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LotjaGi3g1v0183500.6

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0183500
Transcript ID LotjaGi3g1v0183500.6
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Serine/threonine-protein phosphatase; TAIR: AT1G08420.2 BRI1 suppressor 1 (BSU1)-like 2; Swiss-Prot: sp|Q9SHS7|BSL3_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL3; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0H3J2|A0A0R0H3J2_SOYBN Serine/threonine-protein phosphatase; Found in the gene: LotjaGi3g1v0183500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:25705832..25720633) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AGGTGTTTGGATTCCTCAAAATGTTGATTCGGAATACGAATTTACAGGAATTCTAGCTCGATCTTCACGGAATTCCTCGA ATCTTAGGGTTGAACCAATGGATGTTGATTCCTCGATGGTGCCGGACGCCGATCACGATCCAGCTACAGAGAATCACGCC GCGGCTGAGGAAGACGGAGAGAAGCTTCCAGAGCCTCCGTCATCCGAGGGTGGATCTCCGGCGCAGCCACAGAGCTCGGT GGTTGGGCCGAGGCTGGCGCCAACTTATACTGTGGTGAATGCGGTTATGGATAAGAAGGAGGACGGGCCGGGGTCGAGGT GCGGCCACACGTTGACGGCTGTGGCGGCGGTCGGAGAGGAGGGGACGCCGGGGTATATTGGTCCGAGGCTGATTTTGTTC GGTGGTGCCACTGCGCTTGAAGGCAATTCTGCGGCTTCAGGGACTCCTTCTTCTGCTGGAAATGCTGGCATACGTAAGTA TATATAGTTATGAAATTGTCTCAGCTTTGTTTTCGGCAGCATGTGTTAGCAGTTAGCTTATTTTCCTCCGGGTATTGTGG TGGCTGAGTGCTTTTGAGTTTTGGTAACTTATGACTACGCCATTTGCATGCTTAATTTATATTCAAGTTGAATTGAAATT GTGGCTCCACACGCTGGTTTCTTTTTGTCAATGTCTAGATATTAGTTAGTACAACTGTATAAATGCAAAGAATCCCAGTT GCATTGCCAGATACGACATTGAAGTGGTGATTTCTTGGCAGTGTTTGTCATCTTTTAGTGTGTTTGGACTTATCATCTTT TAGGGTGTATTTGGCTTTTGGTTGGATTCACCGCTGATATCCGTTGATTTGGCAAAATCTTGCTTCTTCGTTTGTTCATT AGGATGCGTCTAGGCAAACGGGAAACCAAACACACTTAGTCTTTGGTGCTTATGAACTTGATGTTTCCTGTCATGGGAAC 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GTACGATTTCTTCAACCAGTTACCCCAGCCTGATCTATCATATGAAAATGGTTCTTATCTTTGCATTTGCTTTGCTAGCA CCGCATATTCCTTATTTTTTAAAGCAGTCCGATGCACAAAGCTCCCGCTCCGGTAAGGGGTCCGACTATTTGGTCTATGG TACACAGCCTTACCTCGTTTTTTGAAGAGGCTGTTTCAGAACTTGAACCCGTGACCTCAGTCACATGGAAACAACTTTTT ATGGTTGCGCCAAGGCTCCCCCTTCCACATATTCCTTATTGATGTCGTATAATGCAAATTTATTTTATATTTTATATCCT TTGAATTGGATTTGTTCTGGCATTTTTGCGTTGTGTACCCTAGCTTACTAGGTTTGTTGTGTTAATGTGGATAAACAAAT ATACTGTTATGTTGATCTGAGGGTTTCTTGTTACAATTGGAACAGAAAGCGTTGATAAAGAATCTGACGAGTGAGGATTA TTTTTAAAATTGACAGAGTTCTTGTGATGGTTGATTCATTGATTGTAAAGATGATGCTGCACTGGAATCAAATTTAAGCT