity Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate + 2 H+. May or may not be coupled to another reaction.
Molecular function ATPase activity, coupled to transmembrane movement of substances Catalysis of the reaction: ATP + H2O = ADP + phosphate, to directly drive the active transport of a substance across a membrane.
Biological process Transmembrane transport The process in which a solute is transported across a lipid bilayer, from one side of a membrane to the other.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0103200.6, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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