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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0172800 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0172800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA (Cytosine-5-)-methyltransferase; TAIR: AT5G14620.1 domains rearranged methyltransferase 2; Swiss-Prot: sp|Q9M548|DRM2_ARATH DNA (cytosine-5)-methyltransferase DRM2; TrEMBL-Plants: tr|I1K1I2|I1K1I2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0172800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:23885180..23900326) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCTCTCCAACCTCCCACTCCATTCTGATGAAAGAGAAGTCAATCATAGAGGAGGAATTCAAATCCTACGGTTCAGAATTC AATTTCGTAAATGGATTTTATATTTCAACGGCGCCGATTTCTCGATGAAAACAGTGAGATTTGAGTAGCGAAAGTGCGCG CGTGTGTGAACCATTTCAGCTCGAATATTTCCATTGTCACTGAGTTCGTACTCAATTGAAGGCCGTGACTCGGTGCGCGT CCATCAAAACCTCCTCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCCTCCGTCGCGCTCTTCGCCGCTGCACGGTGACGC TCGCGAAATTCGTGTGCAGAGGTTTTTGGTTTCTTGATTATTGTTATTTTTTTCCAGTTATTGTAATTGAAGTGCTTCAA ATTGTGTTGATGTGAGTTTTTTTTTCTTCTTCTTCTTCAATTTTGTGTGCTTTGCGCAGGGGCGAAAGTGCATTCTTGGT TCCATCGGAGGGATTGTTGCTTCTGCATTTTCCTGAGAGGTAGAGATTTCTCTATTGCTTGTTAGTTTCTTTGTTTTTTG AATTTTTTACATGCTTAGTCTCTGTTGATTTCTTAGGGTTTTGTGTTGGGTGTTGATTTTCCCACCCCCAGTACTCTTAT TACAACCCCATTTTTAGGTAGTAATTTCCACATGCATGTGTTTATTGTTTACAATGTTTTTCGAAAACCCAGTAGTGTGT CTTTTAATTTACCGGATTTTAGAAAACCTGGTACTCGTAGTGAGCTTTTAACATACCTGAGATTTAAAAATCCAGTACTG AGATTTAAAACCCGATAGTATGTCTCCGAATGATAGCTTAAGGGGTAAGAGATAGGGGACATACAGGTTGGGTGGGGGAG GTCCAGGGATCAATCCCTGGTGGGTGCAATTTATCTTTCCGATGTACCAACAAAAAAATCAGATAGTATATTTTTAAGGT 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TGGAGATATAGCATATTTTGAGTTTACTGGAGTTTCTCAATTGTATTATCACTTGTCAGATGTTCTAATTTTTTTGTATT GTTTGTGGAGTTAAAAAACATGTTTTGATCAGATCATTTGGTCTTTTAGTTCATCATCGAGACATAGATGCCTAGACTCT TCTGGCCTCTTTCATTGCTCCATTTTGCTAGATGAAAGTTATGGTCCTTGGAGGTTTCTTGTTCTTATGCATGTTTCTTG AAATTTCTGATGTGTTTTTGTAGTGTGCCACTTACTTGAGCACATGCAAATTGCAAGCTTGTAGGTCTCATGAAGCCATT TATCCCTATGTTTCTCTGATGGGCTTCAGAGACAATGTCTTTTATTCCTGCATTGGGAAGTTGCTTGGTTGTTCTGAGAT ATGCTTTTTGGTGATTAGATGGGCCATGAGCTTGTCTAGAGTTCATGATTCAATTATATTTCACTTCAAAGGCTTTGGGT CCTGTACTCCTGTGTGCTTTAACACCATGGACGTTAAAGTTTAATAAGTTGTAGGGTTTGGTTGAGAAACTCGATAAAAT AGGGACCAAATTGAGATGTGATGGTCTCAGAAAACAATTTTTTTTCTATATTGGAAAATTGCTATATGCATGGGGAGGAT CGTTATGGTTAGGGCCTATGTGTTATATTATCATCTAAGAATGCTGTTGTTTCAGAATATTGTTCTAGTTTGTACTGTGT TTGATAAATTAATATATCTGAAATTTTGCTACTGCCCAAATAACAGCTGAATTAAATTAACTTGGTCTTTCCCAATGATA ACCTCATGCGAGGACCTTTTGTTTGTTTGTTTTCAGAAGTTTACATAATAATGGACTTTTTGCTTTCTGTTTTCTTGGCC TCATTGTTTTAGTGAAATACTGCAGGTCCAAACTCCTCGCTTGAAGAACTGGTTGATTTTATAGGTGTTGCTCAAATAGC 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TTGCTCACATATCACACAGTTCTTAGACACTCAATGACACTCAAATCAGGCTTGACAATTGAAGGATACTTATAAAAAAG