GGAGGAATATTGAGAAATATTATTCATTACCATGTAACTAGGATTTAGGAAAATTTTCTTTGATTAGTGCACATGCACTT GTAGTCCATAAGTTTATAGTTGTCTTTTACTCTTTTTATGGCCATACTAATAATAGATAAAGGTGTTAGATTAGTATCTG TAACCATAATTCAATCTCATTAGGAAAATATATTTTCTTGTGTTAGTTAACCCTAAGCCAAAAATTTCAACAATGCTATT AGAACACTAGTGATATAGGCATTTGATTTTCTCTATTGCTAATTTTGTATAAATGACTATCAGATATATCGATTATCTAT TCCTAGGAGATTATGTTGATAGGGGACAGCACAGCCTGGAAACTATATCCCTTCTTCTTTCTCTGAAGGTACTTATGATT 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TTGGCGCTTGTTCAAATAGGTACCGCAAATAATGCTGGGGCAATATTAGTTTTGGGCAGAGACCTTGTTGTGGTTCCTAA GCTGATTCATCCATTACCACCTGCAATTTCTTCACCAGAAACGTCACCTGAACGTCATATTGAAGATACATGGATGCAGG TATTCCAAATATTTTCCATTAAATCATGGTGCTGTGTTATATAATGTGTTACAGCCATCAAATGTACAGGAGCACATCTG TGTGAAGTTATAGCTGATTTCATTTCAAAGCATTATGGTGCTTTTATTTAAAAATAAACACTGTTATTATATGTGCAGGA GTTGAATGCTAACAGACCGGCGACACCAACTAGAGGCCGTCCCCAAGTAACAAATGACCGAGGCTCGCTCGCTTGGATGT AG 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0183500.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGATGTTGATTCCTCGATGGTGCCGGACGCCGATCACGATCCAGCTACAGAGAATCACGCCGCGGCTGAGGAAGACGG AGAGAAGCTTCCAGAGCCTCCGTCATCCGAGGGTGGATCTCCGGCGCAGCCACAGAGCTCGGTGGTTGGGCCGAGGCTGG CGCCAACTTATACTGTGGTGAATGCGGTTATGGATAAGAAGGAGGACGGGCCGGGGTCGAGGTGCGGCCACACGTTGACG GCTGTGGCGGCGGTCGGAGAGGAGGGGACGCCGGGGTATATTGGTCCGAGGCTGATTTTGTTCGGTGGTGCCACTGCGCT TGAAGGCAATTCTGCGGCTTCAGGGACTCCTTCTTCTGCTGGAAATGCTGGCATACGTTTGGCTGGTGCCACGGCTGATG TCCACTGTTATGATGTCTTGACTAATAAATGGTCTAGGTTAACTCCCTATGGAGAACCTCCAACACCAAGGGCTGCACAT GTGGCAACTGCTGTTGGTACCATGGTTGTTATTCAGGGTGGCATTGGTCCTGCTGGTTTGTCAGCAGAGGACCTTCATGT TCTTGATCTCACGCAACAATGGCCCCGCTGGCATAGAGTATCTGTTCAGGGCCCTGGACCAGGGCCACGCTATGGACATG TAATGGCTTTGGTGGGGCAGAGGTATCTTATGGCAATTGGAGGCAATGATGGAAAAAGACCTTTGGCTGATGTGTGGGCC TTGGACACAGCTGCCAAGCCTTATGAGTGGCGCAAGTTAGAGCCTGAAGGAGAGGGACCACCTCCATGCATGTATGCAAC TGCAAGTGCACGCTCGGATGGGCTTCTTCTGCTTTGTGGAGGGAGGGATGCCAATAGTGTTCCATTGGCTAGTGCATATG GACTTGCTAAGCATAGAGATGGTCGTTGGGAATGGGCTATTGCTCCAGGTGTCTCACCATCTCCAAGATATCAACATGCA GCGGTATTTGTGAATGCAAGACTCCATGTGTCTGGTGGGGCTCTTGGTGGAGGACGGATGGTCGAGGACTCATCAAGTGT TGCAGCTGGTGTTTGGTGTGATGCAAAATCTGTTGTAACCAGTCCAAGGACTGGTAGATACAGCGCTGATGCAGCTGGAG GAGACGCTGCAGTTGAGTTGACTCGGCGTTGTAGGCATGCTGCGGCTGCTGTTGGTGATCTAATTTTTATTTATGGTGGT TTACGTGGGGGAATCTTGCTTGATGACCTACTTGTTGCTGAAGATCTTGCTGCTGCTGAAACAACATCTGCTGCTTCACA TGCTGCTGCTGCAGCAGCTGCATCTAATGTACAAGCAGGACACTTGCCTGGACGAAATGGCTTTGTTGATGATAGAACGA GACAAGCGATGCCTGAAGCGGCTGCTGATGGTTCTGTTGTATTAGGCAATCCAGTTGCTCCCCCAATGAATGGTGACATT TATACGGATATCAGCACTGAAAATGCCATGCTTCAGGGACCTCGGCAAACTGCCAAAGGAGTTGAGTATCTGGTTGAAGC ATCTGCAGCAGAAGCTGAAGCTATCAGTGCCGCACTGGCTGCTGCAAAGGCACGACAAGAGAATGGACTCAATGGAGAAG TTGAATTGCCTGACAGAGACCGTGGGGCGGAGGCTACCCCAAGTGGGAAACACACATCTTCCTTGATTAAGCCTGATTCT GTTGGGTCAAATAACATTGCTTCTGGTGGAGTTCGGCTGCATCACAGAGCTGTAGTTGTTGCTGCCGAGACTGGTGGAGC CTTAGGTGGTATGGTTAGACAACTTTCAATTGATCAATTTGAAAATGAAGGCAGGCGTGTCAGTTATGGGACTCCGGAAA ATGCAACTGCTGCTAGAAAATTGTTAGATCGGCAGATGTCAATCAATAGTGTGCCCAAAAAGGTCATAGCACACCTCTTA AAGCCTCGTGGATGGAAACCACCAGTACGCCGACAGTTTTTCTTAGATTGTAATGAAATTGCTGATCTCTGTGATAGTGC TGAGCGGATATTTTCAACAGAACCAAGTGTCTTACAACTTAGTGCTCCGATTAAAATATTTGGTGATTTACATGGGCAGT TTGGGGATCTCATGCGCCTTTTTGACGAGTATGGTGCACCGTCCACTGCCGGTGATATTGCATATATCGATTATCTATTC CTAGGAGATTATGTTGATAGGGGACAGCACAGCCTGGAAACTATATCCCTTCTTCTTTCTCTGAAGGTTGAGTATCCCAA CAATGTACATTTAATACGTGGAAATCATGAAGCTGCAGATATTAATGCTCTTTTTGGTTTTCGAATTGAGTGCATTGAGA GGATGGGTGAGAGAGATGGAATTTGGACATGGCATCGAATGAACCGGTTATTTAATTGGCTTCCTCTGGCGGCTTTAATT GAAAAAAAAATTATTTGCATGCATGGTGGGATCGGTCGTTCAATAAGTCATGTGGAGCAGATTGAGAATATTCAGCGTCC AATTCCGATGGAAGCAGGGTCAATTGTGCTCATGGATCTATTATGGTCTGATCCTACAGAGAATGACAGTGTGGAAGGAC TGCGGCCAAATGCTAGAGGTCCTGGATTAGTTACTTTTGGTCCTGATCGGGTTGTGGAATTTTGCAACAACAATGATCTT CAGCTAATTGTTCGTGCACATGAATGTGTGATGGATGGATTTGAGCGTTTTGCCCAGGGACATCTTATCACGCTTTTCTC AGCTACAAATTATTGTGGTACCGCAAATAATGCTGGGGCAATATTAGTTTTGGGCAGAGACCTTGTTGTGGTTCCTAAGC TGATTCATCCATTACCACCTGCAATTTCTTCACCAGAAACGTCACCTGAACGTCATATTGAAGATACATGGATGCAGGAG TTGAATGCTAACAGACCGGCGACACCAACTAGAGGCCGTCCCCAAGTAACAAATGACCGAGGCTCGCTCGCTTGGATGTA G 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0183500.6) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MDVDSSMVPDADHDPATENHAAAEEDGEKLPEPPSSEGGSPAQPQSSVVGPRLAPTYTVVNAVMDKKEDGPGSRCGHTLT AVAAVGEEGTPGYIGPRLILFGGATALEGNSAASGTPSSAGNAGIRLAGATADVHCYDVLTNKWSRLTPYGEPPTPRAAH VATAVGTMVVIQGGIGPAGLSAEDLHVLDLTQQWPRWHRVSVQGPGPGPRYGHVMALVGQRYLMAIGGNDGKRPLADVWA LDTAAKPYEWRKLEPEGEGPPPCMYATASARSDGLLLLCGGRDANSVPLASAYGLAKHRDGRWEWAIAPGVSPSPRYQHA