TGCATCTTGTTTTTAAATTACTTTAAAAATAGTCGACTTAAAATATCATGAAAGGTCTCCGACACACTTGATTTGGCAAT TGTTGTTGGTATCCTTGTAGCCTAAACTTGTTTATAACAAAAAAATGTTGTATTACTTGAGAAGACGGGAAGCGAAAGTA GCTTATCTTGATCATACAATAAGATATGGATGGTCAAGATTAATTCCTAGTTTTAAACTATTTTTTGTAATGCCACAAGC ACTCACGGTATTCTGCAGGACACATGCATACATGTGTGTCTATTTGCTGTGTCCTGGAGTTCTATGTTTTAGACATTGCT TTAGTGCTTACACAATTATATATGGGCGGGGGTACAAGGATGAATGGAGAAATTAGTGGTTTATGCACTTAAGTTTCCTT GTAAATGTTTCTTTCCTAAGTTCAGTTTATTTCAGGTTGCTTTATACATGTGTGAAACATTCCCATGTGTTCTGATTGCT TTAAGTAGTTGTAGCGGTTTGCTTTTTACAAGAAACTAGTGGTTTATGCATTTACGTTTCCATGTAAATTTCTCTTCCCT TATAAGTTCAGTTTAATTCAGGTGGACACAGTTGCTTACCACCTGTCGGTTCTGAAGGAGATGTACCCTAAGGGTATGAA TGTTCTTTCTCTCTTTTCGGGAATTGGCGGTGCTGAAGTGGCTCTTCATCGCCTTGGTATCCCTCTAAAGAATGTTGTTT CAGTTGAAAAATCAGAAGTGAATAGGAACATTGTCAGGAGTTGGTGGGAGCAAACAAATCAGAAAGGGAATTTGATTGAT CTGGATGATGTACAGCTGCTGGATGCTGATCGTTTGGAGCAGCTGATGAGCGCGACCGGGGGCTTTGATCTGGTTATTGG TGGCAGTCCATGTAATAACCTGGCTGGTAGTAACAGGGTCAGCCGGGATGGACTGGAGGGCAAAGAATCTTCCCTCTTTT TTGATTACTGCCGCATTCTTGACTTGGTAAAATGTATGTCGGCGAGATATCAATGAAAATTGTCCTAAGAAACCTCTTTT TCTGGTTTTGTGTTTAATCCAAACATTTAGGATCTTCTTATATAACTTCAGATATTAGACTGATGCTTATCACCCCATTT TTGTTGCCAGGAAGAGGCAACGATTTCGAATAAGTTTTTTATCTTAACATTTCTGATTTCAGTTTACTATTTCATTAATA CCTAGTGCTCTTTTCGGGTCCAGAACATCCAATAGTGAGTGATTGATGAGACTACAACTTCAAAACCACCCACAGGCTTC CATATCATCTTTAGTTCATCTTTAGATAGTGTTGGATGCTTTAGATTACTAATTTACTACTTTAACCGTTGCACACTTGC ACAATGATGAGTTAGTTCTCGCCCTCATATTTATTGCTATTTTAGTGTTTTTATGTGGATAATCAATTGGATTTGCTGGT CTGTTTCATTTGCTCAGTTTATGAATTTGGAGTTTTGGACCACCCTCACAAAGCGCTAGTCCATTGTATTAAGTACATTG GTAAATGTTTTTCTTCAAACTAAACTGAATCGGAATTGTACTGGCCAACTAAACTGCATATACTATGTATGTTTCTAATT TTTTGGACCTTCCTCACCATGTGTTGG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0172800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTATTGCAGGGTGGAGATGACTCTGGTTTGGAGAGTGACAATATTGATTGGACCACAGAAGATGAGCTTGAGATTGA GAACTTTCAGAGTTCATCTTCATGTTTAAGCATTCCTAATGGAGAGACTATTACTGGGTCTAGTGAGGCAAGCACGTCAG CAGGTTCATCTAATTCAAAGGTATTTGACCACTTTATTGGTATGGGATTTCCTAGAGAAATGATTTTCAAAGTGATTCAG GAACATGGTGAGGAAAATGAAGATAAGCTACTGGAAGAACTTCTTACATACTCGGCTCTAGAAAGCTCTCCTCAGCCACA GGAGCAGCCACAACTGGAACCAGATCCCTTCTCTTCAGAGTATGGAGGGAGCTCTTGGGATATCTCAGATGCTGATACTT TTTCTGATGATGAGGAAATTACAAAATCTGTTTCTGGAAATAATGATACCCTGGTGTCCTTGGTAAAAATGGGCTTCAAG GAAGAGGAAGCTTTAATTGCCATAGAAAGATTAGGTCCAAACTCCTCGCTTGAAGAACTGGTTGATTTTATAGGTGTTGC TCAAATAGCGAAGGCAGAAGATGCCCTTCTACCTCCTGAGGATAAGCCGCGATATAATGAACTTTCTAAACCCAAAAAGC AAAGATTTAATGACTGTGAAGTCCGGGGAAGGAAGAAGCCAAAGACTGAGAACAGAATCCTGAATGAAGATGATGATGAT GTGCCATTACATCTTCCAAACCCAATGATTGGGTTTGGGATTCCCAATGAGTCTTTCTTGACTACACACAGAAAACTTCC AGGGGATGCTCTGGGGCCTCCTTACTTCTATTATGAGAATGTGGCATTTGCTCCAAAAGGTGTTTGGCAAACTATTTCAA