AVFVNARLHVSGGALGGGRMVEDSSSVAAGVWCDAKSVVTSPRTGRYSADAAGGDAAVELTRRCRHAAAAVGDLIFIYGG LRGGILLDDLLVAEDLAAAETTSAASHAAAAAAASNVQAGHLPGRNGFVDDRTRQAMPEAAADGSVVLGNPVAPPMNGDI YTDISTENAMLQGPRQTAKGVEYLVEASAAEAEAISAALAAAKARQENGLNGEVELPDRDRGAEATPSGKHTSSLIKPDS VGSNNIASGGVRLHHRAVVVAAETGGALGGMVRQLSIDQFENEGRRVSYGTPENATAARKLLDRQMSINSVPKKVIAHLL KPRGWKPPVRRQFFLDCNEIADLCDSAERIFSTEPSVLQLSAPIKIFGDLHGQFGDLMRLFDEYGAPSTAGDIAYIDYLF LGDYVDRGQHSLETISLLLSLKVEYPNNVHLIRGNHEAADINALFGFRIECIERMGERDGIWTWHRMNRLFNWLPLAALI EKKIICMHGGIGRSISHVEQIENIQRPIPMEAGSIVLMDLLWSDPTENDSVEGLRPNARGPGLVTFGPDRVVEFCNNNDL QLIVRAHECVMDGFERFAQGHLITLFSATNYCGTANNAGAILVLGRDLVVVPKLIHPLPPAISSPETSPERHIEDTWMQE LNANRPATPTRGRPQVTNDRGSLAWM 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 32 32 -
PANTHER 1 986 986 0.0
MobiDBLite 1 52 52 -
PANTHER 1 986 986 0.0
PIRSF 27 986 960 0.0
Gene3D 121 372 252 1.2E-24
SUPERFAMILY 128 413 286 1.19E-37
Pfam 226 270 45 1.0E-4
MobiDBLite 530 561 32 -
MobiDBLite 532 546 15 -
MobiDBLite 547 561 15 -
Gene3D 616 961 346 2.5E-109
CDD 635 937 303 0.0
SUPERFAMILY 640 946 307 1.48E-94
SMART 655 939 285 2.0E-104
Pfam 683 890 208 8.0E-33
PRINTS 683 710 28 2.0E-59
PRINTS 718 745 28 2.0E-59
PRINTS 751 775 25 2.0E-59
ProSitePatterns 752 757 6 -
PRINTS 789 815 27 2.0E-59
PRINTS 879 899 21 2.0E-59
PRINTS 901 917 17 2.0E-59
MobiDBLite 963 986 24 -
MobiDBLite 963 977 15 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Phosphoprotein phosphatase activity Catalysis of the reaction: a phosphoprotein + H2O = a protein + phosphate. Together with protein kinases, these enzymes control the state of phosphorylation of cell proteins and thereby provide an important mechanism for regulating cellular activity.
Molecular function Protein binding Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules).
Biological process Brassinosteroid mediated signaling pathway A series of molecular signals mediated by the detection of brassinosteroid.
Molecular function Hydrolase activity Catalysis of the hydrolysis of various bonds, e.g. C-O, C-N, C-C, phosphoric anhydride bonds, etc. Hydrolase is the systematic name for any enzyme of EC class 3.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0183500.6, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…