GATTCTTGTTTGATGTAGAGCCCGAATTTGTAGATTCCAAATATTTCTGTGCTGCTGCCAGGAAAAGGGGCTATATTCAC AATTTGCCAATTGAAAATAGATTCCCCGTTCTACCACAGCCACCCCGAACGATACATGATGCTTTTCCCCTAACAAGGAA GTGGTGGCCCTCGTGGGATCCAAGGACCAAACTTAATTGCTTGCAAACCTGTATTGCCAGTGCAAAACTGACAGAAAGAA TTCGGAAGGCTGTAGAGAATTATGATGGAGAGCCACCTGAAAGCGTCCAAAAGTATGTGCTCTATCAGAGTCGGAAGTGG AATCTGGTTTGGGTGGGAAGGAATAAGGTTGCCCCACTAGAACCAGATGAAATAGAAACGCTTTTGGGCTTCCCAAGGAA CCACACAAGAGGAGGTGGAATCAGTAGGACTGACAGATACAAGTCCCTTGGCAATTCATTCCAGGTGGACACAGTTGCTT ACCACCTGTCGGTTCTGAAGGAGATGTACCCTAAGGGTATGAATGTTCTTTCTCTCTTTTCGGGAATTGGCGGTGCTGAA GTGGCTCTTCATCGCCTTGGTATCCCTCTAAAGAATGTTGTTTCAGTTGAAAAATCAGAAGTGAATAGGAACATTGTCAG GAGTTGGTGGGAGCAAACAAATCAGAAAGGGAATTTGATTGATCTGGATGATGTACAGCTGCTGGATGCTGATCGTTTGG AGCAGCTGATGAGCGCGACCGGGGGCTTTGATCTGGTTATTGGTGGCAGTCCATGTAATAACCTGGCTGGTAGTAACAGG GTCAGCCGGGATGGACTGGAGGGCAAAGAATCTTCCCTCTTTTTTGATTACTGCCGCATTCTTGACTTGGTAAAATGTAT GTCGGCGAGATATCAATGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0172800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLLQGGDDSGLESDNIDWTTEDELEIENFQSSSSCLSIPNGETITGSSEASTSAGSSNSKVFDHFIGMGFPREMIFKVIQ EHGEENEDKLLEELLTYSALESSPQPQEQPQLEPDPFSSEYGGSSWDISDADTFSDDEEITKSVSGNNDTLVSLVKMGFK EEEALIAIERLGPNSSLEELVDFIGVAQIAKAEDALLPPEDKPRYNELSKPKKQRFNDCEVRGRKKPKTENRILNEDDDD VPLHLPNPMIGFGIPNESFLTTHRKLPGDALGPPYFYYENVAFAPKGVWQTISRFLFDVEPEFVDSKYFCAAARKRGYIH NLPIENRFPVLPQPPRTIHDAFPLTRKWWPSWDPRTKLNCLQTCIASAKLTERIRKAVENYDGEPPESVQKYVLYQSRKW NLVWVGRNKVAPLEPDEIETLLGFPRNHTRGGGISRTDRYKSLGNSFQVDTVAYHLSVLKEMYPKGMNVLSLFSGIGGAE VALHRLGIPLKNVVSVEKSEVNRNIVRSWWEQTNQKGNLIDLDDVQLLDADRLEQLMSATGGFDLVIGGSPCNNLAGSNR VSRDGLEGKESSLFFDYCRILDLVKCMSARYQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 20 | 20 | - | – | |
| PANTHER | 12 | 590 | 579 | 3.8E-262 | – | |
| PANTHER | 12 | 590 | 579 | 3.8E-262 | – | |
| MobiDBLite | 30 | 57 | 28 | - | – | |
| Gene3D | 43 | 102 | 60 | 2.9E-7 | – | |
| MobiDBLite | 101 | 131 | 31 | - | – | |
| ProSiteProfiles | 135 | 187 | 53 | 8.619 | ||
| Gene3D | 259 | 348 | 90 | 2.3E-8 | – | |
| ProSiteProfiles | 262 | 591 | 330 | 134.301 | ||
| SUPERFAMILY | 263 | 460 | 198 | 3.88E-23 | ||
| SUPERFAMILY | 465 | 585 | 121 | 1.76E-17 | ||
| Gene3D | 466 | 591 | 126 | 2.5E-38 | – | |
| Pfam | 467 | 582 | 116 | 2.9E-11 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | DNA methylation | The covalent transfer of a methyl group to either N-6 of adenine or C-5 or N-4 of cytosine. | ||
| Molecular function | Methyltransferase activity | Catalysis of the transfer of a methyl group to an acceptor molecule. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0172800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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